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Extended X-ray Absorption

Fine Structure

Yamileth Orozco C.
Pablo Romo V.

Universidad del Valle, Facultad de


Ciencias Naturales y Exactas.

7 de Octubre de 2009
1
Contenido
• Introducción
• Teoría EXAFS
• Instrumentación
• Aplicaciones
• Conclusiones
• Referencias

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Figura 1. Los denominados rayos X "duros“;se producen en los
laboratorios de Cristalografía o en las llamadas grandes instalaciones de
sincrotrón (como el ESRF: European Synchrotron Radiation Facility. El
rango de energía de interés para los estudios fotoelectricos EXAFS (1 a 20
Kev) 3
Descubrimiento de los Rayos X.

Figura 2. Wilhelm Conrad Roentgen. Por su descubrimiento


obtuvo el Premio Nobel de Física de 1901.

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Propiedades de los Rayos X

• No son afectados por campos magnéticos


ni eléctricos.

• Son reflectados, difractados, refractados y


polarizados.

• Son capaces de ionizar gases.


Propiedades de los Rayos X

• Son capaces de liberar fotoelectrones y


electrones de retroceso.

• Pueden ser emitidos en un espectro


continuo.

• Pueden ser emitidos también como una


línea espectral característica de los
elementos químicos.
Tipos de radiación de rayos X

Figura 3. Esquema sobre la Figura 4. Esquema sobre


producción de la denominada la produccion de rayos X
"brehmstrahlung" (radiación de caracteristicos de un metal 7
frenado).
Teoría EXAFS

Figura 5. Absorción de Rayos X (Efecto fotoeléctrico)

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• Los electrones que se encuentran más
cercanos del núcleo son excitados a
estados desocupados de mayor energía.
• Para que se de el proceso EXAFS el
electrón debe vencer la denominada
“Energía de enlace (Eb)”, para poder salir
del átomo.

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Oscilaciones EXAFS

Figura 6. interferencia de salida y la retrodispersion fotoelectronica de la


onda responsable de la oscilación XAFS.
E = hv es la energía recibida del fotón.

SEBILLEAU,D. X-ray and Electron Spectroscopies: An


Introduction. Lect. Notes Phys.2006, 697,15. 10
Ecuaciones

Nj = número de coordinación
fj = Amplitud dispersada
Rj = Radio entre atomo vecino-metal
σj2 = Factor Debye-Waller

µ0= Coeficiente de absorción E0 = Energía de enlace


del átomo aislado (binding)
Δµ0 = Medida del salto de la
absorción ħ = h/2π
Figura 7 .Espectro de absorción para el
cobre metálico

Figura 9.Escalas de Tiempo para la


Espectroscopia de Rayos X.

Figura 8. Espectro EXAFS para


el cobre metálico SEBILLEAU,D. X-ray and Electron Spectroscopies: An 12
Introduction. Lect. Notes Phys.2006, 697,15.
Figura 10. Espectro de absorción para el FeO
Figura 11. Principales características de un Espectro
de X*k3 vs. k

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Instrumentación
• Esquema general
• Fuentes
• Detectores

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Esquema General
(3)
(2)

(4) 1
(1)

Figura 12. Esquema del experimento básico EXAFS


1. La fuente
2. Parte óptica ( espejos y monocromadores)
3. La muestra
4. Detectores, amplificadores y computadores.

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Modos de EXAFS

Figura 13. Modo Transmisión

Figura 14. Modo Fluorescencia

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Fuentes
• Tubos de Rayos X

• Fuente de radiación de sincrotrones

18
Tubo de rayos X

Figura 15. Esquema convencional de un tubo de


Rayos X.

Figura 16. Tubo de


rayos X 19
Tubos de Rayos X
• Los electrones son emitidos de un
cátodo y acelerados hacia un ánodo
en un campo eléctrico creado por un
potencial positivo del ánodo respecto
al cátodo. Este golpea al ánodo,
interactuando con sus átomos y
generando la emisión de rayos X.

20
Generador de anodo rotatorio

Figura 17. Generador de rayos x, Figura 18. Anodo rotatorio


con ánodo rotatorio de cobre pulido.

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Descubrimiento de la radiación
sincrotronica

 La primera observación de RS (radiación


sincrotronica) se realizó en el Laboratorio
de Investigación de General Electric, New
York, EE.UU., en 1947, en el transcurso
de un experimento con un acelerador de
partículas.

 De hecho, la RS aparece como un efecto


indeseado en estos aceleradores y las
primeras instalaciones de RS funcionaban
de forma parásita en aceleradores.

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Instalaciones de un sincrotrón

Figura 19. Imagen aérea de las instalaciones del sincrotrón del ESRF
en Grenoble (Francia).
23
¿Cómo funciona una fuente de
radiación de Sincrotron?

Figura 20. Fuente de radiación de sincrotrón

24
Figura 21. Esquema del punto de Figura 22. Detalle de cómo se producen
giro entre dos segmentos los rayos X en las curvaturas de la
rectilíneos en un sincrotrón. trayectoria de los electrones en un
sincrotrón.

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• Cuando los electrones o positrones se
mueven cerca de la velocidad de la luz,
son sometidos a un campo magnético, la
trayectoria sigue una órbita circular y la
RS se emite en la dirección tangencial.
• La energía de la RS cubre un amplio
espectro con un pico en la llamada
energía crítica Ec, que es proporcional a la
energía del electrón E e inversamente
proporcional al radio de la ρ trayectoria, de
acuerdo a:

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Los tres sincrotrones mas
grandes y potentes del mundo

Figura 23. Figura 24. Figura 25.


ESRF, Francia APS, USA Spring- 8, Japon
7.0 GeV 7.0 GeV 8.0 GeV
Circunferencia de Circunferencia de Circunferencia 27
844 m 1110 m de 1436 m
Sincrotrones a nivel Mundial

LLS

LNLS

Figura 26. Distribución mundial de los principales sincrotrones


• Existen en la actualidad cerca de 40
Sincrotrones operando a nivel mundial.
• Los mas importantes se encuentran en:
• Diamond, Reino Unido
• Soleil, Francia
• CLS, Canadá
• Australia’s Synchrotron
• LLS, España (En construcción)
• Photon Factory, SPring-8, Japón.
• APS,SSRL , USA.

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¿Qué hace que una fuente de
radiación de sincrotón sea única?
1. Amplio ancho de banda. Se puede
obtener un espectro de radiacion desde
el IR lejano hasta rayos γ.

2. Un alto flujo de fotones. Su brillo es un


billón de veces (1012) superior a la de los
rayos X convencionales. Esta
característica da como resultado un alta
eficacia por reducción del tiempo

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3. Colimación alta. La alta colimación de RS
es apropiado para microanálisis. Esta
característica permite analizar elementos
traza, en muestras biológicas a nivel
celular. Permite lograr haces de radiación
de hasta 1µm.

4. Estructura temporal de impulsos.


• Los fotoelectrones de radiación son
agrupados periódicamente en el anillo de
almacenamiento, son pulsados a
intervalos controlados. Esta característica
hace posible realizar las mediciones con
resolución temporal. Permite lograr
mediciones del tiempo de vida de
fluorescencia y reacciones fotoquímicas.
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5. La radiación tiene una distinción selectiva
lineal o polarización circular.
Permite medir la orientación de las
moléculas y estudiar el magnetismo.

• Todas estas características hacen al RS,


un método no destructivo para analizar
materiales con trazas y ultratrazas,
aplicado principalmente a muestras
biológicas.

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Figura 27. Comparación entre la luz proveniente de una fuente de sincrotrón
con una las fuentes convencionales de rayos X. 33
Detectores
• Los detectores mas comúnmente usados
para la técnica EXAFS:
• Cámara de ionización
• Fotomultiplicadores

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Cámara de ionización

Figura 28. Esquema general de un detector de


camara de ionización.

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Camara de ionización

La radiación entra en la cámara através de


una ventana transparente de mica, berilio o
Aluminio. Cada foton de rayos X puede
interaccionar con un átomo de argón,
causando la perdida de uno de sus
electrones externos.
Bajo la influencia de un potencial aplicado, los
electrones móviles migran hacia el ánodo,
filamento central, mientras que los cationes,
que se mueven mas despacio, son atraídos
hacia el cátodo cilíndrico del metal.

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Tubos Fotomultiplicadores

Figura 29. Esquema general de un detector de tubos


fotomultiplicadores.
Aplicaciones - Ventajas
1. Es una prueba local. Puede analizar trazas
(ppm) y ultratrazas (ppb).

2. No depende de la cristalinidad de la muestra, se


pueden analizar : cristales, proteínas ,
cuasicristales, sólidos amorfos, líquidos y otro
tipo de materiales, como metaloproteinas.

3. Los campos de aplicación van desde la


ingeniería (materiales, mecánica, química, etc),
las ciencias básicas (física, química, biología,
matemáticas) y sus derivados.

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Aplicaciones - Ventajas

4. Sirve para determinar el tipo y numero de


átomos vecinos (numero de
coordinación).

5. Determinar la distancia entre el átomo


central y los átomos a su alrededor.

6. Es de rápida medición, el tiempo de vida


del hueco-nucleo es cerca de 10-15
segundos.

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Aplicaciones - Limitaciones
1. La información obtenida para este
análisis es limitada al área mas cercana
al centro del átomo (maximo 5 o 6
angstroms).
2. Dificultad para medir elementos livianos

Figura 30. Espectro de absorción del Kr sin señal EXAFS 40


Articulo
• Structural Studies of the Alzheimer’s
Amyloid Precursor Protein Copper-
binding Domain Reveal How it Binds
Copper Ions.

(KONG,G.; et al 2007)
Estructura del CuBD

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Figura 31. Estructura de la métaloproteína CuBD
Figura 32. a) Espectro de absorción del CuBD 43
b) Espectro EXAFS del CuBD
Conclusiones
EXAFS es una técnica de aplicación local,
lo que significa que con EXAFS, se puede
medir la distribución radial de los átomos
alrededor del sitio central, incluyendo
longitudes entre átomos, números de
coordinación,y desorden térmico.
Proporciona información segura acerca
de la estructura electrónica del átomo
central.

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Referencias
• SEBILLEAU,D. X-ray and Electron Spectroscopies: An Introduction.
Lect. Notes Phys.2006, 697,15.
• SKOOG,D. A; HOLLER, F.J. Principios de Análisis
Instrumental.5ed. Mc Graw Hill. Mexico. 2005. pp.299-300.
• NEWVILLE,M.Fundamentals of XAFS.University of
Chicago.2008.41p.
• RAVEL,B. Introduction to EXAFS Experiments and
Theory.2000.35p.
• LENGELER,B. Extended X-ray Absorption Fine structure. En:
HIPPERT,F.; et al (eds).Neutron and X-ray spectroscopy.Springer.
Cap 4, 2006, pp. 131–168.
• PENNER-HAHN,J. X-ray absorption spectroscopy in coordination
chemistry.Coord. Chem. Rev.1999,190-192,1101-1123.
• BECKHOFF,B.;LANGHOFF,N.;WOLFF,H.;et al (Eds) Handbook of
Practical X-Ray Fluorescence Analysis.Springer Berlin
Heidelberg.2006.
• IDE-EKTESSABI,A. Applications of Synchrotron Radiation.Springer
Berlin Heidelberg.2007.pp. 5-45.
• KONG,G.;ADAMS,J.;HARRIS,H.; et al. Structural Studies of the
Alzheimer’s Amyloid Precursor Protein Copper-binding Domain
Reveal How it Binds Copper Ions.J.Mol.Biol. 2007, 367,148.
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