cido desoxirribonucleico

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Estrutura de um ADN.

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O cido desoxirribonucleico (ADN, em portugus: cido desoxirribonucleico; ou DNA, em ingls: deoxyribonucleic acid) um composto orgnicocujas molculas contm as instrues genticas que coordenam o desenvolvimento e funcionamento de todos os seres vivos e alguns vrus, e que transmitem as caractersticas hereditrias de cada ser vivo. O seu principal papel armazenar as informaes necessrias para a construo dasprotenas e ARNs. Os segmentos de

ADN que contm a informao gentica so denominados genes. O restante da sequncia de ADN tem importncia estrutural ou est envolvido na regulao do uso da informao gentica. A estrutura da molcula de ADN foi descoberta conjuntamente pelo norte-americano James Watson e pelo britnico Francis Crick em 7 de Maro de 1953, o que lhes valeu o Prmio Nobel de Fisiologia ou Medicina em 1962, juntamente com Maurice Wilkins. Do ponto de vista qumico, o ADN um longo polmero de unidades simples (monmeros) de nucleotdeos, cuja cadeia principal formada por molculas de acares e fosfato intercalados unidos por ligaes fosfodister. Ligada molcula de acar est uma de quatro bases nitrogenadas. A sequncia de bases ao longo da molcula de ADN constitui a informao gentica. A leitura destas sequncias feita atravs do cdigo gentico, que especifica a sequncia linear dos aminocidos das protenas. A traduo feita por um RNA mensageiro que copia parte da cadeia de ADN por um processo chamado transcrio e posteriormente a informao contida neste "traduzida" em protenas pela traduo. Embora a maioria do ARN produzido seja usado na sntese de protenas, algum ARN tem funo estrutural, como por exemplo o ARN ribossmico, que faz parte da constituio dos ribossomos. Dentro da clula, o ADN pode ser observado numa estrutura chamada cromossoma durante a metfase. O conjunto de cromossomas de uma clula forma o caritipo. Antes da diviso celular os cromossomas so duplicados atravs de um processo chamado replicao. Eucariontes como animais,plantas, fungos e protozorios tm o seu ADN dentro do ncleo enquanto que procariontes como as bactrias o tm disperso no citoplasma. Dentro dos cromossomas, protenas da cromatina como as histonas compactam e organizam o ADN. Estas estruturas compactas guiam as interaces entre o ADN e outras protenas, ajudando a controlar que partes do ADN so transcritas.
ndice
[esconder]

1 Propriedades fsicas e qumicas

o o o o o o

1.1 Emparelhamento de bases 1.2 Sulcos 1.3 Senso e antissenso 1.4 Superenrolamento 1.5 Estrutura alternativa da dupla hlice 1.6 Estruturas em quadrplex

2 Modificaes qumicas

o o

2.1 Modificaes de bases 2.2 Danos ao ADN

3 Funes biolgicas

o o o

3.1 Genes e genomas 3.2 Transcrio e traduo 3.3 Replicao

4 Interaces com protenas

o o

4.1 Protenas que se ligam ao ADN (DNA-binding) 4.2 Enzimas que modificam o ADN

4.2.1 Nucleases e ligases 4.2.2 Topoisomerases e helicases 4.2.3 Polimerases

5 Recombinao gentica 6 Evoluo do metabolismo de ADN 7 Histria

o o o o

7.1 Descoberta 7.2 Elucidao da composio qumica 7.3 Descoberta da transformao 7.4 Experimento de Hershey-Chase

8 Aplicaes

o o o o o

8.1 Engenharia gentica 8.2 Medicina Forense 8.3 Bioinformtica 8.4 Nanotecnologia de ADN 8.5 Histria e antropologia

9 Ver tambm 10 Referncias 11 Bibliografia 12 Ligaes externas

Propriedades fsicas e qumicas[editar | editar cdigo-fonte]

Estrutura qumica do ADN.

O ADN um longo polmero formado por unidades repetidas chamadas nucleotdeos.1 2 A cadeia de ADN tem 2,2 a 2,4 nanmetros de largura, e um nucleotdeo possui aproximadamente 0,33 nanmetros de comprimento.3 Embora os monmeros (nucleotdeos) que constituem o ADN sejam muito pequenos, os polmeros de ADN podem ser molculas enormes, com milhes de nucleotdeos. Por exemplo, o maior cromossomo humano (cromossomo 1), possui 220 milhes de pares de bases de comprimento.4 Uma molcula de ADN do ser humano possui aproximadamente dois metros de comprimento, encapsulada em um ncleo celular de 6 m, o equivalente a acomodar uma linha de 40 km de comprimento em uma bola de tnis.1 Em organismos vivos, o ADN no existe como uma molcula nica (cadeia simples), mas sim como um par de molculas firmemente associadas.5 6As duas longas cadeias de ADN enrolam-se como uma trepadeira formando uma dupla hlice. Os nucleotdeos esto presentes em ambas as cadeias da dupla hlice, unidos com nucletidos da mesma cadeia por ligaes fosfodister e cadeia complementar atravs de pontes de hidrognio formadas pelas suas bases. Em geral, uma base ligada a um acar chamada nucleosdeo e uma base ligada a um acar e um ou mais fosfatos chamada nucleotdeo. Portanto, o ADN pode ser referido como um polinucleotdeo. 7

Uma cadeia de ADN.

A cadeia principal do ADN formada por fosfato e resduos de acar, dispostos alternadamente. O acar no ADN 2-desoxirribose, uma pentose (acar com cinco carbonos). Os acares so unidos por grupos fosfatoque formam ligaes fosfodiester entre o terceiro e quinto tomos de carbono dos anis de acar adjacentes. Estas ligaes assimtricas significam que uma cadeia de ADN tem uma direo. Numa dupla hlice, a direo dos nucleotdeos de uma cadeia oposta direo dos nucleotdeos da outra cadeia. O formato das cadeia do ADN designado antiparalelo. As terminaes assimtricas das cadeias de ADN so designadas terminais 5' (cinco linha) e 3' (trs linha). Uma das diferenas principais entre o ADN e o ARN encontra-se no acar, com a substituio da 2-desoxirribose no ADN pela ribose no ARN.1 A dupla hlice do ADN estabilizada por pontes de hidrognio entre as bases presas s duas cadeias. As quatro bases encontradas no ADN so a adenina(A), citosina (C), guanina (G) e timina (T). Estas quatro bases ligam-se ao acar/fosfato para formar o nucleotdeo completo.1 Estas bases so classificadas em dois tipos; a adenina e guanina so compostos heterocclicos chamados purinas, enquanto que a citosina e timina sopirimidinas. Uma quinta base (uma pirimidina) chamada uracila (U) aparece no ARN e substitui a timina, a uracila difere da timina pela falta de um grupo demetila no seu anel. A uracila normalmente no est presente no ADN, s ocorrendo como um produto da decomposio da citosina.1 Excees para esta regra so os fagos AR9, 3NT, I10, bem como o PBS1 (muito utilizado em pesquisas), que contm uracila no seu ADN, em vez de timina.8

No topo, pareamento GC com trs pontes de hidrognio. Em baixo, AT com duas pontes de hidrognio.

Emparelhamento de bases[editar | editar cdigo-fonte]

Cada tipo de base numa cadeia forma uma ligao com apenas um tipo de base na outra cadeia. Este comportamento designado de complementariedade de bases. Assim, as purinas formam pontes de hidrognio com pirimidinas, i.e. A liga-se com T e C com G. Este arranjo de dois nucleotdeos complementares na dupla hlice chamado par de bases. Alm das pontes de hidrognio entre as bases, as duas cadeias so mantidas juntas devido a foras geradas por interaes hidrofbicas entre as bases empilhadas, a qual no influenciada pela sequncia do ADN.9 Como as pontes de hidrognio no so ligaes covalentes, podem ser quebradas e reunidas com relativa facilidade. Desta forma, as duas fitas da dupla hlice de ADN podem ser separadas como um zper (fecho de correr) por fora mecnica ou altas temperaturas.10 Como resultado desta complementariedade, toda a informao contida numa das cadeias de ADN est tambm contida na outra, o que fundamental para a replicao do ADN.1 Os dois tipos de pares de base formam diferentes nmeros de pontes de hidrognio: AT forma duas pontes de hidrognio enquanto que GC formam trs pontes de hidrognio. Desta forma a interao entre GC mais forte que AT. Como resultado, a percentagem de GC numa dupla fita de ADN determina a fora de interao entre as duas cadeias.11 Uma parte da dupla cadeia de ADN que precisa de ser separada facilmente, tal como a TATAAT Caixa de Pribnow nos promotores bacterianos, tende a ter sequncias com maior predomnio de AT, para facilitar a abertura da dupla cadeia aquando da transcrio. No laboratrio, a fora desta interaco pode ser medida encontrando a temperatura necessria para quebrar as pontes de hidrognio, a temperatura de desnaturao (tambm chamado Tm). Quando todos os pares de base numa dupla hlice de ADN quebram as suas ligaes, as duas cadeias separam-se e existem em soluo como

duas molculas completamente independentes. Estas molculas de ADN de cadeia simples no tm uma nica forma comum, mas algumas conformaes so mais estveis do que outras.12

Sulcos[editar | editar cdigo-fonte]

O ADN normalmente encontra-se em forma de uma espiral dextrgira (gira para a direita, ou no sentido horrio). Portanto, as duas cadeias de nucleotdeos giram uma sobre a outra e acabam por formar sulcos entre as cadeias de fosfato, deixando expostas as faces das bases nitrogenadas que no esto unidas por pontes de hidrognio com a base complementar.13 H dois tipos de sulcos na superfcie da dupla hlice: um com 22 denominado sulco maior e um com 12 designado de sulco menor.14 A principal funo dos sulcos do ADN fornecer a informao acerca das bases que se encontram ligadas numa determinada regio da dupla cadeia sem necessidade de abertura. O sulco maior oferece maior acessibilidade para ligao com protenas do que o sulco menor. Um exemplo disto a TBP (TATA-binding protein) uma importante protena para a transcrio em eucariotas.15

Senso e antissenso[editar | editar cdigo-fonte]

Uma sequncia de ADN chamada de senso se possui a mesma sequncia do ARNm. A cadeia oposta (complementar) cadeia "senso" denominada sequncia antissenso. Como a ARN polimerase sintetiza um ARN que complementar fita molde, ento podemos dizer que ela utiliza a cadeia anti-senso como molde para produzir um ARN. As sequncias senso e anti-senso podem existir em diferentes partes da mesma cadeia de ADN, que pode ser de um lado ou do outro, dependendo de onde se encontra a sequncia codificadora. s vezes no possvel dizer qual a cadeia senso ou antissenso. Isto acontece devido existncia de genes que se sobrepem. Neste caso ambas as cadeias do origem a um ARN.16 Nasbactrias, a sobreposio pode estar envolvida da regulao da transcrio.17 Nos vrus, a sobreposio aumenta a capacidade do armazenamento de informaes em pequenos genomas virais.18

Superenrolamento[editar | editar cdigo-fonte]

O ADN pode ser torcido num processo denominado superenrolamento. No estado relaxado do ADN, uma fita normalmente d uma volta completa ao eixo da dupla hlice a cada 10,4 pares de base, mas se o ADN est torcido, as cadeias ficam mais ou menos enroladas.19 Se o ADN est torcido na direo da hlice, denominado um superenrolamento positivo e as bases esto unidas mais firmemente. J o superenrolamento negativo refere-se a uma toro na direo oposta, resultando num afrouxamento das bases. Na natureza, o ADN apresenta um ligeiro superenrolamento negativo que causado pela ao da enzima topoisomerase.20 Estas enzimas tambm so necessrias para aliviar o estresse de toro causado no ADN durante os processos de transcrio e replicao.21

Estrutura alternativa da dupla hlice[editar | editar cdigo-fonte]

Da direita para a esquerda, a estrutura do ADN A, B e Z.

O ADN pode existir em muitas formaes diferentes. As formaes mais comuns so: ADN-A, ADNB, ADN-C, ADN-D,22 ADN-E,23 ADN-H,24 ADN-L,22 ADN-P,25 e ADN-Z.26 Porm, s as formaes de ADN A, B e Z foram encontradas em sistemas biolgicos naturais. A formao que o ADN adopta depende de vrios fatores da prpria sequncia de ADN: a intensidade e direo do superenrolamento, modificaes qumicas das bases e a soluo na qual o ADN est presente (ex.: concentrao de metais, ies e poliaminas).27 Das trs formaes referidas, a forma B a mais comum nas condies encontradas nas clulas.28 A forma A corresponde espiral dextra mais larga, com um sulco menor largo e superficial e um sulco maior estreito e profundo. A forma A ocorre sob condies no fisiolgicas em amostras de ADN desidratadas, enquanto na clula pode ser produzida por pareamento hbrido de ADN e ARN ou pelo complexo enzima-ADN.29 30 Em segmentos de ADN onde as bases foram quimicamente modificadas por metilao, o ADN pode sofrer uma grande modificao na sua formao e adoptar a forma ADN-Z. A cadeia gira sobre o eixo da dupla hlice para a esquerda, o oposto da forma mais comum ADN-B.31 Esta estrutura rara e pode ser reconhecida por protenas especificas de ligao com o ADN-Z. Pode estar envolvida na regulao da transcrio.32

Estruturas em quadrplex[editar | editar cdigo-fonte]

Ver artigo principal: Quadrplex-G

Estrutura de um quadrplex de ADN formado por repeties telomricas. A conformao do esqueleto de ADN diferente da tpica estrutura helicoidal. 33

Nas extremidades do cromossomas lineares esto zonas especializadas do ADN chamadas telmeros. A funo principal destas regies permitir que a clula replique as extremidades do cromossoma usando a enzima telomerase, porque enzimas que permitem replicar ADN normalmente no conseguem copiar as extremidades 3' dos cromossomas.34 Estas tampas de cromossoma especializadas tambm ajudam a proteger as extremidades do ADN, e evitam que o sistema de reparao de ADN elimine estas regies como erros que precisassem de ser corrigidos.35 Em clulas humanas, os telmeros tm normalmente vrios milhares de repeties de uma sequncia simples (TTAGGG).36 Estas sequncias ricas em guanina podem estabilizar as extremidades dos cromossomas formando estruturas de unidades de quatro bases empilhadas, ao invs dos pares de base usuais encontrados em outras molculas de ADN. Quatro bases de guanina formam uma placa chata e depois estas unidades chatas de quatro bases empilham-se no topo umas das outras, para formarem estruturas quadrplex-G estveis.37 Estas estruturas so estabilizadas por pontes de hidrognio entre as margens das bases e por quelao de um io metlico no centro de cada unidade de quatro bases.38 Outras estruturas podem tambm ser formadas, com o conjunto central de quatro bases provenientes de uma cadeia simples enrolada volta das bases ou de diversas cadeias paralelas, cada uma contribuindo com uma base para a estrutura central.39 Alm destas estruturas empilhadas, os telmeros tambm formam grandes estruturas em forma de lao chamados telomere loops ou T-loops. O ADN de cadeia simples enrola-se volta de um crculo grande estabilizado por protenas que se ligam a telmeros.40 Mesmo no fim dos T-loops, o ADN de cadeia simples do telmero mantido sobre uma regio de ADN de cadeia dupla pela cadeia do telmero que desestabiliza o ADN de dupla hlice e o emparelhamento de bases de uma das duas cadeias. Esta estrutura de cadeia tripla chamada de lao de deslocamento ou D-loop.37

Modificaes qumicas[editar | editar cdigo-fonte]

citosina

5-metilcitosina

timina

Estrutura da citosina com e sem o grupo 5-metil. Depois de desaminao, a 5-metilcitosina tem a mesma estrutura da timina

Modificaes de bases[editar | editar cdigo-fonte]

Ver artigo principal: Metilao do ADN

A expresso de genes influenciado pela maneira como o ADN est disposto nos cromossomas, numa estrutura chamada cromatina. As modificaes de bases podem estar envolvidas na disposio, com as regies quem tem expresso gnica baixa ou inexistente contendo usualmente nveis elevados de metilao de citosina. Por exemplo, a metilao de citosina produz 5metilcitosina, que importante nainactivao do cromossoma X.41 O nvel mdio de metilao varia entre organismos - o verme Caenorhabditis elegans tem pouca metilao da citosina, enquanto que vertebrados tm nveis mais elevados, com at 1% do seu ADN contendo 5metilcitosina42 Apesar da importncia da 5-metilcitosina, esta pode desaminar transformando-se em timina. Citosinas metiladas so por isso especialmente susceptveis de sofrer mutaes.43 Outras modificaes de bases incluem metilao de adeninas em bactrias e glicosilao do uracilo para produzir a "base-J" em organismos da classe Kinetoplastida.44 45

Danos ao ADN[editar | editar cdigo-fonte]

Ver artigo principal: Mutao

Benzopireno, o maior mutagnio no fumo do tabaco, ligando-se ao ADN46

O ADN pode ser danificado por muitos tipos diferentes de mutagnios, que alteram a sequncia de ADN. Estes incluem agentes oxidantes, agentes alquilantes e tambm por radiao electromagntica de grande energia tal como luz ultravioleta e raios-X. O tipo de dano ao ADN produzido depende do tipo de mutagnio. A luz ultravioleta, por exemplo, pode danificar o ADN produzindo dmeros de timina, que so ligaes cruzadas entre pirimidinas.47 Por outro lado, oxidantes como radicais livres ou perxido de hidrognio produzem mltiplos tipos de danos, incluindo modificaes de bases, em particular guanosina, e quebras das cadeias duplas. 48 Em cada clula humana, cerca de 500 bases podem sofrer danos por oxidao por dia.49 50 As quebras da

cadeia dupla so leses oxidativas de difcil reparao, que podem produzir mutaes pontuais, inseres e deleces, assim como translocaes cromossmicas.51 Muitos mutagnios encaixam entre o espao entre dois pares de bases adjacentes, na chamada intercalao. A maioria dos intercaladores soaromticos e molculas planas e incluem brometo de etdio, daunomicina, doxorrubicina e talidomida. Para que um intercalador encaixe entre pares de bases, as bases tm de se separar, abrindo a cadeia dupla. Isto inibe a transcrio e a replicao do ADN, causando toxicidade e mutaes. Como resultado, os intercaladores de ADN so muitas vezes carcinognicos. Benzopireno, acridinas, aflatoxina e brometo de etdio so exemplos bem conhecidos.52 53 54 No entanto, devido sua capacidade de inibir a transcrio e replicao, estas toxinas tambm so usadas em quimioterapia para inibir o crescimento rpido de clulas tumorais.55

Funes biolgicas[editar | editar cdigo-fonte]

O ADN ocorre normalmente como cromossomas lineares em eucariotas e como cromossomas circulares em procariotas. O conjunto dos cromossomas numa clula perfazem o seu genoma; o genoma humano tem aproximadamente 3 mil milhes de pares de base dispostos em 46 cromossomas.56 A informao transportada pelo ADN est contida nas sequncias de ADN chamados genes. A transmisso da informao dos genes conseguida pela complementaridade do emparelhamento das bases. Por exemplo, na transcrio, quando uma clula usa a informao num gene, a sequncia de ADN copiado para uma sequncia de ARN complementar atravs da atraco entre o ADN e os nucleotdeos de ARN correctos. Esta cpia de ARN pode ser depois usada para compor uma sequncia proteica correspondente no processo de traduo, que depende da mesma interaco entre nucleotdeos de ARN. Alternativamente, uma clula pode simplesmente copiar a sua informao gentica num processo chamado replicao do ADN.

Genes e genomas[editar | editar cdigo-fonte]

Ver artigo principal: Ncleo celular, cromatina, cromossoma, gene, ADN no-codificante

T7 ARN polimerase (azul) produzindo um ARNm (verde) a partir de um molde de ADN (laranja). 57

O ADN genmico est localizado no ncleo celular dos eucariontes, assim como em pequenas quantidades em mitocndrias e em cloroplastos. Em procariontes, o ADN est dentro de um corpo

de forma irregular no citoplasma chamado nucleide.58 A informao gentica num genoma est nos genes, e o conjunto completo desta informao num organismo chamado o seu gentipo. Um gene a unidade bsica da hereditariedade e uma regio do ADN que influencia uma caracterstica particular num organismo. Genes contm uma fase aberta de leitura que pode ser transcrita, assim como sequncias reguladoras tais como promotores ou acentuassomos, que controlam a transcrio da fase aberta de leitura. Em muitas espcies, apenas uma pequena fraco da sequncia total do genoma codifica uma protena. Por exemplo, apenas 1,5% do genoma humano consiste de exes (que codificam protenas), com mais de 50% do ADN humano consistindo de sequncias repetitivas.59 As razes para a presena de tanto ADN no-codificante em genomas eucariticos e as extraordinrias diferenas no tamanho do genoma, ou valor C, entre espcies representam um enigma conhecido por enigma do valor C.60 Contudo, sequncias de ADN que no codificam protenas podem ainda codificar molculas de ARN no-codificante funcional, que esto envolvidas na regulao da expresso gnica.61 Algumas sequncias de ADN no-codificante tm um papel estrutural nos cromossomas. Os telmeros e centrmeros contm tipicamente poucos genes, mas so importantes para a funo e estabilidade dos cromossomas.35 62 Uma forma abundante de ADN no codificante em humanos so ospseudogenes, que so cpias de genes que foram desabilitados por mutao.63 Estas sequncias so usualmente apenas fsseis moleculares, apesar de poderem servir ocasionalmente como material gentico em bruto para a criao de novos genes atravs do processo de duplicao de genes e divergncia.64

Transcrio e traduo[editar | editar cdigo-fonte]

Ver artigo principal: Cdigo gentico, transcrio (gentica), sntese proteica

Replicao de ADN. A dupla hlice desdobrada por uma helicase e por umatopoisomerase. Em seguida, uma ADN polimerase produz uma cpia da cadeia lder. Outra ADN polimerase liga-se cadeia atrasada. Esta enzima produz segmentos descontnuos (chamados fragmentos de Okazaki) antes de a ADN ligase os juntar.

Um gene uma sequncia de ADN que contm informao gentica e pode influenciar o fentipo de um organismo. Dentro de um gene, a sequncia de bases ao longo de uma cadeia de ADN definem uma cadeia de ARN mensageiro, que por sua vez define uma ou mais sequncias proteicas. A relao entre a sequncia de nucletidos de um gene e a sequncia de aminocidos de uma protena determinada pelas regras de traduo, conhecidas colectivamente como o cdigo

gentico. O cdigo gentico consiste de 'palavras' de trs letras chamadas codes formadas por uma sequncia de trs nucletidos (p.e. ACU, CAG, UUU).65 Na transcrio, os codes de um gene so copiados para um ARN mensageiro pela ARN polimerase. Esta cpia de ARN depois descodificada por um ribossoma que l a sequncia de ARN emparelhando o ARN mensageiro com o ARN de transferncia, que carrega aminocidos. Uma vez que h quatro bases em combinaes de 3 letras, h 64 codes possveis ( combinaes). Estas codificam os vinte aminocidos, dando maioria dos aminocidos mais do que um codo possvel. H tambm trs codes 'stop' ou 'nonsense' significando o fim da regio codificante; estes so os codes UAA, UGA e UAG.66

Replicao[editar | editar cdigo-fonte]

Ver artigo principal: Replicao do ADN A diviso celular essencial para que um organismo cresa, mas quando uma clula se divide tem de replicar o ADN do seu genoma para que as duas clulas-filha tenham a mesma informao gentica que a clula parental. A estrutura em dupla-hlice do ADN fornece um mecanismo simples para a sua replicao. As duas cadeias so separadas e sequncias de ADN complementares a cada uma das cadeias so recriadas por uma enzima chamada ADN polimerase. Esta enzima constri a cadeia complementar encontrando a base correcta atravs de emparelhamento com a base complementar, e ligando-a cadeia original. Como as polimerases de ADN s conseguem fazer a extenso de uma cadeia de ADN na direco 5' para 3', outros mecanismos so usados para copiar a cadeia antiparalela da dupla hlice.67 Desta forma, a base presente na cadeia antiga determina que base vai aparecer na nova cadeia e a clula acaba com uma cpia perfeita do seu ADN.

Interaces com protenas[editar | editar cdigo-fonte]

Todas as funes do ADN dependem de interaces com protenas. Estas interaces com protenas podem ser no-especficas, ou a protena pode ligar-se especificamente a uma nica sequncia de ADN. Algumas enzimas tambm se podem ligar ao ADN. Destas, as polimerases que copiam as sequncias de ADN na transcrio e replicao so particularmente importantes.

Protenas que se ligam ao ADN (DNA-binding)[editar | editar cdigofonte]

Interaco do ADN com histonas (mostrado em branco, em cima). Os aminocidos bsicos destas protenas (em baixo esquerda, em azul) liga-se aos grupos fosfato do ADN (em baixo direita, em vermelho).

Protenas estruturais que se ligam ao ADN so exemplos bem estudados de interaces noespecficas ADN-protenas. Nos cromossomas, o ADN est ligado a protenas estruturais formando complexos. Estas protenas organizam o ADN numa estrutura compacta, a cromatina. Em eucariontes esta estrutura envolve a ligao do ADN a um complexo de pequenas protenas bsicas chamadas histonas, enquanto que em procariontes esto envolvidas vrios tipos de protenas.68 69 As histonas formam um complexo em forma de disco, o nucleossoma, que contm duas voltas completas de ADN de cadeia dupla sua volta. Estas interaces no-especficas formam-se quando os resduos bsicos das histonas fazem ligaes inicas ao esqueleto acarfosfato acdico do ADN, e por isso so largamente independentes da sequncia de bases.70 Modificaes qumicas nestes resduos de amino-cidos incluem metilao, fosforilao e acetilao.71 Estas mudanas qumicas alteram a fora da interaco entre o ADN e as histonas, tornando o ADN mais ou menos acessvel a factores de transcrio e mudando a taxa de transcrio.72 Outras protenas com ligao a ADN no-especficas incluem o grupo de protenas de alta mobilidade, que se ligam a ADN dobrado ou distorcido. 73 Estas protenas so importantes pois dobram conjuntos de nucleossomas e organizam-nos em estruturas maiores que constituem os cromossomas.74 Um grupo distinto destas protenas so as que se ligam especificamente a ADN de cadeia simples. Nos humanos, a protena de replicao A o membro desta famlia mais bem compreendido e usado em processos onde a dupla hlice separada, incluindo durante a replicao do ADN, recombinao e reparo.75 Estas protenas parecem estabilizar ADN de cadeia dupla e protegem-no da formao de hairpin loops e da degradao por nucleases.

O factor de transcrio do hlice-volta-hlice lambda repressor ligado ao seu alvo de ADN. 76

Em contraste, outras protenas evoluram de modo a ligar-se a sequncias de ADN especficas. Os factores de transcrio so dos mais intensivamente estudados (protenas que regulam a transcrio). Cada factor de transcrio liga-se a um conjunto particular de sequncias de ADN e activa ou inibe a transcrio de genes que tenham estas sequncias perto dos seus promotores. Os factores de transcrio fazem isto de duas maneiras. Primeiro, podem ligar-se polimerase do ARN responsvel pela transcrio, quer directamente quer atravs de protenas mediadoras; isto posiciona a polimerase no promotor e permite que comece a transcrio.77 Em alternativa, os factores de transcrio podem ligar-se a enzimas que modificam as histonas no promotor; isto muda a acessibilidade do molde de ADN polimerase.78 Como estes locais de ligao podem ocorrer pelo genoma inteiro de um organismo, mudanas na actividade de um tipo de factor de transcrio pode afectar milhares de genes.79 Por consequncia, estas protenas so muitas vezes alvo de processos de transduo de sinal que controlam respostas a mudanas ambientais ou diferenciao e desenvolvimento celular. A especificidade da interaco destes factores de transcrio com o ADN provm das protenas que fazem contactos mltiplos com a extremidade das bases de ADN, permitindo a leitura da sequncia de ADN. A maior parte destas interaces com bases faz-se no sulco maior, onde as bases esto mais acessveis.80

Enzimas que modificam o ADN[editar | editar cdigo-fonte]

Nucleases e ligases[editar | editar cdigo-fonte]

A enzima de restrio EcoRV (verde) num complexo com o seu ADN substrato.81

As nucleases so enzimas que cortam as cadeias de ADN mediante a catlise da hidrlise das ligaes fosfodister. As nucleases que hidrolisam nucletidos a partir dos extremos das cadeias de ADN denominam-se exonucleases, enquanto que as endonucleases cortam no interior das cadeias. As nucleases que se utilizam com maior frequncia em biologia molecular so as enzimas de restrio, endonucleases que cortam o ADN em sequncias especficas. Por exemplo, a enzima EcoRV, mostrada esquerda, reconhece a sequncia de 6 bases 5-GAT|ATC-3 e faz um corte em ambas as cadeias na linha vertical indicada, gerando duas molculas de ADN. Outras enzimas de restrio geram, no entanto, extremidades coesivas, j que cortam de forma diferente as duas cadeias de ADN. Na natureza, estas enzimas protegem as bactrias contra as infeces de fagos, ao digerir o ADN do fago quando entra atravs da parede bacteriana, actuando como um mecanismo de defesa.82 Em biotecnologia, estas nucleases especficas utilizam-se naclonagem molecular e na tcnica de impresso de ADN ( fingerprinting, em ingls). As enzimas denominadas ADN ligases podem reunir pedaos de ADN cortados ou quebrados.83 As ligases so particularmente importantes nareplicao do ADN da cadeia atrasada de ADN, j que unem os fragmentos curtos de ADN gerados no garfo de replicao para formar uma cpia completa do molde de ADN. Tambm se utilizam no reparo de ADN e na recombinao gentica.83

Topoisomerases e helicases[editar | editar cdigo-fonte]

As topoisomerases so enzimas que possuem actividade de nuclease e ligase. Estas protenas mudam a quantidade de ADN superenrolado. Algumas destas enzimas funcionam cortando a hlice de ADN e permitindo a uma seco que faa rotao, de maneira a reduzir o grau de superenrolamento; uma vez feito isto, a enzima volta a unir os fragmentos de ADN.20 Otros tipos de enzimas so capazes de cortar uma hlice de ADN e depois passar a segunda cadeia de ADN atravs desta quebra, antes de reunir as hlices.84 As topoisomerases so necessrias para muitos processos em que intervm o ADN, como a replicao e a transcrio.21 As helicases so protenas que pertencem ao grupo dos motores moleculares. Utilizam energia qumica armazenada nos trifosfatos de nuclesidos, fundamentalmente ATP, para romper pontes de hidrgeno entre bases e separar a dupla hlice de ADN em cadeias simples. Estas enzimas so

essenciais para a maioria dos processos em que as enzimas necessitam de aceder s bases do ADN.85

Polimerases[editar | editar cdigo-fonte]

As polimerases so enzimas que sintetizam cadeias de nucletidos a partir de trifosfatos de nuclesidos. A sequncia de seus produtos so cpias de cadeias de polinucletidos existentes, que se denominam moldes. Estas enzimas funcionam adicionando nucletidos ao grupo hidrxilo em 3' do nucletido anterior numa cadeia de ADN. Por consequncia, todas as polimerases funcionam na direco 5 3.86 Nos stios activos destas enzimas, o trifosfato de nuclesido que se incorpora emparelha a sua base com a correspondente no molde: isto permite que a polimerase sintetize de forma precisa a cadeia complementar ao molde. As polimerases classificam-se de acordo com o tipo de molde que utilizam:

Na replicao do ADN, uma ADN polimerase dependente de ADN realiza uma cpia de ADN a partir de uma sequncia de ADN. A preciso vital neste processo, por isso muitas destas polimerases possuem uma actividade de verificao de leitura (proofreading). Mediante esta actividade, a polimerase reconhece erros ocasionais na reaco de sntese, devido falta de emparelhamento entre o nucletido errneo e o molde, o que gera um desacoplamento (mismatch). Se se detecta um desacoplamento, activa-se uma actividade exonuclease na direco 3 5 e a base incorrecta eliminada.87 Na maioria dos organismos, as ADN polimerases funcionam num grande complexo denominado replissoma, que contm mltiplas unidades acessrias, como helicases.88

As ADN polimerases dependentes de ARN so uma classe especializada de polimerases que copiam a sequncia de uma cadeia de ARN em ADN. Incluem a transcriptase reversa, que uma enzima viral implicada na infeco de clulas por retrovrus, e a telomerase, que necessria para a replicao dos telmeros.34 89 A telomerase uma polimerase inusual, porque contm o seu prprio molde de ARN como parte da sua estrutura.35

A transcrio levada a cabo por uma ARN polimerase dependente de ADN que copia a sequncia de uma das cadeias de ADN em ARN. Para comear a transcrever um gene, a ARN polimerase une-se a uma sequncia do ADN denominada promotor, e separa as cadeias de ADN. Ento

copia a sequncia do gene num transcrito de ARN mensageiro at que alcana uma regio do ADN denominada terminador, onde se detm e se separa do ADN. Como ocorre com as ADN polimerases dependentes de ADN em humanos, a ARN polimerase II (a enzima que transcreve a maioria dos genes do genoma humano) funciona como um grande complexo multiproteco que contm mltiplas subunidades reguladoras e accessrias.90

Recombinao gentica[editar | editar cdigo-fonte]

Estrutura de um intermedirio em juno de Holliday na recombinao gentica. A quatro cadeias de ADN separadas esto coloridas em vermelho, azul, verde e amarelo.
91

Ver artigo principal: Recombinao gentica

A recombinao implica a rotura e reunio de dois (M e F) para produzir dois cromossomas novos, reorganizados (C1 e C2).

Uma hlice de ADN normalmente no interage com outros segmentos de ADN. Nas clulas humanas os diferentes cromossomas ocupam reas separadas no ncleo celular denominadas territrios cromossmicos.92 A separao fsica dos diferentes cromossomas importante para que o ADN mantenha a sua capacidade de funcionar como um armazm estvel de informao. Um dos poucos momentos em que os cromossomas interagem durante o sobrecruzamento cromossmico(chromosomal crossover, em ingls), durante o qual se recombinam. O sobrecruzamento cromossmico ocorre quando duas hlices de ADN se rompem, sofrem intercmbio e se unem novamente.93 A recombinao permite aos cromossomas trocar informao gentica e produzir novas combinaes de genes, o que aumenta a eficincia da seleco natural e pode ser importante na evoluo rpida de novas protenas.94 Durante a profase I da meiose, uma vez que os cromossomas homlogos esto perfeitamente emparelhados formando estruturas que se denominam bivalentes, produz-se o fenmeno de sobrecruzamento ou entrecruzamento (crossing-over), no qual os cromatdeos homlogos no irmos (procedentes do pai e da me) trocam material gentico. A recombinao gentica resultante faz aumentar em grande medida a variao gentica entre a descendncia de progenitores que se reproduzem por via sexual. A recombinao gentica tambm pode estar implicada na reparao do ADN, em particular na resposta celular s roturas da dupla cadeia (double-strand breaks).95 A forma mais frequente de sobrecruzamento cromossmico a recombinao homloga, na qual os dois cromossomas implicados compartilham sequncias muito similares. A recombinao nohomloga pode ser danosa para as clulas, j que pode produzir translocaes cromossmicase anormalidades genticas. A reaco de recombinao catalisada por enzimas conhecidas como recombinases, tais como a RAD51.96 O primeiro passo no processo de recombinao uma rotura da dupla cadeia, causada por uma endonuclease ou por dano no ADN.97Posteriormente, uma srie de passos catalisados em parte pela recombinase conduz unio das duas hlices formando pelo menos uma juno de Holliday, na qual um segmento de uma cadeia simples anelada com a cadeia complementar na outra hlice. A juno de Holliday uma estrutura de unio tetradrica que pode mover-se ao longo do par de cromossomas, intercambiando uma cadeia por outra. A reaco de recombinao detm-se pelo corte da unio e a reunio dos segmentos de ADN libertados.98

Evoluo do metabolismo de ADN[editar | editar cdigo-fonte]

Ver artigo principal: Hiptese do mundo de ARN O ADN contm a informao gentica que permite maioria dos organismos vivos funcionar, crescer e reproduzir-se. No entanto, desconhece-se o intervalo de tempo durante o qual ele exerceu

esta funo nos ~3000 milhes de anos desde a histria da vida, j que se props que as formas de vida mais precoces poderiam ter utilizado ARN como material gentico.86 99 O ARN poderia ter funcionado como parte central de um metabolismo primordial, j que pode transmitir informao gentica e simultaneamente actuar como catalisador, formando parte das ribozimas.100 Este antigo mundo de ARN onde os cidos nucleicos funcionariam como catalisadores e como armazns de informao gentica, poderia ter influenciado na evoluo do cdigo gentico actual, baseado em quatro nucletidos. Isto se deveria a que o nmero de bases nicas num organismo determinado entre um nmero pequeno de bases (o que aumentaria a preciso da replicao) e um nmero grande de bases (que por sua vez aumentaria a eficincia cataltica das ribozimas).101 Infelizmente, no dispomos de evidncia directa dos sistemas genticos ancestrais, porque a recuperao do ADN a partir da maior parte dos fsseis impossvel. O ADN capaz de sobreviver no meio ambiente durante menos de um milho de anos, e logo comea a degradar-se lentamente em fragmentos de menor tamanho em soluo.102 Algumas investigaes pretendem a obteno de ADN mais antigo, como no caso do isolamento de uma bactria vivel a partir de um cristal salino de 250 milhes de anos de antiguidade,103 mas estes dados so controversos.104105 No entanto, podem utilizar-se ferramentas de evoluo molecular para inferir os genomas de organismos ancestrais a partir de organismos contemporneos.106 107 Em muitos casos, estas inferncias so suficientemente fiveis, de maneira que uma biomolcula codificada num genoma ancestral pode ser ressuscitada no laboratrio para ser estudada hoje.108 109 Uma vez recomposta a biomolcula ancestral, suas propriedades poderiam oferecer informaes sobre os ambientes primordial, remetendo ao campo emergente da paleogentica experimental.110Apesar de tudo, o processo de trabalho retrospectivo tem limitaes inerentes, razo pela qual outros investigadores tentam elucidar o mecanismo evolutivo trabalhando desde a origem da Terra at adiante no tempo. Dada suficiente informao sobre como as substncias csmicas poderiam haver-se depositado na Terra e sobre as transformaes que poderiam ter tido lugar na superfcie terrestre, talvez poderamos ser capazes de desenvolver modelos prospectivos de evoluo da informao gentica.

Histria[editar | editar cdigo-fonte]

Ver artigo principal: Histria do estudo do ADN

Descoberta[editar | editar cdigo-fonte]

Friedrich Miescher.

A histria do ADN comea no final da dcada de 1860, com a chegada do mdico suo Friedrich Miescher (1844-1895) Universidade de Tbingen, uma pacata cidade no sul da Alemanha. O jovem pesquisador estava disposto dedicar-se ao estudo da qumica da clula e escolheu essa universidade porque nela o qumico Felix Hoppe-Seyler (1825-1895) havia inaugurado um importante laboratrio de qumica fisiolgica. Na poca floresciam ideias a respeito das origens e funes das clulas, aps a queda da teoria da gerao espontnea. A teoria celular estabelecia-se como um dos pilares da Biologia. Por tudo isso, as clulas atraam a ateno de estudantes entusiasmados, como Miescher.111 Felix Hoppe-Seyler foi quem primeiro descreveu as interaes entre a hemoglobina, a protena responsvel pela cor do sangue, e o gs oxignio. Seu trabalho levou-o a interessar-se pela composio bioqumica dos linfcitos. Mas Miescher enfrentou dificuldades para obter amostras com linfcitos em quantidade e grau de pureza adequados. Por sugesto de Hoppe-Seyler, Miescher comeou a estudar a qumica das clulas do pus; o material para a pesquisa era abundante, pois dezenas de bandagens com material purulento eram diariamente descartadas por um hospital prximo universidade. Miescher desenvolveu tcnicas adequadas para o isolamento das clulas presentes em pus das bandagens e para a sua anlise qumica. O objetivo inicial era investigar as protenas celulares, um grupo de substncias descoberto cerca de trinta anos antes.111 Em um dos seus muitos experimentos com clulas do pus, Miescher obteve um precipitado que diferia quimicamente de todas as substncias proticas conhecidas. Ele descobriu que a nova substncia concentrava-se no ncleo celular, na poca considerado uma estrutura de pouca importncia para o funcionamento celular. Aprimorando os mtodos de extrao e purificao da nova substncia, Miescher pde realizar uma anlise qumica mais precisa, que mostrou que as quantidades relativas de hidrognio, carbono, oxignio e nitrognio presentes diferiam das

encontradas em protenas, alm de uma quantidade incomum de fsforo. substncia descoberta Miescher denominou nuclena, pelo fato de ela estar concentrada no ncleo das clulas.111 O trabalho sobre nuclena s foi publicado em 1871, aps certa resistncia do editor da revista cientfica, o prprio Hoppe-Seyler, que, no incio, no acreditou nos resultados apresentados por Miescher. Mesmo depois da publicao do trabalho, muitos pesquisadores continuaram duvidando da existncia da nuclena; na opinio deles, o achado de Miescher devia ser uma mistura de fosfato inorgnico e protenas.111 112

Elucidao da composio qumica[editar | editar cdigo-fonte]

As desconfianas quanto real existncia da nova substncia descrita por Miescher s foram superadas por volta de 1889, quando Richard Altmann (1852-1900) obteve preparaes altamente purificadas de nuclena, sem nenhuma contaminao por protenas. Pelo fato de a substncia ter carter cido, o que j havia sido detectado por Miescher, Altmann sugeriu que ela fosse chamada de cido nuclico em vez de nuclena.113 Outro pesquisador pioneiro na descoberta foi Albrecht Kossel (1853-1927). Em 1877, ele juntou-se ao grupo de pesquisa de Hoppe-Seyler, ento trabalhando na Universidade de Estrasburgo (Frana), e comeou a estudar a composio qumica das nuclenas. Kossel detectou dois tipos de bases nitrogenadas j conhecidas, a adenina e a guanina. Em 1893, identificou uma nova base nitrogenada, que era liberada pela degradao de nuclena da clulas do timo; por isso denominoua timina. Logo em seguida, descobriu que a nuclena continha um quarto tipo de base nitrogenada, a qual denominou citosina.114 Em 1894, o grupo liderado por Kossel descobriu que os cidos nucleicos continham tambm pentose, um acar com cinco tomos de carbono.115Em reconhecimento s suas contribuies na rea, foi agraciado em 1910 com o Nobel de Fisiologia ou Medicina.116 Em 1909, Phoebus Levene e Walter Abraham Jacobs (1883-1967) conseguiram determinar a organizao das molculas de fosfato, de pentose e base nitrogenada no cido nucleico.117 Esses trs componentes esto unidos entre si formando uma unidade fundamental, o nucleotdeo. Em 1929, Levene e colaboradores identificaram pentoses componente do cido nucleico das clulas do timo, que denominaram 2-deoxi-D-ribose, pelo fato de ela possuir, no carbono 2 de sua cadeia, um tomo de oxignio a menos que a ribose, uma pentose j conhecida, encontrada pelos pesquisadores em dois tipos de cidos nuclicos: o cido ribonucleico, ou ribose, e o cido desoxirribonuclico, ou ADN, cujo acar a desoxirribose.118 119

Descoberta da transformao[editar | editar cdigo-fonte]

Frederick Griffith em 1936.

Frederick Griffith fez uma importante observao no curso dos experimentos com a bactria Streptococcus pneumoniae em 1928. Esta bactria, que causa pneumonia em humanos, normalmente letal em camundongos. Entretanto algumas linhagens desta espcie de bactrias eram menos virulentas (menos capazes de causar doenas ou morte). Nos experimentos de Griffith, ele usou duas linhagens distinguveis pelas suas colnias quando cultivadas em laboratrio. Uma linhagem era um tipo normalmente virulento e mortal para a maioria dos animais de laboratrio. As clulas desta linhagem esto envoltas em uma cpsula de polissacardeo, dando s colnias em aspecto liso, sendo esta linhagem identificada com S(smooth, em ingls). A outra linhagem de Griffith era um tipo mutante no virulento que crescia em camundongos. Nesta linhagem, a capa de polissacardeo est ausente, dando s colnias um aspecto rugoso. Esta linhagem chamada R (rough, em ingls).120 Griffith inativou algumas clulas virulentas a alta temperatura. Injetou ento as clulas mortas por aquecimento nos camundongos. Os camundongos sobreviveram, mostrando que os restos das clulas no causam morte. Entretanto os camundongos injetados com uma mistura de clulas virulentas mortas por aquecimento e clulas no virulentas vivas morreram. Alm disso, as clulas vivas podiam ser recuperadas de camundongos mortos. Estas clulas deram colnias lisas e foram virulentas em uma injeo subsequente. De algum modo, os restos das clulas S aquecidas haviam convertido clulas R vivas em clulas S vivas.121

Streptococcus pneumoniae.

A etapa seguinte era determinar que componente qumico das clulas doadoras mortas havia causado esta converso. Esta substncia tinha mudado o gentipo da linhagem receptora e portanto podia ser uma candidata a material gentico. Este problema foi resolvido pelos experimentos feitos em 1944 por Oswald Avery e dois colegas, C M. Macleod e M. McCarty. Seu enfoque ao problema foi destruir quimicamente todas as principais categorias de substncias no extrato de clulas mortas, uma de cada vez, e descobrir se o extrato havia perdido a habilidade de converso. As clulas virulentas possuam uma capa lisa de polissacardeo, enquanto as clulas no virulentas, no. Assim os polissacardeos eram um candidato bvio a ser o agente responsvel. Entretanto, quando os polissacardeos foram destrudos, a mistura ainda era capaz de converso. As protenas, gorduras e cido ribonucleico (ARN) foram todos excludos. A mistura s perdia a sua capacidade de converso quando a mistura doadora era tratada comenzima desoxirribonuclease (DNase), que quebra o ADN. Estes resultados indicavam fortemente que o ADN era o material gentico. Hoje sabemos que os fragmentos do ADN transformante que conferem virulncia entram no cromossomo bacteriano e substituem suas contrapartes que conferem no-virulncia.122

Experimento de Hershey-Chase[editar | editar cdigo-fonte]

Ver artigo principal: Experincia de HersheyChase

Estrutura do fago T2.

Os experimentos feitos por Avery e seus colegas foram definitivos, mas muitos cientistas mostraram-se muito relutantes em aceitar o ADN (e no as protenas) como material gentico.113 Evidncias adicionais foram publicadas em 1952 por Alfred Day Hershey e Martha Chase, cujo experimento com o fago T2, um vrus que transfecta na bactria a informao

especfica para a reproduo viral. Se eles pudessem descobrir que material o fago transmitia bactria hospedeira, determinariam o material gentico do fago.123 O fago tem uma constituio molecular relativamente simples. A maior parte de sua estrutura de protena, com o ADN contido dentro da capa de protena de sua "cabea". Hershey e Chase decidiram marcar o ADN e a protena usando radioistopos, de modo que pudessem rastrear os dois materiais durante a infeco. O fsforo no encontrado nas protenas mas uma parte integrante do ADN. Contrariamente, o enxofre est presente nas protenas mas nunca no ADN. Hershey e Chase incorporaram o radioistopo de fsforo (32P) no ADN do fago e o enxofre (35S) nas protenas de uma cultura separada de fagos. Eles ento infectaram duas culturas de E. coli com muitas partculas de vrus por clulas: uma cultura de E. colirecebeu fagos marcados com 32P e a outra recebeu fagos marcados com 35S. Decorrido tempo suficiente para que ocorresse a infeco, os cientistas removeram as embalagens de fago (chamadas ghosts) das clulas bacterianas por agitao em um liquidificador. Eles separaram as clulas bacterianas dos envoltrios dos fagos em umacentrfuga e ento mediram a radioatividade nas duas fraes. Quando o fago marcado com 32P foi usado para infectar E. coli, a mais alta radioatividade foi encontrada dentro das bactrias, indicando que o ADN do fago havia entrado nas clulas. Quando era usado o fago marcado com 35S, maior parte do material radioativo estava nos invlucros dos fagos, indicando que a protena do fago nunca entrava nas bactrias. A concluso era inevitvel: o ADN era o material hereditrio. As protenas do fago eram apenas embalagens estruturais abandonadas aps o ADN viral entrar na bactria.123

Aplicaes[editar | editar cdigo-fonte]

Engenharia gentica[editar | editar cdigo-fonte]
Ver artigo principal: Engenharia gentica, biologia molecular A investigao sobre o ADN tem um impacto significativo, especialmente no mbito da medicina, mas tambm na agricultura e pecuria, com objectivos de domesticao, seleco e de cruzamentos dirigidos. A moderna biologia e bioqumica fazem uso intensivo da tecnologia do ADN recombinante, introduzindo genes de interesse em organismos, com o objectivo de expressar uma protena recombinante concreta, que pode ser:

isolada para seu uso posterior: por exemplo, podem-se transformar microorganismos para produzir grandes quantidades de substncias teis, como a insulina, que posteriormente se isolam e se utilizam em terapias.124 125 126

necessria para substituir a expresso de um gene endgeno danificado que seja causador de uma patologia, o que permitiria o restabelecimento da actividade da protena perdida e eventualmente a recuperao do estado fisiolgico normal, no

patolgico. Este o objectivo da terapia gentica, um dos campos em que se est a trabalhar activamente em medicina, analisando vantagens e inconvenientes de diferentes sistemas de administrao do gene (virais e no virais) e os mecanismos de seleco do ponto de integrao dos elementos genticos (distintos para os vrus e transposes) no genoma alvo.127 Neste caso, antes de apresentar-se a possibilidade de realizar uma terapia gnica numa determinada patologia, fundamental compreender o impacto do gene de interesse no desenvolvimento de dita patologia, para o qual necessrio o desenvolvimento de um modelo animal, eliminando ou modificando dito gene num animal de laboratrio, mediante a tcnica nocaute.128 S no caso de os resultados no modelo animal serem satisfatrios poder ser analisada a possibilidade de restabelecer o gene danificado mediante terapia gnica.

utilizada para enriquecer um alimento: por exemplo, a composio do leite (que uma importante fonte de protenas para o consumo humano e animal) pode modificar-se mediante transgnese, adicionando genes exgenos e inactivando genes endgenos para melhorar o seu valor nutricional, reduzir infeces nas glndulas mamrias, proporcionar aos consumidores protenas antipatognicas e preparar protenas recombinantes para o uso farmacutico.129 130

til para melhorar a resistncia do organismo transformado: por exemplo, em plantas podem-se introduzir genes que conferem resistncia a agentes patognicos (vrus, insectos, fungos), assim como a agentes estressantes abiticos (salinidade, seca, metais pesados).131 132 133

Medicina Forense[editar | editar cdigo-fonte]

A Medicina Forense pode utilizar o ADN presente no sangue, no smen, na pele, na saliva ou em pelos existentes na cena de um crime para identificar o responsvel. Esta tcnica denominaseimpresso gentica ou perfil de ADN. Ao realizar a impresso gentica, compara-se o comprimento de seces altamente variveis do ADN repetitivo, como os microssatlites, entre pessoas diferentes. Este mtodo muito fivel para identificar um criminoso.134 No entanto, a identificao pode complicar-se se a cena do crime estiver contaminada com ADN de pessoas diferentes.135 A tcnica da impresso gentica foi desenvolvida em 1984 pelo geneticista britnico Sir Alec Jeffreys,136 e utilizada pela primeira vez para condenar Colin Pitchfork por causa dos assassinatos de Narborough (Reino Unido) em 1983 e 1986.137 Pode-se requerer s pessoas

acusadas de certos tipos de crimes que cedam una amostra de ADN para ser introduzida numa base de dados. Isto tem facilitado o trabalho dos investigadores na resoluo de casos antigos, onde s se obteve uma amostra de ADN da cena do crime, em alguns casos permitindo exonerar um convicto. A impresso gentica tambm pode ser utilizado para identificar vtimas de acidentes em massa,138 ou para realizar provas de consanguinidade.139

Bioinformtica[editar | editar cdigo-fonte]

Ver artigo principal: Bioinformtica A Bioinformtica implica a manipulao, busca e extraco de informao dos dados da sequncia do ADN. O desenvolvimento das tcnicas para armazenar e procurar sequncias de ADN gerou avanos no desenvolvimento de software para computadores, com muitas aplicaes, especialmente algoritmos de busca de frases, aprendizagem automtica e teorias de bases de dados.140 A busca de frases ou algoritmos de coincidncias, que procuram a ocorrncia de uma sequncia de letras dentro de uma sequncia de letras maior, desenvolveu-se para buscar sequncias especficas de nucletidos.141 Em outras aplicaes como editores de textos, inclusive algoritmos simples podem funcionar, mas as sequncias de ADN podem gerar que estes algoritmos apresentem um comportamento de quase o pior caso, devido ao baixo nmero de carcteres. O problema relacionado do alinhamento de sequncias procura identificar sequnciashomlogas e localizar mutaes especficas que as diferenciam. Estas tcnicas, fundamentalmente o alinhamento mltiplo de sequncias, utilizam-se ao estudar as relaes filogenticas e a funo das protenas.142 As coleces de dados que representam sequncias do ADN do tamanho de um genoma, tais como as produzidas pelo Projecto Genoma Humano, so difceis de utilizar sem notaes que marcam a localizao dos genes e dos elementos reguladores em cada cromossoma. As regies de ADN que tm padres associados com genes codificantes de protenas ou ARN podem identificar-se por algoritmos de localizao de genes, o que permite aos investigadores predizer a presena de produtos gnicos especficos num organismo mesmo antes que se tenha isolado experimentalmente.143

Nanotecnologia de ADN[editar | editar cdigo-fonte]

Ver artigo principal: Nanotecnologia A nanotecnologia de ADN utiliza as propriedades nicas de reconhecimento molecular de ADN e outros cidos nucleicos para criar complexos ramificados auto-ensamblados com propriedades teis. Neste caso, o ADN utiliza-se como um material estrutural, mais que como um portador de informao biolgica.144 Isto conduziu criao de lminas peridicas de duas dimenses (ambas baseadas em azulejos, assim como usando o mtodo de "ADN origami"), para alm de estruturas em trs dimenses em forma de poliedros.145

Histria e antropologia[editar | editar cdigo-fonte]

Ver artigo principal: Filogenia, Genealogia molecular

O ADN armazena mutaes conservadas com o tempo e portanto contm informao histrica. Comparando sequncias de ADN, os geneticistas podem inferir a histria evolutiva dos organismos, a sua filogenia.146 O campo da filogenia uma ferramenta potente na biologia evolutiva. Se se compararem as sequncias de ADN dentro de uma espcie, os geneticistas de populaes podem conhecer a histria de populaes particulares. Isto pode-se utilizar numa ampla variedade de estudos, desde ecologia at antropologia; por exemplo, evidncia baseada na anlise de ADN est a ser utilizada para identificar as Dez Tribos Perdidas de Israel.147 148

Ver tambm[editar | editar cdigo-fonte]

cido ribonucleico Exo Gene Intro Protena Sequncia de ADN Transcrio

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Bibliografia[editar | editar cdigo-fonte]

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Ligaes externas[editar | editar cdigo-fonte]

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The Secret Life of DNA - DNA Music compositions (em ingls) The Register of Francis Crick Personal Papers 1938 2007 (em ingls) na Mandeville Special Collections Library, Geisel Library, University of California, San Diego

DNA Interactive (em ingls) Stio do Dolan DNA Learning Center que inclui dezenas de animaes assim como entrevistas com James Watson e outros (requer Adobe Flash)

DNA from the Beginning (em ingls) Stio da DNA Learning Center sobre DNA, genes e hereditariedade desde Mendel at ao Projecto Genoma Humano

Double Helix 19532003 (em ingls) National Centre for Biotechnology Education

Double helix: 50 years of DNA (em ingls) , Nature Contribuio de Rosalind Franklin para o estudo do ADN (em ingls)

U.S. National DNA Day (em ingls) Veja vdeos e participe em chat em tempo real com cientistas de topo

Genetic Education Modules for Teachers (em ingls) DNA from the Beginning Study Guide

Oia Francis Crick e James Watson a falar para a BBC en 1962, 1972 e 1974 (em ingls)

DNA sob microscpio electrnico (em ingls) Enrolamento de DNA para formar cromossomas (em ingls) DISPLAR: Predio de stios de ligao ao ADN em protenas (em ingls)

Dolan DNA Learning Center (em ingls) (em ingls) Olby, R. (2003) "Quiet debut for the double helix" Nature 421 (January 23): 402405.

guia bsico animado de clonagem de ADN (em ingls) DNA the Double Helix Game (em ingls) - Do stio oficial do Prmio Nobel

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