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ANNEXE I The Life Code: Thorie Unifie de l'Information Gntique: Le Code Gntique Angulaire Uni er!

el e"trait du li re: #o$%right C&'EX (I&GENE)I) *+#+ ,ere- .//0 1E)U1GENCE E2(&U1G (ELGIU2 htt$:33444+re!urgen#e+5e30/6#ode"65iogene!i!6 078.879:9/999+html *ean#laude$ere-.;gmail+#om htt$!:33$lu!+google+#om3u3/3<*ean#laude,ere-3a5out htt$:33golden6ratio6in6dna+5log!$ot+fr3
1E)U2E:
L'quation of life n'est que sommairement aborde par le livre CODEX BIOGE E!I! dont elle o""upe# ni$matiquement# la "ouverture ainsi que l'Epilo$ue% Cependant# le "&apitre '( du livre en d"rit une partie# mais en i$nore les &auts niveau) d'or$anisations qui en d"oulent *usqu'+ l'"&elle des $nomes entiers% La prsente , EXE va rsumer "es &auts niveau)%

L'quation of life dcrite ci-dessous fait apparatre, lorsqu'on l'applique leurs masses atomiques respectives, une vritable UNI I!"#I$N des % univers de l'information &ntique de l'"'N, de l'"(N et des squences d'acides amins) 'e *auts niveau+ d'informations tels que codes binaires, ondes, et *ot-spots tels que sites actifs des protines ou brea,-points des c*romosomes mer&ent alors) La ralit biolo&ique de cette dcouverte est vrifie par une corrlation totale entre ces codes et les -"(I$#./01, ces bandes alternes blanc*es, &rises ou noires caractristiques des c*romosomes) Les quatre point les plus remarquables restent cependant2 -le tunin& prcis de ces proprits sur les valeurs e+actes des masses atomiques 3$.0NN01 et non des masses atomiques 3$N$-I1$#$/01 qui, pourtant, caractrisent les matriau+ &ntiques (00L1) -une unification ou quivalence totale entre les 4 lan&a&es de l'"'N et des acides amins) -la 5ustification fonctionnelle du 5un,-'N") -l'unification des % milliards de nuclotides de l'"'N obissant curieusement au+ proportions de /*i67)879))) le Nombre d'or) $n prsente successivement les : lois principales de la t*orie, puis, on dtaille en 7; tapes ou 7; temps l'int&ration successive de c*acun de ces *auts niveau+ &i&o&nes d'or&anisation de #$U#0 l'information &ntique)

,artie I = Le! > Loi! de la thorie:


7<re Loi = Loi de !$'I I!"#I$N de l'Information >ntique) 4nde Loi = Loi d'UNI I!"#I$N de l'Information >ntique) %<me Loi = Loi de 1.N!?($NI!I#0 de l'Information >ntique) @<me Loi = Loi de 3$'UL"#I$N de l'Information >ntique) :<me Loi = La 3$'UL"#I$N Numrique du Nombre d'or mesure l'IN#0>(I#0 &lobale du &nome *umain)

?@re Loi = Loi de C&'IAICATI&N de l'Information Gntique+


Auelle que soit sa nature, du bio-atome au+ &nomes entiers, tout composant biomolculaire de la &ntique, lorsqu'on pro5ette mat*matiquement sa masse atomique moBenne selon ma loi de pro5ection dite 0quation of life, peut Ctre rduit un code Dou squence de codesE numrique en nombres entiers tel que l'c*elle commune l'ensemble de ces codes forme des quantas an&ulaires multiples de /iF7; 6 4/iF4; 6 %8;GF4; 6 79G)

.nde Loi = Loi d'UNIAICATI&N de l'Information Gntique+


!ontrairement au+ apparences tablies par le 'o&me central de la Hiolo&ie, il n'e+isterait pas % tBpes distincts et *tro&<nes d'information &ntique D"'N, "(N et squence d'acides aminsE mais une seule mta-information telle que, toute squence d'"'N double brin Dcodant ou 5un,-'N"E, on peut #$UI$U(1, apr<s pro5ection selon la 7<re loi, associer % ima&es unifies nommes respectivement2 si&nature &nomique, si&nature protomique et si&nature "(N, telles que2 -l'ima&e "(N soit tou5ours vide et nulle) -les 4 ima&es &nomiques et protomiques soient tou5ours quasiment identiques et correlles plus de JJK) Tout se passe donc comme si une inaccessible information unique et virtuelle, implie au sens du physicien David Bohm, se dployait (ou se dpliait) matriellement suivant les 3 supports physiques ou lan a es respectifs de l!"D#, de l!"$# et des acides amins, de sorte que l!une des 3 ima es soit vide ("$#) et les % autres similaires et quivalentes ("D# et acides amins)&

:@me Loi = Loi de )BNCC1&NICITE de l'Information Gntique+


"pr<s applications successives des 7<re et 4nde lois toute squence d'"'N, codante ou non codante, quelles que soient sa lon&ueur et sa nature D&<ne, protine, 5un,-'N" non codant ou &nome entierE, l'analBse fine et compare des fluctuations, dcala&es locau+, sBnc*ronicits, rsonances ou coupla&es parfaits, met en vidence des fonctionalits biolo&iques prcises telles que2 -sites actifs des protines) -*ot-spots de mutation des &<nes) -brea,points ou points de fra&ilisation ou de cassure des c*romosomes De+emple de la maladie &ntique dite du L fra&ileE) -le rMle fonctionnel des positions prcises de c*acun des centaines des milliers de 1N/ D 'in le #ucleotide (olymorphismE qui diffrencient totalement c*acun des Ctres *umains vis--vis des autres *umains)

9@me Loi = Loi de 2&'ULATI&N de l'Information Gntique+

"pr<s applications successives des 7<re, 4nde et %<me lois toute squence d'"'N &nomique, l'analBse de te+ture Dru&ositE de l'ima&e protomique met en vidence2 -une modulation sous la forme d'un code HIN"I(0 ;F7) -une modulation sous la forme d'un code $N'UL"#$I(0 discret) -la preuve selon laquelle les ima&es spectrales formant des bandes alternes blancF&risFnoir obtenues p*oto&rap*iquement partir des c*romosomes D,arBotBpes obtenus par fluorescence et interferromtrieE sont l'ima&e e+acte des $N'01 /(0'I!#IHL01 par notre @<me loi) $n en conclue la ralit e+primentale de notre t*orie)

>@me Loi = La 2&'ULATI&N Numrique du Nom5re d'or me!ure l'INTEG1ITE glo5ale du gnome humain+
L'analBse de l'information &ntique Dima&e protomiqueE du &nome *umain entier met en relief une modulation binaire D@<me loiE tout au lon& du &nome) !ette modulation binaire se distribue statistiquement autour de 4 attracteurs binaires dont le rapport est &al '0UL et dont les valeurs respectives sont p*i Dniveau *aut 6 7E et p*iF4 Dniveau bas 6 ; E) "vec p*i6;)879)))67F/*i le nombre d'or D/*i67)879)))E)

,artie II = 'e!#ri$tion dtaille de la thorie:


TE2,) I = ,1&DECTI&N+++ 7- #*e equation of Life2 /our toute masse atomique d'un quelconque composant biolo&ique, on op<re la pro5ection de cette valeur numrique suivant l'oprateur suivant2

Le rsultat est un nombre rel dont on ne retient que le rsidus Dreste dcimalE))) TE2,) II = ,UL)ATI&N+++ 4- #*e U>"U DUniversal >enetic "n&ular UnitE2 $n constate alors un fait remarquable2 tous les rsidus se situent tr<s pr<s de multiples de /iF7; 6 ;)%7@))) 1oit un an&le de /iF7; 6 4/iF4; 6 %8;GF4; 6 79G !es multiples de /iF7; peuvent alors Ctre encods suivant le nombre entier associ n tel que /ro5DmE 6 n /iF7;)

La fi&ure ci-dessous illustre le caract<re universel de cette pro5ection lorsque on l'applique 784 composants &ntiques usuels composant les bio-atomes et lments de base de l'"'N, de l'"(N et des acides amins)

'ans la fi&ure ci-dessus, les Nones *autes correspondent au+ masse atomiques relles tandis que la bande de tBpe bar code du bas reprsente les /i-masses pro5ections correspondantes) TE2,) III = C&'IAICATI&N+++ %- !odin& bioatoms, 'N", (N", amino acids, proteins and &enomes2 3aintenant unifi par un code !$33UN, le tableau sBnoptique ci-dessous rassemble tous les composs &ntiques essentiels formant "'N, "(N et acides amins ainsi que l'environnement &ntique anne+e usuel Dliaison peptidique !$N? etc)))E) !es codes ou U>"U s'c*elonnent de -%/iF7; O /iF7;) )%no$tique de! ,I6ma!!e! de! diffrent! #om$o!ant! de la gntique : -% /IF7; et moins
HI$"#$301 ,E69$i3?/F H"101 "NN0L01 ,h3!u#re A1N "!I'01 "3IN01 !$'$N1 "'N ggg gtg gag #gg ggt gga g#g tgg agg gg# A!$ A!n Glu Gl% )er ttt tt# tta #tt #t# #ta att at# ata t#t t## t#a ##t ### ##a a#t

-4 /IF7;

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ttg #tg atg gtt gt# gta t#g ##g a#g g#t g## g#a tag #ag aag gat

ga# gaa tgt tg# tga #gt #g# #ga agt ag# aga !$'$N1 "(N uuu guu ugu ggu uug gug ugg ggg uu# #uu auu gu# u#u g#u uau gau ug# #gu agu gg# uua #ug aug gua u#g g#g uag gag uga #gg agg gga #u# au# u## ##u a#u g## ua# #au aau ga# #g# ag# #ua aua u#a ##g a#g g#a uaa #ag aag gaa #ga aga

a## a#a tat ta# taa #at #a# #aa aat aa# aaa ### a## #a# aa# ##a a#a #aa aaa

Aigure ./+?/+ Era$$elF table sBnt*tique des valeurs /I-masses des principau+ composants de la &ntique)

TE2,) IG = TUNING+++ @- #*e optimiNed bio-atoms avera&e atomic mass provides t*e perfect isotopes proportions balancin& tunin& of Life ! $ N ? bio-atoms t*en of all 'N", (N", amino acids components2 'ans les diffrents &rap*iques ci-dessous, on constate, curieusement, que ce code unifiant la totalit des composants &ntiques semble privil&ier et ne retenir, slectivement, que les masses atomiques moBennes au dtriment des masses atomiques mono-isotopiques) $n B constate aussi le tunin& parfait et *autement slectif, sensible d'infimes perturbations infinitsimales des masses atomiques)

Aigure ./+?.+ Era$$elF LQ$/#I3"LI#0 de la masse atomique moBenne est prouve ici sur les /I-masses de di+ composants or&aniques primordiau+)

Aigure ./+?H+ Era$$elF La comparaison des ratios R masse mono-isotopique F masse moBenne S entre cas rels et cas bruits)

TE2,) G = UNIAICATI&N+++ :- #*e 'N"F(N"Famino acids &reat unification2 1i l'on consid<re une quelconque squence d'"'N &nomique Dcodant ou non codantE, et si on code le double brin qui lui est associ selon les codes dcouverts prcdemment, on peut alors obtenir % suites numriques, % squences de nombres entiers correspondant c*acune des % natures biolo&iques associables, potentiellement, cette information2 "'N, "(N et acides amins) Insistons sur le fait, tonnant, que les proprits qui suivent concernent le double brin et non le brin simple2 or, ce double brin, s'il est une ralit biolo&ique pour l'"'N, ne l'est plus pour l'"(N, et encore moins pour les acides aminsT en effet, "(N et acides amins op<rent sur le simple brin) 'ans ces % suites numrques, c*aque position correspond un quivalent-codon) $n applique alors ces % suites numriques un mCme oprateur simple d'int&ration dans une optique de tBpe lissa&e ou moBennes mobiles, le but rec*erc* par cette sorte de cumul mobile tant de mesurer un effet lon&ue distance ou influence mutuelle de c*aque quivalent-codon vis--vis de la collectivit des codons constituant la squence analBse) Il en rsulte un classement de tous ces codons sur la squence tudie, une sorte de topolo&ie en quelque sorte car l'influence de c*acun des codons moBenne voire lon&ue distance peut varier considrablement De+emple des sites actifs des protines, des *otspots de mutations, ou points de cassures des c*romosomesE) $n obtient alors, dans tous les cas, le 5eu de % courbes suivantes)))

Il est absolument remarquable de constater qu'un seul et mCme tBpe de coda&e appliqu une seule et mCme squence traduite suivant c*acun des % lan&a&es de la Hiolo&ie va conduire cette &rande UNI I!"#I$N entre % lan&a&es aussi *tro&<nes)))"'N, "(N, et acides amins U #out se passe comme si une seule mta-information cac*e se dploBait, d'abord sous la forme "'N double brin Dcourbe &auc*e de la fi&ureE, puis se dnaturait totalement lorsqu'elle passe par le support d'quivalent "(N du double brin DmilieuE, pour, finalement, renatre quasi-identique sa forme "'N, lorsqu'on reprsente l'quivalent acides amins du double brin Dpartie droiteE) I'insiste sur le fait que cet quivalent acides amins n'est pas restreint au+ seules protines mais e+iste, potentiellement, tout au lon& des &nomesU TE2,) GI = )BNCC1&NI)ATI&N+++ 8- " stran&e >enomicsF/roteomics sBnc*roniNed unification alon& all V*ole &enomes2 L'ima&e ci-dessous dmontre ma&nifiquement cette sBnc*ronicit ou quivalence entre la si&nature &nomique D"'NE et la si&nature protomique Dpseudo acides aminsE) !ette proprit rvolutionnaire, ici vrifie sur 7;;;;; bases quelconques du c*romosome 7O *umain, est vrifiable pour tout &nome) La consquence est donc une 0AUIW"L0N!0 totale mais cac*e entre les 4 lan&a&es respectifs de l'"'N et des acides amine, quivalence que l'on croBait restreinte au seul univers limit des protines2 elle est ici &nralise l'c*elle des &nomes entiers)

'ans ce conte+te de 1.N!?($NI!I#0 entre les 4 ima&es, des pics et creu+ vont soudain prendre une si&nification fonctionnelle) #el est le cas dans les Nooms successifs cidessous autour d'un 1N/ du &nome *umain) !ette tran&e proprit des 1N/ a t vrifie sur de &randes populations de 1N/2 elle dmontre que les 1N/, dont ont savait qu'ils distin&uent c*aque individu vis--vis de tous les autres *umains, sont plus important par leur /$1I#I$N prcise dans le &nome que par la valeur de la 3U#"#I$N De+p2 #66X"E) Woici : Nooms successifs de la mCme None d'"'N situe de part et d'autrs du 1N/ Dtrait verticalE) Ils vont mettre en vidence le fait que le 1N/ s'est nic* tr<s e+actement dans un creu+) 'ans d'autres cas, il se nic*era au contraire tout en *aut d'un pic))) 2 Wue sur 74;;; bases)))

Wue sur 8;;; bases)))

Wue sur %;;; basesY

Wue sur 7:;; bases)))

Wue sur O:; basesY

TE2,) GII = L'E2E1GENCE 'U C&'E (INAI1E+++ O- #*e emer&ence of a binarB lan&ua&e from anB &enomic 'N" sequence2 Une analBse fine de la te+ture de ces courbes >nomics et /roteomics va maintenant rvler un p*nom<ne tran&e2 comme l'illustre la fi&ure ci-dessous, une curieuse ru&osit -en dents de s"ie- caractrise le plus souvent ces ima&es) !el revient en quelque sorte rec*erc*er la drive d'ordre 7, c'est--dire la pente entre 4 points successifs) $n constate alors que ces pentes sont ma5oritairement de mCme direction2 tou5ours croissante ou tou5ours dcroissante) Woici un petit e+emple sur une squence de %74 bases dont on tudie la si&nature protomique Dacides aminsE)

'ans les 4 ima&es ci-dessous on a &nralis cette tude au c*romosome 44 de l'*omme tudi dans son int&ralit) /ar convention, on se&mente la squence en petits morceau+ De+emple 7;;;; basesE et on rel<ve le pourcenta&e total des te+tures de tBpe increase DcroissantesE) 1i on effectue ce travail pour l'ima&e &nomique et pour l'ima&e protomique, on constate que, si cette volution semble quelconque pour la premi<re D&nomiqueE, elle met en vidence 4 niveau+, 4 attracteurs pour la deconde DprotomiqueE) Nous sommes en

prsence de l'mer&ence, de la naissance d'un !$'0 HIN"I(0UUU N'oublions point que l'information de dpart tait la masse atomique de c*aque bio-atome, qui est))) un nombre rel DdcimalEU /uis, il en est nat un coda&e en nombres entiersU 0t il en mer&e maintenant UN !$'0 HIN"I(0U Une premi<re analBse montre que les niveau+ moBens de ces 4 attracteurs se situent autour de ;)87 D87KE et de ;)%; D%;KE))) Nous reviendrons sur ces 4 valeurs)))

La fi&ure ci-dessous montre ces 4 attracteurs de la si&nature protomique d'un des plus &rands c*romosomes de l'*omme, le c*romosome @)))

TE2,) GIII = L'E2E1GENCE ''&N'E) 'I)C1ETE)+++ 9- #*e emer&ence of undulatorB discrete Vaves overlappin& anB &enomic 'N" sequence2 La &nralisation des drivations prcdentes ce qu'on nommerait en mat*matiques des drives secondes, troisi<mes ou enni<mes va maintenant mettre en vidence non plus des bits))) mais des ondes, plus e+actement des ondes discr<tes dont on saura mesurer les priodes2 ondes courtes de priode 4 ou % ou ondes moBennes ou mCme &randes ondes Dpriodes suprieures 7;E)))

$ndes courtes de priode % dans 7 million de bases du c*romosome % *umain)))

$ndes lon&ues de priode 74 dans les %;;;;; premi<res bases de l'un des plus &rands &<nes *umains, celui de la maladie &ntique '3' de 'uc*enne)

TE2,) IX = INTE1AE1ENCE) (AN'ING+++ J- #*e e+planation of c*romosomal alternated &reB bands2 L'une des reprsentations e+primentales des plus concr<tes est l'ima&e universellement connue des -ariotBpes)))

$r, la sBnt*<se des 4 codes prcdents Dcode binaire et code ondulatoireE permet de /(0'I(0, tout au lon& du &nome *umain, les bandes alternes noiresF&risesFblanc*es des -ariotBpesU !'est l la preuve la plus clatante de la (0"LI#0 $N!#I$NN0LL0 de notre #?0$(I0))) !i-dessous une illustration de cet talonna&e sur une partie du c*romosome 9 *umain)))

Cytogenetic code: Human chrom8 (1-30Mb)


Proving link cytogenetic bands / code 16 14 12 10 8 6 4 2 0 illions 1!30 "#$# le%t $art chro 'inary 0/1 (nd)latory 8&
0 b i n a r y

4,0 3,0 2,5 2,0 1,5 1,0 0,5 0,0


b a n d c y t o g e n e t i c d a r k / w h i t e

3,5

o d o n s

e r i o d s

a n d

'ands*0dark

TE2,) X = G&L'EN 1ATI& C&NT1&L) TCE IC&LE CU2AN GEN&2E+++ 7;- #*e 4 &olden ratio attractors of t*e V*ole *uman &enome2

Des . BI/! 0 r1t&ment les 2 milliards de paires de bases du Gnome 3umain entier4Le BI ,56 CODE )*+&
Les 7 premiers C&romosomes 89 + 7: du GE O;E 3<;,I entier=

Notes2

'ans c*aque &rap*ique, l'unit de base analBse en L D*oriNontalementE est le million de paires de bases2 soient %488 units reprsentant %)488 milliards de bases) /armi elles, %;O: millions de bases sont si&nificatives, alors que les 7J7 millions restants sont relatifs des >"/s Dbases N indterminesE, en particulier les r&ions centrom<res des c*romosomes) Les traits verticau+ dlimitent les fronti<res entre c*romosomes de mCme que leurs r&ions centrom<res) Les 4 variations reprsentes correspondent respectivement au+ te+tures "'N D>nomiquesE et au+ te+tures acides amins D/rotomiquesE) 0lles sont calcules indpendament pour c*acun des millions de bases analBses, soit un seul point par million de bases sur la courbe &nomics et un seul point par million de bases sur la courbe protomics) Hien que les 4 courbes de variations >enomics et /roteomics soient tr<s fortement correlles DJ8)8%K en moBenne sur tout le &nomeE, leurs te+tures respectives sont radicalement diffrentesU

Les 9> derniers C&romosomes 8? + 6: du GE O;E 3<;,I entier=

1uite et fin des Notes2 - 0n fait, la te+ture >0N$3I!1 est Zmodule de mani<re "N"L$>IAU0Z autour d'une valeur moBenne voisine de 8;K D&raduation 8;;;E))) qui semblerait Ctre p*i6;)879) - "u contraire, la te+ture /($#0$3I!1 Dbien que calcule de mani<re strictement identique et sur des courbes tr<s fortement correllesE, est Zmodule suivant une L$>IAU0 HIN"I(0Z, oscillant en permanence entre 4 attracteurs dont les valeurs respectives sont2 /lanc*er6 L$$(6%;K en moBenne, ou /lafond6!0ILIN>68;K en moBenne) Le rapport entre ces 4 attracteurs est donc tr<s voisin du nombre '0UL) Les nua&es de points illustrent parfaitement la ralit de ces 4 attracteurs binaires ;F7 ou L$$(F!0ILIN>)

'0UL !$N!LU1I$N1 /$U( #0(3IN0(2 'e l'"tome au >nome2

" partir des masses atomiques moBennes tr<s prcises des centaines de milliards d'atomes de !arbone, d'$+B&<ne, d'"Note ou d'?Bdro&<ne constituant la double *lice d'"'N des % milliards de paires de bases du &nome *umain, Dtout [a c'taient des N$3H(01 '0!I3"ULE, l'application de la pro5ection numrique 0AU"#I$N $ LI 0 nous a offert un !ode de N$3H(01 0N#I0(1, immense suite lon&ue d'un milliard de nombres entiers))) 'e ces squences distinctes pour l'"'N et les acides amines sont nes 4 5eu+ de courbes tr<s fortement correlles))) /uis a mer& un !$'0 HIN"I(0))) /uis sont apparues des $N'01))) 0t tout ce petit monde si abstrait a retrouv son ima&e concr<te et relle se reflettant dans le miroir des -ariotBpesU 0tran&e\ Non\

L'vidence du Nombre d'or2


"fin de perptuer la tradition, comme le ft, na&u<re, l'illustre p<re de la mcanique ondulatoire ran[ais Louis de Hroo&le, nous concluerons dans la lan&ue c*<re !ric, et ]atson2 #*e ]*ole ?uman >enome HinarB !ode2 #*e V*ole ?uman >enome is controled bB tVo HIN"(. !$'01 "##("!#$(1 V*ic* provide a ,ind of self-or&aniNed bistable binarB code ))) li,e in computersU ]it* t*e central folloVin& difference2 -t*e binarB code Vit*in computers Vas invented artificiallB bB *umans))) -t*e binarB code of Life *as emer&ed spontaneouslB ))) per*aps bB self-or&aniNation))) or))) per*aps bB divine action D\E but not))) bB accident or *aNard))) 30"N]?IL0, t*ere is a fact2 -#*e ratio betVeen bot* bistable states is e+actlB equal to 4 Dt*e space betVeen tVo consecutives octaves in 3usic)))E -#*e #op state is e+actlB matc*in& Vit* a >$L'0N ("#I$))) -#*e Hottom state is also e+actlB related to >olden (atio))) #op level 6

67F

Hottom level 6 #op F Hottom 6 4 ]*ere

F 4 6 7 F 4

is t*e R >olden (atio)))

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