Cours - de - Genetique Licence 2 ROUSSEAU

Analyse Gntique Cours 1
Philippe ROUSSEAU, Matre de confrence Laboratoire de Microbiologie et de Gntique Molculaire Tel: 05 61 33 59 16 - Mail: philippe.rousseau@ibcg.biotoul.fr Site: www.iefg.biotoul.fr - liens eseignements
Premire partie: Gntique Fondamentale (cours 1 et 2)

Rappels Notion de gne, expression, mutation, rparation La fonction du gne Relation un gne/une fonction: Beadle et Tatum La fonction dominante ou rcessive La complmentation de deux gnes
Deuxime partie: Gntique Mendlienne (cours 3 6)

Sgrgation indpendante Liaison gntique Interaction gnique Un gne, deux gnes Un gne li son centromre, deux gnes Epistasie et synergie
Troisime partie: Gntique molculaire (procaryote, cours 7 9)

Transformation bactrienne Echanges gntiques Echanges gntiques Rgulation gntique Transformation, recombinaison, Transductions localises et gnralises Conjugaison: facteur F Oprons
Quatrime partie: Gntique des populations (cours 10)

Hardy-Weinberg
Notion de gne
Gne: Unit fonctionnelle et physique lmentaire de lhrdit qui transmet linformation dune gnration la suivante. Un fragment dADN, constitu dune rgion transcrite et de squences rgulatrices.
Promoteur Stop
Licence2: Gntique - T2
Procaryote
Eucaryote
Promoteur
Intron
Stop
Exon1 Codant
Exon2
Fonction du gne
Modle simple bactrien La structure du gne reflte sa fonction: Assurer lexpression du matriel gntique.
+1 -35 -10
Unit fonctionnelle: gne

Promoteur RNAP Stop
RNAP
Transcription Traduction Codon initiation Codon Stop
Promoteur: exemple E.coli
maturation
Larchitecture dune protine est la cl de la fonction des gnes.
Importance de larchitecture dune protine: Notion de site actif
+ substrat enzyme enzyme
+ produit
La structure tridimensionnelle de la protine (enzyme) dfinit sa fonction biochimique.
Si la structure tridimensionnelle de la protine est modifie, sa fonction biochimique peut elle aussi tre modifie. La mutation du gne peut induire ce type de modification.
Mutation: au niveau de lADN
Mutation: processus par lequel des gnes passent dune forme alllique une autre. Exemple dune mutation ponctuelle: Altration dune base. Etape facilite par les agents mutagnes: - rayons UV - rayons X - rayons beta et gamma - acide nitreux - nitrosoguanidine Altration dune base
*
Gnration 2 ACGTC TGTAG ACATC TGTAG rplication ACGTC TGCAG ACGTC TGCAG ACGTC TGCAG
*
Gnration 1 ACGTC TGTAG

*
ACGTC TGCAG
ACGTC TGCAG
rplication
Rparation
Rparation:
- processus par lequel la plupart des lsions ou des mutations de lADN sont rpares - ce processus est enzymatique - la dfaillance dans un des ces processus enzymatique est la base dun phnotype hypermutateur ex: cancers de la peau ou du colon chez lhomme
Gnrat 1 Altration dune base
Gnrat 1
ACGTC TGTAG ACGTC TGCAG

*
ACGTC TGCAG ACGTC TGCAG

Rparation du msappariement
ACGTC TGCAG
Rparation de la lsion
ACGTC TGCAG
rplication
Mutation: au niveau protique

Promoteur Stop
Dans une mutation ponctuelle, le changement de base peut induire un changement de codon.
Les mutations ponctuelles peuvent tre: - faux-sens: changement de codon et dacide amin - non-sens: changement de codon vers un codon stop - silencieuse: changement de codon sans changement dacide amin
TGT(Cys)
TCT(Ser)
TAC(Tyr)
TAA(Stop)
CCT(Pro)
CCC(Pro)
Autres exemples de mutations
Insertion
Promoteur
Dltion
Stop
inversion
Le plus souvent ce type de mutation amne une destruction de la phase codante du gne et donc une perte de fonction.
Rversion et supression
Reversion: annulation de la mutation
mutation
On parle de rversion ou de supression lorsquune mutation en annule une autre
reversion
- reversion vraie - reversion quivalente
AAA(Lys) TCC(Ser)
GAA(Glu) TGC(Cys)
AAA(lys) AGC(Ser)
Supression: annulation des consquences dune mutation - supression intragnique une autre mutation dans le gne qui restaure lintgrit de la fonction code.
ex: si la mutation 1 induit une dformation du site actif, la mutation suppressive induit une autre dformation qui compense celle induite par la mutation1. - supression extragnique la mutation dun autre gne qui annule les effets de la premire.
ex: si une mutation 1, dans un gne codant une sous-unit dune enzyme bipartite, une mutation suppressive dans le gne codant lautre sous-unit peut compenser la premire mutation.
Test de fluctuation: Luria & Delbrck

culture1
Analyse sur 108 bactrie par cultures de 1 ml inocules par 103 bactries.
N culture
nb. Colonie T1R 1 4 0 0 12 0 0 9 120 0 14,6
1 mutant culture2 4 mutants culture3 0 mutant
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Moyenne
Il existe une grande fluctuation entre les expriences: les mutations arrivent par hasard.
Frquence de mutation: loi de Poisson
loi de Poisson donne ici la frquence dapparition au hasard dune mutation : si si alors, i = nombre de cellules au dbut de la culture = 103 n = nombre de cellules la fin de la culture = 108 d = nombre de divisions pour passer de i n cellules d = n-i = 108 - 103 d~= n
Alors, si T = le taux de mutation par division On a: Donc
f(la classe 0) = e -Td

ln(f o) = -Td
f(la classe 0) = frquence des cultures

sans colonie T1R Cf. Diapo n:10
soit T = - (ln(f o)/d) = -(ln(5/10)/ 108) = 0,7 x 10-8
Isolement de mutants rsistants chez la E.coli
Levure [drogueS]
Cette exprience est rpte autant de fois que lon veut de mutants indpendants
MC 103/ml
30C T 108/ml
MC + drogue +
talement de 1 ml soit ~108 E.coli
MC [drogue S] [drogue R] + +
30C, T
MC + drogue
F(drogueR) ~ 108
Isolement de mutants argchez E. coli
Agent mutagne
Cette exprience est rpte autant de fois que lon veut de mutants indpendants.
MM + arg 103/ml
30C T 108/ml
Dilution 106 fois talement de 1 ml Soit ~100 E.coli
MM [arg-] [arg+] +
MM + arginine + +
30C, T
e u iq l p r
30C, T
MM + arg
MM
Analyse Gntique
Cours 2
Philippe ROUSSEAU, Matre de confrence Laboratoire de Microbiologie et de Gntique Molculaire Tel: 05 61 33 59 16 - Mail: rousseau@ibcg.biotoul.fr Site: www.iefg.biotoul.fr - liens eseignements
Premire partie: Gntique Fondamentale

Rappels Notion de gne, expression, mutation, fparation, Frquence La fonction du gne Relation un gne, une fonction: Beadle et Tatum La fonction dominante ou rcessive La complmentation de deux gnes
Deuxime partie: Gntique Mendellienne

Sgrgation indpendante Liaison gntique Interaction gnique Un gne, deux gnes Un gne li son centromre, deux gnes Epistasie, synergie de phnotype
Troisime partie: Gntique molculaire (procaryote)

Transformation bactrienne Echanges gntiques Echanges gntiques Rgulation gntique Transformation, recombinaison, aquisition de resistances Transductions localises et gnralises Conjugaison: facteur F Oprons
Quatrime partie: Gntique des populations

Hardy-Weinberg
Enzymes dficientes: dominance et rcessivit chez les diplodes

Enzyme active + substrat Enzyme active + substrat
Enzyme inactive
+ Enzyme active substrat
Enzyme inactive
Enzyme inactive
Gnotypes
Homozygote sauvage a+/a+ [normal]
Htrozygote a+/a[normal] si haplo-suffisance [dficient] si haplo-insuffisance [intermdiaire] si co-dominance
Homozygote mutant a-/a[dficient]
Phnotypes
Consquence fonctionnelle des mutations: 1

perte de fonction: mutation qui inactive lenzyme.
Enzyme active
Enzyme active
Enzyme inactive
Enzyme active
Enzyme inactive
Enzyme inactive
+/+ [actif]
+/m [?]
m/m [inactif]

gain de fonction: mutation donnant une enzyme plus active ou ayant une activit diffrente.
Enzyme active
Enzyme active
Enzyme active
Enzyme active
Enzyme active
Enzyme active
+/+ [actif]
+/m [actif et ?]
m/m [actif et ?]

conditionnelle: mutation dont les effets ne se voient que dans certaines conditions physiologiques.
Enzyme active
Changement de conditions
Enzyme active Enzyme active Enzyme inactive
Enzyme active
Enzyme inactive
Enzyme inactive
Enzyme active
Enzyme active
+/+ [actif]
+/m [?] [actif]
m/m [inactif]
[actif]
Croisement de mutants: la complmentation

Enzyme 1 inactive Enzyme 2 active Enzyme 1 inactive
Enzyme 2 active
croisement Haplode (n) mutant 1 rcessif: [inactif]
Enzyme 1 active
Enzyme 2 inactive
Enzyme 1 active
Enzyme 2 inactive
Haplode (n) mutant 2 rcessif: [inactif]
Diplode (2n) [actif] Il y a complmentation, les parents nont pas de gne mutant en commun
Croisement de mutants: la non-complmentation
Enzyme inactive
Enzyme inactive
croisement Haplode (n) mutant 1 rcessif: [inactif]
Enzyme inactive
Enzyme inactive
Haplode (n) mutant 2 rcessif: [inactif]
Diplode (2n): [inactif] Il ny a pas complmentation, les parents ont au moins un gne mutant en commun
Un gne <-> une enzyme

Beadle & Tatum: Chez Neurospora, isolement de trois groupes de
mutants incapables de synthtiser larginine en conditions naturelles. MM + Ornithine MM + Citruline MM + Arginine
Biosynthse de larginine
milieux
MM
gne a
Prcurseur Enzyme A
Sauvage prototrophe Mutants auxotrophes groupe 1 Mutants auxotrophes Groupe 2 Mutants Auxotrophes Groupes 3
gne b
Enzyme B
Ornithine
+ -
+ +
gne c
Enzyme C
Citruline
Arginine
Premire partie: Gntique Fondamentale (cours 1 et 2)

Rappels Notion de gne, expression, mutation, rparation La fonction du gne Relation un gne/une fonction: Beadle et Tatum La fonction dominante ou rcessive La complmentation de deux gnes
Deuxime partie: Gntique Mendlienne (cours 3 6)

Sgrgation indpendante Liaison gntique Interaction gnique Un gne, deux gnes Un gne li son centromre, deux gnes Epistasie et synergie
Troisime partie: Gntique molculaire (procaryote, cours 7 9)

Transformation bactrienne Echanges gntiques Echanges gntiques Rgulation gntique Transformation, recombinaison, Transductions localises et gnralises Conjugaison: facteur F Oprons
Quatrime partie: Gntique des populations (cours 10)

Hardy-Weinberg
La reproduction sexue: brassage gntique
Licence2: Gntique
2n Sordaria macrospora
2n
Levure
Humain
fcondation
n n 2n
2n
mose
La miose: lieu du brassage gntique

La miose fcondation rplication mioseI miose II
Licence2: Gntique
2n
2n (x 2)
n (x 2)
Brassage interchromosomique
mioseI rplication fcondation
Licence2: Gntique
miose II
quiprobable
Pour 1 chromosome, il y a deux arrangements possibles la mtaphase de la miose I Tous les gamtes sont quiprobables
Brassage interchromosomique II
fcondation rplication mioseI miose II
Licence2: Gntique
quiprobable
Pour 2 chromosomes, il y a deux arrangements possibles la mtaphase de la mioses I, et 22 = 4 gamtes differents Tous les gamtes (parentaux P et recombins R) sont quiprobables
Brassage intrachromosomique
Licence2: Gntique
non quiprobable
crossing-over
Le crossing-over a lieu au niveau dun chiasma lors de lappariement des chromosomes homologues en mtaphase I Les gamtes (parentaux P et recombins R) ne sont pas quiprobables
Consquences du brassage gntique

n 2n n 1re loi de Mendel
Licence2: Gntique
ttrades
Arg+ Arg-
Sgrgation monognique: 1/2 Arg+ 1/2 Argchez les gamtes de l hybride
Arg+
Arg+
1/2
Arg-
Arg-
1/2
Les brassages inter et intra ny changent rien
Consquences du brassage gntique
Licence2: Gntique
Graine jaune
Graine verte
J/J
v/v
100%
F1
J/v
F2 = F1 x F1 75% 25% 3/4 1/4 J 1/2 V 1/2
J 1/2 J/J v/J
1/2
J/v v/v
Croisement test
J/J x v/v
Licence2: Gntique
F1: J/v F1 x F1 F2: J 1/2 v

1/2
Test cross F1 x v/v v

1/2
J 1/2 J/J v/J 1/4
J/v v/v
J 1/2 v
1
1/2
J/v
v/v
3/4
1/2
1/2
Lhrdit dignique
Licence2: Gntique
fcondation
Am Bm Bm
mioses
Am
Bm
Am
Ap Bp Am Bp Ap Bm
Gamtes descendants
P
parental
Ap Bp
Gamtes parentaux
Ap Bp
diplode
R
recombin
P = R indpendance gnique P > R liaison gnique
Haplode: 2 gnes indpendants / 2 caractres

Gal1 Gal1
diplode
Licence2: Gntique
1/4 1/4 1/4 1/4
Trp1 + Gal1, Trp1
P
parental
Trp1
R
recombin
Trp1+
Gal1-
Trp1+, Gal11/4 Trp1+, Gal1Trp1-, Gal1+ 1/4 Trp1-, Gal1+ quiprobable Trp1+, Gal1+ 1/4
Trp1-
Gal1+
Trp1+, Gal1+ Trp1-, Gal11/4 Trp1-, Gal1-
Haplode: Deux gnes pour un phnotype

[Arg-] [Arg-] [Arg+] [Arg-] [Arg-]
Licence2: Gntique
1/4 1/4 1/4 1/4
P
parental
diplode
[Arg+]
R
recombin
Arg1-
Arg2-
Arg1-, Arg21/4 Arg1-, Arg2Arg1+, Arg2+ 1/4 Arg1+, Arg2+ quiprobable Arg1-, Arg2+ 1/4
Arg1+
Arg2+
Arg1-, Arg2+ Arg1+, Arg21/4 Arg1+, Arg2-
Diplode: deux gnes indpendants
Licence2: Gntique
Graine jaune et lisse
Graine verte et ride
J, L J, L J, L v, r
parental J, L 1/4 J/J, L/L v/J, r/L J/J, r/L v/J, L/L v, r 1/4
v, r v, r
100%
F1
F2 = F1 x F1 9/16 3/16 3/16 1/16

J, L 1/4 v, r 1/4 J, r 1/4 v, L 1/4
recombin J, r 1/4 v, L 1/4 J/v, L/L v/v, r/L J/v, r/L v/v, L/L
J/v, L/r J/J, L/r v/v, r/r v/J, r/r
J/v, r/r J/J, r/r v/v, L/r v/J, L/r
Test-cross pour deux gnes indpendants
Licence2: Gntique
Graine Graine Jaune et lisse verte et ride
F1
Graine verte et ride
x
100% F1 Test-cross J, L v, r
parental
v, r v, r
recombin J, r 1/4 v/J, r/r v, L 1/4 v/v, r/L
F2 = F1 x F1
v, r 1
J, L 1/4 v/J, r/L
v, r 1/4 v/v, r/r
9/16 3/16
3/16 1/16
1/4 1/4
1/4 1/4


Sgrgation indpendante Liaison gntique Interaction gnique Un gne, deux gnes Un gne li son centromre, deux gnes Epistasie, synergie de phnotype


Hardy-Weinberg
La prrduction: brassage interchromosomique
Licence2: Gntique
Haplode (n)
diplode (2n)
Haplode (n)
f f
c
Positionement alatoire des chromosomes la mtaphase I
2 asques possibles et quiprobables
La postrduction: brassage intrachromosomique

Haplode (n) diplode (2n)
Licence2: Gntique
Haplode (n)
f f
c
Crossing-over
4 asques possibles et quiprobables
Postrduction: la distance gne-centromre
Licence2: Gntique
1 2 3
La frquence dun crossing-over est proportionnelle la distance gntique qui spare les deux positions recombines. La frquence des asques post-rduits est proportionnelle la frquence des crossing-over entre un gne suivi et son centromre. La moiti des spores des asques post-rduits ont subit un crossing-over entre le gne suivi et son centromre. Donc:
dg-c = F (recomins) = comprise entre 0 et 33,3 cM F(recombins) = f (post-rduits) = ( post-rduit) / (pr-rduits + post-rduits)
Lhrdit multignique
Licence2: Gntique
fcondation
Am Bm
mioses
Am
Bm
Ap Bp
Gamtes parentaux
Am Bm Ap Bp
diplode
Ap Bp Am Bp Ap Bm
Gamtes descendants
P = R indpendance gnique P > R liaison gnique: dgenet = % R
Haplode: deux gnes lis

levures Gal2 Fcondation Trp1 Mioses
Diplode (+) Gal2 Gal2 Trp1 Trp1 Gal2 Gal2,Trp1 + Trp1
Licence2: Gntique
Gal2,Trp1 Gal2,Trp1 + +
DP
Gal2 et Trp1 sont chacun monognique DP > DR, le gne gal1 est li au gne trp1 d
DR
gal2-trp1
= (1/2 T + DR) / (T+DR+DP) x 100
Licence2: Gntique
A chaque fois quon voit un DR, un DP et deux T arrivent par double crossing-over .
a A
B b
a A
B b
a A
B b
DP
a A B b a A B b
T
a A B b
DR
DP
Une formule plus raliste serait: d
a-b
= ( (T-2DR) + 4DR) / (DP+DR+T) x 100
Licence2: Gntique
d (cM)
DP > DR 2 gnes lis: d = ( T + 3DR) / (T + DP + DR) x 100 0 < d < 50cM DP = DR 2 gnes indpendants: - 2 gnes sur deux chromosomes
a A
B b
a A
B b
- 2 gnes distants de plus de 50 cM
a A
B b
Diplode: deux gnes lis

B, V B, V
X
Licence2: Gntique
b, v b, v b, v b, v R = (1- P)
bV (1-P)/2 bV/bv 185 Bv (1-P)/2 Bv/bv 206
B, V b, v x F1 Test cross
bv1 BV P/2 BV/bv 965
P=P
bv P/2 bv/bv 944
965
944
206
185
d b-v = (1-P) x 100 = (f(b,V) + f(B,v) ) x 100 = ((206+185)/2300) x 100 = 17 cM
Distance gntique : rsum
Licence2: Gntique
Haplobiontiques spores non ordonnes ou ordonnes distance gne-gne :

d g-g = ( T + 3DR) / (T + DP + DR) x 100 < 50cM
Diplobiontiques distance gne-gne :
d g-g
= (1-P) x 100 < 50cM
Recombinaison intragnique: distance entre allles

n: [-]
Licence2: Gntique
Gamtes produits
a, [-] b, [-] ab, [-]
b
n: [-]
b
2n: [-] Pas de complmentation
++, [+]
P>>R


Sgrgation indpendante Liaison gntique Interaction gnique Liaison au sexe Un gne, deux gnes Un gne li son centromre, deux gnes Epistasie et synergie de phnotype


Hardy-Weinberg
Variations sur le 9:3:3:1, interactions gnique
Licence2: Gntique
- 9 :7
Le phnotype apparat chez lhomozygote pour un des allles rcessifs.
- 9 :4 :3 - 9 :6 :1
Un allle du 1er gne cache les allles du 2me gne. Effet additif des allles rcessifs de 2 gnes contrlant 1 caractre.
- 15 :1
Le phnotype napparat que chez lhomozygote rcessif pour les deux gnes.
- 13 :3
Le phnotype rcessif du 1er gne est supprim par lallle rcessif du 2me gne.
Lhrdit lie au sexe
Licence2: Gntique
htrogamte
homogamte
Rgions homoloqgues entre X et Y Pseudo-autosomales
Autosomes
Chromosomes sexuels
Lhrdit lie au sexe
Licence2: Gntique
XR/XR x Xb/Y
F1
XR/Xb
XR/Y
50% 100%
50%
F2 = F1 x F1
XR 1/2 XR 1/2 XR/XR Xb

1/2
Y1/2 XR/Y Xb/Y
XR/Xb
Lhrdit lie au sexe
Licence2: Gntique
Xb/Xb x XR/Y
F1
Xb/XR
Xb/Y
50% 50%
50% 50%
F2 = F1 x F1
Xb
1/2
Y1/2 XR/Y Xb/Y
XR 1/2 Xb/XR Xb
1/2
Xb/Xb




Hardy-Weinberg
Parasexualit chez les bactries: transfert de gnes

culture1
mutations = hasard brassage gntique
Licence2: Gntique
culture2
par transformation par transduction par conjugaison
batries comptentes Batriophages plasmides conjugatifs
Transfert de gnes : la transformation

Bactrie donneuse StrR
Licence2: Gntique
lyse lysat
Entre de lADN transformant qui peut porter le(s) gne(s) responsable(s) du phnotype StrR
Intgration de lADN transformant par recombinaison (rec)
rec
Bactrie rceptrice StrS
Bactrie transforme StrR Si une bactrie est transforme par deux gnes, il y a cotransformation On en dduit que ces deux gnes sont proches
Transfert de gnes : la transduction

La bactrie donneuse (StrR) est infecte par un bactriophage transducteur (ex: P1 infectant E. coli) Le lysat transducteur contient des bactriophages non virulents ayant encapsid de lADN de la bactrie donneuse
Licence2: Gntique
lyse
lysat
Infection de la bactrie rceptrice (StrS) par un des bactriophages non virulents. LADN inject peut porter le(s) gne(s) responsable(s) de StrR
Bactrie rceptrice StrS
Intgration par recombinaison (rec)
Bactrie transforme StrR
Si deux gnes sont transduits ensemble, il y a cotransduction On en dduit que ces deux gnes sont proches (d < 90 kpb dans le cas E.coli/P1)
Transfert de gnes : la conjugaison F

F
Licence2: Gntique
Une bactrie qui contient le plasmide F (facteur F) est dite F+ alors qune bactrie F- na pas le facteur F
les bactries F+ et F- sassocient (pilli)
Il y a mise en place dun systme de scrtion dADN (TypeIV) entre les bactries F+ et FLADN de F est alors rpliqu et inject dans la bactrie FCette rplication est initie OriT est se fait par cercle roulant Lentre dADN dans la bactrie F- est oriente (OriT puis a puis b) Une fois que tout LADN de F est entr, il est circularis La bactrie F- est devenue F+
Transfert de gnes : Les tats de F
Licence2: Gntique
F
rec
Bactrie FLintgration ou lxcision du F se fait par recombinaison entre des squences prsentes la fois sur le chromosome bactrien et sur le plasmide F (ex: transposon)
Bactrie F+ Intgration de F
rec
Bactrie F
Excision de F
Bactrie HFR
Transfert de gnes : la conjugaison HFR
Licence2: Licence2: Gntique Gntique
Une bactrie qui contient F intgr dans son gnome est dites HFR (High Frequency of Recombination)
les bactries HFR et F- sassocient (pilli)
Il y a mise en place du systme de scrtion, rpliquation et injection de lADN de F dans la bactrie FIci, ce transfert dADN initie OriT fait aussi entrer lADN chromosomique flanquant le F Le transfert est orient : OriT puis a puis lADN chromosomique (gne(s)) proche de a Les ADNs homologues sapparient et recombinent LADN de F ne peut entrer entirement La bactrie F- reste donc F-, mais acquiert de lADN chromosomique (gne(s)) de lHFR
Transfert de gnes : la conjugaison F

F
Licence2: Gntique
Une bactrie qui contient le plasmide F est equivalente une bactrie F+ (synthse de pilli et du systme de scrtion dADN). les bactries HFR et F- sassocient (pilli)
LADN de F est rpliqu et inject dans la bactrie FCette rplication est initie OriT et fait entr lADN de F ainsi que lADN chromosomique contenu dans le F Une fois que tout LADN de F est entr et rpliqu dans la bactrie F-, il est circularis La bactrie F- est devenue F+ Cette bactrie est dipode pour chromosomique contenu dans le F On parle de diplodie partielle stable Les ADNs homologues peuvent recombiner lADN




Hardy-Weinberg
Analyse gntique de la dgradation du lactose chez E.coli Jacob & monod: Prix Nobel 1963
Licence2: Gntique
Isolement de trois gnes impliqus dans la dgradation du lactose chez E.coli Isolement de mutants [lac-] Tous sont localiss dans la mme rgion (co-transduction) Tous se rassemblent en trois groupes de complmentations (utilisation des F) lacZ: gne codant la bta-galactosidase lacY: gne codant la permase lacA: gne codant la trans-actylase lacZlacYlacA[lac-] [lac-] [lac-]
La mutation du gne lacI modifie lexpression de de lacZ, Y et A Dosage de lactivit du gne lacZ: souche lacI + Milieu avec lactose 100 UM 100 UM Milieu sans lactose 100 UM 0 UM
UM = Unit Miller Activit bta-galactosidase
Modle de la rgulation gntique de lopron lactose

Promoteur (P) Oprateur (O)
Licence2: Gntique
Sans lactose
lacI
ARNP
lacZ
lacY
lacA
Rpresseur actif
Avec lactose
Rpresseur inactif
lacI
lacZ
lacY
lacA
ARNP
Les phnotypes des mutants de lopron lactose vrifient le modle

Chez un diplode pour lopron lactose (ex: F lactose)
Promoteur (P) Oprateur (O)
Licence2: Gntique
Promoteur et Oprateur actifs en CIS lacY lacA

F lactose
lacI
lacZ
Represseur actif en CIS et en TRANS
lacI
Promoteur (P)
lacZ
Oprateur (O)
lacY
lacA
chromosome
Promoteur et Oprateur actifs en CIS




Hardy-Weinberg
Gntique des Populations

Pour le gnticien une population est une communaut de reproduction.
Licence2: Gntique
La gntique des populations essaie de dfinir les frquences dallles dans une population. Cas simple du groupe sanguin humain MN
Dans une population de 208 bdouins, On a: [M] = M/M = 119 [M,N] = M/N = 76 [N] = N/N = 13
Cette population est idale:
- Tous les gnotypes se voient (pas de rcessivit). - Les individus se croisent librement (panmixie). - Aucune slection. Et on peut crire: F M = p = ((2 x 119) + 76) / (2 x 208) = 0,755 F N = q = (1-p) = 0,245 M/M = p2 = 0,57 (118,6) M/N = 2pq = 0,37 (76,9) N/N = q2 = 0,06 (12,5)
Alors les croisements donnent:
M(p) M(p) N(q) M/M(p2) M/N(pq)
N(q) M/N(pq) N/N(q2)
Loi de Hardy-Weinberg
Licence2: Gntique
Dans une population isole deffectif illimit, non soumise la slection et dans laquelle il ny a pas de mutation, les frquences allliques restent constantes. Si les accouplements sont panmictiques, les frquences gnotypiques se dduisent directement des frquences allliques selon la relation:
FM = p M/M = p2
et
FN = q N/N = q2
M/N = 2pq
On observe: Blancs USA P2 0,540 Noirs USA 0,532 Indiens USA 0,776 Esquimaux Groenland O,913 Aborignes Australie 0,178
Loi de Hardy-Weinberg si rcessivit
Licence2: Gntique
La mucoviscidose est une maladie rcessive monognique qui touche 1 enfant sur 2500 en France. Selon la loi de Hardy-Weinberg, on a:
a/a = q2 = 1/2500 = 0,0004 Donc q = 0,02 Donc p = 0,98 Et on a: A/A = p2 = 0,964 A/a = 2pq = O,O392 ~ 1/25
Loi de Hardy-Weinberg si rcessivit et liaison au sexe
Licence2: Gntique
L hmophilie est une maladie rcessive monognique lie au chromosome X qui touche 1 garon sur 10000 en France. Selon la loi de Hardy-Weinberg: On a chez les garons (XY): soit Xa/Y , soit XA/Y donc Fa = q = 10-4 et FA = p = (1-q) = 0,9999 Donc chez les filles (XX), on a: a/a = q2 = (10-4 )2 = 10-8 A/A = p2 = 0,9998 a/A = 2pq = 1,9998 10-4 ~ 1/ 5000
Loi de Hardy-Weinberg si multialllisme
Licence2: Gntique
Cas du groupe sanguin humain ABO: On a : [A] = A/A ou A/o; [B] = B/B ou B/o; [AB] = A/B; [O] = o/o Si on pose FA = p; FB = q ; Fo = r Avec p + q + r = 1 Selon la loi de Hardy-Weinberg: [A] = p2 + 2pr [B] = q2 + 2qr [AB] = 2pq [0] = r2
Limite de Loi de Hardy-Weinberg
Licence2: Gntique
La loi de Hardy-Weinberg nest applicable qu une population panmictique.
Cas de la consanguinit (rgime ferm): On observe ce phnomne chez les albinos o 15% (1/6) des individus atteints (a/a) proviennent de mariages entre cousins. Si la consanguinit navait aucun effet, on aurait seulement 0,5% (1/200) dindividus atteints qui viendraient de ce type dunions. En fait, la consanguinit induit: A/a < 2pq Il faut faire intervenir un coefficient de Consanguinit dans la loi de Hardyweinberg. Ne sont pas panmictiques, les: - Rgimes ferms = Autogamie, consanguinit, homogamie ( A/a < 2pq ) - Rgimes ouverts = htrogamie ( A/a > 2pq )
supplments
Rgulation gntique: cis & trans

Chez un diplode pour lopron lactose (ex: F lactose)
Licence2: Gntique
Promoteur (P)
Oprateur (O)
Promoteur et Oprateur actifs en CIS lacY lacA

F lactose
lacI
lacZ
Represseur actif en CIS et en TRANS
lacI
Promoteur (P)
lacZ
Oprateur (O)
lacY
lacA
chromosome
Promoteur et Oprateur actifs en CIS
Rpression catabolique de loperon lactose: Diauxie lactose-glucose

Promoteur (P) +1 Oprateur (O)
Licence2: Gntique
lacI
En prsence de lactose
CRP-AMPc ARNP transcription
lacZ
exclusion dinducteur
Represseur inactif
ARNP
CRP-AMPc
- glucose + lactose
En prsence de lactose
+1
CRP
+ glucose
lacI
lacZ
loperon lactose
Promoteur
Licence2: Gntique
stop
lacZ
lacY
lacA
ARN polymrase ARNP ribosome
Bta-galactosidase
permase
transactylase

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Analyse Gntique Cours 1

Premire partie: Gntique Fondamentale (cours 1 et 2)

Deuxime partie: Gntique Mendlienne (cours 3 6)

Troisime partie: Gntique molculaire (procaryote, cours 7 9)

Quatrime partie: Gntique des populations (cours 10)

Unit fonctionnelle: gne

Transcription Traduction Codon initiation Codon Stop

Promoteur: exemple E.coli

Larchitecture dune protine est la cl de la fonction des gnes.

Importance de larchitecture dune protine: Notion de site actif

+ substrat enzyme enzyme

La structure tridimensionnelle de la protine (enzyme) dfinit sa fonction biochimique.

Mutation: au niveau de lADN

Gnration 1 ACGTC TGTAG

Gnrat 1 Altration dune base

ACGTC TGTAG ACGTC TGCAG

ACGTC TGCAG ACGTC TGCAG

Mutation: au niveau protique

Autres exemples de mutations

On parle de rversion ou de supression lorsquune mutation en annule une autre

- reversion vraie - reversion quivalente

Test de fluctuation: Luria & Delbrck

Licence2: Gntique - T10

nb. Colonie T1R 1 4 0 0 12 0 0 9 120 0 14,6

1 mutant culture2 4 mutants culture3 0 mutant

Frquence de mutation: loi de Poisson

Licence2: Gntique - T11

Alors, si T = le taux de mutation par division On a: Donc

f(la classe 0) = e -Td

f(la classe 0) = frquence des cultures

soit T = - (ln(f o)/d) = -(ln(5/10)/ 108) = 0,7 x 10-8

Isolement de mutants rsistants chez la E.coli

Licence2: Gntique - T12

talement de 1 ml soit ~108 E.coli

Isolement de mutants arg- chez E. coli

Licence2: Gntique - T13

Dilution 106 fois talement de 1 ml Soit ~100 E.coli

Premire partie: Gntique Fondamentale

Deuxime partie: Gntique Mendellienne

Troisime partie: Gntique molculaire (procaryote)

Quatrime partie: Gntique des populations

Enzymes dficientes: dominance et rcessivit chez les diplodes

Licence2: Gntique - T15

+ Enzyme active substrat

Homozygote sauvage a+/a+ [normal]

Htrozygote a+/a[normal] si haplo-suffisance [dficient] si haplo-insuffisance [intermdiaire] si co-dominance

Homozygote mutant a-/a[dficient]

Consquence fonctionnelle des mutations: 1

Licence2: Gntique - T16

Consquence fonctionnelle des mutations: 2

Licence2: Gntique - T17

Consquence fonctionnelle des mutations: 3

Licence2: Gntique - T18

+/m [?] [actif]

Croisement de mutants: la complmentation

Licence2: Gntique - T19

croisement Haplode (n) mutant 1 rcessif: [inactif]

Haplode (n) mutant 2 rcessif: [inactif]

Croisement de mutants: la non-complmentation

Licence2: Gntique - T20

croisement Haplode (n) mutant 1 rcessif: [inactif]

Haplode (n) mutant 2 rcessif: [inactif]

Un gne <-> une enzyme