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INMEGEN
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Mapa del
Genoma de
Poblaciones
Mexicanas
Libro de divulgacin
del Proyecto de
Diversidad Genmica
de la Poblacin Mexicana
Mapa del Genoma de Poblaciones Mexicanas
Libro de divulgacin del
Proyecto de Diversidad Genmica de la Poblacin Mexicana
Instituto Nacional de Medicina Genmica
Directorio
Dr. Francisco Xavier Sobern Mainero
Director General
Dra. Alessandra Carnevale Cantoni
Directora de Investigacin
Dr. Santiago March Mifsut
Director de Enseanza y Divulgacin
Dra. Ma. del Carmen lvarez-Buylla Roces
Directora de Vinculacin y Desarrollo Institucional
Lic. Juan Manuel Garca Rocha
Director de Administracin
Ing. Carlos Dvila Garca
Director de Desarrollo Tecnolgico
Mapa del Genoma de Poblaciones Mexicanas
Libro de divulgacin del
Proyecto de Diversidad Genmica de la Poblacin Mexicana
Textos
Dr. Gerardo Jimnez Snchez
Coordinacin Editorial
Subdireccin de Divulgacin Cientca
Lic. Alejandro Lpez Franco
Diseo e Ilustraciones
D.G. Gerardo Vaca Presbistero
Colaboradores
Dra. Irma Silva Zolezzi
Lic Jos Bedolla Castro
Mtro. Alejandro Rodrguez Torres
Lic. Anglica Martell Rodrguez
Lic. Berenice Gonzlez Miranda
D.G. Mauricio Guevara Galvn
Segunda Edicin. 2010
DR Instituto Nacional de Medicina Genmica
Perifrico Sur 4124, Torre Zaro II, Piso 6
Col. Jardines del Pedregal, Mxico, D.F. 01900, Mxico
www.inmegen.gob.mx
Impreso en Mxico
Print in Mexico
ISBN 970-42-0005-6
Contenido
El genoma humano. 4
El proyecto del genoma humano y la diversidad genmica 6
La medicina genmica 8
Variaciones genmicas entre las poblaciones 10
Mxico prepara una estrategia para no quedarse
fuera de la carrera genmica 12
La planeacin del proyecto para elaborar
el mapa del genoma de poblaciones mexicanas 14
Los aspectos ticos, legales y sociales del proyecto 16
Las visitas a los estados y la recoleccin de las muestras 18
El procesamiento de las muestras y la generacin de resultados 20
La publicacin de los resultados 22
Los principales hallazgos y los benecios del proyecto 24
El cuerpo humano tiene trillones de clulas, cada una tiene un ncleo en el cual se encuen-
tra el genoma humano. Esta molcula est formada de cido desoxirribonuclico o ADN,
mide cerca de metro y medio de largo y se compacta en 23 pares de estructuras llamadas
cromosomas. El ADN est compuesto por 3,200 millones de nucletidos o unidades que
conocemos por sus iniciales: A (Adenina), C (Citosina), T (Timina) y G (Guanina).
El orden preciso de cada letra es fundamental pues en la secuencia se encuentran las ins-
trucciones para cada una de las reacciones qumicas que lleva a cabo el organismo. Estas
instrucciones se encuentran en los genes, que son segmentos de la cadena. Hay cerca de
25,000 genes en el genoma humano. Es as, que al genoma humano se le conoce como el
Libro de la Vida y lo podramos comparar con un texto escrito con 3,200 millones de le-
tras, utilizando un alfabeto de solo cuatro letras. La mitad del genoma humano la heredamos
de nuestra madre y la otra de nuestro padre.
El genoma humano est en permanente interaccin con el medio ambiente, de tal forma
que responde a los estmulos que recibe. As, mientras el ser humano se adapte plenamente
al medio ambiente se encontrar sano.
El genoma
humano
4
El Proyecto del Genoma Humano (1990-2004) se j como objetivo encontrar el orden
preciso de cada una de las letras que lo forman y establecer un mapa que ubicara a cada
uno de los genes que ah se albergan.
Los seres humanos compartimos cerca del 99.9% de la secuencia del genoma humano. El
0.1% restante no se comparte sino que otorga la individualidad genmica a cada individuo,
dando caractersticas propias como el color del pelo, la forma de la cara o el tono del color
de ojos. Estas variaciones en el genoma tambin coneren a cada uno diferentes grados
de riesgo o proteccin a enfermedades comunes como diabetes, obesidad, hipertensin,
cncer, entre otras.

Las variaciones ms comunes en el genoma humano son los cambios de una letra por otra
que se conocen como SNPs por sus siglas en ingls. Esto quiere decir que hay posiciones en
la cadena donde Pedro puede tener una A, mientras que Lupita tiene una T en esa misma
posicin. Se han descubierto cerca de 10 millones de estos cambios y al parecer cada uno
de nosotros tenemos cerca de tres millones de ellos en nuestro genoma. Podramos ima-
ginar el conjunto de SNPs de una persona como un cdigo de barras nico que identica
a cada uno.
El proyecto del genoma humano y
la diversidad genmica
6
Las enfermedades tienen un componente gentico y otro ambiental, los dos igualmente
importantes. La capacidad de leer las variaciones del genoma humano dio lugar a un nuevo
reto: buscar aquellas que aumentan el riesgo para padecer enfermedades comunes. As, po-
dremos adaptar el medio ambiente, es decir nuestro estilo de vida, a los riesgos genticos
de cada persona y el doctor podr darnos una atencin mdica ms individualizada, ms
predictiva y ms preventiva.
Ah! Una cosa debe quedarte clara, la medicina genmica no guarda relacin con la clo-
nacin de seres humanos, ni con la manipulacin de embriones humanos o de clulas
madre. Tampoco se relaciona con la reproduccin asistida, ni manipula genes para selec-
cionar rasgos de los individuos en una poblacin.
Imagnate, la medicina genmica, permitir en el futuro leer nuestro genoma para saber
de que debemos cuidarnos antes de tener sntomas de las enfermedades, y as evitar o
retrasar su aparicin, sus complicaciones y secuelas y reducir costos de atencin! Mas
an, dar lugar a nuevas estrategias de tratamiento como la farmacogenmica generando
medicamentos ms efectivos y menos txicos con base en la estructura genmica de cada
poblacin.
La medicina
genmica
8
Poco tiempo despus surgi el Proyecto Internacional del HapMap que se propuso encon-
trar las variaciones ms frecuentes en algunas poblaciones ancestrales del mundo. As, para
encontrar la variabilidad genmica entre y dentro de estas poblaciones se tomaron mues-
tras de sangre de voluntarios de frica, Europa y Asia. El conocimiento de estas variaciones
permitira a los cientcos acelerar el descubrimiento de genes que predisponen o coneren
resistencia a enfermedades comunes.
El desarrollo del HapMap requiri de nuevas y ms avanzadas tecnologas, entre ellas los
chips que leen el genoma humano y las supercomputadoras que integran la informacin en
grandes bases de datos.
Los resultados de este proyecto, que termin en 2006, estn depositados en una base de
datos que todos podemos consultar gratuitamente a travs del internet.
El HapMap no incluy a poblaciones de Amrica Latina, cuya mayora es mestiza, es decir,
que tiene una ancestra mixta a la cual contribuyen poblaciones ancestrales locales, euro-
peas y africanas, lo cual gener el riesgo segregar a la poblacin de Mxico, y a otros pases
de la regin, de los benecios que derivaran de este nuevo conocimiento.
Variaciones genmicas
entre las poblaciones
10
El importante impacto que tendra el conocimiento de las variaciones del genoma humano
en la salud pblica hizo que Mxico planeara una estrategia para que la medicina genmica
se incorporara a sus prioridades.
As, investigadores mexicanos elaboraron un plan para trabajar en la investigacin cientca
sobre las aplicaciones mdicas del genoma humano. De ah surgieron diferentes proyectos
que incluan el estudio de las caractersticas del genoma de los mexicanos en forma similar
al HapMap.
Hubo importantes instituciones mexicanas que sumaron esfuerzos para este propsito. En
forma destacada la Secretara de Salud, la Universidad Nacional Autnoma de Mxico, el
Consejo Nacional de Ciencia y Tecnologa y la Fundacin Mexicana para la Salud. Ms an,
los diputados y los senadores mexicanos trabajaron intensamente para asegurar que Mxi-
co participara cabalmente en el desarrollo de la medicina genmica, y para ello, crearon el
Instituto Nacional de Medicina Genmica (INMEGEN) que naci el 20 de Julio de 2004. Su
misin consisti en desarrollar investigacin cientca, infraestructura tecnolgica, progra-
mas educativos y de divulgacin, que sirvieran de base para el desarrollo de una plataforma
de medicina genmica para los mexicanos.
Mxico prepara una estrategia
para no quedarse fuera
de la carrera genmica
12
El reto no era minsculo! Mxico es un pas con una gran riqueza cultural producto de su
historia. Su poblacin, mestiza en su mayora, resulta de la mezcla de genomas de poblacio-
nes ancestrales indgenas, espaolas y, en menor proporcin, africanas que llegaron a Mxico
en tiempos de la colonia.
El INMEGEN se puso a trabajar y elabor el proyecto del Mapa del Genoma de Pobla-
ciones Mexicanas, cuyo objetivo es conocer las variaciones mas frecuentes en la poblacin
mexicana usando modernas tecnologas genmicas para estudiar muestras de participantes
mexicanos. Para lograr el objetivo haba que ir a regiones distantes del pas a invitar a la
poblacin a participar, montar unidades de alta tecnologa, desarrollar metodologas de la-
boratorio y bioinformtica, y conseguir los recursos necesarios para lograr el objetivo.
As, las Comisiones de Investigacin, de Etica y de Bioseguridad del INMEGEN aprobaron el
proyecto en junio de 2005 y pocos meses despus comenzaron las visitas a diversas partes
de Mxico.
Manos a la obra! En poco tiempo el INMEGEN haba comenzado uno de los proyectos
cientcos ms ambiciosos para conocer las caractersticas del mapa del genoma de pobla-
ciones mexicanas.
La planeacin del proyecto para
elaborar el mapa del genoma de
poblaciones mexicanas
14
Si bien el reto cientco tecnolgico era de enorme envergadura, se puso especial cuidado
en los aspectos ticos, legales y sociales. Para ello, se consultaron a los expertos mundiales
en esta materia, pues el INMEGEN se haba propuesto disear una de las mejores estrate-
gias del mundo para desarrollar el proyecto con pleno apego a las leyes mexicanas y a los
principios ticos universales. Todas las muestras seran annimas y solo algunas llegaran
al resultado nal, as se protegi la privacidad de los participantes!
Se dise un procedimiento para consultar a las comunidades sobre su inters en el pro-
yecto y una carta de consentimiento individual que explicaba el proyecto y las implicaciones
de dar una muestra. Esta carta se peg en forma de poster por las ciudades. Adems se
reparti un trptico informativo al pblico en general.
En cada estado participante se estableci un equipo de trabajo formado por los cientcos
del INMEGEN y las autoridades estatales encabezadas por su gobernador o gobernadora.
Se llevaron a cabo reuniones de trabajo para la aprobacin local del proyecto y se dise-
aron campaas de informacin que incluyeron conferencias pblicas para explicarlo a la
poblacin.
Los aspectos ticos,
legales y sociales del proyecto
16
Inicialmente participaron Yucatn, Sonora, Veracruz, Guerrero, Zacatecas, Guanajuato, Oaxa-
ca. Posteriormente se sumaron Durango, Campeche y Tamaulipas.
La preparacin en cada estado fue muy intensa, los medios de comunicacin tuvieron un
papel muy importante al explicar claramente el proyecto al pblico. Tres a cuatro semanas
despus, llegado el da de recoleccin de las muestras. Se invit a todos. Quien quisiera do-
nar una muestra, requera ser mayor de 18 aos, originario del estado en que se colectaron
las mismas y que sus dos padres y cuatro abuelos tambin lo fueran.
La toma de las muestras en cada estado se acompa de un evento acadmico con con-
ferencistas locales y del INMEGEN, casi siempre en las universidades locales. Participaron
cientos de personas y en cada caso se rm un convenio de colaboracin entre el gobierno
estatal, el INMEGEN y la universidad participante.
Las las eran inmensas! Afuera del auditorio se instalaron unidades para las tomas de
muestras annimas con personal especializado. Donaron muestras 100 hombres y 100
mujeres en cada estado. Los donadores primero leyeron el consentimiento informado, que
rmaron frente a dos testigos de la comunidad e investigadores del INMEGEN, a n de
consultar sus dudas antes de contribuir con una muestra.
Cada tubo de sangre fue etiquetado con un cdigo de barras que identicaba el estado
donde se haba recolectado y el gnero de la persona. Esa misma noche, despus de cada
jornada, las muestras llegaron al INMEGEN en la Ciudad de Mxico para su resguardo.
Las visitas a los estados
y la recoleccin de las muestras
18
Las muestras reposaban tranquilamente en el refrigerador del laboratorio mientras se pre-
paraba un grupo de cientcos para extraer el genoma de cada tubo de sangre. Para ello
utilizaron modernos mtodos, equipos de laboratorio y robots sosticados que llevaban a
cabo el trabajo con gran precisin. El trabajo fue arduo y muchas horas despus se obtena
el genoma puricado de cada uno de los participantes.
Ms adelante, otro grupo de especialistas apoyados por la tecnologa ms avanzada, tomaba
las hebras del genoma humano, las cortaba, las pintaba con un colorante e introduca cada
muestra a un chip de plstico que cabe en la palma de la mano. Un par de pasos ms ade-
lante, un microscopio con rayo lser lea cada uno de los chips identicando miles de SNPs
en cada muestra y transmitiendo las seales a una computadora.
Por otra parte, un grupo de expertos en sistemas computacionales integraban la informa-
cin en una supercomputadora preparada para este n que procesaba 2.3 trillones de
operaciones por segundo!
As, despus de semanas y meses de intenso trabajo, un grupo de genetistas, matemticos y
estadsticos, entre otros, descifraban los resultados que daran lugar al primer borrador del
mapa del genoma de poblaciones mexicanas.
El procesamiento de las muestras
y la generacin de resultados
20
Los estados de la Repblica Mexicana participantes fueron seleccionados con base en su
historia demogrca, ubicacin geogrca y voluntad para participar, a n de generar una
muestra que incluyera la variabilidad gentica comn de los mexicanos. Participaron Yuca-
tn, Zacatecas, Sonora, Guanajuato, Veracruz, Guerrero, Oaxaca, Campeche, Tamaulipas y
Durango.
En total se recibieron muestras de cerca de 3,000 participantes de los diez estados de la
Repblica: 1,500 hombres y 1,500 mujeres. La muestra incluy cuatro grupos indgenas: Te-
pehuanos de Durango, Mixtecos y Zapotecos de Oaxaca y Mayas de Campeche.
La primera fase de anlisis incluy a los primeros seis estados mencionados y al grupo Za-
poteca en quienes se analizaron 100,000 SNPs. Las siguientes fases llegarn a un milln y
medio de SNPs en un mayor nmero de poblaciones.

Estos resultados se han integrado en un mapa genmico interactivo y disponible al pblico
por Internet en: http://diversity.inmegen.gob.mx. Adems, los resultados cientcos iniciales
se publicaron en una de las revistas cientcas ms importantes del mundo, Proceedings of
the National Academy of Sciences (PNAS). Peridicamente el INMEGEN publica un infor-
me de avances del proyecto en www.inmegen.gob.mx
La publicacin
de los resultados
22
Los resultados iniciales del proyecto muestran que las diferencias genticas entre mestizos
de diferentes regiones de Mxico se deben principalmente a diferencias en contribuciones
ancestrales entre poblaciones europeas y amerindias. La comparacin de la proporcin
de estas contribuciones entre los estados participantes demostr diferencias importantes
entre algunos de ellos.
El anlisis de los resultados detect la existencia de algunos SNPs privados en los mestizos
mexicanos, es decir, que no estn presentes en las poblaciones del HapMap, lo que sugiere
su origen amerindio. Es importante destacan que estos y otros SNPs privados que segu-
ramente existen, no seran detectados si se estudia a la poblacin mexicana con los datos
generados por el HapMap.
La pregunta sobre la utilidad del HapMap para estudiar el genoma de los mexicanos se
respondi mediante un anlisis de haplotipos compartidos. Este demostr que para tener
una cobertura signicativa del genoma en los mexicanos es necesario leer todos los SNPs
estudiados en las cuatro poblaciones del HapMap, lo que si bien indica que los resultados
del HapMap podran utilizarse en la poblacin mexicana, demuestra tambin que resultara
extraordinariamente costoso.
Este resultado es crtico para Mxico y otros pases de Amrica Latina en donde el nan-
ciamiento para la investigacin cientca a menudo es limitado. Ms an, resultara poco
Los principales hallazgos
y los benecios del proyecto
24
razonable, pues los resultados del estudio demostraron que cuando se utiliza como re-
ferencia cualquiera de los estados de la Repblica participantes, se logra una cobertura
mucho mayor del genoma de la poblacin mexicana que cuando se utiliza cualquiera de las
poblaciones del HapMap.
Los resultados iniciales del proyecto demostraron la factibilidad e importancia estratgica
para Mxico de contar con una base de datos pblica con la informacin inicial sobre la
estructura genmica de los mexicanos y un catlogo de sus variaciones ms comunes. Este
recurso pblico se convertir en una importante fuente de informacin para el diseo de
los estudios genmicos dirigidos a encontrar genes asociados a enfermedades comunes, no
slo en Mxico, sino tambin en muchas partes de Amrica Latina.
La aventura apenas ha comenzado, se han establecido bases robustas para que Mxico
participe plenamente de la era genmica, con los benecios que sta traer. Esta primera
parte del proyecto demuestra claramente cmo los cientcos mexicanos pueden enfrentar
competitivamente los retos cientcos y tecnolgicos del mundo contemporneo.
Lo mejor est por venir
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Mapa del Genoma de Poblaciones Mexicanas
Libro de divulgacin del
Proyecto de Diversidad Genmica de la Poblacin Mexicana
Tiraje
2000 ejemplares
Agosto de 2010
Impreso por
Talleres Grcos de Mxico
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Mapa del
Genoma de
Poblaciones
Mexicanas
Libro de divulgacin
del Proyecto de
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