cido desoxirribonucleico

ADN redirige aqu. Para otras acepciones, vase ADN (desambiguacin).

DNA redirige aqu. Para otras acepciones, vase DNA (desambiguacin).


Situacin del ADN dentro de una clula eucariota.
El cido desoxirribonucleico, frecuentemente abreviado comoADN, es un cido nucleico que
contiene instrucciones genticasusadas en el desarrollo y funcionamiento de todos
los organismosvivos conocidos y algunos virus, y es responsable de su transmisinhereditaria. El
papel principal de la molcula de ADN es el almacenamiento a largo plazo de informacin. Muchas
veces, el ADN es comparado con un plano o una receta, o un cdigo, ya que contiene las
instrucciones necesarias para construir otros componentes de las clulas, como las protenas y las
molculas deARN. Los segmentos de ADN que llevan esta informacin gentica son
llamados genes, pero las otras secuencias de ADN tienen propsitos estructurales o toman parte en
la regulacin del uso de esta informacin gentica.
Desde el punto de vista qumico, el ADN es un polmero de nucletidos, es decir, un polinucletido.
Un polmero es un compuesto formado por muchas unidades simples conectadas entre s, como si
fuera un largo tren formado por vagones. En el ADN, cadavagn es un nucletido, y cada nucletido,
a su vez, est formado por un azcar (la desoxirribosa), una base nitrogenada (que puede
seradeninaA, timinaT, citosinaC o guaninaG) y un grupo fosfatoque acta como enganche
de cada vagn con el siguiente. Lo que distingue a un vagn (nucletido) de otro es, entonces, la
base nitrogenada, y por ello la secuencia del ADN se especifica nombrando slo la secuencia de sus
bases. La disposicin secuencial de estas cuatro bases a lo largo de la cadena (el ordenamiento de
los cuatro tipos de vagones a lo largo de todo el tren) es la que codifica la informacin gentica: por
ejemplo, una secuencia de ADN puede ser ATGCTAGATCGC... En los organismos vivos, el ADN se
presenta como una doble cadena de nucletidos, en la que las dos hebras estn unidas entre s por
unas conexiones denominadas puentes de hidrgeno.
1

Para que la informacin que contiene el ADN pueda ser utilizada por la maquinaria celular, debe
copiarse en primer lugar en unostrenes de nucletidos, ms cortos y con unas unidades diferentes,
llamados ARN. Las molculas de ARN se copian exactamente del ADN mediante un proceso
denominado transcripcin. Una vez procesadas en el ncleo celular, las molculas de ARN pueden
salir alcitoplasma para su utilizacin posterior. La informacin contenida en el ARN se interpreta
usando el cdigo gentico, que especifica la secuencia de los aminocidos de las protenas, segn
una correspondencia de un triplete de nucletidos (codn) para cada aminocido. Esto es, la
informacin gentica (esencialmente: qu protenas se van a producir en cada momento del ciclo de
vida de una clula) se halla codificada en las secuencias de nucletidos del ADN y debe traducirse
para poder funcionar. Tal traduccin se realiza usando el cdigo gentico a modo de diccionario. El
diccionario "secuencia de nucletido-secuencia de aminocidos" permite el ensamblado de largas
cadenas de aminocidos (las protenas) en el citoplasma de la clula. Por ejemplo, en el caso de la
secuencia de ADN indicada antes (ATGCTAGATCGC...), la ARN polimerasa utilizara como molde
la cadena complementaria de dicha secuencia de ADN (que sera TAC-GAT-CTA-GCG-...) para
transcribir una molcula de ARNm que se leera AUG-CUA-GAU-CGC-... ; el ARNm resultante,
utilizando el cdigo gentico, se traducira como la secuencia de aminocidos metionina-leucina-
cido asprtico-arginina-...
Las secuencias de ADN que constituyen la unidad fundamental, fsica y funcional de la herencia se
denominan genes. Cada gen contiene una parte que se transcribe a ARN y otra que se encarga de
definir cundo y dnde deben expresarse. La informacin contenida en los genes (gentica) se
emplea para generar ARN y protenas, que son los componentes bsicos de las clulas, los
"ladrillos" que se utilizan para la construccin de los orgnulos u organelos celulares, entre otras
funciones.
Dentro de las clulas, el ADN est organizado en estructuras llamadas cromosomas que, durante
el ciclo celular, se duplican antes de que la clula se divida. Los organismos eucariotas (por
ejemplo, animales, plantas, y hongos) almacenan la mayor parte de su ADN dentro del ncleo
celular y una mnima parte en elementos celulares llamados mitocondrias, y en los plastos y los
centros organizadores de microtbulos o centrolos, en caso de tenerlos; los organismos
procariotas (bacterias y arqueas) lo almacenan en elcitoplasma de la clula, y, por ltimo, los virus
ADN lo hacen en el interior de la cpsida de naturaleza proteica. Existen multitud de protenas, como
por ejemplo las histonas y los factores de transcripcin, que se unen al ADN dotndolo de una
estructura tridimensional determinada y regulando su expresin. Los factores de
transcripcin reconocen secuencias reguladoras del ADN y especifican la pauta de transcripcin de
los genes. El material gentico completo de una dotacin cromosmica se denomina genomay, con
pequeas variaciones, es caracterstico de cada especie.


Historia de la gentica[editar editar fuente]
Artculo principal: Historia de la gentica.


Friedrich Miescher, bilogo y mdico suizo (1844-1895).
El ADN lo aisl por primera vez, durante el invierno de 1869, el mdico suizo Friedrich
Miescher mientras trabajaba en la Universidad de Tubinga. Miescher realizaba experimentos
acerca de la composicin qumica del pus de vendas quirrgicas desechadas cuando not un
precipitado de una sustancia desconocida que caracteriz qumicamente ms tarde.
2

3
Lo
llam nuclena, debido a que lo haba extrado a partir de ncleos celulares.
4
Se necesitaron
casi 70 aos de investigacin para poder identificar los componentes y laestructura de los
cidos nucleicos.
En 1919 Phoebus Levene identific que un nucletido est formado por una base nitrogenada,
un azcar y un fosfato.
5
Levene sugiri que el ADN generaba una estructura con forma
de solenoide (muelle) con unidades de nucletidos unidos a travs de los grupos fosfato. En
1930 Levene y su maestro Albrecht Kossel probaron que la nuclena de Miescher es un cido
desoxirribonucleico (ADN) formado por cuatro bases nitrogenadas
(citosina (C),timina (T), adenina (A) y guanina (G)), el azcar desoxirribosa y un grupo fosfato, y
que, en su estructura bsica, el nucletido est compuesto por un azcar unido a la base y al
fosfato.
6
Sin embargo, Levene pensaba que la cadena era corta y que las bases se repetan en
un orden fijo. En 1937 William Astbury produjo el primer patrn de difraccin de rayos Xque
mostraba que el ADN tena una estructura regular.
7



Maclyn McCarty con Francis Crick y James D Watson.
La funcin biolgica del ADN comenz a dilucidarse en 1928, con una serie bsica de
experimentos de la gentica moderna realizados por Frederick Griffith, quien estaba trabajando
con cepas "lisas" (S) o "rugosas" (R) de la bacteria Pneumococcus (causante de la neumona),
segn la presencia (S) o no (R) de una cpsula azucarada, que es la que confiere virulencia
(vase tambin experimento de Griffith). La inyeccin de neumococos S vivos en ratones
produce la muerte de stos, y Griffith observ que, si inyectaba ratones con neumococos R
vivos o con neumococos S muertos por calor, los ratones no moran. Sin embargo, si inyectaba
a la vez neumococos R vivos y neumococos S muertos, los ratones moran, y en su sangre se
podan aislar neumococos S vivos. Como las bacterias muertas no pudieron haberse
multiplicado dentro del ratn, Griffith razon que deba producirse algn tipo de cambio o
transformacin de un tipo bacteriano a otro por medio de una transferencia de alguna sustancia
activa, que denomin principio transformante. Esta sustancia proporcionaba la capacidad a los
neumococos R de producir una cpsula azucarada y transformarse as en virulentas. En los
siguientes 15 aos, estos experimentos iniciales se replicaron mezclando distintos tipos de
cepas bacterianas muertas por el calor con otras vivas, tanto en ratones (in vivo) como en
tubos de ensayo (in vitro).
8
La bsqueda del factor transformante que era capaz de hacer
virulentas a cepas que inicialmente no lo eran continu hasta 1944, ao en el cual Oswald
Avery, Colin MacLeod y Maclyn McCarty realizaron un experimento hoy clsico. Estos
investigadores extrajeron la fraccin activa (el factor transformante) y, mediante anlisis
qumicos, enzimticos y serolgicos, observaron que no contena protenas, ni lpidos no
ligados, ni polisacridos activos, sino que estaba constituido principalmente por "una forma
viscosa de cido desoxirribonucleico altamente polimerizado", es decir, ADN. El ADN extrado
de las cepas bacterianas S muertas por el calor lo mezclaron "in vitro" con cepas R vivas: el
resultado fue que se formaron colonias bacterianas S, por lo que se concluy inequvocamente
que el factor o principio transformante era el ADN.
9

A pesar de que la identificacin del ADN como principio transformante an tard varios aos en
ser universalmente aceptada, este descubrimiento fue decisivo en el conocimiento de la base
molecular de la herencia, y constituye el nacimiento de la gentica molecular. Finalmente, el
papel exclusivo del ADN en la heredabilidad fue confirmado en 1952 mediante los
experimentos de Alfred Hershey y Martha Chase, en los cuales comprobaron que el fago
T2 transmita su informacin gentica en su ADN, pero no en su protena
10
(vase
tambin experimento de Hershey y Chase).
En cuanto a la caracterizacin qumica de la molcula, en 1940 Chargaff realiz algunos
experimentos que le sirvieron para establecer las proporciones de las bases nitrogenadas en el
ADN. Descubri que las proporciones de purinas eran idnticas a las de pirimidinas, la
"equimolecularidad" de las bases ([A]=[T], [G]=[C]) y el hecho de que la cantidad de G+C en
una determinada molcula de ADN no siempre es igual a la cantidad de A+T y puede variar
desde el 36 hasta el 70 por ciento del contenido total.
6
Con toda esta informacin y junto con
los datos de difraccin de rayos X proporcionados por Rosalind Franklin, James
Watson y Francis Crick propusieron en1953 el modelo de la doble hlice de ADN para
representar la estructura tridimensional del polmero.
11
En una serie de cinco artculos en el
mismo nmero de Nature se public la evidencia experimental que apoyaba el modelo de
Watson y Crick.
12
De stos, el artculo de Franklin y Raymond Gosling fue la primera
publicacin con datos de difraccin de rayos X que apoyaba el modelo de Watson y Crick,
13

14
y
en ese mismo nmero de Nature tambin apareca un artculo sobre la estructura del ADN
de Maurice Wilkins y sus colaboradores.
15

Watson, Crick y Wilkins recibieron conjuntamente, en 1962, despus de la muerte de Rosalind
Franklin, el Premio Nobel en Fisiologa o Medicina.
16
Sin embargo, el debate contina sobre
quin debera recibir crdito por el descubrimiento.
17

Propiedades fsicas y qumicas[editar editar fuente]


Estructura qumica del ADN: dos cadenas de nucletidos conectadas mediante puentes de hidrgeno, que
aparecen como lneas punteadas.
El ADN es un largo polmero formado por unidades repetitivas, losnucletidos.
18

19
Una doble
cadena de ADN mide de 22 a 26angstroms (2,2 a 2,6 nanmetros) de ancho, y una unidad (un
nucletido) mide 3,3 (0,33 nm) de largo.
20
Aunque cada unidad individual que se repite es
muy pequea, los polmeros de ADN pueden ser molculas enormes que contienen millones
denucletidos. Por ejemplo, el cromosoma humano ms largo, elcromosoma nmero 1, tiene
aproximadamente 220 millones de pares de bases.
21

En los organismos vivos, el ADN no suele existir como una molcula individual, sino como una
pareja de molculas estrechamente asociadas. Las dos cadenas de ADN se enroscan sobre s
mismas formando una especie de escalera de caracol, denominada doble hlice. El modelo de
estructura en doble hlice fue propuesto en 1953por James Watson y Francis Crick (el
artculo Molecular Structure of Nucleic Acids: A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid fue
publicado el 25 de abril de 1953 en Nature), despus de obtener una imagen de la estructura
de doble hlice gracias a la refraccin por rayos X hecha por Rosalind Franklin.
22
El xito de
este modelo radicaba en su consistencia con las propiedades fsicas y qumicas del ADN. El
estudio mostraba adems que la complementariedad de bases poda ser relevante en
su replicacin, y tambin la importancia de la secuencia de bases como portadora de
informacin gentica.
2324

25
Cada unidad que se repite, el nucletido, contiene un segmento de
la estructura de soporte (azcar + fosfato), que mantiene la cadena unida, y una base, que
interacciona con la otra cadena de ADN en la hlice. En general, una base ligada a un azcar
se denomina nuclesido y una base ligada a un azcar y a uno o ms grupos fosfatos recibe el
nombre de nucletido.
Cuando muchos nucletidos se encuentran unidos, como ocurre en el ADN, el polmero
resultante se denomina polinucletido.
26

Componentes[editar editar fuente]
Estructura de soporte: La estructura de soporte de una hebra de ADN est formada por
unidades alternas de grupos fosfato yazcar.
27
El azcar en el ADN es una pentosa,
concretamente, la desoxirribosa.
cido fosfrico:


Enlace fosfodister. El grupo fosfato (PO4
3-
) une el carbono 5' del azcar de un nuclesido con el carbono 3' del
siguiente.
Su frmula qumica es H
3
PO
4
. Cada nucletido puede contener uno
(monofosfato:AMP), dos (difosfato: ADP) o tres (trifosfato: ATP) grupos de cido
fosfrico, aunque como monmeros constituyentes de los cidos nucleicos slo
aparecen en forma de nuclesidos monofosfato.
Desoxirribosa:
Es un monosacrido de 5 tomos de carbono (una pentosa) derivado de la ribosa, que
forma parte de la estructura de nucletidos del ADN. Su frmula es C
5
H
10
O
4
. Una de
las principales diferencias entre el ADN y el ARN es el azcar, pues en el ARN la 2-
desoxirribosa del ADN es reemplazada por una pentosa alternativa, laribosa.
25

Las molculas de azcar se unen entre s a travs de grupos fosfato, que
formanenlaces fosfodister entre los tomos de carbono tercero (3, tres prima) y
quinto (5, cinco prima) de dos anillos adyacentes de azcar. La formacin
de enlacesasimtricos implica que cada hebra de ADN tiene una direccin. En
una doble hlice, la direccin de los nucletidos en una hebra (3 5) es opuesta a la
direccin en la otra hebra (5 3). Esta organizacin de las hebras de ADN se
denomina antiparalela; son cadenas paralelas, pero con direcciones opuestas. De la
misma manera, los extremos asimtricos de las hebras de ADN se denominanextremo
5 (cinco prima) y extremo 3 (tres prima), respectivamente.
Bases nitrogenadas:
Las cuatro bases nitrogenadas mayoritarias que se encuentran en el ADN son
laadenina (A), la citosina (C), la guanina (G) y la timina (T). Cada una de estas cuatro
bases est unida al armazn de azcar-fosfato a travs del azcar para formar el
nucletido completo (base-azcar-fosfato). Las bases son compuestos
heterocclicos y aromticos con dos o ms tomos de nitrgeno, y, dentro de las bases
mayoritarias, se clasifican en dos grupos: las bases pricas o purinas(adenina y
guanina), derivadas de la purina y formadas por dos anillos unidos entre s, y las bases
pirimidnicas o bases pirimdicaso pirimidinas (citosina y timina), derivadas de la
pirimidina y con un solo anillo.
25
En los cidos nucleicos existe una quinta base
pirimidnica, denominada uracilo (U), que normalmente ocupa el lugar de la timina en
el ARN y difiere de sta en que carece de un grupo metilo en su anillo. El uracilo no se
encuentra habitualmente en el ADN, slo aparece raramente como un producto
residual de la degradacin de la citosina por procesos de desaminacin oxidativa.


Timina: 2, 4-dioxo, 5-metilpirimidina.
Timina:
En el cdigo gentico se representa con la letra T. Es un derivado pirimidnico con
un grupo oxoen las posiciones 2 y 4, y un grupo metil en la posicin 5. Forma
el nuclesido timidina (siempre desoxitimidina, ya que slo aparece en el ADN) y
el nucletido timidilato o timidina monofosfato (dTMP). En el ADN, la timina siempre
se empareja con la adenina de la cadena complementaria mediante 2 puentes de
hidrgeno, T=A. Su frmula qumica es C
5
H
6
N
2
O
2
y su nomenclatura 2, 4-dioxo, 5-
metilpirimidina.


Citosina: 2-oxo, 4-aminopirimidina.
Citosina:
En el cdigo gentico se representa con la letra C. Es un derivado pirimidnico, con
un grupo amino en posicin 4 y un grupo oxo en posicin 2. Forma
el nuclesido citidina (desoxicitidina en el ADN) y elnucletido citidilato o
(desoxi)citidina monofosfato (dCMP en el ADN, CMP en el ARN). La citosina siempre
se empareja en el ADN con la guanina de la cadena complementaria mediante un triple
enlace,CG. Su frmula qumica es C
4
H
5
N
3
O y su nomenclatura 2-oxo, 4
aminopirimidina. Su masa moleculares de 111,10 unidades de masa atmica. La
citosina se descubri en 1894, al aislarla del tejido del timode carnero.


Adenina: 6-aminopurina.
Adenina:
En el cdigo gentico se representa con la letra A. Es un derivado de la purina con un
grupo amino en la posicin 6. Forma el nuclesidoadenosina (desoxiadenosina en el
ADN) y el nucletido adenilato o (desoxi)adenosina monofosfato (dAMP, AMP). En el
ADN siempre se empareja con la timina de la cadena complementaria mediante 2
puentes de hidrgeno, A=T. Su frmula qumica es C
5
H
5
N
5
y su nomenclatura 6-
aminopurina. La adenina, junto con la timina, fue descubierta en 1885 por el mdico
alemn Albrecht Kossel.


Guanina: 6-oxo, 2-aminopurina.
Guanina:
En el cdigo gentico se representa con la letra G. Es un derivado prico con un grupo
oxo en la posicin 6 y un grupo amino en la posicin 2. Forma el nuclesido
(desoxi)guanosina y el nucletido guanilato o (desoxi)guanosina monofosfato (dGMP,
GMP). La guanina siempre se empareja en el ADN con la citosina de la cadena
complementaria mediante tres enlaces de hidrgeno, GC. Su frmula qumica es
C
5
H
5
N
5
O y su nomenclatura 6-oxo, 2-aminopurina.
Tambin existen otras bases nitrogenadas (las
llamadas bases nitrogenadas minoritarias), derivadas de
forma natural o sinttica de alguna otra base mayoritaria. Lo
son por ejemplo la hipoxantina, relativamente abundante en
el tRNA, o la cafena, ambas derivadas de la adenina; otras,
como elaciclovir, derivadas de la guanina, son anlogos
sintticos usados en terapia antiviral; otras, como una de las
derivadas del uracilo, son antitumorales.
Las bases nitrogenadas tienen una serie de caractersticas
que les confieren unas propiedades determinadas. Una
caracterstica importante es su carcter aromtico,
consecuencia de la presencia en el anillo de dobles enlaces
en posicin conjugada. Ello les confiere la capacidad de
absorber luz en la zona ultravioleta del espectro en torno a
los 260 nm, lo cual puede aprovecharse para determinar
el coeficiente de extincin del ADN y hallar la concentracin
existente de los cidos nucleicos. Otra de sus caractersticas
es que presentan tautomera o isomera de grupos
funcionales, debido a que un tomo de hidrgeno unido a
otro tomo puede migrar a una posicin vecina; en las bases
nitrogenadas se dan dos tipos de tautomeras:
tautomera lactama-lactima, donde el hidrgeno migra del
nitrgeno al oxgeno del grupo oxo (forma lactama) y
viceversa (forma lactima), y tautomera imina-
amina primaria, donde el hidrgeno puede estar formando el
grupo amina (forma amina primaria) o migrar al nitrgeno
adyacente (forma imina). La adenina slo puede presentar
tautomera amina-imina, la timina y el uracilo muestran
tautomera doble lactama-lactima, y la guanina y citosina
pueden presentar ambas. Por otro lado, y aunque se trate de
molculas apolares, las bases nitrogenadas presentan
suficiente carcterpolar como para establecer puentes de
hidrgeno, ya que tienen tomos
muy electronegativos (nitrgeno y oxgeno) que presentan
carga parcial negativa, y tomos de hidrgeno con carga
parcial positiva, de manera que se forman dipolos que
permiten que se formen estos enlaces dbiles.
Se estima que el genoma humano haploide tiene alrededor
de 3.000 millones de pares de bases. Para indicar el tamao
de las molculas de ADN se indica el nmero de pares de
bases, y como derivados hay dos unidades de medida muy
utilizadas, la kilobase(kb), que equivale a 1.000 pares de
bases, y la megabase (Mb), que equivale a un milln de
pares de bases.
Apareamiento de bases[editar editar fuente]
Vase tambin: Par de bases.


Un par de bases CG con tres puentes de hidrgeno.


Un par A=T con dos puentes de hidrgeno. Los puentes de
hidrgeno se muestran como lneas discontinuas.
La dble hlice de ADN se mantiene estable mediante la
formacin de puentes de hidrgenoentre las bases
asociadas a cada una de las dos hebras. Para la formacin
de un enlace de hidrgeno una de las bases debe presentar
un "donador" de hidrgenos con un tomo de hidrgeno con
carga parcial positiva (-NH
2
o -NH) y la otra base debe
presentar un grupo "aceptor" de hidrgenos con un tomo
cargado electronegativamente (C=O o N). Los puentes de
hidrgeno son uniones ms dbiles que los tpicos enlaces
qumicos covalentes, como los que conectan los tomos en
cada hebra de ADN, pero ms fuertes que interacciones
hidrfobas individuales, enlaces de Van der Waals, etc.
Como los puentes de hidrgeno no son enlaces covalentes,
pueden romperse y formarse de nuevo de forma
relativamente sencilla. Por esta razn, las dos hebras de la
doble hlice pueden separarse como una cremallera, bien
por fuerza mecnica o por alta temperatura.
28
La doble
hlice se estabiliza adems por el efecto hidrofbico y el
apilamiento, que no se ven influidos por la secuencia de
bases del ADN.
29

Cada tipo de base en una hebra forma un enlace
nicamente con un tipo de base en la otra hebra, lo que se
denomina complementariedad de las bases. As, las purinas
forman enlaces con las pirimidinas, de forma que A se
enlaza slo con T, y C slo con G. La organizacin de dos
nucletidos apareados a lo largo de la doble hlice se
denominaapareamiento de bases. Este emparejamiento
corresponde a la observacin ya realizada por Erwin
Chargaff (1905-2002),
30
que mostr que la cantidad de
adenina era muy similar a la cantidad de timina, y que la
cantidad de citosina era igual a la cantidad de guanina en el
ADN. Como resultado de esta complementariedad, toda la
informacin contenida en la secuencia de doble hebra de la
hlice de ADN est duplicada en cada hebra, lo cual es
fundamental durante el proceso de replicacin del ADN. En
efecto, esta interaccin reversible y especfica entre pares
de bases complementarias es crtica para todas las
funciones del ADN en los organismos vivos.
18

Como se ha indicado anteriormente, los dos tipos de pares
de bases forman un nmero diferente de enlaces de
hidrgeno: A=T forman dos puentes de hidrgeno, y CG
forman tres puentes de hidrgeno (ver imgenes). El par de
bases GC es por tanto ms fuerte que el par de bases AT.
Como consecuencia, tanto el porcentaje de pares de bases
GC como la longitud total de la doble hlice de ADN
determinan la fuerza de la asociacin entre las dos hebras
de ADN. Las dobles hlices largas de ADN con alto
contenido en GC tienen hebras que interaccionan ms
fuertemente que las dobles hlices cortas con alto contenido
en AT.
31
Por esta razn, las zonas de la doble hlice de ADN
que necesitan separarse fcilmente tienden a tener un alto
contenido en AT, como por ejemplo la secuencia TATAAT de
la caja de Pribnow de algunos promotores.
32
En el
laboratorio, la fuerza de esta interaccin puede medirse
buscando la temperatura requerida para romper los puentes
de hidrgeno, la temperatura de fusin (tambin denominado
valor T
m
, del inglsmelting temperature). Cuando todas las
pares de bases en una doble hlice se funden, las hebras se
separan en solucin en dos hebras completamente
independientes. Estas molculas de ADN de hebra simple
no tienen una nica forma comn, sino que algunas
conformaciones son ms estables que otras.
33

Otros tipos de pares de bases[editar editar
fuente]


Par de bases A=T de tipo Watson-Crick. En azul el donador de
hidrgenos y en rojo el aceptor.


Par de bases A=T de tipo Watson-Crick reverso. En azul el
donador de hidrgenos y en rojo el aceptor. Ntese que la
pirimidina ha sufrido un giro de 180 sobre el eje del carbono 6.
Existen diferentes tipos de pares de bases que se pueden
formar segn el modo como se forman los puentes de
hidrgeno. Los que se observan en la doble hlice de ADN
son los llamados pares de bases Watson-Crick, pero
tambin existen otros posibles pares de bases, como los
denominadosHoogsteen y Wobble u oscilante, que pueden
aparecer en circunstancias particulares. Adems, para cada
tipo existe a su vez el mismo par reverso, es decir, el que se
da si se gira la base pirimidnica 180 sobre su eje.
Watson-Crick (pares de bases de la doble hlice): los
grupos de la base prica que intervienen en el enlace de
hidrgeno son los que corresponden a las posiciones 1 y
6 (N aceptor y -NH
2
donador si la purina es una A) y los
grupos de la base pirimidnica, los que se encuentran en
las posiciones 3 y 4 (-NH donador y C=O aceptor si la
pirimidina es una T). En el par de bases Watson-Crick
reverso participaran los grupos de las posiciones 2 y 3
de la base pirimidnica (ver imgenes).
Hoogsteen: en este caso cambian los grupos de la base
prica, que ofrece una cara diferente (posiciones 6 y 7) y
que forman enlaces con los grupos de las pirimidinas de
las posiciones 3 y 4 (como en Watson-Crick). Tambin
puede haber Hoogsteen reversos. Con este tipo de
enlace pueden unirse A=U (Hoogsteen y Hoogsteen
reverso) y A=C (Hoogsteen reverso).
Wobble u oscilante: este tipo de enlace permite que se
unan guanina y citosina con un doble enlace (G=T). La
base prica (G) forma enlace con los grupos de las
posiciones 1 y 6 (como en Watson-Crick) y la pirimidina
(T) con los grupos de las posiciones 2 y 3. Este tipo de
enlace no funcionara con A=C, ya que quedaran
enfrentados los 2 aceptores y los 2 donadores, y slo se
podra dar en el caso inverso. Encontramos pares de
bases de tipo oscilante en el ARN, durante el
apareamiento de codn yanticodn. Con este tipo de
enlace pueden unirse G=U (oscilante y oscilante
reverso) y A=C (oscilante reverso).
En total, en su forma tautomrica mayoritaria, existen 28
posibles pares de bases nitrogenadas: 10 posibles pares de
bases purina-pirimidina (2 pares Watson-Crick y 2 Watson
Crick reverso, 1 par Hoogsteen y 2 pares Hoogsteen
reverso, 1 par oscilante y 2 pares oscilante reverso), 7 pares
homo purina-purina (A=A, G=G), 4 pares A=G y 7 pares
pirimidina-pirimidina. Esto sin contar con los pares de bases
que pueden formarse si tambin tenemos en cuenta las
otras formas tautomricas minoritarias de las bases
nitrogenadas; stos, adems, pueden ser responsables
de mutaciones puntuales por sustitucin de tipo transicin.
Estructura[editar editar fuente]
El ADN es una molcula bicatenaria, es decir, est formada
por dos cadenas dispuestas de forma antiparalela y con las
bases nitrogenadas enfrentadas. En su estructura
tridimensional, se distinguen distintos niveles:
34

35

1. Estructura primaria:
Secuencia de nucletidos encadenados. Es en
estas cadenas donde se encuentra la
informacin gentica, y dado que el esqueleto
es el mismo para todos, la diferencia de la
informacin radica en la distinta secuencia de
bases nitrogenadas. Esta secuencia presenta
un cdigo, que determina una informacin u
otra, segn el orden de las bases.
2. Estructura secundaria:
Es una estructura en doble hlice. Permite
explicar el almacenamiento de la informacin
gentica y el mecanismo de duplicacin del
ADN. Fue postulada por Watson y Crick,
basndose en la difraccin de rayos X que
haban realizado Franklin y Wilkins, y en la
equivalencia de bases de Chargaff, segn la
cual la suma de adeninas ms guaninas es
igual a la suma de timinas ms citosinas.
Es una cadena doble, dextrgira o levgira,
segn el tipo de ADN. Ambas cadenas son
complementarias, pues la adenina y la guanina
de una cadena se unen, respectivamente, a la
timina y la citosina de la otra. Ambas cadenas
son antiparalelas, pues el extremo 3 de una se
enfrenta al extremo 5 de la homloga.
Existen tres modelos de ADN. El ADN de tipo B
es el ms abundante y es el que tiene la
estructura descrita por Watson y Crick.
3. Estructura terciaria:
Se refiere a cmo se almacena el ADN en un
espacio reducido, para formar los cromosomas.
Vara segn se trate de
organismos procariotas o eucariotas:
2. En procariotas el ADN se pliega como una
sper-hlice, generalmente en forma
circular y asociada a una pequea cantidad
de protenas. Lo mismo ocurre
en orgnulos celulares como
las mitocondrias y en los cloroplastos.
3. En eucariotas, dado que la cantidad de
ADN de cada cromosoma es muy grande,
el empaquetamiento ha de ser ms
complejo y compacto; para ello se necesita
la presencia de protenas, como
las histonas y otras protenas de naturaleza
no histnica (en los espermatozoides estas
protenas son las protaminas).
34

4. Estructura cuaternaria:
La cromatina presente en el ncleo tiene un grosor de 300 , pues la fibra de
cromatina de 100 se enrolla formando una fibra de cromatina de 300 . El
enrollamiento de los nucleosomas recibe el nombre de solenoide. Dichos
solenoides se enrollan formando la cromatina del ncleo interfsico de la clula
eucariota. Cuando la clula entra en divisin, el ADN se compacta ms, formando
as los cromosomas.
Estructuras en doble hlice[editar editar
fuente]


De izquierda a derecha, las estructuras de ADN A, B y Z.
El ADN existe en muchas conformaciones.
27
Sin
embargo, en organismos vivos slo se han observado
las conformaciones ADN-A, ADN-B y ADN-Z. La
conformacin que adopta el ADN depende de su
secuencia, la cantidad y direccin
de superenrollamiento que presenta, la presencia
de modificaciones qumicas en las bases y las
condiciones de la solucin, tales como la concentracin
de iones de metales y poliaminas.
36
De las tres
conformaciones, la forma "B" es la ms comn en las
condiciones existentes en las clulas.
37
Las dos dobles
hlices alternativas del ADN difieren en su geometra y
dimensiones.
La forma "A" es una espiral que gira hacia la derecha,
ms amplia que la "B", con una hendidura menor
superficial y ms amplia, y una hendidura mayor ms
estrecha y profunda. La forma "A" ocurre en condiciones
no fisiolgicas en formas deshidratadas de ADN,
mientras que en la clula puede producirse en
apareamientos hbridos de hebras ADN-ARN, adems
de en complejos enzima-ADN.
3839

Los segmentos de ADN en los que las bases han sido
modificadas por metilacin pueden sufrir cambios
conformacionales mayores y adoptar la forma "Z". En
este caso, las hebras giran alrededor del eje de la hlice
en una espiral que gira a mano izquierda, lo opuesto a la
forma "B" ms frecuente.
40
Estas estructuras poco
frecuentes pueden ser reconocidas por protenas
especficas que se unen a ADN-Z y posiblemente estn
implicadas en la regulacin de la transcripcin.
41

Estructuras en cudruplex[editar editar
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Estructura de un ADN en cudruplex formada por repeticiones en
los telmeros. La conformacin de la estructura de soporte del
ADN difiere significativamente de la tpica estructura en hlice.
42

En los extremos de los cromosomas lineales existen
regiones especializadas de ADN
denominadas telmeros. La funcin principal de estas
regiones es permitir a la clula replicar los extremos
cromosmicos utilizando la enzimatelomerasa, puesto
que las enzimas que replican el resto del ADN no
pueden copiar los extremos 3' de los
cromosomas.
43
Estas terminaciones cromosmicas
especializadas tambin protegen los extremos del ADN,
y evitan que los sistemas de reparacin del ADN en la
clula los procesen como ADN daado que debe ser
corregido.
44
En las clulas humanas, los telmeros son
largas zonas de ADN de hebra sencilla que contienen
algunos miles de repeticiones de una nica secuencia
TTAGGG.
45

Estas secuencias ricas en guanina pueden estabilizar
los extremos cromosmicos mediante la formacin de
estructuras de juegos apilados de unidades de cuatro
bases, en lugar de los pares de bases encontrados
normalmente en otras estructuras de ADN. En este
caso, cuatro bases guanina forman unidades con
superficie plana que se apilan una sobre otra, para
formar una estructura cudruple-G estable.
46
Estas
estructuras se estabilizan formando puentes de
hidrgeno entre los extremos de las bases y
la quelatacin de un metal inico en el centro de cada
unidad de cuatro bases.
47
Tambin se pueden formar
otras estructuras, con el juego central de cuatro bases
procedente, o bien de una hebra sencilla plegada
alrededor de las bases, o bien de varias hebras
paralelas diferentes, de forma que cada una contribuye
con una base a la estructura central.
Adems de estas estructuras apiladas,
los telmeros tambin forman largas estructuras en lazo,
denominadas lazos telomricos o lazos-T (T-loops en
ingls). En este caso, las hebras simples de ADN se
enroscan sobre s mismas en un amplio crculo
estabilizado por protenas que se unen a telmeros.
48
En
el extremo del lazo T, el ADN telomrico de hebra
sencilla se sujeta a una regin de ADN de doble hebra
porque la hebra de ADN telomrico altera la doble hlice
y se aparea a una de las dos hebras. Esta estructura de
triple hebra se denomina lazo de desplazamiento o lazo
D (D-loop).
46

Hendiduras mayor y menor[editar editar
fuente]

Animacin de la estructura de una seccin de ADN. Las
bases se encuentran horizontalmente entre las dos hebras en
espiral. Versin ampliada
49



Doble hlice: a) Dextrgira, b) Levgira.
La doble hlice es una espiraldextrgira, esto es, cada
una de las cadenas de nucletidos gira a derechas; esto
puede verificarse si nos fijamos, yendo de abajo a
arriba, en la direccin que siguen los segmentos de las
hebras que quedan en primer plano. Si las dos hebras
giran a derechas se dice que la doble hlice es
dextrgira, y si giran a izquierdas, levgira (esta forma
puede aparecer en hlices alternativas debido a
cambios conformacionales en el ADN). Pero en la
conformacin ms comn que adopta el ADN, la doble
hlice es dextrgira, girando cada par de bases respecto
al anterior unos 36.
50

Cuando las dos hebras de ADN se enrollan una sobre la
otra (sea a derechas o a izquierdas), se forman huecos
o hendiduras entre una hebra y la otra, dejando
expuestos los laterales de las bases nitrogenadas del
interior (ver la animacin). En la conformacin ms
comn que adopta el ADN aparecen, como
consecuencia de los ngulos formados entre
los azcares de ambas cadenas de cada par de bases
nitrogenadas, dos tipos de hendiduras alrededor de la
superficie de la doble hlice: una de ellas, la hendidura o
surco mayor, que mide 22 (2,2 nm) de ancho, y la
otra, la hendidura o surco menor, que mide 12 (1,2
nm) de ancho.
51
Cada vuelta de hlice, que es cuando
sta ha realizado un giro de 360 o lo que es lo mismo,
de principio de hendidura mayor a final de hendidura
menor, medir por tanto 34 , y en cada una de esas
vueltas hay unos 10,5 pb.


Hendiduras mayor y menor de la doble hlice.
La anchura de la hendidura mayor implica que los
extremos de las bases son ms accesibles en sta, de
forma que la cantidad de grupos qumicos expuestos
tambin es mayor lo cual facilita la diferenciacin entre
los pares de bases A-T, T-A, C-G, G-C. Como
consecuencia de ello, tambin se ver facilitado el
reconocimiento de secuencias de ADN por parte de
diferentes protenas sin la necesidad de abrir la doble
hlice. As, protenas como los factores de
transcripcin que pueden unirse a secuencias
especficas, frecuentemente contactan con los laterales
de las bases expuestos en la hendidura mayor.
52
Por el
contrario, los grupos qumicos que quedan expuestos en
la hendidura menor son similares, de forma que el
reconocimiento de los pares de bases es ms difcil; por
ello se dice que la hendidura mayor contiene ms
informacin que la hendidura menor.
50

Sentido y antisentido[editar editar fuente]
Artculo principal: Antisentido.
Una secuencia de ADN se denomina "sentido" (en
ingls, sense) si su secuencia es la misma que la
secuencia de un ARN mensajeroque se traduce en una
protena. La secuencia de la hebra de ADN
complementaria se denomina "antisentido" (antisense).
En ambas hebras de ADN de la doble hlice pueden
existir tanto secuencias sentido, que codifican ARNm,
como antisentido, que no lo codifican. Es decir, las
secuencias que codifican ARNm no estn todas
presentes en una sola de las hebras, sino repartidas
entre las dos hebras. Tanto en procariotas como
en eucariotas se producen ARNs con
secuencias antisentido, pero la funcin de esos ARNs
no est completamente clara.
53
Se ha propuesto que los
ARNs antisentido estn implicados en la regulacin de
la expresin gnicamediante apareamiento ARN-ARN:
los ARNs antisentido se aparearan con los ARNm
complementarios, bloqueando de esta forma
sutraduccin.
54

En unas pocas secuencias de ADN en procariotas y
eucariotas (este hecho es ms frecuente
en plsmidos y virus), la distincin entre
hebras sentido y antisentido es ms difusa, debido a que
presentan genes superpuestos.
55
En estos casos,
algunas secuencias de ADN tienen una funcin doble,
codificando una protena cuando se lee a lo largo de una
hebra, y una segunda protena cuando se lee en la
direccin contraria a lo largo de la otra hebra.
En bacterias, esta superposicin puede estar
involucrada en la regulacin de latranscripcin del
gen,
56
mientras que en virus los genes superpuestos
aumentan la cantidad de informacin que puede
codificarse en sus diminutos genomas.
57

Superenrollamiento[editar editar fuente]


Estructura de molculas de ADN lineales con los extremos
fijos y superenrolladas. Por claridad, se ha omitido la
estructura en hlice del ADN.
El ADN puede retorcerse como una cuerda en un
proceso que se denomina superenrollamiento del
ADN(supercoiling, en ingls). Cuando el ADN est en
un estado "relajado", una hebra normalmente gira
alrededor del eje de la doble hlice una vez cada 10,4
pares de bases, pero si el ADN est retorcido las hebras
pueden estar unidas ms estrechamente o ms
relajadamente.
58
Si el ADN est retorcido en la direccin
de la hlice, se dice que el superenrollamiento es
positivo, y las bases se mantienen juntas de forma ms
estrecha. Si el ADN se retuerce en la direccin opuesta,
el superenrollamiento se llama negativo, y las bases se
alejan. En la naturaleza, la mayor parte del ADN tiene un
ligero superenrollamiento negativo que es producido
por enzimas denominadas topoisomerasas.
59
Estas
enzimas tambin son necesarias para liberar las fuerzas
de torsin introducidas en las hebras de ADN durante
procesos como la transcripcin y la replicacin.
60

Modificaciones qumicas[editar editar
fuente]


citosina 5-metil-citosina timina
Estructura de la citosina con y sin el grupo metilo. Tras la desaminacin,
la 5-metil-citosina tiene la misma estructura que la timina.
Modificaciones de bases del
ADN[editar editar fuente]
Vase tambin: Metilacin.
La expresin de los genes est influenciada por la forma
en la que el ADN est empaquetado en cromosomas, en
una estructura denominada cromatina. Las
modificaciones de bases pueden estar implicadas en el
empaquetamiento del ADN: las regiones que presentan
una expresin gnica baja o nula normalmente
contienen niveles altos de metilacin de las
bases citosina. Por ejemplo, la metilacin de citosina
produce 5-metil-citosina, que es importante para la
inactivacin del cromosoma X.
61
El nivel medio de
metilacin vara entre organismos: el
gusano Caenorhabditis elegans carece de metilacin de
citosina, mientras que los vertebrados presentan un
nivel alto - hasta 1% de su ADN contiene 5-metil-
citosina.
62
A pesar de la importancia de la 5-metil-
citosina, sta puede desaminarse para generar una
base timina. Las citosinas metiladas son por tanto
particularmente sensibles a mutaciones.
63
Otras
modificaciones de bases incluyen la metilacin
de adenina en bacterias y laglicosilacin de uracilo para
producir la "base-J" en kinetoplastos.
64

65

Dao del ADN[editar editar fuente]
Vase tambin: Mutacin.


Benzopireno, el mayor mutgeno deltabaco, unido al ADN.
66

El ADN puede resultar daado por muchos tipos
de mutgenos, que cambian la secuencia del
ADN: agentes alquilantes, adems de radiacin
electromagntica de alta energa, como
luz ultravioleta y rayos X. El tipo de dao producido en el
ADN depende del tipo de mutgeno. Por ejemplo, la luz
UV puede daar al ADN produciendo dmeros de timina,
que se forman por ligamiento cruzado entre
bases pirimidnicas.
67
Por otro lado, oxidantes tales
como radicales libres o el perxido de
hidrgeno producen mltiples daos, incluyendo
modificaciones de bases, sobre todo guanina, y roturas
de doble hebra (double-strand breaks).
68
En una clula
humana cualquiera, alrededor de 500 bases sufren dao
oxidativo cada da.
69

70
De estas lesiones oxidativas, las
ms peligrosas son las roturas de doble hebra, ya que
son difciles de reparar y pueden producir mutaciones
puntuales, insercionesy deleciones de la secuencia de
ADN, as como translocaciones cromosmicas.
71

Muchos mutgenos se posicionan entre dos pares de
bases adyacentes, por lo que se denominan agentes
intercalantes. La mayora de los agentes intercalantes
son molculasaromticas y planas, como el bromuro de
etidio, la daunomicina, la doxorubicina y latalidomida.
Para que un agente intercalante pueda integrarse entre
dos pares de bases, stas deben separarse,
distorsionando las hebras de ADN y abriendo la doble
hlice. Esto inhibe la transcripcin y la replicacin del
ADN, causando toxicidad y mutaciones. Por ello, los
agentes intercalantes del ADN son a
menudo carcingenos: el benzopireno, lasacridinas,
la aflatoxina y el bromuro de etidio son ejemplos bien
conocidos.
72

73

74
Sin embargo, debido a su capacidad
para inhibir la replicacin y la transcripcin del ADN,
estas toxinas tambin se utilizan en quimioterapia para
inhibir el rpido crecimiento de las clulas cancerosas.
75

El dao en el ADN inicia una respuesta que activa
diferentes mecanismos de reparacin que reconocen
lesiones especficas en el ADN, que son reparadas en el
momento para recuperar la secuencia original del ADN.
Asimismo, el dao en el ADN provoca una parada en
el ciclo celular, que conlleva la alteracin de numerosos
procesos fisiolgicos, que a su vez implica sntesis,
transporte y degradacin de protenas (vase
tambin Checkpoint de daos en el ADN).
Alternativamente, si el dao genmico es demasiado
grande para que pueda ser reparado, los mecanismos
de control inducirn la activacin de una serie de rutas
celulares que culminarn en la muerte celular.
Funciones biolgicas[editar editar fuente]
Las funciones biolgicas del ADN incluyen el
almacenamiento de informacin (genes y genoma), la
codificacin de protenas (transcripcin y traduccin) y
su autoduplicacin (replicacin del ADN) para asegurar
la transmisin de la informacin a las clulas hijas
durante la divisin celular.
Genes y genoma[editar editar fuente]
Vanse tambin: Ncleo
celular, Cromatina, Cromosoma y Genoma.
El ADN se puede considerar como un almacn cuyo
contenido es la informacin (mensaje) necesaria para
construir y sostener el organismo en el que reside, la
cual se transmite de generacin en generacin. El
conjunto de informacin que cumple esta funcin en un
organismo dado se denomina genoma, y el ADN que lo
constituye, ADN genmico.
El ADN genmico (que se organiza en molculas
de cromatina que a su vez se ensamblan
en cromosomas) se encuentra en el ncleo celular de
los eucariotas, adems de pequeas cantidades en
las mitocondrias y cloroplastos. En procariotas, el ADN
se encuentra en un cuerpo de forma irregular
denominado nucleoide.
76

El ADN codificante[editar editar fuente]


ARN polimerasa T7 (azul) produciendo un ARNm (verde) a partir
de un molde de ADN (naranja).
77

Vase tambin: Gen.
La informacin gentica de un genoma est contenida
en los genes, y al conjunto de toda la informacin que
corresponde a un organismo se le denomina
su genotipo. Un gen es una unidad de herencia y es una
regin de ADN que influye en una caracterstica
particular de un organismo (como el color de los ojos,
por ejemplo). Los genes contienen un "marco de lectura
abierto" (open reading frame) que puede transcribirse,
adems de secuencias reguladoras, tales
como promotores y enhancers, que controlan la
transcripcin del marco de lectura abierto.
Desde este punto de vista, las obreras de este
mecanismo son las protenas. Estas pueden
ser estructurales, como las protenas de
los msculos,cartlagos, pelo, etc., o funcionales, como
la hemoglobina o las innumerablesenzimas del
organismo. La funcin principal de la herencia es la
especificacin de las protenas, siendo el ADN una
especie de plano o recetapara producirlas. La mayor
parte de las veces la modificacin del ADN provocar
una disfuncin proteica que dar lugar a la aparicin de
alguna enfermedad. Pero en determinadas ocasiones,
las modificaciones podrn provocar cambios
beneficiosos que darn lugar a individuos mejor
adaptados a su entorno.
Las aproximadamente treinta mil protenas diferentes en
el cuerpo humano estn constituidas por
veinte aminocidos diferentes, y una molcula de ADN
debe especificar la secuencia en que se unen dichos
aminocidos.
En el proceso de elaborar una protena, el ADN de un
gen se lee y se transcribe a ARN. Este ARN sirve como
mensajero entre el ADN y la maquinaria que elaborar
las protenas y por eso recibe el nombre de ARN
mensajero o ARNm. El ARN mensajero sirve de molde a
la maquinaria que elabora las protenas, para que
ensamble los aminocidos en el orden preciso
para armar la protena.
El dogma central de la biologa molecular estableca que
el flujo de actividad y de informacin era: ADN
ARN protena. No obstante, en la actualidad ha
quedado demostrado que este "dogma" debe ser
ampliado, pues se han encontrado otros flujos de
informacin: en algunos organismos (virus de ARN) la
informacin fluye de ARN a ADN; este proceso se
conoce como "transcripcin inversa o reversa", tambin
llamada "retrotranscripcin". Adems, se sabe que
existen secuencias de ADN que se transcriben a ARN y
son funcionales como tales, sin llegar a traducirse nunca
a protena: son los ARN no codificantes, como es el
caso de los ARN interferentes.
34

35

El ADN no codificante[editar editar fuente]
El ADN del genoma de un organismo puede dividirse
conceptualmente en dos: el que codifica las protenas
(los genes) y el que no codifica. En muchas especies,
slo una pequea fraccin del genoma codifica
protenas. Por ejemplo, slo alrededor del 1,5% del
genoma humano consiste en exones que codifican
protenas (20.000 a 25.000 genes), mientras que ms
del 90% consiste en ADN no codificante.
78

El ADN no codificante (tambin denominado ADN
basura o junk DNA) corresponde a secuencias del
genoma que no generan una protena (procedentes de
transposiciones, duplicaciones, translocaciones y
recombinaciones de virus, etc.), incluyendo los intrones.
Hasta hace poco tiempo se pensaba que el ADN no
codificante no tena utilidad alguna, pero estudios
recientes indican que eso es inexacto. Entre otras
funciones, se postula que el llamado "ADN basura"
regula la expresin diferencial de los genes.
79
Por
ejemplo, algunas secuencias tienen afinidad hacia
protenas especiales que tienen la capacidad de unirse
al ADN (como los homeodominios, los complejos
receptores de hormonas esteroides, etc.), con un papel
importante en el control de los mecanismos de
trascripcin y replicacin. Estas secuencias se llaman
frecuentemente "secuencias reguladoras", y los
investigadores suponen que slo se ha identificado una
pequea fraccin de las que realmente existen. La
presencia de tanto ADN no codificante en genomas
eucariticos y las diferencias en tamao del genoma
entre especies representan un misterio que es conocido
como el "enigma del valor de C".
80
Recientemente, un
grupo de investigadores de la Universidad de Yale ha
descubierto una secuencia de ADN no codificante que
sera la responsable de que los seres humanos hayan
desarrollado la capacidad de agarrar y/o manipular
objetos o herramientas.
81

Por otro lado, algunas secuencias de ADN desempean
un papel estructural en los cromosomas:
los telmeros y centrmeroscontienen pocos o ningn
gen codificante de protenas, pero son importantes para
estabilizar la estructura de los cromosomas. Algunos
genes no codifican protenas, pero s se transcriben en
ARN: ARN ribosmico, ARN de transferencia y ARN de
interferencia(ARNi, que son ARN que bloquean la
expresin de genes especficos). La estructura de
intrones y exones de algunos genes (como los
de inmunoglobulinas y protocadherinas) son importantes
por permitir los cortes y empalmes alternativos del pre-
ARN mensajero que hacen posible la sntesis de
diferentes protenas a partir de un mismo gen (sin esta
capacidad no existira el sistema inmune, por ejemplo).
Algunas secuencias de ADN no codificante
representan pseudogenes que tienen valor evolutivo, ya
que permiten la creacin de nuevos genes con nuevas
funciones.
35
Otros ADN no codificantes proceden de la
duplicacin de pequeas regiones del ADN; esto tiene
mucha utilidad, ya que el rastreo de estas secuencias
repetitivas permite estudios de filogenia.
Transcripcin y traduccin[editar editar
fuente]
Artculos principales: Transcripcin (gentica) y Traduccin
(gentica).
En un gen, la secuencia de nucletidos a lo largo de una
hebra de ADN se transcribe a un ARN
mensajero (ARNm) y esta secuencia a su vez
se traduce a una protena que un organismo es capaz
de sintetizar o "expresar" en uno o varios momentos de
su vida, usando la informacin de dicha secuencia.
La relacin entre la secuencia de nucletidos y la
secuencia de aminocidos de la protena viene
determinada por el cdigo gentico, que se utiliza
durante el proceso de traduccin o sntesis de protenas.
La unidad codificadora del cdigo gentico es un grupo
de tres nucletidos (triplete), representado por las tres
letras iniciales de las bases nitrogenadas (por ej., ACT,
CAG, TTT). Los tripletes del ADN se transcriben en sus
bases complementarias en el ARN mensajero, y en este
caso los tripletes se denominan codones (para el
ejemplo anterior, UGA, GUC, AAA). En el ribosoma cada
codn del ARN mensajero interacciona con una
molcula de ARN de transferencia (ARNt o tRNA) que
contenga el triplete complementario, denominado
anticodn. Cada ARNt porta el aminocido
correspondiente al codn de acuerdo con el cdigo
gentico, de modo que el ribosoma va uniendo los
aminocidos para formar una nueva protena de acuerdo
con las "instrucciones" de la secuencia del ARNm.
Existen 64 codones posibles, por lo cual corresponde
ms de uno para cada aminocido (por esta duplicidad
de codones se dice que el cdigo gentico es un cdigo
degenerado: no es unvoco); algunos codones indican la
terminacin de la sntesis, el fin de la secuencia
codificante; estos codones de terminacin ocodones de
parada son UAA, UGA y UAG (en ingls, nonsense
codons o stop codons).
34

Replicacin del ADN[editar editar fuente]


Esquema representativo de la replicacin del ADN.
Artculo principal: Replicacin de ADN.
La replicacin del ADN es el proceso por el cual se
obtienen copias o rplicas idnticas de una molcula de
ADN. La replicacin es fundamental para la
transferencia de la informacin gentica de una
generacin a la siguiente y, por ende, es la base de
la herencia. El mecanismo consiste esencialmente en la
separacin de las dos hebras de la doble hlice, las
cuales sirven de molde para la posterior sntesis de
cadenas complementarias a cada una de ellas, que
llevar por nombre ARNm. El resultado final son dos
molculas idnticas a la original. Este tipo de replicacin
se denomina semiconservativa debido a que cada una
de las dos molculas resultantes de la duplicacin
presenta una cadena procedente de la molcula "madre"
y otra recin sintetizada.
Hiptesis sobre la duplicacin del
ADN[editar editar fuente]
En un principio, se propusieron tres hiptesis:
Semiconservativa: Segn esta hiptesis,
formulada por Watson y Crick, cada hebra sirve de
molde para que se forme una hebra nueva,
mediante la complentariedad de bases, quedando al
final dos dobles hlices formadas por una hebra
antigua (molde) y una nueva hebra (copia).
Conservativa: Tras la duplicacin quedaran las
dos hebras antiguas juntas y, por otro lado, las dos
hebras nuevas formando una doble hlice.
Dispersiva: Segn esta hiptesis, las hebras
resultantes estaran formadas por fragmentos en
doble hlice ADN antiguo y ADN recin sintetizado.
Interacciones ADN-
protena[editar editar fuente]
Todas las funciones del ADN dependen de sus
interacciones con protenas. Estas interacciones pueden
ser inespecficas, o bien la protena puede unirse de
forma especfica a una nica secuencia de ADN.
Tambin pueden unirse enzimas, entre las cuales son
particularmente importantes las polimerasas, que copian
las secuencia de bases del ADN durante la transcripcin
y la replicacin.
Protenas que unen ADN[editar editar
fuente]
Interacciones inespecficas[editar editar
fuente]

Interaccin de ADN con histonas (en blanco, arriba). Los
aminocidos bsicos de estas protenas (abajo a la izquierda,
en azul) se unen a los grupos cidos de los fosfatos del ADN
(abajo a la derecha, en rojo).
Las protenas estructurales que se unen al ADN son
ejemplos bien conocidos de interacciones inespecficas
ADN-protenas. En los cromosomas, el ADN se
encuentra formando complejos con protenas
estructurales. Estas protenas organizan el ADN en una
estructura compacta denominada cromatina.
En eucariotas esta estructura implica la unin del ADN a
un complejo formado por pequeas protenas bsicas
denominadas histonas, mientras que
en procariotas estn involucradas una gran variedad de
protenas.
82

83
Las histonas forman un complejo de
forma cilndrica denominado nucleosoma, en torno al
cual se enrollan casi dos vueltas de ADN de doble
hlice. Estas interacciones inespecficas quedan
determinadas por la existencia de residuos bsicos en
las histonas, que forman enlaces inicos con el
esqueleto de azcar-fosfato del ADN y, por tanto, son en
gran parte independientes de la secuencia de
bases.
84
Estos aminocidos bsicos experimentan
modificaciones qumicas
demetilacin, fosforilacin y acetilacin,
85
que alteran la
fuerza de la interaccin entre el ADN y las histonas,
haciendo al ADN ms o menos accesible a los factores
de transcripcin y por tanto modificando la tasa de
transcripcin.
86

Otras protenas que se unen a ADN de manera
inespecfica en la cromatina incluyen las protenas del
grupo de alta movilidad (HMG, High Mobility Group)
que se unen a ADN plegado o distorsionado.
87
Estas
protenas son importantes durante el plegamiento de los
nucleosomas, organizndolos en estructuras ms
complejas para constituir los cromosomas
88
durante el
proceso de condensacin cromosmica. Se ha
propuesto que en este proceso tambin intervendran
otras protenas, formando una especie de "andamio"
sobre el cual se organiza la cromatina; los principales
componentes de esta estructura seran la
enzima topoisomerasa II (topoIIalpha) y
la condensina 13S.
89
Sin embargo, el papel estructural
de latopoIIalpha en la organizacin de los cromosomas
an es discutido, ya que otros grupos argumentan que
esta enzima se intercambia rpidamente tanto en los
brazos cromosmicos como en los cinetocoros durante
la mitosis.
90

Interacciones especficas[editar editar
fuente]
Un grupo bien definido de protenas que unen ADN es el
conformado por las protenas que se unen
especficamente a ADN monocatenario o ADN de
hebra sencilla (ssDNA). En humanos, la protena A de
replicacin es la mejor conocida de su familia y acta en
procesos en los que la doble hlice se separa, como
la replicacin del ADN, la recombinacin o la reparacin
del ADN.
91
Estas protenas parecen estabilizar el ADN
monocatenario, protegindolo para evitar que forme
estructuras de tallo-lazo (stem-loop) o que sea
degradado por nucleasas.


El factor de transcripcin represor del fago lambda unido a su
ADN diana mediante un motivo hlice-giro-hlice (helix-turn-
helix).
92

Sin embargo, otras protenas han evolucionado para
unirse especficamente a secuencias particulares de
ADN. La especificidad de la interaccin de las protenas
con el ADN procede de los mltiples contactos con las
bases de ADN, lo que les permite "leer" la secuencia del
ADN. La mayora de esas interacciones con las bases
ocurre en la hendidura mayor, donde las bases son ms
accesibles.
93

Las protenas especficas estudiadas con mayor detalle
son las encargadas de regular la transcripcin,
denominadas por ello factores de transcripcin. Cada
factor de transcripcin se une a una secuencia concreta
de ADN y activa o inhibe la transcripcin de los genes
que presentan estas secuencias prximas a sus
promotores. Los factores de transcripcin pueden
efectuar esto de dos formas:
En primer lugar, pueden unirse a la polimerasa de
ARN responsable de la transcripcin, bien
directamente o a travs de otras protenas
mediadoras. De esta forma. se estabiliza la unin
entre la ARN polimerasa y el promotor, lo que
permite el inicio de la transcripcin.
94

En segundo lugar, los factores de transcripcin
pueden unirse a enzimas que modifican las histonas
del promotor, lo que altera la accesibilidad del
molde de ADN a la ARN polimerasa.
95

Como los ADN diana pueden encontrarse por todo
el genoma del organismo, los cambios en la actividad de
un tipo de factor de transcripcin pueden afectar a miles
de genes.
96
En consecuencia, estas protenas son
frecuentemente las dianas de los procesos
de transduccin de seales que controlan las respuestas
a cambios ambientales o diferenciacin y desarrollo
celular.


La enzima de restriccin EcoRV (verde) formando un complejo
con su ADN diana.
97

Enzimas que modifican el
ADN[editar editar fuente]
Nucleasas y ligasas[editar editar fuente]
Las nucleasas son enzimas que cortan las hebras de
ADN mediante la catlisis de lahidrlisis de los enlaces
fosfodister. Las nucleasas que hidrolizan nucletidos a
partir de los extremos de las hebras de ADN se
denominan exonucleasas, mientras que
lasendonucleasas cortan en el interior de las hebras.
Las nucleasas que se utilizan con mayor frecuencia
en biologa molecular son las enzimas de restriccin,
endonucleasas que cortan el ADN por determinadas
secuencias especficas. Por ejemplo, la enzima EcoRV,
que se muestra a la izquierda, reconoce la secuencia de
6 bases 5-GAT|ATC-3, y hace un corte en ambas
hebras en la lnea vertical indicada, generando dos
molculas de ADN con los extremos romos. Otras
enzimas de restriccin generan sin embargo extremos
cohesivos, ya que cortan de forma diferente las dos
hebras de ADN. En la naturaleza, estas enzimas
protegen a las bacterias contra las infecciones de fagos,
al digerir el ADN de dicho fago cuando entra a travs de
la pared bacteriana, actuando como un mecanismo de
defensa.
98
En biotecnologa, estas nucleasas
especficas de la secuencias de ADN se utilizan
en ingeniera gentica para clonar fragmentos de ADN y
en la tcnica dehuella gentica.
Las enzimas denominadas ADN ligasas pueden reunir
hebras de ADN cortadas o rotas.
99
Las ligasas son
particularmente importantes en la replicacin de la hebra
que sufre replicacin discontinua en el ADN, ya que
unen los fragmentos cortos de ADN generados en
lahorquilla de replicacin para formar una copia
completa del molde de ADN. Tambin se utilizan en
la reparacin del ADN y en procesos de recombinacin
gentica.
99

Topoisomerasas y helicasas[editar editar
fuente]
Las topoisomerasas son enzimas que poseen a la vez
actividad nucleasa y ligasa. Estas protenas varan la
cantidad de ADN superenrollado. Algunas de estas
enzimas funcionan cortando la hlice de ADN y
permitiendo que una seccin rote, de manera que
reducen el grado de superenrollamiento. Una vez hecho
esto, la enzima vuelve a unir los fragmentos de
ADN.
59
Otros tipos de enzimas son capaces de cortar
una hlice de ADN y luego pasar la segunda hebra de
ADN a travs de la rotura, antes de reunir las
hlices.
100
Las topoisomerasas son necesarias para
muchos procesos en los que interviene el ADN, como
la replicacin del ADN y latranscripcin.
60

Las helicasas son unas protenas que pertenecen al
grupo de los motores moleculares. Utilizan energa
qumica almacenada en los nuclesidos trifosfatos,
fundamentalmente ATP, para romper puentes de
hidrgeno entre bases y separar la doble hlice de ADN
en hebras simples.
101
Estas enzimas son esenciales
para la mayora de los procesos en los que las enzimas
necesitan acceder a las bases del ADN.
Polimerasas[editar editar fuente]
Las polimerasas son enzimas que sintetizan cadenas de
nucletidos a partir de nuclesidos trifosfatos. La
secuencia de sus productos son copias de cadenas de
polinucletidos existentes, que se denominan moldes.
Estas enzimas funcionan aadiendo nucletidos al
grupo hidroxilo en 3' del nucletido previo en una hebra
de ADN. En consecuencia, todas las polimerasas
funcionan en direccin 5 --> 3.
102
En los sitios
activos de estas enzimas, el nuclesido trifosfato que se
incorpora aparea su base con la correspondiente en el
molde: esto permite que la polimerasa sintentice de
forma precisa la hebra complementaria al molde.
Las polimerasas se clasifican de acuerdo al tipo de
molde que utilizan:
En la replicacin del ADN, una ADN polimerasa
dependiente de ADN realiza una copia de ADN a
partir de una secuencia de ADN. La precisin es
vital en este proceso, por lo que muchas de estas
polimerasas tienen una actividad de verificacin de
la lectura (proofreading). Mediante esta actividad, la
polimerasa reconoce errores ocasionales en la
reaccin de sntesis, debido a la falta de
apareamiente entre el nucletido errneo y el
molde, lo que genera un desacoplamiento
(mismatch). Si se detecta un desacoplamiento, se
activa una actividad exonucleasa en direccin 3 -->
5 y la base incorrecta se elimina.
103
En la mayora
de los organismos las ADN polimerasas funcionan
en un gran complejo denominado replisoma, que
contiene mltiples unidades accesorias,
como helicasas.
104

Las ADN polimerasas dependientes de ARN son
una clase especializada de polimerasas que copian
la secuencia de una hebra de ARN en ADN.
Incluyen la transcriptasa inversa, que es una
enzima viral implicada en la infeccin de clulas
por retrovirus, y latelomerasa, que es necesaria
para la replicacin de los telmeros.
105

43
La
telomerasa es una polimerasa inusual, porque
contiene su propio molde de ARN como parte de su
estructura.
44

La transcripcin se lleva a cabo por una ARN
polimerasa dependiente de ADN que copia la
secuencia de una de las hebras de ADN en ARN.
Para empezar a transcribir un gen, la ARN
polimerasa se une a una secuencia del ADN
denominada promotor, y separa las hebras del
ADN. Entonces copia la secuencia del gen en un
transcrito de ARN mensajero hasta que alcanza una
regin de ADN denomimada terminador, donde se
detiene y se separa del ADN. Como ocurre con las
ADN polimerasas dependientes de ADN en
humanos, la ARN polimerasa II (la enzima que
transcribe la mayora de los genes del genoma
humano) funciona como un gran complejo
multiproteico que contiene mltiples subunidades
reguladoras y accesorias.
106

Recombinacin gentica[editar editar
fuente]


Estructura de un intermedio en unin de Holliday en
la recombinacin gentica. Las cuatro hebras de ADN
separadas estn coloreadas en rojo, azul, verde y amarillo.
107

Artculo principal: Recombinacin gentica.


La recombinacin implica la rotura y reunin de dos cromosomas
homlogos (M y F) para producir dos cromosomas nuevos
reorganizados (C1 y C2).
Una hlice de ADN normalmente no interacciona con
otros segmentos de ADN, y en las clulas humanas los
diferentes cromosomas incluso ocupan reas separadas
en el ncleo celular denominadas territorios
cromosmicos.
108
La separacin fsica de los diferentes
cromosomas es importante para que el ADN mantenga
su capacidad de funcionar como un almacn estable de
informacin. Uno de los pocos momentos en los que los
cromosomas interaccionan es durante
elsobrecruzamiento cromosmico(chromosomal
crossover), durante el cual se recombinan. El
sobrecruzamiento cromosmico ocurre cuando dos
hlices de ADN se rompen, se intercambian y se unen
de nuevo.
La recombinacin permite a los cromosomas
intercambiar informacin gentica y produce nuevas
combinaciones de genes, lo que aumenta la eficiencia
de la seleccin natural y puede ser importante en la
evolucin rpida de nuevas protenas.
109
Durante la
profase I de la meiosis, una vez que los cromosomas
homlogos estn perfectamente apareados formando
estructuras llamadas bivalentes, se produce el
fenmeno de sobrecruzamiento o
entrecruzamiento (crossing-over), en el cual las
cromtidas homlogas no hermanas (procedentes del
padre y de la madre) intercambian material gentico. La
recombinacin gentica resultante hace aumentar en
gran medida la variacin gentica entre la descendencia
de progenitores que se reproducen por va sexual. La
recombinacin gentica tambin puede estar implicada
en la reparacin del ADN, en particular en la respuesta
celular a las roturas de doble hebra (double-strand
breaks).
110

La forma ms frecuente de sobrecruzamiento
cromosmico es la recombinacin homloga, en la que
los dos cromosomas implicados comparten secuencias
muy similares. La recombinacin no-homloga puede
ser daina para las clulas, ya que puede
producirtranslocaciones cromosmicas y anomalas
genticas. La reaccin de recombinacin est catalizada
por enzimas conocidas comorecombinasas, tales
como RAD51.
111
El primer paso en el proceso de
recombinacin es una rotura de doble hebra, causada
bien por una endonucleasa o por dao en el
ADN.
112
Posteriormente, una serie de pasos catalizados
en parte por la recombinasa, conducen a la unin de las
dos hlices formando al menos una unin de Holliday,
en la que un segmento de una hebra simple es anillado
con la hebra complementaria en la otra hlice. La unin
de Holliday es una estructura de unin tetrahdrica que
puede moverse a lo largo del par de cromosomas,
intercambiando una hebra por otra. La reaccin de
recombinacin se detiene por el corte de la unin y la
reunin de los segmentos de ADN liberados.
113

Evolucin del metabolismo de
ADN[editar editar fuente]
Vase tambin: Hiptesis del mundo de ARN.
El ADN contiene la informacin gentica que permite a
la mayora de los organismos vivientes funcionar, crecer
y reproducirse. Sin embargo, no est claro durante
cunto tiempo ha ejercido esta funcin en los ~3000
millones de aos de la historia de la vida, ya que se ha
propuesto que las formas de vida ms tempranas
podran haber utilizado ARN como material
gentico.
114

115
El ARN podra haber funcionado como la
parte central de un metabolismo primigenio, ya que
puede transmitir informacin gentica y
simultneamente actuar como catalizador formando
parte de las ribozimas.
116
Este antiguo Mundo de
ARN donde los cidos nucleicos funcionaran como
catalizadores y como almacenes de informacin
gentica podra haber influido en la evolucin del cdigo
gentico actual, basado en cuatro nucletidos. Esto se
debera a que el nmero de bases nicas en un
organismo es un compromiso entre un nmero pequeo
de bases (lo que aumentara la precisin de la
replicacin) y un nmero grande de bases (que a su vez
aumentara la eficiencia cataltica de las ribozimas).
117

Desafortunadamente, no se cuenta con evidencia
directa de los sistemas genticos ancestrales porque la
recuperacin del ADN a partir de la mayor parte de los
fsiles es imposible. Esto se debe a que el ADN es
capaz de sobrevivir en el medio ambiente durante
menos de un milln de aos, y luego empieza a
degradarse lentamente en fragmentos de menor tamao
en solucin.
118
Algunas investigaciones pretenden que
se ha obtenido ADN ms antiguo, por ejemplo un
informe sobre el aislamiento de una bacteria viable a
partir de un cristal salino de 250 millones de aos de
antigedad,
119
pero estos datos son controvertidos.
120

121

Sin embargo, pueden utilizarse herramientas de
evolucin molecular para inferir los genomas de
organismos ancestrales a partir de organismos
contemporneos.
122

123
En muchos casos, estas
inferencias son suficientemente fiables, de manera que
una biomolcula codificada en un genoma ancestral
puede resucitarse en el laboratorio para ser estudiada
hoy.
124

125
Una vez que la biomolcula ancestral se ha
resucitado, sus propiedades pueden ofrecer inferencias
sobre ambientes y estilos de vida primigenios. Este
proceso se relaciona con el campo emergente de
la paleogentica experimental.
126

A pesar de todo, el proceso de trabajo hacia atrs desde
el presente tiene limitaciones inherentes, razn por la
cual otros investigadores tratan de elucidar el
mecanismo evolutivo trabajando desde el origen de la
Tierra en adelante. Dada suficiente informacin sobre la
qumica en el cosmos, la manera en la que las
sustancias csmicas podran haberse depositado en la
Tierra, y las transformaciones que podran haber tenido
lugar en la superficie terrestre primigenia, tal vez
podramos ser capaces de aprender sobre los orgenes
para desarrollar modelos de evolucin ulterior de la
informacin gentica
127
(vase tambin el artculo sobre
elorigen de la vida).
Tcnicas comunes[editar editar fuente]
El conocimiento de la estructura del ADN ha permitido el
desarrollo de multitud de herramientas tecnolgicas que
explotan sus propiedades fisicoqumicas para analizar
su implicacin en problemas concretos: por ejemplo,
desde anlisis filogeeticos para detectar similitudes
entre diferentes taxones, a la caracterizacin de la
variabilidad individual de un paciente en su respuesta a
un determinado frmaco, pasando por un enfoque
global, a nivel genmico, de cualquier caracterstica
especfica en un grupo de individuos de inters.
128

Podemos clasificar las metodologas de anlisis del ADN
en aquellas que buscan su multiplicacin, ya in vivo,
como la reaccin en cadena de la polimerasa (PCR),
ya in vitro, como la clonacin, y aquellas que explotan
las propiedades especficas de elementos concretos, o
de genomas adecuadamente clonados. Es el caso de la
secuenciacin de ADN y de la hibridacin con sondas
especficas ("southern blot" y chips de ADN).
Tecnologa del ADN
recombinante[editar editar fuente]
Artculo principal: ADN recombinante.
La tecnologa del ADN recombinante, piedra angular de
la ingeniera gentica, permite propagar grandes
cantidades de un fragmento de ADN de inters, el cual
se dice que ha sido clonado. Para ello, debe introducirse
dicho fragmento en otro elemento de ADN,
generalmente un plsmido, que posee en su secuencia
los elementos necesarios para que la maquinaria celular
de un hospedador, normalmente Escherichia coli, lo
replique. De este modo, una vez transformada la cepa
bacteriana, el fragmento de ADN clonado se reproduce
cada vez que aquella se divide.
129

Para clonar la secuencia de ADN de inters, se
emplean enzimas como herramientas de corte y
empalme del fragmento y del vector (el plsmido).
Dichas enzimas corresponden a dos grupos: en primer
lugar, las enzimas de restriccin, que poseen la
capacidad de reconocer y cortar secuencias especficas;
en segundo lugar, la ADN ligasa, que establece
un enlace covalente entre extremos de ADN
compatibles
128
(ver seccin Nucleasas y ligasas).
Secuenciacin[editar editar fuente]
Artculo principal: Secuenciacin de ADN.
La secuenciacin del ADN consiste en dilucidar el orden
de los nucletidos de un polmero de ADN de cualquier
longitud, si bien suele dirigirse hacia la determinacin
de genomas completos, debido a que las tcnicas
actuales permiten realizar esta secuenciacin a gran
velocidad, lo cual ha sido de gran importancia para
proyectos de secuenciacin a gran escala como
el Proyecto Genoma Humano. Otros proyectos
relacionados, en ocasiones fruto de la colaboracin de
cientficos a escala mundial, han establecido la
secuencia completa del ADN de
muchos genomas de animales, plantas y microorganism
os.
El mtodo de secuenciacin de Sanger ha sido el ms
empleado durante el siglo XX. Se basa en la sntesis de
ADN en presencia dedidesoxinuclesidos, compuestos
que, a diferencia de los desoxinuclesidos normales
(dNTPs), carecen de un grupo hidroxilo en su extremo
3'. Aunque los didesoxinucletidos trifosfatados
(ddNTPs) pueden incorporarse a la cadena en sntesis,
la carencia de un extremo 3'-OH imposibilita la
generacin de un nuevo enlace fosfodister con el
nuclesido siguiente; por tanto, provocan la terminacin
de la sntesis. Por esta razn, el mtodo de
secuenciacin tambin se denomina de terminacin de
cadena. La reaccin se realiza usualmente preparando
un tubo con el ADN molde, la polimerasa, un cebador,
dNTPs convencionales y una pequea cantidad de
ddNTPs marcados fluorescentemente en su base
nitrogenada. De este modo, el ddTTP puede ir marcado
en azul, el ddATP en rojo, etc. Durante la polimerizacin,
se van truncando las cadenas crecientes, al azar, en
distintas posiciones. Por tanto, se produce una serie de
productos de distinto tamao, coincidiendo la posicin
de la terminacin debido a la incorporacin del ddNTP
correspondiente. Una vez terminada la reaccin, es
posible correr la mezcla en una electroforesis
capilar (que resuelve todos los fragmentos segn su
longitud) en la cual se lee la fluorescencia para cada
posicin del polmero. En nuestro ejemplo, la lectura
azul-rojo-azul-azul se traducira como TATT.
130

131

Reaccin en cadena de la polimerasa
(PCR)[editar editar fuente]
Artculo principal: Reaccin en cadena de la polimerasa.
La reaccin en cadena de la polimerasa, habitualmente
conocida como PCR por sus siglas en ingls, es una
tcnica de biologa molecular descrita en 1986 por Kary
Mullis,
132
cuyo objetivo es obtener un gran nmero de
copias de un fragmento de ADN dado, partiendo de una
escasa cantidad de aqul. Para ello, se emplea
una ADN polimerasa termoestable que, en presencia de
una mezcla de los cuatro desoxinucletidos, un tampn
de la fuerza inica adecuada y los cationes precisos
para la actividad de la enzima, dos oligonucletidos
(denominados cebadores) complementarios a parte de
la secuencia (situados a distancia suficiente y en sentido
antiparalelo) y bajo unas condiciones de temperatura
adecuadas, moduladas por un aparato
denominado termociclador,
generaexponencialmente nuevos fragmentos de ADN
semejantes al original y acotados por los dos
cebadores.
129

La PCR puede efectuarse como una tcnica de punto
final, esto es, como una herramienta de generacin del
ADN deseado, o como un mtodo continuo, en el que se
evale dicha polimerizacin a tiempo real. Esta ltima
variante es comn en la PCR cuantitativa.
128

Southern blot[editar editar fuente]
Artculo principal: Southern blot.
El mtodo de hibridacin Southern o Southern blot
(el nombre original en el idioma ingls) permite la
deteccin de una secuencia de ADN en una muestra
compleja o no del cido nucleico. Para ello, combina una
separacin mediante masa y carga (efectuada mediante
una electroforesis en gel) con una hibridacin con una
sonda de cido nucleico marcada de algn modo (ya
sea conradiactividad o con un compuesto qumico) que,
tras varias reacciones, d lugar a la aparicin de una
seal de color o fluorescencia. Dicha hibridacin se
realiza tras la transferencia del ADN separado mediante
la electroforesis a una membrana de filtro. Una tcnica
semejante, pero en la cual no se produce la mencionada
separacin electrofortica se denomina dot blot.
El mtodo recibe su nombre en honor a su inventor,
el bilogo ingls Edwin Southern.
133
Por analoga al
mtodo Southern, se han desarrollado tcnicas
semejantes que permiten la deteccin de secuencias
dadas de ARN (mtodo Northern, que emplea sondas
de ARN o ADN marcadas)
134
o de protenas especficas
(tcnica Western, basada en el uso de anticuerpos).
135

Chips de ADN[editar editar fuente]
Artculo principal: Chip de ADN.


Microarray con 37.500 oligonucletidos especficos. Arriba a
la izquierda se puede apreciar una regin ampliada del chip.
Los chips de ADN son colecciones
de oligonucletidos de ADN complementario dispuestos
en hileras fijadas sobre un soporte, frecuentemente de
cristal. Se utilizan para el estudio de mutaciones de
genes conocidos o para monitorizar la expresin gnica
de una preparacin de ARN.
Aplicaciones[editar editar fuente]
Ingeniera gentica[editar editar fuente]
Vanse tambin: Ingeniera gentica y biologa molecular.
La investigacin sobre el ADN tiene un impacto
significativo, especialmente en el mbito de la medicina,
pero tambin en agricultura y ganadera (donde los
objetivos son los mismos que con las tcnicas
tradicionales que el hombre lleva utilizando desde hace
milenios - la domesticacin, la seleccin y los cruces
dirigidos - para obtener variedades de animales y
plantas ms productivos). La moderna biologa y
bioqumica hacen uso intensivo de latecnologa del ADN
recombinante, introduciendo genes de inters en
organismos, con el objetivo de expresar una protena
recombinante concreta, que puede ser:
aislada para su uso posterior: por ejemplo, se
pueden transformar microorganismos para
convertirlos en autnticas fbricas que producen
grandes cantidades de sustancias tiles,
como insulina o vacunas, que posteriormente se
aslan y se utilizan teraputicamente.
136

137

138

necesaria para reemplazar la expresin de un gen
endgeno daado que ha dado lugar a una
patologa, lo que permitira el restablecimiento de la
actividad de la protena perdida y eventualmente la
recuperacin del estado fisiolgico normal, no
patolgico. Este es el objetivo de la terapia gnica,
uno de los campos en los que se est trabajando
activamente en medicina, analizando ventajas e
inconvenientes de diferentes sistemas de
administracin del gen (virales y no virales) y los
mecanismos de seleccin del punto de integracin
de los elementos genticos (distintos para los virus
y los transposones) en el genoma diana.
139
En este
caso, antes de plantearse la posibilidad de realizar
una terapia gnica en una determinada patologa,
es fundamental comprender el impacto del gen de
inters en el desarrollo de dicha patologa, para lo
cual es necesario el desarrollo de un modelo
animal, eliminando o modificando dicho gen en un
animal de laboratorio, mediante la tcnica
knockout.
140
Slo en el caso de que los resultados
en el modelo animal sean satisfactorios se
procedera a analizar la posibilidad de restablecer el
gen daado mediante terapia gnica.
utilizada para enriquecer un alimento: por ejemplo,
la composicin de la leche (una importante fuente
de protenas para el consumo humano y animal)
puede modificarse mediante transgnesis,
aadiendo genes exgenos y desactivando genes
endgenos para mejorar su valor nutricional, reducir
infecciones en las glndulas mamarias,
proporcionar a los consumidores protenas
antipatgenas y preparar protenas recombinantes
para su uso farmacutico.
141

142

til para mejorar la resistencia del organismo
transformado: por ejemplo en plantas se pueden
introducir genes que confieren resistencia a
patgenos (virus, insectos, hongos), as como a
agentes estresantes abiticos (salinidad, sequedad,
metales pesados).
143

144

145

Medicina forense[editar editar fuente]
Vase tambin: Huella gentica.
Los mdicos forenses pueden utilizar el ADN presente
en la sangre, el semen, la piel, la saliva o el pelo en la
escena de un crimen para identificar al responsable.
Esta tcnica se denomina huella gentica, o tambin
"perfil de ADN". Al realizar la huella gentica, se
compara la longitud de secciones altamente variables de
ADN repetitivo, como los microsatlites, entre personas
diferentes. Este mtodo es frecuentemente muy fiable
para identificar a un criminal.
146
Sin embargo, la
identificacin puede complicarse si la escena est
contaminada con ADN de personas diferentes.
147
La
tcnica de la huella gentica fue desarrollada en 1984
por el genetista britnico Sir Alec Jeffreys,
148
y fue
utilizada por primera vez en medicina forense para
condenar a Colin Pitchfork por los asesinatos
deNarborough en 1983 y de Enderby en 1986.
149
Se
puede requerir a las personas acusadas de ciertos tipos
de crmenes que proporcionen una muestra de ADN
para introducirlos en una base de datos. Esto ha
facilitado la labor de los investigadores en la resolucin
de casos antiguos, donde slo se obtuvo una muestra
de ADN de la escena del crimen, en algunos casos
permitiendo exonerar a un convicto. La huella gentica
tambin puede utilizarse para identificar vctimas de
accidentes en masa,
150
o para realizar pruebas de
consanguinidad.
151

Bioinformtica[editar editar fuente]
Vase tambin: Bioinformtica.
La bioinformtica implica la manipulacin, bsqueda
y extraccin de informacin de los datos de la secuencia
del ADN. El desarrollo de las tcnicas para almacenar y
buscar secuencias de ADN ha generado avances en el
desarrollo de software de los ordenadores, para muchas
aplicaciones, especialmente algoritmos de bsqueda de
frases, aprendizaje automtico y teoras de bases de
datos.
152
La bsqueda de frases o algoritmos de
coincidencias, que buscan la ocurrencia de una
secuencia de letras dentro de una secuencia de letras
mayor, se desarroll para buscar secuencias especficas
de nucletidos.
153
En otras aplicaciones como editores
de textos, incluso algoritmos simples pueden funcionar,
pero las secuencias de ADN pueden generar que estos
algoritmos presenten un comportamiento de casi-el-
peor-caso, debido al bajo nmero de caracteres. El
problema relacionado del alineamiento de
secuenciaspersigue identificar secuencias homlogas y
localizar mutaciones especficas que las diferencian.
Estas tcnicas, fundamentalmente el alineamiento
mltiple de secuencias, se utilizan al estudiar las
relaciones filogenticas y la funcin de las
protenas.
154
Las colecciones de datos que representan
secuencias de ADN del tamao de un genoma, tales
como las producidas por el Proyecto Genoma Humano,
son difciles de usar sin anotaciones, que marcan la
localizacin de los genes y los elementos reguladores
en cada cromosoma. Las regiones de ADN que tienen
patrones asociados con genes que codifican protenas
o ARN pueden identificarse por algoritmos
de localizacin de genes, lo que permite a los
investigadores predecir la presencia de productos
gnicos especficos en un organismo incluso antes de
que haya sido aislado experimentalmente.
155

Nanotecnologa de ADN[editar editar
fuente]


La estructura de ADN de la izquierda (mostrada de forma
esquemtica) se auto-ensambla en la estructura visualizada
por microscopa de fuerza atmica a la derecha.
La nanotecnologa de ADN es el campo que busca disear
estructuras a nanoescala utilizando las propiedades de
reconocimiento molecular de las molculas de ADN. Imagen
de Strong, 2004. Plantilla:Doi-inline
Vase tambin: Nanotecnologa.
La nanotecnologa de ADN utiliza las propiedades
nicas de reconocimiento molecular del ADN y otros
cidos nucleicos para crear complejos ramificados auto-
ensamblados con propiedades tiles. En este caso, el
ADN se utiliza como un material estructural, ms que
como un portador de informacin biolgica.
156
Esto ha
conducido a la creacin de lminas peridicas de dos
dimensiones (ambas basadas en azulejos, as como
usando el mtodo de ADN origami
157
), adems de
estructuras en tres dimensiones con forma depoliedros.
Historia, antropologa y
paleontologa[editar editar fuente]
Vanse tambin: Filogenia y Genealoga molecular.
A lo largo del tiempo, el ADN almacena mutaciones que
se heredan y, por tanto, contiene informacin histrica,
de manera que comparando secuencias de ADN, los
genetistas pueden inferir la historia evolutiva de los
organismos, su filogenia.
158
La investigacin filogentica
es una herramienta fundamental en biologa evolutiva. Si
se comparan las secuencias de ADN dentro de una
especie, los genetistas de poblaciones pueden conocer
la historia de poblaciones particulares. Esto se puede
utilizar en una amplia variedad de estudios,
desde ecologa hasta antropologa, como ilustra el
anlisis de ADN llevado a cabo para identificar las Diez
Tribus Perdidas de Israel.
159

160
Por otro lado, el ADN
tambin se utiliza para estudiar relaciones familiares
recientes.
Igualmente en paleontologa (en la paleogentica) el
ADN en algunos casos tambin se puede utilizar para
estudiar a especies extintas (ADN fsil).