GENERALIDADES DE

VIROLOGIA
Microbiologa 2
Ctedra 2
Facultad de Medicina, UBA
Qu es un virus?
Virus
Son parsitos intracelulares obligatorios, no
pueden sintetizar ATP ni protenas independientemente
de la clula.
Los virus no son seres celulares.
El genoma viral puede ser ARN o ADN, pero no ambos.
Los virus poseen una cpside protica y algunos una
envoltura.
Los componentes virales se ensamblan y no se replican
por division.
Son seres vivos?
Una entidad viva es aquella capaz de
multiplicar sus estructuras pero adems, tiene
la capacidad potencial de generar nuevas
estructuras de mayor complejidad. La seleccin
de dichas estructuras (perpetuacin) esta dada
por la Seleccin Natural.
La evolucin define la condicin de
materia viva, los virus son materia viva.
Porqu es importante el
estudio de los virus?
Importancia clnica. Son los causantes de
numerosas enfermedades.
Son importantes herramientas en investigacin.
Utilizando virus se ha avanzado en la Biologa
Molecular, conocimiento de genes, de mecanismos
de replicacin, trascripcin, c. nucleicos, etc.
Importancia biolgica. Todos los seres vivos del
planeta tienen virus que los parasitan.
Componentes del virin
Tamao
1 m= 0,000000001 nm
Aprox: 20 a 250 nm
Genoma viral
ADN o ARN
Informacin para la replicacin viral y formacin de
nuevos viriones
Tamao de genoma variable
Haploides
Monocatenarios (sc): 1 sola cadena de nucletidos
Bicatenarios (dc): 2 cadenas de nucletidos
Molcula continua: lineal o circular
Segmentado
Genoma viral
DNA:
- doble cadena - lineal (Herpesvirus)
- circular (Papovavirus)
- simple cadena - lineal (Parvovirus)
- circular (v. bacterianos)
RNA: mayora simple cadena y lineal
- genoma fragmentado o segmentado
Ej. Virus de la gripe (sc)
Polaridad del ARN
o ARN Polaridad (+): codifica como ARNm,
se traduce a protena.
ARN Polaridad (-): debe pasar a ARN (+)
para poder traducirse a protena
Polaridad mixta o bisentido: arenavirus
Capside
Es una estructura que rodea y protege al
genoma vrico y est formado por protenas
codificadas por genes del virus.
Estas protenas que forman la cpside se
denominan protmeros.
Simetra es la forma que adopta un virus en
el espacio, esta dada por la estructura de la
Nucleocpside.
Simetra Helicoidal
Desnudo
Ej: mosaico del tabaco
Envuelto
Ej: Ortomixovirus
Nucleocpside cilndrica que puede estar
extendida o enrrollada sobre si misma.
Simetra Icosadrica
Desnudo
Ej: Adenovirus
Envuelto
Ej: Herpesvirus
Son icosaedros regulares, de 20 caras
triangulares, 12 aristas.
Binaria y Compleja
Binaria
Complejo
Cabeza icosadrica
y cola helicoidal.
Nucleocpside helicoidal o
icosadrica recubierta por una
envoltura laxa. Ovoides,
esfricos o pleomorficos
Envoltura
Es una capa membranosa que rodea la nucleocpside de
diferentes virus. Esta envoltura tiene estructura de
membrana, con bicapa lipdica con protenas:
Los lpidos de la envoltura proceden de las membranas
de la celula hospedadora.
Las protenas estan codificadas por genes del virus
- Glicoprotenas: tiene unidos azucares. Sobresalen de
la membrana. Espculas o peplmeros.
Fn: Unin a clula hospedadora
Actividad enzimtica
Protenas
Constituyen del 50 al 90%de la partcula viral
Estructurales: estan presentes en el virin en una
proporcin importante y mantienen la estructura del
mismo.
Superficie: constituyen los capsmeros y peplmeros
(proyecciones de la envoltura, glicoprotenas, ej:
Hemaglutinina y Neuraminidasa)
Internas: ubicadas en la cara interna de la envoltura,
entre capas de capsmeros, en el centro del virin.
No Estructurales: enzimas requeridas para el ciclo
de replicacin, que se sintetizan en la fase temprana
de la replicacin.
Clasificacin viral: Criterios
1. Tipo de cido nuclico, caractersticas del mismo y
mecanismos de replicacin.
2. Tamao del virin y simetra de la cpside.
3. N de capsmeros en los virus desnudos o dimetro de la
hlice en los helicoidales.
4. Presencia o no de envoltura.
5. Lugar de ensamble de las partculas virales (ncleo o
citoplasma).
6. Forma de salida de la clula husped (por lisis o brotacin).
Clasificacin ICTV
El Comit Internacional de Taxonoma de Virus (ICTV):
La estructura general de la taxonoma es la siguiente:
Taxn Terminacin N
Orden -virales 5
Familia -viridae 82
Subfamilia -virinae 11
Gnero -virus 307
Especie virus 2083
Los rdenes son: caudovirales, herpesvirales, mononegavirales,
nidovirales y picornavirales.
El comit no distingue formalmente entre subespecies, cepas y
aislamientos.
Existen unos 3.000 tipos que an no han sido clasificados.
Clasificacin ICTV
El ICTV estableci la base de datos de virus
universal de la ICTV (ICTVdB), disponible en
internet.
http://www.phene.cpmc.columbia.edu/index.
htm
http://www.ictvonline.org/index.
Familias de virus ADN y algunos miembros
importantes
Family Members
POXVIRIDAE
Smallpox virus, vaccinia virus, monkeypox,
molluscum contagiosum
Herpesviridae
Herpes simplex virus types 1 and 2, varicella-zoster
virus, Epstein-Barr virus, cytomegalovirus, human
herpesviruses 6, 7, 8
Adenoviridae Adenovirus
Papilloma viridae Papilloma virus
Polyoma viridae JC virus, BK virus, SV40
Hepadnaviridae Hepatitis B virus
Parvoviridae Parvovirus B19, adeno-associated virus
Family Members
PARAMYXOVIRIDAE
Parainfluenza virus, sarampion, parotiditis, virus respiratorio sincicial
virus, metapneumovirus
ORTHOMYXOVIRIDAE Influenza virus types A, B, and C
CORONAVIRIDAE Coronavirus, SARS (sindrome respiratorio severo y agudo)
Arenaviridae
Lassa fever virus, Tacaribe virus complex (Junin and Machupo viruses),
lymphocytic choriomeningitis virus
Rhabdoviridae Rabia
Filoviridae Ebola, Marburg
Bunyaviridae California encefalitis virus, virus fiebre hemorrgica, Hanta virus
Retroviridae Human T-cell leukemia virus types I and II, HIV
Reoviridae Rotavirus
Picornaviridae Rhinovirus, poliovirus, echoviruses, coxsackievirus, hepatitis A virus
Togaviridae Rubeola ; virus de la encefalitis del oeste, este, y equina Venezuela
Flaviviridae
Virus de fiebre amarrilla , dengue, virus de encefalitis de San Luis, West
Nile virus, virus hepatitis C
Caliciviridae Norwalk virus, calicivirus
Etapas de la replicacin viral I
1. Iniciacin:
a) Adsorcin: es la unin especfica de la protena viral de
superficie con el receptor de la membrana celular. Tropismo.
b) Penetracin: Endocitosis mediada por receptor (EMR), o fusion
c) Desnudamiento: del genoma viral. Citoplasma o enlos poros
de la membrana nuclear.
2. Expresin y replicacin del genoma:
Genomas virales poseen diferentes estrategias de multiplicacin
viral.
ARNm viral. Sntesis de protenas virales.
a) Protenas que interfieren con el metabolismo celular
b) Polimerasas: sntesis de cidos nuclicos virales
c) Estructurales: formaran la estructura de los viriones
Etapas de la replicacin viral II
3. Ensamble, maduracin y egreso de la
clula infectada
a) Intracelular:
- en el citoplasma celular
- ncleo celular
b) Ensamble es simultneo al egreso de la clula.
- Membrana citoplasmtica
- virus emergen por brotacin.
- lisis celular o casi no citolticos (retrovirus).
c) Ensamble en el ncleo celular: herpesvirus.
Herpesvirus
DNA, envuelto
Picornavirus: RNA (+) desnudo
Diferentes vas para la sntesis de
ARNm viral
Replicacin genmica de virus con
diferentes tipos de cidos nuclicos
Curva de crecimiento de un nico ciclo de
multiplicacin viral
Patognesis
Patognesis del virus es el proceso por el
cual los virus producen enfermedad en el
husped.
La produccin de la enfermedad, que es el
foco de la patognesis, es en realidad un
resultado relativamente inusual de la
infeccin viral de un husped.
Virulencia
La virulencia de un virus es su capacidad, en
comparacin con otros virus estrechamente
relacionados, para producir enfermedad en un
husped.
La virulencia depende de una variedad de factores:
virales: - dosis de virus
- va de entrada
husped:
- edad del husped
- sexo
- estado inmunolgico
- especies
Tropismo
La relacin virus husped es especfica: dada por la unin
de protenas virales a receptores de la membrana celular.
Cada virus afecta a un grupo: humanos, animales, vegetales o
bacterias y dentro de ellos, solamente a algunas clulas
(dermotropos, neumotropos, hepatotropos, neurotropos y
pantotropos). Ej: sarampin.
Virus que producen zoonosis: Rabia, arenavirus (Fiebre
hemorrgica Argentina).
El mdico debe contemplar la clasificacin y el tropismo de
cada virus ya que la accin patgena viral depende de este
ltimo, as se orientar dentro de un espectro limitado de virus
causantes de la patologa.
Patogenia de las infecciones virales
Estados:
1. Infeccin inicial del husped: el virus se
adsorbe a clulas susceptibles y luego
penetra en el tejido. Puertas de entrada.
2. Diseminacin de la infeccin: multiplicacin
y diseminacin local a travs del cuerpo.
3. Eliminacin de virus al exterior. Relacionado
con la transmisin viral.
Puertas de entrada
Organo Virus Mecanismo
Piel Rabia Mordedura por perros y zorros
Arbo=Fiebre amarilla Picadura de artrpodos (Aedes
aegypty)
HBV, HVC, HIV, EBV,
CMV
Transfusiones, inyecciones
Papiloma Verruga en piel
Tracto respiratorio Influenza,
Parainflueza,
Sarampin
Va aerea, intensidad de las
secreciones por boca o nariz,
contaminacin manos, etc
Orofaringe y
tracto entrico
EV, Rotavirus, ADV 40
y 41
Contaminacin fecal-oral
Tracto genito-
urinario
ADV 11y21, BK, HSV-
1y2, HIV,
HBV,Papiloma
Relaciones sexuales, canal de parto
Va conjuntival ADV 8, EV 70 Contacto con objetos contaminados
Vas de diseminasin
Transmisin de virus al exterior del
organismo
Liberacin viral de la clula, salida del husped,
transporte a travs del medio ambiente en forma viable y
entrada apropiada a un nuevo husped susceptible.
Factores que intervienen:
1. Cantidad de virus.
2. Estabilidad viral en el medio ambiente
3. Presencia de vectores transmisores
4. Disponibilidad de huspedes susceptibles
5. Constitucin gentica del virus y el husped
Fuentes de transmisin: secreciones respiratorias,
saliva, heces, orina, secreciones genitales, leche,
sangre o piel.
Efecto de la infeccin viral sobre la
clula
El resultado de la accin viral sobre la clula puede
detectarse por la observacin del Efecto Citoptico,
producido de distintas maneras:
Lisis celular:
1. Interferencia de la biosntesis de macromolculas
celulares
2. Alteracin de la funcin de la membrana plasmtica
3. Liberacin de enzimas hidrolticas degradativas desde las
membranas lisosomales.
Formacin de sincicios gigantes: fusin de membranas
celulares, se forma una masa citoplasmtica que puede
contener mltiples ncleos
Cuerpos de inclusin: acmulos cristalinos de partculas
virales , se observan inclusiones intranucleares (HSV o
parvovirus), Cuerpos de Negri (Rabia), depsitos de Ag
virales.
Tipos de
infecciones
virales
Cuasiespecies
La mezcla de virus presente en el husped en un momento
dado es una cuasiespecies.
Las ARN y ADN polimerasas virales producen errores generando
cepas mutantes durante la infeccin viral.
La mutacin es un fenmeno mas importante en los virus ARN ya
que sus polimerasas son menos fieles que las de los virus de
ADN.
La cuasiespecie se encuentra sometida a las presiones
selectivas complejas y poderosas en el husped, y algunos virus
pueden tener una ventaja fsica sobre los dems.
La naturaleza de estas presiones selectivas y el potencial
patgeno de los virus seleccionados son determinantes
importantes de la patogenia viral.
Efecto de agentes fisicoqumicos
sobre los virus I
El conocimiento de la sensibilidad de los virus a
las condiciones ambientales es importante para:
Determinar la viabilidad de muestras clnicas
para el diagnstico virolgico.
La conservacin de vacunas virales a virus vivo.
Estimar la infectividad a temperatura ambiente.
Decontaminar materiales.
Efectuar un tratamiento adecuado para el agua
potable.
Efecto de agentes fisicoqumicos
sobre los virus II
Temperatura: los virus son lbiles al calor. En general se
inactivan 1 hs a 60C.
pH y medio inico: mejor conservacin en medios
isotnicos y pH fisiolgico. Excepcin: enterovirus
estables a pH 3.
Radiaciones: UV y ionizantes (rayos X y gamma)
inactivan a los virus por su accin sobre el genoma viral.
Solventes lpidos: los virus envueltos son sensibles a
ter, cloroformo, sales biliares, detergentes aninicos. Los
virus desnudos son resistentes a los solventes lipdicos.
Ej. Enterovirus.
DIAGNSTICO VIROLGICO
Para qu sirve?
Diagnstico individual en un caso clnico.
Intervencin teraputica: tratamiento especfico.
Para definir un pronstico en la evolucin del paciente
Indicar la necesidad de una vacunacin.
Vigilancia epidemiolgica: incidencia de enfermedades,
cepas circulantes de virus.
Para adoptar medidas de salud pblica en la
comunidad.
Calidad de la Muestra
La calidad del diagnstico virolgico est
condicionado por la calidad de la muestra.
Tipo de muestra: depende de la patologa y el virus
Tiempo de toma de muestra: dentro de los 7 das de
iniciado el cuadro clnico, para serologa tambin a los 14
o 21 das.
Calidad: -Viabilidad viral
- Integridad genoma viral
- Presencia de inhibidores
- Biopsias del lugar del foco
o Cantidad: 0,5 ul - PCR 100-200 ul
- Cultivo 200 ul
Tiempo y condiciones de transporte
Tipos de muestras
Manifestaciones Agentes Muestras
Infeccin del SNC EV, HSV, Rabia, Sarampin,
Arbovirus
LCR, orina, sangre
Infeccin
respiratoria baja
Influenza, Parainfluenza, Sincicial
respiratorio, ADV
ANF
Infeccin
respiratoria alta
Rinovirus, Adenovirus, EV,
Reovirus
H. Nasal, H. Farngeo,
ANF, heces
Piel y mucosas Viruela, Vaccinia, Varicela, HSV,
EV
H. Farngeo, raspado
base vescula
Exantma Rubela Sangre heparinizada,
LCR, H. Farngeo
Conjuntivitis HSV, Adenovirus, EV70 H. Ocular
Sistmica CMV, Adenovirus, CAV-B Orina, sangre, H.
Farngeo, LCR
Diarrea infantil Rotavirus Materia fecal
Hepatitis, SIDA HAV, HBV, HIV Suero
Recoleccin y Conservacin
Conservar en fro (4C). Evitar el congelamiento y
descongelamiento. Procesar en forma inmediata.
Muestra Recoleccin
Suero, sangre entera,
plasma, leucocitos
3-10 ml, tubo estril
Hisopados Tubo con medio de
transporte
Fudos Tubo estril
Biopsias y necropsias Tubo estril con medio de
transporte
LCR Tubo estril
Materia Fecal 4 grs, frasco limpio
Curvas de deteccin de virus y Ac
Mtodos de Diagnstico Directos
Detectan la presencia de virus en muestras
clnicas.
1. Deteccin del virus como agente infeccioso:
Aislamiento viral
2. Deteccin de partcula viral: Microscopa
electrnica
3. Antgenos virales: IF, IP, EIA
4. Genomas virales: PCR, rtPCR. Mtodos
moleculares
Aislamiento Viral
Es el mtodo de diagnstico clsico.
Es un sistema de amplificacin, que incrementa
la cantidad de virus presente en la muestra.
Producto: virus viable.
La cepa aislada puede conservarse. Permite la
posterior caracterizacin del virus.
Permite la deteccin de diferentes agentes
virales, incluso aquellos no sospechados
inicialmente.
Tipo de cultivo Lnea celular Virus
Primario Rin de mono Influenza, Parainfluenza, EV
Rin de conejo HSV
Rin de embrin
humano
ADV, EV
Diploide Fibroblastos HSV, CMV, VZV, ADV, RSV,
PAR, BK, Rinovirus
Continuos Hep-2 ADV, HSV, PAR, RSV,
Parainfluenza y EV (algunos)
A549 HSV, ADV, EV
MDCK Influenza
Vero HSV, VZV, PAR
Rd Polio, Echo, CAV
L20b Poliovirus
Efecto Citoptico (ECP)
ECP: es el cambio morfolgico producido
en las clulas infectadas que puede
visualizarse microscpicamente.
Cuerpos de inclusin
Clulas multinucleadas
Sinsicios celulares
Vacuolizacin citoplasmtica
ECP HSV
IFI HSV
Fibroblastos infectados con HSV Fibroblastos normales
Foco en Vero
Desventajas del Aislamiento Viral
Baja sensibilidad
Deben utilizarse combinaciones de lneas celulares.
Siempre requiere confirmacin.
Existen virus que son difciles de aislar (CAV) son de
lento crecimiento (CMV).
Demora de resultados: 6 7 das hasta 14 das o ms.
Laboriosa, personal altamente entrenado, infraestructura
especial de laboratorio.
Se debe trabajar en condiciones de esterilidad (cabina con
flujo de aire laminar).
Microscopa electrnica
Visualizacin directa de partculas virales en muestras
Rpido
No requiere virus viable
Procedimiento abierto
Costo y el mantenimiento del microscopio electrnico es
complejo
Sensibilidad: relacionada con la alta concentracin de
partculas virales (105 a 106/L)
Usos: - Muestras de materia fecal en gastroenteritis
virales. Ej: Rotaviruses, Adenovirus 40 y 41, Norovirus
y Astroviruses.
- Lquido de ampollas: HSV, Poxvirus, Marburg,
Ebola
- tejidos fijados obtenidos por biopsia o autopsia
- identificacin de virus en cultivos celular
Fotografa electrnica de virus
entricos
ADENOVIRUS ASTROVIRUS
ENTEROVIRUS
ROTAVIRUS
Fotografa electrnica de
Herpesvirus
Deteccin de ANTGENOS VIRALES
a) El Ag viral se expresa y esta presente en la
muestra
b) Existencia de un Ac (monoclonal o policlonal)
apropiado
c) Variabilidad antignica no excluye el
reconocimiento de los reactivos inmunolgicos
de las diferentes cepas del virus blanco
d) El antgeno a detectar es estable y no se
degrada durante el transporte y procesamiento
de la muestra.
Mtodos: Inmunoflorescencia
1. Inmunofluorescencia
(IF): isotiocianato de
fluorescena (FITC)
- Directa: Fcil de usar,
conjugacin de cada Ac
antiviral
- Indirecta:Ms sensible
y ms verstil.
- Microscopio de
fluorescencia (luz UV)
Mtodos: Inmunoperoxidasa
Coloracin con peroxidasa de rbano picante. Se incuba
Ac-Peroxidasa con muestra (Ag) + sustrato: cambio de
color
Microscopa de luz
Venta: tejido intacto (tcnicas histoqumicas), lo que
permite el exmen de la relacin espacial entre
antgenos virales y las estructuras celulares.
Desventaja: es ms complicado y peroxidasas
endgenas puede producir tincin de fondo.
Ej: Herpes
Mtodos: ELISA
3. Enzima Inmunoensayo
Formato de anticuerpos doble sandwich
Cambio de color indica presencia de antgeno del virus
Propiedades deteccin Ag
Verstil
En fase slida o lquida.
Integridad de la muestra no es tan importante, ventajoso
para transporte de muestra prolongado.
Aplicacin a muestras diversas
Posibilidades de automatizacin.
Instrumentos de laboratorio estn disponibles que puede
realizar EIA para detectar tanto antgenos o anticuerpos.
Aplicaciones de deteccin de Ag
Muestra Virus
Respiratorias
(ANF, HF, H Nasal, BAL)
Respiratorio sincicial
Influenza A,B
Parainfluenza 1,3
Adenovirus
Parotidtis
Piel o hisopado mucosa
HSV, VZV
Conjuntiva o hisopado cornea HSV, ADV
Sangre CMV (pp65)
HBV (Ag superficie)
HIV (p24)
Materia Fecal Rotavirus
Adenovirus (entrico)
Genoma virales: el blanco para
mtodos moleculares
Deteccin de genoma viral: PCR
Reaccin en Cadena de la Polimerasa:
amplificacin enzimtica in vitro de un
fragmento de ADN ARN en forma exponencial.
Proceso repetitivo de ciclos: cada ciclo consta de
los siguientes pasos.
Desnaturalizacin
Annealing
Extensin
Cada paso se produce a una temperatura
determinada
Formatos de PCR
RT-PCR: Virus RNA:
- Retrotranscripcin: ARN a ADNc (37 o 42 C)
Nested: reaccin de PCR anidada. Mayor
sensibilidad.
Mltiplex PCR: permite la deteccin de diferentes
virus en una nica reaccin. Los fragmentos
amplificados deben tener tamaos diferentes.
Etapas de la PCR
1. Preparacin de mezclas: enzimas,
iniciadores, nucletidos, buffer
2. Extraccin de cidos nuclicos:
Isotiocianato de guanidinio: DNA y RNA
Trizol: RNA
Columnas (slica)
3. PCR: amplificacin del target
4. Visualizacin del producto amplificado:
Electroforsis en gel de agarosa
Ventajas de la PCR
Rpida: resultados en el da
Elevada sensibilidad y especificidad
No requiere la viabilidad del virus
Desventajas de la PCR
RNA es fcilmente degradable
Inhibicin de la reaccin (falsos
negativos)
Contaminacin (falsos positivos)
PCR Multiple Virus Neurotrpos
Blancos amplificados: DNA polimerasa (HSV) y 5NCR (EV)
Sensibilidad: - HSV, EBV: 1-5 molculas
- VZV: 5-50 molculas
- CMV, HHV6: 50-100 molculas
- EV: 0.01 0.001 TCDI
50
PCR en Tiempo Real
PCR: procesos de amplificacin y deteccin
ocurren en forma simultnea.
Deteccin: mide fluorescencia emitida, la cual es
proporcional al ADN sintetizado.
Sistemas fluorescentes:
- Agentes intercalantes: SYBER Green I
- Sondas especficas marcadas con fluorocromos:
Taq Man
TAQ MAN
Caractersticas de PCR Tiempo Real
Deteccin en tiempo real del producto amplificado.
Sistema de amplificacin y deteccin integrados.
Bajo riesgo de contaminacin, sin manipulacion post-
amplificacin
Cuantitativa
Rpida
Reproducible
Altamente especfica: iniciadores y sonda
No utiliza Bromuro de Etidio
Fcil de automatizar
Sensibilidad similar a Nested-PCR
Reactivo dependiente
Costo
Deteccin de cidos nuclicos
aplicados al diagnstico viral I
Virus Muestra Aplicacin
HIV Leucocitos del RN de madre HIV Infeccin perinatal
HIV Plasma
Carga viral (pronstico, respuesta al
tratamiento)
HSV, VZV
LCR, fluido ocular, hisopados
de lesiones mucocutneas
Encefaltis, meningitis, retinitis,
lesiones mucocutneas
CMV
Sangre (entera, luecocitos o
plasma), LCR, fluido ocular,
lquido amnitico
Infeccin sistmica post-transplante,
encefalitis, infeccin congnita,
ensayo cuantitativo para monitorear
severidad de la infeccin y respuesta a
la terapia
EBV LCR, Sangre (entera, luecocitos
o plasma)
Linfoma primario de SNC adquirido por
SIDA, post-transplante, desorden
linfoproliferativo
HHV-6,7
Sangre, LCR Infeccin sistmica, encefalitis
Deteccin de cidos nuclicos
aplicados al diagnstico viral II
Virus Muestra Aplicacin
HHV-8 Sangre, lquido pleural o
pericardial
Diagnsitco de linfoma
ADV Sangre, secreciones
respiratorias
Infeccin respiratoria, diseminasin
de infeccin en inmunosuprimmidos
Parvo
B19
Suero, lquido aminitico Infeccin crnica de parvovirus
B19, crissi aplsica, infeccin
congnita
JC LCR Leucoencefalopata multifocal
progresiva
BK
Orina, plasma Riesgo de nefropata post-
transplante renal
HPV
Secreciones genitales Tipo viral asociado a carcinoma
cervical
EV
LCR, sangre (entera, suero,
plasma)
Meningitis o infeccin sistmica
Deteccin de cidos nuclicos
aplicados al diagnstico viral III
Virus Muestra Aplicacin
WestNile
LCR, sangre Infeccin SNC (IS), screening en
sangre de infeccin presintomtica
HepC Plasma Infeccin. Ensayo cuanti para evaluar la
respuesta a la terapia
HepB Suero Infeccin cuando serologa es ambigua.
Infeccin activa. Ensayo cuanti para
evaluar la respuesta a la terapia y
emergencia de resistencia
Rabia Saliva, LCR Diagnsitco de rabia
V. Resp Muestras respiratorias Elevada sensibilidad, incluyendo agentes
no cultivables
Gastro
Materia Fecal Elevada sensibilidad, incluyendo
agentes no cultivables
Secuenciacin genmica viral
Secuenciacin nucleotdica de productos de PCR
Deteccin de resistencia a los antivirales en VIH (plasma) y
CMV
Identificacin de serotipos: EV
Deteccin de cepas mutantes: cepas derivadas de la vacuna
Sabin con capacidad patognica.
Deteccin de cepas recombinantes
Aplicaciones epidemiolgicos
Relaciones filogenticas
BAlp167-ARG04
Mza159-ARG04
BAm717-ARG03
Mza162-ARG04
BAm715-ARG03
Mza143-ARG04
Mza124-ARG04
Mza152-ARG04
BA22-ARG04
BA107-ARG04
BAc29-ARG04
BAsm91-04
Mza130-ARG04
BA334-ARG04
Chaco343-ARG04
Tu296-ARG04
Tu283-ARG04
Cba286-ARG04
Cba314-ARG04
Cba1551-ARG06
Cba182-ARG04
Cba275-ARG04
Chaco69-ARG04
B2 2006 y Brote 2003-2004
BAz549-ARG03
TF59-ARG04
BAz551-ARG03
BAz499-ARG03
BAz500-ARG03
B1 Zarate 2003 y TF
CapFed55-ARG01
BA13-ARG03
SF40-ARG03
BA173-ARG03
BAta1261-ARG06
Chaco61-ARG07
B3 2003 2006-07
Mis116-ARG04
Mza147-ARG04
ER108-ARG01
SF187-ARG03
SF49-ARG03
A2 2001 y Brote 2003-2004
Mza305-ARG98
Mza311-ARG98
373-ARG97
Ch341-ARG98
Ch345-ARG98
Ch336-ARG98
Ch337-ARG98
Ch339-ARG98
A1 1997 y Brote 1998
BastianniVP1
99
91
62
76
25
47
89
68
44
99
99
99
99
82
76
48
99
75
73
88
99
37
59
79
74
97
75
92
42
84
47
72
36
23
56
61
26
31
25
30
7
31
8
17
0.02
Mtodos de Diagnstico Indirectos
Serologa: deteccin de anticuerpos especficos
antivirales en el suero del paciente.
- Conversin serolgica: aparicin o aumento de 4 o
ms veces del ttulo de Ac entre 2 muestras pareadas
de suero, fase aguda y convalesciente (14 a 21 das).
IgG.
- Presencia de IgM especfica: en una sola muestra
de perodo agudo o convalescencia temprana
- ELISA, RIA, Western Blot
Serologa: Curva de deteccin de Ac
Diagnstico serolgico se basa en la cintica de la
respuesta de Ac a la infeccin viral.
Aplicacin de la serologa
Infeccin aguda Estado inmune
Epstein-Barr Varicela Zoster
Citomegalovirus (S. Mononucleosis) Herpesvirus
Hepatitis viruses (A-B) Citomegalovirus
Paperas Epstein Barr
Rubola Paperas
Parotiditis Rubola
Parvovirus B19 Parotiditis
Encefalitis virus Parvovirus B19
Rabia Hepatitis viruses (A-B)
Fiebre Hemorrgica
Dengue
HIV
HTLV-1/2
Bibliografa
Fields Virology 5 edicin. Lippincott
Willams-Wilkins
www.who/int/es
www.paho.org
www.cdc.gov
www.msal.gov.ar
www.anlis.gov.ar