19. En la secuencia de un gen, a que se denomina el nucletido +1?

El primer paso de la transcripcin es la unin de la enzima ARN polimerasa a una

regin del gen llamada promotor. El promotor es una secuencia especfica de
bases con alta afinidad por la enzima, por lo que proporciona a la misma su sitio
de unin al ADN. Es asimismo una seal que indica cul cadena se ha de
transcribir. La transcripcin es asimtrica, pues usualmente slo se transcribe una
de las dos cadenas que forman cada gen. La cadena que acta como plantilla es
la cadena molde, negativa o no codificante; la hebra no transcripta,
complementaria de la anterior, se denomina antimolde, positiva o codificante. La
ARN polimerasa se desplaza sobre la cadena molde, recorrindola en direccin 3
=> 5 o ro abajo y transcribindola a partir del nucletido que el promotor seala
como punto de inicio de la transcripcin. Este nucletido se nombra +1 y los
siguientes, ro abajo, siguen la numeracin correlativa (+2, +3, etc.). Partiendo
desde el punto de inicio en la direccin contraria, es decir ro o corriente arriba,
los nucletidos se numeran 1, -2, etc.
http://genomasur.com/lecturas/Guia11.htm
20. Una vez sintetizadas, todas las protenas deben ser modificadas? Explique
su respuesta. Referente a eso, en qu consisten las modificaciones
postraduccionales? De tres ejemplos.
- La modificacin postraduccional de las protenas tiene por objeto procesar o
alterar los polipptidos recin sintetizados con el fin de producir la conformacin
tridimensional correcta de las protenas, dichas modificaciones incluyen
procesamientos proteolticos, alteracin de aminocidos o unin de estructuras
grandes con lpidos o carbohidratos pero no todas las protenas necesitan de
estas modificaciones para ser funcionales.
- Conjunto de procesos que modifican las protenas una vez ha terminado su
sntesis, con el objetivo de contribuir a su correcto plegamiento, a su activacin o a
la regulacin de su actividad o situacin en el interior de la clula. Las
modificaciones postraduccionales determinan: actividad de la protena,
localizacin, recambio o degradacin e interacciones con otras protenas.
Ejemplos:
Hidroxilacin (Adicin de un grupo hidroxilo a las protenas)
Metilacin (Introduccin del grupo metilo)
Fosforilacin (Adicin del grupo fosfato)
http://quimicaclinicauv.blogspot.com/2008/10/modificaciones-post-
traduccionales.html
21. Describa las modificaciones: postranscripcionales del ARNm, ARNt y ARNr.
- ARNm: Comprenden varios pasos moleculares.
La adicin del casquete o del CAP: Adicin del nucletido guanina. La
funcin de este CAP es reconocer el primer codn para iniciar la traduccin del
ARNt.
La adicin del Poli A: Adicin de 200 a 250 adeninas en el extremo 3' del
transcrito primario (ARNtp). El Poli A saca el ARNm al citoplasma y protege el
ARNm de las endonucleasas citoplasmticas.
El splicing: Es la eliminacin de fragmentos del ARNtp que no intervienen en
la sntesis de la protena (Intron) y en el empalme o unin de los fragmentos
que harn parte del ARNm (Exn) y por lo tanto son las secuencias de
nucletidos que establecen la secuencia de codones que complementan con
los ARNt.
La edicin del ARN: Ocurren mutaciones puntuales tipo transicin y
transversin en el ARNm. Se conoce que existe otro ARN llamado gua (ARNg)
que asociado a protenas se pega al ARNtp que adems de inducir las
mutaciones puntuales selecciona los fragmentos a eliminar en el "splicing".
- ARNt comprende:
La adicin de grupos metilos.
La modificacin de nucletidos.
http://eniah.galeon.com/productos840732.html
22. Que son los micro ARN? En qu tipos de clulas se presentan? Cul es su
importancia a nivel funcional?
- Un microRNA es un ARN monocatenario de entre 19 y 25 nt de longitud. Estn
implicados en la regulacin gnica post-transcripcional y probablemente tambin
en la metilacin del ADN. Los microRNA se transcriben a partir de genes de ADN
pero no se traducen a protena (genes no-codificantes); son presentes en un
amplio rango de especies tanto en plantas como en animales, muchos de ellos
son altamente conservados, la mayora de los genes de microRNA se ubican en
regiones intergnicas y tienen su propio promotor y elementos regulatorios,
aproximadamente el 40% de los genes de microRNA estn ubicado en intrones
se transcriben conjuntamente con el gen hospedador, estn involucrados en
muchos procesos bsicos (metabolismo, desarrollo, sistema inmunolgico, etc.) y
algunos microRNA estn implicados en el desarrollo de patolgicas como el
cncer.
http://bioinfo2.ugr.es/presentaciones/genomica/microRNA.pdf
- En las clulas madre
- Se suelen unir a la regin 3 UTR donde inician la degradacin del mRNA o
inhiben la traduccin:
Si la funcin es por inhibicin de traduccin o por degradacin depende
posiblemente del grado de complementariedad entre microRNA y 3UTR
Hay otras posibles funciones como la metilacin del ADN que de momento
parece bien establecido en plantas.
http://bioinfo2.ugr.es/presentaciones/genomica/microRNA.pdf
23. Hay diferencias entre las ARN polimerasas procariotas y eucariotas?
ARN polimerasa en procariotas: La misma enzima cataliza la sntesis de todos
los tipos de ARN (ARNm, ARNr y ARNt).
La ARN polimerasa en procariotas en una gran molcula. Est formada por cinco
subunidades de aproximadamente 410 kDa, con dos unidades idnticas, que se
une al ADN de forma inespecfica para catalizar la sntesis de ARN. Todas las
unidades que forman la enzima funcionan conjuntamente para llevar a cabo las
reacciones de transcripcin. Las ARN polimerasas de los organismos procariontes
funcionan de forma anloga, aunque alguna subunidad de la protena difiera en su
composicin.
ARN polimerasa en eucariotas: Existen tres tipos de ARN polimerasa, cada una
especializada en la sntesis de un ARN determinado:
ARN polimerasa I: Sntesis, reparacin y revisin. Sintetiza precursores
de ARN ribosmico.
ARN polimerasa II: Reparacin, Sintetiza precursores de ARN
mensajero, microARNs y otros tipos de cido ribonucleico. Esta polimerasa es
el tipo ms estudiado, y se requieren factores de transcripcin para que se una
a los promotores del ADN.
ARN polimerasa III: sintetiza ARN de transferencia, ARN ribosmico de 5S y
otros pequeos ARN (ARNpequeos) encontrados en el ncleo celular (ARNp
nucleares) y en el citoplasma(ARNp citoplasmticos).
www.uam.es/personal_pdi/ciencias/ibonilla/.../6.2.Transcripcion.PPT
24. Por qu la sntesis de los fragmentos de okazaki se inicia por la primasa en
lugar de una ADN polimerasa?
La sntesis continua de dos nuevas hebras en la horquilla de replicacin requiere
que una de las hebras se sintetice en sentido 5 a 3 mientras que la otra en el
sentido opuesto (3a 5 Fragmentos de Okazaki). Pero la ADN polimerasa
cataliza la polimerizacin de los dNTPs solamente en sentido 5 a 3, por lo que no
son capaces de iniciar la sntesis de los fragmentos de Okazaki. La enzima
primasa sintetiza los fragmentos cortos de ARN complementarios a la hebra
rezagada molde en la horquilla de replicacin. Los fragmentos de Okazaki se
sintetizan mediante la extensin de estos iniciadores de ARN por la ADN
polimerasa. Una consecuencia importante de estos iniciadores de ARN es que los
nuevos fragmentos de Okasaki sintetizados contienen una unin ARN ADN.
Cooper La Clula