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Medicina Personalizada
y Predictiva
Informe de Prospectiva
Tecnolgica Sectorial
Farmacogenmica:
Medicina Personalizada
y Predictiva
Informe de Prospectiva
Tecnolgica Sectorial
Farmacogenmica:
Medicina Personalizada y Predictiva
El presente informe de Prospectiva Tecnolgica
ha sido realizado en el marco del convenio de colaboracin
conjunta entre la Fundacin Observatorio de Prospectiva
Tecnolgico Industrial (OPTI) y Genoma Espaa.
Genoma Espaa y Fundacin OPTI, agradecen de toda
sinceridad el apoyo desinteresado de toda la comunidad
cientfica y empresarial que ha participado en este informe, y
ms en concreto a los miembros del Panel de Expertos.
Luis Prez Jurado, Universidad Pompeu Fabra
Santiago Lamas, CIB
Juan Carlos Tercero, Zeltia/Pharmamar
Antonio Martnez, Progenika
Joaqun Dopazo, CIPF
ngel Carracedo, CEGEN
Francisco Abad Santos, Comit tico del Hospital
de la Princesa
Carlos Romeo Casabona, Ctedra Interuniversitaria
de Derecho y Genoma Humano
Pablo Olivera Mas, Garrigues
Julio Bentez, Escuela de Medicina, Universidad
de Extremadura y Hospital Universitario Infanta Cristina.
Montserrat Baiget, Hospital Santa Creu i Sant Pau
Ignacio Garca-Ribas, Lilly
Jaime del Barrio, Instituto Roche
Jos Jernimo Navas Palacios, Instituto de Salud Carlos III
Julio Rodrguez Villanueva, Genomix, Genetix and Health S.L.
Cristina Rondinone, Roche
Natividad Calvente, Agencia Espaola del Medicamento
Vctor Gonzlez Rumayor, Direccin General
de Terapias Avanzadas y Transplantes
Marisa Espasa, IQS
La reproduccin parcial de este informe est autorizada bajo
la premisa de incluir referencia al mismo, indicando:
Farmacogenmica: Medicina Personalizada y Predictiva.
Genoma Espaa/Fundacin OPTI.
Genoma Espaa no se hace responsable del uso que se
realice de la informacin contenida en esta publicacin. Las
opiniones que aparecen en este informe corresponden a los
expertos consultados y a los autores del mismo.
Relatores:
Olga Ruiz Galn (Genoma Espaa)
Miguel Vega Garca (Genoma Espaa)
Coordinacin:
Fernando Garcs Toledano (Genoma Espaa)
Ana Morato (Fundacin OPTI)
Miguel Vega Garca (Genoma Espaa)
Copyright: Fundacin Espaola para el Desarrollo
de la Investigacin en Genmica y Protemica/OPTI
Edicin: Cintia Refojo (Genoma Espaa)
Referencia: GEN-ES09002
Fecha: abril 2009
Depsito Legal: M-21908-2009
Diseo y realizacin: Creaciones Hazanas, S.L.
ndice de contenido
RESUMEN EJECUTIVO
FARMACOGENMICA Y MEDICINA PERSONALIZADA
EN LA SANIDAD ESPAOLA
CIENCIA Y TECNOLOGA
1. Identificacin y validacin de biomarcadores.
Realizacin de estudios de asociacin 16
2. Universalizacin de la secuenciacin y genotipado 18
3. Anlisis bioinformtico de los marcadores genticos 20
4. Validacin clnica/mdica de los marcadores
para utilizar en medicina personalizada 21
5. Desarrollo y aplicacin de tecnologa para la determinacin
de biomarcadores 25
PROFESIONALES Y AUTORIDADES SANITARIAS
6. Formacin de profesionales sanitarios en medicina personalizada
en base a marcadores genticos 27
7. Anlisis de datos genmicos en los hospitales/centros
de atencin primaria 30
8. Estandarizacin de los requerimientos
de los Comits de tica de la Investigacin 31
9. Registro de pacientes genotipados y de su respuesta teraputica 32
10. EMR (Electronic Medical Records) 33
11. Anlisis coste-beneficio 35
REGLAMENTACION Y EXPLOTACIN COMERCIAL
12. Autorizacin de comercializacin y publicidad sobre productos diagnsticos 39
13. Criterios uniformes para evaluacin de proyectos de investigacin,
de actuacin y coordinacin 40
14. Biobancos. Acceso a muestras 41
15. Traslado y explotacin del conocimiento
desde el rea acadmica a la industria 43
37
27
16
10
7
PACIENTES Y EDUCACIN A LA SOCIEDAD
16. Educacin a la sociedad 46
17. Asociaciones de pacientes 47
18. Medios de comunicacin 49
ASPECTOS TICOS, LEGALES Y SOCIALES
19. Consentimiento informado 51
20. Proteccin de la intimidad y los datos genticos 53
21. No discriminacin/no estigmatizacin 55
22. Garantas de acceso equitativo a nuevos diagnsticos
y terapias en todo el territorio 56
23. Proteccin de los consumidores 57
CONCLUSIONES
ABREVIATURAS
GLOSARIO
64
63
59
51
46
Farmacogenmica: Medicina Personalizada y Predictiva 77
Resumen ejecutivo
Los requisitos de seguridad y eficacia que debe cumplir un frmaco para ser aproba-
do son muy estrictos, siendo necesaria la realizacin de ensayos clnicos que permi-
tan recoger datos referentes a su absorcin, distribucin, metabolismo y excrecin,
establecer la eficacia para una indicacin determinada, as como demostrar su perfil
de seguridad. Sin embargo, es sabido que la respuesta a los frmacos no siempre
es la esperada. Aunque en la mayor parte de los casos como consecuencia de la ad-
ministracin de un determinado frmaco se produce el efecto teraputico deseado,
la eficacia media de un frmaco se encuentra en el 50% existiendo un 25-75% de
casos (en funcin de la patologa) en los que este efecto no se produce, conducien-
do a lo que se denomina fracaso teraputico.
Ms grave es la aparicin de reacciones adversas medicamentosas, como hepatoto-
xicidad, nefrotoxicidad o cardiotoxicidad, que son responsables de ms de un 3%
de las hospitalizaciones que se producen en los pases desarrollados. De hecho, en
ocasiones es necesario retirar del mercado frmacos que haban pasado satisfacto-
riamente los ensayos clnicos, debido a la aparicin de estos efectos adversos. En
concreto, entre los aos 1961 y 1992 se retiraron ms de 131 frmacos del merca-
do, debido a efectos adversos inesperados. Otro dato a tener en cuenta en el desarro-
llo de frmacos es que el 81% de los frmacos que acceden a ensayos clnicos deben
ser retirados por problemas de eficacia y toxicidad, con el enorme gasto que esto
conlleva.
Estos hechos, que se relacionan con una mala calidad asistencial y con gastos inne-
cesarios, se deben a que la respuesta a los frmacos es un proceso de enorme com-
plejidad. Tras la administracin de un frmaco este se distribuye por el organismo,
es metabolizado por distintas enzimas e interacta con un gran nmero de prote-
nas. Los eventos que afectan al metabolismo global de frmacos son aquellos que
determinan su farmacocintica y su farmacodinmica. En la farmacocintica inter-
vienen una gran cantidad de mecanismos moleculares complejos relacionados con la
absorcin, distribucin, metabolismo y excrecin del frmaco, y en la farmacodin-
mica los relacionados con receptores, canales inicos, enzimas y sistema inmune.
En la actualidad la dosis de un frmaco se ajusta en funcin del peso, edad y fun-
cin renal y heptica. Sin embargo, dos individuos que presenten los mismos valo-
res para estos parmetros pueden presentar diferencias en los genes que codifican
para las protenas implicadas en el metabolismo de dicho medicamento, de modo
que responda de manera diferente frente a su administracin. Por ejemplo, en el
caso de las enzimas encargadas de degradar determinados frmacos a formas inac-
tivas existen variantes que son ms efectivas que en la poblacin normal, por lo que
degradarn ms rpido el frmaco en cuestin y la dosis estndar no ser suficien-
te. Existen otras variantes que, por el contrario, son menos activas, de modo que
las personas que las portan no pueden degradar de manera eficaz el frmaco, y una
dosis estndar ser excesiva, pudiendo llegar a ser txica. Igual puede ocurrir con
enzimas que son capaces de convertir un determinado frmaco de formas inactivas
a activas, a formas txicas, etc. Otros genes donde las variaciones en la secuencia
pueden relacionarse con falta de eficacia o toxicidad son los que codifican para re-
ceptores, transportadores, o distintos componentes de cascadas de sealizacin.
8 Genoma Espaa
Los estudios genticos nos ofrecen la posibilidad de asociar una variacin gentica
con la capacidad de respuesta de un paciente a un determinado medicamento, lo
cual permitira administrar a un paciente determinado el rango de dosis adecuado
en funcin de la eficacia y toxicidad del frmaco, pudiendo evitar efectos adversos o
falta de eficacia.
Por otra parte, muchos de los tratamientos se aplican mediante estrategias terapu-
ticas de ensayo y error. En primer lugar se aplica un frmaco de primera lnea y, en
caso de que este no funcione, se pasa a un segundo frmaco. Esto puede dar lugar a
una prdida de tiempo en caso de que el primer tratamiento no sea eficaz que, en
algunos pacientes como los psiquitricos, resulta muy importante, ya que la ausen-
cia de tratamiento adecuado puede tener efectos graves. Un ejemplo es la esquizo-
frenia, en la que un 10-20% de los pacientes tratados con antipsicticos no respon-
den inicialmente al tratamiento y, de los que responden, algunos pueden sufrir
recadas o incluso desarrollar efectos adversos que llevan al abandono del tratamien-
to. Durante el tiempo que se tarda en encontrar el tratamiento adecuado los pacien-
tes no solo sufren los sntomas de la enfermedad sino incluso efectos adversos.
En pacientes oncolgicos los efectos adversos de los frmacos empleados son im-
portantes, con un margen de dosis muy estrecho. En este caso sera de gran inte-
rs identificar previamente a aquellos pacientes que no respondern de manera
adecuada, con el fin de utilizar otros tratamientos, y aquellos cuyo metabolismo
permitir aceptar dosis ms elevadas, ya que existe una relacin directa entre la
dosis y la eficacia.
La inquietud por conocer los efectos que tienen las variaciones en los genes sobre
la respuesta a los frmacos no es algo reciente. Esto ha dado lugar al nacimiento
de la farmacogentica. Existen distintas definiciones para esta disciplina, que podra
entenderse como aquella rama de la farmacologa orientada al estudio de los aspec-
tos genticos relacionados con la variabilidad de la respuesta a frmacos en indivi-
duos o poblaciones.
Por su parte la farmacogenmica se puede entender como el estudio del total de los
genes relacionados con el metabolismo de frmacos, as como de la forma en que
dichos genes manifiestan sus variaciones y de qu manera estas pueden interactuar
para configurar el fenotipo de cada individuo en lo que afecta a la respuesta a me-
dicamentos.
Los enormes avances tcnicos ocurridos en materia de secuenciacin no solo han
permitido que el proyecto Genoma Humano se concluyese antes de lo esperado,
sino que, adems, llevase unido un enorme abaratamiento de los costes. Si secuen-
ciar el primer genoma humano cost cerca de 3.000 millones de dlares y varios
aos, en 2007 secuenciar el genoma de James Watson cost algo ms de un milln
de dlares y solo unos meses, y se trabaja en la actualidad para conseguir la se-
cuenciacin de un genoma completo por menos de 1.000 $, en un tiempo de pocos
minutos.
El desarrollo de la farmacogenmica permitir aplicaciones como individualizacin
del tratamiento en base a criterios de eficacia y toxicidad, reutilizacin de frmacos
rechazados por sus efectos txicos, mejora del diseo de ensayos clnicos mediante
Farmacogenmica: Medicina Personalizada y Predictiva 9
una mejor seleccin de pacientes y, en definitiva, un mejor conocimiento de la en-
fermedad a travs de la identificacin de subtipos genticos y descubrimiento de
nuevas dianas. Su aplicacin en el sistema sanitario contribuir a mejorar la calidad
asistencial y previsiblemente a una reduccin en los costes a medio o largo plazo.
Para su implantacin ser necesario contar con la participacin de todos los agentes
implicados en la cadena de valor del sector sanitario. Dentro de dicha cadena se in-
cluyen agentes reguladores (principalmente agencias reguladoras encargadas de la
aprobacin de nuevos medicamentos, como EMEA y FDA), industria farmacutica y
biotecnolgica, proveedores de servicios de asistencia sanitaria y prescriptores (en-
cargados de proporcionar las pruebas diagnsticas y tratamientos), proveedores de
tecnologa (aquellas empresas cuya tecnologa es imprescindible para su desarrollo,
como seran por ejemplo las empresas de bioinformtica), aseguradoras (pblicas y
privadas) y, finalmente, pacientes.
El objetivo del presente estudio es elaborar una hoja de ruta para la implantacin
de la farmacogenmica en la sanidad espaola. Para ello, con la colaboracin de ex-
pertos en las disciplinas relacionadas, se ha establecido un posible escenario para el
ao 2020 y se han identificado los temas clave para alcanzarlo, junto con las capa-
cidades y las barreras de tipo no tecnolgico que existen y las medidas que permiti-
rn potenciar las capacidades y superar las barreras.
Farmacogenmica y Medicina Personalizada
en la Sanidad Espaola
Los avances de la medicina y el desarrollo de frmacos en el incipiente siglo XXI
han permitido mejorar la calidad de vida de muchos pacientes afectados por enfer-
medades crnicas y agudas, e incluso algunos tratamientos han conducido a un au-
mento de varios aos de la esperanza de vida en Espaa. Segn las Tablas de Mor-
talidad de Espaa en el perodo 1992-2005, publicados por el Instituto Nacional de
Estadstica en 2007, la esperanza de vida al nacimiento en nuestro pas en 2005 fue
de 80,23 aos, 1,4 aos por encima de la media europea, y ms de dos aos supe-
rior a la cifra en 1995. Adems, de estos datos se deduce que las mejoras en la ca-
lidad y esperanza de vida se producen a edades avanzadas, en particular, desde
1981 la esperanza de vida de las mujeres y varones de 65 aos se ha incrementado
en 3,2 y 2,4 aos respectivamente
1
.
Este aumento de la esperanza de vida, unido al descenso de las tasas de fecundi-
dad, ha conducido a un envejecimiento progresivo de la poblacin, lo cual trae apa-
rejado el aumento de la incidencia de enfermedades crnicas, degenerativas o inca-
pacitantes, menos frecuentes hace algunos aos. Si a principios del siglo XX la
principal causa de mortalidad eran las enfermedades infecciosas, ya desde 1980 las
enfermedades del aparato circulatorio permanecen como primera causa, aunque el
porcentaje que representan estas enfermedades (por ejemplo, ictus o enfermeda-
des coronarias) ha descendido desde dicho ao, pasando de un 45,8% a un 34,1%
en 2002. La segunda y tercera causas de mortalidad fueron el cncer y las enfer-
medades del aparato respiratorio, con un notable incremento en estas estadsticas
de la enfermedad de Alzheimer y de complicaciones asociadas a la hipertensin. Es-
tos hechos hacen que si bien el tiempo de vida se alarga, la mejora en la calidad de
la misma no tiene por qu ser pareja, siendo necesario continuar con el desarrollo
de nuevos frmacos para estas patologas, as como mejorar la eficacia y seguridad
de los que ya existen.
Los frmacos que existen en la actualidad cumplen con requisitos muy estrictos en
trminos de seguridad y eficacia para su aprobacin, sin embargo es un hecho que
la respuesta de los pacientes a los mismos no siempre es la esperada. Aunque en la
mayor parte de los casos como consecuencia de la administracin de un determina-
do frmaco se produce el efecto teraputico deseado, en ciertos individuos la res-
puesta puede variar desde la falta de eficacia hasta la aparicin de efectos
adversos
2
. Existen estudios que muestran que en Estados Unidos las reacciones ad-
versas a medicamentos han causado (o contribuido a ello) entre el 6% y el 7% de
las hospitalizaciones
3
. De hecho, se han retirado del mercado aproximadamente un
4% de los nuevos medicamentos debido a reacciones adversas. Adems, se estima
10 Genoma Espaa
1
Instituto Nacional de Estadstica. Tablas de Mortalidad 1992-2005.
2
Roden, D. M.; Altman, R. B.; Benowitz, N. L.; Flockhart, D. A.; Giacomini, K. M.; Johnson, J. A.;
Krauss, R. M.; McLeod, H. L.; Ratain, M. J.; Relling, M. V.; Ring, H. Z.; Shuldiner, A. R.; Weinshil-
boum, R. M.; Weiss, S. T. (2006). Pharmacogenomics: challenges and opportunities. Ann Intern
Med, 21; 145(10): 749-57.
3
Ingelman-Sunderberg, M. (2008). Pharmacogenomic Biomarkers for Prediction of Severe Adver-
se Drug Reactions. N Engl. J. Med, 358, 637-639.
Farmacogenmica: Medicina Personalizada y Predictiva 11
que el 50% de los pacientes tratados con frmacos no responden a los mismos, con
el consiguiente coste para los sistemas sanitarios.
El fundamento de la variabilidad en la respuesta a los medicamentos se encuentra
en las variaciones genticas entre pacientes, en concreto, en los genes implicados
en el metabolismo de frmacos o en otros genes cuyas protenas codificadas inter-
accionan con la actividad del frmaco. De la inquietud por conocer el efecto que tie-
nen los genes en la respuesta a frmacos se encargan la farmacogenmica y la
farmacogentica, que fueron definidas por la Agencia Europea del Medicamento
(EMEA) en 2007. En concreto, la Farmacogenmica se define como la investiga-
cin de las variaciones del ADN y ARN en relacin con la respuesta a los frmacos,
y la Farmacogentica como una parte de la Farmacogenmica que estudia la in-
fluencia que tienen las variaciones en la secuencia del ADN sobre la respuesta a los
frmacos.
Es conocido que los factores genticos tienen un importante papel en gran cantidad
de enfermedades comunes y que la determinacin de estos tendra el potencial de
proporcionar informacin sobre patognesis o revelar nuevas dianas o estrategias
teraputicas. Asimismo, podran ser tiles como biomarcadores para diagnstico,
estratificacin de pacientes y categorizacin pronstica o teraputica
4
. Nace as el
concepto de medicina personalizada o a medida, entendida como la aplicacin del
conocimiento de las bases genticas de la enfermedad y de los mecanismos de res-
puesta a frmacos, al diagnstico y tratamiento de las enfermedades. La medicina
personalizada permite la administracin a cada individuo del medicamento adecua-
do para la patologa que padece, y en la dosis adecuada para salvaguardar la efica-
cia y seguridad del mismo.
Un posible escenario para 2020 es aquel en el que la prescripcin de frmacos evo-
lucione desde el diagnstico basado en sntomas y signos, a una prescripcin dirigi-
da y complementada con el perfil gentico individual. La posibilidad de asociar un
polimorfismo gentico con la capacidad de respuesta a un determinado medicamen-
to permitir determinar el tipo de metabolismo y riesgo de toxicidad o de fracaso
teraputico, diferenciando a cada paciente como individuo respondedor o no res-
pondedor por su perfil molecular. Esta determinacin previa permitir la eleccin
del frmaco adecuado y la dosis ptima, lo que supondr un ahorro de tiempo y re-
cursos econmicos, un cambio cualitativo y cuantitativo en el desarrollo y prevalen-
cia de las enfermedades y, en definitiva, una mejor asistencia sanitaria. Las reas
teraputicas de aplicacin incluiran oncologa, psiquiatra, enfermedades cardiovas-
culares, enfermedades inflamatorias crnicas y del sistema nervioso y diabetes, en-
tre otras.
La aplicacin de la farmacogenmica en el sistema sanitario podra contribuir a la
reduccin de costes totales a medio plazo, principalmente por la reduccin de los
costes asociados a la administracin de un frmaco o una dosis no adecuados. Sin
embargo, a corto plazo supondr un incremento del gasto sanitario debido a los
costes que implicar la realizacin de pruebas genticas previas al tratamiento. Te-
niendo en cuenta que el retorno social y econmico de la implantacin de la medici-
4
Kingsmore, S. F. et al. (2008). Genome-wide association studies: progress and potential for drug
discovery and development. Nature Reviews, 7, 221-230.
na personalizada se producir en un plazo medio, parece crtico disear una estra-
tegia de implantacin que consiga sus objetivos sin incurrir en grandes costes, que
podran poner en riesgo la conclusin satisfactoria de este proyecto.
El gasto sanitario en nuestro pas supone un importante porcentaje del PIB. La fi-
nanciacin de nuevas terapias o diagnsticos requiere su motivacin mediante estu-
dios que analicen el valor aportado por los medicamentos y/o tecnologas sanitarias
tanto desde la perspectiva individual (coste efectividad, coste-beneficio, etc.), como
global (eficiencia econmica, productividad marginal del gasto teraputico, etc.).
Precisamente el anlisis de coste-beneficio es una de las principales claves para lle-
var la farmacogenmica a la clnica. Las variables que permiten asegurar el uso de
un test concreto de farmacogenmica son:
Coste de la tecnologa.
Efectividad de la tecnologa (la asociacin entre genotipo y fenotipo clnico es
fuerte y la frecuencia de la variante allica es alta).
Morbilidad/mortalidad asociada a la enfermedad.
Coste del tratamiento de la enfermedad.
En la prctica clnica, las situaciones que permiten introducir un test farmacogen-
mico que cumpla con los parmetros de coste-beneficio son:
Enfermedades crnicas que requieren de una terapia larga.
Terapias que requieren de periodos largos de tiempo antes de poder evaluar la
eficacia del tratamiento.
Situaciones en que terapias inapropiadas pueden tener consecuencias irreversibles.
Tratamientos asociados a eventos adversos y como consecuencia alta morbilidad
potencial.
Tratamientos de coste elevado cuya eficacia pueda predecirse mediante un test
farmacogentico.
El primer escollo con el que se encuentra la farmacogenmica para su desembarco
en la prctica clnica es precisamente la efectividad de la tecnologa o validacin de
los marcadores genticos que permiten adaptar la intervencin teraputica de for-
ma individualizada en cada paciente. Ya en el ao 2002 se public un interesante
trabajo
5
que mostraba que de 166 asociaciones genotipo-fenotipo establecidas en
estudios cientficos y clnicos tan solo 6 haban podido ser replicadas consistente-
mente. El principal marcador gentico es el SNP (polimorfismo de un solo nucleti-
do en sus siglas en ingls), que se ha utilizado en mltiples estudios denominados
de asociacin, utilizando, en general, estrategias basadas en la seleccin de genes
candidatos. Los estudios de asociacin iniciales carecan en ocasiones de un diseo
adecuado y especialmente adolecan de defectos estadsticos, lo que origin pobres
resultados iniciales y falta de replicacin.
12 Genoma Espaa
5
Hirschhorn, J. N.; Lohmueller, K.; Byrne, E.; Hirschhorn, K. (2002). A comprehensive review of
genetic association studies. Genet Med, 4(2): 45-61.
Farmacogenmica: Medicina Personalizada y Predictiva 13
Actualmente, los estudios de asociacin con SNP de todo el genoma (GWA, Genome
Wide Association) con chips de muy alta densidad de SNP se estn demostrando bas-
tante eficaces para la identificacin de genes involucrados en enfermedades comple-
jas. En cualquier caso, la eficacia de los estudios de asociacin ha mejorado conside-
rablemente gracias a mejores diseos, a la eficacia de los servicios de genotipado, a
los mtodos estadsticos utilizados y al uso de grandes nmeros muestrales
6,7
.
En cualquier caso, la caracterizacin de SNP no es lo nico que permitir conocer la
variabilidad en la respuesta a frmacos, ya que existen factores de regulacin adi-
cionales como la epigentica, el silenciamiento de genes o la interferencia de RNA
que, en general, son factores de regulacin que se derivan de la interaccin del ge-
noma con el entorno, o incluso variaciones estructurales como variantes en nmero
de copias de un gen (CNV, en sus siglas en ingls), que deben ser exploradas. As,
por ejemplo, los CNV son responsables en gran medida de la variabilidad gentica
entre individuos
8
. El Proyecto Genoma Humano nos muestra que los seres humanos
poseemos un 99,9% de homologa entre nuestros genomas, si bien el estudio de
los CNV nos lleva a asegurar que las diferencias en la dotacin gentica son muy
superiores al 0,1%.
La farmacogenmica basada en el genotipo, es decir, mediante la utilizacin exclusi-
va de SNP, puede estar limitada en situaciones donde el entorno del paciente afecta
de manera significativa a la eficacia y toxicidad de medicamentos. En casos donde
mltiples genes contribuyen significativamente al fenotipo de la enfermedad habra
complicaciones adicionales, sobre todo de interpretacin de diferentes genotipos
que dan lugar a un mismo fenotipo y que en ltimo trmino afectan al cociente efi-
cacia/toxicidad de los frmacos a suministrar.
As pues, a lo largo de los ltimos aos se ha superado el concepto del SNP como
marcador universal para la farmacogenmica, y poco a poco van abrindose paso
otros marcadores genticos, proteicos y metablicos para aumentar la fiabilidad de
los test farmacogenmicos (por ejemplo, la concentracin de creatinina en suero
permite ajustar la dosis de muchas drogas). En la actualidad, la mayor parte de los
biomarcadores de respuesta a frmaco de uso habitual y aprobados por las agen-
cias reguladoras son a nivel de expresin, as como biomarcadores a nivel de va-
riantes en genes de enzimas metabolizadoras (y menos frecuentemente otros ge-
nes relacionados con el transporte o el mecanismo de accin).
Un ejemplo de esta integracin de marcadores, que podr constituir el camino por
el que discurra el futuro de la aplicacin clnica de la farmacogenmica, es la warfa-
rina (medicamento que evita la formacin de cogulos y trombos pero que, depen-
diendo del metabolismo del paciente, puede causar hemorragias graves). En este
sentido la FDA aprob un algoritmo de dosificacin de este frmaco en funcin de
parmetros genticos y no genticos.
6
The Wellcome Trust Case Control Consortium (2007). Genome-wide association study of 14,000
cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature, 447, 661-678.
7
Stephen F. Kingsmore, et al. (2008). Genome-wide association studies: progress and potential
for drug discovery and development. Nature Reviews Drug Discovery, 7, 221-230.
8
Estivill, X.; Armengol, L. (2007). Copy Number Variants and Common Disorders: Filling the Gaps
and Exploring Complexity in Genome-Wide Association Studies. PLoS Genetics, 3(10), 1787-99.
Por otra parte, se espera que el avance en el conocimiento de marcadores validados
permita la identificacin de aquellos que se relacionen con la predisposicin a pade-
cer ciertas enfermedades, por lo que, de manera casi paralela al desarrollo de test
farmacogenmicos, ser posible desarrollar test de prediccin de riesgo de padecer
ciertas enfermedades. La importancia de estos desarrollos radica en que el conoci-
miento previo del riesgo de padecer una enfermedad permitir realizar intervencio-
nes preventivas, que pueden incluir desde modificaciones de hbitos de vida o ali-
mentacin, que ayuden a la prevencin de ciertas patologas, hasta un seguimiento
clnico que permita adelantar el inicio de un tratamiento determinado. La medicina
preventiva es el ltimo paradigma en el cuidado de la salud, al fin y al cabo des-
pus de muchos aos de investigacin gentica y farmacogenmica es posible que
descubramos que el mayor impacto que podemos tener en la salud pblica ser de-
mostrar que el entorno (dieta, ejercicio, frmacos, etc.) es la mejor solucin coste-
beneficio a muchos de los problemas de salud y que por tanto sea el propio indivi-
duo, con el conocimiento de su genoma, el propio gestor de los riesgos asociados a
su salud. El avance en el conocimiento de los genes implicados en enfermedades
complejas, adems de una posible prediccin del riesgo, permitir subclasificarlas
de una manera ms etiopatognica, lo que permitir una mejora global en la perso-
nalizacin del tratamiento.
Parece claro, por tanto, que la medicina personalizada en estos momentos supone
una oportunidad que Espaa debe aprovechar, ya que si bien sus aplicaciones futu-
ras son prometedoras, el camino a recorrer an es largo. Es necesario avanzar en
mltiples aspectos, incluyendo el rea cientfico-tecnolgica, reglamentacin y ex-
plotacin comercial, aspectos sociales, profesionales sanitarios y de autoridades sa-
nitarias.
Partiendo de este documento, se han realizado reuniones con expertos de los cam-
pos relacionados con la farmacogenmica, con el fin de identificar aquellas reas en
las que se debe avanzar para conseguir la implantacin de la farmacogenmica en
nuestro pas. Fruto de estas reuniones se identificaron cinco reas:
Ciencia y Tecnologa.
Profesionales y Autoridades Sanitarias.
Reglamentacin y Explotacin Comercial.
Pacientes y Educacin a la Sociedad.
Aspectos ticos, Legales y Sociales.
Dentro de cada una de estas grandes reas se identificaron temas clave, y para
cada uno de ellos se recopilaron los estmulos que ayudarn a su consecucin y las
barreras que podran impedirla, as como las recomendaciones y medidas necesa-
rias para minimizar las barreras y potenciar los estmulos. A continuacin se recoge
y analiza el resultado de estas reuniones.
14 Genoma Espaa
Farmacogenmica: Medicina Personalizada y Predictiva 15
Tabla 1. reas de actuacin y temas clave en farmacogenmica.
1. Identificacin y validacin de biomarcadores.
Realizacin de estudios de asociacin.
2. Universalizacin de la secuenciacin y genotipado.
3. Anlisis bioinformtico de los marcadores genticos.
6. Formacin de profesionales sanitarios en medicina
personalizada en base a marcadores genticos.
12. Criterios uniformes para evaluacin de proyectos de
investigacin, de actuacin y coordinacin.
13. Biobancos. Acceso a muestras.
14. Autorizacin de comercializacin y publicidad sobre
productos diagnsticos.
15. Traslado y explotacin del conocimiento desde el
rea acadmica a la industria.
16. Educacin a la sociedad.
17. Asociaciones de pacientes.
18. Medios de comunicacin.
19. Consentimiento informado.
20. Proteccin de la intimidad y los datos genticos.
21. No discriminacin / no estigmatizacin.
22. Garantas de acceso equitativo a nuevos
diagnsticos y terapias en todo el territorio.
23. Proteccin de los consumidores.
7. Anlisis de datos genmicos
en los hospitales/atencin primaria.
8. Estandarizacin de los requerimientos de los
Comits de tica de la Investigacin.
9. Registro de pacientes genotipados y de su respuesta
teraputica.
10. EMR (Electronic Medical Records).
11. Anlisis coste-beneficio.
4. Validacin clnica/mdica de los marcadores para
utilizar en medicina personalizada.
5. Desarrollo y aplicacin de tecnologa para la
determinacin de biomarcadores.
REA 1
CIENCIA
Y TECNOLOGA
REA 2
PROFESIONALES
Y AUTORIDADES
SANITARIAS
REA 3
REGLAMENTACIN
Y EXPLOTACIN
COMERCIAL
REA 4
PACIENTES
Y EDUCACIN
A LA SOCIEDAD
REA 5
ASPECTOS
TICOS, LEGALES
Y SOCIALES
REAS DE ACTUACIN Y TEMAS CLAVE EN FARMACOGENMICA
Ciencia y tecnologa
En estos momentos es imprescindible avanzar en el rea cientfico-tecnolgica, de
modo que sea posible identificar qu variaciones genticas (polimorfismos) se asocian
con una determinada respuesta a un tratamiento farmacolgico, as como mejorar la
tecnologa necesaria para el desarrollo y aplicacin de la medicina personalizada.
16 Genoma Espaa
Tabla 2. Temas clave en el rea de ciencia y tecnologa.
1. Identificacin y validacin de biomarcadores.
Realizacin de estudios de asociacin
La respuesta a frmacos es un proceso complejo en el que intervienen gran canti-
dad de protenas codificadas por otros tantos genes. La implantacin de la farmaco-
genmica requerir el establecimiento de relaciones fenotipo-genotipo fiables, sien-
do esta cuestin de enorme importancia, ya que solo podrn usarse en la prctica
clnica los marcadores que se encuentren validados, quedando aquellos no valida-
dos relegados al mbito de la investigacin. Para alcanzar este objetivo sern nece-
sarias, entre otras, las siguientes cuestiones:
Contar con muestras bien caracterizadas fenotpicamente, mediante caracteriza-
cin clnica y vinculacin al historial mdico.
Identificacin de genes candidatos y de marcadores dentro de estos genes, tanto
para poblacin afectada como poblacin control.
Establecimiento de biobancos con criterios homogneos para la caracterizacin
fenotpica de las muestras procedentes de poblacin control y afectada.
Establecimiento de bases de datos de historial de respuesta al tratamiento bien
documentadas (tanto para reacciones adversas y efectos secundarios, como para
falta de respuesta).
Realizacin de estudios de asociacin de gran envergadura, bien diseados y co-
ordinados, que permitan asociar marcadores a fenotipos concretos.
El Proyecto 1.000 Genomas
9
, en el que participan las empresas Illumina, 454 Life
Sciences y Applied Biosystems, implicar la secuenciacin del genoma de al menos
1. Identificacin y validacin de biomarcadores.
Realizacin de estudios de asociacin.
2. Universalizacin de la secuenciacin y genotipado.
3. Anlisis bioinformtico de los marcadores genticos.
4. Validacin clnica/mdica de los marcadores
para utilizar en medicina personalizada.
5. Desarrollo y aplicacin de tecnologa
para la determinacin de biomarcadores.
REA 1
CIENCIA
Y TECNOLOGA
9
http://www.1000genomes.org/
TEMAS CLAVE EN EL REA DE CIENCIA Y TECNOLOGA
Farmacogenmica: Medicina Personalizada y Predictiva 17
1.000 personas de todo el mundo, con fondos de distintos pases y tiene como obje-
tivo producir un mapa del genoma humano que proporcione una visin de las varia-
ciones en el ADN relevantes en biomedicina. Parece, por tanto, que este evento de
crucial importancia se alcanzar en los prximos aos. Es importante sealar que la
repercusin de estos descubrimientos no ser solo en el mbito cientfico, sino tam-
bin en el mbito industrial. La identificacin de estos marcadores permitir profun-
dizar en el conocimiento de la respuesta a frmacos, descifrar mecanismos y encon-
trar nuevas dianas teraputicas, cuya aplicacin industrial ser tanto el desarrollo
de test de diagnstico como la mejora en el desarrollo de nuevos frmacos.
Los expertos sealan que el principal estmulo a este tema crtico vendr de la
mano de la realizacin de estudios de asociacin gentica de todo el genoma de
mbito multinacional. En la actualidad ya se han concluido numerosos estudios, con
poblaciones concretas y algunos multinacionales, cuyos resultados han sido publica-
dos. As, se ha asociado el SNP rs11610206 en el locus 12q13 con el riesgo de pa-
decer enfermedad de Alzheimer de aparicin tarda
10
, o el rs2241880-G del gen
ATG16L1, con enfermedad de Crohn
11
.
Por otra parte, se estn llevando a cabo estudios de expresin frmaco-protemi-
cos, que podrn vincularse a los estudios de asociacin. La informacin que aportan
estos estudios es muy valiosa ya que analizan la influencia de los frmacos en la
expresin de protenas, incluyendo modificaciones postraduccionales.
Adems, el desarrollo cientfico-tecnolgico impulsado por el proyecto Genoma Hu-
mano ha permitido avances tecnolgicos aprovechables para posteriores investiga-
ciones y ha sentado las bases que permiten continuar avanzando en esta rea.
Finalmente, un estmulo que resultar fundamental es la demanda clnica. La inclu-
sin de la farmacogenmica en el catlogo de prioridades mdicas ser un estmulo
fundamental para la promocin de la identificacin y validacin de biomarcadores.
Las barreras detectadas se refieren principalmente a aspectos metodolgicos, que
hacen que los datos que se obtienen no sean todo lo consistentes que debieran. Entre
algunas puede mencionarse la dificultad para obtener cohortes grandes que no se en-
cuentren sesgadas geogrfica o tnicamente y la dificultad para establecer fenotipos,
ya que, como se viene mencionando a lo largo del informe, tanto la respuesta a fr-
macos como la aparicin de enfermedades son fenmenos complejos, multifactoria-
les. Otra barrera importante es la dificultad de obtener grupos de control caracteriza-
dos fenotpicamente, que son imprescindibles para llevar a cabo este tipo de estudios.
Las recomendaciones de los expertos recogen la creacin de consorcios o comits
que dicten aquellos requisitos que debe reunir un marcador para ser validado cien-
tficamente y la identificacin de lderes clnicos capaces de transmitir la importan-
cia de la identificacin de marcadores, no solo desde el punto de vista cientfico,
10
The Wellcome Trust Case Control Consortium (2007). Genome-wide association study of 14,000
cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature, 447, 661-678.
11
Beecham (2009). Genome-wide association study implicates a chromosome 12 risk locus for
late-onset Alzheimer disease. Am J Hum Genet, 84, 35-43.
18 Genoma Espaa
sino como punto de partida indispensable para la aplicacin clnica de la farmacoge-
nmica. Por otra parte, ya que los avances vendrn de la mano de los GWA, es ne-
cesario potenciar las estructuras existentes que podran permitir su realizacin,
como es el caso del Centro Nacional de Genotipado, que en la actualidad tiene una
capacidad limitada para ejecutar este tipo de estudios de forma rpida (y barata),
sobre todo teniendo en cuenta los varios miles de muestras necesarias actualmente
en estos estudios.
ESTMULOS
Estudios GWA multinacionales.
Desarrollo tecnolgico.
Catlogo de prioridades mdicas.
Estudios de expresin frmaco-protemicos.
BARRERAS
Cohortes pequeas/sesgadas geogrfica y/o tnicamente.
Dificultad para establecer fenotipos.
Controles sin datos fenotpicos.
MEDIDAS/RECOMENDACIONES
Creacin de consorcios o comits con participacin de cientficos,
industria y agentes gubernamentales, que establezcan criterios de validacin.
Identificacin lderes clnicos que transmitan la importancia de la aplicacin
de los descubrimientos cientficos.
Potenciacin del Centro Nacional de Genotipado.
2. Universalizacin de la secuenciacin y genotipado
La obtencin de los datos genmicos se realiza en la actualidad mediante genotipado
o secuenciacin de un nmero limitado de puntos del genoma, en concreto SNP,
dado el elevado precio que tiene en estos momentos la secuenciacin de genomas
completos. En la actualidad, el uso de SNP es muy til dada su amplia distribucin,
aunque en el caso de enfermedades complejas, en las que la correlacin fenotipo-
genotipo es ms dbil, se ha logrado un xito ms moderado. Se ha propuesto la
utilizacin de SNP funcionales
12
para elevar significativamente la sensibilidad de los
test de asociacin, aunque quizs el reto ms importante sera el desarrollo de m-
todos que permitan la secuenciacin de genomas completos (todos los puntos del
genoma) por un coste asequible en un tiempo ms corto que el que hasta ahora se
requiere. La secuenciacin del genoma de James Watson en 2007 cost menos de
2.000.000 $ y dos meses. Recientemente una empresa estadounidense anunci la
secuenciacin de un genoma humano completo por 100.000 $ en un tiempo de se-
manas. El objetivo que se plantea es conseguir la secuenciacin de un genoma com-
pleto por un precio inferior a 1.000 $ en un tiempo de minutos, existiendo ya empre-
12
Aquellos que dan lugar a cambios en la funcin del gen en el que se encuentran.
Farmacogenmica: Medicina Personalizada y Predictiva 19
sas que afirman que en pocos aos sern capaces de hacerlo. Existen iniciativas que
buscan impulsar la consecucin de este objetivo, como el Instituto de Salud Esta-
dounidense (NIH en sus siglas en ingls), que financia el desarrollo de tecnologas
que abaraten y aceleren la secuenciacin.
La posibilidad de contar con la informacin gentica completa ser til no solo para
posibles intervenciones en el mbito mdico, sino que cada individuo dispondr de
una informacin extremadamente valiosa sobre predisposiciones fisiolgicas y/o pa-
tolgicas, con la posibilidad de potenciar y/o limitar respectivamente las mismas.
El principal estmulo identificado por los expertos para la universalizacin del ge-
notipado y la secuenciacin es la demanda de medicina personalizada y predictiva.
En el momento en que la demanda despegue, ser necesario contar con las herra-
mientas que permitan ofrecer este servicio de manera rutinaria en los hospitales o
centros de especialidades.
Las barreras detectadas por los expertos se refieren principalmente al elevado coste
de la tecnologa necesaria para realizar genotipado y secuenciacin de alto rendi-
miento, ya que se trata de tecnologa con un alto precio y turn-over que no resulta
asumible por la mayor parte de las empresas y hospitales, lo que implica que no
pueda utilizarse de manera rutinaria. Por otra parte, el apoyo institucional para el
desarrollo o compra de nueva tecnologa relacionada con la secuenciacin de alto
rendimiento hasta ahora ha sido muy limitado, a diferencia de lo que ocurre con
otras tecnologas para las que existen plataformas que prestan servicios a investiga-
dores e industria. No obstante, es necesario sealar el inters por parte del Ministe-
rio de Ciencia e Innovacin en la creacin de una plataforma de secuenciacin gen-
mica, el Laboratorio de Secuenciacin Genmica en Barcelona, al servicio de la
investigacin pblica y privada. Se trata de una plataforma de cooperacin interna-
cional cuyo objetivo inicial es integrarse dentro del Consorcio Internacional del Geno-
ma del Cncer (ICGC en sus siglas en ingls), cuyo objetivo es identificar en los pr-
ximos aos las alteraciones genmicas de los 50 tipos de cncer ms comunes.
La recomendacin de los expertos en esta rea crtica es evaluar la conveniencia
del uso de las plataformas de ultrasecuenciacin destinadas a la investigacin para
su uso clnico. En caso de que resultase positiva, constituira un impulso inicial muy
importante para la farmacogenmica en Espaa.
ESTMULOS
Demanda de medicina personalizada y predictiva.
BARRERAS
Coste de la tecnologa de secuenciacin de genomas completos.
Escaso apoyo institucional a la secuenciacin de alto rendimiento.
MEDIDAS/RECOMENDACIONES
Evaluar la conveniencia del uso de plataformas de ultrasecuenciacin,
inicialmente dirigidas a I+D, para su uso clnico.
20 Genoma Espaa
3. Anlisis bioinformtico
de los marcadores genticos
La cantidad de informacin que deber manejarse una vez que la secuenciacin de
genomas completos sea asequible ser de una magnitud enorme. Ser necesario
que esta informacin sea traducida al lenguaje mdico para poder ser aplicada.
Esta traduccin implica que a partir del genoma de una persona se pueda conocer
mejor de qu manera un paciente responder a un frmaco, qu frmacos y qu
dosis sern adecuados para tratar su patologa y, posiblemente, se podrn realizar
predicciones sobre el riesgo real de padecer ciertas enfermedades. Para conseguir
este objetivo, debern desarrollarse herramientas o algoritmos de prediccin en cl-
nica que permitan traducir los datos genticos obtenidos de un paciente mediante
la secuenciacin de su genoma, en resultados para que el especialista sanitario
pueda realizar su diagnstico y prescribir su tratamiento.
Es importante sealar que estas herramientas de prediccin a partir de datos genticos
sern de aplicacin no solo en clnica, sino que ser posible exportar el conocimiento a
otros campos con componente biolgico, unos ms cercanos como el desarrollo de fr-
macos, pero tambin campos ms alejados como agricultura y ganadera, alimentacin
o biocombustibles.
De nuevo, el principal estmulo identificado por los expertos en este campo est
relacionado con la demanda clnica de herramientas y soluciones. En concreto, con-
sideran que un estmulo fundamental es (ser) la necesidad de desarrollar y optimi-
zar algoritmos para diagnstico/pronstico que permitan la automatizacin del an-
lisis de datos, generando a partir de los datos genmicos informes comprensibles
y aplicables en el nivel clnico.
Las barreras principalmente se deben al tipo y volumen de datos de que se trata.
Son datos muy heterogneos, generados mediante diferentes tecnologas, no exis-
tiendo en este momento ni una base de datos de biomarcadores con datos europeos
integrados, ni posibilidades tcnicas para la integracin de los datos generados me-
diante distintas tecnologas. Adems, los sistemas de anlisis estn por detrs de la
tecnologa de generacin de datos. Finalmente, la falta de expertos es una barrera
muy importante a tener en cuenta.
Entre las recomendaciones de los expertos, cabe sealar la utilizacin de platafor-
mas ya existentes, como es el caso del Instituto Nacional de Bioinformtica (INB),
cuyo uso se podra potenciar para la prestacin de servicios clnicos. Otras medidas
incluiran la homogeneizacin de la toma de datos, con el fin de evitar la heterogenei-
dad de los existentes hasta ahora, as como la creacin de una red europea que inte-
gre los datos de farmacogenmica, semejante a la red creada por el NIH, denomina-
da the Pharmacogenetics Research Network (PGRN). Dentro de esta iniciativa se
incluye una base de datos denominada PharmGKB (www.pharmgkb.org), la cual es
un repositorio para datos genticos y genmicos, y de fenotipos moleculares y celula-
res e informacin clnica de personas que han participado en estudios de investigacin
farmacogenmicos. Incluye datos referentes a investigacin en enfermedades cardio-
vasculares, pulmonares y cncer, y de rutas metablicas y de transporte, entre otros.
Segn indican los expertos, sera interesante realizar una iniciativa de este tipo en
Europa, con datos de poblaciones europeas.
Farmacogenmica: Medicina Personalizada y Predictiva 21
4. Validacin clnica/mdica de los marcadores
para utilizar en medicina personalizada
Los marcadores genticos, adems de validarse cientficamente, deben validarse cl-
nicamente, es decir, debe demostrarse que su aplicacin en la prctica clnica es til
y que se trata de marcadores fiables. En el caso de enfermedades complejas, algu-
nos de los marcadores identificados solo tienen una pequea contribucin al fenoti-
po final, por lo que, aunque cumpliesen con estos criterios, su utilidad clnica o m-
dica podra ser muy limitada. Estos criterios idealmente podran ser establecidos por
sociedades mdicas auspiciadas por organismos pblicos o quizs un organismo su-
perior semejante a la Human Genetics Commission del Reino Unido. En Estados Uni-
dos se ha creado la iniciativa Biomarkers Consortium, una asociacin pblico-pri-
vada con participacin de agentes gubernamentales, industria, academia y
asociaciones de pacientes. Entre sus objetivos se encuentran la identificacin y vali-
dacin de nuevos biomarcadores con el fin de acelerar el desarrollo de nuevas tec-
nologas, medicinas y terapias para prevencin, deteccin temprana, diagnstico y
tratamiento de enfermedades.
FDA y EMEA han desarrollado un esquema conjunto de validacin de biomarcadores
donde se han definido la hoja de ruta de la validacin y las responsabilidades de los
equipos de revisin.
Es importante enfatizar en este punto que el objetivo es la validacin de un proto-
colo particular de farmacogenmica, no solo una asociacin entre un SNP y una res-
puesta a un frmaco. Estos estudios de validacin y regulados son generalmente
ensayos clnicos controlados randomizados (Randomized Controlled Trials) y, aun-
que permiten obtener las evidencias adecuadas entre el perfil gentico y la enfer-
medad, resultan costossimos, lo que limita su ejecucin.
ESTMULOS
Desarrollo de algoritmos y software especializado para diagnstico/pronstico
que permita la automatizacin del anlisis de datos.
BARRERAS
Falta de expertos.
Heterogeneidad de los datos existentes.
Falta de posibilidades tcnicas de integracin de los datos generados mediante
distintas tecnologas.
Desarrollo de tecnologa ms rpido que los sistemas de anlisis.
Falta de existencia de una base de datos de biomarcadores con datos europeos
integrados.
MEDIDAS/RECOMENDACIONES
Potenciar el INB para servicios clnicos.
Homogeneizacin de los criterios para toma de datos.
Creacin de una red europea que integre los datos de farmacogenmica
semejante a la creada por el NIH.
22 Genoma Espaa
En la actualidad se comercializan test que permiten detectar variantes de enzimas
implicadas en el metabolismo de frmacos, que ayudan a individualizar el trata-
miento de cada paciente, para reducir los efectos adversos y mejorar la eficacia. En
concreto, el AmpliChip