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Aislamiento e identificacin de diez cepas bacterianas desnitrificantes a partir de un suelo agrcola contaminado con abonos nitrogenados proveniente de una finca productora de cebolla en la Laguna de Tota, Boyac, Colombia Joaqun L. Benavides Lpez de Mesa 1 , Gladys M. Quintero 1 , Olga Luca Ostos Ortiz 2 1 Universidad de La Salle, 2 Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca Correspondencia: jbenavides@lasalle.edu.co Recibido: 13-10-06 / Aceptado: 17-11-06 Resumen Este articulo presenta los resultados de la versatilidad adaptativa y tolerancia de una consorcio bacteriano constituido por 10 cepas bacterianas endmicas de un suelo agrcola contaminado, proveniente de una finca productora de cebolla ubicada en la laguna de Tota en Aquitania, Boyac, Colombia, expuesto al uso incontro- lado de fertilizantes nitrogenados. La consorcio bacteriano aislado del suelo est conformado por: Bacillus megaterium, Bacillus licheniformis, Pseudomonas stutzeri, Acinetobacter sp, Propionibacterium sp, Peptoestreptococcus sp, Sthaphylococcus coagulasa negativa, Corynebacterium sp, Clostridium sp y Actinomyces sp. Se demostr que los microorganismos aislados tienen capacidad desnitrificante in vitro, transformando el nitrato a nitrgeno molecular. La consorcio bacteriano aislado se constituye en una alterna- tiva de biorremediacin para recuperar suelo agrcola contaminado con exceso de fertilizantes nitrogenados. Palabras Claves: agentes fertilizantes, amonio, biorremediacin, desnitrificacin, nitratos, urea. Abstract This article presents the results of the adaptative versatility and tolerance of a bacterial consortium made up of 10 bacterial stocks endemic to a contaminated soil coming from an onion farm located near Laguna de Tota, Aquitania, Boyac, Colombia. This soil has been exposed to the uncontrolled use of nitrogen rich fertilizers. The bacterial consortium from the soil is made up of Bacillus megaterium, Bacillus licheniformis, Pseudomonas stutzeri, Acinetobacter sp, Propionibacterium sp, Peptoestreptococcus sp, coagulasa negative sthaphylococci, Corynebacterium sp, Clostridium sp, and Actinomyces sp. It was demonstrated that the isolated microorganisms have in vitro denitrifying capabilities, thus transforming nitrates to molecular nitrogen. The isolated bacterial association constitutes a bioremediation alternative to recover the soil that has been contaminated by the excess of nitrogen rich fertilizers. Key words: ammonium, biodegradation, denitrification, fertility agents, nitrates, urea. ARTCULO PRODUCTO DE LA INVESTIGACIN 51 Introduccin La salinizacin de suelos es un problema universal y complejo que ocasiona un impacto ambiental negativo, el cual se ha incrementado con el pasar de los aos como consecuencia del uso indiscriminado de abonos, convir- tindose en una amenaza para la agricultura, la flora y fauna autctona (1). Las tcnicas de biorremediacin, constituyen una importante alternativa de solucin a la salinizacin de suelos, ya que permiten eliminar o inmovilizar contami- nantes, transformndolos o degradndolos a sustan- cias menos peligrosas o inocuas. Dichas tcnicas utili- zan microorganismos con capacidad para utilizar los contaminantes como fuente de energa o como aceptores y donadores de electrones dentro de la cadena respira- toria, mejorando as, la calidad y condiciones fsico-qu- micas del suelo, contribuyendo en el crecimiento, rendi- miento y calidad de las cosechas (2). De esta forma, la biorremediacin de suelos conta- minados por fertilizantes nitrogenados (gallinaza, urea), puede realizarse mediante la aplicacin y/o bioaumentacin de microorganismos desnitrificantes autctonos, que utilizan formas de nitrgeno inorgnico o amonio previamente reducido convirtindolo en sus- tancias gaseosas como N 2 O, NO y N 2 , los cuales son emitidos a la atmsfera (3). Las bacterias desnitrificantes son filogenticamente diversas y estn distribuidas ampliamente en ecosistemas acuticos y terrestres. El proceso de desnitrificacin ocurre en muchas especies de Eubacterias y en unas pocas Arqueobacterias. Las Proteobacterias, las Enterobacterias, son anaerobios facultativos, debido a que cambian el aceptor de electrones como el oxigeno por xidos de nitrgeno bajo condiciones anxicas. Otros estudios han demostrado que las bacterias desnitrificantes y fijadoras de nitrgeno se encuentran en la capa superfi- cial del suelo a una profundidad de 5 cm (4). El aislamiento de estos microorganismos se realiz en un medio de cultivo al que se le aadi nitrato potsico como aceptor de electrones, una fuente de carbono no fermentable como donador de electrones y sales minerales a fin de no seleccionar organismos fermentativos. El objetivo del estudio, fue aislar e identificar me- diante el uso de medios selectivos y pruebas bioqumicas convencionales, consorcios bacterianos desnitrificantes a partir de un suelo proveniente de una finca productora de cebolla cerca a la laguna de Tota (Boyac) contami- nado por exceso de fertilizantes (nitratos y amonio). Materiales y mtodos Toma de muestra de suelo La muestra de suelo fue trada de la finca Siempre Viva la cual se encuentra ubicada en el municipio de Aquitania (Boyac). Para la recoleccin del suelo se delimit un rea aproximada de 1500 m 2 dentro de la cual se tomaron muestras compuestas utilizando un muestreo aleatorio en zig-zag. Se removi la capa su- perficial presente y se excav hasta una profundidad de 20 cm. Las muestras fueron empacadas en 14 sacos (40 kilos). La seleccin de la muestra se bas en anli- sis fsico-qumicos previos confirmando altas concen- traciones de nitratos. Montaje ex situ La muestra fue trasladada a un invernadero construi- do en la Sede La Floresta de la Universidad de La Salle, donde se utiliz un rea total de terreno de 14m 2, de los cuales 6m 2 se emplearon
para la disposicin del suelo. Se realiz el montaje de 3 surcos problema (unidades expe- rimentales) y un control, cada surco de 52 cm de ancho, por 1,30 cm de largo, por 20 cm de profundidad; cada unidad experimental posea tres rplicas, el montaje con- t con un sistema de impermeabilizacin para la recolec- cin y manejo de lixiviados con el fin de evitar la contami- nacin del suelo problema, suelos aledaos y acuferos. Homogenizado de suelo De cada muestra de suelo secado y tamizado se pesaron 25 g. y se homogenizaron en 225 ml agua peptonada (0,85%), con cicloheximida (50 mg/ml) para inhibir el AISLAMIENTO E IDENTIFICACIN DE DIEZ CEPAS BACTERIANAS DESNITRIFICANTES A PARTIR DE UN SUELO AGRCOLA CONTAMINADO: 50-54 52 NOVA - PUBLICACIN CIENTFICA - ISSN: 1794-2470 VOL.4 No. 6 JUNIO - DICIEMBRE DE 2006:1-114 crecimiento fngico; se mantuvieron en agitacin a 120 rpm, por 30 minutos a temperatura ambiente (20 C). Conteo preliminar de clulas viables A partir del homogenizado se determin la concen- tracin inicial de bacterias viables hetertrofas y desnitrificantes de cada uno de los surcos mediante la tcnica de recuento por vertido en placa, previa prepa- racin de la muestra de suelo por homogenizacin y se- cado, segn protocolo. Recuento de desnitrificantes A partir del homogenizado se prepararon diluciones seriadas en base 10 en medio lquido mineral; (10 0 a 10 -7 ); de cada dilucin se inocul, por triplicado, 0,1 ml a pla- cas de petri. Luego se agregaron 20 ml de medio agar mineral mnimo fundido y mantenido a 45 0 C. Una vez solidificados los medios se llevaron a incubar a 37 0 C durante 48-96 horas, para obtener crecimiento de colo- nias. Para cuantificar las colonias se seleccionaron las diluciones que presentaron crecimiento entre 30 y 300 UFC, se realiz el clculo teniendo en cuenta el ttulo de la dilucin y la cantidad de inculo utilizado. Los resulta- dos se expresan en UFC/g de suelo. Aislamiento e identificacin de consorcios denitrificantes bacterianos nativos A partir del crecimiento obtenido en las placas de recuento de desnitrificantes y hetertrofos se realiz el aislamiento de los consorcios bacterianos nativos me- diante resiembra en medio de sales minerales. Los cul- tivos se manipularon en iguales condiciones de creci- miento a las descritas para los recuentos bacterianos y se realizaron las resiembras necesarias en medio slido hasta obtener cepas puras. Las cepas puras componen- tes de los consorcios nativos se resembraron en medios de cultivo de aislamiento primario bsicos y con el fin de obtener el crecimiento suficiente para su completa iden- tificacin y para mantenerlas viables. Los microorganismos aislados se determinaron segn los protocolos convencionales de identificacin: teniendo en cuenta las caractersticas macroscpicas de las colonias, la morfologa microscpica, por medio de la tincin de Gram y coloraciones especiales para cpsula, esporas e inclusiones citoplasmticas. Segn las caractersticas micro y macroscpicas de las colonias aisladas se procedi a la aplicacin de los protocolos convencionales y pruebas bioqumicas especiales para la identificacin de bacterias provenientes de suelo. Resultados Recuento Inicial de clulas viables:1.3 x 10 4 UFC/g. de suelo. Una vez se observ crecimiento a partir de los aislamientos positivos se procedi a realizar caracteri- zacin macro y microscpica de las colonias aisladas. El recuento promedio de UFC/g de suelo post-tratamiento fue de 6.3x 10 4 , el recuento promedio en el surco con- trol fue de 2,6x10 4 . Identificacin bioqumica. En la Tabla 1 se presentan los microorganismos aislados e identificados mediante pruebas bioqumicas. Tabla 1. Microorganismos aislados e identificados mediante pruebas bioqumicas. 53 La actividad desnitrificante (AD) del consorcio bacteriano, fue demostrada mediante anlisis fisicoqumicos observando mediante espectrofotometra, una disminucin significativa de nitratos en las Unida- des experimentales (p 0.05) en relacin al control des- pus de introducir el consorcio bacteriano, figura 1. Discusin El consorcio bacteriano identificado a partir del sue- lo problema estuvo compuesto por: Bacillus megaterium, Bacillus licheniformis, Pseudomonas sp, Acinetobacter sp, Propionibacterium, Clostridium sp, Actinomyces. Peptoestreptococcus, Sthaphylococcus coagulasa negativa, Corynebacterium. El recuento promedio de UFC/g de suelo post-trata- miento fue de 6.3x 10 4 y en el surco control fue de 2,6x10 4 . Utilizando todo el consorcio no se pudo determinar una concentracin bacteriana ptima para la desnitrificacin; por lo que se sugiere en futuros ensayos probar diferen- tes asociaciones bacterianas y diferentes concentracio- nes de las mismas. En cuanto al anlisis de los nitratos se observaron diferencias significativas entre las unidades experimentales y el control, mostrando que el consorcio bacteriano aislado llev a cabo el proceso de desnitrificacin de una manera efectiva. Numerosos estudios han reportado microorganismos como potentes desnitrificantes en suelo (3,5,6). Sin embargo, no existen reportes de trabajos utilizando consorcios bacterianos. En este trabajo se realiz la biorremediacin con un consorcio nativo de bacterias desnitrificantes, lo que permite combinar y complementar las funciones metablicas de diferentes microorganismos, para que colectivamente desnitrifiquen el suelo. Adicionalmente al estar en grupo las diferentes especies bacterianas pueden tolerar los cambios fsico-qumicos que se den en el ambiente durante el proceso de biorremediacin (3, 6, 7, 8). En la presente investigacin se aisl Pseudomonas stutzeri, la cual se encuentra ampliamente distribuida en la suelos y agua, y ha sido recuperada de humus, estircol, paja, aguas servidas, aguas estancadas, alimen- tos preparados para bebes, equipos hospitalarios, cos- mticos para los ojos, y diversos materiales clnicos. Esta especie ha sido reportada frecuentemente como desnitrificante del suelo (9). Tambin se aislaron diferentes microorganismos de la familia Bacillaceae, sus numerosas especies suelen ser mesfilas, aerobias o anaerobias facultativas, algu- nas de sus especies termfilas pueden desarrollarse tam- bin en los extremos de acidez y alcalinidad con pH entre 2-10, por lo que pueden recuperarse a partir de una variedad de nichos ecolgicos. Las diferentes es- pecies de Bacillus son de amplia distribucin, habitan suelos, agua y polvo ambiental. El gnero Bacillus, ha sido informado como desnitrificantes fuertes y rpidos, ya que convierten los nitratos a nitritos en 24 horas como es el caso de la especie Bacillus licheniformis (8). Otro de los gneros, pertenecientes a la familia Bacillaceae, el Clostridium, con especies anaerobias facultativos estrictas, comnmente encontradas en suelo tambin han sido informados como potentes biorremediadores, utilizados con frecuencia para degra- dacin de derivados de petrleo (10). En este trabajo se encontraron, haciendo parte del consorcio nativo, especies de Staphylococcus coagulasa negativa, las cuales estn ampliamente distribuidas en Figura 1. Anlisis estadstico para nitratos post-tratamiento con el consorcio bacteriano aislado. AISLAMIENTO E IDENTIFICACIN DE DIEZ CEPAS BACTERIANAS DESNITRIFICANTES A PARTIR DE UN SUELO AGRCOLA CONTAMINADO: 50-54 54 NOVA - PUBLICACIN CIENTFICA - ISSN: 1794-2470 VOL.4 No. 6 JUNIO - DICIEMBRE DE 2006:1-114 diferentes nichos ecolgicos y se caracterizan por su gran capacidad de tolerancia al medio ambiente (8). Tambin se encontraron especies de: Propioni- bacterium, que son bacilos Gram positivos, anaerobios facultativos, frecuentemente aislados de suelos, los cuales tambin utilizan el NO 3 - como aceptor de electrones; de Peptostreptococcus, cocos Gram positivos, de cre- cimiento lento en medios convencionales, no hemolticos, distribuidos en el medio ambiente. Otro gnero encontrado fue Corynebacterium, ba- cilos aerobios, Gram positivos, formadores de grnulos metacromticos, sus diferentes especies han sido repor- tadas con frecuencia aisladas de diferentes tipos de suelo (6,11). El Acinetobacter un bacilo Gram negativo, no fermentador de glucosa, distribuido ampliamente en el medio ambiente, en diferentes tipos de suelo y agua ha sido reportado como especie capaz de desnitrificar de manera lenta y dbil (12), tambin fue identificado en este estudio haciendo parte del consorcio nativo. Finalmente, otro de los microorganismos encontrados fue el gnero Actinomyces, bacilos filamentosos y ramificados, pleomorficos, Gram variables, de crecimien- to tpico en placas de agar, que tambin ha sido reportado en la literatura como microorganismo desnitrificante (12). Debido a que algunas especies comnmente identifi- cadas por PCR no fueron aisladas en nuestro estudio, se recomienda en futuros estudios utilizar tcnicas de biologa molecular para la identificacin de microorganismos difciles de recuperar por cultivo en placa o en medio lquido que aparecen en la literatura identificados y haciendo parte de la poblacin nativa de suelos contaminados (13). Agradecimientos Los autores agradecen a la Universidad de la Salle y a la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca por la financiacin de la investigacin, al Sr. Guillermo Lpez, propietario de la Finca Siempre Viva, y al Dr. Ricardo Montealegre Coordinador de Laboratorios Universidad de la Salle por su apoyo incondicional. Referencias 1. elen E, Akif M. Isolation and characterization of aerobic denitrifiers from agricultural soil. Turk Journal Biology 2003; 29: 9 -14. 2. Eweis J, Schroeder, E., Chang, D., Scow, K., Morton, R., and Caballero, R. Principios de Biorecuperacin. Tratamientos para la descontaminacin y regeneracin de suelos y aguas subterrneas mediante procesos biolgicos y fisicoqumicos. McGraw Hill. Espaa. 1999. p. 131-147. 3. Ri ch J, Hei chen P, Bot t oml ey J, Cromack J. Communi t y Composition and Functioning of Denitrifying Bacteria from Adj acent Meadow and Forest Soi l s. Appl i ed and Environmental Microbiology. 2003;69(10): 5974-82. 4. Rsh C, Mergel A, Bothe H. 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