Problemas de los temas de aminocidos y protenas.

1. Se practic una electroforesis sobre papel, a pH 6,0, de una mezcla de glicocola,

alanina, cido glutmico, lisina, arginina y serina.
a) Cul(es) de los compuestos se mueve hacia el nodo?.
b) Cul de ellos emigra hacia el ctodo?.
c) Cul de ellos permanece en, o cerca de, el origen?.

2. A una resina de intercambio aninico se le aade una mezcla de lisina, arginina, cido
asprtico, cido glutmico, tirosina y alanina, a pH elevado. Predecir el orden de elucin
de los aminocidos por tratamiento de la resina con disoluciones de pH sucesivamente
decrecientes.

3. La cromatografa monodimensional sobre papel de una mezcla de serina, alanina,
cido glutmico e isoleucina, se llevo a cabo con un sistema disolvente que contiene
n-butanol, agua y cido actico. Predecir las movilidades relativas de los aminocidos
en el sistema descrito indicando, en primer lugar, cul se espera sea el que se desplace
a mayor distancia del origen.

4. En qu direccin (es decir, hacia el nodo (A, +), hacia el ctodo (C, -) o en el
origen (O)) emigrarn las siguientes protenas en un campo elctrico al pH indicado?:
a) Ovoalbmina a pH 5.0.
b) !-lactoglobulina a pH 5.0 y 7.0.
c) Quimotripsingeno a pH 5.0 9.5 y 11.
pI para ovoalbmina 4.6; pI para beta-lactoglobulina 5.2; pI para
quimiotripsingeno 9.5.

5. A qu pH sera ms eficaz la electroforesis para la separacin de las siguientes
mezclas de protenas?:
a) Seroalbmina y hemoglobina (pI: 4.9 y 6.8).
b) Mioglobina y quimotripsingeno (pI: 7 y 9.5).
c) Ovoalbmina, seroalbmina y ureasa (pI 4.6, 4.9 y 5) .

6. Predecir la secuencia en que las protenas siguientes resultaran eludidas en una
columna de exclusin molecular, con un intervalo de fraccionamiento de protena de
5000 a 400000 daltons: mioglobina, catalasa, citocromo c, miosina, quimotripsingeno
y seroalbmina (pesos moleculares: 16900, 221600, 13370, 524800, 23240, 68500
daltons, respectivamente).

7. Cul ser el peso molecular de una protena desconocida, si los volmenes de
elucin del citocromo c, de la !-lactoglobulina, de la protena desconocida y de la
hemoglobina, en una columna de exclusin molecular como la descrita en el problema
anterior son:118, 58, 37 y 24 ml, respectivamente?. Supngase que todas las protenas
son esfricas y se hallan dentro del intervalo de fraccionamiento proteico de la columna.

8. a) Predgase la accin de la tripsina sobre los siguientes pptidos.
1)Lys-Asp-Gly-Ala-Ala-Glu-Ser-Gly.
2)Ala-Ala-His-Arg-Glu-Lys-Phe-Ile.
3)Tyr-Cys-Lys-Ala-Arg-Arg-Gly.
4)Phe-Ala-Glu-Ser-Ala-Gly.
b) Si cada uno de los fragmentos resultantes por digestin trptica se trata a
continuacin con 2,4-dinitrofluorobenceno, y luego se realiza la hidrlisis de los enlaces
peptdicos, cul o cuales seran los 2,4-dinitrofenil-aminocidos resultantes.

9. a) Escrbanse los pptidos formados cuando se trata con quimotripsina el siguiente
polipptido:
Val-Ala-Lys-Glu-Glu-Phe-Val-Met-Tyr-Cys-Glu-Trp-Met-Gly-Gly-Phe.
b) Supngase que los pptidos reaccionan posteriormente con bromuro de ciangeno;
hgase una lista de los productos obtenidos.

10. Predecir la direccin de la emigracin (es decir, estacionario (0), hacia el ctodo (C)
o hacia el nodo (A) de los siguientes pptidos, durante la electroforesis sobre papel a
pH 1.9 , 3.0 , 6.5 y 10.0:
a) Lys-Gly-Ala-Gly.
b) Lys-Gly-Ala-Glu.
c) His-Gly-Ala-Glu.
d) Glu-Gly-Ala-Glu.
e) Gln-Gly-Ala-Lys.

11. Si los cinco pptidos del problema 10 se encuentran presentes en una mezcla,
predgase el orden de elucin relativo de cada pptido en una columna de resina de
intercambio inico conteniendo Dowex-1 (intercambiador aninico) cuando la columna
se eluye con un sistema tampn cuyo pH experimenta un cambio continuo desde un
valor inicial de 10 hasta un valor final de 1.0.

12. Se obtuvieron los siguientes datos, acerca de la estructura de una cadena
polipeptdica. La hidrlisis total produjo Gly, Ala,Val
2
, Leu
2,
Ile, Cys
4,
Asp
2,
Glu
4,
Ser
2,

Tyr
2
. El tratamiento de la cadena con 2,4-dinitrofluorobenceno, seguido de hidrlisis
cida, rindi 2,4-dinitrofenil-glicina. El anlisis del grupo C-terminal dio aspartato. La
hidrlisis cida parcial proporcion los siguientes oligopptidos , entre otros:
Cys-Cys-Ala, Glu-Asp-Tyr, Glu-Glu-Cys, Glu-Leu-Glu, Cys-Asp, Tyr-Cys, Ser-Val-
Cys, Glu-Cys-Cys, Ser-Leu-Tyr, Leu-Tyr-Glu, Gly-Ile-Val-Glu-Glu. La escisin con
pepsina rindi un pptido que por hidrlisis dio Ser-Val-Cys y Ser-Leu. Formlese una
estructura que est de acuerdo con los datos anteriores.

13. Un pptido A, de composicin Lys, His, Asp, Glu
2
, Ala, Ile, Val y Tyr, produjo
2,4-dinitrofenilaspartato al efectuar el anlisis del resto N-terminal con 2,4-
dinitrofluorobenceno y valina libre como primer producto con la carboxipeptidasa. La
digestin de A con tripsina rindi dos pptidos. Uno de ellos contenia Lys, Asp, Glu,
Ala, y Tyr. El otro (His, Glu, Ile, Val) rindi 2,4-dinitrofenilhistidina al analizar el resto
N-terminal con 2,4-dinitrofluorobenceno. La escisin del ltimo con termolisina rindi
entre otros productos, histidina libre. A partir de A, se formaron tambin dos pptidos
quimotrpticos. Uno contena Asp, Ala, y Tyr y el otro contena Lys, His, Glu
2,
Ile y
Val. Dedzcase una estructura para el pptido A.

14. La hidrlisis cida de 1 mmol de un pentapptido hipottico rindi 2mmol de cido
glutmico, 1mmol de lisina, y no se recuper cuantitativamente ningn otro
aminocido. La tripsina escinde el pentapptido original en dos fragmentos. Por
electroforesis a pH 7.0 uno de los fragmentos trpticos se desplaza hacia el nodo, y el
otro hacia el ctodo. El tratamiento de uno de los fragmentos trpticos con DNFB,
seguido de hidrlisis cida, rinde cido DNF-glutmico. El tratamiento del pentapptido
original con quimotripsina origina dos dipptidos y cido glutmico libre. Propngase
una secuencia aminocida para el pentapptido que est de acuerdo con los datos
precedentes.

15. Un organismo de origen desconocido produce un potente inhibidor de la transmisin
nerviosa y queremos secuenciarlo. El anlisis de aminocidos muestra una composicin
de Ala5, Lys1, Phe1, El pptido intacto reacciona con DNFB y tras la hidrlisis cida
del mismo se obtiene DNF-alanina. La digestin con tripsina produce un tripptido y un
tetrapptido de composiciones Ala3. Phe1 y Lys1, Ala2. La reaccin del pptido
intacto con quimotripsina da un hexapptido y alanita libre. Cul es la secuencia del
inhibidor?.

16. Se ha aislado un octapptido a partir de un hongo raro que previene la calvicie y
estamos interesados en sus posibilidades comerciales. El anlisis de aminocidos da una
composicin: Lys2, Asp1, Tyr1, Phe1, Gly1, Ser1, Ala1. El pptido intacto reacciona
con DNFB y tras la hidrlisis cida del mismo se obtine DNF-alanina. La digestin con
tripsina da pptidos con la composicin: Lys1, Ala1, Ser1 y Gly1, Phe1, Lys1, ms un
dipptido. La reaccin con quimitripsina libera cido asprtico, un tetrapptido de
composicin: Lys1, Ser1, Phe1, Ala1 y un tripptido que libera DNF-glicina tras
reaccionar con DNFB seguido de hidrlisis cido. Cul es la secuencia del pptido
problema?.

17. Un abejorro sudamericano produce una sustancia que extrae el oro del agua marina,
y deseamos conocer su estructura para llevar a cabo su sntesis a gran escala. El anlisis
de aminocidos da una composicin: Lys1, Pro1, Arg1, Phe1, Ala1, Tyr1, Ser1. La
reaccin con DNFB no da ningn producto a no ser que el material se haga reaccionar
previamente con quimotripsina, en cuyo caso se obtiene DNF-serina y DNF-lisina a
partir de los pptidos obtenidos, cuya composicin es Ala1,Tyr1, Ser1 y Pro1, Phe1,
Lys1,Arg1. La reaccin con tripsina tambin produce dos pptidos de composiciones
Arg, Pro y Phe, Tyr, Lys, Ser, Ala. Cul es la estructura del pptido y su secuencia?.