A eletroforese uma tcnica fundamental no estudo de protenas e cidos
nuclicos, ela se baseia no comportamento de molculas em um campo eltrico. A eletroforese foi proposta inicialmente por Ame Teselius em 1937 como um mtodo que permitia a visualizao de protenas de acordo com o comprimento dos fragmentos de aminocidos e cargas eltricas. Esta tcnica se mostrou extremamente simples e rpida, o que impulsionou seu aprimoramento e utilizao, atualmente, para identificar, separar e purificar partes de DNA. Tanto o DNA quanto o RNA so eletricamente carregados e possuem cargas negativas, devido aos grupos fosfato presente nas suas estruturas. Conclumos, portanto, que ao colocarmos fragmentos desses cidos nuclicos em um campo eltrico, eles migraro para o plo positivo do mesmo. Na eletroforese usa-se um suporte slido, geralmente um gel, que pode ser agarose ou poliacrilamida, dependendo do tamanho das molculas que se pretende analisar. A estrutura da poliacrilamida composta por poros menores, sendo por isso utilizada na separao e visualizao de protenas, enquanto a agarose possui poros maiores, sendo, portanto utilizada para a anlise dos cidos nuclicos. O processo envolve o endurecimento do gel (como acontece com a gelatina), que preparado entre placas de vidro com a criao de pequenos poos com o auxlio de um pente. O espao restante preenchido com algum lquido que seja bom condutor de eletricidade e aps esta etapa as amostras podem ser depositadas nos poos. Um dos poos deve conter uma amostra padro, cujas molculas possuam pesos conhecidos. Na eletroforese, acontece a separao e identificao das protenas e cidos nuclicos pelo seu peso molecular. Depois da deposio das amostras o sistema submetido a uma diferena de potencial eltrico e durante esse processo h uma corrida onde os fragmentos migram para o plo positivo da corrente saindo dos poos e penetrando no gel. Nesta corrida os fragmentos que possuem maior massa e tamanho migram mais lentamente, ao contrrio dos menores. Aps a separao das molculas pela corrente eltrica, o gel retirado para que seja possvel a visualizao das mesmas. Para isso, necessria a aplicao de um corante especial, como por exemplo, o brometo de etdio (EtBr) de frmula C 21 H 20 BrN 3. A eletroforese mais eficiente na determinao de fragmentos de DNA do que outras tcnicas como a centrifugao atravs de gradiente de concentrao, e largamente utilizada em testes de paternidade, a at mesmo na fabricao de vacinas e antibiticos quando combinada com outras tcnicas como, por exemplo, enzimas de restrio. Tambm possibilita agropecuria a criao de transgnicos, alm de ser utilizada no diagnstico de anemia falciforme, clonagem e engenharia gentica e diagnstico de variaes de vrus. No mundo forense a eletroforese pode ser usada na comparao de DNA do criminoso, encontrado no local do crime, com o DNA de um suspeito, o que em muitas situaes auxilia na soluo de casos difceis.