Syllabus - 240324208 Bioquimica Ambiental

FACULTAD DE INGENIERIAS Y ARQUITECTURA
ESCUELA ACADMICO PROFESIONAL DE INGENIERIA AMBIENTAL

BIOQUMICA AMBIENTAL Pgina 1

BIOQUMICA AMBIENTAL
SLABO

I. DATOS GENERALES

1.1 ASIGNATURA : BIOQUMICA AMBIENTAL
1.2 CDIGO : 24-208
1.3 PRE-REQUISITO : 24-201
1.4 HORAS SEMANALES : 4 HORAS

1.4.1 TEORA : 2 HORAS

1.4.2 PRCTICA : 2 HORAS
1.5 N DE CRDITOS : 3 CRDITOS
1.6 CICLO : IV CICLO
1.7 TIPO DE CURSO : OBLIGATORIO
1.8 DURACIN DEL CURSO : 18 SEMANAS EN TOTAL
1.9 CURSO REGULAR : 17 SEMANAS
1.10 EXAMEN SUSTITUTORIO : 1 SEMANA
1.11
DURACIN MODALIDAD
DISTANCIA
: 9 SEMANAS EN TOTAL
1.12 CURSO REGULAR : 8 SEMANAS
1.13 EXAMEN SUSTITUTORIO : 1 SEMANA

II. DESCRIPCIN DE LA ASIGNATURA:

La asignatura pretende que el estudiante tenga conocimientos sobre el
metabolismo de los seres vivos en relacin con el medio ambiente y los
principales problemas ambientales. Se estudiar la composicin qumica, los
ciclos biogeoqumicos y el flujo de materia y energa en la Bisfera. Se revisar la
multitud de sustancias qumicas (xenobiticos) dispersas en el medio ambiente y
la dinmica que presentan en los organismos.

En una segunda instancia, se proporciona a los alumnos las conexiones tericas
necesarias para poder estudiar los efectos de las diversas actividades humanas
sobre el medio ambiente y su control: se analizarn los efectos de los diversos
tipos de contaminantes a nivel bioqumico; el metabolismo y la biotransformacin
de los xenobiticos; la toxicidad de los contaminantes y la biorremediacin de la
contaminacin.

III. OBJETIVOS

Proporcionar desde el punto de vista bioqumico los conocimientos tericos y
prcticos necesarios para:
Identificar la dinmica y los efectos bioqumicos de los diversos contaminantes
en los organismos y el ambiente.
Reconocer el papel de los organismos en la transformacin de la materia y las
importantes aplicaciones que estos han tenido, tienen y tendrn en la
resolucin de problemas ambientales.
Aplicar los conocimientos de bioqumica a la solucin de problemas de
contaminacin ambiental



Fomentar en el estudiante el espritu de investigacin cientfica, desarrollando
bases analticas que lo enlacen con otras materias de su especialidad y carrera
profesional.

IV. METODOLOGA:

Modo Presencial
El profesor har la presentacin introductoria del curso y del Slabos
propiamente dicho, al comienzo del curso, enfatizando que promover la
investigacin y el dilogo constante con los alumnos para ayudar a que fijen y
profundicen mejor los conocimientos que vayan adquiriendo.

En todo momento resaltar la importancia de la necesidad de su participacin
espontnea en el curso y que no slo deben conocer sino, investigar los
diferente temas tratados.

En esencia, la asignatura se desarrollara con los siguientes lineamientos
metodolgicos:

a) El profesor del curso presentar en cada clase, el fundamento terico de los
diferentes temas, siguiendo el orden que se seala en el programa
analtico. Adems propiciar y estimular la intervencin de los alumnos en
la clase. Dejar temas para que los alumnos hagan investigacin sobre los
mismos, en diferentes niveles de complejidad.

b) La Universidad tiene a disposicin de los estudiantes separatas, guas de
prctica y otros materiales (para ser copiados) los que debern ser
resueltos por el alumno para que de esta manera investigue los alcances y
profundidad de los conocimientos adquiridos.

c) En caso que los alumnos encuentren dificultad para resolver cualquier
problema relacionado con la asignatura, podrn acudir a realizar la
respectiva consulta al profesor responsable.

d) Es requisito, que el alumno, en todos los Trabajos de Investigacin,
Prcticas, Monografas, Presentaciones, etc. haga uso intensivo de la
Tecnologa de la Informacin con nfasis en la Ofimtica para Ingenieros, la
misma que tiene incluida: Internet, Intranet y Correo Electrnico.

Modo a distancia
En este proceso, es indispensable que cuente usted con un nivel de lectura
comprensiva e interpretativa para lo cual se pone en su consideracin las
siguientes pautas:

a) Busque las condiciones ambientales ms propicias para el estudio, lo que le
facilitar su concentracin y su aprendizaje.

b) Haga un cronograma de estudio que deber cumplir en forma sistemtica.

c) Recuerde que debe interpretar con sus propias palabras los conceptos
presentados por el autor, esto le permitir una mayor comprensin del
tema.



d) Recurra a los glosarios que se encuentran al final de cada unidad didctica
as como al diccionario, ya que enriquecer su vocabulario y entender
claramente las ideas expresadas en el texto.

e) Resuelva todas las actividades: autoevaluacin, prcticas y ejercicios
propuestos.

f) Cuide la adecuada presentacin de sus trabajos, ya sea de fondo
(profundidad, exactitud y rigurosidad de sus respuestas) como de forma
(ortografa y orden).

V. EVALUACIN:

Modo Presencial

El reglamento vigente de la universidad exige la asistencia obligatoria a clases
y que el profesor pase lista de asistencia en cada clase que dicta, anotando las
inasistencias en el registro que le proporciona la Universidad. No podr
sobrepasarse el 30% de inasistencias justificadas a las horas lectivas tericas,
ni el 20% a las prcticas para tener derecho a evaluacin.

Dada la naturaleza del curso respecto a que imparte conocimientos pero
adems es de suma importancia la transmisin directa de la experiencia del
profesor y que los alumnos participen activamente en el aula, se reitera que es
de vital importancia la asistencia a clases.

La justificacin de las inasistencias slo ser aceptada con el informe que
pueda elevar, el Departamento de Bienestar Universitario, al profesor del curso
con copia al Encargado Acadmico de la Carrera.

Finalmente, debe quedar perfectamente entendido que slo cuando el alumno
asiste a clases, gana el derecho de ser evaluado y que en todo momento
estar presente la normatividad expresada en el reglamento de la Universidad.

La modalidad de Evaluacin ser la siguiente:

- Trabajo Acadmico (TA), El sistema de evaluacin permanente contempla
las siguientes modalidades de trabajo acadmico: Participacin en clase.
Prcticas calificadas. Seminarios de discusin. Trabajos de investigacin,
experimentacin u observacin. Trabajos de produccin. Elaboracin de
proyectos. Exposiciones. Trabajos de aplicacin. Resolucin de casos y
problemas.

- Examen Parcial (EP), que consiste de una evaluacin terico - prctico de
conocimiento y donde el alumno dar sus respuestas por escrito.

- Examen Final (EF), que consiste en la evaluacin terico - prctico de
conocimiento de todo el curso y donde el alumno dar sus respuestas por
escrito.

La ponderacin de notas que el profesor debe mantener es la siguiente:



DESCRIPCIN PONDERACIN
Examen parcial Peso 3
Examen final Peso 3
Trabajo acadmico Peso 4

- Examen Sustitutorio (ES), que consiste en la evaluacin terico - prctico
de conocimiento de todo el curso y donde el alumno dar sus respuestas
por escrito. La nota obtenida en el examen Sustitutorio, podr reemplazar
la nota ms baja que el alumno haya obtenido en su Primer examen
Parcial o en el Examen Final y de proceder el reemplazo, se recalcular la
nueva nota final.

En caso la nota del Examen Sustitutorio sea ms baja que la nota ms
baja del Primer Examen Parcial o del Examen final, no se reemplazar
ninguna de ellas, quedando el alumno con la nota obtenida hasta antes del
Examen Sustitutorio.

Las calificaciones de los exmenes se regirn por el sistema vigesimal. Para
aprobar una asignatura se requiere calificacin mnima de 11,00 puntos. Al
establecer el promedio final deber considerarse a favor del alumno el residuo
igual o superior a cinco dcimas (0,5) como un punto.

Modo a distancia

A continuacin se detallarn los criterios de evaluacin de esta asignatura:

a. Exmenes. Son evaluaciones que Ud. rendir en forma virtual, dichos
exmenes consisten en:

- Examen Parcial, consiste de una evaluacin terico - prctico de
conocimiento y donde el alumno dar sus respuestas por escrito.

- Examen Final, consiste en la evaluacin terico - prctico de conocimiento
de todo el curso y donde el alumno dar sus respuestas por escrito.

- Examen Sustitutorio, consiste en la evaluacin terico - prctico de
conocimiento de todo el curso y donde el alumno dar sus respuestas por
escrito. Usted solo podr acceder al examen sustitutorio sino ha sido
evaluado en el examen parcial o en el examen final o haya desaprobado
alguno de ellos. La nota obtenida en el examen Sustitutorio, podr
reemplazar la nota ms baja que el alumno haya obtenido en el Examen
Parcial o en el Examen Final, y de proceder el reemplazo, se recalcular la
nueva nota final.

En caso la nota del Examen Sustitutorio sea ms baja que las notas
obtenidas en el Examen Parcial o Examen Final, no se reemplazar
ninguna de ellas, quedando el alumno con el promedio obtenido antes del
Examen Sustitutorio.

A continuacin le sealamos la semana de estudios en la que sern evaluados
los exmenes:



EXAMEN SEMANA DE ESTUDIO
Examen parcial 4ta semana
Examen final 8va semana
Examen sustitutorio 18ava semana

Las calificaciones de los exmenes se regirn por el sistema vigesimal. Para
aprobar una asignatura se requiere calificacin mnima de 11.00 puntos. Al
establecer el promedio final deber considerarse a favor del alumno el residuo
igual o superior a cinco dcimas (0.5) como un punto.

Dada la naturaleza del curso, es muy importante que exista la participacin
activa del estudiante en su proceso de aprendizaje. Por ello, se tiene las
siguientes caractersticas:

Forma : Permanente.
Rubros :

Examen parcial. (35%)
Examen final. (35%)
Actividad Obligatoria Individual (30%)

b. Actividades Obligatorias (AO). Conforman los trabajos que se entregar
durante el desarrollo de la asignatura, y que complementaran la evaluacin
final del estudiante. Las actividades se realizaran de forma individual. El
detalle de las actividades lo encontrar en el aula virtual que usted podr
acceder a travs del campus virtual con su usuario y clave. Es importante
que Ud. visite cotidianamente el Foro del Aula Virtual para tener
conocimientos detallados de las actividades del curso, al mismo tiempo
visite desde su aula virtual, accediendo al espacio llamado Materiales del
curso, el espacio denominado actividades obligatorias en l encontrar la
Actividad o Actividades obligatorias que usted tendr que desarrollar. El
porcentaje de criterios evaluativos quedarn sealados en el Aula Virtual,
accediendo a Visualizar notas.

VI. CONTENIDO

SEMANA 01: Modalidad presencial Semana 01 Modalidad a distancia
INTRODUCCIN A LA BIOQUMICA AMBIENTAL
Introduccin. Definicin de la Bioqumica Ambiental y su relacin con otras
ciencias. Flujo de materia y energa en la biosfera: Principales organismos
implicados en los ciclos biogeoqumicos y en la biorremediacin: organismos
auttrofos y hetertrofos.

CICLOS BIOGEOQUMICOS
Ciclo del oxgeno. Produccin y consumo de oxgeno por los seres vivos:
fotosntesis y respiracin. Metabolismo energtico aerobio. Fosforilacin oxidativa
y sntesis de ATP.
Ciclo del carbono I. Relacin con el ciclo del oxgeno. Fijacin biolgica de CO
2
.
Fase lumnica de la fotosntesis. Ciclo de Calvin. Fotorrespiracin. Adaptaciones
fotosintticas: va C4.



Ciclo del carbono II. Ciclo del metano. Metangenos: ruta bioenergtica y ruta
biosintticas. Metilotrofos y metanotrofos.
Ciclo del nitrgeno. Fijacin biolgica del nitrgeno: complejo enzimtico
nitrogenasa. Nitrificacin. Reduccin de nitratos. Asimilacin del amonio y sntesis
de aminocidos. Amonificacin y desnitrificacin.
Ciclo del azufre y del fsforo. Bacterias del azufre. Reduccin desasimilatoria de
sulfatos. Reduccin asimilatoria. Ciclo del fsforo.
Ciclo del hierro. Reduccin bacteriana del hierro frrico. Bacterias oxidantes del
hierro. Oxidacin bacteriana de la pirita.

XENOBITICOS
Compuestos qumicos xenobiticos
Concepto de Xenobitico. Clasificaciones de xenobiticos. Contaminantes
orgnicos: plaguicidas y compuestos industriales. Contaminantes inorgnicos:
metales pesados y xidos.

Dispersin de los Xenobiticos en el ambiente
Atmsfera: Reacciones qumicas y fotoqumicas. Contaminantes atmosfricos:
xidos de carbono y efecto invernadero; xidos de azufre y lluvia cida; xidos de
nitrgeno y smog fotoqumico; clorofluorcarbonos y destruccin de la capa de
ozono.
Hidrsfera: Solubilidad de los gases en el agua. Contaminantes del agua: metales
pesados, hidrocarburos y bifenilo policlorados. Contaminacin de ros por materia
orgnica y eutrofizacin de lagos.
Litsfera: Componentes de los suelos: arcillas y sustancias hmicas.
Micronutrientes y micronutrientes: fertilizantes. Contaminantes del suelo:
insecticidas, herbicidas y fungicidas.

DINMICA DE LOS XENOBITICOS EN LOS ORGANISMOS
Absorcin: Rutas de exposicin a xenobiticos y vas de penetracin en los
organismos. Absorcin a travs de membranas biolgicas. Otras vas de
absorcin. Caractersticas qumicas de los xenobiticos que influyen en su
absorcin. Velocidad y extensin de la absorcin: biodisponibilidad.
Prctica Calificada

Distribucin: Distribucin de los xenobiticos en los organismos. Factores que
afectan a la distribucin y cintica. Interacciones ligando-protena. Receptores
celulares. Otros factores.
Eliminacin: Excrecin y eliminacin de xenobiticos y sus metabolitos. Efecto
del peso molecular, solubilidad y polaridad sobre la excrecin.

METABOLISMO DE LOS XENOBITICOS
Toxicologa: Fase cintica de los contaminantes. Metabolismo de xenobiticos:
reacciones de fase I y II. Fase dinmica: mecanismos de toxicidad de
contaminantes. Factores que modifican la toxicidad. Mecanismos generales de
resistencia a drogas y contaminantes.



BIOTRANSFORMACIN DE LOS XENOBITICOS
Biotransformacin en animales. Reacciones de fase I. Reacciones de oxidacin:
citocromos P
450
. Reacciones de reduccin e hidrlisis.
Biotransformacin en animales. Reacciones de fase II. Glucuronilacin.
Sulfonacin. Conjugacin con glutation. Acetilacin. Metilacin. Transferencia de
azufre.
Biotransformacin en plantas. Reacciones de formacin de glucsidos.
Glucosilacin de fenoles. Glucosilacin de herbicidas y fungicidas sistmicos:
aplicaciones.

SEMANA 09: Modalidad presencial

Examen Parcial
(*) El examen parcial Modalidad a distancia se tomar en la semana 04, revisar
cronograma.

TOXICIDAD DE LOS CONTAMINANTES
Contaminantes orgnicos
Contaminantes orgnicos I. Mecanismos moleculares de actuacin de plaguicidas
y su toxicidad. (Transmisin del impulso nervioso)
Contaminantes orgnicos II. Mecanismos de toxicidad de dioxinas y
dibenzofuranos policlorados, y de bifenilos policlorados (PCBs) y policromados
(PBBs). Otros contaminantes orgnicos.

Contaminantes inorgnicos
Contaminantes inorgnicos gaseosos. Monxido de carbono. xidos de azufre.
xidos de nitrgeno y nitritos. Ozono y smog fotoqumico. Fluoruros.
Radicales libres y especies reactivas de oxgeno. Generacin de especies
reactivas de oxgeno y radicales libres. Eliminacin de oxidantes y radicales libres.
Sistemas enzimticos de reparacin
Contaminacin por elementos y compuestos metlicos. Mecanismos generales de
toxicidad de metales. Efectos moleculares de los metales pesados y metaloides.
Mecanismos biolgicos de defensa.

Accin de contaminantes sobre el DNA.
Teratognesis, mutagnesis y carcinognesis. Tipos de mutaciones. Mutaciones
espontneas. Mutagnesis por radiaciones ionizantes y radiacin UV.
Mutagnesis por agentes qumicos. Mecanismos de reparacin del DNA.

BIORREMEDIACIN DE LA CONTAMINACIN
Biorremediacin por plantas.
Manipulacin gentica de plantas: aplicaciones ambientales.
Fitorremediacin de suelos contaminados.
Prctica Calificada



Biodegradacin microbiana de contaminantes I.
Biorremediacin de la contaminacin por petrleo. Degradacin microbiana de
hidrocarburos alifticos. Degradacin aerobia y anaerobia de hidrocarburos
aromticos.

Biodegradacin microbiana de contaminantes II.
Degradacin de insecticidas organoclorados: utilizacin de rutas cometablicas y
de bacterias recombinantes. Degradacin de herbicidas triaznicos. Tratamiento
microbiolgico de aguas contaminadas por metales: biosorcin, precipitacin
extracelular e interaccin con biomolculas.

EXPOSICIN DEL TRABAJO DE INVESTIGACIN

SEMANA 17: Modalidad Presencial

Examen Final
(*) El examen Final Modalidad a distancia se tomar en la semana 08, revisar
cronograma.

SEMANA 18:

Examen Sustitutorio
(*) El examen sustitutorio Modalidad a distancia se tomar en la semana 18,
revisar cronograma.

VII. BIBLIOGRAFA

1. Toxicologa Ambiental. Albert. Ed. Uteha (Noriega Editores). 1995
2. Introduction to Environmental Toxicology. Landis y Yu. Ed. Lewis Publishers.
1998
3. Brock. Biologa de los microorganismos. Madigan, Martinko, Parker. 2003
4. Microbiologa. Stanier y otros. Ed. Revert. 1991
5. Bioqumica de los Microorganismos. Pars y Jurez. Ed. Revert. 1997
6. Introduccin a la Microbiologa. Ingraham e Ingraham. Ed. Revert. 1998
7. Biologa Celular y Molecular. Lodish y otros. Ed. Panamericana. 2002
8. Biodegradacin y Biorremediacin. Alexander, M. Academia Press.1999
9. Ecologa Microbiana Ambiental. Atlas, R.M. & Bartha. R. 4 Edicin. Prentice
Hall. Madrid. 2001
10. Principios de Bioqumica. Lehninger, Cox y Nelson. Ed. Omega. 2001
11. Bioqumica. Mathews, van Holde y Ahern. Ed. Addison Wesley. 2002
12. Bioqumica. Rawn. Ed. McGraw-Hill Interamericana. 1989
13. Bioqumica. Stryer, Berg y Tymoczko. Ed. Revert. 1995
14. Microbiologa: Conceptos y Aplicaciones. Pelczar J, Chan, E.C.S. & Krieg, N.R.
1 Edicin. McGraw Hill. INC Mxico. 1993

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