SINTESIS TEORICA DEL CENTRO DE OPERACIONES DE LA CELULA EL NCLEO 2 UNIVERSIDAD AUTONOMA DEL CARMEN FACULTAD DE MEDICINA DES CI ENCI AS DE LA SALUD
TRABAJ O: SINTESIS TEORICA DE EL CENTRO DE OPERACIONES DE LA CELULA EL NCLEO
ACREDITAR LA ASIGNATURA DE: ESTRUCTURA Y FUNCION A NIVEL CELULAR
PRESENTA: -Garca Damas Diego Jos Guadalupe -Heredia Xtel Itzayana -Hidalgo Lpez Juan Alberto -Poot Pal Adriana Victoria -Rejn Aguilar Nallely del Socorro -Reyes Hernndez Carmen Sofa
DIRECTOR DE TRABAJ O: DAVID ALAN ESCAMILLA
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CONTENI DO UNIDAD 3. - EL CENTRO DE OPERACIONES DE LA CELULA EL NUCLEO
3.1. - Resumen 01 3.2. - Caractersticas del ncleo en interface 02 3.3. - La envoltura nuclear 05 3.4. Estructura y funciones de la cromatina 10 3.4.1. Heterocromatina 14 3.4.2. - Eucromatina 15 3.4.3. - Compactacin del ADN a cromosomas 16 3.4.4. Metilacin 17 3.5. - ADN 17 3.5.1. Replicacin 23 3.5.2. Factores de transcripcin 29 3.5.3. Reparacin del ADN 33 3.5.4. Topoisomerasa 36 3.5.6. Mutaciones del ADN 37 3.6. Cuerpos nucleares 44 3.6.1. Nuclolo sus regiones y sntesis de ribosomas 44 3.6.2. Los cuerpos de Cajal 45 3.6.3. - Los cuerpos de PML 46 3.7. La sntesis y degradacin de macromolculas 47 3.8. Discusin 50
Descripcin.
Contenido
Pgs.
I
4 3.1. Resumen El ncleo es la estructura ms destacada de la clula eucarionte, tanto por su morfologa como por sus funciones. Su tamao es variable (5 a 10 mm) al igual que su ubicacin siendo en la mayora de los tipos celulares central. El ncleo celular contiene la informacin gentica, junto con la maquinaria para la duplicacin del DNA y para la transcripcin y el procesamiento del RNA. El ncleo de una clula que no est dividindose, tambin llamada clula en interface, tiene diferentes componentes. El conjunto de genes de esos cromosomas se denomina genoma nuclear. La funcin del ncleo es mantener la integridad de esos genes y controlar las actividades celulares regulando la expresin gnica. Por ello se dice que el ncleo es el centro de control de la clula .La envoltura nuclear consiste en una doble membranas que tiene continuidad con el retculo endoplasmatico, la envoltura nuclear se caracteriza por tener una capa porosa, cuyo nmero y tamao depende del tipo celular, tambin le permite el transporte bidireccional de sustancias del ncleo al citoplasma. La cromatina es el material gentico que existe cuando las clulas no se estn dividiendo, durante la interface y son un complejo de nucleoprotenas que se encuentra disperso en la mayor parte del ncleo. La unidad estructural de la cromatina son los nucleosomas, contienen aproximadamente 165 pares de bases de ADN que se enrollan en una superhelice izquierda, de aproximadamente 2 vueltas alrededor de un octamero de histonas centrales es decir por octamero hay 2 copias de las siguientes histonas: H2A, H2B, H3 Y H4. La vida depende de la capacidad de las clulas para almacenar, recuperar y traducir las instrucciones genticas necesarias para generar y mantener un organismo vivo. Esta informacin hereditaria se pasa de una clula a sus hijas durante la divisin celular y, en los organismos multicelulares, de generacin en generacin a travs de las clulas germinales. Las instrucciones se almacenan dentro de toda clula viva en sus genes, los elementos portadores informacin que determinan las caractersticas de una especie en conjunto y de los individuos dentro de ella. El nuclolo es un sitio donde se sintetiza el RNA ribosmico, en este se produce el armado inicial de los ribosomas siendo de gran importancia para la sntesis de protenas. El nuclolo una estructura intranuclear no membranoso que rodea genes de RNA. 5 3.2. Caractersticas del ncleo en interface: El ncleo es una estructura esfrica u ovalada que en general corresponde al element ms prominente de la clula. La mayora de las clulas tiene un solo ncleo, aunque algunas clulas, como los eritrocitos maduros carecen de l, En cambio, las clulas musculares esquelticas y algunos otros tipos celulares tienen mltiples ncleos. El ncleo esta separado del citoplasma por una doble membrana denominada envoltura o membrana nuclear.(Gerard J.Tortora, Derrickson Bryan,2013, principios de anatoma y fisiologa, Editorial Medica Panamericana, Mxico D.F) El ncleo es la organela ms voluminosa de las clulas eucariontes y est rodeado por dos membranas; cada una de ellas es una bicapa fosfolipdica que contiene muchos tipos diferentes de protena. La membrana nuclear interna define el ncleo entre s. En muchas clulas la membrana nuclear externa se contina con el retculo endoplasmtico rugoso y el espacio entre las membranas externa e interna se contina con la luz del retculo endoplasmtico rugoso. (Lodish Harvey, Berk Arnold, 2002, Biologa Celular y Molecular, Editorial medica Panamericana, Estados Unidos)
Figura. 3.2.1-caracteristicas del ncleo El ncleo suele tener de 3 a 1 micras de dimetro, aunque puede tener 25 micras o ms en el ovulo y algunas celular ganglionares grandes. El ncleo suele ser nico, pero clulas como las parenquimatosas del hgado y las del musculo cardiaco pueden ser binucleadas, mientras que las clulas del musculo esqueltico y los osteoclastos son multinucleados. el volumen del ncleo guarda relacin con su contenido de cido desoxirribonucleico y, por lo tanto, el nmero de cromosomas; est comprobado que el volumen aumenta con las actividades sintticas de la clula. El ncleo contiene el material gentico de la clula y ejerce una influencia directa sobre las actividades metablicas del citoplasma. Es esencial para la vida de la clula; si se extirpa 6 experimentalmente, cesa la sntesis de protenas en el citoplasma y la clula muere rpidamente. (Leeson Roland, 1997, Histologa, Nueva editorial interamericana, Mxico D.F El ncleo celular contiene la informacin gentica, junto con la maquinaria para la duplicacin del DNA y para la transcripcin y el procesamiento del RNA. El ncleo de una clula que no est dividindose, tambin llamada clula en interfase, tiene diferentes componentes. (Ross Michael H., 2012, Histologa, Editorial Medica Panamericana, Estados Unidos.) Como ya hemos citado anteriormente, el ncleo tiene diferentes autores que citan opiniones distintas, pero que comparten ciertas caractersticas, algunos mencionan con exactitud su tamao, su composicin y que es el orgnulo mas grande de la clula, aunque en particular el siguiente autor menciono a groso modo una caracterstica del ncleo. El ncleo es el depsito de informacin de la clula. El ncleo suele ser el orgnulo ms destacado de la clula eucarionte, est rodeado por dos membranas concntricas que forman la envoltura nuclear, y contiene molculas de DNA; polmeros muy largos que codifican la informacin gentica del organismo. En el microscopio ptico, estas molculas de DNA gigantes son visibles como cromosomas individuales cuando se condensan mientras la clula se prepara para dividirse en dos clulas hijas. El DNA tambin almacena la informacin gentica de las clulas procariontes; estas clulas carecen de un ncleo definido, no porque no tengan DNA, sino porque no lo guardan en el interior de una envoltura nuclear separado del resto del contenido celular.
7 Fig. 3.2.2-nucleo en interfase El ncleo est constituido en gran parte por los cromosomas, las estructuras nucleares transportadoras de un daguerrotipo completo para todas las especies heredables y las caractersticas individuales de un animal.
El ncleo celular contiene la informacin gentica, junto con la maquinaria para la duplicacin del DNA y para la transcripcin y el procesamiento del RNA. El ncleo de una clula que no est dividindose, tambin llamada clula en interfase, tienen los componentes que siguen: La cromatina. Figura 3.2.3-interfase Es el material nuclear organizado en eurocromatina y heterocromatina. Contiene DNA asociado con una masa ms o menos igual de protenas nucleares diversas por ejemplo las histonas que son necesarias para la funcin del DNA. El nuclolo Es una regin pequea dentro del ncleo y contiene DNA en la forma de genes de RNA ribosmico activos desde el punto de vista trancripcional, RNA y protenas el nuclolo es el sitio donde ocurre la sntesis de del rRNA y contiene protenas reguladoras del ciclo celular.
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Envoltura nuclear Es el sistema de membranas que rodea el ncleo de la clula. Se compone de una membrana interna y otra externa que estn separadas por un espacio (la cisterna peri nuclear) y perforadas por los poros nucleares. La membrana externa de la envoltura nuclear es continua con la del retculo endoplasmatico rugoso RER y, con frecuencia, tiene ribosomas adosados. Fig. 3.2.4 -caractersticas de envoltura nuclear
El nucleoplasma Es todo el contenido nuclear que no es cromatina ni nuclolo, es el material encerrado por la envoltura nuclear con la exclusin de la cromatina y el nuclolo. (Ross Michael H., 2012, Histologa, Editorial Medica Panamericana, Estados Unidos.)
3.3. La envoltura nuclear LA MEMBRANA NUCLEAR El ncleo est rodeado por dos membranas concntricas, cada una compuesta por una bicapa de fosfolpidos que contienen diferentes tipos de protenas; ambas membranas constituyen la envoltura nuclear. Las dos membranas nucleares se funden en los puntos donde se insertan las estructuras de los 9 poros nucleares. Es decir, estos poros o canales, con apariencia de anillo, atraviesan las membranas nucleares y estn formadas por protenas especficas de dichos poros y sirven para el transporte regulado y especifico de micro y macromolculas, en ambas direcciones, entre el interior del ncleo y el citoplasma (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). La envoltura nuclear circunda el DNA y define el comportamiento nuclear. Esta formada por dos membranas concntricas. La membrana nuclear interna que contiene protenas que actan como sitios de unin para los cromosomas y para la lamina nuclear, una red de filamentos proteicos finamente entretejidos que delita la cara interna de la membrana y proporciona un sostn estructural para la envoltura nuclear. La composicin de la membrana externa tiene una semejanza cercana con la membrana del RE, con la que se continua (BRUCE, A. (2006). Introduccion a la Biologia Celular. Buenos Aires: Medica Panamericana). Recubriendo la cara interna de estas membranas y adosadas a ellas, se encuentra un cascaron lamina nuclear, formado por protenas estructurales o protenas de filamentos intermedios llamados lamins y protenas que se unen a ella. La lamina da soporte a las membranas. Esta estructura est formada por filamentos de lamin A,C y B que se entrecruzan formando una malla ortogonal que se adhiere a la superficie interna del ncleo (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). La lamina se pega a la membrana nuclear a traves de protenas integrales de la membrana interna (Emerina, LAP2b) que forman los siguientes complejos que se unen a la cromatina: lamin A-Emerina-BAF y lamin B-LAP2b-BAF respectivamente; y de lpidos poli-isoprenoloides que en forma covalente se unen a la regin C-terminal B que tiene un receptor localizado en la membrana interna (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). 10 Durante la divisin celular, la envoltura nuclear se fragmenta para permitir La Separacin de las copias del ADN en clulas hijas. De acuerdo con Beaudouin y Salina, en la profase temprana, la dineina se recluta a la envoltura nuclear, donde al interactuar con dinactina, se activa como motor y se transporta junto con otros componentes de la membrana, en direccin del extremo (-) de los microtubulos presentes en parte de la superficie nuclear y con los cuales interactan, es decir, en direccin de los cromosomas, lo que induce invagaciones de dicha envoltura, en la vecindad de estos y donde se observa la lmina contrada. Este hecho produce tensin en la superficie opuesta de la envoltura nuclear, hasta el punto en que se rompa la lmina, la membrana interna y el NPC, en el sitio de mxima tensin, formando perforaciones, y con lo cual la envoltura nuclear pierde totalmente su forma previa y esta es removida por el mismo proceso (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). La formacin de la envoltura nuclear al final de la mitosis, en la telofase. Es poco conocida, sin embargo, se sabe que Ran-GTP y la hidrolisis de GTP para la formacin de la envoltura nuclear durante la metafase la Ran se encuentra en el citoplasma, tal vez en forma de Ran-GDP que en la cromatina es transformada en Ran-GTP, en la telofase, por intermedio de RCCI, un factor que intercambia los nucletidos que es reclutado por Ran a estas fraccin (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). LOS POROS NUCLEARES: Los poros o canales insertos en las membranas nucleares estn formados por complejos proteicos, de al menos 400 protenas, llamadas Complejos de los Poros Nucleares (NPCs) con peso molecular de 125MDa, la longitud del canal es de 65nm, su dimetro externo es de 133nm, y su entrada es de 42nm. El numero de poros nucleares que tiene un ncleo, en promedio, es de 3000- 4000, pero esta cantidad depende en buena medida de la actividad de transcripcin del ncleo (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). 11 En eucariontes, el NPC est formado por ms de 30 diferentes protenas, llamadas nucleoporinas. Las nucleoporinas o subunidades del canal, estn estructuradas en columnas que forman las paredes de un canal octagonal(ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). LA IMPORTACION DE MACROMOLECULAS: Como ya mencionamos, estos factores de transporte tienen interacciones especificas con algunas nucleoporinas. Estas protenas contienen repetidos de fenilalanina-glicina (Fen-Gil) que es un sitio de reconocimiento para el receptor trasportador (importinas o exportinas) asociado a su carga. La mayora de estas protenas no fijan el receptor al canal, por el contrario, tienen interaccionesdebiles; lo que les permite moverse de un lado a otro del mismo. Se estima que en el interior de un canal existen ms de 1000 copias de estos repetidos de Fen-Gil (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). Los receptores transportadores identifican sus sustratos por reconocimiento de seales especficas presentes en las macromolculas transportadas. Estas molculas, como resultado de su transporte, se acumulan a un lado a otro de la membrana nuclear, por lo que este proceso ocurre en contra de un gradiente qumico, lo que aparentemente requiere de consumo de energa (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). El transporte nucleocitoplasmatico es dirigido por varias clases de receptores transportadores solubles que interaccionan, en forma especfica, con el NPC y con la molcula o complejo transportado (carga). Una clase de de ellos, es la familia de importinas y exportinas o karioferinas; estas participan en la mayora del transporte nuclear. Por el momento se conocen nueve importinas y cinco exportinas, y cada una reconoce diferente seal de transporte. En relacin con la importacin de protenas del citoplasma al ncleo, esta se realiza a travs de la formacin del complejo: ranGTP-beta-importina--importina-proteina de importacin (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). 12 LA EXPORTACION DE MACROMOLECULAS: Las exportinas, entre las que destacan su receptor CRM1, requieren de su unin con la ranGTP para favorecer la interaccin con su carga, este receptor es una de las exportinas ms verstiles, facilita la salida de diferentes protenas: reguladores del ciclo celular, factores de transcripcin, protenas que unen ARN y otras varias. El transporte de los sustratos, por exportar, es dependiente de la seal de exportacin nuclear (NES), la que es rica en leucinas y contienen los sustratos transportados. Hay varias de estas seales que inducen una exportacin rpida desde el ncleo (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). Para exportar U ARNsn es necesario el reconocimiento de la estructura, el casquete, la 7-methyl guanosina del ARN, por medio del complejo de unin del casquete nuclear (CBC) y de la accin de la protena adaptadora fosforilada. PHAX sirve de puente entre el CBC-U snARN y CRM1-RanGTP (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). La exportacin del ARNr como unidades ribosomales, una carga compleja, se ensamblan en el ncleo a partir del ARNrs de 25,5.8 y 18s y alrededor de 80 protenas ribosomales que forman las subunidades de ribonucleoproteinas de 60 y 40S, respectivamente (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). El transporte nucleocitoplasmatico del ARNt se lleva a cabo, al menos en un 80%, por medio de la exportina-t/Los1p que pertenece a la familia de importina_/karioferina. La exportina-t, sin necesidad de una protena adaptadora, se une directamente al ARNt y como todas las karioferinas se une a su carga y RanGTP en forma cooperativa (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). El transporte nucleocitoplasmatico del ARNm requiere que los distintos procesos nucleares de transcripcin, procesamiento del ARN premensajero y su transporte al citoplasma, se lleva a cabo de una forma secuencial y 13 coordinada con el fin de aumentar las secuencias de cada paso y evitar o minimizar posibles errores. Para que esto ocurra se requiere de una interrelacin entre cada uno de estos diferentes procesos.(ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). 3.4. Estructura y funciones de la cromatina
La Cromatina es el material gentico que existe cuando las clulas no se estn dividiendo, durante la interface y son un complejo de nucleoprotenas que se encuentra disperso en la mayor parte del ncleo. (Lodish,Berk,Matsudaira,Kaiser Krieger,Scott,Zipursky & Darnell. (2012). Biologa Celular y Molecular. Estados Unidos: Medica Panamericana). En las clulas eucariontes buena parte del volumen del ncleo esta ocupado por el genoma, el cual esta empacado en estructuras separadas llamadas cromosomas. Los cromosomas estn estructurados por doblamientos y compactacin de los complejos ADN-protenas. Dicho complejo recibe el nombre de cromatina. Las protenas que forman la cromatina son histonas, factores de transcripcin y reguladores, protenas de alta movilidad y algunas protenas estructurales de la matriz nuclear. El ADN est formado por una doble cadena complementaria de polidesoxirribonucleico en forma de hlice con un dimetro de 2nm. Esta cadena est cubierta, por al menos una masa equivalente de protenas con afinidad por el ADN que forman la cromatina. (alemn. (1999). Fisiologa celular y molecular. Mxico D.F.: Alemn.) Organizacin de la cromatina: la fibra de cromatina es una estructura de nucleoprotenas muy heterognea. Sin embargo, su organizacin y composicin es dinmica y sufre reacciones de condensacin y descondensacion. La unidad estructural de la cromatina es el nucleosomas, contiene aproximadamente 165 pares de bases de ADN que se enrollan en una superhelice izquierda, de aproximadamente 2 vueltas alrededor de un octamero de histonas centrales es decir por octamero hay 2 copias de las siguientes histonas: H2A, H2B, H3 Y H4. Asi se forma el primer nivel de organizacin de la cromatina el de cuentas en una cadena de cromatina con un dimetro de 14 10nm y una compactacin del ADN. En estas condiciones el ADN enrollado alrededor del octamero de histonas est parcialmente accesibles a protenas reguladoras, pero podran estar ms disponibles si el ADN se desenrollara un poco del octamero. Cada histona central tiene 2 dominios funcionales separados, uno llamado el doblez histona que permite la unin de histona a histona y de histona a ADN dentro del nucleosomas y los dominios cola o NH2 y COOH terminales que contienen sitios para modificaciones postraduccionales como acelitalacion, metilacin, fosforilacin y ubiquitinilacion. (alemn. (1999). Fisiologa celular y molecular. Mxico D.F.: Aleman.). El ADN tiene que estar muy plegado y compactado en el ncleo celular. Esto se logra mediante la formacin de un complejo nucleoproteico singular llamado cromatina. El complejo de la cromatina consiste en ADN y protenas estructurales. El plegamiento adicional de la cromatina, como el que ocurre durante la mitosis, produce las estructuras denominadas cromosomas. Toda clula humana normal, excepto los gametos, contiene 46 cromosomas. Entre las protenas de la cromatina, hay cinco protenas bsicas llamadas histonas y otras protenas no histonas. Una caracterstica singular de la compactacin cromatinica es que la maquinaria de transcripcin tenga acceso a aquellas regiones de los cromosomas que son necesarias para la expresin de los genes. (Geneser, Finn. (2000). Histologa. Buenos Aires Argentina: Medica Panamericana). En general, en el ncleo se encuentran dos formas de cromatina: una forma condensada, que recibe el nombre de heterocromatina y una forma laxa llamada eucromatina. (Geneser, Finn. (2000). Histologa. Buenos Aires Argentina: Medica Panamericana). En la mayora de las clulas, la cromatina no tiene un aspecto homogneo; por el contrario, cmulos de protena muy teida estn incluidos en un fondo general de tincin ms leve. El material con tincin ms intensa es la cromatina muy condensada que recibe el nombre de heterocromatina, mientras que el material poco teido es una forma dispersa llamada eucromatina (en la cual est la mayora de los genes transcritos). La basofilia caracterstica de la 15 cromatina es consecuencia de los grupos fosfato del ADN. (Geneser, Finn. (2000). Histologa. Buenos Aires Argentina: Medica Panamericana). Estructura de la Cromatina Condensada: cuando se extrae la cromatina de las clulas en un buffer isotnico, la mayora aparece como fibras de 30nm de dimetro; se cree que estas fibras condensadas los nucleosomas estn empaquetados en un espiral irregular o formando un solenoide con aproximadamente seis nucleosomas por vuelta, la cromatina en las regiones cromosmicas que no est siendo transcripta existe predominantemente en la forma condensada de fibras de 30nm y en estructuras plegadas de orden superior cuyas conformaciones detalladas todava no se conocen. (Lodish,Berk,Matsudaira,Kaiser Krieger,Scott,Zipursky & Darnell. (2012). Biologa Celular y Molecular. Estados Unidos: Medica Panamericana). La modificacin de las colas de histona controla la condensacin de la cromatina, cada una de las histonas que conforman el ncleo del nucleosomas contiene un ncleo amino flexible de 11 a 37 residuos que se extienden desde la estructura fija del nucleosomas; estos extremos se llaman colas de las histonas. Las colas de las histonas se requieren para que la cromatina se condense desde la conformacin de perlas de un collar a la fibra de 30nm. Las colas de las histonas tambin pueden unirse a otras protenas asociadas con la cromatina que influyen en la estructura de la cromatina y en procesos como la transcripcin y replicacin del ADN.( Lodish,Berk,Matsudaira,Kaiser Krieger,Scott,Zipursky & Darnell. (2012). Biologa Celular y Molecular. Estados Unidos: Medica Panamericana). Las protenas no histonas proporcionan un armazn estructural para los bucles largos de cromatina: aunque las histonas son las protenas predominantes en los cromosomas, las protenas no histonas tambin estn involucradas en la organizacin de la estructura del cromosoma. Es as como se propone que los bucles de la fibra de cromatina de 30nm de unas pocas mega bases de longitud se asocian con un armazn cromosmico flexible, para dar la forma extendida caracterstica de los cromosomas durante la interface, entonces, se presenta que el plegamiento del armazn produce la estructura altamente condensada caracterstica de los cromosomas en metafase. Pero 16 an no se determin la geometra del plegamiento del armazn de los cromosomas en metafase. (Lodish,Berk,Matsudaira,Kaiser Krieger,Scott,Zipursky & Darnell. (2012). Biologa Celular y Molecular. Estados Unidos: Medica Panamericana). Los experimentos de hibridacin in situ con varias sondas diferentes de DNA marcadas con fluorescencia en clulas humanas en interface avalan el modelo de bucles, en este experimento algunas secuencias de la sonda separadas por millones de pares de bases en el DNA lineal aparecieron en forma reproducible muy cercanas entre s en el ncleo en interface de diferentes clulas, se postulo que estos sitios de sonda estrechamente espaciados se encuentran cerca de secuencias especificas del DNA, llamadas regiones asociadas con el armazn (SAR) o regiones de adhesin a la matriz (MAR), que estn conectadas al armazn del cromosoma. (Lodish,Berk,Matsudaira,Kaiser Krieger,Scott,Zipursky & Darnell. (2012). Biologa Celular y Molecular. Estados Unidos: Medica Panamericana). La SAR han sido ubicadas mediante la digestin de cromosomas libres de histona con enzimas de restriccin y la posterior recuperacin de los fragmentos unidos a las protenas del armazn, en general las SAR se encuentran entre unidades de transcripcin, en otras palabras los genes se localizan principalmente dentro de los bucles de cromatina, los cuales estn adheridos en sus bases a un armazn cromosmico. (Lodish,Berk,Matsudaira,Kaiser Krieger,Scott,Zipursky & Darnell. (2012). Biologa Celular y Molecular. Estados Unidos: Medica Panamericana).
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Fig.3.4.-compactacion del ADN (Modelo de empaquetamiento de la cromatina y del armazn cromosmico en los cromosomas en metafase: en los cromosomas en interfase, largas extensiones de cromatina de 30nm forman bucles hacia afuera de los armazones extendidos. En los cromosomas metafasicos, el armazn se pliega adicionalmente para formar un estructura muy compacta cuya geometra precisa an no se ha determinado). A medida que las clulas salen de la mitosis y los cromosomas condensados se desenrollan, ciertas secciones permanecen teidas de oscuro, las reas teidas de oscuro denominadas heterocromatina son regiones de cromatina condensada. Las porciones de cromatina con coloracin clara se llaman eucromatina, debido a esto y a que las regiones de heterocromatinas aparentemente permanecen condensadas durante todo el ciclo de vida de la clula, se les ha considerado sitios de genes inactivos, sin embargo se localizaron algunos genes transcriptos en las regiones de heterocromatina. A s mismo no todos los genes inactivos y las regiones no transcriptas de ADN son visibles como heterocromatina. (Lodish,Berk,Matsudaira,Kaiser Krieger,Scott,Zipursky & Darnell. (2012). Biologa Celular y Molecular. Estados Unidos: Medica Panamericana).
3.4.1 La heterocromatina se distribuye en tres ubicaciones: 18 -La cromatina marginal est ubicada en el permetro del ncleo (la estructura que antes los microscpicas pticos llamaban membrana nuclear en realidad es, en su mayor parte, cromatina marginal. -Los cariosomas son corpsculos bien definidos, de forma y tamao irregulares, y que estn distribuidos por todo el ncleo. -La cromatina asociada con el nuclolo es la cromatina que se encuentra en relacin con el nuclolo. (Lodish,Berk,Matsudaira,Kaiser Krieger,Scott,Zipursky & Darnell. (2012). Biologa Celular y Molecular. Estados Unidos: Medica Panamericana). 3.4.2. La eucromatina no es obvia en la microscopia ptica. Est en el nucleoplasma en las regiones claras o transparentes que hay entre la heterocromatina y alrededor de ella. En la macrofotografas electrnicas de rutina, no se ve una demarcacin neta entre la eucromatina y la heterocromatina: ambas tienen aspecto granular o filamentoso, pero la eucromatina est menos compactada. La eucromatina indica cromatina activa, es decir, la cromatina que est extendida de modo que la informacin gentica en el ADN pueda leerse y transcribirse. Es prominente en las clulas metablicamente activas, como en las neuronas y en los hepatocitos.( Geneser, Finn. (2000). Histologa. Buenos Aires Argentina: Medica Panamericana) 3.4.3 Compactacin del ADN en cromosomas: Las unidades estructurales cromatinica ms pequeas son complejos macromoleculares de ADN e histonas llamados nucleosomas, Estos se encuentran tanto en la eucromatina como en la heterocromatina y en los cromosomas. Estas partculas de 10nm de dimetro representan el primer nivel de plegamiento cromatinico y se forman por el enrollamiento de la molcula de ADN alrededor de un centro proteico. Este paso acorta unas siete veces la molcula del ADN en relacin con la molcula de ADN desplegada. El centro del nucleosoma consiste en ocho molculas de histonas y se les conoce como octamero histonico. La molcula de ADN describe dos vueltas (unos 146 pares de nucletidos) alrededor de este octamero histonico central. Entre cada partcula, el ADN se extiende como un filamento de 2nm que une los nucleosomas contiguos. Cuando la cromatina 19 se extrae del ncleo, la subestructura nucleosomica de la cromatina es visible con la microscopia electrnica de transmisin (MET), la cual es descrita con frecuencia como las perlas de un collar. En el paso siguiente una cadena de nucleosomas se enrolla para formar una fibrilla cromatinica de 30nm. Seis nucleosomas completan una vuelta o espiral del solenoide de la fibrilla cromatinina, que es unas 40 veces ms corta que el ADN no plegado. Segmentos largos de fibrillas cromatinicas de 30nm se organizan adicionalmente en regiones de bucles o asas, que estn fijadas a la armazn cromosmica o matriz nuclear compuesta por protenas no histonas. (. Geneser, Finn. (2000). Histologa. Buenos Aires Argentina: Medica Panamericana). En la heterocromatina, las unidades de fibrillas cromatinicas estn muy juntas y se pliegan unas sobre otras; en la eucromatina, en cambio, las fibrillas tienen una disposicin menos compacta. .( Geneser, Finn. (2000). Histologa. Buenos Aires Argentina: Medica Panamericana). En las clulas en divisin, la cromatina esta condensada y organizada en cuerpos bien definidos llamados cromosomas. Durante la divisin mittica las fibras cromatinicas formadas por las regiones de bucles unidas a una armazn proteica flexible sufren condensacin para generar cromosomas. Cada cromosoma se compone de de dos cromatides que estn unidos en un punto llamado centrmero. (.Geneser, Finn. (2000). Histologa. Buenos Aires Argentina: Medica Panamericana). La expresin de los genes esta reprimida en la heterocromatina y la transcripcin esta activada en la eucromatina; en algunas regiones del genoma la cromatina se forma con diferentes caractersticas estructurales: tres son las regiones ms conocidas los centromeros, los telomeros y los cromosomas X inactivos de los mamferos. (aleman. (1999). Fisiologia celular y molecular. Mxico D.F.: Aleman.) 3.4.4 La Metilacin: el proceso de acetilacin acta en sinergia para generar una estructura local de la cromatina, permisiva a la transcripcin, por otra parte, el efecto mayor de las modificaciones postraduccion de las colas de las histonas, es su habilidad de atraer protenas especificas a las regiones de la 20 cromatina que han sido modificadas. Dependiendo del tipo de cambios postraduccionales de las colas, las protenas que se adicionan pueden incrementar la compactacin de la cromatina, o por el contrario facilitar el acceso al ADN, si adems se toma en cuenta que la combinacin de las modificaciones postraduccionales y el nmero posible de estados funcionales de las histonas es muy grande, asi las modificaciones covalentes de las histonas pueden afectar una a la otra en forma positiva o negativa. Tambin se ha observado que la fosforilacin de un sitio cercano puede favorecer la acetilacin de otro y la metilacin y fosforilacin de sitios adyacentes pueden interferirse en sus funciones y la acetilacin y la mutilacin no pueden ocurrir simultneamente en la misma lisina. Las colas de las histonas sobresalen de los nucleosomas y son ms accesibles aun en la cromatina condensada por ello son ms aptos para ejecutar los mensajes respectivos. Colectivamente, este complejo conjunto de procesos modifican en forma covalente pero coordinada en el tiempo y en el espacio las histonas y a sus funciones, definiendo en esta forma un estado o patrn particular de la expresin de los genes del genoma de cada tipo de clula al que se llama el cdigo de las histonas. (aleman. (1999). Fisiologa celular y molecular. Mxico D.F.: Alemn.)
3.5. - ADN
LA ESTRUCTURA Y LA FUNCIN DEL DNA.
Mucho antes de que conocieran la estructura del DNA. Los bilogos haban descubierto que los rasgos hereditarios y los genes que los determinan estaban asociados con los cromosomas. Los cromosomas (denominados as a causa de sus propiedades de tincin; del gr., chroma, color y soma, cuerpo) fueron descubiertos en el siglo XIX en la forma de estructuras filamentosas en el ncleo de la clula eucaritica, que se tornan visibles conforme la clula comienza a dividirse. Cuando fue posible realizar anlisis bioqumicos, los investigadores descubrieron que 21 los cromosomas contenan tanto DNA como protenas; pero, no se saba cul de estos componentes codificaba la informacin gentica del organismo (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana).
Fig. 3.5.1 Estructura del DNA
Hoy sabemos que el DNA transporta la informacin hereditaria de la clula y que los componentes proteicos de los cromosomas principalmente compactan y controlan las molculas de DNA de una longitud enorme. Pero en la dcada de 1940 los bilogos tenan dificultad en aceptar el DNA como el material gentico por la aparente simplicidad de su qumica. Simplemente, se consideraba al DNA como un polmero largo compuesto por slo cuatro tipos de subunidades que desde el punto de vista qumico son muy semejantes entre s (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana).
Luego, a principios de la dcada de 1950, el DNA se examin por medio del anlisis de difraccin de rayos X, una tcnica para determinar la estructura atmica tridimensional de una molcula. Los resultados iniciales indicaban que el DNA estaba compuesto por dos cadenas enrolladas en una hlice. El descubrimiento de que el DNA era bicatenario fue de una importancia crucial. Provey una de las pistas principales que, en 1953, condujeron a un modelo correcto para la estructura del DNA (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana). Ni bien se propuso el modelo de Watson-Crick de la estructura del DNA, se volvi obvio el potencial del DNA para la duplicacin y la codificacin de la informacin (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana).
22 UNA MOLCULA DE DNA CONSISTE EN DOS CADENAS DE NUCLETIDOS COMPLEMENTARIAS. El cido nucleico que sirve de portador de la informacin gentica en todos los organismos, excepto algunos virus, es el cido desoxirribonucleico (ADN) (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana). Una molcula de cido de desoxirribonucleico (DNA) consiste en dos cadenas largas de polinucletidos. Cada una de estas cadenas de DNA (tambin llamadas hebras de DNA) est compuesta por cuatro tipos de subunidades (nucletidos) y ambas cadenas se mantienen unidas por la accin de enlaces de hidrgeno (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana). Un puente de hidrgeno se forma al compartirse un tomo de hidrgeno entre un tomo de hidrgeno donador nico covalentemente y cargado positivamente (William D. Stansfield. (2001). Gentica. Colombia: Mc Graw Hill). Un complejo base-azcar se llama nuclesido; un nuclesido ms un grupo fosfato forma un nucletido (William D. Stansfield. (2001). Gentica. Colombia: Mc Graw Hill). Los nucletidos estn compuestos por una pentosa, carbohidrato simple de cinco carbonos, a la cual se une uno o ms grupos fosfatos y una base nitrogenada. Para los nucletidos del DNA la pentosa es desoxirribosa unida a un solo grupo fosfato (de ah el nombre de cido desoxirribonucleico); la base puede ser adenina (A), citosina (c), guanina (G) o timina (T). Los nucletidos estn unidos entre s de modo covalente formando una cadena a travs de las pentosas y los fosfatos que establecen un esqueleto de pentosa-fosfato- pentosa-fosfato alternantes. Dado que es solo la base que difiere en cada uno de los tipos de subunidades, cada cadena de polinucletidos del DNA puede considerarse como un collar formado por cuatro tipos de perlas (las cuatro bases A, C, G y T). Estos mismos smbolos (A, C, G y T), por lo general tambin se utilizan para referirse a los cuatro tipos diferentes de nucletidos o sea, las bases con su pentosa y su grupo fosfato asociado (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana). 23 La forma en que estn unidas entre s las subunidades (nucletidos) concede a una cadena de DNA una polaridad qumica. Si imaginamos que cada nucletido tiene una prominencia (el fosfato) y una oquedad, cada cadena, formada por prominencias insertadas en oquedades de nucletidos vecinos, tendr todas sus subunidades alineadas en la misma orientacin. Adems, los dos extremos de la cadena pueden distinguirse con facilidad porque uno tendr una oquedad (el hidroxilo 3) y el otro, una prominencia (el fosfato 5). Esta polaridad en una cadena de DNA se indica denominando extremo 3a uno de los extremos y extremo 5 al otro. Esta conveccin se fundamente en los detalles del enlace qumico entre las subunidades nucletidicas (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana). Las dos cadenas de polinucletidos en la doble hlice del DNA se mantienen unidas por enlaces de hidrgeno entre las bases de las cadenas diferentes. Por lo tanto, todas las bases estn en el interior de la hlice, con los esqueletos de pentosa-fosfato en el exterior. Sin embargo, las bases no se aparean al azar: A siempre se aparea con T y G siempre con C. En cada caso, una base ms voluminosa compuesta por dos anillos como una purina se aparea con una base de un solo anillo, una pirimidina. Cada par de purina-pirimidina se denomina par de bases y este apareamiento de bases complementarias permite que los pares de bases se compacten en la distribucin ms favorable desde el punto de vista energtico en el interior de la doble hlice. En esta distribucin, cada par de bases es de un ancho semejante de modo que mantienen los esqueletos de pentosa-fosfato separados con la misma distancia a lo largo de la molcula de DNA. Los miembros de cada par de bases pueden encajar dentro de la doble hlice porque las dos cadenas de la hlice corren antiparalelas una con respecto de la otra, es decir que estn orientadas con polaridad opuestas. Las cadenas antiparalelas de pentosa-fosfato luego se enroscan una alrededor de la otra formando una doble hlice con 10 pares de bases por vuelta helicoidal. Este enrollamiento tambin contribuye a la conformacin energticamente favorable de la doble hlice del ADN (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana). 24 Una consecuencia de los requerimientos del apareamiento de las bases de la doble hlice es que cada cadena de una molcula de DNA contiene una secuencia de nucletidos que es exactamente complementaria de la secuencia de nucletidos de su cadena pareja (una A siempre se aparea con una T en la cadena opuesta y una C siempre se aparea con una G). Esta complementariedad es de importancia fundamental para el copiado y la reparacin del DNA (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana).
LA ESTRUCTURA DEL DNA PROVEE UN MECANISMO PARA LA HERENCIA. Los genes transportan informacin biolgica que debe copiarse y transmitirse en forma precisa cuando la clula se divide y genera dos clulas hijas (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana). El DNA codifica la informacin en el orden o la secuencia de os nucletidos a lo largo de cada cadena. Cada base (A, C, T y G) puede considerarse una letra en un alfabeto de cuatro letras que se utiliza para componer mensajes biolgicos en la estructura qumica del DNA tienen secuencias de nucletidos diferentes, y en consecuencia, transportan mensajes biolgicos diferentes (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana). Un poco antes de haberse determinado la estructura del DNA ya se haba establecido que los genes contienen las instrucciones para la produccin de las protenas. Por consiguiente, de algn modo, los mensajes en el DNA deban codificar las protenas. Si consideramos la condicin qumica de las protenas, el problema es ms fcil de definir. La funcin de una protena est determinada por su estructura tridimensional y; a su vez, su estructura est determinada por la secuencia de los aminocidos en su cadena polipeptdica. Por lo tanto, la secuencia lineal de los nucletidos en un gen debe representar, de algn modo, la secuencia lineal de los aminocidos en una protena (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana). 25 El conjunto completo de la informacin en el DNA de un organismo recibe el nombre de genoma (el termino tambin se utiliza para hacer alusin al DNA que transporta esta informacin). La cantidad total de esta informacin es sorprendente; escrita con el alfabeto de cuatro letras (nucletidos), la secuencia de nucletidos de un gen humano muy pequeo ocupa un cuarto de una pgina de texto, mientras que la secuencia completa del genoma humano llenara ms de 1000 libros (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana).
LA ESTRUCTURA DE LOS CROMOSOMAS EUCARITICOS.
Cada clula humana contiene unos 2 m de DNA; sin embargo, el ncleo celular mide slo 5-8 um. De dimetro. Comprimir todo este material en un espacio tan pequeo equivale a tratar de plegar 40 km de un hilo muy delgado dentro de una pelota de tenis (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana).
Fig. 3.5.2 Cromosoma
En las clulas eucariticas, las molculas muy largas de DNA bicatenario se compactan en estructuras llamadas cromosomas, los cuales no slo caben perfectamente dentro del ncleo sino que tambin pueden repartirse con facilidad entre las dos clulas hijas durante cada divisin celular. La compleja tarea de compactar el DNA es realizada por protenas especializadas que se unen al DNA y lo pliegan, generando as una serie de espirales y asas que proveen niveles de organizacin cada vez ms elevados e impiden que el DNA se convierta en una maraa incontrolable. Lo 26 sorprendente es que el DNA se compacta de un modo que le permite permanecer accesible a todas las enzimas y dems protenas que lo duplican, lo reparan y dirigen la expresin de sus genes (Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana). En el transcurso de la metafase, lo cromosomas de un mamfero poseen una simetra doble, con la cromtide hermana duplicada e idnticas conectadas en un centrmero, cuya posicin relativa es caracterstica para un cromosoma dado. El centrmero es una regin rica en adenina-timina (A-T) que contienen secuencias de DNA repetidas que varan en tamao (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). Los extremos de cada cromosoma contienen estructuras llamas telmeros, que constan de repeticiones ricas en TG cortas (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana).
3.5.1. Replicacin
ORIGEN DE REPLICACIN EN LOS CROMOSOMAS. Toda molcula de DNA que vaya a ser replicada tiene un origen de replicacin desde donde se inicia el proceso en ambas direcciones hasta que se termina de copiar toda la molcula de DNA. Los cromosomas lineales de las clulas eucariticas tienen varios orgenes desde donde se iniciar la replicacin simultneamente. Son molculas ms largas, y varios orgenes garantizarn que en un breve perodo de tiempo toda la molcula se replique completamente. En este origen de replicacin se inicia la apertura de la doble hlice, pudindose observar al microscopio electrnico las burbujas de replicacin. En los cromosomas lineales, con varias burbujas abrindose simultneamente, estas se irn haciendo ms grandes, se irn aproximando unas a otras hasta fusionarse y completarn la replicacin de la molcula. Cada burbuja tendr dos horquillas de replicacin que irn desarrollando la hlice de DNA en direcciones opuestas (apertura bidireccional) mientras las dos cadenas se van replicando (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). 27 LOS FRAGMENTOS DE OGAZAKI EXPLICAN LA REPLICACIN DE SNTESIS DE LAS CADENAS. Al centrar la atencin en una burbuja de replicacin, se observa que una cadena parental tendr la polaridad 5-3, mientras que la otra cadena tendr una polaridad 3-5. Por lo tanto, las nuevas cadenas de DNA, al ser antiparalelas, tendrn orientaciones opuestas a las parentales (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). La sntesis de la nueva cadena de DNA seguir siempre el mismo procedimiento: unir el nuevo nucletido a la posicin 3-OH de la desoxirribosa. El nuevo nucletido trifosfato que entrar en la cadena se unir se unir mediante un enlace ster fosfrico, quedando ahora libre la posicin la posicin 3-OH de este nuevo nucletido. La reaccin de formacin de este enlace se puede dar espontneamente gracias a que el nucletido que se va a unir energticamente activado (debido a que es un nucletido trifosfato) y libera un pirofosfato al formar el enlace fosfodister. Las enzimas que posibilitan la formacin de este enlace fosfodister en la sntesis del DNA continan incorporando nuevos nucletidos siempre en la direccin 5-3 de la nueva cadena. El nucletido nuevo que se incorpora deber ser complementario al de su misma posicin en la cadena molde, mantenindose unido por puentes de hidrgeno (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). Al observar ahora una horquilla de replicacin, la cadena 3-5; servir de molde para la sntesis de la nueva cadena en direccin 5-3; sin embargo, en la otra hebra parental, la nueva cadena debe seguir el sentido 3-5. Cmo se puede replicar esta hebra? Okazaki demostr que, en la cadena que deba crecer en direccin 3-5, tambin segua creciendo la sntesis en la direccin 5-3, sin embargo lo haca en pequeos fragmentos rellenando los espacios de la horquilla marcha atrs. La cadena o hebra que crece sin interrupcin en direccin 5-3 se denomina cadena lder o hebra continua, mientras que la que crece mediante pequeos fragmentos, llamado de Okazaki, se denomina cadena retrasada o hebra discontinua. En cada burbuja de replicacin habr dos horquillas cada una con una banda continua y otra discontinua (Feduchi, 28 Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana).
LA MAQUINARIA ENZIMTICA DE REPLICACIN ES MUY COMPLEJA. ETAPAS DE LA REPLICACIN DEL DNA. ORIGEN DE LA REPLICACIN: se unir especficamente una protena iniciadora (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). APERTURA DE LA HELICE: Una vez fijada la protena iniciadora, se unirn otras protenas capaces de desenrollar la doble hlice. La enzima DNA helicasa se encarga de romper los puentes de hidrgeno entre cadenas complementarias, pero solo lo har si previamente se ha unido la protena iniciadora al origen de replicacin. La helicasa se une a la banda discontinua de cada horquilla de replicacin siguiendo el sentido 5-3 de apertura de la horquilla. Las bandas separadas volveran a unirse, sino fuera porque las protenas de unin a cadena sencilla (SSB, del ingls single strand binding proteins) se unen rpidamente a las bandas sencillas impidiendo su reanillamiento. Otra enzima necesaria para la apertura de la hlice es la DNA girasa, una topoisomerasa que relaja la tensin que se va acumulando por la apertura de la horquilla. La enzima rompe la cadena de DNA, libera la tensin y sella de nuevo la cadena (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana).
29 Fig. 3.5.1.1- Maquinaria enzimtica del ADN INICIO DE LA SNTESIS DEL DNA: cada vez que el DNA polimerasa comienza la replicacin de un fragmento de DNA requiere un cebador o primer de RNA que aporte el 3-OH de un nucletido sobre el que seguirn unindose los dems. Este pequeo fragmento de RNA o primer de 10 a 12 ribonucletidos va a ser sintetizado por la enzima primasa, un tipo de RNA polimerasa que, a diferencia de la DNA polimerasa, no necesita un 3-OH para unir el primer nucletido. La cadena continua solo requerir una vez la accin de la primasa; sin embargo, la cadena retrasada necesitar que la primasa aada un primer cada vez que comience un nuevo fragmento de Okazaki (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). SNTESIS DEL DNA: una vez que comienza a trabajar las enzimas encargadas de abrir la horquilla de replicacin y que la primasa ha colocado los primers, la DNA polimerasa podr comenzar a sintetizar las nuevas hebras de DNA de las dos bandas. Las DNA polimerasas estn formadas por cinco diferentes tipos de enzimas: dos de ellas, las DNA polimerasa I Y III, se encargan de la polimerizacin de las nuevas hebras, mientras que las otras tres son enzimas encargadas de reparar los daos que pueda sufrir el DNA durante el proceso (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). Aunque con diferencias particulares, todas las DNA polimerasas van a ser capaces de realizar los siguientes procesos: 1. Sintetizar una secuencia, complementaria y antiparalela, a partir de un molde. 2. Sintetizar la nueva hebra en direccin 5-3. 3. Requerir un primer de RNA para aadir el primer desoxirribonucletido a la cadena. 4. Realizar el enlace fosfodister entre un extremo 3-OH del ltimo nucletido de la cadena recin sintetizada y el 5-P del nuevo nucletido trifosfato a incorporar, liberando dos fosfatos (pirofosfato) en el proceso. 5. Asociarse a otras protenas para realizar su funcin (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). 30
La DNA polimerasa III es un complejo multiproteico que lleva a cabo la mayor parte del trabajo de replicacin del DNA. Tienen asociadas principalmente dos funciones:
1. Actividad polimerasa 5-3 que permite la sntesis de la nueva hebra. Actividad exonucleasa 3-5 que realiza la funcin de correccin durante la lectura. Esta funcin es primordial para mantener la fidelidad de la nueva copia de DNA. La DNA polimerasa revisa el nucletido que acaba de incorporar y, en el caso de que se haya equivocado al introducirlo, este se quedara sin unirse a su complementario, con lo que la propia DNA polimerasa lo retirar gracias a la actividad exonucleasa 3-5. Esta es la principal diferencia entre una RNA polimerasa y una DNA polimerasa, por eso la DNA polimerasa no puede iniciar un nuevo fragmento, mientras que una RNA polimerasa como la primasa s; la DNA polimerasa siempre necesita revisar el nucletido anterior para poder aadir el nuevo. Gracias a esta actividad correctora, la DNA polimerasa solo se equivoca 1 vez cada 10 millones de bases aadidas (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana).
La DNA polimerasa I tiene estas dos mismas funciones, pero adems, presenta la actividad exonucleasa 5-3. Esta actividad exonucleasa 5-3 permitir que la propia enzima retire el primer de RNA que la primasa ha aadido y rellene este hueco con desoxirribonucletidos recin sintetizados, ya que tiene tambin actividad polimerasa 5-3y correctora de pruebas (exonucleasa 3-5). Por lo tanto, parece que la principal funcin del DNA polimerasa I es la de retirar los primers y rellenar los huecos (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). El proceso de sntesis de la cadena de DNA necesita, por lo tanto, la actividad de la DNA polimerasa III, que se encarga de sintetizar los tramos de DNA a partir de un primer, y de la DNA polimerasa I que retira los primers de RNA aadidos por la primasa y aade nuevos desoxirribonucletidos en estos tramos. Cuando la DNA polimerasa I termina de colocar el ltimo desoxirribonucletido, dejar un extremo 3-OH que no podr unir al extremo 5- 31 P del primer desoxirribonucletido aadido por la DNA polimerasa III (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana).
UNIN DE LOS FRAGMENTOS: ser la enzima DNA ligasa la encargada de unir los dos nucletidos comentados anteriormente, mediante un enlace fosfodister sin la necesidad de aadir un nuevo nucletido. Solo se encarga de ligar el ltimo nucletido aadido por la DNA polimerasa III (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). LOS TELMEROS SON LOS EXTREMOS QUE ASEGURAN LA REPLICACIN EFICIENTE. Cmo se resuelve la replicacin de los extremos en una molcula lineal? La replicacin de los telmeros (extremos del cromosoma) ha proporcionado nuevas claves para comprender la fecha de caducidad de las clulas (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). Si se observa la horquilla de replicacin avanzando hacia el extremo de un cromosoma, la banda retrasada habr generado un primer complementario al extremo 3-OH, que la DNA polimerasa correspondiente se encargar de retirar. Sin embargo, en este caso no hay un extremo 3-OH libre para que la DNA polimerasa contine rellenando el espacio dejado al retirar el primer. Queda un extremo protuberante que debe ser rellenado por la enzima telomerasa, una ribozima (con una porcin de protena y una porcin de RNA). Los telmeros presentan secuencias repetitivas ricas en G y la porcin de RNA de la telomerasa posee una secuencia de unos 15 a 20 ribonucletidos que son complementarios a este extremo protuberante. Esta porcin de RNA sirve de molde para que la actividad polimerasa de la telomerasa le sintetice DNA complementario al RNA de la propia enzima. De esta forma se extiende el extremo del cromosoma impidiendo que se acorte cada vez que se replica. Estudios recientes han indicado que las clulas que estn en crecimiento presentan una alta actividad telomerasa, mientras que las clulas somticas, al tener una baja actividad telomerasa, van sufriendo un acortamiento de los cromosomas hasta que la clula muere. Por lo tanto, se podra decir que la 32 fecha de caducidad de una clula depende de la actividad de la telomerasa (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana).
3.5.2. Factores de transcripcin
La Sntesis de RNA Las sntesis del RNA es la transcripcin del mensajero energtico. Toda molcula de RNA presente en una clula ha sido sintetizada a partir de un molde de DNA en un proceso denominado transcripcin. Haciendo un paralalismo con el proceso de replicacin del DNA, se observa que la transcripcin tambin se requiere un molde de DNA y un complejo aparato proteico que se encarga de sintetizar la molcula final., el RNA en este caso, utilizando determinados materiales de construccin, los riboucleotidos, sin embargo hay una diferencia significativa entre estos dos procesos. Una vez que se inicia la replicacin del DNA, todas las molculas de la clula se replican a la vez, y lo hacen una sola vez durante el ciclo celular. La sntesis del RNA, por el contrario, es un proceso altamente selectivo ya que no todos los genes van a transcribirse a la vez durante toda la vida de la clula. La clula debe detectar el momento en que necesita transcribir un determinado mensaje, y lo har solo cuando necesite dichos productos. Todas las clulas de un organismo tienen mismos genes, sin embargo solo se expresan en determinados momentos de la vida del organismo, o en determinados tejidos, dependiendo de las necesidades de dicho organismo. Los mecanismos que controlan el inicio de la transcripcin de un gen son ms complejos, requieran la presencia de secuencia especficas en el DNA y multitud de factores proteicos que las reconozcan. (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010). La unidad de transcripcin esta especificada por la secuencia de DNA La maquinaria encargada de la sntesis del RNA sigue reglas c0monunes c a las descritas en el DNA: una hebra de DNA sirve de molde para que la enzima, 33 en este proceso la RNA polimerasa, vaya aadiendo los nucletidos complementarios segn la direccin de la sntesis 5 3. Sin embargo, a diferencia de la replicacin, en la transcripcin, solo una de las dos hebras del DNA ser el molde. Si se considera un segmento de DNA que corresponda a un gen, solo una de las dos bandas va a servir de molde, y la copia de RNA ser idntica a una de las dos bandas. En la mayora de los caso, en un fragmento de DNA, solo se transcribe una de las dos bandas, y, dado que la maquinaria de transcripcin siempre alcanza en el sentido de 5 3 (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.- Madrid: Medica Panamericana, 2010). Los genes codifican proteinas solo son una pequea porcin de toda la molcula de DNA. Las enzimas encargadas de transcribir los genes deben reconocer una seal en el cromosoma que indique donde comienza y donde termina el mensaje. La unidad de transcripcin de un gen consta de tres regiones: un promotor, una secuencia codificante y una seal de terminacin- existen secuencias en el DNA que sirven de seal de comienzo para que el RNA polimerasa se fije a una de las dos heveas de DNA: son los promotores. Estas secuencias estn presentes en una posicin inmediatamente anterior a la regin codificante. Mediante el anlisis de las secuencias de multitud de genes, se ha observado que existe una secuencia consenso en una posicin fija de la regin 5 no codificante de un gen (5- UTR, untranslate region). Esta ser la seal para que la enzima RNA polimerasa, encercada de sintetizar el RNA a partir de la copia de ADN, comience a transcribir el mensaje. De la mima forma, la enzima debe recibir una seal que le indique donde termina el mensaje. La seal de terminacin se transcribe y, solo despus de ser copiada, la maquinaria de transcripcin deja de transcribir el mensaje. (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, et al. Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
34 La transcripcin de los genes eucariotas Existen diferencias RNA polimerasas segn la naturaleza del ARN que se transcribe, es decir, existe una gran especializacin de manera que cada enzima solo va a sintetizar un tipo especfico de RNA Las RNA polimerasas necesitan factores que promueven la iniciacin de la transcripcin. Los factores de transcripcin generales son necesarios para iniciar este proceso La terminacin en eucariotas parece un proceso menos preciso; es decir, no hay una secuencia consenso. El control de la iniciacin en un proceso mucho m regulado en eucariotas, ya que los genes estn muy distanciados y existen muchos tramos de DNA con elementos reguladoras. Las investigaciones actuales aportan cada vez ms informacin acerca de estos elementos indicando su importante papel regulador. Otra importante diferencia es el hecho de que la iniciacin de estos genes debe ocurrir en la compleja estructura de la cromatina (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
35 Fig. 3.5.2.1-Traduccion del ADN
Iniciacin: los factores de transcripcin generales ( denominados TFIIA, TFIIB, TFIID, etc.) se unen al promotor del gen, que tambin posee una secuencia consenso denominada caja TATA por la secuencia rica en T y A que se encuentra en la posicin -25 del promotor. Los factores son necesarios para que la RNA polimerasa se fije al promotor y comience la transcripcin del gen. La unin del factor TFIID junto con otros factores promueven la unin de la RNA polimerasa II al promotor, en particular es la subunidad TBP(TATA binding protein) del factor TFIID la que promueve la unin especficamente de la RNA polimerasa II a la caja TATA. A continuacin, otros factores formaran el complejo de iniciacin de la transcripcin, que ser caracterstico segn el tipo de promotor que lleve le gen (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
Elongacin: posteriormente al inicio de la transcripcin se produce la fosforilacin de una porcin de la RNA polimerasa deje de unirse fuertemente al promotor y contine la transcripcin del gen: se produce un cambio conformacional RNA polimerasa debido a la fosforilacin del extremo C- terminal de la enzima que es catalizada por una subunidad del factor de transcripcin TFIIH con actividad quinasa. La fosforilacin hace que la polimerasa se separe del complejo de iniciacin de la transcripcin que quedar unida al promotor donde se podr iniciar la transcripcin de un nuevo mensajero. La RNA polimerasa que ha comenzado a reclutar el complejo de iniciacin podra considerarse la enzima pionera, sin embargo, este complejo de iniciacin seguir unido al promotor de manera que si una nueva enzima lo vuelve a reconocer comenzar la sntesis sin necesidad de haber reclutado a todos los factores de iniciacin. As, la primera o pionera ayudar a que nuevas rondas de transcripcin comiencen ms de prisa. Adems parece ser que tiene lugar una alteracin de la estructura del nucleosoma en aquellos genes que estn transcribiendo debido a una asociacin entre a enzima esto a acetil transferasa y la enzima RNA polimerasa primera. Es importante resaltar, sin 36 embargo, que las histonas de octamero de nucleosoma nunca llegan a disociarse del DNA que se esta transcribiendo. La fosforilacin del extremo c-terminal de la RNA polimerasa permite mas, la unin de varias protenas que van a modificar el DNA a medida que se van sintetizando (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
Terminacin. Este proceso es poco preciso en los organismos eucariotes porque no hay seales determinacin exacta o consenso tal y como ocurre en procariotas. La RNA polimerasa sigue ,a transcripcin del gen incluso en la secuencia no codificante de la porcin 3` (3`-UTR o Untraslate regin) posteriormente el RNA ya separado de la cadena de DNA ser procesado por otras enzimas que modifican el extremo 3`. Una vez descolgada la RNA polimerasa fosforilada de la cadena de DNA se eliminan los grupos fosfato mediante una fosforasa, que dejara preparado de nuevo a la enzima para iniciar una nueva ronda de transcripcin. Los RNA transcritos en eucariotas van a sufrir un proceso de modificacin en el proceso de maduracin que dejara preparado al RNA para ser expresado al citoplasma donde podr realizar su funcin, dependiendo del tipo de RNA del que se trate (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
3.5.3. Reparacin del ADN
LOS DAOS SUFRIDOS EN EL DNA DEBEN SER REPARADOS. El DNA est sometido constamente a agentes mutagnicos y cambios espontneos. A pesar de ello, la tasa de mutacin permanece considerablemente baja gracias a la eficiencia con la que se repara el DNA. Menos de una, cada 1,000 lesiones del DNA se convierten en mutacin. El resto, se corrigen (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana).
37 REPARACIN DE LOS ERRORES DE APAREAMIENTO: la replicacin es extraordinariamente precisa. La mayora de los errores que aparecen inicialmente se corrigen, y no se transforman en mutaciones permanentes. Algunas de estas correcciones se realizan durante la replicacin por la actividad de correccin durante la lectura. Pero muchos de los nucletidos incorporados de forma incorrecta que escapan a la deteccin de la correccin durante la lectura, se corrigen por reparacin de los errores de apareamiento. La presencia de los nucletidos agregados de forma incorrecta persisten tras la replicacin deforman la estructura tridimensional del DNA; las enzimas encargadas de eliminar estos nucletidos reconocen la deformidad y usan la cadena de nucletidos original como molde para remplazar el nucletido errneo (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). REPARACIN DIRECTA: los mecanismos de reparacin directa no reemplazan los nucletidos alterados, sino que les devuelven sus estructuras correctas originales. Uno de los mecanismos de reparacin directa mejor caracterizados es la fotorreactivacin de los dmeros de pirimidina inducidos por la luz UV. La E coli. Y algunas clulas eucariticas poseen una enzima denominada fotoliasa, que utiliza energa de la luz para romper las uniones covalentes que conectan las pirimidinas en un dmero (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). REPARACIN POR ESCISIN DE BASES: en este mecanismo de reparacin, primero se escinden las bases modificadas y despus se reemplaza el nucletido completo. La escisin de las bases modificadas las cataliza un grupo de enzimas denominadas DNA glucosilasas, cada una de las cuales reconoce y extrae un tipo especfico de base modificada rompiendo la unin entre esa base y la desoxirribosa (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). Una vez extrada la base, una enzima denominada endonucleasa AP (apurnica o apirimidnica) corta el enlace fosfodister, y otras enzimas eliminan la desoxirribosa. Luego, la DNA polimerasa agrega nucletidos nuevos al grupo 3-OH y reemplaza los nucletidos en la cadena daada. La DNA ligasa sella el enlace fosfodister, restaurndose de este modo la secuencia original 38 (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). REPARACIN POR ESCISIN DE NUCLETIDOS: este proceso elimina lesiones voluminosas del DNA que distorsionan la doble hlice, como los dmeros de pirimidina. Es un proceso bastante verstil y puede reparar muchos tipos de daos diferentes del DNA. Se encuentran en clulas de todos los organismos, y es uno de los mecanismos de reparacin ms importante. Este mecanismo de reparacin es complejo. En los seres humanos, participan muchos genes. Primero, un complejo de enzimas examina el DNA buscando distorsiones en su configuracin tridimensional. Cuando se detectan, otras enzimas separan las dos cadenas en la regin daada y las protenas SSB estabilizan las cadenas separadas. Despus, se corta el esqueleto de azcar- fosfato de la cadena daada a ambos lados de la lesin y se elimina una parte de la cadena daada; la DNA polimerasa rellena el hueco y la ligasa lo sellan (Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). TOPOISOMERASA Enzimas que determinan y modifican la estructura espacial del ADN (Murray, Bender, Botham, Kennelly, Rodwell, Weil. (2013). Harper Bioqumica Ilustrada. Mxico DF: Mc Graw Hill). EL DNA EXISTE EN FORMAS RELAJADA Y SUPERENRROLLADA. En algunos organismos, como bacterias, bacterifagos, muchos virus de animales que contienen DNA, as como organelos como las mitocondrias, los extremos de las molculas de DNA estn unidos para crear un crculo cerrado sin extremos covalentemente libres. Claro que esto no destruye la polaridad de las molculas, pero elimina todos los grupos hidroxilo y fosforilo 3 y 5. Los crculos cerrados existen en forma relajada y superenrrollada. Las superhlices se introducen cuando un crculo cerrado se gira alrededor de su propio eje o cuando un fragmento lineal del DNA dplex, cuyos extremos estn fijos, se tuerce. Este proceso que necesita energa coloca a la molcula bajo tensin de torsin, y mientras mayor es el nmero de superhlices, mayor es la tensin o torsin (esto se prueba al torcer una banda de caucho, goma o liga). Las superhlices negativas se forman cuando la molcula se tuerce en la direccin opuesta desde las vueltas en la direccin de las manecillas del reloj de la doble 39 hlice diestra que se encuentra en el B-DNA. Se dice que ese DNA est subgirado. La energa requerida para lograr este estado se encuentra, en cierto sentido, almacenada en las superhlices. Por ello, el subgiro facilita la transicin hacia otra forma que requiere energa. Una transicin de este tipo es la separacin de cadena, que es un prerrequisito para la replicacin y la transcripcin del DNA. En consecuencia, el DNA superenrrollado es una forma preferida en sistemas biolgicos (Murray, Bender, Botham, Kennelly, Rodwell, Weil. (2013). Harper Bioqumica Ilustrada. Mxico DF: Mc Graw Hill). Las enzimas que catalizan cambios topolgicos del DNA se llaman topoisomerasas, las cuales pueden relajar o insertar superhlices, usando ATP como una fuente de energa. Hay homlogos de esta enzima en todos los organismos, y son blancos importantes, y son blancos importantes de la quimioterapia de cncer (Murray, Bender, Botham, Kennelly, Rodwell, Weil. (2013). Harper Bioqumica Ilustrada. Mxico DF: Mc Graw Hill).
3.5.4. Topoisomerasa
TOPOISOMERASA Enzimas que determinan y modifican la estructura espacial del ADN (Murray, Bender, Botham, Kennelly, Rodwell, Weil. (2013). Harper Bioqumica Ilustrada. Mxico DF: Mc Graw Hill).
EL DNA EXISTE EN FORMAS RELAJADA Y SUPERENRROLLADA. En algunos organismos, como bacterias, bacterifagos, muchos virus de animales que contienen DNA, as como organelos como las mitocondrias, los extremos de las molculas de DNA estn unidos para crear un crculo cerrado sin extremos covalentemente libres. 40 Claro que esto no destruye la polaridad de las molculas, pero elimina todos los grupos hidroxilo y fosforilo 3 y 5. Los crculos cerrados existen en forma relajada y superenrrollada. Las superhlices se introducen cuando un crculo cerrado se gira alrededor de su propio eje o cuando un fragmento lineal del DNA dplex, cuyos extremos estn fijos, se tuerce. Este proceso que necesita energa coloca a la molcula bajo tensin de torsin, y mientras mayor es el nmero de superhlices, mayor es la tensin o torsin (esto se prueba al torcer una banda de caucho, goma o liga). Las superhlices negativas se forman cuando la molcula se tuerce en la direccin opuesta desde las vueltas en la direccin de las manecillas del reloj de la doble hlice diestra que se encuentra en el B-DNA. Se dice que ese DNA est subgirado. La energa requerida para lograr este estado se encuentra, en cierto sentido, almacenada en las superhlices. Por ello, el subgiro facilita la transicin hacia otra forma que requiere energa. Una transicin de este tipo es la separacin de cadena, que es un prerrequisito para la replicacin y la transcripcin del DNA. En consecuencia, el DNA superenrrollado es una forma preferida en sistemas biolgicos (Murray, Bender, Botham, Kennelly, Rodwell, Weil. (2013). Harper Bioqumica Ilustrada. Mxico DF: Mc Graw Hill). Las enzimas que catalizan cambios topolgicos del DNA se llaman topoisomerasas, las cuales pueden relajar o insertar superhlices, usando ATP como una fuente de energa. Hay homlogos de esta enzima en todos los organismos, y son blancos importantes, y son blancos importantes de la quimioterapia de cncer (Murray, Bender, Botham, Kennelly, Rodwell, Weil. (2013). Harper Bioqumica Ilustrada. Mxico DF: Mc Graw Hill).
3.5.6. Mutaciones del ADN
Mutaciones y variabilidad gentica
La replicacin de las largas molculas de ADN es un proceso complejo muy regulado. La DNA polimerasa solo se equivoca en unas cada 107 bases aadidas, gracias a su capacidad correctora. Sin embargo, los errores en el ADN no solo pueden ser ocasionados por una falta de fidelidad durante el proceso de replicacin, si no que el material gentico, aun estando protegido 41 en el ncleo del clula eucariota, sufre daos a lo largo de su vida por ello existe una gran maquinaria clula encargada de revisar el material gentico y reparar todos los daos que vaya detectando. Solo en algunos casos estos sistemas de reparacin fallan, y entonces lo errores permanentes se fijan como mutaciones. Una mutacin es un cambio heredable en informacin gentica. Las mutaciones son la fuente de variabilidad y diversidad de los organismos vivos de la evolucin. Sin ella y la variabilidad gentica que genera el organismo no podrn adaptarse a los cambios del medio ambiente y estaran en peligro de extincin. Sin embargo, desde el punto de un individuo estas mutaciones pueden ser fatales no solo para la vida de una clula sino para el organismo completo (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
Tipos de mutaciones gnicas:
Las mutaciones gnicas se pueden clasificar en tres tipos bsicos segn su naturaleza molecular: situaciones de bases intercesiones y de lesiones 1-situaciones de bases: es el tipo de mutacin gnica en ellas se produce la alteracin de un solo nucletido en el DNA. Cuando se altera la base de un nucletido, tambin se altera la base nucletido de la cadena opuesta. Por ello, una sustitucin de una base provoca la sustitucin de un par de bases. Las sustituciones de bases pueden ser de 2 tipos. Una transicin, se cambia una purina por otra diferente o, alternativamente, una pirimidina es remplazada por una purina. LAS TRANSICIONES SULEN SER MAS FRECUNTES. Inserciones y de lesiones: supone la adishion o la eliminacin, respectivamente, de una o ms pares de nucletidos. Son ms frecuentes que las sustituciones de bases. Las inserciones y de lesiones dentro de secuencias que codifican protenas pueden conducir a mutaciones de marco de lectura de un gen. El codn de iniciacin del RNAm establece el marco de lectura; despus de este codn, se leen otros codones en forma sucesiva como grupos de 3 nucletidos no superpuestos. La adishion o de lesin de un nucletido cambia el marco de lectura y altera todos los aminocidos codificados por los codones que siguen a la mutacin. Ahora bien, como los codones estn 42 constituidos por 3 nucletidos, el marco de lectura si las inserciones o de lediosne consisten e n algn mltiplo de tres nucletidos, aunque si pueden afectar el fenotipo. Estas mutaciones se denominan de inserciones y de lesiones en el marco de lectura (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
Causas de las mutaciones Adems de las mutaciones ocasionadas por errores en el proceso de replicacin, se pueden producir otros tipos de mutaciones. Las que surgen por cambios estructurales en el cabio del DNA se denomina mutaciones espontaneas, mientras por las provocada por cambios causados por sustancias qumicas ambientales o por radiaciones se denomina mutaciones inducidas. Mutaciones espontanea: se producen por cambios qumicos espontaneo en el DNA. Unos de estos cambios es la despurinacion, es decir, la prdida de una base purica de un nucletido. La despurinacion se produce cuando se rompe el enlace covalente que une la purina con el azcar desoxirribosa, lo que produce un sitio apurinico ( un nucletido que carece de su base purica). Un sitio apurinico no puede ser de molde para una base complementaria durante la replicacin, por lo que se incorpora a un nucletido incorrecto a la cadena de DNA recin sintetiza, produciendo un error(Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
Otro cambio qumico espontaneo que tiene lugar en el DNA es la desafinacin, esto es, la prdida de un grupo amino de una base. La desafinacin puede producirse de forma espontnea o ser inducida por sustancias qumicas mutagenicos (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010). La desafinacin puede alterar las propiedades de apareamiento de una base: la desafinacin de la citosina por ejemplo produce un uracilo, que se aparea con la adenina durante la replicacin provocando mutaciones (Bioqumica: 43 conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010). Mutaciones inducidas: numerosos agentes ambientales, incluidas ciertas sustancias qumicas y la radiacin, pueden daar el DNA. Un agente ambiental que eleva de forma significativa la tasa de mutacin por encima de la tasa espontanea se denomina mutagenica. Algunos mgatenos son: Anlogos de bases: son sustancias qumicas con estructuras similares a las de algunas de las cuatro bases del DNA. La DNA polimerasa no puede distinguir en tres los anlogos y las bases estndar; as se realiza la replicacin en presencia de los anlogos, estos podrn incorporarse a las mo, ecuals de DNA recin sintetizadas. Por ejemplo el 5bromouracilo (5-VU) es un anlogo de timina (posee la mis mi estructura que esta excepto por la presencia de un tomo de bromo en el carbono 5 en lugar de un grupo metilo). El 5- Bromouracilo puede aparearse de una forma incorrecta con la guanina, dando lugar a una transicin (T.A=>5-VU.A=>5-VU.G=>C.G) (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
Reacciones oxidativas: las formas reactivas del oxgeno (como el perxido de hidrogeno, los radicales sper xidos y los radicales hidroxilos) se producen tanto en el curso del metabolismo aerobio normal, por la radiacin, el ozono, los perxidos y ciertas drogas. Estas formas reactivas del oxgeno daan el DNA e inducen mutaciones provocando cambios qumicos en esta molcula. Por ejemplo, la oxidacin convierte la guanina en 8-oxi-7,8-hidrodesociguanina, que suele aparearse de forma incorrecta con la avenida en lugar de la citosina y causa una mutacin de transverso G.C=>T.A (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
Agentes intercalantes: como la proflabina, la naranja de acridina, el bromuro de estudio la dioxina, tienen un tamao casi igual al de un nucletido. Producen 44 mutaciones al intercalarse entre bases adyacentes de DNA, distorsionando la estructura tridimensional de la hlice, y provocando inserciones y de lesiones durante la replicacin, que conducen a mutaciones del marco de lectura. Por ello, a menudo los agentes mutagenicos de los agentes intercalantes son graves (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
Radiaciones: ionizantes, como los rayos X y gamma, penetran en los tejidos y daan el DNA. Desplazan electrones de los tomos donde se encuentran, transformando las molculas estables en radicales libres e iones reactivos. Luego, estos alteran las estructuras de las bese y rompes los enlaces fosfodiester del DNA. Por otro lado, las radiaciones ionizantes producen rotura s en la doble cadena del DNA (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010). La luz UV, aunque posee menos energa que la radiacin ionizante y no expulsa electrones ni causa ionizacin, es altamente mutagenica. Las bases purica y pirimidimicas absorben con rapidez la luz UV; como resultados se establecen uniones a qumicas entre las molculas pirimidimicas adyacentes en la misma cadena de DNA, formando estructuras llamadas dmeras de pirimidina. Los ms frecuentes estn formados por dos bases de timina (dmeros de timina), pero tambin pueden darse dmeros de citosina y de timina-citosina. Estos dmeros distorsionan la configuracin del DNA y, a menudo bloquean la replicacin, lo que inhibe la divisin celular y provoca la muerte de las clulas. La mayora de los dmeros de pirimidina se reparan por mecanismo que se vern a continuacin (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
Efectos fenotpicos de las mutaciones: la sustitucin de una base que altera un codn en el Ram y produce la incorporacin de un aminocido diferente en la protena se conoce como mutaciones de cambio de sentido. Una mutacin si sentido cambia un codn con sentido (aquel que codifica un aminocido) por un 45 codn sin sentido (uno que termina la traduccin). Una mutacin silenciosa altera el codn, pero gracias redundancia del cdigo gentico, el codn sigue codificando el mismo aminocido. Una mutacin neutral es una mutacin de un aminocido aqu altera la secuencia de aminocidos de una protena, pero que no cambia su funcin. Se produce cuando un aminocido se remplaza por otro qumicamente similar, o cuando el aminocido tiene poca influencia en la funcin de la protena.
Los daos sufridos en el DNA deben ser reparados.
Como se acaba de comentar, el DNA est sometido constantemente agentes mutagenicos y cambios espontneos. A pesar de ello, la tasa de mutacin permanece considerablemente baja gracias a la eficiencia con la que se repara el DNA. Menos de una cada mil lesiones del DNA se convierte en mutacin. El resto se corrige, hay 4 mecanismos generales de reparacin del DNA que se comenta continuacin:
Reaparicin de los errores de apareamiento: la replicacin es extraordinariamente precisa. La mayora de los errores que aparecen inicialmente se corrigen, y no se transformas inmutaciones permanentes (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.- Madrid: Medica Panamericana, 2010). Algunas de estas correcciones se realizan durante la replicacin por la actividad de correccin durante la lectura, ya comentada. Pero los muchos de los nucletidos incorporados de forma incorrecta que escavan a la deteccin de la coercin durante la lectura se corrigen por reparacin de los errores de Apareamiento. La presencia de nucletidos agregados de forma correcta que persisten tras la replicacin deforma a la estructura tridimensional de DNA. Las enzimas encargadas de eliminar estos nucletidos reconocen la deformidad y usan la cadena de nucletidos original como molde opera remplazar el nucletido errneo (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010). 46
Reparacin directa: los mecanismos de relacin directa no remplazan los nucletidos alterados, sino que les devuelvan sus estructuras correctas originales. Uno del os mecanismo d reaccin directa mejor caracterizados es la foto reactivacin de los dmeros de pirimidina inducidos por la luz UV. La bacteria E.COLI y algunas clulas eucariotas poseen una enzima denominada totolease, que utiliza energa de la luz para romper las uniones covalentes que secta las pirinmidninas en un dmero (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
Reparacin por escisin de bases: en este mecanismo de reparacin, primero se escinden las bases modificadas y despus se remplazan el nucletido. Las escisin de las bases modificadas la cataliza un grupo de enzimas denominadas glucocilasas. Cada una de las cuales reconoce y extrae un tipo de especifico de base modificada rompieron la unin entre esa base y la desoxirribosa. Una vez extrada la base, una enzima denominada endonuleasa AP (A purifica o A pirimidimicas) corta el enlace fosfodiester, y otras enzimas elimina la desoxirribosa. Luego la DNA polimerasa agrega nucletidos nuevos al grupo 3-OH y remplaza los nucletidos en la cadena daada. La DNA ligasa sella en enlace fosfodiester, restaurndose de este modo la secuencia original. Reparacin por escisin de nucletidos: este proceso elimina lesiones voluminosas del DNA que distorsionan la doble hlice, como os dmeros de pirimidina. Es un proceso bastante verstil y puede reparar muchos tipos de daos diferentes del DNA. Se encuentran en clulas de todos los organismos, y es uno del os mecanismos de reparacin ms importantes (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
Este mecanismo de reparacin es complejo. En los seres humamos, participan muchos genes, primero, un complejo examina el DNA buscando distorsiones en su configuracin tridimensional. Cuando se detecta, otras enzimas separan 47 las dos cadenas en la regin daada y las protenas ESSB estabilizan las cadenas separadas. Despus se corta el esqueleto de azcar-fosfato de la cadena daada ambos lados de la lesin y se elimina una parte de la cadena daada; la DNA polimerasa y la ligasa lo sella (Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.-Madrid: Medica Panamericana, 2010).
3.6. Cuerpos nucleares
Entre los que se incluyen: el nuclolo, los cuerpos moteados, los cuerpos enrollados o cuerpos de Cajal, los cuerpos de la leucemia promielocitica o cuerpos PML, entre otros, su estructura composicin y funcin es motivo de intensos estudios, con objeto de tener una mejor idea de las funciones globales del ncleo, de su organizacin y de la interrelacin funcional dinmica que se da entre varios de estos cuerpos nucleares.
3.6.1. Nuclolo sus regiones y sntesis de ribosomas
El ncleo contiene uno o ms cuerpos esfricos denominados nuclolos, que participan en la sntesis de los ribosomas. Cada nuclolo est compuesto por protenas, DNA y RNA y no est rodeado por una membrana. [Tortora G. & Derrickson B. (2013). EL NIVEL CELULAR DE ORGANIZACIN. En Principios de Anatoma y Fisiologa (pp. 88 - 89). BUENOS AIRES- BOGOT -CARACAS - MADRID - MXICO -PORTO ALEGRE: Editorial Mdica Panamericana S.A de C.V.] El nuclolo es el sitio donde se sintetiza el RNA ribosmico y se produce el armado inicial de los ribosomas. El nuclolo es una estructura intranuclear no membranosa que rodea genes de RNA ribosmicos activos desde el punto de vista transcripcional. Es el sitio primario de produccin y armado de los ribosomas. El ncleo varia de tamao, y est muy bien desarrollado, en particular en las activas durante la sntesis de protenas. Algunas clulas poseen ms de un nuclolo. 48 El nuclolo tiene tres regiones de morfologa bien definidas: Centros fibrilares, que sintetizan asas de DNA de cinco cromosomas diferentes ( 13,14,15,21 y 22) con genes de RNA ribosmicos, RNA polimerasa I y factores de transcripcin. Material fibrilar (pars fibrosa), que contiene genes ribosmicos en proceso de transcripcin activa y grandes cantidades de RNA ribosmico. Material granular (pars granular), que es el sitio del armado inicial de ribosomas y contiene partculas prerribosmicas muy juntas.
La red est formada por los materiales granular y fibrilar y recibe el nombre de nucleolonema. El RNA ribosmico se halla tanto en material granular como en el fibrilar, y est organizado, respectivamente, tanto en grnulos como filamentos muy delgados y muy juntos. Los genes para las subunidades ribosmicas estn ubicados en los intersticios de esta red y los transcribe la RNA polimerasa I. Luego del procesamiento y de las modificaciones adicionales de los RNA ribosmicos por los RNA nucleonares pequeos (snoRNA), las subunidades de RNA ribosmicos se arman mediante el uso de protenas ribosmicas importadas desde el citoplasma. Las subunidades ribosmicas armadas parcialmente (prerribosomas) se exportan desde el ncleo a travs de los poros nucleares para completar su armado final en el citoplasma, donde se convierten en ribosomas maduros. Ross. (2012). EL NCLEO CELULAR. En Histologa Texto y Atlas Color Con Biologa Celular y Molecular (p.79). BUENOS AIRES - CARACAS - MADRID - MXICO - PORTO ALEGRE: Editorial Mdica Panamericana.
3.6.2. Los cuerpos de cajal
Para llevar a cabo las diferentes funciones nucleares en la forma ms adecuada, el ncleo se ha compartamentalizado u organizado en subdominios y estructuras con morfologa distinta, los llamados cuerpos nucleares, entre los que se incluyen: el nuclolo, los cuerpos moteados, los cuerpos enrollados o cuerpos de Cajal, los cuerpos de la leucemia promielocitica o cuerpos PML, entre otros, su estructura composicin y funcin es motivo de intensos 49 estudios, con objeto de tener una mejor idea de las funciones globales del ncleo, de su organizacin y de la interrelacin funcional dinmica que se da entre varios de estos cuerpos nucleares. Los cuerpos de Cajal semejan esferas de hilos enrollados, cuyos dimetros oscilan entre 0.2-1.5 mm y su nmero no es muy grande. Contienen una pequea fraccin de 1-5% de ARNsn que son los pequeos ARNs o subunidades de los traslaposomas, las pequeas RNPs del nuclolo (RNPsno) que dan mayor precisin a la ruptura del ARNpre, contienen pequeos ARNs guas llamados pequeos ARNs de los cuerpos de Cajal (CB). Adems, los cuerpos de Cajal contienen diferentes protenas: coilina p80, fibrilarina, Nopp 140, NAP57, LS, PTF, TFIIF, TFIIH, topoisomerasa I, ciclina E y protenas Sm entre otras. Los CB estn a menudo asociados a la periferia del nuclolo de donde se mueven para alejarse o acercarse. Es de suponerse que los CB estn relacionados funcionalmente con el nuclolo y le proporcionan nuevos factores de procesamiento ensamblados o maduros como son los ARNsno ya que la funcin principal de los CB parece ser l maduracin de las pequeas RBPs nucleares. Se sabe que las RPsn y RNPsno recin ensambladas se concentran en los CB, antes de que lo hagan en los cuerpos moteados o en el nuclolo, respectivamente. As, a semejanza del ARNpre los ARNsno y los ARNsn son extensamente modificados despus de la transcripcin. Los CB contiene los ARNsn que se encuentra en los traslaposomas, pero no contienen ninguna de las protenas del complejo de traslape. Los CB contienen protenas que participan en la formacin de los complejos de transcripcin y en la regulacin del ciclo celular.
3.6.3. - Los cuerpos de PML
Tienen forma de anillo, en promedio es de 0.3 a 1 micras de dimetro, su nmero es de 10-20 por ncleo. Es un anillo que en su periferia contiene la protena de la leucemia promielocitica (PML). Constituidas por una cpsula fibrilar externa que aparece densa con las tcnicas de contraste comunes y reacciona como el anticuerpo, mientas que en su parte interna es finamente fibrillas o tubular. Otros componentes presentes son las protenas retinoblastoma (RB), el receptor al cido retinoico (RARa), la Sp100, SUMO-1, 50 ndp53, CBP y GRIP-1. Se conoce que algunas de las protenas de los cuerpos PML (Cs-PML) son conjugadas con la protena SUMO-1, por ello es posible que a travs de SUMOilaciones o fosforilaciones reversibles de alguna Protena puedan modular sus interacciones con otros cuerpos o estructuras nucleares, lo que determina su distribucin entre estos y el nucleoplasma. Los Cs-ML tienen una funcin antiviral. (Biologa Celular y molecular, Jimnez, L. Felipe; Merchant, Horacio. Pearson Educacin, Mxico 2003) La protena PML interacciona con la protena RB y ISG20, que directa o indirectamente regula la divisin celular. La protena PML regula negativamente el crecimiento celular e induce la supresin de tumores.
3.7. La sntesis y degradacin de macromolculas
La degradacin de determinadas protenas se encuentra el punto de control de diversos procesos biolgicos, algunos tan fundamentales como la progresin del ciclo celular. (Recuperado de: http://www.encuentros.uma.es/encuentros52/proteolisis.html. Mara Teresa Olmo Aparicio es becaria pre doctoral en el Departamento de Biologa Molecular y Bioqumica de la Universidad de Mlaga. Daniel Rodrguez Agudo es estudiante de 5 curso de Biologa). Las protenas se parecen a los intermedios metablicos de bajo peso molecular, en el sentido de que estn sujetas a una biosntesis y degradacin continua, en un proceso denominado recambio proteico. Para una protena intracelular cuya concentracin total no cambie con el tiempo, la concentracin de estado estacionario se mantiene mediante la sntesis de la protena a una velocidad suficiente para reponer las prdidas producidas por la degradacin de la protena. Muchos de los aminocidos liberados durante el recambio proteico se reutilizan en la sntesis de nuevas protenas. (Recuperado de: http://digitum.um.es/xmlui/bitstream/10201/6236/1/Proteolisis%20Intracelular%2 0Recambio%20Proteico.pdf. Protelisis Intracelular: Recambio Proteico. Jos Neptuno Rodrguez Lpez. ) 51 El periodo de vida de una protena es enormemente variable. Las protenas estructurales que forman parte de tejidos permanentes, como el hueso o el musculo pueden durar meses o incluso aos, mientras que otras protenas, como las enzimas metablicas y las que regulan el crecimiento, mitosis y la divisin de las clulas duran slo horas, das horas o incluso segundos. (Bruce Albert, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. (2011) introduccin a la Biologa celular, Mxico, Panamericano). Las clulas tienen vas especializadas que degradan enzimticamente a las protenas en sus aminocidos componentes (proceso denominado protelisis) las enzimas que degradan protenas, primero a pptidos cortos y por, ultimo, a aminocidos individuales, se conocen colectivamente como proteasas. La accin de las proteasas hidrolizan los enlaces pepiticos entre aminocidos. (Bruce Albert et al (2011) introduccin a la Biologa celular, Mxico, Panamericano). Una funcin de la va proteoltica es degradar con rapidez las protenas cuyo periodo de vida debe ser breve. Otra funcin es reconocer y eliminar a las protenas daadas o mal plegadas. Esto es crucial en el organismo, ya que trastornos neurodegenerativos, como las enfermedades de Huntington, Alzheimer y Creutzfeldt- Jacob, son causadas por la agregacin de protenas mal plegadas. En las clulas eucariontes, la mayor parte de las protenas degradadas son realizadas por maquinarias denominadas proteasomas. (Bruce Albert et al (2011) introduccin a la Biologa celular, Mxico, Panamericano).
52 Fig. 37.1 Degradacin de macromolculas Una proteasoma contiene un cilindro central formado a partir de proteasas cuyos sitios activos enfrentan una cmara interna. Cada extremo del cilindro esta obturado por un gran complejo proteico formado por no menos de 10 tipos diferentes de subunidades proteicas Estas actan sobre las protenas que han sido marcadas para su destruccin mediante una unin covalente de una protena denominada ubicuitina, determinadas enzimas marcan determinadas protenas con una o ms molculas de ubicuitina, despus estas protenas son reconocidas por el proteasoma y aspiradas hacia ella por las protenas de tapn. (Bruce Albert et al (2011) introduccin a la Biologa celular, Mxico, Panamericano). La protelisis puede contribuir al proceso de apoptosis por varios mecanismos, por ejemplo produciendo alteraciones estructurales, activando otras molculas las efectoras como pueden ser las endonucleasas o eliminando sustancia inhibidora de otras enzimas. El efecto de la protelisis en el ncleo puede ser diverso. La degradacin de la laminina B1 puede ocasionar el colapso d la cromatina al perder su fijacin en la matriz nuclear. Las proteasas pueden contribuir a la fragmentacin de DNA por activacin endonucleares. (Fisiopatologa Quirrgica. Jaime Arias; Mara ngeles Aller; Jos Ignacio Aria; Laureano Lorente. Editorial Tebar, 1999) 53 3.8. Discusin
Reyes Hernndez Carmen Sofa Paras las caractersticas principales del ncleo en la interface utilice diferentes bibliografas por ejemplo el tratado de anatoma y fisiologa Tortora menciona aspectos muy importantes sobre este tema, como el concepto general, y algunas de sus caractersticas sin embargo, el libro de Histologa de Leeson Ronald nos proporciona algunos aspectos importantes que en lo personal no encontr en otro libro como por ejemplo la medida del ncleo, que suele tener de 3 a 1 micras de dimetro y hasta 25 micras en el ovulo, pero el libro que ms me convenci es el Atlas de Histologa de Ross Pawlina, ya que aparte de mencionar las caractersticas principales del ncleo est muy completo en cuanto las caractersticas principales que presenta este en la interface. Por otro lado el libro de Histologa de Ross Michael nos muestra adems de una amplia informacin sobre el ncleo, como podemos diferenciar en in microscopio al ncleo por medio de una tincin, pero este tema no lo incluimos en la monografa ya que en el temario no se nos presenta como necesario por ahora. En el libro de fisiologa celular/ principios y conceptos de Alemn. Le gran importancia a la envoltura nuclear ya que por medio de ellas se llevan el transporte de micro y macromolculas desde el ncleo al citoplasma. Garca Damas Diego Jos Guadalupe: Lodish,Berk,Matsudaira,Kaiser Krieger,Scott,Zipursky & Darnell consideran que l las protenas no histonas proporcionan una armazn estructural para los bucles largos de cromatina: aunque las histonas son las protenas predominantes en los cromosomas, las protenas no histonas tambin estn involucradas en la organizacin de la estructura del cromosoma. Por su parte en la compactacin del DNA el Autor Fin Geneser muestra que las unidades estructurales cromatinicas ms pequeas son complejos macromoleculares de ADN e histonas llamados nucleosomas, Estos se encuentran tanto en la eucromatina como en la heterocromatina y en los cromosomas. Estas partculas de 10nm de dimetro representan el primer nivel de plegamiento cromatinico y se forman por el enrollamiento de la molcula de ADN alrededor de un centro proteico. Este 54 paso acorta unas siete veces la molcula del ADN en relacin con la molcula de ADN desplegada. El centro del nucleosomas consiste en ocho molculas de histonas y se les conoce como octamero histonico. Los autores de estos libros afirman las secuencias que se presentan en la formacin del plegamiento del DNA desde el punto de vista de las histonas y el nombre para sus unidades que es el nucleosomas. En el libro de bioqumica conceptos esenciales los autores Feduchi, Blasco, Romero, Yez explican mas detalladamente lo que son los nucletidos y nucletidos no solo enfocndose a su estructura de acuerdo a su composicin qumica sino que tambin nos habla de las numerosas funciones que desempean en el metabolismo a lo que en el libro introduccin a la biologa celular solo se limiten a la estructura qumica de cada uno de ellos. Hidalgo Lpez Juan Alberto. En comparacin de libros de anatoma la estructura del nuclolo solo lo encontr en libros de histologa, es de gran importancia identificar y aprender las distintas regiones del nuclolo ya que cada una tiene funciones diferentes. Dndole la importancia correspondiente a esta estructura es vital el conocimiento de este ya que es parte de una cadena que da origen a transformaciones u adaptaciones que necesitan las clulas en diferentes situaciones, Poot Pal Adriana Victoria: Mediante la lectura y el estudio de la degradacin en el ncleo pude apreciar que en diversas bibliografas nos brindan informacin ya sea ms completa o muy ambigua. Revisando la biografa del libro de Introduccin a la biologa celular de Bruce Albert et al (2011) Mxico, Panamericano). Nos habla sobre los procesos de la protelisis, sin embargo en el libro de Fisiopatologa Quirrgica. Jaime Arias; Mara Angeles Aller; Jos Ignacio Aria; Laureano Lorente. Editorial Tebar, 1999 nos habla del proceso a nivel nuclear, que es lo que nos importaba; las consecuencias que tiene si este proceso falla.
55 Bibliografas 1-(Lodish,Berk,Matsudaira,Kaiser Krieger,Scott,Zipursky & Darnell. (2012). Biologa Celular y Molecular. Estados Unidos: Medica Panamericana). 2-(Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. (2012). Introduccin a la Biologa Celular. Madrid Espaa: Panamericana). 3-Interna (ALEMAN, V. (2004). Fisiologa Celular y Molecular Principios y Conceptos. Ed. Hernndez, M.E y Ortega, A.). 4-. (Geneser, Finn. (2000). Histologa. Buenos Aires Argentina: Medica Panamericana). 5-(Bioqumica: conceptos esenciales; Elena Freduchi Canosa, Isabel Blasco Catieyra, Carlos Santiago Romero Magdalena, Esther Yaez Conde; 1 Ed.- Madrid: Medica Panamericana, 2010). 6-(Fisiopatologa Quirrgica. Jaime Arias; Mara ngeles Aller; Jos Ignacio Aria; Laureano Lorente. Editorial Tebar, 1999). 7-(Feduchi, Blasco, Romero, Yez. (2010). Bioqumica conceptos esenciales. Madrid, Espaa: Panamericana). 8-(Recuperado de: http://www.encuentros.uma.es/encuentros52/proteolisis.html. Mara Teresa Olmo Aparicio es becaria pre doctoral en el Departamento de Biologa Molecular y Bioqumica de la Universidad de Mlaga. Daniel Rodrguez Agudo es estudiante de 5 curso de Biologa). 9-cncer (Murray, Bender, Botham, Kennelly, Rodwell, Weil. (2013). Harper Bioqumica Ilustrada. Mxico DF: Mc Graw Hill).