ANLISIS DE PROTENAS EN GRNULOS Y HOJAS DE Acacia hindsii Y EN
HORMIGAS DE LA REGIN DE IRAPUATO
Ramrez Ramrez, G. (1) ; Heil, M. (2) ; Orona Tamayo, D. (2) ; Adame lvarez R. M. (2) ; Ramrez Ramrez, D.T. (3) ; Durn Flores, F.D. (1) (1) Facultad de Qumica Universidad Autnoma de Quertaro (2) Departamento de Ingeniera Gentica Centro de Investigacin y Estudios Avanzados, Campus Guanajuato (3) Facultad Ciencias Qumicas Universidad de Guanajuato
RESUMEN Se extrajeron protenas de hojas, grnulos de Acacia hindsii y hormigas de la regin por dos mtodos (fenol y TCA/Acetona) posteriormente se corri un gel SDS-PAGE al 13% para evaluar la calidad de las extracciones. El mtodo TCA/Acetona fue el que presento mayor limpieza y mejor calidad de protena. Se corrieron geles en dos dimensiones (2- DE) para grnulos con gradiente de pH 3-10 y 4-7, de los perfiles obtenidos, a las protenas se les asigno funcin e identidad por medio de bsquedas bioinformaticas en donde se uso como referencia el frijol soya (Glycine max), encontrando protenas de reserva que contienen aminocidos esenciales para insectos, con lo que podemos presuntivamente decir que esto ayuda a la interaccin planta-hormiga.
INTRODUCCIN Algunas plantas para defenderse cuentan con sistemas especializados como las espinas, produccin de gomas otras son venenosas o demasiados altas para los depredadores, a este tipo de defensa se le conoce como Defensa Directa, sin embargo existen a su vez las llamadas Defensas Indirectas, el termino se introdujo en la literatura hace 20 aos segn resume Heil, M. (2008) de Dicke y Sabelis, (1988). En la Defensa Indirecta la planta utiliza insectos para ahuyentar herbvoros o vegetacin competitiva que pueda ser daina para esta, a su vez proporciona al insecto algn tipo de recompensa, lo cual nos lleva a un mutualismo planta-insecto. En Mxico una de las plantas estudiadas que utiliza defensa indirecta es Acacia hindsii. Las Acacias son arboles o arbustos espinosos; son plantas mirmecoflicas (relacin planta-insecto, en este caso hormiga), a su vez existen Acacias mirmecoflicas que pueden ser mirmecofticas que son aquellas en la que existe un mutualismo planta-hormiga permanente (la planta proporciona alimento y casa y la hormiga a su vez defiende a la planta) o no mirmecoftica aquellas en las que el mutualismo se da solamente cuando la planta es atacada. Acacia hindsii es una planta mirmecoftica, la planta se encarga de proporcionar a la hormiga casa (espinas) y alimento (grnulos y nctar extrafloral), y a cambio la hormiga defiende a la planta contra herbvoros y vegetacin competitiva. Los grnulos (Food Bodies) son un tipo de hoja modificada que utilizan las hormigas para alimentarse, se encuentran en la punta de la hoja (Fig. 1). Los grnulos de Acacia contienen todos los aminoacidos y cidos grasos que son esenciales para los insectos; el contenido de lipidos y proteinas es mayor que en las hojas (Heil, M. y col. 2004) por lo que las hormigas prefieren este tipo de hoja modificada en lugar de la hoja normal. Para abordar esta idea, nos dimos a la tarea de Fig. 1. Grnulos en Acacia hindsii 1
separar extractos proteicos de granulos de A. hindsii por medio de 2-DE e identificar aquellas proteinas por medio de analisis bioinformatico y relacionar si existen proteinas con alguna relacion importante entre la interaccion planta-hormiga.
PARTE EXPERIMENTAL Extraccin de proteina. El material fresco fue molido en un mortero en presencia de nitrgeno lquido, se pesaron 15 mg de grnulos, 97 mg de hojas tomadas de A.hindsii cultivada en invernadero y 13 mg hormiga y se resuspendieron en 1 ml de buffer de extraccin fro (0.7 M de sucrosa; 0.1 M KCl; 0.5 M Tris-HCl, pH 7.5 y 50 mM EDTA, -mercaptoetanol al 2% y 1% de inhibidores de proteasas) y se adiciono un volumen igual de fenol saturado con Tris-HCl, pH7.5, se agito por 30 min a 4C y se centrifugaron a 7000 rpm por 30 min a 4C. A la fase superior se le adiciono un volumen igual de buffer de extraccin y se repitieron los pasos anteriores dos veces. Las protenas precipitaron con 5 volmenes de acetato de amonio en metanol 0.1 M fro, y se almacenaron a -20C. se centrifug por 30 minutos a 7000 rpm a 4C, la pastilla se lavo con 2 volmenes de metanol fro dos veces y se centrifugaron 10 minutos a 7000 rpm a 4C. Para el mtodo TCA/Acetona, el mismo peso de cada tejido fue extrado con el mismo buffer de extraccin (como arriba), se agito 30 min y se centrifugaron a 14000 rpm por 30 min a 4C, se colectaron los sobrenadantes y fueron precipitados com 1 ml de TCA/Acetona 10% y se incubo por toda la noche a -20C, se volvieron a centrifugar a 14000 rpm en frio, las pastillas fueron lavadas 5 veces con acetona/DTT (0.1%) y se corrieron en un SDS-PAGE al 13% .
Electroforesis en dos dimensiones. Aproximadamente 90-120 g de protena fueron solubilizadas en 125 L de buffer de rehidratacin (Urea 7M, Thiourea 2 M, CHAPS 2%, IPG Buffer 2%, Azul de bromofenol 0.0002%), la mezcla se coloco en una tira de 7 cm con gradiente de pH de 3-10 y 4-7 y se rehidrataron por 16 h continuas, despus de este tiempo, se corri el IEF a 12kVh. Para el SDS-PAGE, las tiras fueron equilibradas 15 min con Buffer de equilibrio (6 M urea, 75 mM Tris-HCl pH 8.8, 29.3% glicerol, 2% SDS, 0.002% azul de bromofenol y DTT 64 mM) y otros 15 min con el mismo buffer pero ahora con iodoacetamida 18.4 mM, posterior a esto, las tiras fueron corridas en un SDS-PAGE al 13%.
RESULTADOS
2
Fig.2. Comparacin de los dos mtodos de extraccin de protenas de grnulos (FBs), hojas (L) y hormiga(A) en un SDS-PAGE al 13%. Carriles: 1(FBs), 3(L) y 5(A) protenas extradas con fenol y 2(FBs), 4(L), 6(A) extradas con TCA/Acetona.
Gy1 Gy
Fig. 4. Gel de 2-DE de grnulos con gradiente pH 3-10 mostrando protenas de reserva (almacenamiento). Fig.3. Gel de 2-DE de grnulos con gradiente pH 4-7.
Fig. 5. Categorizacin funcional de protenas de grnulos de A. hindsii
DISCUSIN DE RESULTADOS A. hindsii es una planta mirmecoftica y con altos componentes recalcitrantes en sus diferentes tejidos, por lo tanto en nuestra investigacin, utilizamos dos mtodos para la extraccin de protenas de hojas y grnulos de la misma planta y de hormiga, como se puede observar en la figura 2, la comparacin de los extractos de protenas obtenidos con el mtodo con fenol, no fue viable, debido a que no pudimos apreciar patrones de bandeo en ninguno de los tejidos (carriles 1, 3 y 5), por otro lado, con el mtodo de TCA/Acetona, obtuvimos patrones de bandeo de buena calidad, cantidad y limpieza (carriles 2, 4 y 6). Nuestros resultados no son sorprendentes, debido a que Saravanan y col. (2004) extrajeron protenas con el mtodo de fenol de tejidos altamente recalcitrantes como jitomate, pltanos, naranjas y uvas, y obtuvieron buena calidad en la protena analizada, por lo tanto esto nos puede indicar que A. hindsii es una planta con mayores componentes recalcitrantes (polisacridos, sales, lpidos, compuestos fenlicos etc.) que las plantas mencionadas. Hasta la fecha, no se haba realizado un anlisis de protenas en A. hindsii, por lo que nos dimos a la tarea de separar los extractos obtenidos por medio de 2-DE (figuras 3 y 4), donde obtuvimos perfil y buena 3
separacin electrofortica de las protenas de grnulos de A. hindsii, sin embargo, las muestras separadas con pH de 3-10, fue imposible realizar un anlisis debido a la gran cantidad de protenas encontradas, para solucionar esto, las protenas fueron separadas por un gradiente de pH de 4-7, obtenindose manchas individuales de protenas lo que nos ayudo para realizar la bsqueda bioinformatica de las protenas ms abundantes, con esta bsqueda pudimos asignar la identidad y la categorizacin de las protenas de los grnulos (Figura 5) por medio de la base de datos de ExPASY, observando protenas involucradas en diferentes procesos celulares, resaltando aquellas protenas que son de almacenamiento, las cuales se creen que contienen los principales aminocidos y que concuerda con lo reportado por Heil, M. y col.(2004), que los grnulos contienen aminocidos esenciales para los insectos, sin embargo, se necesitan hacer mas estudios para apoyar completamente esta especulacin.
CONCLUSIONES Es importante que en la protemica comparativa puedan utilizarse protocolos que sean los idneos para la extraccin de protenas, por lo tanto cuando utilizamos el mtodo de extraccin por fenol y TCA/Acetona, el mtodo TCA/Acetona fue el ms efectivo para eliminar contaminantes, como lpidos, componentes fenlicos, pigmentos, polisacridos etc, y obtener una protena de calidad. Una segunda conclusin es que el protocolo de extraccin genero una buena separacin electrofortica de protenas en 2-DE y por ultimo existen circuitos bioqumicos que interaccionan propiamente en la produccin de protenas de reserva de los grnulos de A. hindsii y que son aprovechadas por las hormigas para su alimentacin. BIBLIOGRAFA Artculos: Heil, M., y col. Main nutrient compounds in food bodies of Mexican Acacia ant- plants, Chemoecology, 14, 45-52, 2004
Heil, M., Indirect defence via tritrophic interactions, New Phytologist, Vol. 178, Num.1, 41- 61(21), 2008.
Saravanan, R. S. and Rose, J.K.C., A crititical evaluation of sample extraction techniques for enhanced proteomic analysis of recalcitrant plant tissues, Proteomics 4:2522-2532, 2004.
Internet: Base de datos ExPASY. http://ca.expasy.org/cgi-bin/tagident0.pl
Manuales: Humana Press, Handbook of Proteomics Methods. 409-416. 2003
GE Healthcare, Handbook 80-6429-60AC,2-D Electrophoresis, Principles and Methods, 2004 4