Introduccin

Powdercell 2.3 para Windows es un programa basado en GUI (interfaz grfica de

usuario, es un tipo de interfaz de usuario que permite a los usuarios a interactuar con
dispositivos electrnicos con imgenes en lugar de comandos de texto) para explorar la
manipulacin de estructuras cristalinas y el clculo de los patrones de polvo. Es de libre
acceso para uso acadmico y no comercial.

PowderCell para Windows est pensado para realizar la simulacin del difractograma
que se obtendra en un experimento de difraccin de un material cristalino (mineral en
nuestro caso). Simultneamente, se realiza la visualizacin de la estructura cristalina
del mineral.

Tambin se pueden cambiar algunos de los parmetros que describen sus estructuras
cristalinas (parmetros de celda elemental, grupo espacial de simetra o coordenadas
de los tomos constituyentes) para estudiar cmo se modifica el difractograma
correspondiente. PowderCell es muy til para ilustrar de forma sencilla la relacin que
existe entre la estructura interna de un material cristalino y el diagrama de difraccin
(de rayos X o de neutrones).



























Objetivos

Conocer el uso del programa Powder Cell 2.3 for Windows e identificar las
principales funciones de los elementos de la aplicacin Powder Cell.

Crear y manipular una celda unitaria de cristales cbicos usando este programa
Powder Cell 2.3.

Identificar su principal funcin del programa por la que fue creada (difraccin de
rayos x).


































Marco Terico

POWDER CELL 2.3

El objetivo de PowderCell es en primer lugar una modificacin de la estructura intuitiva
por paso a paso manipulacin y una comparacin casi simultneo entre los datos
experimentales y el patrn de difraccin de polvo calculado.

En el segundo programa contiene procedimientos de refinamiento para adaptar los
datos experimentales y tericos de forma automtica. Desde nuestro punto de vista, se
recomienda disponer de una cscara fcil de usar, que se centra en los datos de
entrada slo es necesaria o la solucin de los problemas de difraccin de polvo
exclusivamente.

Sin embargo, esto no es una desventaja en particular una gran cantidad de informacin
interesante que el usuario es capaz de extraer, por ejemplo, relativa a la simetra del
cristal o composicin de fase, tamao de grano, tensin, etc.








La captura de pantalla muestra el equipo del programa. Tenga en cuenta que usted es
capaz de trabajar con ms de una estructura de forma simultnea.



La interaccin entre una estructura de manipulacin (torsin de un fragmento de
molcula) y el diagrama del polvo resultante. En aras de la simplicidad slo una
molcula ha demostrado.


Con la ayuda de PowderCell que son, por ejemplo para poder:

Utilizar diferentes formatos de importacin de datos de estructura (ICSD,
SHELX, CELULAR EN POLVO).

Visualizar estructuras cristalinas con ms de 740 configuraciones diferentes
tipos de grupos en el espacio.

Transformar los diferentes ajustes para monoclnico, ortorrmbica y grupo
espacial rombodrica tipo en otro.

Generar toda klassengleiche y subgrupos translationengleiche - una herramienta
excelente para la investigacin de las transiciones de fase u otros efectos
descritos por una disminucin de la densidad de simetra.

Variar la disposicin de la estructura dentro de la celda unitaria mediante
rotacin y traslacin de los tomos o molculas seleccionadas antes.

Mostrar la correspondiente radiografa de neutrones o los patrones de difraccin
de polvo de forma simultnea para un mximo de 10 fases.

simular diferentes condiciones de difraccin, por ejemplo, la radiacin, la divisin
doblete, geometra de difraccin, ranuras variables, la orientacin preferida, la
dispersin, el volumen de cualquier anmalo o fracciones de masa en una
mezcla de fases, etc.

Seleccionar diferentes funciones de convolucin.

Comparar difractogramas experimentales y calculados grficamente y / o usando
los valores R.

Exportar la estructura cristalina y el patrn de polvo simulado en diferentes
formatos grficos (por ejemplo, Windows Metafile, PostScript, POVRay ).

Utilizar el portapapeles para pegar grficos y tablas reflexin en otros programas
de Windows.

Exportar los patrones de difraccin en diferentes formatos de archivo (por
ejemplo, Siemens DIFFRAC EN:. * cruda).

PowderCell 2.3 ofrece nuevas caractersticas interesantes, como por ejemplo:

Extensa visin general de todas las posiciones atmicas generadas, los ngulos
de unin y las distancias, el espacio-grupo de informacin (posiciones generales
y especiales, notacin Wyckoff, la lista de todos los subgrupos mximo incl.
transformacin del eje de unidad mvil y cambio de origen).

Refinamiento automtico de datos de difraccin de polvos experimentales y
simulados utilizando polinomio antecedentes, factores de escala, la variacin de
constantes de red, cambio de cero, la ampliacin de la reflexin, la funcin de -
convolucin, orientacin preferida.

Clculo del tamao y la cepa.

Regiones excluidas en los patrones de difraccin experimentales.

Anlisis cuantitativo fase.

Descomposicin de reflexiones para una estimacin de la amplitud de la
estructura con respecto a anlisis de la estructura de datos en polvo (algoritmo
LeBail).


Difraccin de rayos X:
El descubrimiento de los rayos x y su difraccin por los cristales supuso un gran
avance del conocimiento cientfico. Toda sustancia con un orden interno produce un
diagrama de difraccin de rayos x nico. Si hubiera ms de una sustancia en un mismo
cristal, cada uno mostrara su diagrama independiente de las otras.
Los rayos x fueron descubiertos en 1895 por Rntgen, por ello le concedieron el Premio
embargo, esa radiacin era mucho ms penetrante que la luz y poda atravesar el
cuerpo humano, la madera, piezas delgadas de metal, etc. Esta propiedad encontr
inmediatamente aplicacin en la obtencin de radiografas: las porciones menos
densas de un material dejan pasar la radiacin X en mayor proporcin que las ms
densas: de esta forma es posible localizar la posicin de una fractura en un hueso o
una grieta en una pieza metlica. Nobel en 1901. l pens que no tenan nada que ver
con la luz, ms tarde se demostr que los rayos x son otra onda electromagntica ms,
como los rayos ultravioleta, los gamma, las ondas de radio o la luz visible.
Recibi ese nombre (rayos x) porque se desconoca su naturaleza en ese momento. A
diferencia de la luz ordinaria, esa radiacin era invisible pero viajaba en lnea recta y
ennegreca las pelculas fotogrficas de manera similar a como lo haca la luz.














El detector de rayos x va formando un arco sobre la muestra para detectar las
diferentes intensidades difractadas. Este detector electrnico se basa en la capacidad
de ionizacin de los rayos x. Antiguamente se usaba como dispositivo para detectar los
rayos x, una pelcula fotogrfica. En el difractograma de rayos x veremos una serie de
picos a diferentes ngulos y con una intensidad determinada.





Materiales

Computadora personal
Software PowderCell 2.3 for Windows

Procedimiento

En el programa powder cell podremos obtener la visualizacin de la estructura cristalina
de un material.

Para poder empezar a visualizar la estructura buscamos en las opciones y damos click
en FILE -> NEW la cual nos aparecer una ventana en la cual ingresaremos datos
como la constante de red de la estructura y los ngulos de la celda.

Para ingresar los elementos qumicos hacemos el uso de los nmeros atmicos los
cuales sern visto en una tabla peridica del programa, ya encontrado el nmero
atmico del elemento necesario procederemos a ingresar las coordinas de la posicin
de este y as sucesivamente ingresaremos los elementos necesarios para la estructura
cristalina del material.

























Cuestionario

1.- Identificar los elementos de la pantalla principal del programa PowderCell 2.3



1) la barra de ttulo:

Esta barra nos muestra el nombre del programa, as como la direccin donde se
encuentra guardado el archivo.


2) la barra de mens:

Donde encontramos los mens: archive, estructura, seleccin, opciones, difraccin,
Windows, especial, ayuda.


4) barra de herramientas o la barra de instrumento superior.



Esta barra puede llamar las funciones ms importantes usando botones especiales

4) Barra de instrumento para influir en la representacin de una estructura


Esta barra nos presenta diferentes botones con funciones como girar, rotar o aumentar
y disminuir una estructura, mostrar sus coordenadas, los smbolos las distancias de los
tomos. Etc.

2.- En relacin a la pregunta 1, describir las funciones principales de los mens:

FILE: este men tienes las funciones de guardar o abrir un archivo ya existente, o crear
un nuevo archivo, as como cerrarlo.

STRUCTURE.-este men nos da funciones de toda la estructura, como una proyeccin
plana de tal, representacin de lmites; muestra los grupos y subgrupo. Etc.

SELECT.- tiene las funciones de seleccionar un tomo, una molcula y su rango o
seleccionar toda la figura de un cristal que se est representando, as tambin tiene las
funciones de deshacer o borrar lo seleccionado; y tambin de mover los tomos
seleccionados.

OPTIONS.- este men tiene las funciones: mostrar la barra de smbolos, mostrar la
representacin de una estructura (de un elemento qumico) muestra su nmero
atmico, radio, etc.

DIFFRACTION.- como su nombre indica, este men tiene que ver con todo
relacionado a la difraccin de una estructura, como tenga que ver con clculos de
difraccin.


WINDOWS.- este men tiene las funciones de cmo mostrar las ventanas abiertas en
el programa, ya sea en forma cascada, o mostrando el ttulo de una ventana as como
cerrar las ventanas abiertas.

SPECIAL.- contiene funciones especiales al tratar una estructura de un cristal.

HELP.- este men tiene las ayudas para las funciones describiendo las funciones o
actividades que describe cada botn para el uso del programa, as tambin nos
describe y presenta el programa.

3.- Identificar y describir las funciones de cada uno de los iconos de acceso
directo de la barra de herramientas.





1. Abrir un fichero existente. Estos pueden tener las extensiones cel., res o ins.
2. Introducir datos cristalogrficos manualmente, parmetros e celda, grupo espacial y
coordenadas atmicas.
3. Obtener informacin sobre el grupo espacial y la estructura cristalina representada.
4. Activar o desactivar la ventana de representacin de la estructura cristalina.
5. Cambia el aspecto de la estructura tamao color de los tomos, tipos de enlace, etc.
6. Activa ventana con informacin sobre sobre coordenadas atmicas, distancias y
ngulos de enlace y ngulos de torsin entre tomos seleccionados.
7. Activa una ventana con las distancias mximas y mnimas de enlace entre dos tomos
seleccionados.
8. Cambia de posicin (sus coordenadas atmicas) el tomo seleccionado.
9. Controla el nmero de celdas unidades que deseadas representa.
10. Permite proyectar la estructura sobre un plano (hkl) determinado.
11. Activar o desactivar la ventana de difractograma simulado.
12. Obtener informacin sobre las condiciones de simulacin del experimento radiacin
utilizada, intervalos, geometra del difractometro, etc.
13. Acceso a los parmetros que controlan la forma de los mximos de difraccin.
14. Listado de los ndices de Miller (hkl) de los mximos de difraccin.





15. Rotaciones de la representacin de la estructura segn diferentes ejes.
16. Angulo de rotacin a utilizar al pulsar sobre los iconos n 15.
17. Representa el par estereoscpico de la estructura cristalina.
18. Representa nicamente la unidad asimtrica de la estructura cristalina.
19. Representar o esconde los ejes del cristal.
20. Muestra o esconde los enlaces interatmicos.
21. Borrar la representacin excepto la celda unidad y los ejes.
22. Mostrar o esconder la celda elemental.
23. Regresar a la vista inicial de la estructura cristalina.
24. Obtener informacin acerca de las distancias de enlace interatmicos
representados.
25. Incluir etiquetas con los nombres de los tomos.
26. Desplazamiento en diferentes direcciones en la representacin del
difractograma.
27. Calcular el diagrama de difraccin suma, simula el difractograma de una
mezcla de fases.
28. Representacin los diagrama de difraccin de cada una de las fases
individuales.
29. Controla la informacin a colocar sobre cada mximo de difraccin.























4.- Considerando que el ClNa tiene una estructura cubica de constante de red de
5.63 A, que contiene cuatro tomos de Cl en las posiciones de 000, 0, 0
y 0 y cuatro tomos de Na en las posiciones , 0 0 , 0 0 y 0 0
construir la celda.

Habiendo seguido los pasos del procedimiento y luego de introducir los datos nos
mostrara la siguiente tabla:


















La cual nos mostrara la siguiente estructura cristalina.



ESTRUCTURA CRISTALINA ClNa
















5.- Construir la celda unitaria del CsCl en cuya estructura existe solo una
molcula por celda, con tomos Cs en los vrtices 0 0 0 y tomos de Cl en las
posiciones centradas en el cuerpo de la re espacial cubica simple y
constante de red 4.11.

Introduciendo datos.





ESTRUCTURA CRISTALINA CsCl
















4.- Construir la celda unitaria del ZnS, en cuya estructura existen cuatro
molculas de ZnS por celda, con tomos de Zn en las posiciones 000, 0 , 0
, 0 y tomos de S en las posiciones , , , de la red
espacial cubica cara centrada y constante de red 5.41 A.

Introduciendo datos






ESTRUCTURA CRISTALINA ZnS

















7.- De lo observado en el laboratorio 1, qu similitudes y diferencias encuentra
usted entre los programas Powdercell 2.3 y CaRIne Crystallography 3.0?

CaRIne Crystallography 3.0 Powder Cell 2.3

El CaRIne Crystallography 3.0 es
una herramienta informtica que
permite la creacin, visualizacin y
modificacin simulada de
estructuras cristalinas. Realiza
diversos clculos cristalogrficos de
los diferentes modelos simulando
una variedad de condiciones
experimentales

Unas de las tantas funciones para
usar en el CaRIne Crystallography
3.0 son:

Controlar la apertura o creacin de
celdas cristalogrficas.
Controlar la rotacin de las celdas
para un mejor visualizacin de los
planos cristalogrficos.
Controlar la traslacin de los planos.
Calcular las distancias entre los
tomos de las celdas.
Calcular el ngulo entre las
direcciones de los planos.
Calcular el volumen y la densidad
de la celda unitaria.
Crear proyecciones estereogrficas.
Crear registros de difraccin de
rayos x para diferentes longitudes
de onda.
modificar el cristal.
La creacin de un cristal.
Aadir tomos.
Estudiar las relaciones entre la
orientacin de los cristales.





El programa PowderCell 2.3 est pensado
para realizar la simulacin del
difractograma que se obtendra en un
experimento de difraccin de un material
cristalino (mineral en nuestro caso).
Simultneamente, se realiza la
visualizacin de la estructura cristalina del
mineral.

Tambin con ayuda de este programa se
pueden cambiar algunos de los
parmetros que describen sus estructuras
cristalinas (parmetros de celda elemental,
grupo espacial de simetra o coordenadas
de los tomos constituyentes) para
estudiar como se modifica el difractograma
correspondiente. PowderCell es muy til
para ilustrar de forma sencilla la relacin
que existe entre la estructura interna de un
material cristalino y el diagrama de
difraccin (de rayos X o de neutrones).

Adems, PowderCell permite realizar un
estudio bastante completo de un modelo,
ya que :
Calcula los parmetros geomtricos
generales de la estructura (distancias y
ngulos de enlace, ngulos de torsin
interatmicos, etc) o de los tomos.
Este programa es incluso, puede variarse
interactivamente la disposicin espacial o
la naturaleza qumica de los tomos
seleccionados en la estructura, y analizar
los cambios que ello provocara en el
diagrama de difraccin.


Resultados

Se observa la distribucin de una celda unitaria la cual es ms espaciada para
el estudio de difraccin de rayos x.

La estructura cristalina mostrada observa tomos del mismo tamao no toma en
cuenta los radios atmicos.
Nos da un mejor estudio detallado del difractograma.

Conclusiones

Mediante este programa se puede observar que la estructura del cristal esta
mejor definida y ms espaciada con ms orden aunque este no sea su real
estructura ya que este programa est ms definido para la experimentacin de
difraccin de rayos

Se logr obtener las diferencias y semejanzas entre dos aplicaciones (carine y
poder cell) para la simulacin de una celda unitaria, destacando powder en una
funcin creada nicamente para el profundo anlisis de una celda unitaria
cuando se le somete a una difraccin de rayos x obteniendo de ella las
distancias entre los tomos, el clculo de los ngulos entre planos, su simetra,
dando una imagen en donde se podra visualizar la estructura de un mineral.

No olvidando que el carine que solo se enfoca ms en el anlisis de las celdas
unitarias.

Bibliografa

http://www.ehu.es/imacris/PIE05/web/PowderCell.htm#ficheroPwC
http://www.upct.es/~dimgc/webjoseperez/DOCENCIA_archivos/Aplicaciones_DR
X_Apuntes_y_ejercicios.pdf
http://www.spanishminerals.com/articlelosrayosxysudifraccionporloscristales.htm