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TD1 Prof. A.

EL MEZIANE
Universit Cadi-Ayyad
FST Marrakech
Dpartement de Biologie
TD1 Structure et Rplication du Matriel Gntique
1. Comment lADN pourrait-il remplir les exigences attendues dun matriel gntique
2. Schmatisez la structure de dACG et indiquez clairement les extrmits 5 et 3.
Comment les diffrentes composantes sont-elles lies entre elles.
Schmatisez le brin complmentaire et montrez les liaisons hydrogne entre les bases
apparies (Schma des bases).
3. Ecrire la squence complmentaire CGGGACCCTTAAC?
4. Dans une molcule dADN simple brin, la quantit de G est le double de la quantit de A
alors que la quantit de T est trois fois suprieure celle de C. Egalement, le rapport
pyrimidine/purine est de 1,5/1. Quelle est la composition de cet ADN en base ?
5. On vient de dcouvrir une nouvelle souche bactrienne. Son gnome contient 4,4 x 10
6
pb.
Quelle est la masse de lADN dans une bactrie en fg? (1 fg = 10
-15
)
Quelle est la taille de lADN compltement tir ?
6. Le gnome humain contient 3 milliards paires de bases.
a. Si le pourcentage de la guanine est de 21%, Dterminer le pourcentage de
chacune des trois autres bases ?
b. Sachant que le poids molculaire d1 nuclotide est 330 g/mol, quelle est la masse
de lADN en pg dans une cellule dpiderme ?
c. Quelle est la longueur en cm de cet ADN sil est compltement tir ?
7. On chauffe des solutions de 2 ADN diffrents (A) et (B) et on mesure leur absorbance
260 nm en fonction de l'lvation de temprature. Les rsultats sont prsents sur le
graphique suivant.

a. Que signifient les diffrences enregistres pour les ADN A et B 40 C ?
b. Que traduit l'augmentation de l'absorbance lorsque la temprature s'lve ?
c. L'un des ADN possde 20% de bases A, et l'autre 20% de bases G. Retrouvez la
composition des ADN (A) et (B).

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8. Un certain nombre de facteurs influence le comportement dune molcule linaire dADN
double brin dans une solution de chlorure de sodium 0,25M. Expliquez chacune des
observations suivantes :
a. Le Tm augmente proportionnellement la longueur de la molcule.
b. Lorsque la concentration de chlorure de sodium diminue, le Tm diminue.
c. La renaturation des simples brins en double brin se produit plus rapidement
lorsque la concentration en ADN est augmente.
9. La valeur de Tm dADN en C peut tre calcule en utilisant la formule simplifie du Tm:
Tm = 69,3 + 0,41 (G+C)
o G+C reprsente le pourcentage molaire de guanine + cytosine
a- Quel est le Tm dun chantillon dADN E. coli contenant 50% de G+C. ?
b- Les courbes de fusion pour la plupart des molcules naturelles dADN montrent
des Tm suprieures 65C. Pourquoi cela est-il important pour la plupart des
organismes ?
10. Certaines protines qui interagissent avec lADN double brin, se fixent sur des squences
spcifiques dADN.
a- Pourquoi est-il peu vraisemblable que ces protines interviennent en dtectant les
diffrences de diamtre de lhlice ?
b- Quelles autres caractristiques de la double hlice pourraient tre reconnues
spcifiquement par ces protines ?
11. Certaines DNA Binding Proteins (protines capable de se fixer sur lADN) sont
constitues de deux sous-units de reconnaissance a-hlicodales qui sont relies par un
axe de symtrie dordre 2 et spares dune distance de 34 .
a- ces protines se fixent-elles sur un ADN simple brin ou double brin ?
b- ces protines se fixent-elles prfrentiellement sur un ADN de forme A, B ou
Z ?
c- expliquez comment ces protines interagissent avec lADN.
12. Pourquoi les mutants de lADN polymrase I (polI) sont plus sensibles la lumire
ultraviolette que les souches sauvages ?
13. Lactivit de lADN polymrase I ncessite-elle :
a- Une matrice
b- Une amorce avec un groupement 5-hydroxyle libre
c- dATP, dCTP, dGTP et dTTP
d- ATP
e- Mg
2+

14. Supposons un mutant bactrien rplique son ADN une vitesse extrmement faible. Ce
mutant possde des activits totalement normales des ADN polymrases I et III, de
lADN gyrase et de lADN ligase et produit galement des quantits normales des
protines dnaA, dnaB, dnaC et SSB. La squence nuclotidique de la rgion oriC du mutant
est la mme que celle du sauvage. Quel dficit pourrait-il causer la diminution de la
vitesse de rplication chez le mutant ? Expliquez brivement.