1.- suelo y agua: SUELO: Los microorganismos son los componentes ms importantes del suelo. Constituyen su parte viva y son los responsables de la dinmica de transformacin y desarrollo. La diversidad de microorganismos que se encuentran en una fraccin de suelo cumplen funciones determinantes en la transformacin de los componentes orgnicos e inorgnicos que se le incorporan. Esto permite comprender su importancia en la nutricin de las plantas al efectuar procesos de transformacin hasta elementos que pueden ser asimilados por sus races. La humificacin de la materia orgnica es un proceso netamente microbiolgico. La microflora del suelo est compuesta por bacterias, actinomicetos, hongos, algas, virus y protozoarios. BACTERIAS: Los suelos agrcolas que estn sometidos a la mecanizacin continua, al monocultivo, al riego, a la aplicacin de agroqumicos y fertilizantes de sntesis, a la compactacin y a las quemas, tienen una flora microbiana muy baja que afecta su fertilidad. Las bacterias benficas del suelo son indispensables para recuperar la estructura perdidad por las practicas agrcolas, para hacer disponibles los nutrientes que hay en el suelo y para incorporarle la materia organiza que necesita para mejorar la fertilidad. Entre los gneros bacterianos ms importantes agrcolamente por la transformacin de los compuestos orgnicos e inorgnicos y que favorecen la nutricin de las plantas estn: Bacillus, Pseudomonas, Azotobacter, Azospirillum, Beijerinckia, Nitrosomonas, Nitrobacter, Clostridium, Thiobacillus, Lactobacillus, y Rhyzobium. ACTINOMICETOS DEL SUELO: Se nutren de materiales orgnicos (hetertrofos). Degradan desde azcares simples, protenas, cidos orgnicos hasta substratos muy complejos compuestos por hemicelulosas, ligninas, quitinas y parafinas. Por esto son importantes en el proceso de transformacin hasta la obtencin del humus en el suelo. Adems son considerados como los mejores agregadores del suelo, pues son muy eficientes produciendo sustancias hmicas. Los gneros de actinomicetos del suelo ms importantes para la nutricin de las plantas son: Streptomyces, Nocardia, Micromonospora, Thermoactinomices, Frankia y Actinomyces. HONGOS DEL SUELO: Los gneros de hongos ms importantes asociados a las races de las plantas son Aspergillus, Penicillium, Rhizopus y Trichoderma. El Aspergillus y el Penicillium movilizan el fsforo y el nitrgeno del suelo. El Trichoderma sostiene la humedad en las races en condiciones de sequa. Algunas levaduras son importantes fermentadoras de carbohidratos produciendo alcoholes que son utilizados por otros microorganismos como fuentes de energa. Entre los gneros ms importantes estn el Saccharomyces y el Rhodotorula.
AGUA: AGUA POTABLE: De los muchos microorganismos infecciosos que se encuentran en el medio ambiente, en el agua se pueden hallar bacterias (como Shigella, Escherichia coli, Vibrio y Salmonella), virus (como el virus Norwalk y rotavirus) y protozoos (como Entamoeba, Giardia y Cryptosporidium). Estos microorganismos pueden provocar sntomas como nuseas, vmitos, diarrea y calambres estomacales. En las personas adultas con un buen estado de salud, estas enfermedades suelen ser leves y duran poco tiempo. En bebs, nios, ancianos y personas con el sistema inmunolgico deprimido, pueden revestir mayor gravedad
Escherichia coli enteropatgena Yersinia enterocolitica Leptospira spp. Virus Enterovirus ( 71 tipos ) ( polio, echo, Coxsackie ) Virus de la hepatitis A Adenovirus ( 31 tipos ) Rotavirus
Parvovirus ( 2 tipos )
2.-plantas y productos vegetales: Control biolgico de algunos patgenos de diversas plantas utilizando rizo bacterias como agentes supresivos PATGENO CULTIVO Bacterias: Erwinia carotovora Erwinia tracheiphila
Pepino Tomate 3.-tracto intestinal del hombre y animales: Areas que generalmente albergan microorganismos. La parte del tuvo digestivo que invariablemente alberga microorganismos es el intestino grueso, aunque ocasionalmente tambin pueden recuperarse de leon bajo en sujetos normales.
4.-manipiladores de alimento Principales microorganismos patgenos que se pueden encontrar en los alimentos ESCHERICHIA COLI Es un husped constante del intestino del hombre y animales de sangre caliente. Ocasionan pocas toxiinfecciones alimentaras, pero su presencia elevada en los alimentos, evidencia contaminacin fecal reciente, ya que mueren pronto fuera del intestino por lo que se utilizan como indicadores de calidad higinica. SALMONELLA La Salmonella se encuentra de forma natural en el intestino del ser humano y de los animales; por ello, las heces son foco de contaminacin de los alimentos y el agua. STAPHILOCOCOS AUREUS Estas bacterias, Staphylococcus aureus, se encuentran de forma natural en nuestra piel, nariz, boca y manos y son un foco de infeccin especialmente importante los cortes en las manos, las heridas infectadas y los flemones. ESTREPTOCOCOS FECALES El hbitat normal de estos es el tubo digestivo de animales de sangre caliente. Son indicadores de contaminacin fecal, por lo que su presencia en los alimentos indica falta de higiene o defectuosas condiciones de conservacin, excepto en alimentos en los que interviene como flora bacteriana natural de procesos fermentativos, como es el caso de quesos, embutidos crudos e incluso productos crnicos. CLOSTRIDIUM SULFITO REDUCTORES El botulismo es una enfermedad producida por las toxinas de un microorganismo anaerobio (vive en ausencia de oxgeno) productor de esporas, Clostridum botulinum, presente en la tierra y en aguas prximas a la costa en muchas regiones del mundo BACILLUS CEREUS Se encuentran en el suelo, polvo y aguas no potables. Los alimentos implicados son principalmente las carnes picadas y embutidos de hgados contaminados, con partculas de tierra o suciedades de polvo con bacillus. SHIGELLA Se encuentran en manipuladores enfermos o portadores, transmitindose a los alimentos durante su manipulacin, bien sea por contacto directo o indirectamente por agua contaminada por el hombre. Por lo que habr que tener especial cuidado con el agua usada en la manipulacin, que sea potable y est debidamente clorada.
YERSINIA Germen que en condiciones de refrigeracin es capaz de ser activo. Puede encontrarse en carne de porcino, vacuno, pollo y productos crnicos. CAMPILOBACTER Frecuentemente lo encontramos en el intestino de cerdos y aves. 22 ESTREPTOCOCOS FECALES Se encuentran disperso en todos los seres vivos (plantas, animales, insectos...) y sustancias inertes (agua, polvo, tierra...).