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Agora des savoirs.

Montpellier 18/11/ 2009 M-C Maurel

Les origines de la vie

Marie-Christine Maurel
marie-christine.maurel@upmc.fr

http://anbiophy.snv.jussieu.fr

Agora des savoirs. Montpellier 18/11/ 2009 M-C Maurel

Depuis quand y-a-til de la vie sur Terre?


Trouve-t-on des traces de vie ancienne?
O et quelles traces?
Quest-ce qui est ncessaire la vie ?
Quelle est la plus petite unit du vivant ?
Quelles sont les formes limites? les limites des mtabolismes?
Quelles sont les pistes scientifiques permettant
comprendre nos origines?

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Microfossiles Prcambrien,
ressemblent aux cyanobacteria
modernes (alignements de
cellules).

Modern Lyngbya

From Schopf

Fossil Palaeolyngbya ~ 950 Ma-old (Lakhanda formation :


Siberia, Russia et Bitter Spring, Australia) Hermann 1981

~3,465 Ma-old

W. Schopf, Nature,
Nature, 1998

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own
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Mycoplasma genitalium

480 genes

265-350 genes

Systme vivant
minimal
Mycoplasma laboratorium

Craig Venter et al

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-up
m
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t
bo

Briques lmentaires du vivant

Fonctions biologiques

Complexit biologique

Extrait de La naissance de la vie, MC Maurel, Dunod, 2003

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Stanley Miller

Oparin

Haldane

Soupe Prbiotique (ocan primitif)


Briques lmentaires du vivant
dans latmosphre primitive.

Cellules primitives (coacervats)

N + CH4 ---> HCN + 3/2 H2


et CH4 + H2O ---> HCHO + 2H2

Acides amins

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From A. Lazcano

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Coacervats
Maurel 1979

Vsicules

Zepi k, Rajamani , Maurel, Deamer, 2007

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Joan Oro

from Lazcano

5 HCN
Extrait de La naissance de la vie, MC Maurel, Dunod, 2003

adnine

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Sources hydrothermales
(3000m sous la mer)

Ifremer

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Sources sulfureuses Yellowstone (USA)


Photos Martine Dombrosky

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M

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Aucune de ces 2 hypothses


ne peut tre rejete demble.
NH3

CH4
HCN
Matire organique
extraterrestre

pyrite

soupe primitive
From Lazcano

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Life has developed its processes gradually, never rejecting


what it has built, but building over what has already
taken place. As a result the cell resembles the site of an
archeological excavation with the successive strata on top of
one another, the oldest one the deepest
Szent-Gyorgyi, 1972

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Les molcules biologiques > structures historiques


Une histoire biochimique lie les premiers cycles mtaboliques
au mtabolisme actuel

Evolution darwinienne
Rplication productive

Exprimenter in vitro les concepts de lvolution biologique

gnration de nouvelles
molcules ou re-mergence
de molcules disparues.

Etude de voies biochimiques fossiles


Mimer des cycles de slectionamplification-mutation.

Nothing makes

sense in biology,

but in the light of evolution


(1973) Theodosius Dobzhansky

-----> aptamres partir


dune population initiale de 1030
variants!
SELEX: Systemati c Evoluti on
of Li gand by Exponenti al Enri chment

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Fo

ADN

Imaginer lmergence spontane et

simultane des acides nucliques et des


protines .?

ARNs

Concevoir lapparition spontane et

Compartiment

simultane de la relation de codage


entre acides nucliques et protines?

Protines
Rseau pigntique
(temps, environnement,
lipides, sucres, etc.)

Ribozymes > ARN gnotype et phnotype


Hypothse du Monde de lARN qui aurait
prcd le monde actuel bas sur lADN et les

Fonctions

Extrait de MC Maurel, sous presse, 2010

protines

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Monde ARN pisode de lHistoire Naturelle du vivant?


Loop

Non-paired
segments

Bulge

Loop Hairpin:
ds in helix
(pairings)

Nobel
1989

Hairpin
with loop

T. Cech

S. Altman
ARN ribosomal qui catalyse la formation
du lien peptidique (Moore & Steitz, 2002)

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Nobel
2006
Andrew FIRE et Craig MELO
Prix Nobel de Physiologie et de Mdecine .
ARN interfrence
Roger KORNBERG .
Prix Nobel de Chimie.
Structure de lARN polymrase II.

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Nobel
2009
Elucidation of Ribosome
Structure and Insight into
the Translation Mechanism
Venkatraman
Ramakrishnan

Thomas
A. Steitz

Ada
E. Yonath

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Le Monde ARN
un pisode de lHistoire naturelle ?
Hypothses
1/ A une certaine poque, au cours de lvolution,
la continuit gntique fut assure par la rplication
de lA RN.
2/ La rplication reposait sur des liaisons faibles (appariements type
Watson-Crick).
3/ Les protines gntiquement codes ntaient pas impliques dans la
catalyse qui tait assure par des petits peptides et des ribozymes
(A RN).

Faits
Replication : amorces ARN, Ribonuclotide rductase, U--->T
Cofacteurs Ribonuclotidiques
(AMP, FAD, NAD, CoA, etc.)
Ribozymes, tRNA, tmRNA, ncRNA
Ribosome

ARN avant lADN


ADN = ARN modifi

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LARN serait apparu avant lADN


Existe-t-il des organismes qui ne contiennent
que de lARN?

Aux frontires du vivant les virus ARN,


les virodes, les ARN satellites?

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Les virus
Les virus contiennent de lADN et/ou de lARN
10 000 virus seulement sont connus !
Plus de 1031 virus diffrents existeraient sur Terre soit une diversit
bien suprieure celle cumule des 3 domaines du vivants.
Le parasitisme nest pas lapanage des virus (existe aussi chez certaines
bactries)

Le Mimivirus (Didier Raoult) a de


nombreux gnes qui nont aucun
homologue dans les 3 domaines du
vivant:
origine indpendante ---> 4me
branche dans larbre du vivant celle
des Girus (Giant Virus)?

Sont susceptibles de variabilit gntique et peuvent donc voluer


Ne sexpriment que quand les conditions sont favorables ( la faon dune graine)
Daprs Pour la Science, 2006

Certains virus changent de


forme en dehors de tout
contexte cellulaire (virus ATV)

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Aux frontires de la vie les virodes


Les plus petits agents pathognes des
plantes

ARN circulaire en simple brin compos

de 246-574 nuclotides
structure en tige, pas denveloppe, ni de
capside

PSTVd: Potato Spindle Tuber Viroid

ARN catalytique assure la rplication

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Motifs catalytiques

Virodes
--------> fossiles vivants

de lvolution pr-cellulaire ?

From Ferr dAmar

Structure en pingle cheveux qui permet aux virodes de


se rpliquer cest--dire de reproduire leur propre gnome

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Prebiotic world

Genetics first

Biochemical monomers
Macromolecules and pre RNA World
eR
In s id e t h

N A w o rl

RNA World
Protocells, Ribocytes,
RNA/DNA world, others?

LARN a-t-il pu exister seul ?


LARN rsiste-t-il dans des conditions primitives: tempratures extrmes, pH extrmes ou hautes
pressions?

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http://anbiophy.snv.jussieu.fr
Motifs ARN des virodes sont actifs

Ifremer

Hautes pressions (up to 200 MPa)

Hautes tempratures : 80-90C

Hydrothermal vents : 40 MPa


120 MPa (Philippine Pits).

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Virodes
fossiles vivants
de lvolution pr-cellulaire ?
Continuum entre :
monde ARN, virodes, virus et lignes cellulaires ?

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