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Physiologie Animale.

TD n2 :

La flore Digestive chez lHomme.


100 milliards de bactries rparties en 400 espces diffrentes. Cela donne une biomasse
considrable qui se traduit par la production denzymes et de mtabolites in vivo.
Cest un cosystme intgr avec des interactions.

I\ Rpartition.
On a une variabilit selon : les segments (tages) du tube digestif, la teneur du milieu en
O2, les scrtions du tube digestif, les nutriments disponibles, la vitesse de transit (rapide
jusquau caecum, puis ralentie).
Globalement, on a un gradient oral/aboral.
La bouche prsente peu de flore qui est peu active car le temps buccal est court.
Lestomac a une flore faible adapte un pH trs bas (moins de 10^3)
Lintestin grle prsente une variabilit quantitative (duodnum : 10 3 ; jjunum : 10 4 10
6 ; ilon : 10 6 10 8) et une variabilit qualitative par la diminution progressive des bactries
arobies au profit des bactries anarobies strictes.
Le colon est un milieu o le contenu est ralenti : il y a une stase et une augmentation de la
population bactrienne (10 9 10 11). Cest une chambre de fermentation . Il est le sige de
biotransformation des aliments non assimils par lintestin. Cette zone est colonise de faon
permanente. La flore anarobie est dense, active et produit de nombreux mtabolites.
Ces bactries sont xnobiotiques, responsables dune stimulation non spcifique du systme
immunitaire.
La stase du contenu nexplique pas elle seule, limportance de cette flore. Des bactries
ont une capacit dadhsion aux mucines, aux cellules choliques par des liaisons spcifiques : les
adhsines.

II\ Composition classique.


Cette flore est difficile quantifier et les rsultats sont variables cause de plusieurs
facteurs : mode de prlvement, mthode microbiologique, prsence de bactries dorigine
alimentaire, physiologie intestinale, contexte environnemental de lhte selon son rgime
alimentaire, les bactries exognes et les substrats antibiotiques.
Lintestin grle :
Les bactries de ce segment appartiennent au genre Lactobacillus et Streptococcus. De
plus, quelques espces de la famille des Entrobactriaceae sont prsentes.

Le colon :
On trouve quatre types de flore :

une flore dominante : exclusivement anarobie, Eubactrium, Clostridium,


Propionylbacterium, Bifidobacterium.
Une sous-dominante : on a diverses espces de la famille des
Enterobacteriaceae (E. coli) et les genres Lactobacillus, Streptococcus et
Enterococcus.
Une rsiduelle : les bactries en transit ou rprimes par la flore dominante.
Une fcale, avec de nombreuses espces mortes. La flore nest pas
reprsentative des diverses niches cologiques de lcosystme digestif.

Les flores sont tudies pour retrouver des souches pathognes ou potentiellement
pathognes pour lHomme.

III\ Les rles de la flore intestinale.


A\ Effets digestifs.
Des modifications anatomiques et histologiques vont tre lies la prsence de la
microflore et qui sont mises en vidence par comparaison dun animal sans germe avec un animal
normal.
Une augmentation de la flore entrane un ralentissement du transit et une dilatation du
caecum.
La vitesse de renouvellement cellulaire (index mitotique) est rduite chez lanimal axnique.

B\ Effets nutritionnels.
1\ Effets bnfiques pour lhte.
Il va y avoir production dacides gras chane courte qui diminue la synthse hpatique du
cholestrol. On trouve aussi la dgradation des glucides non absorbs (amidon, pectine, cellulose)
qui entrane la production dacides organiques assimilables par lhte (actate, butyrate,
propionate) et de gaz (CO2 et H2).
Lhydrolyse des lipides alimentaires non absorbs se fait grce aux lipases bactriennes.
La dgradation de certaines protines en acides amins permet la rcupration dazote.
Il peut galement y avoir des apports vitaminiques grce certaines bactries capables de
synthtiser, in vitro, un large ventail de vitamines (riboflavine 2, acide pantothnique 5,
pyridoxine B6, Biotine B8, vitamine K).
Des bactries anarobies strictes, comme Clostridium butyricum, sont capables de
synthtiser de la vitamine B12 qui est dune grande utilit pour la croissance locale des bactries.
Les gaz intestinaux sont le rsultat de fermentation microbienne dans le gros intestin
partir des glucides et des protines arrivant ce niveau. Il sagit de traces compares aux
ruminants.

2\ Effets nfastes pour lhte.


Les cots nfastes touchent gnralement le mtabolisme :
- Mtabolisme glucidique et apparition de composs aglycones (drivs des
glucoronides qui sont cancrignes)

Mtabolisme azot : les nitrates et amines donnent des composs cancrognes


les nitrosamines.
Mtabolisme xnobiotique avec possibilit dinactivation de mdicaments ou
production de mtabolites toxiques.

3\ effets divers.
La flore rsidente a un effet de barrire vis--vis des bactries exognes : il y a
limination totale (effet drastique) ou maintien ltat de sous dominance (effet permissif).
La flore stimule limmunit locale et maintien le statut immunitaire un certain niveau.

IV\ Conclusion.
Quelles que soient les techniques dtude, on constate que la flore reste stable.
Il faudrait viter les agressions (jene alimentaire, modification brutale de rgime,
modification pristaltique, antibiothrapie).
La flore est un cosystme complexe et doit tre protge.