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Taxonomie[modifier | modifier le code]

Les salmonelles ont t nommes ainsi en l'honneur du mdecin vtrinaire amricain Daniel Elmer
Salmon mme si l'homme qui a dcouvert le genre tait Theobald Smith, qui travailla sous la
direction de Salmon au Bureau of Animal Industry (BAI) ds 18841.
D'aprs les travaux rcents de taxonomie, en particulier par hybridation de l'ADN, le
genre Salmonella comporte deux espces, la principale (longtemps considre comme la
seule), Salmonella enterica comprend six sous-espces dont la plus frquente est Salmonella
enterica Enterica elles-mmes divises en de nombreux srovars : Enteritidis, Derby, Hadar,
Infantis, Paratyphique, Typha, Martyrium, Virchow, etc.. Actuellement plus de 2 600 srovars (ou
srotypes) sont dcrits.

Espces et sous espces[modifier | modifier le code]

Salmonella bongori ;

Salmonella enterica ;

Salmonella enterica Arizonae ;

Salmonella enterica Diarizonae ;

Salmonella enterica Enterica ;

Salmonella enterica Houtenae ;

Salmonella enterica Indica ;

Salmonella enterica Salamae ;

Salmonella subterranea (depuis 2004).

En 2000, le Centre national de rfrence des Salmonella et Shigella (CNRSS) de l'Institut Pasteur,
Paris, avait rfrenc 883 souches de Salmonella dorigine humaine.
Lessrovars Enteritidis et Typhimurium en reprsentaient respectivement 36 % et 29 %. On connat
aujourd'hui plus de 2 000 srotypes de salmonelles. Ce sont les plus nombreuses au monde !

Caractres biochimiques[modifier | modifier le code]


Ce sont des entrobactries bacilles Gram ngatifs, mobiles pour la plupart (ciliature
pritriche)mais certaines sont immobiles, aro-anarobies facultatifs, oxydase -, nitrate rductase +,
fermentative du glucose, lactose -, H2S + (ou -), urase -, lysine dcarboxylase +, utilisant la voie
des acides mixtes, indole-, ne possdant pas la bta-galactosidase, forte contagiosit,
responsables de gastro-entrites, toxi-infections alimentaires et des
fivres typhode et paratyphode (S. typhi et S. paratyphi).

Dose infectieuse[modifier | modifier le code]


Il n'y a pas de dose infectieuse type, celle-ci dpendant :
1. de la pathognicit de la souche (ou srovar) considre
2. de facteurs de sensibilit de l'hte

3. de la concentration microbienne (dose en contact ou ingre).

Virulence[modifier | modifier le code]


Elle dpend des souches et des conditions. Des salmonelles dites hypervirulentes , sources
potentielles de maladies mergentes ont t observes en 2011-2012 en Californie (Santa Barbara)
sur des animaux d'levage. Ce sont des souches particulirement rsistantes, propagation
inhabituellement rapides, rsistantes aux vaccins existants (en 2012) et qui entrent dans l'organisme
comme un cheval de Troie, deviennent inhabituellement virulentes, puis reprennent un
comportement plus normal quand elles retournent dans l'environnement, o elles sont alors moins
dtectables2.

Caractres antigniques[modifier | modifier le code]


Comme toutes les Enterobacteriaceae, les Salmonella possdent des antignes somatiques O
(situ dans la paroi). Il en existe 67, on distingue l'antigne O majeur caractrisant un groupe
de Salmonella et l'antigne O mineur qui est accessoire. La dltion par mutation de l'antigne O
entrane une perte partielle ou totale du pouvoir pathogne.
Les Salmonella possdent galement des antignes flagellaires H. Ils sont prsents sous deux
formes diffrentes (phase). Soit sous les deux formes simultanment (diphasique) soit sous la forme
d'une seule phase (monophasique). Ces deux phases sont codes par deux gnes diffrents mais
trs voisins, ils doivent provenir de la duplication d'un mme gne ancestral.
Enfin, Salmonella ser. Typhi, S. ser. Paratyphi C et S. ser. Dublin possdent l'antigne capsulaire de
nature polyosidique Vi pouvant (plus ou moins) masquer l'antigne somatique O. Ce dernier est
dmasqu par destruction de l'antigne Vi (chauffage 100 C pendant 10 min).

Habitat[modifier | modifier le code]


Les salmonelles peuvent survivre plusieurs semaines en milieu sec et plusieurs mois dans l'eau.
Elles se retrouvent donc frquemment dans les milieux aquatiques pollus, la contamination par
les excrments d'animaux porteurs tant trs importante. Les vertbrs aquatiques, notamment
les oiseaux (Anatids) et les reptiles (Chloniens) sont d'importants vecteurs de salmonelles.
Les volailles, les bovins et les ovins tant des animaux frquemment contaminants, les salmonelles
peuvent se retrouver dans les aliments, notamment les viandes, le lait, et un uf dont la coquille est
fle.

Pathognie[modifier | modifier le code]


Deux groupes, distincts par leur pathognie et leur pidmiologie, d'importance numrique trs
ingale, concernent la pathologie humaine.

Syndromes typhodes et paratyphodes[modifier | modifier le code]


Quatre srotypes de salmonella sont adapts l'homme, qui en constitue le seul rservoir et chez
qui ils provoquent une maladie spcifique. Ce sont S. typhi (bacille d'Eberth),S. paratyphi A, S.
paratyphi B (bacille de Schotmller) et S. paratyphi C (bacille d'Hirschfeld), accessoirement S.

sendai. Les germes pntrent, mme en nombre restreint, par voie digestive et aprs une incubation
assez longue (jusqu' 3 semaines) traversent la muqueuse intestinale et envahissent le tissu
lymphode pr-intestinal (plaques de Peyer). De l, le germe passe avec la lymphe dans la
circulation, ce qui dtermine un tat septicmique. La septicmie n'est donc pas une complication
accidentelle mais s'inscrit dans l'volution normale de la maladie. Par ailleurs, les plaques de Peyer
peuvent s'ulcrer et entraner une perforation intestinale et une pritonite. Le malade guri peut
rester porteur de germes pendant des mois ou des annes, les bactries persistant surtout dans
les voies biliaires.
La libration d'endotoxine joue un rle important dans la pathognie de la maladie, d'o le danger de
l'administration d'une forte dose d'antibiotique qui risque de provoquer une lyse massive des
bactries.
La transmission se fait surtout par voie d'eau potable lors des pidmies tendues. Mais le contact
direct ou les aliments peuvent galement tre en cause dans la propagation. Le contrle
bactriologique strict des eaux de consommation ainsi que la surveillance du rservoir de germes
(porteurs) expliquent la diminution spectaculaire des fivres typhodes et paratyphodes dans les
pays hygine dveloppe.

Toxi-infections alimentaires ou entrites salmonella[modifier | modifier le


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Est responsable le groupe potentiellement constitu par tous les autres srotypes (plus de mille)
dont la plupart n'ont cependant jamais t rencontrs chez l'homme. Ces salmonella sont rencontrs
chez diverses espces animales, la plupart n'tant d'ailleurs pas lies un hte spcifique et
pouvant aussi infecter l'homme. Il s'agit donc d'unezoonose.
Le germe pntre par voie digestive et doit tre ingr en trs grand nombre pour dclencher la
maladie chez l'adulte sain. L'acidit gastrique serait entre autres responsable de la destruction de la
majorit des germes ingrs. Ce contage massif est ralis par l'ingestion d'aliments dans lesquels
le germe a pullul comme dans un milieu de culture.
Toutefois les nourrissons et les jeunes enfants sont bien plus sensibles l'infection qui peut tre
ralise par l'ingestion d'un nombre minime de bactries. On a pu prouver que, chez les
nourrissons, la contamination pouvait se faire par l'inhalation de poussires charges de bactries.
Aprs une courte incubation de quelques heures un jour, le germe se multiplie dans la lumire
intestinale en provoquant un syndrome inflammatoire intestinal avec diarrhe souvent mucopurulente et sanguinolente. Chez les nourrissons, la dshydratation peut entraner un tat de
toxicose grave. Gnralement, la maladie est bnigne. Il n'y a normalement pas de septicmie, qui
peut cependant survenir exceptionnellement titre de complication chez des sujets dbilits
(maladie de Hodgkin, par exemple). Des localisations extra-intestinales sont possibles, en particulier
des mningites salmonella chez les enfants, des ostites, etc.

pidmiologie des toxi-infections alimentaires[modifier | modifier le


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L'pidmiologie fait intervenir l'alimentation, surtout les viandes, les ufs et les produits laitiers.

Ces salmonella prsentent une forte recrudescence durant l't. La majorit des entrites
salmonella surviennent chez les jeunes enfants, sous forme de cas disperss. Au moins 25 % des
entrites estivales des jeunes enfants sont causes par des salmonella. En Europe occidentale, S.
typhimurium reprsente prs de 70 % des isolements !

Diagnostic[modifier | modifier le code]


Les procds de diagnostic biologique sont diffrents dans les deux groupes pathogniques.

Syndromes typhodes[modifier | modifier le code]