LenLis

Vida que no acaba mais

Uma nova rea de pesquisa,
a metagenmica, mostra que o mundo
microscpico tem uma biodiversidade sem
precedentes, alm de um papel importante
para a manuteno dos ecossistemas

Luciana Christante

40 unespcincia .:. outubro de 2009

mais micro-organismos entre a terra e os mares do que

sonha nossa v biologia. Com
o perdo de William Shakespeare pela
parfrase ao seu clssico pensamento, a
frase a melhor traduo da biodiversidade desse universo gigantesco, porm
desconhecido. Bem, sonhava. Um novo
mecanismo de anlise gentica conhecido como metagenmica est revelando o
tamanho desse mundo.

Ferramentas poderosas

Trazendo tecnologias avanadas de genmica e bioinformtica, a metagenmica

vem transformando os laboratrios de
Microbiologia nos ltimos dez anos. Sua
principal ferramenta o sequenciamento
do tipo shot-gun (traduzido como a tiros
de cartucheira), usado pela primeira
vez em grande escala pelo geneticista e
empresrio americano Craig Venter, em
1998 quando a Celera, seu conglomerado, entrou numa ambiciosa concorrncia
com o consrcio pblico que coordenava
o Projeto Genoma Humano.
O segredo do shot-gun sequencing
bombardear o DNA intensa e aleatoriamente, para depois sequenciar muitos
fragmentos curtos ao mesmo tempo, com
mais rapidez e menos custo. Depois
preciso remontar o quebra-cabea para
cada espcie, antes de partir para anlises mais especficas, gene a gene. As duas
etapas so de alta complexidade e seriam
impensveis sem o uso de poderosos algoritmos da bioinformtica.
Especialistas estimam que pode haver
mais de 10 milhes de espcies de bact-

rias. Mas eles no parecem preocupados

com a classificao taxonmica de tantas
novas conhecidas; o que os interessa a
diversidade gentica das populaes. E
ela j muito superior ao que se imaginava, como demonstrou o prprio Venter
com uma expedio cientfica ao Atlntico Norte entre 2004 e 2006. Nas guas
do mar dos Sargaos (no meio do oceano)
foram encontradas cerca de 1.800 espcies de micro-organismos, o que resultou
na identificao de mais de 1,2 milho
de genes codificadores de protena dez
vezes mais que o catalogado nas maiores
bases de dados de protenas da poca.
Abundantes e ubquas

Alm de ampliar a compreenso sobre

a filognese das formas primordiais de
vida, o instrumental metagenmico vem
revelando a importncia da microbiota nos
ciclos geolgicos (carbono e nitrognio,
por exemplo) e no equilbrio dos ecossistemas, devido a sua abundante e ubqua
presena nos solos, na gua, na fauna e
na flora. Podemos conhecer a representao de cada espcie, famlia ou gnero na
populao de um determinado ambiente,
saber se esta proporo muda ao longo
do tempo e em funo da ao humana,
explica Eliana Gertrudes de Macedo Lemos, especialista em metagenmica de
solos da Faculdade de Cincias Agrrias
e Veterinrias da Unesp em Jaboticabal.
Tambm na biotecnologia, a metagenmica traz a possibilidade de acesso
a gigantescas bibliotecas de genes, de
onde podem sair muitas protenas e, sobretudo, enzimas com grande potencial
na agricultura e na remediao de danos
ambientais, por exemplo. O conjunto
gnico da microbiota de um ambiente
capaz de revelar quais vias metablicas esto em ao, se ela est envolvida
com processos de ciclagem de um dado
nutriente, como nitrognio e fsforo. Ou
se capaz de degradar poluentes, como
petrleo, fertilizantes, metais pesados,
enumera Eliana. As indstrias qumica,
farmacutica e alimentcia esto atentas
s oportunidades que o sequenciamento
do genoma coletivo da microbiota, o microbioma, pode abrir num futuro prximo.

Juergen Schonnop

Desde que o holands Anthony van Leeuwenhoek usou pela primeira vez um microscpio para observar material biolgico, em
1674, a Microbiologia classificou cerca de
5 mil espcies de bactrias muito menos
do que se pode esperar de seres que vivem
neste planeta, como habitantes originais,
h pelo menos 3,5 bilhes de anos.
A Microbiologia clssica sempre trabalhou focada numa nica espcie, cultivada em laboratrio, afirma Daro Abel
Palmieri, do Laboratrio de Biotecnologia
Vegetal da Faculdade de Cincias e Letras
da Unesp em Assis. Com a metagenmica,
explica, tornou-se possvel estudar espcies que no se deixam cultivar em placas
de Petri e estufas a esmagadora maioria.
Em 1g de solo, por exemplo, j foram
identificadas geneticamente cerca de 1
milho de espcies de bactrias, das quais
no mximo 1% sobrevivem isoladas e fora
de seu habitat. Outra vantagem do mtodo
permitir a anlise simultnea do DNA
de todos os micro-organismos de uma
amostra ambiental, diz o pesquisador.

O inspito reino
das arqueas
A metagenmica tem renovado
o interesse pelas arqueas,
organismos procariotos sobre
os quais ainda se sabe muito
pouco, porque muito difcil
cultiv-los em laboratrio,
explica Daro Abel Palmieri,
da Unesp em Assis.
Estes seres unicelulares so
comumente encontrados
em lugares inspitos
muitos quentes, salinos
ou sulfurosos, como os
giseres (foto). Antigamente
eles eram conhecidos
como arqueobactrias,
quando ento pertenciam
ao reino Monera, que era
o nico reino procarioto.
Mas a taxonomia mudou. Nos
anos 1970, concluiu-se que as
arqueas so to diferentes das
bactrias e dos eucariotos que
mereciam ter um reino s para
si. Atualmente os procariotos
so representados pelos
reinos Bacteria e Archaea.

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