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Clasificacin

Existen muchas formas de clasificar los aminocidos; las dos que se presentan a continuacin
son las ms comunes.

Segn las propiedades de su cadena

Otra forma de clasificar los aminocidos de acuerdo a su cadena lateral.

Los aminocidos se clasifican habitualmente segn las propiedades de su cadena lateral:

Neutros polares, polares o hidrfilos : serina (Ser, S), treonina (Thr, T), cistena (Cys, C),
glutamina (Gln, Q), asparagina (Asn, N) , tirosina (Tyr, Y) y glicina (Gly, G).

Neutros no polares, apolares o hidrfobos: alanina (Ala, A), valina (Val, V), leucina (Leu, L),
isoleucina (Ile, I), metionina (Met, M), prolina (Pro, P), fenilalanina (Phe, F) y triptfano (Trp,
W).

Con carga negativa o cidos: cido asprtico (Asp, D) y cido glutmico (Glu, E).

Con carga positiva o bsicos: lisina (Lys, K), arginina (Arg, R) e histidina (His, H).

Aromticos: fenilalanina (Phe, F), tirosina (Tyr, Y) y triptfano (Trp, W) (ya incluidos en los
grupos neutros polares y neutros no polares).

Segn su obtencin
A los aminocidos que deben ser captados como parte de los alimentos se los
llama esenciales; la carencia de estos aminocidos en la dieta limita el desarrollo del
organismo, ya que no es posible reponer las clulas de los tejidos que mueren o crear tejidos
nuevos, en el caso del crecimiento. Para el ser humano, los aminocidos esenciales son:

Valina (Val, V)

Leucina (Leu, L)

Treonina (Thr, T)

Lisina (Lys, K)

Triptfano (Trp, W)

Histidina (His, H) *

Fenilalanina (Phe, F)

Isoleucina (Ile, I)

Arginina (Arg, R) *

Metionina (Met, M)

A los aminocidos que pueden sintetizarse en el propio organismo se los conoce como no
esenciales y son:

Alanina (Ala, A)

Prolina (Pro, P)

Glicina (Gly, G)

Serina (Ser, S)

Cistena (Cys, C) **

Asparagina (Asn, N)

Glutamina (Gln, Q)

Tirosina (Tyr, Y) **

cido asprtico (Asp, D)

cido glutmico (Glu, E)

Estas clasificaciones varan segn la especie e incluso, para algunos aminocidos, segn los
autores. Se han aislado cepas de bacterias con requerimientos diferenciales de cada tipo de
aminocido.

Segn la ubicacin del grupo amino


Alfa-aminocidos: El grupo amino est ubicado en el carbono n 2 de la cadena, es decir el
primer carbono a continuacin del grupo carboxilo (histricamente este carbono se denomina
carbono alfa). La mayora de las protenas estn compuestas por residuos de alfa-aminocidos
enlazados mediante enlaces amida (enlaces peptdicos).

Beta-aminocidos: El grupo amino est ubicado en el carbono n 3 de la cadena, es decir


en el segundo carbono a continuacin del grupo carboxilo.

Gamma-aminocidos: El grupo amino est ubicado en el carbono n 4 de la cadena, es


decir en el tercer carbono a continuacin del grupo carboxilo.

Aminocidos codificados en el genoma


Los aminocidos proteicos, cannicos o naturales son aquellos que estn codificados en el
genoma; para la mayora de los seres vivos son 20: alanina, arginina, asparagina, aspartato,
cistena, fenilalanina, glicina, glutamato, glutamina, histidina, isoleucina, leucina, lisina,
metionina, prolina, serina, tirosina, treonina, triptfano y valina.
Sin embargo, hay excepciones: en algunos seres vivos el cdigo gentico tiene pequeas
modificaciones y puede codificar otros aminocidos. El aminocido nmero 21 es
la selenocistena, que aparece tanto en eucariotas como procariotas y arqueas, y el nmero 22
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es la pirrolisina que aparece slo en arqueas.

Aminocidos modificados
Las modificaciones postraduccionales de los 20 aminocidos codificados genticamente
conducen a la formacin de 100 o ms derivados de los aminocidos. Las modificaciones de

los aminocidos juegan con frecuencia un papel de gran importancia en la correcta


funcionalidad de una protena.
Son numerosos los ejemplos de modificacin postraduccional de aminocidos. La formacin
de puentes disulfuro, claves en la estabilizacin de la estructura terciaria de las protenas, est
catalizada por una disulfuro isomerasa. En las histonas tiene lugar la metilacin de las lisinas.
En el colgeno abunda el aminocido 4-hidroxiprolina, que es el resultado de la hidroxilacin de
la prolina. La metionina inicial de todos los polipptidos (codificada por el codn de inicio AUG)
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casi siempre se elimina por protelisis.
Algunos aminocidos no proteicos tienen funcin propia, por ejemplo
como neurotransmisores o vitaminas. Por ejemplo, la beta-alanina o el cido gammaaminobutrico (GABA). Existen muchos aminocidos no proteicos que juegan papeles distintos
en la naturaleza y pueden o no provenir de aminocidos. Ejemplos de estos aminocidos no
protenicos son:

Sarcosina

Etilglicina o cido -aminobutrico (AABA)

cido djenclico

Hipoglicinas A y B

Mimosina

Aliina

Canalina

Canavalina

Ornitina

Homometionina

Homoserina

Homoarginina

Homofenilalanina

Homocistena

Homoleucina

Cistationina

Norvalina

Norleucina

Ciclopentenilglicina

-Alanina

cido gamma-aminobutrico

cido ibotnico

cido pipeclico

cido guanidinactico

Taurina

cido trans-2-amino-5-cloro-4-hexenoico

cido trans-2-amino-5-cloro-6-hidroxi-4-hexenoico

cido 2-amino-4-cloro-4-pentenoico

cido diaminopimlico

Semialdehdo asprtico

Semialdehdo glutmico

Citrulina

DOPA

Quinurenina

Nicotianina

cido 2-azetidincarboxlico

-(4-hidroxibenzotiazol-6-il)alanina

-(2-metil-4-hidroxibenzotiazol-6-il)-alanina

Indospicina

N-(indol-3-acetil)lisina

(p-hidroximetil)fenilalanina

0-etil-L-homoserina, aislada de Corynebacterium ethanolaminophilum

5-Hidroxitriptfano

cido licoprdico, aislado de Lycoperdon perlatum

cido lentnico

cido estizolobnico

cido estizolbico

Tiroxina

Azoxibacilina