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J US
A
CI
TI CIA S O
PROTOCOLO DE INVESTIGACIN
PRESENTA
FERNANDO EFRN PALACIOS GARCA
DIRECTOR
DRA. MA. CARMEN SANCHEZ HERNANDEZ
ASESORES
DRA. TANIA VOLKE SEPLVEDA
DR. RUBN DAZ GODNEZ
Enero 2014
INTRODUCCIN
Ms de 2,000, 000,000 de toneladas mtricas de petrleo son producidas por ao en todo
el mundo. En Mxico se producen 2,983 millones barriles/da (CIA World Factbook,
2010). El petrleo y sus derivados son la principal fuente de energa para las industrias y
la vida diaria del ser humano. Sin embargo, las fugas y derrames son frecuentes durante
el proceso de exploracin, produccin, refinacin, transporte y almacenamiento del
petrleo (Das y Chandran, 2011). La liberacin de los hidrocarburos (HC) en el medio
ambiente es la principal causa de contaminacin de suelos y aguas (Holliger y col. 1994);
particularmente, la contaminacin del suelo con hidrocarburos causa daos masivos a la
flora y fauna existente. El petrleo y sus derivados constituyen una importante fuente de
contaminacin. Se estima que de 0,08 % a 0,46 % (ms de tres millones de toneladas)
de la produccin total del petrleo termina formando parte, bajo diversas formas, de la
contaminacin ambiental (Jacobucci y col. 2000). El petrleo contamina el ambiente en
las diferentes etapas de su explotacin, extraccin, transporte y refinado (Vasudevan;
Rajaram, 2001). Los daos causados por la contaminacin por HC son varios como: la
reduccin o destruccin de la vida marina, destruccin del hbitat de toda forma de vida
silvestre, reduccin total o parcial de las playas costeras y sus animales, modificacin de
la vida microbiolgica presente en el suelo y agua.
El petrleo es un combustible natural compuesto de varios tipos de hidrocarburos, es
decir, de molculas que contienen bsicamente, carbono e hidrgeno. Estas molculas
pueden estar formadas de cadenas de tomos de carbono largas o cortas y que pueden
adoptar diferentes estructuras. Los HC del petrleo pueden dividirse en cuatro categoras
de compuestos:
I. Los saturados: los alcanos como el hexano, el octano, el decano, el hexadecano, los
isoalcanos y los cicloalcanos como el ciclohexano.
II. Los aromticos: benceno, tolueno, xileno y naftaleno agrupados tambin bajo la
apelacin BTEX y los poliaromticos o PAHs (Rittman, 1994).
III. Las resinas: slidos polares amorfos disueltos que contienen nitrgeno, azufre y
oxgeno.
IV. Los asfltenos: grandes molculas polares coloidales sin disolver que son ms
resistentes a la biodegradacin (Balba; Al-Awadhi; Al-Daher, 1998).
En trminos generales, de un 70 a un 97% de los hidrocarburos del petrleo es
degradable (la fraccin de hidrocarburos saturados y aromticos) y el resto representa
los asfaltenos y las resinas esencialmente inertes (Prince y col. 1999). Cada una de las
categoras agrupa compuestos con caractersticas de solubilidad, volatilidad y toxicidad
propias. Desde un punto de vista de biodegradabilidad, los hidrocarburos pueden
ordenarse de mayor a menor biodegradabilidad en: alcanos lineales > alcanos
ramificados > aromticos ligeros > alcanos cclicos > aromticos pesados > compuestos
polares (Olson, y col. 1999; Harris, 1997).
Los alcanos son molculas qumicamente muy estables en las que el esqueleto
carbonado se encuentra saturado de hidrgeno. Presentan estructuras lineales,
ramificadas o cclicas. Los ramificados conforman la mayor parte del petrleo; en caso
de una contaminacin con petrleo, son degradados ms lentamente y despus de
haberse degradado los lineales (Rittman, 1994). Los de cadena corta son ms txicos
que los de cadena larga, siendo estos ltimos ms hidrofbicos (Balba; Al- Awadhi; AlDaher, 1998). El HXD es un HC de la familia de los alcanos (sin anillos ni enlaces
mltiples) cuya frmula qumica es C16H34. Su estructura consiste en una cadena lineal
de 16 tomos de carbono, con tres hidrgenos unidos a cada uno de los dos carbonos
extremos y dos hidrgenos unidos a los restantes 14 tomos de carbono (Morrison boyd,
1987). El hexadecano, es un sustrato selectivo ideal para aislar microorganismos
capaces de degradar los alcanos (Wrenn; Venosa, 1996).
Los tratamientos biolgicos representan usualmente la mejor alternativa. Adems de no
implicar los costos de equipos, materiales, productos y maquinaria necesarios para los
tratamientos fsicos y qumicos, pueden aplicarse sobre el sitio mismo de la
contaminacin, sin exigir el desplazamiento de los suelos contaminados. El tratamiento
biolgico de descontaminacin recibe tambin el nombre de biorremediacin.
La biorremediacin es definida como el proceso mediante el cual los microorganismos
transforman o alteran (a travs de reacciones de xido-reduccin) la estructura qumica
de los contaminantes en el ambiente (EPA, 2009). La biodegradacin de los
hidrocarburos del petrleo es un proceso complejo que depende de la estructura
molecular y de la concentracin de los hidrocarburos en los sitios contaminados. Los
hidrocarburos provenientes de los productos petroleros pueden funcionar como fuente de
carbono y de energa para el crecimiento de diferentes microorganismos que pueden de
este modo, colonizar los sitios contaminados y degradar el agente contaminante
(Thomassin-Lacroix y col. 2002).
Se conocen varios factores que inciden en la degradacin de los hidrocarburos pero uno
de los ms importantes es su baja biodisponibilidad para los microorganismos. La
biodisponibilidad es definida como el grado de interaccin de los compuestos o
contaminantes con los microorganismos (Harms y col. 2010). Por lo tanto, los
hidrocarburos del petrleo difieren entre s por su susceptibilidad al ataque microbiano,
la susceptibilidad de los hidrocarburos a la degradacin generalmente es considerada en
el siguiente orden: alcanos lineales> alcanos ramificados> aromticos pequeos> ciclo
alcanos> hidrocarburos aromticos policclicos. Particularmente, los alcanos son
hidrocarburos saturados y son los principales constituyentes del petrleo en un 20 a 25%
(Ulrici, 2000), de aqu la importancia de estudiar y entender la biodegradacin, sus
alcances y consecuencias. El hexadecano (HXD) es considerado como un compuesto
modelo representativo de los alcanos.
Se ha aislado y reportado un gran nmero de microorganismos con la capacidad para
degradar hidrocarburos. En la siguiente tabla se muestran los principales gneros
microbianos que son capaces de utilizar alcanos como nica fuente de carbono y energa.
Como se aprecia, los alcanos son degradados principalmente por bacterias, hongos y
levaduras, destacando los gneros Acinetobacter y Pseudomonas como los ms
estudiados (van Beilen y col. 2003; Throne-Holst y col. 2007).
Bacterias
Levaduras
Achromobacter
Candida
Acinetobacter
Cryptococcus
Alcanivorax
Debaryomyces
Alcaligenes
Hansenula
Bacillus
Pichia
Brevibacterium
Rhodotorula
Burkholderia
Saccharomyces
Corynebacterium
Sporobolomyces
Flavobacterium
Torulopsis
Mycobacterium
Trichosporon
Nocardia
Yarrowia
Pseudomonas
Rhodococcus
Sphingomonas
Streptomyces
Adaptada de Van Beilen y col. 2003.
Hongos
Aspergillus
Cladosporium
Corollasporium
Cunninghamella
Dendryphiella
Fusarium
Gliocladium
Lulworthia
Penicilium
Varicospora
Verticilium
Algas
Prototheca
Los hongos representan un reino que comprende una gran variedad de organismos
eucariontes, morfolgicamente clasificados como levaduras, hongos filamentosos u
hongos dimrficos. Muchos de ellos viven como saprfitos descomponiendo materia
muerta, mientras que otros han evolucionado para ser patgenos obligados u
oportunistas, obteniendo nutrientes de sus huspedes, animales o plantas. Los hongos
filamentosos han desarrollado una habilidad extraordinaria para adaptarse a los cambios
ambientales, principalmente debido a sus sistemas enzimticos de defensa que los
protegen de compuestos exgenos txicos, xenobiticos. Fusarium oxysporum es un
hongo del gnero ascomycota, cosmopolita que existe en muchas formas patognicas,
parasitando ms de 100 especies de plantas gimnospermas y angiospermas, gracias a
los diversos mecanismos que tiene el hongo para vencer las defensas de muchas plantas
(Gottwald y col. 2001). Se caracteriza por producir colonias de rpido crecimiento, con
una tasa diaria cercana a un centmetro en medio papa- dextrosa agar (PDA) a 25C.
Este hongo puede presentar dos tipos de morfologa: una de tipo micelial caracterizada
por la produccin de abundante micelio areo, algodonoso, con una coloracin variable,
de blanco a rosado durazno, pero usualmente con un tinte prpura o violeta ms intenso
en la superficie del agar y pocas microconidias (Booth, 1970) y una de tipo pionotal con
la formacin de poco o ningn micelio areo y abundantes microconidias. Neurospora es
un gnero de hongos ascomicetos. Es un microorganismo aerobio obligado. El nombre
del gnero, que significa "esporas nervio" se refiere a las estras caractersticas en las
esporas que se asemejan a los axones. Se caracteriza por crecer en gran variedad de
mono y disacridos como fuentes de carbono y digerir carbohidratos complejos como
celulosa y almidn (Tatum 1961).
Hiptesis:
Las cepas de F. oxysporum y N. sitophila crecern en una fermentacin lquida que
contenga diferentes concentraciones de HXD (500,1000 y 1500 mg de HXD/L)
utilizndolo como nica fuente de carbono.
Objetivo general
Evaluar el crecimiento de F. oxysporum y N. sitophila en una fermentacin liquida
con un medio que contenga hexadecano a concentraciones de 500, 1000 y 1500
mg de HXD/L y cuantificar la degradacin de este compuesto a travs del tiempo
de fermentacin.
Especficos:
Metodologa
Microorganismos
Las cepas a utilizar sern F. oxysporum y N. sitophila, depositadas en el cepario del
Centro de Investigaciones en Ciencias Biolgicas (CICB) de la Universidad Autnoma de
Tlaxcala. Se reactivar el inoculo de una colonia crecida sobre agar extracto de papa
(PDA) a 20C durante 7 das.
Medios de cultivo
Se prepararan cuatro medios de cultivo enriquecidos con glucosa y extracto de levadura
(MGEL). 1) Medio de cultivo MGEL conteniendo en (g/l): glucosa, 10; extracto de
levadura, 5; KH2PO4, 0.6; MgSO4.7H2O, 0.5; K2HPO4, 0.4; CuSO4, 0.25; FeSO4.7H2O,
0.05; MnSO4.H2O, 0.05 ZnSO4.7H2O, 0.002. (Snchez y Cols. 2009), 2) MGEL + 500 mg
de HXD/l, 3) MGEL + 1000 mg de HXD/l y 4) MGEL + 1500 mg de HXD/l. El pH inicial
de crecimiento se ajustara a 7.5 con HCl 1M. Las condiciones de cultivo sern matraces
Erlenmeyer de 150 ml, conteniendo 50 ml de cada medio de cultivo a utilizar y 3 inculos
de 4 mm de dimetro tomados de la periferia de la colonia de la cepa previamente
reactivada (F. oxysporum y N. sitophila respectivamente), crecido a 25C durante 15 das
en una incubadora orbital a 120 rpm.
Evaluacin de la tasa especifica de crecimiento, biomasa y obtencin del extracto
crudo enzimtico
Los hongos van a desarrollarse en el medio antes mencionado. Posteriormente se
obtendr el extracto crudo enzimtico (ECE) que corresponde al sobrenadante de los
cultivos cada 12h para la cepa de N. sitophila y cada 24 h para la cepa de F. oxysporum
por filtracin, seguido de la retencin de la biomasa a travs de papel filtro Whatman No.
4. Con tres replicas, una vez que se encuentre retenida la biomasa sobre el papel
Whatman se secar hasta obtener un peso constante y as poder realizar la cuantificacin
por diferencia de peso seco (AOAC 1990).
El progreso de la biomasa en funcin del tiempo X = X (t) se ajustar mediante la ecuacin
logstica de Velhurst-Pearl:
dX / dt = (1-X / Xmax) X
La solucin a la ecuacin ser la siguiente:
X = Xmax / (1 + C*e-*t)
Donde:
= Mxima velocidad especfica de crecimiento (h-1)
Xmax = Valor de la biomasa mxima o de equilibrio (g/L) cuando dX / dt = 0 para X > 0.
t = Tiempo transcurrido en la fermentacin (h)
Anlisis estadstico
El anlisis se llevara a cabo aplicando un Anlisis de varianza (ANOVA) utilizando el
programa Graph pad Prism version 6.0
Resultados preliminares
Para este trabajo se comenz por realizar una prueba piloto, en la cual se pretenda
comprobar que la cepa de F. oxysporum utilizara HXD como fuente nica de carbono y
energa, esto durante 15 das de fermentacin y bajo dos diferentes concentraciones de
HXD.
Para esto se prepar un medio lquido que contiene (g/L) sales minerales; KH2PO4, 0.6;
MgSO4.7H2O, 0.5; K2HPO4, 0.4; CuSO4, 0.25; FeSO4.7H2O, 0.05; MnSO4.H2O, 0.05
ZnSO4.7H2O, 0.002; y una relacin C/N del 5 donde la fuente de carbono es HXD y la
fuente de N es (NH4)2 SO4. No se utiliz otra fuente de carbono como la glucosa.
Las condiciones de cultivo fueron en matraces Erlenmeyer de 150 ml adicionando 50 ml
de medio lquido y tres inculos de 4 mm obtenidos de la periferia de la colonia de F.
oxysporum previamente crecidas en cajas Petri con agar PDA. Para la concentracin de
1500 mg/L de HXD se agreg 75 L de HXD utilizando 1.2 g/L de (NH4)2 SO4 como fuente
de N y para la concentracin de 500 mg/L de HXD se agreg 25 L de HXD y 0.4 g/L de
(NH4)2 SO4, ajustando el pH a 7.5 con HCL 1M. Como surfactante se utiliz Tween 80 al
0.04% (400 L/L). Por ltimo la fermentacin se realiz a travs de 15 das por duplicado
en una incubadora orbital a 120 rpm a 26C.
Los parmetros a evaluar en esta prueba fueron:
Resultados
Para la concentracin de 1500 mg de HXD/L se obtuvieron los siguientes datos de
biomasa producida respecto al tiempo. Estos datos al ser muy bajos no pueden ajustarse
a la ecuacin de la lnea recta ya que arroja valores negativos el Ln de la fase
exponencial, y por lo tanto no podr ajustarse a la ecuacin logstica.
Tiempo
0
24
48
72
96
120
144
X experimental g/L
0
0.0328
0.0586
0.0618
0.0568
0.0642
0.0749
168
192
216
240
264
288
312
336
0.0962
0.1281
0.1012
0.1123
0.0938
0.0765
0.0922
0.0775
0
24
48
72
96
pH
promedio
7.5
6.885
6.79
6.725
6.675
120
144
168
192
216
240
264
288
312
336
6.575
6.495
6.415
6.45
6.44
6.45
6.345
6.425
6.265
6.42
7.6
7.4
7.2
7
pH
Tiempo
6.8
6.6
6.4
6.2
0
50
100
150
200
250
300
350
Tiempo (h)
La oxidacin de los hidrocarburos produce cidos grasos que son utilizados por los
microorganismos o liberadas en el medio. Si este es el caso, el pH del medio disminuye.
400
X experimental g/l
0
24
48
72
96
120
144
168
192
216
240
264
288
312
336
0
0.0269
0.0341
0.0413
0.0474
0.045
0.04369
0.0479
0.0436
0.0403
0.0485
0.051
0.0564
0.052
0.0421
7.6
7.4
7.2
7
pH
Perfil de pH
Tiempo pH promedio
0
7.5
24
6.865
48
6.77
72
6.78
96
6.99
120
6.52
144
6.55
168
6.66
192
6.725
216
6.62
240
6.63
264
6.635
288
6.535
312
6.47
336
6.4
6.8
6.6
6.4
6.2
-50
50
100
150
200
Tiempo (h)
250
300
350
400
Conclusin preliminar
A partir de esta prueba podemos decir que la cepa de F. oxysporum necesita de una
fuente de carbono primaria ms asimilable para adaptarse al medio y despus poder
metabolizar el HXD. El perfil de pH nos demuestra que existe un crecimiento debido a la
acidificacin del medio de cultivo en el cual al ajustar el pH inicial a 7.5 al final de la
fermentacin se determin un pH de 6.4.
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