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Estequiometría
Reacciones Biológicas
Modelos No Modelos
Estructurados Estructurados
Los modelos segregados son complejos ya que a las células se las reconoce como discretas.
Estos modelos pueden reconocer como diferentes a las "células más viejas" de las "células
más jóvenes". En cambio en los modelos no segregados se considera que una "célula
promedio" puede representar toda la población.
Los modelos estructurados modelan a la célula (a la biomasa) como un sistema de
componentes múltiples (ribosomas, enzimas, membranas,etc.). Como caso más simple, se
presentan los modelos no estructurados donde todos los componentes celulares se
representan por una única concentración, la de la biomasa (X). Una reacción biológica real
debería ser representada por un modelo segregado estructurado. Sin embargo, los modelos
no segregados no estructurados son usados por su simplicidad matemática y por su
capacidad de representar adecuadamente un vasto conjunto de reacciones biológicas de
interés. Los modelos no segregados no estructurados suelen llamarse del tipo "Caja Negra". 1
Reacciones Biológicas. Estequiometría
Reacciones Biológicas
Si= Sustrato i (extracelular)
Pi= Producto i (extracelular)
X= Biomasa (composición única)
Modelos No Modelos
Estructurados Estructurados
1 S1 2 S2 3 S3 ... X 1 P1 2 P2 3 P3 ...
1 S1 2 S2 3 S3 ... X 1 P1 2 P2 3 P3 ...
2 3 1 2 3
S1 S2 S3 ... X P1 P2 P3 ...
1 1 1 1 1 1
Y: Coeficiente de Rendimiento
Yij: Moles de la especie i / moles de la especie j
1
Yij
Y ji
4
Reacciones Biológicas. Estequiometría
α1 α i γ βi
rPi Ys1Pi rs1
5
Reacciones Biológicas. Estequiometría
Unidades y Signos
+ - Recordemos: rj (molj / litro min) - +
i
rs Ys s rs rs rX Ys X rs rs
i 1 i 1
1 1 - 1 1
1 1 -
mol Si mol Si mol S1 mol X mol X mol S1
l min mol S1 l min l min mol S1 l min
- +
i
rP Ys P rs rs
i 1 i 1
1 1 -
mol Pi mol Pi mol S1
l min mol S1 l min
6
Reacciones Biológicas. Estequiometría
8
Reacciones Biológicas. Estequiometría
Coeficientes a determinar!
1 C6 H12 O6 + 2 O2 + 3 NH3 CH1.70O0.46N0.17+ 1 CO2 + 2 H2O
SUSTRATOS PRODUCTOS
9
Reacciones Biológicas. Estequiometría
C6 H12 O6 + YS1S2 O2 + YS1S3 NH3 YS1X CH1.70O0.46N0.17+ YS1P1 CO2 + YS1P2 H2O
C6 H12 O6 + 3.94 O2 + 0.33 NH3 1.93 CH1.70O0.46N0.17+ 4.07 CO2 + 4.85H2O
15
Reacciones Biológicas. Estequiometría
Y*S1X = X1=-0.3212
Y*S1P1= X2=-0.6788
Y*S1S2= X3=+0.6571
Y*S1P2= X4=-0.8089
Y*S1S3= X5= +0.0546
Reacciones Biológicas. Estequiometría
FC Fórmula NO REDUCIDA
CH2O + Y*S1S2 O2 + Y*S1S3 NH3 Y*S1X CH1.70O0.46N0.17+ Y*S1P1 CO2 + Y*S1P2 H2O
CH2O + 0.66 O2 + 0.05 NH3 0.32 CH1.70O0.46N0.17+ 0.68 CO2 + 0.81 H2O
Y*S1X = X1=-0.3212 YS1X = -1.9272
Y*S1P1= X2=-0.6788 YS1P1= -4.0728
Y*S1S2= X3=+0.6571
Y*S1P2= X4=-0.8089
YS1S2= +3.9427
YS1P2= -4.8533
Yij=6Y*ij
Y*S1S3= X5= +0.0546 YS1S3= +0.3276
Los rendimientos tienen distintos valores de acuerdo a las fórmula químicas usadas en la
Postulación de la reacción
Reacciones Biológicas. Estequiometría
20
Modelado de Biorreactores Ideales
Biorreactores Discontinuos
Perfectamente Mezclados
Cultivo BATCH
21
Modelado de Biorreactores Ideales
Otras cinéticas
Más de un sustrato límitante
S1 S2
m mmax 1 mmax 2
S1 K s1 S2 K s1
Inhibición por alta concentración de sustrato
S
m m max 2
S
S Ks
KI
KI=constante de inhibición, g o mol /l
Modelado de Bioreactores Ideales
Otras cinéticas
Inhibición por alta concentración de producto
S 1
m m max
S Ks 1 P
KI
Biorreactores BATCH
Modelo asumiendo cinética del tipo Monod
Sustrato Limitante
Biomasa Producto
dN j
rj V
dt
Biorreactores BATCH
Modelo asumiendo cinética del tipo Monod
S1 X P1
d (S1 V ) N S1 S1 V
YXS1 m X V
dt rs1 Yxs1 m X
Modelado de Bioreactores Ideales
Biorreactores BATCH
Modelo asumiendo cinética del tipo Monod
S1 X P1
dN j
rj V Balance para un Sustrato
dt
d (S1 V )
YXS1 m X V
dt
Balance para la biomasa
d ( XV )
Reactores Tanque Agitado
Discontinuo - BATCH
m XV
dt
Balance para un Producto
d (P1 V )
YXP1 m X V
dt
Modelado de Bioreactores Ideales
Biorreactores BATCH
Modelo asumiendo cinética del tipo Monod
S1 X P1
d (S1 V ) dS1
d ( XV ) dX
m XV mX
dt dt
Balance para un Producto Balance para un Producto
d (P1 V ) dP1
YXP1 m X V YXP1 m X
dt dt
Modelado de Bioreactores Ideales
dS1 S1
YXS1 m max X DATOS
dt S1 K s
YXS1 0.8
dX S1
m max X YXP1 5.6
dt S1 K s
X (t 0) X 0 1g / l
dP1 S1
YXP1 m max X S1 (t 0 ) S10 20 g / l
dt S1 K s
m max 0.33h 1
K s 1.7 g / l
Modelado de Bioreactores Ideales
1. FASE DE DEMORA
Esta fase corresponde al tiempo que le lleva a la bacteria adaptarse al nuevo medio
cultivo. Durante esta fase el crecimiento es prácticamente nulo.
En la fase de
crecimiento
exponencial se
verifica:
S
m mmax m mmax S K S
S Ks
Modelado de Bioreactores Ideales
S
m mmax m mmax S K S
S Ks
dS1 S1
YXS1 m max X dS1
YXS m max X
dt S1 K s dt 1
dX S1
m max X dX
m max X
dt S1 K s dt
dP1 S1 dP1
YXP1 m max X YXP m max X
dt S1 K s dt 1
Modelado de Bioreactores Ideales
m mmax S K S dX
m max X
dt
dX
m max dt
X
X dX t
0 m max dt
X X 0
ln X ln X 0 m max t
X X 0 exp(m max t )
Modelado de Bioreactores Ideales
X X 0 exp(mmax t ) ; ln X ln X 0 mmax t
La fase exponencial se
reconoce por su linealidad
30
25
X, g/l
20
15
10
0
0 5 10 15 20
Tiempo, h
Escala lineal Escala logarítmica
Modelado de Bioreactores Ideales
ln (2) X 2X 0
3. FASE ESTACIONARIA
El crecimiento en esta fase no cesa, sin embargo el crecimiento neto es 0.
S
m mmax
S Ks
En la fase
estacionaria
se verifica:
dX S1
m max X 0 m 0; S 0
dt S1 K s
Modelado de Bioreactores Ideales
4. FASE DE MUERTE
El crecimiento en esta fase no cesa, sin embargo el crecimiento neto es 0.
S1 ... YS X X YS P P1 ...
1 1 1
Muerte
Modelado de Bioreactores Ideales
S1 ... YS X X YS P P1 ...
4. FASE DE MUERTE 1 1 1
Muerte
Modelo que no contempla la muerte Modelo que sí contempla la muerte
Balance para un Sustrato Balance para un Sustrato
dS1 dS1
YXS1 m X YXS1 m X
dt dt
Balance para la biomasa Balance para la biomasa
dX dX
m X X
mX
dt dt
Balance para un Producto Balance para un Producto
dP1 dP1
YXP1 m X YXP1 m X
dt dt
Modelado de Bioreactores Ideales
S1 ... YS X X YS P P1 ...
1 1 1
Balance para un Sustrato
dS1
Muerte YXS m X mX m
Mantenimiento dt 1
dP1
YXP1 m X
dt
Modelado de Bioreactores Ideales
X X X
X X X
o o o
P P P P
P
P
t t t
Producto asociado Producto asociado Producto no asociado
1 al crecimiento 2 al crecimiento mixto 3 al crecimiento
S1 ... YS X X YS P P1 ...
1 1 1
Balance para un Sustrato
dS1
Muerte YXS m X mX m
Mantenimiento dt 1
1 dS1 YXS m X dX
X0
dt 1
(X X )
1 1
XS1
2 dX m X
0
dt
Balance para un Producto
3
(P P ) Y 0
(X X )
1 1
3 dP1 2 0 XP1
YXP1 m X
dt
Modelado de Bioreactores Ideales
(S S ) Y
XS
dt 1
0
m
(X X )
Balance para la biomasa 1 1
0 XS1
m
2 dX m X
dt
Balance para un Producto
S vs X, CORRELACION LINEAL!
Modelado de Bioreactores Ideales
BATCH. Ejemplo 3
Acido
Glucosa (G) Láctico (AL)
Time [h] [g/L] [g/L] X, [g/L]
0 19.5 0.45 0.01
13 16.88 3.88 0.41
14 14.85 4.94 0.54
16 13.11 6.98 0.92
18 10.4 8.98 0.99
19 8.91 10.3 1.05
20 7.75 10.83 1.15
22 5.18 12.57 1.3
24 3.64 14.58 1.35
37 0.25 16.03 0.69
Modelado de Bioreactores Ideales
Escala logarítmica
Crecimiento exponencial 4
Primeros puntos!!!!
Modelado de Bioreactores Ideales
BATCH. Ejemplo 3
0.00
-0.50 0 5 10 15 20
-2.50
-3.00
-3.50 y = 0.2838x - 4.6003
-4.00 R² = 0.9999
-4.50
-5.00
Tiempo, h
Modelado de Bioreactores Ideales
BATCH. Ejemplo 3
25
y = -11.586x + 21.074
(S S ) Y
20
R² = 0.9379 0
(X X )
15 1 1
0 XS1
s
10
0 1.6
0 0.2 0.4 0.6 0.8 1 1.2 1.4 1.6
1.4 y = 0.0973x + 0.0633
x 1.2 R² = 0.9603
1
(P P ) Y
P 0.8
0 0.6
(X X )
1 1 0.4
0 XP1
0.2
0
0 2 4 6 8 10 12 14 16
x
Modelado de Biorreactores Ideales
Biorreactores Continuos
Perfectamente Mezclados en Estado Estacionario
QUIMIOSTATOS
54
Modelado de Biorreactores Ideales
0 M j 0 rj V M j
V: volumen del reactor (l, litro)
rj: Velocidad de generación o
desaparición de la especie j (molj/min)
Mj: Caudal de moles de la especie j
(molj/min)
F= Caudal volumétrico, l/min
D Coeficiente de dilución
Unidades: 1/h 0 (S10 S1 )D rS 1
Modelado de Bioreactores Ideales
0 (S10 S1 )D rS 1
0 (S10 S1 )D YXS1 mX
S1
0 (S10 S1 )D YXS1 mmax X CONCENTRACION A LA SALIDA
S1 K S1 DEL BIOREACTOR
Modelado de Bioreactores Ideales
0 X D mX m mmax
S1
S1 K s
S1
D mmax CONCENTRACION A LA SALIDA
S1 K S
DEL BIOREACTOR
1
Modelado de Bioreactores Ideales
0 (P10 P1 )D YXP mX
S1
m mmax
1 S1 K s
0 (S10 S1 )D YXS1 mX
S1
0 (P10 P1 )D YXP1 mmax X CONCENTRACION A LA SALIDA
S1 K S1 DEL BIOREACTOR
Modelado de Bioreactores Ideales
Sustrato
Gaseoso Concentración
del sustrato
S 2g en la fase
líquida
Concentración
del sustrato
en la fase
gaseosa
* Concentración
S g
2
S :
2 del sustrato
en la fase
S2 S 2* líquida en la
interfase G-L
Modelado de Bioreactores Ideales
S g pS 2 yS2 PT
2
S *
2 Presión total
S 2* H S2 H S2
S2
Constante de Henry, es una función
de la temperatura!
Gas Constant de Henry H a 25C
atm/(mol/l)
He 2865
O2 756.7
N2 1600
H2 1228
CO2 29.8
NH3 56.9
Modelado de Bioreactores Ideales
0 M j 0 rj V M j
Moles/h que entran al reactor:
por la corriente líquida y desde
la fase gaseosa
0 S20 F k L a(S2* S2 )V rS 2 V S2 F
0 (S20 S2 )D k L a(S2* S2 ) rS 2
Coeficiente de Area superficial de
transferencia de burbujas por unidad
masa de vlumen
kLa Se puede determinar experimentalmente
Modelado de Bioreactores Ideales
*
P
2
g P : Concentración
2
* del producto
P 2 en la fase
P2 líquida en la
interfase G-L
0 M j 0 rj V M j
0 P20 F k L a(P2* P2 )V rP 2 V P2 F
0 (P20 P2 )D k L a(P P2 ) rP 2 2
*
pP2 yP2 PT
P
2
*
H P2 H P2
Modelado de Bioreactores Ideales
0 (S10 S1 )D rS 1
Dm
Balance para un producto en fase líquida
0 (P10 P1 )D rP1
Balance para un sustrato que proviene de una fase gaseosa
0 (S20 S2 )D k L a(S2* S2 ) rS 2
Balance para un producto que se libera como gas
0 (P20 P2 )D k L a(P P2 ) rP 2 2
*
Modelado de Bioreactores Ideales
QUIMIOSTATO
Ejemplo 1
QUIMIOSTATO
Ejemplo 1 (Cont.)
Balance para la biomasa
Dm
S1
D mmax
S1 K S 1 Concentración de
DS1 DK S mmax S1
1
sustrato a la salida
en función de D
DK S
S1 1
(mmax D )
Modelado de Bioreactores Ideales
QUIMIOSTATO
Ejemplo 1 (cont.)
Balance para un Sustrato en fase líquida
Dm
X
( S10 S1 )
X YS1 X S10
DK S1
YXS 1
(mmax D )
DK S
S1 1
(mmax D )
Modelado de Bioreactores Ideales
QUIMIOSTATO
Ejemplo 1 (cont.)
DK S DK S1
S1 1
X YS1 X S10
(mmax D ) (mmax D ) 12
D, 1/l S X DX 10 S
0.1 0.1034483 1.9793103 0.197931 X
0.4 0.4615385 1.9076923 0.7630769
8
0.7 0.9130435 1.8173913 1.2721739 DX
1 1.5 1.7 1.7
XyS
1.3 2.2941176 1.5411765 2.0035294 6
1.6 3.4285714 1.3142857 2.1028571
1.9 5.1818182 0.9636364 1.8309091
2 6 0.8 1.6 4
2.1 7 0.6 1.26
2.2 8.25 0.35 0.77
2.30765 9.9992056 0.0001589 0.0003666 2
2.6 9.9992056 0.0001589 0.0004131
2.7 9.9992056 0.0001589 0.000429
2.8 9.9992056 0.0001589 0.0004449 0
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3
2.9 9.9992056 0.0001589 0.0004607
D
Modelado de Bioreactores Ideales
QUIMIOSTATO
Ejemplo 1 (cont.)
D de lavado se obtiene haciendo X=0 12
DK S1 10 S
X YS1 X S10 0
(mmax D ) 8
X
DX
S10
Dmax m max 2.3
XyS
6
S10 K S1
4
Dmax
2
0
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3
D
Modelado de Bioreactores Ideales
QUIMIOSTATO
Ejemplo 1 (cont.)
DX opt
12
Se deriva la función DX y se iguala a 0
KS 10 S
DOPT mmax 1 1 1.55 X
S10 K S
1 8
DX
Dopt
XyS 6
0
0 0.5 1 1.5 2 2.5 3