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Maldonado Fernndez
Univ. Miler
Cbba 2013
Centro de Biotecnologa
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OBJETIVOS
1.1 General: Determinar el rendimiento de degradacin microbiana en relacin a
llllllllllllllllllllos cuatro tipos de especies de gramneas en suelos contaminados
lllllllllllllllllllcon diesel.
1.2 Especficos:
MARCO TERICO
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Horizonte D: Esta capa posee roca slida bajo el suelo, es importante para la formacin
de acuferos. En Puerto Rico los acuferos se localizan al norte de la isla, siendo stos
muy importantes como reserva de agua.
Cantidad de agua y composicin de gases en el suelo
En el suelo, adems de residuos orgnicos, encontramos agua y gases. La cantidad de
agua en el suelo depende de: la precipitacin y otras condiciones climticas, el drenaje,
ste depende del tamao de las partculas del suelo, la composicin del suelo ,la
poblacin viviente del suelo.
Encontramos el agua en los espacios que hay entre las partculas del suelo o adheridas a
la superficie de las partculas.
La fase gaseosa del suelo consiste mayormente de CO2, O2 y N2, stos se encuentran en
los espacios entre partculas donde no hay agua. La cantidad de gases es inversamente
proporcional a la cantidad de agua en el suelo.
Factores que contribuyen al nmero y tipo de microorganismos en el suelo:
Composicin del suelo (cantidad y tipo de nutrientes).
Caractersticas fsicas del suelo (grado de aireacin, humedad, temperatura y pH).
Tipo de plantas en el suelo (el sistema de races influye en el nmero y tipo de
organismos presentes).
Flora Microbiana en el Suelo: En un suelo frtil podemos encontrar races de plantas
superiores, diversos animales y una gran cantidad de microorganismos.
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La rizsfera es la capa de suelo que se encuentra adyacente a las races. Esta regin se
caracteriza por una alta poblacin microbiana. Las bacterias que crecen en la rizsfera se
ven afectadas positivamente por substancias que liberan las plantas como aminos cidos,
vitaminas y otros. A la vez el crecimiento de las plantas se ve afectado por substancias
liberadas por la poblacin microbiana.
Interaccin entre los microorganismos del suelo
Relaciones simbiticas:
Neutralismo: Es esta relacin dos especies ocupan el mismo ambiente sin que se afecte
una o la otra (neutral).
Mutualismo: Es una asociacin donde cada uno de los organismos envueltos se
benefician (relacin positiva).
Comensalismo: Es esta relacin un organismo se beneficia mientras que el otro no se
afecta (relacin positiva). Un ejemplo lo observamos en los hongos que degradan celulosa
a glucosa y otros compuestos, las bacterias no pueden degradar celulosa, pero s glucosa
beneficindose de esta forma.
Antagonismo: Esto se observa cuando una especie afecta adversamente el ambiente de
otra especie, produciendo diferentes substancias inhibidoras o antibiticas (relacin
negativa). Un ejemplo lo vemos en la produccin de sustancias inhibidoras como:
metano
sulfuros
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estn envueltos en los ciclos de nitrgeno, carbono, azufre y fsforo. Tambin estn
envueltos en los ciclos de hierro, manganeso, mercurio, selenio, zinc y potasio.
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2. Fundamentos de la Biodegradacin
2.1. Organismos Hidrocarburoclsticos
Los llamados organismos hidrocarburoclsticos o petroleolticos son bacterias y hongos
capaces de degradar petrleo fisiolgica y metablicamente. Ms de 100 especies de 30
gneros microbianos son capaces de usar hidrocarburos, como mtodo de subsistencia.
Los gneros de organismos hidrocarbonoclsticos son: Pseudomonas, Nocardia, Vibrio,
Candida, Brevibacterium, Corynebacteium, Flavobacterium, Acinetobacter, Micrococcus,
Arthrobacter, Achromobacter, Rhodococcus, Alcaligenes, Mycobacterium, Bacillus,
Aspergillus,Mucor, Fusarium, Penicillium, Rhodotorula y Sporobolomyces. La fraccin del
total de organismos que metabolizan hidrocarburos es altamente variable, 6 a 82% para
hongos terrestres, 0,13% a 50% para bacterias de la tierra, y del 0,003% a 100% para
bacterias marinas.
En ecosistemas no contaminados, los microorganismos degradadores de hidrocarburos
constituyen menos del 0,1% de la comunidad microbiana; mientras que en ecosistemas
contaminados con hidrocarburos pueden constituir el 100% de la comunidad microbiana.
Las poblaciones dominantes en estas comunidades poseen caractersticas nutricionales
relacionadas al contaminante y pueden ser tambin resistentes a muchas formas de
estrs ambiental. Cuando la fuente de carbono es un substrato insoluble como un
hidrocarburo, los microorganismos facilitan su difusin hacia la clula produciendo
substancias como carbohidratos, cidos grasos, enzimas y biosurfactantes. Los
microorganismos utilizan estos compuestos a manera de un biofilm alrededor de la
molcula del hidrocarburo, para posteriormente ingerirlo o romperlo en compuestos
simples de carbono y oxgeno. Estos microorganismos usan la energa liberada para
manejar los procesos termodinmicamente no espontneos como la sntesis de
componentes celulares.
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Tabla 1. Principales microorganismos petroleolticos objeto de estudio en los ltimos aos (Fuente: Tratamiento
microbiolgico de la contaminacin por petrleo en ambientes marinos. Estudio de su posible optimizacin. M.A: Murado,
J.Mirn, M.P.Gonzlez)
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Temperatura
Generalmente las especies bacterianas crecen a intervalos de temperatura
bastante reducidos en torno a un valor medio tpico de cada zona. Para aguas
canarias, este rango oscila entre -2 y 35C (condiciones mesfilas).
La biodegradacin decrece por desnaturalizacin de las enzimas a temperaturas
superiores a 40C, mientras que se inhibe con temperaturas bajas. Una
temperatura ptima de crecimiento bacteriano suele estar en torno a los 25 C. La
tasa de degradacin decrece exponencialmente cuando se baja de esta
temperatura, habindose comprobado que es 10 veces inferior a 5C.
Oxigenacin
La disponibilidad de oxgeno es fundamental para las degradaciones aerbias, que
son las que resultan ms eficientes. Aunque su disponibilidad no suele ser
limitante en ambientes marinos, la concentracin del mismo depende de su
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Necesidad de nutrientes
El metabolismo microbiano est orientado a la reproduccin de los organismos y
stos requieren que los constituyentes qumicos se encuentren disponibles para su
asimilacin y sntesis. Los nutrientes principalmente requeridos son el fsforo y el
nitrgeno, cuya disponibilidad suele ser ms limitante que la de oxgen, siendo la
mayora de los ambientes marinos deficitarios en estos nutrientes, as como en
hierro.
Por lo general suele haber en el suelo una concentracin de nutrientes suficiente,
sin embargo, si estos no se encontrasen en el rango normal se puede adicionar
mayor cantidad al medio. El rango normal de C:N:P depende del sistema de
tratamiento a emplear, siendo de modo habitual 120:10:1.
pH del suelo
Afecta significativamente en la actividad microbiana. El crecimiento de la mayor
parte de los microorganismos es mximo dentro de un intervalo de pH situado
entre 6 y 8.
Asimismo, el pH tambin afecta directamente en la solubilidad del fsforo y en el
transporte de metales pesados en el suelo. La acidificacin o la reduccin del pH
en el suelo se puede realizar adicionando azufre o compuestos del azufre.
Humedad
Los microorganismos requieren unas condiciones mnimas de humedad para su
crecimiento. El agua forma parte del protoplasma bacteriano y sirve como medio
de transporte a travs del cual los compuestos orgnicos y nutrientes son
movilizados hasta el interior de las clulas.
Un exceso de humedad inhibir el crecimiento bacteriano al reducir la
concentracin de oxgeno en el suelo. El rango vara en funcin de la tcnica.
Ventajas
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Inconvenientes
Para muchos tipos de vertidos su efectividad no ha sido determinada, y en
general es poco eficiente con compuestos pesados.
Su aplicacin en el mar reviste una elevada dificultad y en general no es
viable debido a la inestabilidad del medio
El tiempo necesario para la actuacin de los microorganismos es largo
Su implementacin es especfica para cada lugar contaminado, tanto en lo
referente al tipo de microorganismos empleados como a las tcnicas de
enriquecimiento nutricional y tcnicas de aplicacin.
Su optimizacin requiere informacin sustancial acerca del lugar
contaminado y las caractersticas del vertido, por lo que generalmente no
es una tcnica de aplicacin inmediata.
3. Tcnicas de Biorremediacin
Las medidas de biorremediacin pueden dividirse en aquellas que se llevan a cabo en el
lugar afectado por la contaminacin (In Situ) y aquellas que se llevan a cabo fuera de este
(Ex Situ), con el material que ha sido retirado de la zona contaminada y depositado en
zonas de tratamiento designadas.
Entra las tcnicas Ex Situ se incluyen el cultivo de tierras, la transformacin en abonos y
el bioapilamiento. Durante muchos aos se han empleado con xito algunas de estas
tcnicas, principalmente la de cultivo de tierras, que ha sido explotada como la forma ms
habitual de tratamiento de los residuos oleosos. Sin embargo, en el mbito de la
contaminacin del litoral por hidrocarburos, frecuentemente el gran volumen de residuos
hace que sean las tcnicas In Situlas ms adecuadas para su tratamiento.
Los principales factores que se incluyen en el proceso de biodegradacin son la
disponibilidad de oxgeno y nutrientes. En consecuencia, muchas tcnicas In Situ se
centran en medidas que pueden tomarse para manipular los niveles de estos elementos
con el objeto de crear condiciones ptimas que permitan potenciar el proceso de
biodegradacin. Estas tcnicas reciben habitualmente la denominacin de
Bioestimulacin.
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lenta, como briquetas, pero han de poseer la densidad suficiente y estar bien ligadas con
elementos de amarre para evitar la abrasin fsica y una disolucin rpida a causa de la
accin del oleaje y las mareas.
Los grnulos cilndricos y esfricos de liberacin lenta pueden ser una alternativa, ya que
liberan nutrientes en contacto con el agua de mar o el agua de lluvia, pero tambin
pueden ser arrastrados antes de que resulten eficaces.
Los avances ms recientes incluyen composiciones de nutrientes oleficos que pueden
ser atrados hacia los hidrocarburos reduciendo la tendencia a ser arrastrados.
Cuando se estn aplicando nutrientes en cualquiera de estas formas, se deber tener
especial cuidado para evitar una sobre aplicacin y la consiguiente acumulacin de
nutrientes, ya que esto podra producir fenmenos de eutrofizacin y afloramientos
txicos de algas.
Aireacin
La carencia de oxgeno puede producirse cuando la permeabilidad de los sedimentos del
litoral no es suficiente para permitir que el oxgeno acceda a los microorganismos. En
ciertos casos, puede ocurrir que la presencia de los hidrocarburos reduzca por s misma
la permeabilidad, al obstruir los espacios intersticiales de los sedimentos.
En estos casos, a fin de mantener las condiciones aerbicas que favorecen la
biodegradacin del hidrocarburo, es necesario perturbar fsicamente los sedimentos para
facilitar la entrada de oxgeno, mediante rastrillado o arado realizados de forma peridica,
bien de forma manual o mediante fresadora.
No obstante, ciertos sistemas ambientales son especialmente sensibles a cualquier tipo
de intromisin fsica. En general, en estos lugares se impiden los mtodos
convencionales de limpieza del litoral o se restringen duramente, por lo que se debe
considerar la perturbacin fsica con objeto de ventilacin nicamente si, y siempre n la
medida en que, no se cause perjuicio al medio ambiente. Adems, cuando se estn
moviendo o perturbando materiales en cualquier litoral, debe procurarse no enterrar los
hidrocarburos an ms dentro del sedimento.
Limitaciones
Esta tecnologa no es recomendable para suelos arcillosos, altamente estratificados o
demasiado heterogneos, ya que pueden provocar limitaciones en la transferencia de O2.
Otros factores que pueden limitar su aplicacin, incluyen:
a) que el tipo del suelo no favorezca el crecimiento microbiano
b) un incremento en la movilidad de los contaminantes
c) la obstruccin en los pozos de inyeccin provocada por el crecimiento microbiano
Costos y tiempos de remediacin
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La limpieza de una playa contaminada puede requerir de varios aos con tratamientos
repetidos. Su costo oscila entre 30 y 100 USD/m3. La naturaleza y profundidad de los
contaminantes y el uso de bioaumentacin puede aumentar sus costos (Van Deuren y
col., 1997).
II) Bioaumentacin
Tcnica Empleada
Esta tecnologa se utiliza cuando se requiere el tratamiento inmediato de un sitio
contaminado, o cuando la microflora autctona es insuficiente en nmero o capacidad
degradadora. Consiste en la adicin de microorganismos vivos, que tengan la capacidad
para degradar el contaminante en cuestin, para promover su biodegradacin o su
biotransformacin.
La bioaumentacin puede realizarse sembrando las reas afectadas con microorganismos
petroleolticos autctonos o alctonos, pero en ambos casos se deben aadir nutrientes
auxiliares (N, P y Fe) para favorecer el desarrollo de las especies, ya que el medio marino
es deficitario en stos y se deben equilibrar las proporciones de carbono que implica un
vertido de petrleo. El tamao del inculo a utilizar, depende del tamao de la zona
contaminada, de la dispersin de los contaminantes y de la velocidad de crecimiento de
los microorganismos degradadores.
La ventaja de la adicin de microorganismos alctonos es que stos son seleccionados
de entre los organismos con mayor poder de degradacin del petrleo. En la Tabla 1 se
puede contemplar una lista de las especies capaces de degradar diferentes fracciones
del petrleo.
Limitaciones
A fin de prevenir las posibles alteraciones a los equilibrios ecolgicos que frecuentemente
supone la introduccin en un determinado sistema de organismos forneos, el uso de
estos microorganismos se realizar siempre bajo las siguientes condiciones:
a) Los microorganismos introducidos no son fotosintticos y requieren carbono
orgnico para sobrevivir.
b) No pueden sobrevivir como parsitos de otros organismos, sino nicamente como
saprfitos.
c) No forman esporas o cualquier otra forma de resistencia.
Por otra parte, antes de llevar a cabo la bioaumentacin en un sitio, deben realizarse
cultivos de enriquecimiento, aislar microorganismos capaces de cometabolizar o utilizar el
contaminante como fuente de carbono, y cultivarlos hasta obtener grandes cantidades de
biomasa.
Costos y tiempos de remediacin
Es una tecnologa que puede durar varios meses o aos, y su utilizacin no implica
mucho capital ni costos de operacin.
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III) Fitorremediacin
Tcnica Empleada
Este es el proceso de utilizar el crecimiento de las plantas para acelerar la biodegradacin
natural de los hidrocarburos. Los hidrocarburos que se encuentran infiltrados en el terreno
son, o bien transformados en el proceso de crecimiento de las plantas, o bien asimilados
y metabolizados por la propia vegetacin.
Esta tcnica puede ofrecer buenos resultados en los derrames que afectan a zonas
frgiles como marismas o saladares, donde el tratamiento posible se reduce a una
limpieza suave
con tcnicas poco agresivas. Se puede potenciar el proceso estimulando el crecimiento
de las plantas existentes mediante la adicin de fertilizantes, o bien mediante la
introduccin de plantas nuevas, procurando que sean autctonas de la zona afectada.
En algunos casos, la restauracin del crecimiento vegetal tiene el beneficio aadido de
prevenir o reducir al mnimo los efectos perjudiciales de la erosin.
Los mecanismos por los que acta la fitorremediacin incluyen la rizodegradacin, la
fitoextraccin, la fitodegradacin y la fitoestabilizacin.
Rizodegradacin : Este proceso se lleva a cabo en el suelo que rodea a las races. Las
sustancias excretadas naturalmente por stas, suministran nutrientes para los
microorganismos, mejorando as su actividad biolgica.
Fitoextraccin : Durante la fitoextraccin, los contaminantes son captados por las races
(fitoacumulacin), y posteriormente stos son traslocados y/o acumulados hacia los tallos
y hojas (fitoextraccin).
Fitodegradacin : La fitodegradacin consiste en el metabolismo de contaminantes
dentro de los tejidos de la planta, a travs de enzimas que catalizan su degradacin.
Fitoestabilizacin : Las plantas limitan la movilidad y biodisponibilidad de los
contaminantes en el suelo, debido a la produccin en las races de compuestos qumicos
que pueden adsorber y/o formar complejos con los contaminantes, inmovilizndolos as
en la interfase races:suelo.
Limitaciones
Existen varias limitaciones que deben considerarse para su aplicacin:
a) El tipo de plantas utilizado determina la profundidad a tratar, ya que el tratamiento
del terreno contaminado slo se produce en la zona en que la planta arraiga.
b) Altas concentraciones de hidrocarburos pueden resultar txicas para el vegetal,
por lo que generalmente se requiere una retirada previa de los grandes volmenes
de contaminante.
c) La eficiencia del proceso y su viabilidad puede depender de la estacin del ao.
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MATERIALES Y EQUIPOS
3.1 Materiales
4 Muestras de suelo
6 frascos con tapas de 200ml (para cada muestra)
Solucin buffer PBS
Solucin PCA
Agua destilada
24 cajas Petri (4 por dilucin)
1 caja de tips (para dilucion)
1 caja de tips (para crudo)
1 caja de tips (para muestra)
4 marcadores permanentes
Papel cerafin (cant. considerada)
Papel aluminio (cant. considerada)
Papel madera (cant. considerada)
Bolsas plsticas (cant. considerada)
1 Matraz Erlenmeyer de 200 ml
1 Matraz Erlenmeyer de 1000 ml
1 probeta graduada de 1000 ml
1 Micro Pipeta (20- 200 L)
1 Micro Pipeta ( 800 L)
1 Micro Pipeta ( 200 L)
1Tijera
Pares de Guantes
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Recipiente de etanol
1 Encendedor
Hazas Drigalsky (para crudo y muestra)
1 Cronometro
1 tamiz de 200 micrones
3.2 Equipos
Autoclave
Hornilla
Incubadora
Campana de absorcin
Balanza analtica
Cmara frigorfica
PH metro
ASPECTOS PRELIMINARES
Registrar la temperatura del ambiente y hora de inicio de la prueba.
Previamente a la realizacin de la prueba, se deber determinar en laboratorio el
poder calorfico y el contenido de humedad del combustible.
Asimismo, antes de la realizacin de la prueba se requiere determinar el punto de
ebullicin local del agua, de la siguiente manera: hervir agua en una olla (5 litros);
cuando se produzca la ebullicin y sta se mantenga por unos cinco minutos,
medir la temperatura del agua con el termmetro digital colocado a 5 cm del fondo
de la olla. Se registrar la temperatura mnima y mxima, durante los cinco
minutos sealados. La temperatura de ebullicin corresponder al promedio de las
temperaturas mnima y mxima registradas.
Determinar las dimensiones promedio del combustible a utilizar (longitud x ancho x
altura). En lo posible se deber usar combustible en piezas similares para reducir
variaciones de las condiciones de la prueba; se recomienda usar combustible de
seccin transversal rectangular de alrededor de 3 cm x 4 cm y de longitud
adecuada al modelo de cocina en evaluacin. Se deber separar el combustible
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en tres lotes, los dos primeros de tres kilos y el ltimo de 4 kilos. Se pesar
previamente cada lote
Registrar el contenido de humedad de la madera utilizando un medidor de
humedad de madera o determinado en laboratorio acreditado.
Se usarn tantas ollas como hornillas tenga la cocina.
5
PROCEDIMIENTO EXPERIMENTAL
OBSERVACIONES
CONCLUSIONES
BIBLIOGRAFA
1. Microbial Ecology, Ronald Atlas & Richard Bartha. 1998. Benjamin Cummings
[LIBRO DE TEXTO]
2. Internet Google,Altavista ,Terra,(microbiologa del suelo)
3. Haynes, W.C., Wickerham, L.J. y Hesseltine, C.W. (1955), Maintenance of cultures
of industrially important microorganisms. Appl. Microbiol. 3, 361368.
4. Lopez, M.J. y RamosCormenzana, A. Xanthan production from olivemill
wastewaters. Int. Biodet. Biodegr. 263270.
5. Sutherland, I.W. (1994), Structurefunction relationships in microbial
exopolysaccharides. Biotech. Adv. 12, 393448.
6. Vela, G.R. y Rosenthal, S. (1972). The effect of peptone on azotobacter morfology.
J. Bacteriol. 111, 260266
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