Universidad Catlica Agropecuaria del Trpico Seco

Pbro. Francisco Luis Espinoza Pineda

Fundacin 1968-2012

Segundo Ao

Introduccin a la Bioqumica

Ingeniera Agropecuaria

Bioqumica

Contenido

Introduccin ....................................................................................................................................... 3
Definicin ........................................................................................................................................... 4
Antecedentes histricos del trabajo pionero bioqumico ............. Error! Marcador no definido.
Objeto de estudio de la bioqumica ............................................................................................... 5
Relacin de la bioqumica con otras ciencias .............................................................................. 5
Importancia de la Bioqumica para las ciencias agropecuarias ................................................ 6
Bioelementos..................................................................................................................................... 7
Biomolculas ..................................................................................................................................... 8
Clasificacin de las Biomolculas .................................................................................................. 9
Composicin bioqumica del protoplasma comparado en vegetal y animal ........................ 10
Importancia para los seres vivos.................................................................................................. 10
Reacciones de importancia bioqumica ...................................................................................... 11
Reacciones de toxificacin del organismo. ................................................................................ 13
LISTA DE ABREVIATURAS A UTILIZAR EN BIOQUIMICA ................................................... 14

Introduccin a la Bioqumica

Pgina 2

Bioqumica

OBJETIVOS:
Al finalizar el curso el estudiante estar en capacidad de:

Reconocer la importancia de la Bioqumica para el anlisis y comprensin

de los procesos agropecuarios

Valorar la importancia de la aplicacin del conocimiento bioqumico en las

reas pecuarias y Oleoricultura.

Desarrollar habilidades y destrezas en el trabajo de laboratorio

Ampliar las capacidades para trabajar en equipo y cooperar con sus

compaeros de aula.

Introduccin a la Bioqumica

Pgina 3

Bioqumica

Introduccin
Etimolgicamente la palabra bioqumica significa qumica de la vida. Esta
ciencia, como tal, es relativamente joven, sin embargo, sus races, un poco difusas
pueden ubicarse en los finales del siglo XVIII, como resultado de descubrimientos
aislados de cientficos de muy diversa especialidad, pero en su mayor parte
relacionados con la qumica, la fsica y la biomedicina. Entre los descubrimientos
realizados en esta etapa, que tendrn importante repercusin en el desarrollo de
esta ciencia deben destacarse el aislamiento y la identificacin de numerosas
sustancias naturales.
La Bioqumica es una de las disciplinas que mayor desarrollo ha alcanzado en el
presente siglo. La labor de los bioqumicos en tcnicas tan importantes como la
nutricin, el control de enfermedades y la proteccin de cosechas, ha
proporcionado aportes importantes en la tarea de alimentar a la poblacin mundial.
Adems, el elevado desarrollo cientfico alcanzado por la bioqumica en los ltimos
aos ha contribuido a aumentar los conocimientos acerca de las bases qumicas
de la vida.

Definicin
La bioqumica es el estudio de:
1) la composicin molecular de las clulas vivas;
2) las reacciones qumicas que sufren los compuestos biolgicos;
3) la regulacin de esas reacciones.
Etimolgicamente Bioqumica significa" qumica de la vida".

Es una disciplina

cientfica que se ocupa de los procesos qumicos que ocurren en la materia viva.

Introduccin a la Bioqumica

Pgina 4

Bioqumica

Describe y analiza los fenmenos qumicos que se producen en la clula

estudindolos desde el punto de vista de estructura y funcin.

Objeto de estudio de la bioqumica

El objetivo de la bioqumica es el conocimiento de la estructura y comportamiento
de las molculas biolgicas, que son compuestos de carbono que forman las
diversas partes de la clula y llevan a cabo las reacciones qumicas que le
permiten crecer, alimentarse, reproducirse y usar y almacenar energa.

Relacin de la bioqumica con otras ciencias

La bioqumica tiene sus races en la medicina, la nutricin, la agricultura, la
fermentacin y los procesos qumicos de los productos naturales. Actualmente, se
ocupa del estudio qumico de las molculas que se encuentran en el interior de los
sistemas vivos o asociadas con estos, en especial los procesos qumicos
relacionados con las interacciones de dichas molculas. (Conn et al, 2002)
La bioqumica influye profundamente en la medicina. Los mecanismos
moleculares de muchas enfermedades, tales como la anemia falciforme y
numerosos errores innatos del metabolismo, han sido dilucidados. Los anlisis de
actividades enzimticas son indispensables para el diagnstico clnico correcto.
As, por ejemplo, los niveles de ciertos enzimas en suero revelan si un paciente
acaba de sufrir un infarto de miocardio. Los anlisis de ADN se utilizan en el
diagnostico de enfermedades genticas o infecciosas. Adems, la bioqumica
constituye la base para el diseo racional de nuevos frmacos. Tambin la
agricultura se beneficia de la tecnologa del ADN recombinante, la cual puede
producir cambios programados en la dotacin gentica de los organismos vivos.

Introduccin a la Bioqumica

Pgina 5

Bioqumica

Importancia de la bioqumica con otras ciencias

La bioqumica es una ciencia mdica y biolgica fundamental que ayuda a
comprender la biologa celular, la microbiologa, la nutricin, la farmacologa y la
fisiologa molecular. El esclarecimiento de los mecanismos de los procesos
patolgicos (patognesis) es uno de los objetivos de la bioqumica mdica.
Adems, el conocimiento de la bioqumica es til en el diagnstico y tratamiento
de las enfermedades, y las pruebas que se realizan en los laboratorios de qumica
clnica se utilizan para vigilar el tratamiento.
El rpido desarrollo de la bioqumica en aos recientes, ha permitido a los
investigadores resolver algunos de los desafiantes y fundamentales
problemas de la biologa y de la medicina:
Cmo puede un huevo fertilizado dar lugar a clulas tan
diferentes como las del msculo, las del cerebro o las del
hgado?
Cmo las clulas se encuentran, una a otra, para formar un
rgano complejo?
Cmo se controla el crecimiento de las clulas?

Importancia de la Bioqumica para las ciencias agropecuarias.

La bioqumica proporciona a los ingenieros agrnomos y pecuarios mtodos
efectivos para el aumento de los cultivos el desarrollo y mejoramiento de masa
animal, tanto desde el punto de vista cuantitativo como cualitativo. La aplicacin
de sistemas moderno de produccin tiene como base la investigacin que
proporciona mayor rendimiento y desarrollo econmico, investiga formas de
mejorar la nutricin del hombre y de los animales.

Introduccin a la Bioqumica

Pgina 6

Bioqumica

En la bioqumica el ingeniero agropecuario halla fundamentos cientficos que le

permiten encaminar adecuadamente la auto conservacin y la autoproduccin que
es la base fundamental para el aumento del produccin agropecuaria.
Da una mejor comprensin para los distintos tipos de cra de animales; busca
formas de solucionar los problemas de rechazo de tejidos en los trasplantes
mdicos.
Las investigaciones bioqumicas sirven de bases a los sistemas modernos
adoptando los mtodos de cultivo para un mayor desarrollo y rendimiento
econmico; busca alternativas para los insecticidas y fertilizantes o incrementando
la biodegradacin de los productos desechados en procura de mejorar el medio
ambiente. Permite comprender los fenmenos naturales que ocurren en las
plantas y establecen las bases del crecimiento necesarios para abordar
satisfactoriamente las necesidades del desarrollo. Tambin nos dar respuesta a
la problemtica del crecimiento de la poblacin mundial para aumentar la
produccin de alimento por mtodos no convencionales que no pueden ser el
producto de la aplicacin de mtodos de investigacin emprica. El conocimiento
profundo de los mecanismos de las reacciones bioqumicas ms importantes
permitir mejorar la eficiencia de la produccin tanto de origen animal como
vegetal.

Bioelementos
Son 27 elementos de la naturaleza, que forman parte de los seres vivos, son los
bioelementos o elementos biognicos:
Primarios: Constituyen el 95% del peso de cualquier organismo, estos son C, H,
O, N.
Secundarios: Constituyen el 4% del peso de cualquier organismo, P, S, Ca, Na, K,
Cl, Mg, Fe.
Oligoelementos: Constituyen el 0.1% del peso de cualquier organismo, Cu, Zn,
Mn, Co, Mo, Ni, Si
Introduccin a la Bioqumica

Pgina 7

Bioqumica

Biomolculas
Toda la materia viva est compuesta por:

Agua (hasta 70-80% del peso celular),

Bioelementos primarios como C, O, N, H, P y S, imprescindibles para

formar los principales tipos de molculas biolgicas (carbohidratos, lpidos,
protenas y cidos nuclicos).

Definicin
Las biomolculas se definen como aquellas molculas presentes en los
organismos vivos.
La mayor parte de los componentes qumicos de los organismos son compuestos
orgnicos de carbono, en los que el elemento se halla, relativamente, reducido o
hidrogenado.
Los tipos ms importantes de
molculas

biolgicas

son

los

cidos nucleicos, las protenas, los

carbohidratos y los lpidos.

Introduccin a la Bioqumica

Pgina 8

Bioqumica

Clasificacin de las Biomolculas

1.

Macromolculas:

Son molculas de estructuras muy complejas y de peso molecular, muy alto, ejemplo
de estos son: Las protenas, los cidos nucleicos, los polisacridos (carbohidratos) y
los lpidos complejos.

2. Micromolculas:
Son molculas de peso molecular relativamente pequeo, ejemplo: aminocidos,
monosacridos, nucletidos y cidos grasos; los cuales pueden unirse a travs de
enlaces covalentes, a otros de su mismo tipo dando lugar a la formacin de las
macromolculas.

3. Intermediarios:
Son molculas de tamao menor de estructura simple e intervienen en la sntesis de
las macromolculas y micromolculas.

Ejemplo: cido ctrico, cido pirvico, el

gliceraldehdo-3-fosfato, etc.
De acuerdo a las caractersticas qumicas y metablicas las biomolculas se han
clasificado en cuatro grupos los cuales son:
a) Glcidos o carbohidratos.
b) Lpidos
c) Prtidos
d) cidos nucleicos o sustancias nucletidas.

Al hacer un anlisis del protoplasma animal y vegetal hay ciertas diferencias en

cuanto al contenido en proporcin de lpidos, protenas y carbohidratos, lo que nos
indica algo importante que no desempean el mismo papel metablico en ambas
formas de vida
Introduccin a la Bioqumica

Pgina 9

Bioqumica

Composicin bioqumica del protoplasma comparado en vegetal

y animal

Componente

Protoplasma vegetal

Protoplasma animal

Agua

73 %

85 %

Acidos nucleicos

02%

0.2 %

Lpidos

0.1%

13 % (grasa)

Protenas

0.2%

15 %

Carbohidratos

20%

0.1 %

Minerales

0.4%

0.4 %

Importancia para los seres vivos

Las cuatro biomolculas desempean funciones idnticas, en todas las especies
de clulas. Los cidos nucleicos actan universalmente, en el almacenado y
transmisin de la informacin gentica.
Las protenas son los productos directos y los efectores de la accin de los genes,
y a ellas se incorpora la informacin gentica.
Las protenas son polmeros formados por residuos de aminocidos. En la sntesis
de protenas participan 20 aminocidos codificados genticamente. Las protenas
tienen un papel estructural, funcional, de defensa y regulador en la vida. Las
grasas o lpidos son solubles en solventes orgnicos (ter o cloroformo y metanol).
En la naturaleza hay una gran variedad de lpidos. Las grasas (triglicridos) sirven
como formas de almacenamiento de energa, los fosfolpidos se encuentran en las
membranas y los esteroides estn en las membranas y constituyen las hormonas
esteroides.
Los carbohidratos, o azucares, son compuestos solubles en agua que participan
tanto en la energtica como en la estructura de clulas y rganos. Los
Introduccin a la Bioqumica

Pgina 10

Bioqumica

polisacridos son grandes polmeros de carbohidratos constituidos por unidades

llamadas monosacridos, que son las unidades de azucares mas simples. Los
oligosacridos

son

compuestos formados

por

unos pocos residuos de

monosacridos que pueden estar unidos a protenas. Los oligosacridos tienen

papel estructural y funcional en la economa celular (Roskoski, 1997).

Reacciones de importancia bioqumica

A continuacin estimado alumno le presento un cuadro sinptico de las reacciones
ms importantes que se llevan a cabo dentro de los seres vivos.

Es el tipo de reaccin que involucra el cambio de

1. Reacciones de transferencia

una parte pequea de una molcula a otra, dos

molculas intercambian algunas proporciones de las
mismas. Ejemplo. Las que se dan en la fotosntesis.
Glucosa + ATA Glucosa G.P+ ADP
Oxidacin: Ganancia de oxgeno. Prdida de

2.

Reacciones de Oxidacin
- Reduccin

electrones.
Reduccin: Prdida de oxgeno.
Ganancia de electrones.

3.

Formacin y desdoblamiento de compuestos polmeros: se da la sntesis y

Ejemplo: Cadena respiratoria

degradacin y se presentan dos tipos de reaccin:

Introduccin a la Bioqumica

Pgina 11

Bioqumica

Rompimiento de grandes molculas en unidades pequeas con

a. Hidrlisis

participacin del agua. Ej.

H- OH
Protenas

b. Polimerizacin

aminocidos + Energa

Pequeas unidades se unen se combinan o adicionan para formar

grandes unidades

4.

Rotura y formacin de enlaces Carbono - carbono

Tipos de rupturas del enlace

covalente

Reacciones homolticas (radicales libres)

Reacciones heterolticas (inicas)

Reacciones orgnica

Sirve para obtener alcoholes

A. Sustitucin o desplazamiento
Alargar cadenas
Cuando dos molculas se combinan para dar
Obtener esteres
B. Reacciones de adicin

lugar a una sola. Se combinan con enlaces o

dobles o triples.

Las reacciones generalmente tienen lugar en los sitios reactivos de las molculas
y los iones.

Introduccin a la Bioqumica

Pgina 12

Bioqumica

Estos sitios se agrupan dentro de dos categoras.

1. Reactivos nucleoflicos

o donantes de electrones.

2. Reactivos electrofilicos.

o receptores de electrones.

Eliminacin de agua (o de amonaco) en formacin de

c. Reacciones de eliminacin

dobles enlaces y adicin de agua a los dobles enlaces.

Los enlaces en el reactivo varan entre s y se

D.

Transposicin o reordenamiento

da la conversin de un ismero en otro ej:

CH3-CH2-CH2+ CH3CH+-CH3

Reacciones de toxificacin del organismo.

Estas reacciones se llaman as a un conjunto de reacciones catalizadas por
sistemas multienzimticos que permiten a los seres vivos inactivar y hacer mas
fcilmente eliminables a las sustancias, producir por el propio organismo cuya
acumulacin podra ocasionar trastornos en su funcionamiento, as como los
compuestos txicos ingeridos ocasionalmente como el alimento o aplicados por el
hombre como teraputicos, pesticidas etc.
Las reacciones que tiene lugar en estos procesos pueden ser de cuatro tipos:
oxidacin, hidrlisis, reduccin y conjugacin, los productos que se obtienen de
estas reacciones son ms polares y por tanto ms solubles en agua, lo que hace
ms fcil la excrecin, en algunos casos la misma sustancia sufre ms de una de
estas reacciones en forma consecutiva, como el caso de las biodegradables.

Introduccin a la Bioqumica

Pgina 13

Bioqumica

Ejemplos de estas reacciones son:

a. Oxidacin de alcoholes primarios.
b. Hidroxilacin.
c. .Reacciones de hidrlisis.
d. Reacciones de conjugacin.
e. Acido glucornico.
f. In sulfato.
g. Grupos metilos.
h. Glicina.
i. Acido actico.

LISTA DE ABREVIATURAS A UTILIZAR EN BIOQUIMICA.

ACTH
AMP, ADP,
ATP

Hormona adrenocorticotrfica
5'-Mono-, di- y trifosfato de
adenosina

GSH, GSSG
Hb, HbO2,
HbCO

Glutation y su forma oxidada

Hemoglobina, oxihemoglobina y
carboxihemoglobina

dAMP, dGMP,
dADP, etc.

2'-Desoxiadenosina-5'monofosfato

LDH

Lactato-deshidrogenasa

ATPasa

Adenosin-trifosfatasa

MDH

Malato-deshidrogenasa

CMP, CDP,
CTP

Nucletidos citidnicos

Mb, MbO2

CM-celulosa

Carboximetil-celulosa

NAD, NADH
DPN, DPNH

Nicatinamid-adenin-dinucletido
(nucletido difosfopiridnico) y
su forma reducida

Coenzima A y sus derivados

acilo

NADP,
NADPH
TPN, TPNH

Fosfato de nicotinamid-adenindinucletido (trifosfopiridinnucletido) y su forma reducida

CoASH,
acil-CoA, acilS-Coa

Introduccin a la Bioqumica

Mioglobina, oximioglobina

Pgina 14

Bioqumica

CoQ

Coenzima Q: Ubiquinona

Pi

DEAE-celulosa

Dietilamino-etil-celulosa

PAB o PABA

Fosfato inorgnico
Acido p-aminobenzoico

DFP

Fluorofosfato de isopropilo

PEP

Fosfoenol-piruvato

DNA

Acido desoxirribonucleico

EPG

3-fosfoglicerato

DNasa

Desoxirribonucleasa

PGA

Acido pteroil-glutmico (cido

flico)

DNP
EDTA

2,4-Dinitrofenol

PPi

Pirofosfato inorgnico

Acido etilendiaminotetractico

PRPP

5-Fosforribosil-1-pirofasto

Fd

Ferredoxina

RNA

Acido ribunucleico

FA

Acido graso

mRNA

RNA mensajero

Flavinadenin
dinucletido y su forma
reducida

rRNA

RNA ribosmico

FDNB (DNFB)

Fluorodinitrobenceno

tRNA

RNA transferidor

FDP

Fructoso-1,6-difosfato

RNasa

Ribonucleasa

FAD, FAGH2

FH2, FH4

Acidos dihidro- y
tetrahidroflicos

TMP, TDP,
TTP

Nucletidos de la timidina

FMN, FMNH2

Flavin-monocletido y su
forma reducida

TMV

Virus mosaico del tabaco

GDH

Glutamato-deshidrogenasa

TPP

Pirofosfato de tiamina

GMP, GDP,
GTP

Nucletidos de la guanosina

UDP-gal

G3P

Aldehdo gliceril 3-fosfrico

UDP-glucosa

Uridin-difosfo-glucosa

G6P

Glucosa-6-fosfato

UMP, UDP,
UTP

Nucletidos de la uridina

UV

Introduccin a la Bioqumica

Uridin-difosfo-galactosa

Ultravioleta

Pgina 15