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MODO DE ACCIN DE LAS ENZIMAS

Diagrama de las coordenadas de una reaccin qumica.

Diagrama de las coordenadas de reaccin de una reaccin qumica


catalizada enzimticamente y no catalizada.

Las enzimas alteran las velocidades de reaccin pero no


los equilibrios
S

Keq= [P]eq
[S] eq

El equilibrio de esta reaccin est asociado a la variacin de


energa libre de la reaccin segn la siguiente relacin:
G0= -RT ln Keq
G0 es la variacin de energa libre estndar que se define a
- T= 298K
- P= 1 atm
- Concentracin solutos= 1M
En condiciones fisiolgicas __________ G0 y K eq
Variacin de energa libre estndar bioqumica a pH 7 y no cc solutos 1molar.

G0= -RT ln Keq


G0 est asociada con el equilibrio de la reaccin

Entonces

La velocidad de la reaccin est determinada por la


concentracin de reactivos y por una constante de velocidad.
Por ejemplo, en la siguiente reaccin,
S
P
Para reaccin S P:
v+ = [S].k+,
para la reaccin inversa:
v- = [P].ky la velocidad de la reaccin global:
v = [S].k+ - [P].k- = -d[S]/dt = d[P]/dt.

Energa libre de activacin. La teora del estado de


transicin relaciona cada constante k con una barrera de
energa libre, el G , segn:
k=

k T e -G RT
h

k depende de G

k es la constante de Boltzman, T la temperatura absoluta, h la constante de


Planck, R la constante de los gases y G se expresa en unidades de energa
por mol.

Las enzimas proporcionan trayectorias de reaccin


asociadas a barreras energticas de menor valor que las
asociadas a las mismas reacciones cuando stas ocurren sin
catlisis enzimtica.
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Las interacciones de tipo no covalente entre E y S estn optimizadas en el


estado de transicin de la reaccin.

Relevancia de la Energa libre de unin (GB) en la catlisis

Reaccin catalizada enzimticamente

E +

k1
k-1

ES

k2
k-2

E + P

v= k2[ES] - k-2[E] [P]

Consideracin 1:
En condiciones de velocidad inicial, tiempos cortos
[P]t=0 0 [S]t=x [S]t=0

(y [S]t=x >>> [P]t=x)

k-2 [E] [P] 0 se puede despreciar la rn inversa


y

Vi = k2 [ES]

Consideracin 2:
[S] >>> [E]t

[S]total = [S]libre + [ES]

despreciable
[S]total [S]libre

Vi = k2 [ES]
Cintica del estado estacionario:
v formacin [ES] = v descomposicin [ES]
(+ d[ES]/dt) = (- d[ES]/dt)
k1
E +

(d [ES]/ dt = 0)

k2
ES

E + P

k-1

k1 [E]libre [S]

= k-1 [ES] + k2 [ES]

k1 ([E]total [ES]) [S] = [ES] (k-1 + k2)


([E]total [ES]) [S] = [ES] (k-1 + k2)

(k-1 + k2) = KM

k1

k1

[E]total [S] [ES] [S] = [ES] KM


[E]total [S] = [ES] (KM + [S])
[ES] = [E]total [S]
(KM + [S])
reemplazando en vi = k2 [ES]

vi =

k2 [E]t [S]
(KM + [S])

vi =

k2 [E]t
1 + KM
[S]

Transformacin de Lineweaver-Burk o de las dobles


recprocas:

vi = vmx [S]
(KM + [S])

1 = [S] + KM
vi
vmx [S]

1 = 1 + KM . 1
vi
vmx vmx [S]

y = b
+ a . x (ec. de la recta)

pendiente

INHIBIDORES IREVERSIBLES

Los inhibidores irreversibles se pueden utilizar para


trazar el mapa del centro activo.

Reactivos especficos de grupo: reaccionan con grupos R especficos


de aminocidos. Ej: anhdrido etoxifrmico o dietilpirocarbonato
(DEP), iodoacetamida (IAA)

Marcadores de afinidad: son molculas estructuralmente similares al


sustrato de la enzima que modifican covalentemente los residuos del
centro activo.

Sustrato suicidas o inhibidores basados en el mecanismo, son


sustratos modificados, el inhibidor se une a la enzima como un
sustrato y se transforma inicialmente por el mecanismo cataltico
normal.

INHIBIDORES REVERSIBLES

= 1 + ([I]/KI)

KI = [E].[I]/[EI]

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