APOSTILA - ChemSketch

Tutorial CHEMSKETCH
Tutorial Chemsketch
O Chemsketch um software de desenvolvimento de Qumica Avanada. Foi projetado para
ser usado separadamente ou integrado com outras aplicaes. O Chemsketch usado para
desenhar estruturas qumicas, reaes e diagramas esquemticos. Tambm pode ser usado para
projees de molculas em 3D.
O Chemsketch tem os seguintes mdulos e ferramentas:
- Modo Estrutura para desenhar estruturas qumicas e calcular as suas propriedades;
- Modo Desenho para texto e processos grficos;
- Clculos de propriedades moleculares, tais como: massa, frmula centesimal,
volume molar, ndice de refrao, tenso superficial, constante dieltrica, densidade, etc.
- Nomenclatura Oficial da IUPAC (em ingls)
O software da ACDLabs trabalha com barramento 32-bits sendo aplicvel aos PCs com Sistemas
Operacionais Microsoft Windows 95/98/NT/ME/2000.
6.1 - instalao
A instalao muito simples, voc deve preencher os campos obrigatrios de cadastro, e efetuar o
download. Vale lembrar que este tutorial feito da verso mais antiga do programa (8.0), mais salvo
algumas alteraes estticas e de funcionalidade (muito poucas) a parte operacional padro
continua a mesma e aps aprender a usar todos estes recursos descobrir os novos ser bem mais
simples e fcil.
Veremos agora aps voc t-lo baixado o procedimento, simples, necessrio para instal-lo em seu
computador:
Essa a primeira tela que aparecer aps a execuo do aplicativo de instalao. Para seguir a
instalao, clique no boto: Next.
Com o cursor role at o final da licena. Marque a opo I accept ... e clique em Next.
Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo
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Esta tela mostra em que diretrio o programa ser instalado. Por padro, utiliza-se o seguinte
diretrio: C:\ACDFREE8. Todas as caixas de seleo correspondentes aos componentes que sero
instalados j esto marcadas, e como faremos uso de todos esses componentes no desmarcaremos
nenhuma caixa. Pressione o boto Next.
Clique em Next.
Tutorial CHEMSKETCH
Clique em Install para iniciar a instalao do ChemSketch 8.0. Se desejar trocar alguma
especificao determinada anteriormente, clique em Back e faa a alterao. Para no realizar a
instalao, clique em Cancel.
Esta opo informa que os programas foram instalados com sucesso. Basta ento, pressionar o
boto Finish.
Tutorial CHEMSKETCH
Repita a operao para a instalao do ChemBasic.

6.2 MODOS DE TRABALHO
Iremos ver agora os modos de trabalho do programa ChemSketch 8.0 e suas principais
caractersticas. Para alternar entre os modos de trabalho, basta utilizar o par de botes abaixo, localizados
no canto superior esquerdo da tela.
6.2.1 - Modo Estrutura

O Modo Estrutura permite que o usurio desenhe as estruturas e reaes alm dos diversos sinais
taquigrficos prprios da linguagem qumica. Abaixo, analisamos as barras que compem o modo estrutura.
Barra de Ttulo: Mostra o nome do programa e o nome arquivo atualmente aberto.

Menu: Contm uma srie de palavras. Cada palavra une a uma lista de comandos relacionados
para trabalhar na janela do Chemsketch no modo Estrutura.
Barra Geral: Localizada abaixo da barra de menu, inclui ferramentas que esto presente em ambos
modos de trabalho e o ajudar com tarefas pertinente para ambos os modos como: abrindo e fechando
arquivos, operaes de recortar e colar, aumentando e diminuindo zoom, dentre outros diversos comandos.
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Barra de ChemBasic: Localizada abaixo da Barra Geral uma barra opcional e contm diversas
outras aplicaes muito teis para o trabalho no modo estrutura. Porm, essa barra de ferramenta s ir
aparecer caso o mdulo ChemBasic tenha sido instalado.
Barra estrutura: A barra contm ferramentas para desenhar e manipular estruturas qumicas.
Barra de tomos: Exibida verticalmente esquerda da tela, contm botes que representam
tomos, como tambm ferramentas para propriedades variveis de tomos (valncia, radicais, etc.).
Barra de Radicais: Colocada direita da janela, contm a relao de radicais j utilizados alm do
boto para acessar a tabela de radicais.
rea de Trabalho: Grande rea branca localizada no meio da tela, local onde as estruturas so
desenhadas.
Paleta de Cores: Permitem colorir tomos e ligaes rapidamente.
Barra de Status: Esta barra contm informaes que podem ser teis para o momento atual: nome
do arquivo SK2 que voc est trabalhando, nmero de pgina no arquivo de SK2, nmero de fragmentos na
rea de trabalho e frmula molecular das estruturas selecionadas.
6.2.2 - Desenho
O modo desenho permite ao usurio trabalhar com as diversas ferramentas de desenho para
auxiliar nos diagramas e reaes que se deseja fazer com o Chemsketch.
Abaixo, analisamos as barras que compem o modo desenho.
Barra de Desenhos: Localizada a esquerda da tela, possui diversas ferramentas para desenho,
desde crculos, quadrados, setas, alm de diversas outras possibilidades.
Barra de Edio: A barra de Edio permite manipular e alterar os desenhos no que diz respeito
posio, tamanho, ordem, etc.
6.3 - Manipulando arquivos
6.3.1 - Salvando Arquivos
Para guardarmos os trabalhos feitos devemos salvar o arquivo em alguma unidade de gravao
na barra geral ou clique no menu
(disquete ou disco rgido). Para salvar um arquivo: utilize o boto
File e aps na opo Save as... ou Save ou tecle F2.
No campo Salvar em determine o local onde o arquivo ser gravado, em Nome do arquivo digite
um nome para o arquivo. Aps isso, pressione o boto Salvar.
Tutorial CHEMSKETCH
Obs: O formato padro do ChemSketch sk2. Para salvar o arquivo em outro formato, devemos
proceder com uma exportao de arquivo.
6.3.2 - Exportando Arquivos

Tambm podemos salvar o arquivo com outro formato (exportar), para isso devemos clicar no menu
File e aps na opo Export....
As opes para esse procedimento so as mesmas do salvamento, no entanto na janela Salvar

com o tipo podemos escolher o formato desejado.
Os formatos que o ChemSketch suporta exportar so: imagens: .bmp, .gif, .dib,.tif e .wmf; e
formatos de outros programas: .pcx, .mol, .skc, .chm, .rxn, .cdx, .cml e .pdf.
6.3.3 - Importando Arquivos

Tutorial CHEMSKETCH
O ChemSketch possui uma interface com outros programas como ISISDraw, MDL entre outros.
Essa caracterstica permite que sejam abertos arquivos gerados com formatos de outros programas. Para
isso devemos clicar no menu File e aps na opo Import....
Os formatos que o ChemSketch suporta importar so: imagens: wmf e formatos de outros
programas: .mol, .skc, .chm, .rxn, .cdx, .mst e .rpt.
6.3.4 Copiando Arquivos ou Molculas para um Editor de Texto

Para copiar uma ou mais molculas desenhadas, clicar no menu Edit e na opo Select All.
Clicar novamente em Edit e finalmente na opo Copy ou utilize o boto Copy
. Para colar a(s)
molcula(s) no editor de texto (Word ou outro semelhante), com o mouse selecione a posio onde ser
colocada a molcula e clique em Editar e Colar ou diretamente no boto Colar do editor.
H
O
H
O
H
6.3.5 Abrindo um Arquivo
Para abrir um arquivo do ChemSketch j salvo em alguma unidade de disco, utilize o boto
na barra geral, ou pressione a tecla de atalho F3 ou utilize o menu File e em seguida Open.... Na caixa
de dilogo Open Document procure o arquivo a ser aberto.
O ChemSketch abre somente arquivos no formato .sk2, arquivos de formatos diferentes devem
ser importados.
6.3.6 Criando um Arquivo Novo
Tutorial CHEMSKETCH
Caso voc deseja criar um arquivo novo no ChemSketch, siga os passos abaixo: utilize o boto
na barra geral ou clique no menu File e aps na opo New ou utilize as teclas de atalhos do teclado
<Ctrl>+F3.
6.3.7 Imprimindo um Arquivo
Para imprimir um arquivo no ChemSketch, siga os passos abaixo: utilize o boto
na barra
geral ou clique no menu File e aps na opo Print... ou utilize as teclas de atalhos do teclado <Ctrl>+P.
Na caixa de dilogo Imprimir, mude para as opes desejadas e pressione o boto Ok.
Obs: Antes de imprimir um arquivo, verifique as configuraes da pgina, para isso, clique no menu
File e aps na opo Page Setup.
6. 4 - Desenhando Molculas
6.4.1 - Barra Estrutura
1 Select/Move:
Este boto permite selecionar ou mover qualquer objeto presente na rea de
trabalho. Clique em um ponto e arraste o mouse sobre o que se quer selecionar.
2 Select/Rotate/Resize:
: Este boto permite a rotao de 360 do objeto se lecionado em 2D.
Clique em Edit e Select All para selecionar a molcula ou use uma das ferramentas de seleo (botes 1
e 4 dessa barra).
O objeto ser rotacionado em torno do crculo vermelho que aparece ao ser posicionado o mouse
sobre um dos quadrados pretos (note que o crculo aparece na extremidade oposta do quadrado
selecionado).
Tambm temos o recurso de aumentar ou diminuir o tamanho da molcula, em nosso exemplo,
aumentamos o tamanho da molcula em 31;08% (compare com a molcula acima).
CH3
H3C
3 3D Rotation:
Este boto permite dar rotao em um ambiente 3D.(x, y, z). Clique em Edit e
Select All para selecionar a molcula ou use uma das ferramentas de seleo (botes 1 e 4 dessa barra).
A seguir vemos uma mesma molcula rotacionada em vrias direes.
OH
HO
CH3
H3C
H3C
CH3
H3C
H3C
HO
CH3
HO
CH3
Tutorial CHEMSKETCH
4 Lasso On/Off:
ou
Este boto permite a seleo especfica de algo na rea de trabalho
laando o objeto desenhando-se ao redor do mesmo. Para alternar as formas do boto clique sobre o
mesmo.
5 Draw Normal:
abaixo:
Este boto permite o desenho de uma estrutura orgnica simples como o exemplo
CH3
H3C
Obs: no esquea que antes de desenhar a molcula voc deve selecionar um tomo na barra de
tomos.
Este boto permite o desenho de uma estrutura orgnica contnua, onde as

6 Draw Continuous:
posies dos tomos vo sendo determinadas pelo clique do mouse, sendo que a molcula vai se
completando automaticamente, conforme o exemplo abaixo:
7 Draw Chains:
Este boto permite o desenho de uma estrutura orgnica contnua, de modo que
os tomos assumem uma posio em relao ao outro em forma de v (cadeia em zigue-zague), conforme
o exemplo abaixo:
Obs: Esse boto muito til para cadeias muito extensas. Para saber o nmero de tomos de
carbono na cadeia basta olhar o nmero logo acima do ponteiro do mouse. Este nmero s visvel
enquanto o mouse estiver pressionado.
8 Up Stereo Bonds:
Este boto permite que seja aplicada ligao entre tomos uma
representao que significa que o tomo que possui a ponta mais grossa da cunha cheia est para fora do
plano da rea de trabalho. Veja o exemplo abaixo:
Obs: Uma forma de desfazer a aplicao deste tipo de propriedade clicando no meu Edit e aps
na opo Undo Change Bond ou ento pressionar as teclas de atalho <alt> + <backspace> ou clicar no
boto Undo
da barra geral.
Este boto permite que seja aplicada a ligao entre tomos uma
9 Down Stereo Bonds:
representao que o tomo que possui a ponta mais grossa da cunha tracejada estaria para dentro do
plano da rea de trabalho. Veja o exemplo abaixo:
Tutorial CHEMSKETCH
10
Obs: Uma forma de desfazer a aplicao deste tipo de propriedade clicando no meu Edit e aps
na opo Undo Change Bond ou ento pressionar as teclas de atalho <alt> + <backspace> ou clicar no
boto Undo
da barra geral.
10 Coordinating Bonds:
Este boto permite que se consiga representar uma ligao coordenada
ou dativa. Veja o exemplo abaixo:
Obs: O triangulo branco localizado no canto inferior direito do boto permite a escolha dentre as
diversas formas de setas.
11 Undefined Stereo Bonds:

indefinida. Veja o exemplo abaixo:
Este boto permite representar uma ligao com orientao espacial
CH3
H3C
CH3
diversas formas.
Este boto permite representar uma deslocalizao de carga

12 Solid Delocalization Curve:
utilizando um trao contnuo ou pontilhado.
Tutorial CHEMSKETCH
11
Obs: O triangulo branco localizado no canto inferior direito do boto permite a escolha entre as
formas contnua e pontilhada.
13 Markush Bond:
Este boto permite utilizar a representao para estruturas Markush. A
representao indica que o radical metila pode ocupar as posies orto, meta e para em relao hidroxila
ou seja cada um desses compostos est representado pela estrutura abaixo.
OH
CH3
Obs: O triangulo branco localizado no canto inferior direito do boto permite a escolha entre as
formas abaixo.
Este boto permite a insero do sinal de mais (+) muito comum em reaes
14 Reaction Plus:
orgnicas. Veja exemplo abaixo:
15 Reaction Arrow:
Este boto permite escolher dentre as diversas setas que as reaes possam
a necessitar.
diversas formas de setas.
Para determinarmos as condies da reao, observe as instrues sobre o boto 17.
16 Atom-Atom Map:
Este boto permite fazer a correspondncia manual
entre tomos de reagentes e produtos.
Ao clicarmos no boto aparecer a seguinte caixa de dilogo:
ou automtica
12
Tutorial CHEMSKETCH
17 Reaction Arrow Labeling:

Este boto permite a insero das condies da reao acima e/ou
abaixo da seta. Para abrir a caixa de dilogo Edit Reaction Conditions, clique no tipo de seta desejado
(boto 15) e aplique a seta no local escolhido; em seguida, clique no boto Reaction Arrow Labeling (boto
17) e finalmente clique sobre a seta j inserida. Escreva os dados desejados, podendo utilizar os smbolos
direita e clique em OK.
18 Polymers:
Este boto permite aplicar a representao de polmeros. Desenhe a estrutura da
molcula e clique no boto Polymers, selecione na caixa de dilogo Polymer as opes desejadas e
finalmente clique no ponto onde deseje introduzir o colchete e arraste com o mouse at o ponto final de
insero e solte o mouse.
Tutorial CHEMSKETCH
13
19 Chance Position:
Este boto permite mudar a posio dos tomos ligados ao tomo principal.
Veja o exemplo com o gs metano.
H4
CH4
H4C
C
C
H4
forma 1
forma 3
forma 2
forma 4
Para alternar entre uma forma e outra basta clicar na molcula.
Este boto permite alinhar uma ligao na horizontal. Clique no boto

20 Set Bond Horizontally:
Set Bond Horizontally e em seguida clique na ligao que dever ficar na horizontal. Veja o exemplo
abaixo:
H3C
CH3
H3C
CH3
H3C
CH3
H3C
CH3
antes
depois
antes
depois
21 Set Bond Vertically:

Este boto permite alinhar uma ligao na vertical. Clique no boto Set
Bond Vertically e em seguida clique na ligao que dever ficar na vertical. Veja o exemplo abaixo:
CH3
CH3
CH3
H3C
CH3
H3C
H3C
CH3
antes
depois
antes
depois
22 Flip on bond:
Este boto permite giramos a molcula a partir de uma ligao. Clique sobre o
boto e em seguida clique sobre a ligao que servir de referncia. Veja exemplo abaixo:
23 Flip Top to Bottom:
Este boto permite girar a molcula sobre o eixo horizontal.
Br
CH3
Cl
OH
antes
OH
Cl
CH3
Br
depois
Tutorial CHEMSKETCH
14
24 Flip Left to Right:
Este boto permite girar a molcula sobre o eixo vertical.
Br
Cl
CH3
OH
antes
25 Instant Template:
Br
H3C
Cl
OH
depois
Este boto cria uma cpia da molcula desenhada.
26 Clean Structure:
Este boto permite que a estrutura desenhada possua uma melhor
proporcionalidade entre as ligaes. Veja o exemplo abaixo:
27 Check for Tautomerics Forms:

Este boto permite visualizar as formas tautomricas
(provenientes da isomeria de tautomeria) do composto. Veja exemplo abaixo.
Tutorial CHEMSKETCH
15
Obs: Clicando no boto Replace podemos substituir a estrutura analisada pelo tautmero indicado.
Este boto possibilita a adequao da formula estrutural plana para uma

28 3D Optimization:
conformao 3D. A visualizao 3D mostra todos os tomos de hidrognio. Para aplica-la basta clicar sobre
o boto 3D optimization aps o desenho da molcula. Veja exemplo abaixo:
Obs: Com o boto Rotao 3D (boto 3 desta barra) voc pode girar a molcula e comprovar que
ela est na conformao correta dos tomos pelo efeito da repulso de cargas.
6.4.2 - Barra de tomos
01 Periodic Table of Elements:

Este boto permite que seja escolhido o elemento com o qual se
deseja trabalhar. Outra forma de acessar a Tabela Peridica pressionando a tecla de atalho F7 do seu
teclado ou clicando-se em Templates e em Periodic Table ... da barra de menu.
Tutorial CHEMSKETCH
16
Alm dos dados mostrados na janela inferior, temos os dados de RMN (clique no boto NMR) e as
massas dos istopos com suas propores (clique no boto Mass).
02 Any Atom:
Troca um tomo por qualquer um dos smbolos abaixo.
(Any Atom) indicao de que pode ser qualquer tomo.

( Any Heteroatom) indicao de que pode ser qualquer heterotomo.
Tutorial CHEMSKETCH
17
(Any Atom without Hydrogen) indicao de que pode ser qualquer tomo, exceto o hidrognio.
(Atom from List) cria uma lista de tomos permitidos.
(Atom Not in List) cria uma lista de tomos no permitidos.
03 Any Bond:
Permite assinalar uma ligao com um dos smbolos abaixo.
(Any Bond) indica que pode ser qualquer tipo de ligao (simples, dupla, tripla ou aromtica).
(Aromatic Bond) indica que somente pode possuir ligaes aromticas.
(Single or Double Bond) indica que somente pode possuir ligaes simples e duplas.
(Ring Bond) indica que a ligao faz parte de um anel.
(Chain Bond) indica que a ligao faz parte de uma cadeia aberta.
04 Atoms: Estes botes so colocados automaticamente em funo do seu uso. Os mais usados
permanecem listados.
05 Edit Atom Label:

Permite incluses de textos em qualquer lugar na rea de Trabalho do
Chemsketch. Clique no boto Edit Atom Label, clique no local onde se deseja inserir o texto, digite o texto
na janela e finalmente clique em Insert.
06 Pseudo Atom:
Permite substituir um tomo ou criar um tomo com o rtulo de radical. O
pseudo atom elimina o smbolo do tomo deixando apenas a ligao. Observe o exemplo a seguir.
pseudo tomo
R1
R2
R3
07 Increment (+) Charge:

Veja as opes.
Atribui a um tomo cargas positiva ou negativa ou representa um radical.
atribui ao tomo uma carga positiva acrescentando mais um tomo.

atribui ao tomo uma carga negativa retirando um tomo ligado ao tomo principal.
Tutorial CHEMSKETCH
18
atribui ao tomo a forma de radical livre.

atribui ao tomo a forma de um on radical positivo.
atribui ao tomo a forma de um on radical negativo.
Cl
H2C
CH3
H3C
OH2
H3C
CH3
08 Atom Chemical Properties:

Permite a atribuio de propriedades dos tomos e molculas
como valncias, cargas, istopos, etc. Para aplicar as propriedades clique sobre o boto Atom Chemical
Properties, clique sobre o tomo e preencha a caixa de dilogo Atomic Properties e clique em OK.
Exemplo:
13
+(III)
NH4
09 Manual Numbering:
Permite a numerao manual dos carbonos ou de qualquer tomo. Para
aplicar marcao (numerao, designio alfabtica, etc.) clique no boto Manual Numbering, preencha a
caixa de dilogo Manual Numbering (pode-se adicionar texto antes ou depois da numerao), clique em
OK e finalmente clique sobre os tomos a serem numerados.
Exemplo:
Tutorial CHEMSKETCH
19
Cl
H3C
3
4
CH3
8 isotopo 14
6.4.3 Barra de Radicais
01 Table of Radicals
Permite a insero de radicais ou pedaos de molculas especficas na
molcula que est sendo construda. Clique no boto Table of Radicals, escolha o radical a ser inserido,
clique sobre o radical escolhido e finalmente clique sobre o tomo ao qual o radical ser ligado.
Ao passar com o mouse sobre um radical a sua estrutura ser mostrada no quadro ao centro da
tabela.
02 Mostra os ltimos radicais utilizados.
6.4.4 - Barra Geral

A barra geral, alm dos botes que gerenciam a criao, salvamento e abertura de arquivos, possui
botes que auxiliam no processo de desenho das molculas.
Tutorial CHEMSKETCH
20
01 Modo::
Seleciona o modo de trabalho.
02 New Page:
Insere uma nova pgina em branco.
03 Open File:
extenso .sk2).
Abre um arquivo anteriormente salvo pelo ChemSketch (arquivo com
04 Save File:
Salva um arquivo, em disco rgido ou disquete, com a extenso .sk2. Para
salvar com outra extenso, use o recurso de exportar arquivos.
05 Print:
Permite a impresso da rea de trabalho do ChemSketch.
06 Export to PDF:
pelo programa Acrobat Reader.
Permite a exportao do arquivo com a extenso .pdf, para ser aberto
07 Undo Delete:
O boto undo quando pressionado, volta uma ao realizada no
ChemSketch. Outra opo para usa-lo, clicar em Edit e em Undo Draw.
O boto redo quando pressionado avana uma ao anteriormente realizada,

08 Redo:
que foi retornada pelo boto anterior. Outra opo para usa-lo, clicar em Edit e em Redo.
09 Delete:
O boto delete permite voc apagar tomos ou conjunto de tomos especficos
nas molculas. Clique no boto Delete e em seguida clique sobre o tomo que se deseja apagar.
CH3
antes
deletar o grupo metila
depois
10 Cut:
O boto Cut permite remover um ou um grupo de tomos selecionados. Este
boto usado quando desejamos remover algum objeto da rea de trabalho do ChemSketch para a rea
de Transferncia, de modo que esteja disponvel para ser colado onde for desejado.
11 Copy:
O boto Copy permite fazer cpias de um ou um grupo de tomos selecionados
na rea de trabalho do ChemSketch para a rea de Transferncia, de modo que esteja disponvel para ser
colado onde for desejado.
Tutorial CHEMSKETCH
21
12 Paste:
recortados anteriormente.
O boto Paste permite inserir um ou um grupo de tomos copiados ou
A ferramenta zoom in permite dobrar a visualizao do tamanho da molcula

13 Zoom In:
ou desenho na rea de trabalho. Clique no boto e em seguida em qualquer parte da rea de trabalho e a
resoluo passa para 200%. Repetindo-se a operao podemos atingir 400%.
14 Zoom Out:
trabalho.
Um clique neste boto reduz automaticamente a resoluo da rea de
15 Zoom:
Permite o ajuste manual do tamanho da rea de trabalho (bastando para
isso digitarmos o tamanho desejado na janela), bem como o acesso s opes: Full Page (a pgina inteira
exibida na rea de trabalho 29,5% de resoluo), Page Width (a largura total da pgina exibida na
tela da rea de trabalho 86% de resoluo), Fit Selected (exibe a molcula selecionada em toda a rea
de trabalho exibida na tela), Fit All (exibe todas as molculas selecionadas na rea de trabalho exibida na
tela),
16 Actual Size:
17 Full Page:
18 Fit All:
Retorna a resoluo ao tamanho de 100%.
Exibe a pgina inteira na rea de trabalho.
Exibe a molcula e/ou desenho selecionado em toda a rea de trabalho exibida
na tela.
19 Fit Selected:
exibida na tela.
Exibe todas as molculas e/ou desenhos selecionados na rea de trabalho
20 Open Template Window:

O boto Open Templates Window permite abrir a
coleo de modelos de diversas estruturas j prontas para serem usadas.
Essas estruturas esto divididas em 43 categorias, listadas na pgina seguinte, sendo que algumas
delas apresentam diversas pginas.
Para inserir uma estrutura deve-se seguir os seguintes passos:
1 - Clicar no boto Open Template Window e ser aberta a janela Template Window.
2 - Clicar na categoria desejada.
3 - Procurar a molcula desejada alternando as pginas disponveis.utilizando os botes
.
Previous Page e Next Page
4 - Clique sobre a estrutura desejada, selecionando-a.
Tutorial CHEMSKETCH
22
5 - Mova o cursor at o local da rea de trabalho onde se deseja colar a estrutura e clique
uma vez.
21 Search for Structure:
Boto vlido somente para a verso comercial.
Desenhe uma nica estrutura e clique no boto

22 Generate Name for Structure:
Generate Name for Structure e o nome aparecer automaticamente. Nome de estruturas com mais de 50
tomos ou 3 ciclos somente na verso comercial.
Tutorial CHEMSKETCH
23
NH2
N
N
N
N
H
adenine
23 3D Viewer:
Permite observar a molcula em 3D. Maiores detalhes no tpico 4.6
Molculas em 3D desta apostila.
24 Send Stucture to PDA:
Este boto valido somente para a verso comercial.
6.4.5 Barra Menu
Menu File Semelhante ao menu File de outros programas.
Menu Edit Semelhante ao menu Edit de outros programas.
Tutorial CHEMSKETCH
24
Menu Pages pode ser utilizado quando o documento (arquivo) possuir mais de uma pgina.
Menu Tools
- Structure Properties: permite a manipulao de dados das molculas desenhadas. As guias

Common, Atom e Bond sero estudados detalhadamente no tpico 4.4.6 Desenhando e editando
molculas.
- Clean Structure: de modo semelhante ao boto de mesmo nome possibilita que a estrutura
desenhada possua uma melhor proporcionalidade entre as ligaes.
- Check Tautomeric Forms: de modo semelhante ao boto de mesmo nome possibilita a
visualizao de formas tautomricas do composto desenhado.
- MassSpec Scissors: mostra as ligaes que podem ser rompidas e os possveis fragmentos
resultantes de uma Espectrometria de Massas
H3C
CH3
CH3
CH3
15.0235 Da 15.0235 Da
Tutorial CHEMSKETCH
25
- Show Aromaticity: aplica o smbolo de crculo a compostos aromticos.
- Hide Aromaticity: retorna s ligaes simples e duplas alternadas.
- Expand Shorthand Formulas: este comando permite a expanso de determinadas partes de

molculas previamente convencionadas. A lista completa, em ordem alfabtica inversa, das convenes do
seu programa encontra-se no arquivo Expand.txt no diretrio AcdFree8.
Tambm existe a possibilidade de se criar novas convenes, por exemplo, a conveno a = Br foi
criada por ns. Para a criao de convenes mais complexas deve-se atentar para os seguintes smbolos
aceitos pela ferramenta (ver ajuda do programa para sanar possveis dvidas):
~ (carga negativa)
+ (carga positiva)
- (ligao simples opcional)
= (ligao dupla)
% (ligao tripla)
( ) para envolver os tomos
- Add Explicit Hydrogens: Mostra todos os tomos de hidrognio da molcula.
H
H3C
CH3
H
H
H
H
antes
H
H
H
H
H
depois
- Remove Explicit Hydrogens: Reverte o efeito anterior.

- Bring Bond(s) to Front: Envia uma ligao para a frente.
- Send Bond(s) to Back: Envia uma ligao para trs.
- Auto Renumbering: Numera automaticamente os tomos da molcula.
H
H
Tutorial CHEMSKETCH
26
H3C
7
OH
6 8
2
3
- Clear Numbering: reverte os efeitos do boto anterior.

- Generate: Oferece as opes abaixo:
Name for Structure fornece o nome da estrutura:
H3C
OH
1-methylcyclohexa-2,5-dien-1-ol
Stereo Descriptors mostra os centros quirais: Z ou E e S ou R.
SMILES Notation descreve a molcula utilizando o sistema SMILES (Simplified Molecular Input
Line Entry Specification).
OH
H3C
CH3
CC[C@H](O)CCC
Structure from SMILES monta a estrutura a partir do sistema SMILES.
HO
CH3
Cc1ccccc1O
antes
depois
- Search for Structure ...: vlida somente para a verso comercial.

- Send Structure to PDA : vlida somente para a verso comercial.
- Calculate: permite o clculo das propriedades abaixo:
Tutorial CHEMSKETCH
27
Clique em Tools, depois clique em Calculate e finalmente clique em All Propertiers.

Para a molcula do benzeno foram encontrados os seguintes valores:
Todas esses clculos podem ser copiados para a rea de trabalho, clicando-se em Copy to Editor.
Menu Templates
Tutorial CHEMSKETCH
28
- Template Window ...: Abre a caixa de dilogo Template Window (pgina 109).
- Template Organizer ...: Utilizando-se esta caixa de dilogo podemos remover ou introduzir uma
nova categoria. Para se introduzir uma nova categoria necessrio criar-se um arquivo com extenso .sk2
e coloc-lo no diretrio c:\acdfree8\template.
- Save User Template ...: Salva as alteraes feitas.

- Table of Radicals : Abre a tabela de radicais (pgina 107).
- Periodic Table : Abre a tabela peridica (pgina 104).
- Dictionary : Opo vlida somente para a verso comercial.
Menu Options
Tutorial CHEMSKETCH
29
- Preferences ...: Permite a definio de certos parmetros do programa.
Tutorial CHEMSKETCH
30
- Show Grid: Se marcado mostra uma grade pontilhada.

- Snap on Grid: Move os objetos criados de acordo com a grade.
- Show Palette: Se marcado mostra a palheta de cores.
- Set Structure Drawing Style: Se marcada a posio normal so mostrados os tomos de
carbonos das extremidades, em qualquer outra marcao os tomos de carbono da extremidade no so
escritos.
Tutorial CHEMSKETCH
31
H3C
CH3
posio normal
outra posio
- Apply Structure Drawing Style: Se acionado faz com que o tamanho das ligaes desenhadas
se ajustem a um padro predeterminado.
- Add on Organizer : Permite a instalao de mdulos adicionais para a expanso do

ChemSketch.
- ChemBasic Organizer : Mostra os programas do Chem Basic instalados, havendo a
possibilidade de desinstalao individual desse programas.
Menu Documents
Menu I-Lab
Servio com base de dados de Qumica e programas de predio de propriedades. Voc pode
utilizar o I-Lab Pblico (grtis) e a Edio INTRANET I-Lab (comercial).
Menu ACD/Labs
- 3D Viewer: possibilita uma viso tridimensional da molcula (ver tpico 6.6 Molculas em 3D).
Tutorial CHEMSKETCH
32
- ChemSketch Freeware: possibilita o retorno tela normal do ChemSketch.
Menu Help
6.4.6 Desenhando e editando molculas

I Desenhando uma molcula
1 - Utilizando os botes
ou
(ideal para molculas de cadeia aberta).
Clique no 2 boto (para uma cadeia melhor desenhada) e clique sobre o tomo de carbono
esquerda da tela. Clique sobre a rea de trabalho e arraste o mouse at o comprimento de cadeia desejado.
Solte o mouse.
2 - Utilizando a tabela de radicais (ideal para molculas de cadeia fechada)

Clique no boto Table of Radicals direita da tela (pgina 107) Escolha o radical e clique sobre o
mesmo. Clique sobre a rea de trabalho.
3 - Utilizando a Template Window (ideal para molculas complexas existentes no arquivo).
Clique sobre o boto Open Template Window (pgina 109). Escolha a molcula desejada e clique
sobre ela. Clique sobre a rea de trabalho.
II Ligaes duplas e triplas
Clique sobre uma ligao simples que ela passa a ser dupla, clique sobre a dupla que se transforma
em tripla. Clicando na ligao tripla ela retorna a ligao simples. O nmero de tomos de hidrognio se
ajusta automaticamente nova ligao.
H3C
CH3
antes
H3C
CH2
depois
III - Ramificaes
Para inserir uma ramificao, clique sobre o tomo de carbono da cadeia principal onde dever
estar a ramificao e arraste o mouse. Para uma ramificao com 2 ou mais tomos de carbono, clique no
boto
e arraste at o tamanho desejado.
Tutorial CHEMSKETCH
33
H3C
H3C
CH3
H3C
CH3
CH3
antes
depois
IV - Heterotomos
Clique sobre o tomo a ser inserido (lado esquerdo da tela). Se o tomo no constar dessa lista,
abra a tabela peridica, clicando no boto
carbono e clique sobre o heterotomo.
H3C
. Para eliminar o heterotomo, clique sobre o tomo de
CH3
H3C
antes
NH
CH3
depois
V Grupos funcionais
Para grupos menores (Cl, OH, etc.), clique sobre o tomo (lado esquerdo da tela), clique sobre o
tomo de carbono e arraste o mouse. Para grupos maiores (COOH, NO2, etc.) use a tabela de radicais.
Cl
H3C
CH3
H3C
O
HO
HO
antes
depois
VI Deletando tomos
Para deletar um nico tomo, clique no boto
e depois clique sobre o tomo a ser deletado.
Para deletar um grupo de tomos, clique no boto

e arraste o mouse sobre os tomos a serem
deletados (para marca-los) e finalmente clique em Edit e em Delete ou utilize a tecla Delete.
VII Inserindo texto
Clique no boto
, clique no local onde deseja inserir o texto e aparecer a caixa de dilogo
Edit Label. Utilize uma das opes preestabelecidas ou digite um texto (uma nica linha) na janela
correspondente. Para texto maiores podemos utilizar o recurso de copiar e colar.
Tutorial CHEMSKETCH
34
VIII Inserindo figuras

Para inserir uma figura podemos utilizar o recurso de copiar e colar a partir de uma figura colada em
um processador de texto (Word, por exemplo).
Pode-se utilizar o recurso Import ... do menu File. A importao coloca a figura numa pgina nova
no modo Draw, havendo a necessidade de copia-la e cola-la na pgina original.
CH3
H3C
Para a insero exclusiva de arquivos bitmap (extenso .bmp ou .dib), no modo Draw podemos
utilizar o boto Insert Bitmap
IX Deslocalizando cargas
O ChemSketch possibilita a deslocalizao de cargas.
1 - Desenhe a molcula.
Br
H3C
CH3
2 Adicione o H . D um clique sobre a ligao para eliminar a dupla ligao.
Br
H3C
+
CH3
3 - Delete a carga positiva e selecione os tomos de carbono para a deslocalizao, utilizando o

boto
4 - Clique no boto
colocao da carga positiva.
e em seguida no boto
Br
H3C
CH3
+
e finalmente clique sobre a estrutura para a
Tutorial CHEMSKETCH
35
X Alterando Propriedades
Para alterarmos qualquer formato (cor, tamanho, etc.) poderemos utilizar a opo propriedades das
estruturas.
Clique no menu Tools e na opo Structure Properties e ser aberta a caixa de dilogo
Properties com as guias COMMON, ATOM e BOND.
Outra maneira de abrir essa caixa de dilogo selecionar a entidade qumica e dar um clique duplo
sobre a mesma.
Guia Common
A opo All, se marcada, escreve o smbolo de todos os tomos de carbono da cadeia, juntamente
com os tomos de hidrognio.
A opo Terminal, se marcada, escreve apenas o smbolo dos tomos de carbono e hidrognio
terminais.
A opo Hide Zero Charge, se marcada, no permite a visualizao de carga zero; se
desmarcada, permite essa visualizao em todos os tomos.
A opo Cross Out Invalid Atom, se marcada, risca com uma cruz qualquer invlido, isto , com
um nmero de ligaes no permitido, se desmarcada, possibilita que um tomo tenha um nmero de
ligaes diferente da sua valncia.
Veja os exemplos abaixo:
H3C
terminal (marcada)
all (marcada)
0
H3C
0CH3
0CH2
0CH2
CH
CH2
CH2
2
hide (desmarcada)
CH3
H3C
CH3
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2
H3C
H3C
CH3
CH3
CH3
cross (marcada)
H3C
H3C
CH3
CH3
CH3
Cross (desmarcada)
Tutorial CHEMSKETCH
36
A opo Atom Symbol Size permite determinarmos o tamanho da fonte que ser usada para
desenhar os tomos.
A opo Bond Length permite determinarmos o comprimento da ligao qumica entre os tomos.
Obs: Deixando a opo Auto marcada, deixamos por conta do programa calcular a proporo do
comprimento da ligao em funo da fonte utilizada.
CH 3
CH 3
CH 3
CH 3
CH 3
tamanho 16
CH 3
tamanho 10
tamanho 16
opo auto marcada
opo auto desmarcada
A opo Atom Style permite determinarmos a fonte utilizada, a sua cor e os efeitos de negrito e
itlico.
A opo Bond Style permite determinarmos a largura e a cor das ligaes entre os tomos.
CH 3
H 2C
CH
H
CH 2
H 2C
fonte arial
H 2C
H 2C
CH
fonte holiday
CH 2
CH 2
CH 3
H 2C
H 2C
CH
CH 3
CH 3
CH 3
CH 3
ligao mais larga
tomos azuis e ligaes vermelhas
O boto Apply aplica as alteraes feitas em alguma entidade qumica previamente selecionada.
O boto Set Default grava as alteraes feitas de modo que as modificaes sejam aplicadas nas
prximas entidades qumicas a serem desenhadas.
O boto Update From permite copiar a formatao de uma entidade qumica e aplica-la em outra.
O boto Restore Default restaura as configuraes padro do ChemSketch.
Guia Atom
Tutorial CHEMSKETCH
37
Utilizando a barra
podemos fazer a seleo individual de diversos elementos
e/ou dados, podendo-se em cada um deles formatar a fonte, o tamanho, a cor e os efeitos de negrito e
itlico.
pode-se escolher o tomo principal de sua entidade qumica. A seleo padro
Clicando-se em
o tomo de carbono e o seu acionamento seleciona somente os tomos de carbono.
Clicando-se em
seleciona-se somente os tomos de hidrognio.
Clicando-se em
determina-se a posio, na vertical, que ficar o nmero que indica a
quantidade de hidrognios na entidade qumica.
Clicando-se em
na vertical.
indica-se a carga da entidade qumica desenhada, bem como a sua posio,
Clicando-se em
determina-se a valncia do tomo selecionado, bem como a sua posio, na
vertical.
Clicando-se em
permite explicitar qual istopo estamos usando na entidade qumica, bem
como a sua posio, na vertical.
Clicando-se em
permite determinar a numerao dos tomos de carbono e sua posio nos
eixos X e Y da entidade qumica selecionada.
Guia Bond
Tutorial CHEMSKETCH
38
Utilizando a barra
cada ligao.
podemos fazer a formatar a largura (densidade) e a cor de
Clicando-se em
podemos definir as configuraes de ligaes do tipo simples.
Clicando-se em
podemos definir as configuraes de ligaes do tipo dupla.
Clicando-se em
podemos definir as configuraes de ligaes do tipo tripla.
Clicando-se em
plano (tela).
podemos definir as configuraes de ligaes com representao frente do
Clicando-se em
do plano (tela).
podemos definir as configuraes de ligaes com representao para dentro
Clicando-se em
coordenada.
Clicando-se em
podemos definir as configuraes de ligaes do tipo dativa ou
podemos definir as configuraes de ligaes do tipo indefinidas.
6.5 - Desenhando figuras
Iremos a partir de agora ver as ferramentas de desenho que o ChemSketch proporciona mo mdulo Draw.
6.5.1 - Barra de Desenhos

A barra de desenhos trs consigo uma srie de ferramentas para criarmos os desenhos mais
variados.
Abaixo, temos a descrio de cada uma dessas ferramentas.
Tutorial CHEMSKETCH
39
1 Line:
Este boto permite criar uma linha reta.
2 Arc:
Este boto permite criar um arco de 90 at 270.
3 Curve:
Este boto permite criar uma linha utilizando curvas, no formato especificado no
boto.
4 Polyline:
Este boto permite criar uma forma de linha personalizada.
Se voc apenas clicar sobre um ponto obter sempre uma linha reta (2 e 3 exemplos), se voc
clicar e arrastar o mouse obter linhas curvas (1 e 4 exemplos).
5 Draw Arrow:
Este boto permite o desenho de setas com varias configuraes. Ao clicar,
pela primeira vez, na ferramenta Draw Arrow, abre-se automaticamente a caixa de dilogo Arrow. Use o
boto
para mostrar todas as opes da caixa Arrow.
A primeira janela permite escolhermos o estilo de seta que desejamos usar.
Tutorial CHEMSKETCH
40
A janela Arrow body style permite determinar a distncia entre as 2 linhas da seta dupla.
A ferramenta Arrowhead size permite definirmos a largura (width) e a altura (height) da ponta da
seta. Estes parmetros podem ser especificados em pontos pela simples alterao nas caixas de formulrio
correspondentes ou ento manualmente.
6 Rectangle:
Este boto permite desenhar formar retangulares ou quadradas. Para
desenhar um quadrado, ao desenhar o objeto deixe pressionada a tecla shift do seu teclado.
7 Rounded Rectangle:
Este boto permite o desenho de retngulo com os cantos
arredondados. Para desenhar um quadrado com cantos arredondados, ao desenhar o objeto deixe
pressionada a tecla shift do seu teclado.
8 Elipse:
Permite desenharmos uma elipse na rea de trabalho. Para fazermos um crculo,
ao desenhar o objeto, deixe pressionada a tecla shift do seu teclado.
9 Polygon:
Permite desenharmos formas geomtricas diversas, sempre fechadas.
Se voc apenas clicar sobre um ponto obter sempre uma linha reta, se voc clicar e arrastar o mouse obter
linhas curvas.
OBS: Um clique duplo sobre qualquer objeto desenhado com os botes 1 a 9 permite definir a
formatao, abrindo a caixa de dilogo Objects Panel com as guias Pen e Arrows.
Guia Pen
Tutorial CHEMSKETCH
41
Style: Escolhe o tipo de linha (contnua ou tracejada).

Width: Escolhe a largura da linha.
Color: Escolhe a cor da linha
O boto Load... permite aplicar no objeto selecionado uma configurao pr-existente no
ChemSketch ou uma feita e salva pelo usurio.
Guia Arrow
A janela Body style permite escolher o tipo de linha (simples, dupla, etc), bem como a distncia
entre as linhas duplas..
As janelas Arrowheads shape permitem definir as configuraes de cada ponta da linha,
transformando-a em setas por exemplo.
As janelas Arrowheads size permitem definirmos a densidade das pontas das setas.
10 Insert Bitmap:
(pgina 120).
Este boto permite a insero de bitmaps (extenses .bmp e .dib).
11 Text:
ou Artistic Text:
Estes botes permitem a adio de texto na rea de
trabalho. Para formatao do texto, observe os botes abaixo adicionados a barra de edio (acima da rea
de trabalho) quando esta ferramenta selecionada.
O boto Strikeout
permite adicionarmos o efeito texto riscado ao texto.
Tutorial CHEMSKETCH
42
O boto Superscript
O boto Subscript
permite adicionarmos o efeito sobrescrito ao texto.

permite adicionarmos o efeito subscrito ao texto.
O boto Greek Font
permite que o texto seja escrito em grego (fonte Symbol).
O boto Restore Default Style

O boto Set Default Style
permite restaurarmos o estilo padro definido.

permite definirmos um estilo padro de texto.
Obs: Com um clique duplo sobre o texto j escrito abriremos a caixa de dilogo Objects Panel
Text.
Energia
Energia
A guia Attr permite a rotao do texto em qualquer ngulo, especialmente til para a utilizao em
grficos (giro de 90).
As guias Font e Paragraph permitem a formatao de textos e pargrafos.
Este boto permite a insero de tabelas. Clique sobre o boto e em seguida

12 Table:
sobre a rea de trabalho e ser inserida uma tabela em tamanho padro (2x2). Para aumentarmos o
tamanho da clula e/ou nmero de linhas e de colunas, basta clicar e arrastar o mouse.
O nmero de linhas e/ou colunas pode ser definido na caixa de dilogo Insert Table e o tamanho
da tabela definido pelo arraste do mouse.
O acionamento do boto Table adiciona na barra de edio (acima da rea de trabalho) os seguintes
botes para a formatao da tabela.
Tutorial CHEMSKETCH
43
1 Add Row: Este boto permite a adio de uma linha tabela.

2 Add Column: Este boto permite a adio de uma coluna tabela.
3 Delete Row: Este boto permite a eliminao de uma linha da tabela.
4 Delete Column: Este boto permite a eliminao de uma coluna da tabela.
5 Equalize Width: Este boto iguala a largura das colunas da tabela.
6 Equalize Height: Este boto iguala a altura das linhas da tabela.
7 Add Table Box: Este boto adiciona um novo espao do mesmo tamanho da tabela.
8 Copy Empty Box: Este boto copia os dados para uma clula vazia.
9 Swap Box Order: Este boto troca os contedos das clulas selecionadas.
10 Delete Table: Este boto deleta a tabela selecionada.
Um clique duplo sobre uma clula abre a caixa de dilogo Objectos Panel Table, proporcionando
a formatao das clulas.
13 Brackets:
Este boto permite escolhermos os seguintes smbolos: chaves, parnteses,
colchetes, simples ou duplos.
14 Rounded Callout:
: Este boto utilizado para alguma descrio no estilo bales de
texto.
15 Report Template:
Este boto permite a abertura de janelas de dados criadas , de por
exemplo, 1D RMN, 2D RMN, MASS, UV, IV, etc.
6.5.2 - Barra de Edio
A barra de edio permite manipularmos os objetos j desenhados na rea de desenho.
Abaixo,veremos as funes de cada boto.
Tutorial CHEMSKETCH
44
1 Select/Move/Resize:
objeto na rea de trabalho.
Este boto permite ao usurio selecionar, mover e dimensionar um
2 Select/Move/Rotate:
Este boto, alm das funes de seleo e movimentao dos
objetos, tem como outra funo a rotao em 2D. Para mover passe o mouse sobre um dos quadrados,
clique e arraste.
3 Edit Nodes:
Este boto permite a edio dos ns de um objeto. As ferramentas que criam
objetos com ns so:
4 Edit Text:
Este boto habilita a opo de editarmos alguma caixa de texto (para criar uma
caixa de texto veja pgina 127) presente na rea de trabalho.
5 Bring to front:
Este boto faz com que o objeto selecionado fique na frente dos demais
6 Send to back:
Este boto faz com que o objeto selecionado fique atrs dos demais
objetos.
objetos.
7 Group:
s objeto.
Permite agruparmos dois ou mais objetos selecionados fazendo-os agir como um
8 Flip left to right:

para a direita.
Este boto permite girar o objeto na horizontal, girando da esquerda
9 Flip top to bottom:

para o rodap.
10 Rotate 90:
Este boto permite girar o objeto no sentido vertical, girando do topo
Este boto permite rotacionar o objeto em ngulos fixos de 90.
11 a 13 Horizontally:
Estes botes permitem alinhar o objeto a esquerda, centro
ou direita da pgina, respectivamente, na mesma altura de pgina em que o objeto estiver desenhado.
Estes botes permitem alinhar o objeto na parte superior,
14 a 16 Vertically:
central ou inferior da pgina, respectivamente, na mesma distncia de margem em que o objeto estiver
desenhado.
Tutorial CHEMSKETCH
45
6.5.3 Editando ns
O boto Edit Nodes
permite a manipulao de qualquer figura desenhada atravs da barra
de desenho.(exceto circunferncias ou elipses). Os ns de cada uma das figuras abaixo esto
representados por pequenos quadrados, sendo que cada quadrado corresponde a um n.
Antes de prosseguirmos, necessrio se faz estabelecer a distino entre ns e pontos de controle.

N um ponto da curva ou desenho que pode ser arrastado, isto , deslocado em qualquer direo e
ponto de controle representado por um quadrado preto pequeno que ao ser arrastado muda a forma de
uma linha curva.
Os ns das extremidades tm apenas um ponto de controle por n e os ns intermedirios tm 2
pontos de controle por n.
Barra Node
O acionamento do boto Edit Nodes adiciona na barra de edio (acima da rea de trabalho) os seguintes
botes para a formatao dos ns.
1 Connect Vertices:
extremidade, fechando a curva.
2 Disconnect Vertices:
Esse boto conecta, atravs de uma linha reta, os dois ns da
Este boto desconecta dois ns consecutivos.
Tutorial CHEMSKETCH
46
Para selecionar os dois ns, clique no primeiro e mantendo pressionada a tecla Shift clique sobre
o segundo n. Para desconectar clique sobre o boto.
3 Add Node:
Este boto adiciona um novo n entre dois ns selecionados consecutivos.
4 Delete Nodes:
Este boto permite a eliminao de um n. Clique sobre o n a ser
eliminado e em seguida clique sobre este boto.
5 Convert to Line:
selecionados.
Este boto converte uma linha curva em linha reta, entre dois ns
6 Convert to Curve:
Este boto converte uma linha reta em linha curva, entre dois ns
selecionados. Para converter uma reta em curva, clique no boto Edit Nodes e selecione os dois ns.
Clique no boto Convert to Curve e em seguida clique sobre um dos ns selecionados que aparecero os
pontos de controle. Mova os pontos de controle para fazer a curva e clique em qualquer ponto da rea de
trabalho.
7 Smooth:
na curva.
Este boto permite o alinhamento dos ns, com a conseqente modificao
Tutorial CHEMSKETCH
47
8 Symmet:
Este boto faz com que a distncia entre os pontos de controle e o n seja
a mesma para os dois pontos, com a conseqente modificao na curva.
Efeito da edio dos ns sobre cada tipo de figura
e setas (Arrow)
: A edio dos ns permite a inclinao das retas e/ou
1 - Sobre retas (Line)
setas em qualquer ngulo, bem como a modificao do tamanho.
2 - Sobre arcos (Arc)
: A edio dos ns permite o aumento ou a diminuio, em graus, dos arcos.
3 - Sobre quadrados e retngulos (Rectangle)

em maior ou menor grau, os cantos das figuras.
4 Sobre curvas (Curve)

totalmente a figura original.
e (Rounded Rectangle)
e linhas livres (Polyline)
e (Polygon)
: A edio arredonda,
: Pode-se modificar
48
5 Sobre colchetes, chaves e parnteses (Brackets)
Tutorial CHEMSKETCH
: Podemos aproximar ou afastar essas figuras.
6 Sobre bales de texto (Rounded Callout)

: De acordo com a numerao abaixo, os ns possuem
efeitos diferentes sobre o balo de texto: 1 move a ponta do bico, podendo aumentar ou diminuir de
tamanho e movimenta-lo no espao, 2 move a base do bico, de modo que a bissetriz do ngulo do bico
passe sempre por cima desse n e 3 aumenta ou diminui o tamanho do balo de texto.
49
Tutorial CHEMSKETCH
6.5.4 - Barra Menu

Veremos apenas os menus que sofreram mudanas quando da passagem do modo Structure para
o modo Draw.
Menu Tools
- Pen Style Panel: define o estilo (inteira ou pontilhada), a espessura e a cor da linha de contorno
dos objetos.
- Fill Style Panel: define a cor e a forma do preenchimento do interior dos desenhos, podendo ser
de cor uniforme, riscado ou dgrad.
Tutorial CHEMSKETCH
50
- Arrow Style Panel: define as configuraes de setas, conforme j visto na pgina 125.
- Font Panel: define as configuraes de texto com os mesmos recursos j vistos na pgina 127.
- Paragraph Panel: define as configuraes para a formatao de pargrafos.
- Table Panel: define as configuraes de tabela com os mesmos recursos j vistos na pgina 128.
- Update Object Style Panel: alm de conter as mesmas definies vista anteriormente em Pen
Style Panel e Fill Style Panel, com ela pode-se definir efeitos de sombreamento em objetos na guia
Shadow.
- Style Organizer Panel: mostra todos os estilos de pen, fit, arrowfont, paragraph e table
disponveis, podendo serem criados novos estilos.
- Group at Align Vertically: apresentam correspondncia com os botes da barra de edio vistos
na pgina 129.
- Fit Horizontally: ao ser acionado faz com que o desenho ocupe toda a largura da pgina.
Tutorial CHEMSKETCH
51
antes
depois
- Fit Vertically: ao ser acionado faz com que o desenho ocupe toda a altura da pgina.
- Convert to Polyline: converte qualquer figura fechada para polyline.
- Connect Lines: ao ser acionado conecta as linhas selecionadas.
antes
depois
6.5.5 Desenhando Equaes Qumicas

A seguir veremos os passos necessrios para desenhar a equao abaixo:
25 C
benzeno
, clique na guia Aromatics, clique

1 - Clique sobre o boto Open Template Window
sobre o composto anthracene e finalmente clique na rea de trabalho.
Outra maneira de se desenhar o antraceno clicar no boto Table of Radicals

(antes
verifique a barra vertical direita da tela, se o benzeno foi usado recentemente, ele estar l), clique sobre
o benzeno e clique sobre a rea de trabalho. Posicione o mouse sobre a ligao (conforme o desenho
abaixo e clique novamente). Repita a operao.
2 - Clique sobre o boto Reaction Plus
para inserir o sinal de + aps o antraceno.
+
( esquerda da tela) ou em Draw Normal
(na
3 - Insira o benzeno e clique em Carbon
barra Estrutura). Clique sobre a ligao dupla que ela se transformar em tripla, formando o ciclohexa-3,5dien-1-ino.
Tutorial CHEMSKETCH
52
4 - Clique sobre o boto Reaction Arrow
na barra de estrutura e desenhe a seta com a
forma e o tamanho desejados. Clique no boto Reaction Arrow Labeling

e em seguida sobre a seta
desenhada, preencha os dados acima e abaixo da seta (ver pgina 167) e clique em OK.
25 C
benzeno
5 - Para o desenho do produto Tripticeno, insira o antraceno, clique em Carbon

Draw Normal
ou em
e clique sobre as ligaes, de modo a obter o composto abaixo.
Clique no benzeno, posicionando a seta conforme a figura abaixo e d um clique para a introduo
de mais um ncleo aromtico.
Clicando em em Draw Normal
ligue os tomos de carbono conforme o desenho abaixo.
Selecione a estrutura e clique no boto 3D Optimization
Tutorial CHEMSKETCH
53
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
Clique no menu Tools e em Remove Explicit Hydrogens.
Clique no boto 3D Rotation
e gire a estrutura at a posio desejada.
6.5.6 Desenhando Grficos

A seguir veremos os passos necessrios para desenhar grficos de energia:
1 - Clique sobre o boto Polyline
e desenhe uma curva semelhante ao grfico:
Tutorial CHEMSKETCH
54
2 - Clique sobre o boto Edit Nodes

e agindo sobre os ns e pontos de controle (ver
pgina 130 e seguintes) da figura, molde-a at conseguir o grfico desejado. Se desejar, clique em
Select/Move/Resize
para selecionar a figura e com um clique duplo abra a caixa de dilogo Objects
Panel Lines & Arrows e formate a largura da linha em Width.
3 - Clique no boto Line

e desenhe as linhas para a indicao do H. Com um clique duplo
abra a caixa de dilogo Objects Panel Lines & Arrows e formate o pontilhado da linha em Style.
4 - Clique no boto Brackets

, escolha a chave simples e arrastando o mouse determine o
tamanho desejado. Clique em Flip Left to Right para inverter a chave.
5 - Clique no boto Arrow
e desenhe as duas setas, uma na horizontal e outra na vertical.
Tutorial CHEMSKETCH
55
6 - Clique no boto Artistic Text

clique em Greek Font
e digite todos os textos do grfico. Antes de digitar o ,
. Aps digitar entalpia, clique no boto Rotate 90
ou com um clique duplo no texto abra a caixa de dilogo Objects Panel Text e na guia Attr
registre a rotao de 90.
6.5.7 Desenhando Tabelas

A seguir veremos os passos necessrios para a criao de uma tabela.
56
Tutorial CHEMSKETCH
1 - Desenhar as molculas, utilizando a barra de radicais ( direita da tela) para o benzeno e a

barra de tomos ( esquerda da tela) para as ramificaes e grupos funcionais.
2 - No modo Draw, clique no boto Artistic Text

e digite os textos na formatao desejada.
Aps digitar todos os textos, clique sobre cada um deles e arraste-os para as suas posies aproximadas.
3 - Selecione a primeira estrutura e, no modo Structure, clique em Tools, Calculate e em

Select Properties to Calculate .... Na caixa de dilogo Select Properties to Calculate escolha as
propriedades desejadas e clique em OK.
Tutorial CHEMSKETCH
57
Clique em Tools, Calculate e em Selected Properties.
Clique em Copy to Editor e o texto ser transferido para a rea de trabalho do ChemSketch.
Composition
= C(91.25%) H(8.75%)
3
Molar Volume = 105.7 3.0 cm
3
Density
= 0.871 0.06 g/cm
Recorte o texto acima. cole-o no programa Paint e faa as alteraes necessrias (utilizando o
boto Artistic Text tambm pode-se digitar o texto no prprio ChemSketch, porm teramos dificuldade em
reproduzir o sinal de mais ou menos; por isso optamos pelo programa Paint onde podemos digitar apenas
os nomes das propriedades, aproveitando os valores calculados).
Recorte o texto alterado e cole-o na rea de trabalho do ChemSketch.
Repita as operaes para os outros compostos.
4 - Insira a tabela, clicando no boto Table

e arrastando o mouse at cobrir todo o texto.
Aparecer a caixa de dilogo Insert Table devendo ser definidos os nmeros de linhas e colunas.
Aps o clique em OK aparecer a grade da tabela se sobrepondo ao texto. Clique em Send to

Back
para enviar a grade da tabela para trs. Posicionando o mouse sobre a linha, ele tomar a
58
forma de uma seta dupla (

texto dentro de cada clula.
Tutorial CHEMSKETCH
). Clique e arraste a linha at o local desejado. Se necessrio centralize o
Para preencher as clulas superiores destacando-as, selecione-as, clicando sobre cada clula com
a tecla Shift pressionada. No modo Draw, clique em Tools e em Fill Style Panel que se abrir a caixa
de dilogo Fill.
Nessa caixa selecione o tipo de preenchimento: None (nenhum), Solid (cor slida), Pattern (riscado)
e Shade (dgrad) e a cor para esse preenchimento. Feito isto clique em Apply.
A tabela est pronta.
6.6 - Molculas em 3D
Alm de toda parte de estrutura plana, o ChemSketch possui um mdulo de gerao e visualizao
de molculas em 3D. Para criar uma visualizao em 3D a partir de uma estrutura plana criada na rea de
trabalho, siga os passos abaixo:
1) Desenhe a estrutura plana da molcula a qual deseja-se obter a visualizao em 3D.
Tutorial CHEMSKETCH
59
2) Otimize as ligaes na conformao 3D clicando no boto 3D Optimization

. O
ChemSketch s otimiza uma molcula por vez, se existirem 2 ou mais molculas devemos selecionar
apenas uma de cada vez.
3) Agora voc deve clicar no menu ACD/Labs e aps na opo 3D Viewer. Todas as molculas
desenhadas sero visualizadas em 3D, porm quanto mais molculas contiver a pgina menor ser o
tamanho delas em 3D.
Obs: Para alternar entre o modo 3D e a tela principal do ChemSketch, utilize os botes
localizados na parte inferior da tela. O boto Copy
to ChemSk copia a molcula para a tela principal do ChemSketch, com a visualizao normal daquela tela.
6.6.1 - Barra de manipulao em 3D
Abaixo traremos uma viso geral das ferramentas de manipulao em 3D.
Este boto permite abrirmos um arquivo 3D criado no ChemSketch

1 Open File:
(extenso .s3d), arquivos criados no programa MOPAC Z-Matrix (extenses .mop, .zmt, .dat e .mpc) ou
arquivos criados com MDL Molfile (extenso .mol).
Este boto permite salvarmos o documento ativo no formato de visualizao
2 Save File:
em 3D do ChemSketch (extenso .s3d). Para salvar com extenses diferentes (.mol, .mop, .zmt, .dat, .mpc
e .cml) utilize o menu File e Save as ....
3 3D Rotate:
Permite a rotao da molcula sobre qualquer eixo. Clique sobre o boto e
faa a rotao arrastando o mouse em qualquer direo.
4 Rotate:
Permite a rotao da molcula sobre um nico eixo central.
5 Move:
Permite a movimentao da molcula para qualquer local a rea de trabalho
com um simples arrastar do mouse, sem que a molcula efetue qualquer tipo de rotao.
6 Resize:
Permite aumentar ou diminuir o tamanho da molcula com um arrastar de
mouse. Para aumentar o tamanho arraste o mouse para fora da molcula e para diminuir arraste o mouse
para dentro da molcula.
Tutorial CHEMSKETCH
60
7 Wireframe:
Este tipo de representao 3D mostra a molcula na forma de linhas.
Estrutura plana
8 Sticks:
Estrutura 3D modo de linhas
Este tipo de representao 3D que mostra a molcula na forma de bastes.
Estrutura plana
Estrutura 3D modo de bastes.
9 Balls and Sticks:

paus e bolas.
Estrutura plana
Este tipo de representao 3D que mostra a molcula na forma
Estrutura 3D modo de paus e bolas
Este modelo tem o recurso de se aumentar ou diminuir o tamanho das bolas (botes 14 e 15).
10 Spacefill:
preenchidos.
Este tipo de representao 3D que mostra os espaos vazios da molcula
Tutorial CHEMSKETCH
61
Estrutura plana
11 Dots only:
representao anterior.
Estrutura plana
Estrutura 3D modo de espao preenchido
Esse tipo de representao 3D mostra somente pontos externos da
Estrutura 3D modo de pontos
12 Disks:
Este tipo de representao em 3D mostra os tomos na forma de discos,
muito semelhante a forma Spacefill, porm sem o efeito 3D.
Estrutura plana
Estrutura 3D modo de discos
13 With Dots:
Este boto mostra os pontos externos do modelo preenchido
sobrepostos uma das seguintes representaes em 3D j vistas: boto 7 Wireframe (modo de linhas),
boto 8 - Sticks (modo de bastes), boto 9 - Balls and Sticks (modo de paus e bolas) e boto 12 Disks (modo de discos).
Tutorial CHEMSKETCH
62
Estrutura plana
Estrutura 3D Paus e bolas com pontos
14 Increase Atomic Radii:

de 5% no modelo paus e bolas.
Aumenta o tamanho dos tomos da molcula a uma taxa fixa
15 Decrease Atomic Radii:

de 5% no modelo paus e bolas.
Diminui o tamanho dos tomos da molcula a uma taxa fixa
Permite determinarmos a distncia entre dois tomos em (angstron).

16 Distance:
Para determinar a distncia entre dois tomos, clique primeiramente no boto Distance e aps isso
selecione dois tomos, clicando sobre eles. Os tomos selecionados para a avaliao ficam, por padro, de
colorao verde. Ser aberta automaticamente a caixa de dilogo Internuclear Distance.
Tutorial CHEMSKETCH
63
A distncia tambm informada na barra de status da tela (na parte inferior da tela)
, permanecendo mesmo depois da caixa de dilogo Internuclear Distance
ser fechada.
17 Angle:
Permite determinarmos o ngulo entre trs tomos, em graus. Para
determinar o ngulo de uma ligao, clique primeiramente no boto Angle e aps isso selecione os trs
tomos, clicando sobre eles. Os tomos selecionados para a avaliao ficam, por padro, de colorao
verde. Ser aberta automaticamente a caixa de dilogo Bond Angle.
O ngulo tambm informado na barra de status da tela (na parte inferior da tela)
, permanecendo mesmo depois da caixa de dilogo ser fechada.
18 Torsion Angle:
Permite determinarmos o ngulo de toro entre tomos, em graus.
Para determinar o ngulo torsional, clique primeiramente no boto Torsion Angle e aps isso selecione os
tomos, clicando sobre eles. Os tomos selecionados para a avaliao ficam, por padro, de colorao
verde. Ser aberta automaticamente a caixa de dilogo Torsion Angle.
O ngulo tambm informado na barra de status da tela (na parte inferior da tela)
, permanecendo mesmo depois da caixa de dilogo ser
fechada.
64
19 Mirror:
em um espelho.
Tutorial CHEMSKETCH
Este boto permite a converso de um composto em sua imagem refletida
20 Invert Center:
Este boto permite a converso de um ismero R em ismero S. Para
inverter um centro, clique sobre o boto Invert Center, d um clique sobre o tomo de carbono quiral para
marca-lo (ele ficar verde) e d um segundo clique para inverter o centro quiral.
21 Set Colors:
Este boto permite definirmos as cores tanto dos tomos e ligaes,
como tambm do tomo selecionado e do plano de fundo.
22 Auto Rotate:
direes..
Este boto permite que a molcula adquira auto-rotao em todas as
Alm da auto-rotao, este boto permite que o

23 Auto Rotate and Change Style:
programa troque automaticamente o modo de visualizao da molcula entre as disponveis.
Tutorial CHEMSKETCH
65
24 3D Optimization:
Este boto permite otimizar a estrutura da molcula no formato 3D.
6.6.2 Manipulando Parmetros

Raio atmico
O ChemSketch possui uma tabela de raios atmicos utilizada nos modelos em 3D. Para acessar
essa tabela, no mdulo 3D Viewer, clique em Options e em Radii ....
Distncia internuclear e ngulos

Ao medirmos a distncia ou um ngulo podemos alterar o seu valor na caixa de dilogo
correspondente (pgina 146) e com a opo Instant Preview est marcada a alterao ser imediata.
No exemplo abaixo aumentamos a distncia internuclear de 1,495 para 3,495 angstrons.
6.7 Chem Basic

O ChemBasic um programa que utiliza arquivos .bas, sendo uma ferramenta til na organizao das
pginas de um documento, na converso de arquivos para formatos diferentes, nos clculos de massas de
solutos para o preparo de solues e no desenho de peptdios, carboidratos e cidos nucleicos.
Pode ser iniciado pelo clique em File e em Run ChemBasic ... ou pelo simples acionar de um dos botes
da Barra ChemBasic.
6.7.1 Barra ChemBasic
Para essa barra estar disponvel no Chem Sketch necessrio se fazer o download do ChemBasic (pgina
91) e a sua instalao.
Tutorial CHEMSKETCH
66
1 Insert Page:
2 Clone Page:
documento.
Insere uma pgina em branco no documento ativo do Chem Sketch.

Cria uma ou mais pginas iguais pgina aberta na tela, colocando-as ao final do
3 Move/Copy Page:
Move ou copia a pgina aberta para o local designado.
4 Reorder Pages:
5 Delete Pages:
Copia ou move pginas reordenando-as.
Deleta as pginas assinaladas.
Tutorial CHEMSKETCH
67
6 Rename Pages:
Possibilita a nomeao de pginas.
Permite a insero de nomes e nmeros de pginas e

7 Insert Pages Numbers/Annotations:
anotaes de rodap, com a utilizao dos smbolos visualizados na figura abaixo.
8 Annotate Document:
Nomeia as pginas com o texto inicial de cada uma. Para saber o nome
de cada pgina clique sobre a palavra Page na linha de status logo abaixo da rea de trabalho.
9 Document Browser:
Procura o documento nos arquivos existentes.
Tutorial CHEMSKETCH
68
10 Create HTML:
Cria pgina em HTML a partir do documento corrente.
11 Sketch-to-VRML Converter:
Exporta a pgina corrente para um arquivo tipo VRML.
12 SDF-to-Sketch Converter:
Importa dados de arquivos criados com o MDLs SDfile.
13 Sketch-to-SDF Converter:
o MDLs SDfile.
Exporta os dados das pginas criadas para arquivos criados com
14 Table Wizard:
Ordena todos os textos e/ou desenhos e/ou molculas da pgina em colunas e
fileiras, com a opo de se utilizar ou no as linhas.
15 Replace Element:
outro elemento.
Substitui todos os tomos de um elemento na estrutura por tomos de um
Tutorial CHEMSKETCH
69
16 Remove Spectator Ions:
Utilizado para remover ons pequenos.
17 Solution Calculator:
Calcula a massa, em gramas, do composto da pgina ativa necessria
para prepararmos uma soluo de concentrao e volume determinados.
18 Label Printer:
O programa disponibiliza 45 tipos de tabelas pr-definidas nas quais pode-se
encaixar o composto desenhado.
19 Peptide Builder:
aminocidos.
Cria uma estrutura em 3D de um peptdio a partir de uma seqncia de
Tutorial CHEMSKETCH
70
Pode-se escolher qualquer seqncia de aminocidos dentre os disponveis na base de dados, para isso
devemos digitar a seqncia desejada na janela Enter short-hand.
20 Carbohydrate Builder:
nomes abreviados de acares.
Cria uma estrutura de carboidratos a partir de uma seqncia de
H
O
H
H
O
H
H
H
H
O
H
O H
O H
OH
H
H
O
O
H N
H
H H
H
H
H
H
O
Pode-se escolher qualquer seqncia de acares dentre os disponveis na base de dados, para isso
devemos digitar a seqncia desejada na janela Enter short-hand.
71
Tutorial CHEMSKETCH
21 Nucleic Acid Builder:

Cria uma estrutura em 3D de um cido nuclico (DNA ou RNA), com
uma ou duas hlices, a partir de uma seqncia simplificada de bases.
Pode-se escolher qualquer seqncia de bases dentre as disponveis na base de dados, para isso devemos
digitar a seqncia desejada na janela Enter base sequence of short-hand, utilizando os cdigos
relacionados na janela acima.
Tutorial CHEMSKETCH
72
5-ACTGGG-3
3-TGACCC-5
HO
OH
P
H
O
O
N
N
H
H
O
H
OH
O
H
O
N
O
O
NH
O
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NH H
HO
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NH
OH
O
N
O
O
P
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H3C
N
NH H
HO
NH
H
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N
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OH
N
H
NH
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O
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O
N
N
O
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O
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H
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HO
CH3
O
P
OH
H
N
H
N
O
HO
O
N
O
H
O
P
HO
OH
________________________________
Espero que este tutorial tenha se prestado til, dvidas, crticas e sugestes escrever para:
quimicanatural@gmail.com
Bons Estudos!

APOSTILA - ChemSketch

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Tutorial CHEMSKETCH

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

Repita a operao para a instalao do ChemBasic.

6.2.1 - Modo Estrutura

Barra de Ttulo: Mostra o nome do programa e o nome arquivo atualmente aberto.

6.3.2 - Exportando Arquivos

As opes para esse procedimento so as mesmas do salvamento, no entanto na janela Salvar

6.3.3 - Importando Arquivos

6.3.4 Copiando Arquivos ou Molculas para um Editor de Texto

6.3.5 Abrindo um Arquivo

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

Este boto permite o desenho de uma estrutura orgnica contnua, onde as

11 Undefined Stereo Bonds:

Este boto permite representar uma ligao com orientao espacial

Este boto permite representar uma deslocalizao de carga

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

Para determinarmos as condies da reao, observe as instrues sobre o boto 17.

Ao clicarmos no boto aparecer a seguinte caixa de dilogo:

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

17 Reaction Arrow Labeling:

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

Para alternar entre uma forma e outra basta clicar na molcula.

Este boto permite alinhar uma ligao na horizontal. Clique no boto

21 Set Bond Vertically:

23 Flip Top to Bottom:

Este boto permite girar a molcula sobre o eixo horizontal.

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

24 Flip Left to Right:

Este boto permite girar a molcula sobre o eixo vertical.

Este boto cria uma cpia da molcula desenhada.

27 Check for Tautomerics Forms:

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

Este boto possibilita a adequao da formula estrutural plana para uma

01 Periodic Table of Elements:

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

Troca um tomo por qualquer um dos smbolos abaixo.

(Any Atom) indicao de que pode ser qualquer tomo.

Permite assinalar uma ligao com um dos smbolos abaixo.

05 Edit Atom Label:

07 Increment (+) Charge:

Atribui a um tomo cargas positiva ou negativa ou representa um radical.

atribui ao tomo uma carga positiva acrescentando mais um tomo.

atribui ao tomo a forma de radical livre.

08 Atom Chemical Properties:

6.4.3 Barra de Radicais

02 Mostra os ltimos radicais utilizados.

6.4.4 - Barra Geral

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

Seleciona o modo de trabalho.

Insere uma nova pgina em branco.

Abre um arquivo anteriormente salvo pelo ChemSketch (arquivo com

Permite a impresso da rea de trabalho do ChemSketch.

Permite a exportao do arquivo com a extenso .pdf, para ser aberto

O boto redo quando pressionado avana uma ao anteriormente realizada,

deletar o grupo metila

Prof. M.Sc. Jorge G. F. Lorenzo

O boto Paste permite inserir um ou um grupo de tomos copiados ou

A ferramenta zoom in permite dobrar a visualizao do tamanho da molcula

Um clique neste boto reduz automaticamente a resoluo da rea de

Retorna a resoluo ao tamanho de 100%.

Exibe a pgina inteira na rea de trabalho.