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Elmundoen3D
Sitodoloquesepuedeobservarasimplevistaesen
3D,esrazonablesuponerquelasmolculastambin
debensertridimensionales
Laformaqueadoptanlasmolculasenelespacio
est relacionadaconsuspropiedades.Porlotanto,
parapodercomprendersuspropiedadeses
indispensableconocersuforma
Laimportanciadelaformade
lasmolculasenlacocina
Colgeno
Estructuradelos
pptidosenfro
Hidrlisis
parcialen
mediocido
Estructuradelos
pptidosen
caliente
Frmaco
Receptor
Respuesta biolgica
Depende de la
orientacin espacial
de los tomos
Laimportanciadelaformadelasmolculas
ensuaccinfarmacolgica
Talidomida
LaTalidomida esunfrmacoquefue
comercializadoentrelosaos1958y1963
comosedanteycomocalmantedelas
nuseasdurantelostresprimerosmesesde
embarazo.Estemedicamento,provoc
milesdenacimientosdebebs afectadosde
unaanomalacongnita,caracterizadapor
lacarenciaoexcesivacortedaddelas
extremidades.
Investigandosedescubri quehabados
talidomidas distintas,aunquedeigual
frmulamolecular,enlascualescambiabala
disposicinespacialdelossustituyentes de
uncarbonotetradrico.Unadeellastena
efectosedanteylaotrateratognico.
Isomera
DE CADENA
ESTRUCTURAL
CONSTITUCIONAL
DE POSICIN
DE FUNCIN
ISOMERA
CONFORMACIONAL
ESTEREOISOMERIA
CONFIGURACIONAL
IsmerosConstitucionales
Los ismeros constitucionales o estructurales son los compuestos
que, a pesar de tener la misma frmula molecular, difieren en el
ordenenqueestnconectadoslostomos.
Ejemplo:C5H12
CH3
CH3
CH3 CH CH2 CH3
CH3
C CH3
CH3
2-metilbutano
(isopentano)
2,2-dimetilpropano
(neopentano)
decadena
IsmerosConstitucionales
OH
CH3CHCH2CH3
CH3CH2CH2CH2OH
O
CH3CCH2CH2CH3
O
CH3CH2CCH2CH3
2-pentanona
3-pentanona
2-butanol
1-butanol
Soncompuestosquetienenelmismo
grupo funcional, pero sobre tomos
dePosicin
de
carbono
con
nmeros
localizadoresdiferentes.
IsmerosConstitucionales
*
C3H8O
CH3 O CH2CH3
etil metil ter
un ter
*
*
C3H6O
O
CH3 C CH3
propanona
una cetona
C3H6O2
CH3CH2CH2OH
1-propanol
un alcohol
O
CH3 CH2 C H
propanal
un aldehdo
O
CH3 C O CH3
O
CH3 CH2 C OH
etanoato de metilo
un ster
cido propanoico
un cido carboxlico
Soncompuestosdeigualfrmulamolecularque
deFuncin
presentanfuncionesqumicasdiferentes.
Isomera
DE CADENA
ESTRUCTURAL
CONSTITUCIONAL
DE POSICIN
DE FUNCIN
ISOMERA
CONFORMACIONAL
ESTEREOISOMERIA
CONFIGURACIONAL
Estereoisomera
Losestereoismeros sonismerosquetienenla
mismaconectividadentresustomosperodifierenen
laposicinrelativadelostomosenelespacio.
CONFORMACIONAL
ESTEREOISOMERIA
CONFIGURACIONAL
EstereoisomeraConformacional
Conformaciones:Sonlasdiferentesdisposicionesespacialesque
surgenporrotacinentornoaunenlacesimple(sigmaSP3SP3)
ProyeccionesdeNewman
DiagramadeEnergadelEtano
Tensin Estrica
CICLOALCANOS
Conformaciones en molculas cclicas
CICLOALCANOS
LosCicloalcanossonalcanosendondelos
tomosdecarbonoestnordenadosenun
anillo.Laversatilidaddelcarbonoparaformar
enlacespermitequeunamolculapueda
cerrarsesobres misma,dandolugaraanillos
carbonados.
Enlaindustriapetroleraselosconocecomo
naftenos.
FrmulaGeneral:CnH2n
CICLOALCANOSNOMENCLATURA
Seanteponelapalabracicloalnombredelalcanocorrespondiente
CH2
H2C CH2
H2C
H2C
CH2
CH
CH3
Ciclopropano
CH2
CH2
Metilciclohexano
=
CH3
10
ESTABILIDADDELOSCICLOALCANOS
Teoradelastensiones
AdolfWonBaeyer (PremioNobelen1905)
Lostomosdecarbonoenlosalcanosacclicospresentan
ngulosdeenlacede109.5.Sialformarseelcicloelngulose
desvadeesevalor,laenergadelcompuestoaumenta.Cuanto
mayoresladesviacinconrespectoa109.5 mayoreslaenerga
delcompuestoyporlotantomayorsureactividad.
Elincrementoenlaenergadebidoaladesviacindelngulose
denominatensinangular.
TENSIONDELANILLOENELCICLOPROPANO
Losngulosdeenlacesonde60,enlugarde109,5 como
correspondealahibridacinsp3 delostomosdecarbono.Esta
severatensinangulardalugaraunsolapamientodeficientede
losorbitalessp3.
Lacompresindelngulodelciclopropano es49,5.Laalta
reactividaddelosciclopropanos sedebealabajasuperposicinde
losorbitalesatmicosqueformanlosorbitalesmoleculares.
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TENSIONDELANILLODELCICLOPROPANO
Ademsdelsolapamientodeficientedelosorbitales(tensin
angular),loshidrgenosvecinosenlugardeestaralternadosestn
eclipsados.
Eleclipsamiento
Eleclipsamiento deloshidr
deloshidrgenosdecarbonoscontiguostambi
genosdecarbonoscontiguostambin
aumentalaenerg
n
aumentalaenergadelamol
adelamolculayselodenominatensi
culayselodenominatensi
torsional
TENSIONDELCICLOBUTANO
Latensindeanillodeunciclobutano planosedebeadosfactores:la
tensinangular debidaalacompresindelosngulosdeenlace
desdeelngulotetradricode109,5 hasta90,ylatensintorsional
debidaaleclipsamiento delosenlacesCH.
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CONFORMACIONESDELCICLOPENTANO
Laconformacindelciclopentano est ligeramentedoblada,comola
formadeunsobre.Estaconformacinplegadareduceel
eclipsamiento delosgruposCH2 adyacentes.
Sifueraplanolosngulosserande108,cercanosalosdeltetraedro.
Sinembargo,taldisposicinplanaposeeradiezinteraccionesHH
eclipsadas
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
Elplegamientodelanilloreduceesteefecto,talcomose
muestra enlafigura.Esdecirliberatensintorsional.
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CONFORMACIONESDELCICLOHEXANO
Elciclohexanoesespecialpuestoquenotienetensindeanillo.
Probablementeestaeslacausadequeseaunaunidadmuy
abundanteensustanciasnaturales.Porqu?
Sielciclohexanofueraplano,elanillo
tendraunngulointernode120,
muyinadecuadoparaunhibridacin
sp3.Adems,todosloshidrgenos
estaraneclipsados
CONFORMACIONESDELCICLOHEXANO
Enrealidadelciclohexanonoesplanosinoqueadopta
PREFERENCIALMENTE unaconformacindenominadasilla,dondelos
ngulosinternossonprximosalosidealesdelahibridacinsp3.En
estaconformacintodosloshidrgenosestnalternados.
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CONFORMACIONESDESILLADELCICLOHEXANO
POSICIONESAXIALESYECUATORIALESENLASILLA
Enelciclohexanosedistinguendostiposdeenlacescontomosde
hidrgenosegnsuposicinrelativadentrodelamolcula:
Ecuatoriales:dispuestosalolargodelplanoecuatorialdela
molcula(6)yAxiales:dispuestosperpendicularmentealplanode
lamolcula(3+3)
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CONFORMACIONESDELCICLOHEXANOSUSTITUIDO
Cuandoelciclohexanotieneunsustituyente,lasdossillasen
equilibriodejandetenerlamismaenerga.Laconformacinconel
sustituyenteenecuatorialesmsestable.
Poresaraznenunciclohexanosustituidolaconformacinms
establevaasersiempreaquellaenlaqueelsustituyente mas
voluminosoest enposicinecuatorial.
Equilibrioentreconfrmeros
16
Cuantomsvoluminososeaelgrupomayorser la
diferenciadeenergaentreambosconfrmeros
Sedicequelasillaest congeladaenla
conformacinquetienealgrupotercbutiloen
posicinecuatorial
Conformacionesdeciclohexanos1,2disustituidos
Ismero 1,2 cis
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1,2dimetilciclohexano
Ismero 1,2 cis
Las dos
conformaciones
son igual de
estables
Ismero 1,2 trans
Las dos
conformaciones
NO son igual de
estables
Ms estable
Conformacionesdeciclohexanos1,3disustituidos
Ismero 1,3 cis
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Estereoismeros Configuracionales
Estereoisomeria
Conformacional
Configuracional
Geomtricos
pticos
Estereoismeros Geomtricos
Losismerosgeomtricossepresentanenmolculasque
tienenunpuntoderigidezoriginadoporlapresenciade
doblesenlaces ciclos.
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Alquenos
Nomenclatura(E,Z)
2
1. Seleasignaunaprioridadacada
unodelosgruposdirectamente
unidosaldobleenlace.
Cis o trans?
2. Silosgruposdelamisma
prioridadestndelmismoladoel
ismerosedenominaZ(del
alemnzusammen). Siestnde
ladosopuestosselodesignaal
compuestoconlaletraE(del
alemnentgegen)
20
ReglasdeCahn,Ingold yPrelog
AsignacindePrioridades
1. Amayornmeroatmicomayorprioridad.
2. Silostomosdirectamenteunidosalcarbonodeldoble
enlacesoniguales,sesiguemirandolacadenahasta
encontrarlaprimerdiferencia.
21
22
IsomeraGeomtricaenCiclos
Lapresenciadedossustituyentes enelanillodeuna
molculadecualquiercicloalcano permitelaposibilidadde
existaisomeracis trans.
Siconsideramosel1,2 dimetilciclopentano,pueden
escribirsedosestructuras.Enla1 estructura,losgrupos
metilosestndelmismoladodelanillo (CIS),enlasegunda
deladosopuestos (TRANS)
CH3
H3C
H3C
CIS
CH3
H
TRANS
Estereoismeros Configuracionales
Estereoisomeria
Conformacional
Configuracional
Geomtricos
pticos
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Estereoismeros pticos
QUIRALIDAD
Losobjetosquetienenimgenesespeculares
superponiblessonaquirales
Quiralidad
24
Quiralidad
Lasmolculastambinpuedenserquirales
Cuandounamolculanotieneplanodesimetra
existeunaimagenespecularnosuperponibledela
misma.
Cuandoestoocurresedicequelamolculaesquiral y
pticamenteactiva.
Unamolculapticamenteactivadesvaelplanode
vibracindelaluzpolarizada
25
Polarmetro
Desviacin hacia la
derecha
Desviacin hacia
laizquierda
dextrorrotatoria
(+)
levorrotatoria ()
RotacinEspecfica
Elngulo derotacin observado depende dela
estructura delcompuesto pero tambin delalongitud
delacelda,delaconcentracin delamuestra,dela
temperatura ydelalongitud deonda delaluz irradiada
Rotacin especfica
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Qu caractersticasestructuralestienequetener
unamolculaparateneractividadptica?
Tienequeserquiral,esdecirquenotienequetenerplano
desimetrayestoenmuchoscasossedebealapresencia
decarbonosasimtricos.
Uncarbonoasimtricoesuncarbonoconhibridacinsp3
queest unidoa4sustituyentes distintos.
MolculasQuirales
Lasimgenesespecularesno son
superponibles
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Enantimeros
Sellamaenantimerosadosismerosqueserelacionan
entresiporserimgenesespecularesnosuperponibles
Losdosenantimerostienentodaslaspropiedadesfsicas
idnticas(Puntodefusin,puntodeebullicin,
solubilidad,etc)Lanicapropiedadenlaquedifierenes
enelsentidoderotacindelplanodelaluzpolarizada
Cadaunodelosenantimerosgiraelplanodepolarizacin
delaluzelmismonguloperoendireccionesopuestas
Unoesdextrorrotatorio yelotrolevorrotatorio
Nomenclatura(R,S)
Cadaunadelasmolculasqueconformanelparde
enantimerosdeberecibiralgnnombreadicional
paradistinguirlasentresi.
Elsistemamsaceptadoparanombrarlaconfiguracinde
uncentroestereognico eslaconvencindeCahn,Ingold y
Prelog,queasignaunaletraR oS acadacarbono
asimtrico
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Nomenclatura(R,S)
Lasreglasquehayqueseguirparaasignaruna
configuracin(RoS)sonlassiguientes:
Cadatomounidoalcarbonoasimtricorecibeun
nmero1,2,3 4.
El1seasignaalgrupodemayorprioridadyel4 alde
menorprioridad.Laprioridadseestablecesegnlas
reglasdeCahn,Ingold yPrelog utilizadasparael
sistemadenomenclatura(E),(Z).
Nomenclatura(R,S)
2.Unavezasignadoelordendeprioridadsemirael
carbonoasimtricodesdeelladoopuestoalgrupode
menorprioridad.
Seconectanmedianteunaflecha
losgruposdeprioridades1,2y3.
Silaflechatienesentido
antihorario,seleasignaal
estereocentro laletraS(sinister,
izquierda).
Silasecuenciagiraenelsentido
delasagujasdelrelojla
configuracindelestereocentro
esR(rectus,derecha).
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Nomenclatura(R,S)
Ejemplo:
CHBr2
C
H3C
H
CH(CH3)2
ProyeccionesdeFischer
LaproyeccindeFischeresunaformaderepresentarunamolcula
tridimensionalenunplano
Paratransformarlarepresentacintridimensionaldeunamolculaen
unaproyeccindeFischersesiguenlossiguientespasos:
1.Seorientalaestructurademaneraqueelcarbonodelesterocentro
quedecontenidoenelplanodelpapel,dosdelossustituyentes se
dirijanhaciaelobservadorylosotrosdossustituyentes sealejendel
observador:
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ProyeccionesdeFischer
2.Conlaorientacincorrectaseproyectanlosdos
enlacesqueseacercanalobservadorenlahorizontaly
losdosenlacesquesealejandelobservadorenla
vertical:
Transformacindefrmulasenperspectivasa
proyeccionesenelplano
COOH
COOH
C
H3C
OH
C
CH3
OH
COOH
H
OH
CH3
cido(R)2hidroxipropanoico
CHO
CHO
C
HOH2C
OH
OH
(R)2,3dihidroxipropanal
(Gliceraldehdo)
CH2OH
31
ProyeccionesdeFischer
ParaasignarlaconfiguracinR Senlasproyecciones
deFischersedeterminaprimeroelordendeprioridad
delosgrupossegnlasreglasdeCahn,Ingold yPrelog
Enelprimercasosera:
ProyeccionesdeFischer
ConfiguracinS
Sielgrupodemenorprioridadest enlahorizontal,esto
significaqueespacialmenteseest dirigiendoal
observador.ComolasreglasdeCahn Ingold yPrelog
dicenquedebeestaralejndose,laconfiguracinreales
laopuestaalaobtenida
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ProyeccionesdeFischer
PropiedadesdelasproyeccionesdeFischer:
1. Puedenserrotadas180 enelplanosinquecambiela
configuracindelestereocentro,porejemplo:
2. Sisegiran90 seinviertelaconfiguracindelestereocentro,por
ejemplo:
Nomenclatura(R,S)
Elsentidoderotacindelaluzpolarizadano tieneningunarelacin
conlanomenclatura(R,S).
Elvalordelnguloderotacinysusentidoesexperimental.Nose
puedepredecir.UnamolculaconconfiguracinR podraser
levgira dextrgiraynosepuedeconoceresedatosinose
analizalamuestraenunpolarmetro.
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Enantiomera yActividadBiolgica
Natural
Complejo
enzima
sustrato
(R)()Epinefrina
(Adrenalina)
Sitioactivodela
enzima
Sinttica
CompuestosconmsdeunCarbonoAsimtrico
Cuandouncompuestoorgnicocontienedos ms
estereocentros,dichocompuestopuedetenerun
mximode2n estereismeros.Acontinuacinse
muestranlasproyeccionesdeFischerdeloscuatro
posiblesestereoismeros del3bromobutan2ol y
lasrelacionesdeestereoisomera queexistenentre
ellos:
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Diastereoismeros
Sedenominadiastereoismeros atodoslosestereoismeros que
nosonenantimeros
Losdiastereoismerostienentodassuspropiedadesfsicas
diferentes.
Estadenominacinincluyealosestereismeros geomtricos.Esdecir
queelismeroE esdiastereoismero delZ
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Compuestosmeso
Sellamancompuestosmeso, aaquelloscompuestosque,teniendo
carbonosasimtricos,tienenunaimagenespecularsuperponible,es
decirquenotienenenantimero nipresentanactividadptica.Esto
sedebeaquetienenunplanointernodesimetra
MezclasRacmicas
Unamezclaracmica contieneigualcantidaddelosdos
enantimerosdeunamolcula.Porlotantolamezclano
presentar actividadptica.Suspropiedadesfsicas(P.de
fusin,ebullicin,etc,puedenserdiferentesalasdelos
enantimeros)
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SeparacindeEnantimeros
Sehacereaccionarlamezclaconunreactivopticamenteactivoy
puro.Segeneraas unamezcladediastereoismeros,quetienen
distintaspropiedadesfsicasyselospuedensepararpormedios
fsicoscomocristalizacin,destilacinfraccionada,cromatografa,
etc.
RCOOH + H2N-R'
(+) RCOOH
(-) RCOOH
enantimeros
+ (+) H2N-R'
R-COONH3-R'
(+) R-COONH3-R' (+)
(-) R-COONH3-R' (+)
diastereoismeros
Existentambinfasesquirales paracromatografa
Clasificacindeacuerdoalaconfiguracinrelativaal
Gliceraldehdo
Enlamolculadegliceraldehido elcarbono2esASIMTRICO,yaqueest
sustituidoporcuatrogruposdiferentes.Existen,porlotanto,dosenantimeros.
Antiguamente,antesdequeseideelanomenclaturaR,S,alosenantimerosdel
gliceraldehdo selesasignabalasletrasD (Grupohidroxiloaladerechaenla
proyeccindeFischer)yL(Grupohidroxiloalaizquierdaenlaproyeccinde
Fischer)
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ConfiguracinRelativa
Actualmente,laconfiguracinrelativaalgliceraldehdo secontinautilizandoen
elcampodeloshidratosdecarbono
CHO
CHO
H
OH
HO
HO
OH
HO
OH
HO
OH
H
H
CH2OH
CH2OH
D-Glucosa
L-Glucosa
ConfiguracinRelativaHidratosdeCarbono
CHO
CHO
HO
HO
OH
OH
H
H
OH
HO
OH
HO
CHO
CHO
CH2OH
CH2OH
D-Manosa
L-Manosa
HO
H
OH
H
OH
OH
HO
OH
HO
CH2OH
CH2OH
D-Ribosa
L-Ribosa
CHO
CHO
H
OH
HO
HO
H
HO
H
OH
H
CH2OH
CH2OH
D-Xilosa
L-Xilosa
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MolculasDisimtricas
Poseenactividadpticaporquenotienenplano
desimetraperonotienencarbonosasimtricos.
Ejemplos:alenos ybifenilos
Alenos
Eltomo decarbono centraldeunaleno tiene hibridacin sp yes
lineal,mientras que lostomos decarbono delosextremos tienen
hibridacin sp2 ysontrigonales.
Alenos: Cuandolosdossustituyentes sobrecadatomodecarbono
sp2 sondistintos,lamolculanotieneplanodesimetraporquelos
sustituyentes quedanenplanosperpendiculares.Pornotenerplano
internodesimetralamolculaesquiral.
39
Bifenilos
Bifenilos
Interacciones estricas en una hipottica conformacin plana de un
bifenilo tetrasustituido en posicin orto por grupos voluminosos
40
Bifenilos
Paraevitarlainteraccinentrelostomosdehalgeno,lamolcula
adquiereunaconformacinquecolocaalosdosanillosaromticosen
planosperpendiculares.Esposibleentonces,dibujardos
conformacionesalternativasquesonlasquesemuestrana
continuacin:
Estasdosconformaciones,quecarecendeplanodesimetra,sonentre
s imgenesespeculares,nosonsuperponibles,esdecirenantimeros
Estereoqumica
Laestereoqumica estudianosloladisposicintridimensionaldelas
molculas,sinotambinelcomportamientoqumicoquedependede
estearreglo.
Los estudios estereoqumicos requieren de la observacin e
imaginacinnecesariasparavisualizarlamolcula,objetodeestudio,
en el espacio tridimensional, y deducir las consecuencias de tal
disposicin.Actualmentelaqumicasepiensaentresdimensiones.
Cuando se disea una sntesis se debe analizar con el mismo
detenimiento,laconectividadyfuncionalidaddelosproductosque
se obtendrn y la disposicin espacial de la molcula en su
conjunto.
41
Estereoqumica
Talidomida
Estereoqumica
IBUPROFENO
BAGO
Elibuprofeno(principioactivodelIbupirac)esunamolculaquiral yel
enantimero queposeeelefectoanalgsicoesel(S)(+).Losmedicamentosque
secomercializabanhastaelmomentocontenanlamezclaracmica delmismo.
Actualmentesecomenz acomercializareldexibuprofeno (dex provienede
dextrgiro)quecontienenicamenteelismeroactivo.Serequierelamitaddela
dosisparalograrelmismoefectoanalgsicoyhayalgunasevidenciasqueindican
unadisminucindeltiempodeesperahastaquesesientanlosefectosanalgsicos
delmedicamento.
42