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'A'

B t O A R R A Y
Diagnstico Genbtico

1. Microarrays CGH .....................................................


1. 1.
1.2.
1.3.
1.4.
1.5.

Cytoarray ...........................................................
Cytoarray Plus ................................................
Cytoarray Prenatal ...........................................
DACrA ...............................................................
Microarray CGH 244K ...................
......
........

2. Microarrays SNP ........................................................


2.1.
2.2.
2.3.
2.4.
2.5.
2.6.

2
2
7
14
15
16

17

Sordera Sindrmica ............................................


17
19
Sordera No Sindrrnica ................................
21
Trombofilias ........................................................
23
Craneosinostosis ...............................................
Displasias Oseas ........................ .
.
.
.............. 25
DPN Plus ..........................................................
27

3. Secuenciacin ............................................................

30

CYTOA RRAY
Es el microarray de hibridacin genmica
comparativa de alta resolucin, diseado
especificamente para gentica clinica y
citogentica.

CYTOARRAY PERMITE DETECTAR


Aneuploidias.
Ms de 140 sindromes (una sonda cada 8
kb, 12 sondaslgen).

Detecta alteraciones en el nmero de copias de


ADN, en pacientes con retraso mental idioptico,
autismo y alteraciones congnitas. Permite
definir si el paciente sufre una enfermedad
o sndrome derivados de la presencia de de
deleciones o amplificaciones en las regiones
definidas (ver listado de sindromes que se
adjunta).

233 genes asociados con autismo,


retraso mental, cardiopatias congnitas y
enfermedades oculares.

Cytoarray, con sus ms de cuarenta y


cuatro mil sondas, ha sido especialmente
desarrollado para dar cobertura a numerosos
sindromes citogenticos y deteccin precisa

Endefinitiva una potente herramientadiagnstica


que permite obtener mayor informacin que los
mtodos tradicionales para un diagnstico ms
preciso.

VFlA Haploinsufficiency
jtickler syndrome
3trial fibrillation
Thrombocyiopenia absent radius syndrome
Short stature
Van der Woude syndrome
autism coverage
3iGeorge 2

Vebulette
iirschsprung Disease Plus
10q22-23deletion
10q22-23 deletion
VI R

jplthand foot malformation


Schizencephaly
Beckwith-Wiedemann
long QT syndrome
Beckwith-Wiedemann

de microdeleciones y microduplicaciones,
superando asi a tcnicas como el FISH.

Bandas subtelomricas (una sonda cada 75


kb).

Craniosynostosis
Aniridia
WAGR Syndrome probes
Potocki-Shaflersyndrome

11p15.1-p15.2
11~13-p14
llp13
llpll

Potocki-Shaflersyndrome

llpll

Leukodystrophy
Timothy syndrome

llq13

Sticker 1

12~13

12q14 3 deletion

12q13
12q14

Noonan 1

12q24

Retinoblastoma

13q14

13q21.32 del Protocadherin 9

13q21

brachydactyly

13q31

brachydactyly

13q31

Holopresencaphyl5

13q32

14q12 deletion

14q12

Oligodontia
Angelman 1 Prader Willi

14q13

Angelman 1 Prader Willi

15qll

Angelman 1 Prader Willi

15qll

15qll

MR

15qll

autism

15q12

Oculocutaneousalbinism 2

15q13

MARFAN SYNDROME

15q21

Congenital diaphragmatic hernia

15q26

Congenital diaphragmatic hernia

15q26

IGF-1 resistance

15q25

Mental retardation ascociated with Alpha thalaessamia

16~13

TUBEROUS SCLEROSIS polycystic kidney disease

16~13

RUBINSTEIN-TAYBISYNDROME

16~13

16p13 2 del
Gitleman

16~13

retardation (XLMR)
~iller-~ieker

16pll
17p13

Miller-Dieker

17p13
17~13

Cystinosis
Charcot-MarieTooth Disease
Smith-Magenis

16q13

17pll
17pll

Neurofibromatosis 1

17qll

RENALCYSTS AND DIABETES SYNDROME

17q12

Osteogenesis imperfecta
Campomelic dysplasia
Holopresencaphly4
Dyggve-melchior~claussendisease
PiU Hopkins
CHROMOSOME 18q DELETION SYNDROME
Feingold
Pseudovaginal perineoscrotal hypospadias
Holopresencaphly2
autism
2p15p16.1 microdeletion
Nephronophthsis 1
Holoprosencephaly 9
Mowat-Wilson syndrome
autism
Splithand foot malformation -5
Splithand foot malformation -5
Synpolydactyly
Synpolydactyly
Cleit pallet
Waardenburg syndrome I
2q37

Alagille Syndrome
Brachydactyl type C
DOWN SYNDROME CRlTlCAL REGION
Holoprosencephaly 1
diGeorge 1
diGeorge 1
autism
autism spectrum disorder
Loeys-Dietz syndrome
MR
Waardenburg syndrome IIA
Blepharophimosis
Dandy Walker
Dandy Walker
Microphtihalmia
Optic Atrophy
Wolf-Hirschhorn

Wolf-Hirschhorn
Wolf-Hirschhorn
cleft lip
Rieger
ornelia de Lange
Gardner
deafness
Craniosynostosis
SOTOS
CHROMOSOME 6pter.p24 DELE-1-ION SYNDROME
VEGFA disorders
Cleidocranial dysplasia
obesity severe
Saethre-Chotzen
GRElG CEPHALOPOLYSYNDACTYLY SYNDROME
Williams-Beuren
Williams-Beuren
Williams-Beuren
Ehlers - Danlos
Splithand foot
Verbal dyspraxia
autism
Holoprosencephaly3
diGeorge
CHARGE syndrome
Branchio-Oto-RenalSyndrome
Manic depressive psychosis
Trischororhinophlange al
Langer-Giedion Syndrome probes
HOLOPROSENCEPHALY 7
9q22 32-q22.33 1 Loeys-Dietz
XY sex reversal
Nail-Patella Syndrome
Tuberous sclerosis
9q34.3 syndrome
PAR1
SHOX
Steroid sulfatase
Kallmann

XLMR
Orofaciodigital 1
Nance-Horan
X linked spasrns
X linked juvenille retinoschisis
PLMR
XLMR
Adrenal hypoplasiacongenita
Glycerol Kinase deficiency
Muscular dystrophy
Ornithine transcarbamylase deficiency
Xp11.3 deletion
X-linked Corneia de Lange syndrome
Mental retardation X-linked syndromic
Androgen insensitivity syndrorne
MENTAL RETARDATION XmLINKED WlTH CEREBELLAR HYPOPL
AND DlSTlNCTlVE FACIALAPPEARANCE
Ectodermal dysplasia
XIST deficiency
ALPHATHALASSEMIANENTA L RETARDATION SYNDROME
Menkes disease
X linked agammaglobulinemia
PELIZAEUS-MERZBACHERDISEASE
Alpori syndrome (X)
MR
LYMPHOPROI-IFERATI VE SYNDROME X-LINKED 2
LYMPHOPROLIFERATI VE SYNDROME X-LINKED 1
Lesch-Nyhan syndrome
X linked heterotaxy
Mental retardation X linked Xq27.1 dup and del
Fragile X (FMR1 and FMR2 deletion)
Hunter syndrome MucopolysaccharidosiS type II
RettS
INCONTINENTIA PlGMENTl
Hernophila
PAR2
SRY deletion
AZFa

Mas de 140 sindromes, una prueba cada 8kb por gen. 12 pruebas por gen
Bandas Subtelomricas, una prueba cada 75kb
Autismo/Cardiopatiacc congnitadRetraso MentalIEnfermedades del ojo.
233 genes, una prueba cada 8Kb, 12 pruebas por gen

CYTOARRAY PLUS
Es el microarray de hibridacin genmica
comparativa de alta resolucin, diseado
especficamente para gentica clnica y
citogentica.
Detecta alteraciones en el nmero de copias de
ADN, en pacientes con retraso mental idioptico,
autismo y alteraciones congnitas. Permite
definir si el paciente sufre una enfermedad
o sndrome derivados de la presencia de de
deleciones o amplificaciones en las regiones
definidas (ver listado de sndromes que se
adjunta).
Cytoarray Plus, con sus ms de cien mil sondas,
ha sido especialmente desarrollado para dar
cobertura a numerosos sndromes citogenticos
y deteccin precisa de microdeleciones y
microduplicaciones, superando as a tcnicas
como el FISH.

CYTOARRAY PERMITE DETECTAR


Aneuploidias.
Ms de 200 sndromes (una sonda cada 3
kb, 33 sondaslgen).
410 genes asociados con autismo,
retraso mental, cardiopatas congnitas y
enfermedades oculares.

Bandas subtelomricas (una sonda cada 40


kb).
En definitiva una potente herramientadiagnstica
que permite obtener mayor informacin que los
mtodos tradicionales para un diagnstico ms
preciso.

1p36 Microdeletion
2q32.2 Micordeletion
2q37.3 Monosomy
3q29 Microdeletion
6p25.3 Microdeletion
8p23.1 Microdeletion
8p23.1 Microdeuplication
9~122.32112233 1Loeys-Dietz Microdeletion
9q34.3 Microdeletion
9q34.3 Microdeletion (severe)
10q22-23 Microdeletion
l l q 1 4 Microdeletion
11423 Jacobsen Deletion Syndrme
13q14 Deletion
14q22 Microdeletion
15q13 3 Microdeletion
15q15.3 lnfertility and Deafness
15424 Microdeletion
16p11.2 Deletion
16~11.2-p12.2Microdeletion
16p13.1 Microdeletion predispositionto Autism
17q21.31 Microdeletion
17q21.31 Microduplication
22q11.2 Microduplication
22q13 Microdeletion (Phelan McDermid syndrome)
Abnormal growth
Adrenal hypoplasia congenita
Adult-onset autosomal dominant leukodystrophy
Alagille Syndrome
Albright hereditary osteodystrophy
Alpha thalassemia mental retardation
Alport syndrome (X)
Angelman
Aniridia
Atrial septal defect (ASD) with atrioventrcular conduction defects
Autism genes
AZFa
AZFb (azoospermia factor b)
AZFb + AZFc

Bariter 2
Bariter 3
Bariter 4
Beckwith-Wiedemann
Bilateral frontoparietal polymicrogyria
Blepharophismosis
Branchio-Oto-Renal Syndrome
CADASIL
Campomelic dyplasia
Canavan
Cerebral Carvernous Malformations (CCM)
Cerebral Carvernous Malformations (CCM)
Cerebral Carvernous Malformations (CCM)
Charcot-Marie Toolh Disease
CHARGE syndrome
Cleidocranial dysplasia
Congenital adrenal hyperplasia (CAH)
Congenital diaphragmatic hernia
Congental heart disease genes
Cornelia de Lange
Cowden
Craniosynostosis SOX6
Craniosynoctosis type2
Cri-du-Chat
Currarino
Cystic Fibrosis
Cystinosis
Cystinuria with mitochondrial disease
Cystinuria
Dandy-Walker Syndrome
DCX-Associated Lissencephaly/Subcurtical Band Helerotopia DeafnessDystonis-Optic Neuronopathy
DiGeorge l VCF
DiGeorge Duplication
DiGeorge 2
DMD
Dopa resistant dystonia 1 Parkinsons
Down Syndrome Critica1 Region
Emery-Dreifuss muscular dystrophy

Eye disorder genes


tanconi Anemia
teingold
FLNA-RelatedDisorders
FMRl Microdeletion
FMR2 Microdeletion
tryns lq41
Gardner
Glucose Transport defect
Glycerol kinase
Greig cephalopolysyndact)ly
Hereditary hemorrhagic teangiectasia
Hereditary non-polyposiscolon cancer
Hirschsprung Disease Plus
HNPP
Holoprosencephaly 1
Holoprosencephaly 2
Holoprosencephaly 3
Holoprosencephaly 4
Holoprosencephaly 5
Holoprosencephaly 7
Holoprosencephaly and preaxial polydactly
Holt-Oram
Hypocalcemiawith Bamer
Infantile hyperinulinism,enteropathy and deafness (Ushers disease)
Joubert 5
Kallmann 1
Langer-GiedionSyndrome
Lesch-Nyhan Syndrome
LI-Fraumeni1
Lssencephaly with cerebelar hypoplasia
LMNA
Lowe
Maian 1
Maian 2
MECP2 1 Relts
MENKES
Mental retardat~ongenes incl XLMR
Mental retardation X linked Xq27.1 dup and del
Microphthalmiawith linear skin defects

Microphthalmia
Miller-Dieker
Muenke IAchondroplasia
Muscle-Eye-Brain Disease
Nail-Patella
Nebulene
Nephrolithiasis 1, X-linked, Den1disease
Nephronophthisis
Neurofibromatoas 1 (NF1)
NF1 Microduplication
Neurofibromatosis2 (NF2)
NFlA Haploinsufficiency
Noonan 1
Noonan 4
Norrie disease
Obesity severe
Okihiro
Oligodontia
opitz
Opitz -Kaveggia syndrome
Optic Atrophy
Orofaciodigital 1
Osieopoikilosis
OTC
Pallistar-Killian
Pelizaeus-Merzbacherdisease
Peters Plus Syndrome
Peutz-Jeghers Syndrome
Pin Hopkins
Polycysiic kidney disease
Potocki-Lupski
Potocki-Shafler
Prader-WiIIi
Renal cysis and diabetes
Retnoblastoma
Rieger
Rubinstein-Taybi Syndrome
Saethre-Chotzen
Schizencephaly

SCN1A-related seizures
Shorl stalure
SHOX
Smith-Lemli-Opitz
Smith-Magenis
Smith Magens Microduplication
SOTOS
Splithand foot
Splithand foot malformation 3
Splithand foot malformation -5
SRY deletion
Steroid sulfatase
Stickler 1
STS Microduplication
Synpolydactyly
Thrombocyiopenia absent radius syndrome
Townes Brocks
Transient Neonatal diabetes
Trischororhinophlangeal, Langer-GiedionSyndrome probes
Tuberous sclerosis-1
Tuberous sclerosis-2
Ulnar-Mammary
Van der Woude Syndrome
VEGFA dicorders
Verbal dyspraxia
Von Hippel Lindau
Waardenburg syndrome I
Waardenburg syndrome 4
Waardenburg syndrome IIA
WAGR Syndrome probes
WalkerMlarburg Syndrome
Williams-Beuren
Williams Microduplication
Wilsons disease
Wolf-Hirschhorn
X linked agammaglobulinemia
X linked heterotaxy
X linked juvenille relinoschisis
X linked lymphoproliderativesyndrome
X linked spasmsl atypical Ren

Xp11.3 deletion
XY sex reversal

Xp11.3

9C133.3

All Aneuploidies
All Subtelomeres
200 + Syndromes*, Probe every 3Kb within gene, 33 probes per gene
Subtelomeres probe every 40Kb
Recornbination hotspots, Probe every 40Kb
Autismmeart Disease/MR/Eye*. 41 0 genes, Probe every 3Kb, 33 probes per gene
Genome backbone, Probe every 40Kb
*Average figures for gene regions including 5Kb o1 flanking region
II

300578
184757

CYTOARRAY. DIAGNSTICO
PRENATAL

Es un microarray desarrollado para el


diagnstico prenatal que permite detectar
140 sndromes asociados a 233 genes.
Cytoarray, con sus ms de cuarenta y
cuatro mil sondas, ha sido especialmente
desarrollado para dar cobertura a numerosos
sindromes citogenticos y deteccin precisa
de microdeleciones y microduplicaciones,
superando as a tcnicas como el FISH.

Cariotipos con anomalas que requieren aclaracin


Stillbirthlfetal loss or therapeutic termination
En los casos de sospecha ecogrfica de fetos polimalformados
Gestaciones previas con muerte fetal de causa no establecida o prdida recurrente de la gestacin
(Dos o ms abortos espontneos)
Ansiedad materna.
Antecedentes de enfermedades genticas en hijos previos como; Sndrome de Down, Sndrome de
Edwars, Malformaciones congnitas (Defectos del tubo neural, Hidrocefalia), Metablicas (Muerte
neonatal temprana, Errores innatos del metabolismo), Hematolgicas (Anemias, hemopatas),
Neurolgicas (Retardo mental, X frgil), Malformaciones mltiples (Sndromes genticos, genitales
ambiguo)

IJEJEQ@N DE A N O M A L ~ SCROMOSMICAS EN RESTOS ABORTWOS

(DA6R&)
Aproximadamente el 15% de los embarazos acaban en aborto espontneo. En el 1% de las parejas,
adems, estos abortos se producen de manera recurrente, es decir, se producen tres o ms prdidas
consecutivas antes de los 24 meses. La causa de los abortos de repeticin puede ser variada (edad,
patologa uterina, trombofilia hereditaria e incluso factores nutricionales y ambientales).
Sin embargo, los factores genticos parecen jugar el papel ms importante. En muchas ocasiones, alguno
de los miembros de la pareja tiene una anomala cromosmica, siendo las traslocaciones recprocas una
de las ms frecuentes. Los portadores de traslocaciones recprocas no presentan un fenotipo particular,
pero las parejas sufren de abortos espontneos porque producen un gran nmero de garnetos con
traslocaciones no balanceadas.
Es muy comn que los estudios citogenticos de abortos de repeticin se realicen mediante cariotipo ylo
FISH. Sin embargo, ambas tcnicas tienen diferentes limitaciones (requiere cultivo de clulas, crecimiento
selectivo de clulas maternas, especificada de la prueba, etc.). El array DACrA ha sido especficamente
diseado para identificar alteraciones de nmero de copia en abortos, multiplicando por 10 la resolucin
del cariotipo y evitando la necesidad de cultivar clulas.

Abortos de repeticin de causa desconocida.

Poco material de partida

Diagnstico gentico en abortos

Mayor resolucin

Consejo gentico en parejas con embarazos


interrumpidos.

No es necesario cultivar clulas


Rpidez en el diagnstico

Decisin teraputica.
Deteccin de aneuplodas.

-J3t
Perrin, A et al Fertil Steril 2010,93 2075 e3-6
Ralacan-Separovic, E et al Mol Hum Reprod 2010, 16 125-34
Dria, S et al Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol 2009, 147 144-50

La utilizacin de los arrays de CGH para la deteccin de ganancias o prdidas de material genmico es el
mtodo recomendado para el diagnstico gentico en pacientes con retraso mental idioptico, autismo y10
sndromes polimalformativos as como para identificar o descartar la presencia de alteraciones genmicas
que nos permitan realizar un Cariotipo Molecular que asegure un diagnstico clnico preciso.
El microarray 244k ( o 244.000 sondas de oligonucletidos) que cubren el genoma completo esta
recomendado su uso en pacientes con:

Casos de oacientes con carioli~oalterado:


En
pacientes
con
translocaciones
aparentemente balanceadas con un fenotipo
clnico anormal. El array-CGH puede detectar
deleciones o duplicaciones crpticas en esas
regiones.
En presencia de duplicaciones o deleciones
en el cariotipo para determinar los limites de
las regin alterada.
Cuando
se
identifiquen cromosornas
marcadores, para determinar su origen.

Cariotipo normal y cuadro cllnico:


Retraso mental o del desarrollo no explicado
Anomalas congnitas o rasgos dismrficos.
Desordenes autistas o presentaciones
clinicas que sugieran un sndrome
cromosmico concreto.

MICROARRAY SORDERA
CONGENITA SlNDROMlCA
Este microarray se ha desarrollado de forma que
permita identificar las mutaciones ya descritas
para los genes asociados a sordera congnita no
sindrmica, utilizando la tecnologa innovadora
de los microarrays.

El trmino sordera congnita se aplica siempre


quesedetecteoseconcluyaindependientemente
de la edad, que la sordera est presente desde el
nacimiento del individuo, pudiendo ser de origen
gentico o debida a otros factores (infecciosos,
ambientales, teratgenos).
La sordera congnita es el defecto de nacimiento
ms comn, siendo tambin la patologa
neurosensorial ms prevalente en los paises
desarrollados (Hilgert et al., 2008).

Recin nacidos con sordera identificada en


el programa de Cribado Auditivo Neonatal
Universal.
Estudio gentico molecular de la sordera
congnita autosmica dominante en
cualquier edad.

Consejo genetico e identificacin de las


opciones reproductivas en familias con
individuos afectados.
Diagnstico diferencial para ambas formas

- sindrmica y no sinfrmica - de sordera


congnita.
Apoyo en la decisin teraputica (otociruga,
implante coclear) y plan de rehabilitacin
auditiva

Se estima que 1 de cada 500 recin-nacidos


padece sordera
neurosensorial
bilateral
permanente 2 40dB, en la adolescencia la
prevalencia aumenta para 1 :300 (Morton y
Nance 2006).
Se considera que ms del 50% de los casos
de sordera congnita se deben a factores
genticos El modo de transmisin hereditaria de
sordera puede ser autosmico dominante (AD),
autosmico recesivo (AR), ligado al cromosoma
X o tambin debido a mutaciones en el genoma
mitocondrial. El consejo gentico y la evaluacin
del riesgo de recurrencia dependen, por lo tanto,
de un diagnstico gentico cuidadoso

Transmisibn hereditaria en la sordera aing8nita (in Genereviews)

Este microarray est constituido por un panel de 192 mutaciones puntuales, identificadas en los 14 genes
principales asociados a sordera congnita sindrmica

LISTADO DE S/NDROMES

Sndrome de Walfrm

y QT

largo 50% de los individuos afectados tienen

cardacas antes de los 3 aos

manifestaciones

MICROARRAY SORDERA CONGENITA NO SINDRMICA


Este microarray se ha desarrollado de forma que permita identificar las mutaciones ya descritas para los
genes asociados a sordera congnita no sindrmica, utilizando la tecnologa innovadora de los microarrays.

Recin nacidos con sordera identificada en


el programa de Cribado Auditivo Neonatal
Universal.
Diagnstico gentico de sordera
sindrmica en cualquier edad;

no

Consejo gentico e identificacin de las


opciones reproductivas en familias con
individuos afectados;

El trmino sordera congnita se aplica siempre


quesedetecteoseconcluya independientemente
de la edad, que la sordera est presentedesde el
nacimiento del individuo, pudiendo ser de origen
gentico o debida a otros factores (infecciosos,
ambientales, teratgenos).
La sordera congnita es el defecto de nacimiento
ms comn, siendo tambin la patologa
neurosensorial ms prevalente en los pases
desarrollados (Hilgert et al., 2008). Se estima que
1 de cada 500 recin-nacidos padece sordera
neurosensorial bilateral permanente 2 40dB; en
la adolescencia la prevalencia aumenta para
1:300 (Morton y Nance 2006).

Diagnstico diferencial para ambas formas

- sindrmica y no sindrbmica - de sordera


congnita;
Apoyo en la decisin teraputica (otociruga,
implante coclear) y plan de rehabilitacin
auditiva

Se considera que ms del 50% de los casos


de sordera congnita se deben a factores
genticos. El modo de transmisin hereditariade
sordera puede ser autosmico dominante (AD),
autosbmico recesivo (AR), ligado al cromosoma
X o tambin debido a mutaciones en el genoma
mitocondrial. El consejo gentico y la evaluacin
del riesgo de recurrencia dependen, por lo tanto,
de undiagnstico gentico cuidadoso

itosrnica
recesiva
--.

4utosmica dominante

Mitocondrial

m - .

182 y GJE
-,

u
Otros gel

Transmisibn hereditaria en la sordera congbnita (in Genereviews)

Este microarray est constituido por un panel de 144 mutaciones puntuales, identificadas en los 22 genes
principales asociados a sordera congnita no sindrmica:

El conjunto de mutaciones seleccionadas permite identificar la base rnolecular de la mayora de las formas
ms frecuentes y graves de sordera congnita no sindrmica, tales como: Sndrome de Usher, Sndrome
de Pendred, Sndrome de Waardenburg, Sndrome de QT Largo.

NOTA IMPORTANTE
Este conjunto de mutaciones ha sido delinido con el obletivo de mejorar la capacidad de identificacin de la base molecular de las principales formas de sordera gentica congnita no sindrmica. Sin embargo, un resultado negativo no
excluye la posibilidad de ser portador de una mutacin no incluida en este panel.
Esta contribucin diagnstica del array CGC no pretende ser una alternativa, pero si un valioso complemento al diagnstico clnico de sordera, pudiendo asociarse al Cribado Auditivo Neonatal Universal. El diagnstico precoz es esencial para el desarrollo cognitivo adecuado del nio con sordera congnita prelingual.
Los resultados de este test deben ser cuidadosamente interpretados y presentados a la parejalpacienteiiamiliar en el
mbito de la Consulta de Diagnstico y Consejo Gentico, como medio de identificacin del riesgo de recurrencia y
apoyo en gestaciones futuras.

La trombofilia es una predisposicin para


padecer trombosis, debida a causas genticas,
adquiridas o ambas. En cerca del 40% de los
casos hay una causa hereditaria que, por
s sola puede no desembocar en un cuadro
tromboemblico
Sin embargo, cuando
hay otros factores de riesgo combinados,
como una inmovilizacin prolongada, una
intervencin quirrgica, un embarazo, el uso de
anticonceptivos orales o una terapia hormonal
sustitutiva, existe un efecto aditivo que puede
desencadenar un proceso trombtico o
tromboemblico.
Los cuadros ms frecuentes son la trombosis
venosa de los miembros inferiores y la
tromboembolia pulmonar, pudiendo, sin
embargo, producirse trombosis en otras
localizaciones como la vena porta, la vena
central de la retina o las venas cerebrales.
La trombofilia se ha asociado a abortos de
repeticin, por trombosis de la microvasculatura
uteroplacentaria e hipoperfusin, a infertilidad
y a diversas complicaciones obsttricas como
preeclampsia, desprendimiento prematura de
placenta o escaso desarrollo intrauterino del
feto. Cerca del 30% de esas complicaciones
obsttricas son debidas a una trombofilia
hereditaria.
En muchos casos, despus de un episodio
(tromboflebitis,tromboembolia
trombtico
pulmonar) est indicada una terapia con
anticoagulantes orales del grupo de los
Dicumarnicos. Esta terapia requiere una
monitorizacin rigurosa para obtener y
mantener la dosis teraputica adecuada y
prevenir reacciones adversas, existiendo

diversos factores a tener en cuenta como la edad,


el peso, u otros. Existe tambin una componente
gentica, a travs de variantes que condicionan
la metabolizacin del frmaco

Una trombofilia puede producir alteraciones en la


coagulacin, fibrinlisis, o una lesin del endotelio
y, puede ser causada por variaciones genticas,
que alteran o modulan el comportamiento de los
factores participantes en las varias etapas del
proceso hemosttico.
La participacin de factores de variabilidad de
causagentica, incluso losque tienen un bajo peso
individual, puede determinar comporlamientos
distintos. En esa perspectiva, una caracterizacin
ms amplia de factores genticos que intervienen
en la modulacin del comportamiento y de
las interacciones de los diferentes factores de
coagulacin y fibrinlisis, puede caracterizar
mejor muchas situaciones, con implicaciones en
la prevencin y en la teraputica.
Utilizando la tecnologa de microarrays, el Array
CGC consiste en un panel que permite detectar
simultneamente 9 mutaciones descritas en
las trombofilias hereditarias: Factor V Leiden,
Factor II G20210A, MTHFR C677T, MTHFR
A1298C, PAI 4G/5G, PAI -844A>G, ACE lnsl
Del, Fibringeno beta 455G>A, Factor Xlll
Va134Leu; y 3 mutaciones para la componente
gentica de la respuesta individual a una terapia
anticoagulante con dicumarnicos (warfarina):
CYP2C9 y VKORCI.

APLICACIONES
Enfermos con una historia personal o familiar de trombosis y en familiares de enfermos con trombofilia
hereditaria, principalmente'en situaciones que puedan ser dsencadenantes de un episodio trombtico
como el uso de anticonceptivos orales, un embarazo, una intervencin quirrgica o una terapia hormonal
substitutiva.
Casos de abortos de repeticin

Complicaciones
obsttricas
como
preeclampsia, desprendimiento prematuro
de placenta o retraso de crecimiento
intrauterino del feto.
Evaluacin de una infertilidad.
Mujeres con menos de 50 aos, fumadoras,
con historia de infarto de rniocardio o
accidente vascular cerebral.
Nios con trombosis arteria1
Son debidas a una trombofilia hereditaria.

Con este panel se pretende mejorar la capacidad de identificacin de los principalesfactores genticos implicados en
la trombofilia hereditaria en general y sus consecuencias obsttricas.
Sin embargo, un resultado negativo, no excluye la posibilidad de que exista otra causa, no incluida en este panel.
El estudio farmacogentico de la sensibilidad a los dicumarinicos (warfarina) no sustituye el control peribdico del
laboratorio a travs del Tiempo de Protrombina y10 INR.

DIAGN~STICO
MOLECULAR DE
CRANEOSINOSTOSIS
MEDIANTE ARRAYS

diagnostican durante la infancia o despus del


nacimiento de un nio afectado.

A continuacin se describen las ventajas de


complementar los estudios clnicos (incluyendo
el Diagnstico Prenatal) y radiolgicos con

Puede constituir una anomala aislada o


acompaarse de otras anomalas congnitas,
estando incluida en ms de 100
sndromes genticos (OMIM, 2008). En estos
sndromes, clnicamente heterogneos, existe
muchas veces una superposicin de seales
clnicas que hace su diagnstico preciso muy
difcil.

el estudio molecular de las Craneosinostosis


ms frecuentes, utilizando la tecnologa de
microarrays. Los textos han sido redactados
por el equipo de CGC GeneticsICentro de
Gentica Clnica en colaboracin con la
Profesora Helosa G. Santos, genetista mdico
y consultora
clnica de CGC.

CRANEOSlNOSTOSlS
Se define como Craneosinostosis (CS) una
situacin caracterizada por el cierre prematuro
de una o ms suturas de los huesos del crneo,
provocando alteraciones en la configuracin
craneofacial. Eldesarrolloanmalode los huesos
del crneo, al no acompaar adecuadamente a
las restantes
estructuras cerebrales, provoca frecuentemente
retraso mental, retraso en el desarrollo y
problemas de visin y audicin.
Losdistintostiposde Craneosinostosispresentan
una incidencia global en recin nacidos de
1:2.000 - 1 :2.500 (French et al., 1990; Lajeunie
et al., 1995).
Aunque la mayora de los casos se diagnostican
durante el periodo neonatal, muchos se detectan
ms temprano a travs de ecografa, durante el
periodo prenatal. Debido a la heterogeneidad
de esta patologa, algunos portadores slo se

La etiologa es variable, sabindose an muy


poco sobre el papel de las interacciones genambiente en su aparicin.

Sin embargo, los ms frecuentes, como el


Sindrome de Muenke, el Sindrome de Pfeifer,
el Sndrome de Apert, el Sindrome de Crouzon,
el Sndrome de Jackson-Weiss y el Sndromede
Shaethre-Chotzen, corresponden a mutaciones
especficas, identificadas y localizadas en los
diferentes
genes de los receptores para los factores de
crecimiento de los fibroblastos 1, 2 y 3, lo que
posibilita un diagnstico diferencial a travs de
pruebas moleculares. El Sindrome de Carpenter,
a pesar de tener muy escasa incidencia, tambin
est incluido en el panel para aumentar las
posibilidades de diagnstico diferencial de CS.
ARRAY CYE MF!A EL OIAflFYSftCW OF
CRANEOSINOSTOSIS
La caracterizacin molecular de los genes
asociados a formas sindrmicas de CS es
importante pues permite hacer un diagnstico
ms preciso, especialmente durante el periodo
neonatal, ayudando a definir el tratamiento y
su posible resultado (como la eficacia de una
intervencin quirrgica craneana) y calcular el
riesgo de recurrencia en la familia.

El panel de pruebas incluye 10 mutaciones


puntuales en los 4 genes principales asociados
a formas sindrmicas de CS: FGFRl (Pfeiffer),
FGFR2 (Apert, Crouzon, Jackson-Weiss y
Pfeiffer), FGFR3 (Muenke y Saethre- Chotzen)
y RAB23 (Carpenter).
Con este panel de mutaciones es posible
identificar la base molecular de las formas ms
frecuentes y graves de los sndromes genticos
de CS (Chun K. et al., 2003).

NOTA IMPORTANTE

Con este cribado se pretende mejorar la capacidad de


identilicacin de las principales formas sindrmicas
de Craneosinostosis. Sin embargo, un resultado
negativo no excluye la posibilidad de ser portador de
una mutacin no incluida en este panel.
Esta contribucin molecular no pretende ser una
alternativa, pero si un valioso complemento a los
examenes clnicos. Los resultados deben evaluarse
cuidadosamente, debiendo aconsejarse al enfermo,
pareja o familiares una Consulta de Diagnstico y
Asesoramiento Genetico para evaluar con rigor el
riesgo de repeticin y apoyo en gestaciones futuras

Diagnstico Prenatal, con hallazgos ecogrficos


que sugiriera CS (forma aislada o sindrmica) o
debido a riesgo aumentado de recurrencia.
Diagnstico diferencial de nacidos muertos
Diagnstico diferencial en recin-nacidos,
adolescentes y adultos.
Este Array se ha desarrollado para su aplicacin
en varios tipos de muestras biolgicas. El
ADN se puede obtener a partir de vellosidades
corinicas, lquido amnitico, sangre o
fibroblastos de biopsia fetal.
En diagnstico prenatal con muestras recogidas
por tcnicas invasivas es necesario el envio
simultneo de una muestra biolgica materna
(clulas epiteliales de mucosa bucal, obtenidas
por torunda o sangre perifrica) para excluir la
posibilidad de contaminacin materna.

French LR, Jackson 1-r, MeltonLJ3rd. 1990.A


population-based study of craniosynostosis.
J Clin Epidemiol. 43(1):69-73.
Lajeunie E, Le Merrer M, Bonaiti-Pellie C,
Marchac D, Renier D. 1995. Genetic study
of nonsyndromic corona1 craniosynostosis.
Am J Med Genet. 55(4):500-4.
Chun K, Teebi AS, Azimi C, Steele L,
Ray PN. 2003. Screening of patients with
craniosynostosis: Molecular Strategy. Am J.
Med. Genet 120A: 470-473.
Rasmussen SA, Yazdy MM, Frias JL,
Honein MA.2008. Priorities for Public Health
Research on Craniosynostosis. Am J Med
Genet Part A 146 A: 149-158.

A continuacin se describen las ventajas de complementar el Diagnstico Prenatal de las Displasias


Esquelticas, en los casos en que los datos clnicos no permiten un diagnstico definitivo, con la realizacin
de estudios moleculares utilizando la tecnologa de microarrays. Los textos han sido redactados por el
equipo de CGC GeneticsICentro de Gentica Clnica en colaboracin con la Profesora Helosa G. Santos,
genetista mdico y consultora clnica de CGC.

La Osteocondrodisplasia, tambin denom!nada


por Displasia Esqueltica (DE) o Displasia Osea,
est constituida por cerca de 350 enfermedades
genticas del esqueleto. Su diagnstico es
muchas veces muy difcil y su clasificacin est
basada en las caractersticas del examen clnico,
radiolgico, histopatolgico y molecular (Superti,
Furga y Unger, 2007) Aunque raras, en su
conjunto constituyen el 5% de las enfermedades
genticas del periodo de recin nacido (Orioli et
al., 1986) y son la causa de graves problemas,
tanto a los familiares como a los enfermos,
dada su morbilidad y elevada mortalidad que
se puede manifestar desde el periodo prenatal

Frecuentemente, existe un importante riesgo de


recurrencia en los hijos o en los hermanos de los
casos identificados.
A pesar de ser enfermedades raras, las pruebas
genticas pueden mejorar el diagnstico clnico, e
influenciar, de forma determinante, un diagnstico
diferencial ms precoz y preciso, particularmente
durante el periodo prenatal.

Como es sabido, las DE pueden identificarse en el feto durante el 2OTrimestre y, con frecuencia, antes de
las 20 semanas En la mayora de las situaciones, no existe historia familiar de DE y el diagnstico, basado
esencialmente en las caractersticas ecogrficas del feto, es muy difcil, mantenindose desconocido en
cerca del 60% de los casos (Krakow et al., 2008). Lamentablemente, tambin en las situaciones de muerte
fetal, la realizacin de estudio radiolgico del esqueleto y estudios feto-patolgicos, tienen resultados
lentos, muy onerosos, y, con frecuencia, tambin no concluyentes.
Los diferentes estudios epidemiolgicos realizados en los ltimos aos, permitieron conocer las patologas
ms prevalentes identificables en el feto, que son las siguientes: Displasia Tanatofrica, Osteognesis

Imperfecta (tipo recesivo), Acondrognesis Tipo IB e II, Displasia Campomlica y an, en algunos estudios,
la Acondroplasia (Krakow et al., 2008; Orioli et al., 1986).

La caracterizacin molecular de los genes responsables de estas patologas esquelticas nos ir


permitiendo aumentar la capacidad de diagnstico de las situaciones ms comunes diagnosticables
durante el periodo prenatal.
El panel, especialmente desarrollado para el diagnstico de estas patologas ms frecuentes, est
constituido por 26 mutaciones puntuales, presentes en 6 genes directamente implicados en estas
DE: FGFR3 (Acondroplasia y Displasia Tanatofrica), COL2A1 (Acondrognesis tipo II), SLC26A2
(Acondrognesis tipo IB), CRTAP (Osteognesis Imperfecta, tipo recesivo), LEPREl (Osteognesis
Imperfecta, tipo recesivo), y SOX9 (Displasia Campomlica).

DIAGNSTICO PRENATAL Witr+


(DPN Plus+)

HEXA (Enfermedad de Tay- Sachs)

HGD (Alcaptunuria)
MAN2BI (Enfermedad en Alfa-Monosidase)
NPCllNPC2 (Enfermedad de Niemann-Pick tipo C )

1. DPN CONVENCIONAL

PEXlIPEX26 (Enfermedad de Zellwegger)


a

Deteccin rpida de aneuploidas por


PCR en 24-48h.

QF-

b Cariotipo

PPTl (LipofuscinosisCeroide Neuronal-1)


PYGM (Enfermedad de McArdle o GSD V)
SLC37A4 (GSD 1)
TPPl (LipofuscinosisCeroide Neuronal)

2. DIAGN~STICO MOLECULAR DE
TRASTORNOS
METAB~LICOS POR
ARRAY (94 MUTACIONES)

3. PANEL D E S~NDROMES ASOCIADOS A


RETRASO MENTAL

Enfermedades raras del metabolismo,


incluyendo formas para las cuales existe
tratamiento, que ser ms eficaz cuanto
ms temprano sea implementado.

Enfermedades
que
comprometen
significativamente el desarrollo psicomotor del
nio.
Sndrome de delecin 1p36

ACADM (MCAD)
ARSA (Leucodistrofia Metacromatica)
ATP7B (Enfermedad de Wilson)
BTD (Deficiencia biotinidase)
CLN2 (Enfermedad de Jansky-Bielschovsky)
CLN5 (LipofuscinosisCeroide Neuronal-5)
CLN8 (LipofuscinosisCeroide Neuronal-8)

Microdelecin 9q22.3
Sndrome DiGeorge (22qll)
Sndrome DiGeorge regin 2 (10~15)
Microdelecion NF1
Sndrome de Langer-Giedion (8q)
Sndrome de Miller-Dieker (17p)

CPT2 (Deficiencia en CPT II)

Microdelecin 2p16

FAH (Tirosinemia)

Sndrome de delecin 15q24

G6PC (GSD II)

Sindrome de Cri du Chat (5p15)

GAA (Enfermedadde Pompe o GSD II)

Sndrome de Rubinstein-Taybi

GALC (Enfermedadde Krabbe)

Sndrome de Smith-Magenis

GALT (Galactosemia)

Sindrome de Sotos (5q35.3)

GBA (Enfermedadde Gaucher)

Sndrome de WAGR

HADHA (LCHAD)

Microdelecin 17q21

Microdelecin 3q29
Duplicacin Xq28 (MECP2)
Sndrome de Williams
Sndrome de Wolf-Hirschhorn (4~16.3)
Sndrome de Prader-Willi JAngelman
Sndrome de Phelan-McDermid (22q13)

DIAGNSTICOPRENATAL (DPN
La principal indicacin para la aplicacin de DPN
sigue siendo el riesgo para cromosomopatas.
Sin embargo, entre el 2 y 3% de los recin
nacidos son portadores de una anomala
congnita mayor y en ms del 50% de los casos
estn asociadas a factores genticos.
Actualizado en J u n o 2009

DPR + Plus
Con una nica muestra de material fetal, las
nuevas metodo-logias para DPN gentico,
Dermiten. actualmente.. oDtar
Dor
la realizacin
,
,
de un maior nrnerode tests para enfermedades
congnitas.
Con este abordaje es posible obtener ms
informacin sobre el feto, una vez recogida la
muestra.
Esta secuencia permite una gestin temprana
de las opciones de diagnstico en el
acompaamiento Prenatal.
Este abordaje se puede efectuar a las 12
semanas (biopsia de vellosidades corinicas) o
a las 14115 semanas (lquido amnitico).

4 Deteccin rpida de aneuploidas por QFPCR


4 Sndrome de X Frgil

DPN plus+ est indicado en:

4 Cariotipo

Grvidas com
risco
cromossomopatias.

4 Fibrosis quistica
4 Diagnostico

Molecular de
Metablicos por Array CGC

aumentado

para

Trastornos

J Panel de Sndromes asociados a Retraso

4 Mental
Embarazadas con riesgo aumentado para
cromosomopatas

El ADN fetal se obtiene a partir de vellosidades


corinicas o liquido arnnitico. Es necesario
el envi simultaneo de una muestra biolgica
materna (clulas epiteliales de la mucosa bucal
obtenidas por torunda o sangre periferica) para
excluir la ~osibilidadde contaminacin materna.

Embarazadas con historia familiar de retraso


mental, pero sin diagnstico gentico preciso
Otras

Con este abordaje se pretende mejorar la capacidad de respuesta del diagnstico prenatal. Un resultado negativo no
excluye la existencia de otras enfermedades o mutaciones no incluidas en este panel. Esta contribucin tcnica no
pretende ser una alternativa, pero un complemento al examen clnico.
En las situaciones de historia familiar de enfermedad gentica, con etiologa ya caracterizada se debe hacer el DPN
especifico de la patologa en cuestin. Los resultados de este panel de estudio se debern evaluar y comunicar en el
mbito de una Consulta de Gentica Mdica.

IAI

ENFERMEDAD

S-~etiltransferasa) #610460

*187680

'

1
Acidemia Propinica #606054

PCCB
'232050

Aciduria Glutrica tipo 1 #231670

GCDH
'60880 1

Acondrognesis tipo ll#200610

COL2A1
120140

.-

4u

30
45
Deteccin mutaciones p.Gly375Cys (c.l123G>T),
p.Gly380Arg (c 1138G>A y c.1138GrC) mediante
secuenciacin

FGFR3
"134934

Acondroplasia #100800

JU

metabolismo de la 6-mercaptopurina

PCCA
"232000

15

FGFR3

Alagille Tipo 1, sndrome #118450

Alagille Tipo2, sndrome #610205

JAGl 601920

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

JAGl 601920

Secuenciacin de los exones 2 , 4 , 6 , 9 , 17,23, y 24

15

JAGl 601920
NOTCH2
*600275

Secuenciacin completa

25

Secuenciacin completa

45

25

GPR143

Albinismo Ocular tipo 1 #300500


Aloin smo Oc, oc~tneotipo 1 U703100

Secuenciacin completa

*~nnnnn

30

1 TYR 635333 1

Sec~encacii competa

OCA2
'611409

Deteccin de la delecin de 2,7Kb mediante PCR

20

Secuenciacin completa

40

YS
ri-L) y
uereccion muraciones ~ ~ I U J ~ L L (ale10
p.Glu246Val (aelo PI-S)

15

15

Albinismo Oculocutneo tipo 2 #203200


OCA2

'611409

Alfa-1-Antitripsina 107400

Alfa-Talasemia #141750

Alport, sndrome #203780 #lo4200

atn~iiv~i
107400
SERPlNAl
107400

Secuenciacin completa

15

HBA 141800
'1 41850

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

COL4A3
*120070

Secuenciacin completa

50

COL4A4
'120131

Secuenciacin completa

45

GEN

ENFERMEDAD

MODALIDAD

Alzheimer, enfermedad #lo4300

ndermann, sindrome #218000

neurisma artico torcico familiar


11788 %607086 #132900

Angelman, sindrome #lo5830

mg:fa!i

Deteccin deleciones y disoma uniparental mediante


estudio de microsatlites

25

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

PAX6
"607108

Secuencacin completa

35

FGFR2
*176943

Deteccin mutaciones p.Ser252Trp y p.Pro253Arg


mediante secuenciacin

15

FXN '606829

Deteccin expansin GAA mediante PCR y TP-PCR

20

FXN "606829

Secuenciacin completa

30

Secuenciacin completa

30

PWSlAS

Aniridia #lo6210

Apert, sindrome #101200


Ataxia de Friedreich #229300
Ataxia de Friedreich #160120

PAX6
"607108

KCNAl
*17C1Cn

ENFERMEDAD

Ataxia Espinocerebelosa (Paneles


SCA)

Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 1


#164400
Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 12
#604326
Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 17
#E07136

GEN
ATXNI
"601556
ATXN2
'601517
ATXN3
'607047
CACNAl A
*601011
ATXN7
'607640
ATXNl
"601556
PPP2R2B
'604325

MODALIDAD

Deteccin de las expansiones SCA1, SCA2, SCA3,


SCA6 y SCA7 mediante PCR

20

Deteccin expansin CAG mediante PCR

20

Deteccin expansin CAG mediante PCR

20

TBp .600075

Deteccin expansin CAG mediante PCR

20

Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 2


#183090

ATXN2
%O1517

Deteccin expansin CAG mediante PCR

20

Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 3


#lo9150

ATXN3
'607047

Deteccin expansin CAG mediante PCR

20

Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 6


#183086
Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 7
#164500

CACNAlA
"601011
ATXN7
'607640

Deteccin expansin CAG mediante PCR

20

Deteccin expansin CAG mediante PCR

20

Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 8


#E08768
Ataxia Telangiectasia #208900

ATXNBOS
'603680
ATM %O7585

Deteccin expansin CAG mediante PCR

20

Secuenciacincompleta

60

Atrofia Dentato-Rubro-Plido-Luysiana
#125370

ATNl
"607462

Deteccin expansin CAG mediante PCR

40

AR "313700

Deteccin expansin CAG mediante PCR

40

Deteccin de alteracionesen los genes SMNl y SMN2

30

OPA1
'605290

Secuenciacincompleta

A
Consultar

OPA3
'606580

Secuenciacincompleta

30

SHOX
'312865

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

SHOX
'312865

Secuenciacincompleta

30

Atrofia Espinobulbar de Kennedy


#313200

SMNl
Atrofia Muscular Espinal Proximal
(SMA) #253300

Atrofia dptica Dominante Tipo 1


#165500
Atrofia ptica Dominante Tipo 3
#165300
Baja estatura dioptica ligada al X
#300582

*~~~~
'601627

ENFERMEDAD

MODALIDAD

Bardet-Bield,sndrome

Array de genotipado (308 mutaciones)

40

Bartter, sindrome tipo 4A #602522

BSND
'606412

Secuencacin completa

15

BCR-ABL(Cromosoma Philadelphia)

t(9'22)
(q34;qll)

Cuantificacindel reordenamiento BCR-ABL t(9;22)


(q34;qll) mediante PCR a tiempo real

15

(11~15)
BWSISRS
(11~15)
CDKNlC
(P57)
HBB 141900

MLPA

Beckwith-Wiedemann, sndrome
#130650

23

Estudio de metilacin de la regin genmica BWSISRS


(11~15)

50

Secuencacin completa

30

Secuenciacin completa

15

Brugada, sindrome #601144

SCN5A
*600163

Secuenciacin competa

35

CADASIL (ArteriopataCerebral con


lnfartos

NOTCH3
'600276

Secuenciacin de los exones 3 y 4

15

NOTCH3
'600276

Secuenciacin de los exones 5 , 6 y 11

15

NOTCH3
*600276

Secuencacin completa

30

MLH1
'120436
MSH2
'609309

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

Secuenciacin completa

35

Secuenciacin completa

35

Beta-Talasemia #604131

Subcorticalesy Leucoencefaiopata)
#125310

Cncer Colorrectal Hereditario No


Polipsico (HNPCC) #609310 #120435
#276300

MLH1
"120436
MSH2
*609309

ENFERMEDAD

ncer de Mama Familiar #604370


2555#613399

Carcnoma Medular deTirodes


miliar #155240

Charwt-Marie-Tooth tipo 1A #118220

GEN

MODALIDAD

ENFERMEDAD

Charwt-Marie-Tooth tipo 2K #&O7831

Charmt-Marie-Toothtiuo 4D #601455

E!?!

Charwt-Marie-Tooth tipo 4E #605253

PMP22
'601 097
MPZ '1 59440

Charwt-Marie-Tooth tipo 4F #145900

EGR2
"129010
PRX '605725

Charwt-Marie-Tooth ligada al X
#302800
CHARGE, sindrome #214800

NEFL
'1 62280
GDAPl
"606598

Charwt-Marie-Tooth tipo 2E #607684

GEN

Cinca, sndrome (Enfermedad


infiamatoria muitisistmica infantil)
#E07115

NLRP3'CIAS1
%O6416

H5KZ

CoVn-Lowry, Sindrome #303600

*300075
HTT *613004

Corea de Huntington #143100

NlPBL
%O8667

Cornellia de Lange, sindrome (CDSL1)


U122470

SMClA
"300040
MSX2
'123101

Craneosinostosis tipo 11 #604757

UGTl A l
'1 91740

Crigler-Najjar,sndrome #218800

Crouzon con Acantosis Nigricans,


Sndrome #612247

1 Crouzon. sindrome #123500

30

Secuenciacin completa

15

Deteccin mutacin D Aral48Stu Lom\ mediante PCR

FGFR3
'134934

15

Secuenciacin completa

15

Secuencacin completa

30

Secuenciacin completa

35

Secuenciacin completa

30

Secuencacin competa

Secuenciacin comoeta

75

30

35

Secuenciacin competa

40
20

Secuenciacin competa

50

Secuenciacin completa

40

Secuenciacin completa

30

Secuencacin completa

30

Deteccin de a mutacin p.Ala39lGlu

20

Deteccin mutacin u.Pro250Ara mediante


secuenciacin

FGFR2

Secuencacin comoeta

35

Deteccion expansin CAG mediante PCR

FGFR3
*134934

15

Secuenciacin completa

DlAS

Secuencacin competa

Secuenciacin competa

SLC3A1
'104614

Cistinuria #220100

Secuenciacin completa

GJBl
*304040
*608892
CHD7

MODALIDAD

.l3

ENFERMEDAD

1
Deficienciade la dihidropirimdina
deshidrogenasa(Toxicidad a
5-Fluorouracilo)#274270

'604566
ALG6

MODALIDAD

Dejerne-Sonas, sindrome #145900

DlAS

Perfil de transferrinas sricas por HPLC

30

Secuenciacincompleta

30

Secuenciacincomoleta

30

Secuenciacincompleta

35

DPY D
"612779

Deteccin de la mutacin c.l740+1G>A mediante


secuenciacin

15

DPY D
*612779

Secuenciacincompleta

40

Genotipado del polimorfismo5GI4G en la regin S'UTR


PA1l s173360
mediante PCR a tiemoo real
PMP22
Secuenciacincompleta
*601097

Deficienciade Plasmingeno

15

Diabetes MODYl #125850

HNF4
*600281

Secuenciacincompleta

35

Diabetes MODY2 #125851

1 GCK *138079 1

Secuenciacincomoleta

20

Secuenciacincompleta

35

SHOX
'312865

Disgenesia Gonadal (mujer XY)


isindrome de Swaver) #400045
~

AMELX
'300391

SRY "480000

( OHH '605423 1

Disomia Uniparental del cromosoma 14


#608149

DisplasiaArritmognica del Ventriculo


Derecho #609040 M07450 #610193
#600996

Displasia Cleidocraneal #119600


Displasia Craneometafisaria #118600

SRY '480000

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

Secuenciacincompleta

30

Determinacin de la dotacin cromosmica XY mediante


PCR

15

Deteccin de la presenciao ausencia mediante PCR


Secuenciacincomoleta
~,

1
1

Secuenc!ac!n c~mp!eta

estudio ;ie microsatlites


Secuenciacincompleta

25

DSP "125647

Secuenciacincompleta

40

DSG2
'1 25671

Secuenciacincompleta

40

RYR2
"180902

Secuenciacin de los 30 exones principales

45

RUNX2
*600211

Secuenciacincompleta

30

15
30

"309550
PKP2
'602861

'605145
ANKH

15

Secuenciacincompleta

Diabetes MODYB #600496

15

MPZ 759440

Discondrosteosis de Leri-Weil (LWD)


#127300

PMM2
'601785
MPI "154550

Defecto Congnito de la Glicosilacin,


sindrome #212065 #603147 #602579

GEN

Secuenc~acinde los exones 9 y 10

30

ENFERMEDAD

Displasia Ectodrmica Hidrtica


#129500

Displasia Epifisaria Mltiple tipo 4


#226900
Displasia Metafisaria sin hipotricosis
#250460
Displasia reno hepato pancretica

. . .. ..

..- - - - . .

DisplasiaTanatofrica tipo I y tipo II


#187600 #187601

1 Distonia deTorsin #128100


Distona Mioclnica#159900

Distonia Tipo 5 #128230

Distrofiafacio-escpulo-humeral
#158900
enfermedad de Steiner #160900

MODALIDAD

(Conexina30)
%O4418

Secuenciacin completa

Secuenciacin del exn 8 al exn 19

GJB6

1
Displasia Epifisaria Mltiple tipo 1
#132400

GEN

'OMP
'600310
COMP
'60031 0
MATN3
'602109
COL9A1
120210
COL9A2
'1 20260
COL9A3
'1 20270
SLC26A2
'606718
RMRP
*157660
NPHP3

FGFR3
'134934
FGFR3
'134934
DYTl
'605204
SGCE
"604149
SGCE
'604149
GCHl
'600225
GCHl
"600225
Regin
genmica
D4Z4
DMPK
*605377

DlAS

35

Secuenciacin completa

35

Secuenciacin del exn 2

15

Secuenciacin de los exones 8 y 9

30

Secuenciacn de los exones 2,3,y 4

30

Secuenciacn de los exones 2,3,y 4

30

Deteccin de las mutaciones p.Arg279Trp, c.-26 2T>C y


p.Cys653Ser mediante secuenciacin

30

Secuenciacin completa

30

Secuenciacin comoeta

79

Deteccin mutaciones p Arg248Cys. p Ser249Cys.


p.Gly370Cys, p.Ser371Cys, p.Tyr373Cys, p.Lys650Gln y
las del codn 807 mediante secuenciacin

15

Secuenciacion completa

35

Deteccin de la deecn GAG mediante PCR

25

Secuenciacin de los exones 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 y 9

30

Secuenciacin completa

35

Secuenciacin completa

30

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

Deteccin del reordenamiento D4Z4 mediante Southern


blot

60

Deteccin expansin CTG mediante PCR y TP-PCR

20

ENFERMEDAD

GEN

MODALIDAD

istrofia Muscular de Duchenne-Becker

a Lentis Aislada Autosomica

Ehlers-Danlos, sndrome Tipo III


ecuenciacion competa

Epidermlisis Bulosa Simple #131960

Epidermlisis Bulosa Simple con


Distrofia Muscular #226670

ENFERMEDAD

Epilepsia dependiente de piridoxina


U2661O0

GEN
ALDH7A1
'1 07323

MODALIDAD

Deteccin de la mutacin p.Glu399Arg mediante


secuenciacin

15

Secuenciacin completa

35

TSCl
'605284

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

TSC2
*191092

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

TSCl
'605284

Secuenciacin competa

25

ALDH7A1
'1 n 7 1 ~ 2

Esclerosis Tuberosa #191100

TSC2
'1 91092
EXTl
*608177

Secuenciacin completa

30

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

EXTl
*608177

Secuenciacin completa

35

EXT2
'608210

Secuencacin competa

35

Factor II (Protrombina) 176930

F2 176930

Deteccin del polimorfismo 20210G>A mediante PCR a


tiempo real

20

Factor V (Leiden) #188055

F5 "612309

Deteccin del polirnorfisrno p.Arg506Gln mediante PCR


a tiempo real

20

F12 "610619

Deteccin mutacin p.C46TmediantePCR a tiempo real

20

PAH *612349

Secuenciacin completa

35

CFTR
'602421

Deteccin de la mutacin p.Phe508del mediante PCR a


tiempo real

15

CFiR
'602421

Deteccin de todas las mutaciones con una frecuencia


superior al 1% en la poblacin espaola

20

CFTR
"602421

Secuenciacin completa

25

CFlR
*602421

Deteccin del polimorfismo poli-T,asociado a infertilidad


masculina

15

TNFRSFIA
'191190

Secuenciacin competa

30

EXT2
"608210
Exostosis Mltiple M33700 #133701

Factor XII #234000


Fenilcetonuria#261600

Fibrosis Quistica #219700

Fiebre Familiar de Hibernia (Fiebre


peridica, autosmica dominante)
U142680

ENFERMEDAD

ebre Mediterrnea Familiar #249100

Hipercolesterolemia Familiar #144010

42

OEN

MODALIDAD

ENFERMEDAD
Hiperplasia Adrenal Congnita por
Dficit de la 21-Hidraxilasa 201910
Hipocondroplasia#146000

GEN

MODALIDAD

CYP21A2
201910

Deteccin mutaciones frecuentes mediante


secuenciacin y MLPA

30

FGFR3
'134934

Deteccinmutacin p.Asn540Lys mediante


secuenciacin

15

continentia Pigmenti #308300

ubert, slndrome Tipo4 #609583

ecuenciacion competa

ENFERMEDAD

rsen, sndrome #150250

pard, sindrome 151100

Liddle, enfermedad #177200

Linforna del manto

44

GEN

MODALIDAD

DIAS

Mocardiopata Hipertrfica #115196


#115195#115210 #115197#192600
#608758#608751 +lo2540

MYBPC3
"600958
TNNT2
*191045
TNN13
+191044
TPM1
*191010

Secuenciacin completa

TNNC
'1 50330
MYL2
"1 50330
MYL3
"1 60790
ACTC

Secuenciacin completa

Secuenciacin completa
Mocardiopata no Compacta #115197
#192600#115200#606617#601493

LMNA
'1 50330
DTNA
'601239
LDB3
'605906

Secuenciacin completa

*300394
Mocardiopata no Compacta (neonatalj
#300183 #606617 #601493

'605906

Miotonia Congnita #255700

(~u~opolisacaridosis
Tipo IVaj
#253000

Secuenciacin completa

'601239

CLCNl
. 3 4 a ~ 7 ~

bHLl'4b
'612222

Secuenciacin completa

35

Secuenciacin completa

NLRPBlClASl
'60641 6

Secuenciacin completa

Muenke, sindrome #602&49

FGFR3
'1 34934

Deteccin mutacin p Pro250Arg mediante


secuenciacin

Nail Patella, sndrome #161200

LMX1B
'602575

Secuenciacin completa

Mucke-Wells, sndrome #191900

30

ENFERMEDAD

Obesidad Mrbida #601665

GEN

MODALIDAD

DlAS

lML4K
'1 55541

Secuenciacin completa

30

Secuenciacin completa

30

1
~ecuenciacincompleta

25

~ecuenciacincompleta

30

Osteogenesis Imperfecta #166200


#166210#166220#259420

120150

Osteogenesis lmperfecta tipo llB


#610854
Osteogenesis lmperfecta tipo Vlll
#610915

E4L7
lg; ; l ;b
PRSSl

Pancreatitis Hereditaria #167800

276000

?:g
jo
SDHD

Paraganglioma Familiar #115310


#168000 #605373

'602690
SDHB

V - V 1 . -

Familiar #170400
Parapleja Espstica Familiar 3A
#182600
Parapleja Espstica Familiar 4
#182601

' V

Y14208

SPG4
"604277

Secuenciacin completa

30

Secuenciacin completa

35

Secuenciacin de los exones 2 y 3

30

Secuenciacin del exn 3

15

Secuenciacin completa

15

Secuenciacin completa

30

Secuenciacin completa

30

Y'L"""1I

Y 1 Ic.0 I I U L C ( u I V I I 1 o

p-l Y-.L"I

amo,

y.-lyuLVVI)I,

p Arg1239His y p Arg1239Gly mediante secuenciacin

30

Secuenciacin completa

35

Secuenciacin completa

35

Parkinson 1, enfermedad #168601

completa
?iSecuenciacin
:&
n
PARK2
'602544
PARK2
+602544

Deteccion de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

40

Parkinson 2, enfermedad #600116

Secuenciacin completa

35

Parkinson 6, enfermedad #605909


Parkinson 7, enfermedad #606324

PlNKl
DJ1 '602533

Secuenciacin completa
Secuenciacin completa

30

I
Partington. sndrome #309510
Peters, anomala #604229

ARX .300382

ARX '300382
PAXG
"607108

Deteccin de la duplicacin c.428451dup mediante


secuenciacin
Secuenciacin completa
Secuenciacin completa

30

30

30
30
40

ENFERMEDAD

PeutzJeghers, sindrome #175200

Policitemia Vera #263300


Poliposis Adenomatosa Colorrectal
Autosmica Recesiva #608456

Poliposis Adenomatosa Familiar


#175100

GEN

STK11
'60221 6
STKll
e602216

MODALIDAD
Deteccin de grandes deleciones ylo duplicaciones
mediante MLPA

25

Secuenciacin completa

35

Estudio de la mutacin p Val617Phe mediante PCR a


JAK2 147796
tiempo real
Deteccin de las mutaciones p.Tyrl65Cys y
p Gly382Asp mediante secuenciacin

MYH .604933
MYH '604933

1 Secuenciacin completa
uerecclon oe las muiacones p u i n IUWLA y
p Glul309AspfsX mediante secuenciacin
Secuenciacin completa

APC .611731
APC '611731

PKD1 601313 Secuenciacin completa


Poliquistosis Renal #173900

Poliquistosis Renal Autosmica


Recesiva #263200

PKD2

.,,..,.
E7: !

Secuenciacin completa

T6F:2

Porfra Aguda Intermitente #176000


Porfra Variegata #176200

PPOX
,600923

Poner 1, sindrome #191830

!=.A7

Prader-Willi. sindrome #176270

Regin
genmica
PWSIAS

E
Pseudohipoaldosteronismo#264350

f
:
!
,
?
Pseudohipoparatiroidismo#lo3580
#603233#612462

GNAS
+139320

Pseudopseudohipoparatiroidisrno

G.?A:,_

15

120
60
115
50

~ecuenciacincompleta

30

Secuenciacin completa

30

~ecuenciacincompleta

150

Deteccin deleciones y dsomia uniparental mediante


estudio de microsatlites
~ecuenciacincompleta

35
135

~ecuenciacincompleta

35

Secuenciacin completa

30

~ecuenciacincompleta

130

20

1 Secuenciacin completa

25

Secuenciacin completa

Estudio de metilacin de la regin genmica PWSIAS

Regin

",","::y

Secuenciacin de los exones 3, 36 y 58

30
135

ENFERMEDAD

GEN

MODALIDAD

Pseudoxantoma Elstico #177850

1 ,,,

SCN5A

QT largo, sindrome #192500 #609620


#609622 #603830

Queratodermia Palmoplantar de ThostUnna #600962

'

SCN5A
*600163
KCNQl
"607542
KCNH2
+152427
KCNEl
+176261
KCNE2
+603796
KCNJ2
"600681
KRTl
'1 39350

Secuenciacin completa

45

Secuenciacin completa

1
1

Secuenciacin completa
Secuenciacin compieta

1
1

30
30

Raquitismo Hipofosiatmico ligado al


cromosorna X #307800

PHEX
,300550

Secuenciacin completa

40

Rendu-Osler, sndrome #600376

g;ii

~ecuenciacincompleta

30

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

45

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

Secuenciacin completa

25

Secuenciacin del exn 1 al exn 15

35

Reordenamientos subtelomricos

Retinoblastoma 180200

Retinosis Pigmentaria ligada al


cromosorna X (RP3) #300029

Retraso mental ligado al cromosoma X


#300419

RB1 180200

RB1 180200
RPGR
.31261
RPGR
+312610

Secuenciacin del exn ORF15

30

ARX *300382

Deteccin de la duplicacin c.428451dup mediante


secuenciacin

30

An"

9"

*.3,-,n.30.?

:--:A-

. . . -N

"IAS

ENFERMEDAD

GEN

MODALIDAD

ivtLrz
+300005
Rett, sndrome ?Y312750

Rubinstein-Taybi, sndrome #180849

MECPP
'300005
CDKLS
300203
CREBBP
%O0140
CREBBP
'600140

Secuenciacin completa

Shwachman-Diamond. sndrome
#260400
Sndrome de Insensibilidad a
Andrqenos #300068

Sordera Hereditaria Materna #580000


Sordera Neurosencorial no sindrmica

Autosomica Recesiva #220290


#601071

Sotos, sindrome #117550

AR '313700

IVI I niun i

Deteccin de arandes deeciones .


Vduulicaciones
IO
.
mediante MLPA

23

Deteccin deleciones y dsoma uniparental mediante


estudio de microsatlites

25

Estudio de metilacin de la reain


BWSISRS
- aenmica
(11~15)

3U

Secuenciacin completa del ARN mensajero

30

Secuenciacin completa

uereccion muracion m. 1 3 3 3meaianre


~ ~
secuenciacin

'561 000

GJB2
(Conexina 26) Deteccin mutacin c.35delG mediante secuenciacin

(Conexina 26) Secuenciacin completa


'121011

OTO F
'603681
NSDl
'606681
NSDl
NSDl
*606681

Stickler, sndrome Tipo 1 #108300

l --

mediante MLPA

BWSISRS
(11~15)
SBDS
"607444

30
duulicaciones

I Deteccin de arandes deeciones VOI

Chr 7
Russell-Silver, sindrome #180860

DlAS

130

15

1 20
30

Deteccin de las mutacones p Gln829Ter y


p Pro1825Ala mediante secuenciacin

15

Deteccin de grandes deeciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

Secuenciacin del exn 6

30

Secuenciacin completa

45

~ecuenciacincompleta

lb5

Trombofilia, panel

MTHFR
'607093 FII
176930 FV
"612309 PAI
173360

Anlisis simultneo de FII (20210G>A), FV


(p.Arg506Gln). MTHFR (c 6 7 7 h T ) y 5G14G en la regin 20
5 i UTR del gen PAI

MTHFR
'607093 FII
176930 FV
"612309

Anlisis simultneo de FII (20210G>A), FV


(p.Arg506GIn) y MTHFR (c.677C>T)

20

Anlisis simultneo de FII (20210G>A), FV


(p.Arg506Gln). MTHFR (c.677hT) y MTHFR
(C 1298AzC)

20

"~CU~II~~I~CIU
~ IwI r r ~ l ~ l e l a

35

Secuenciacin completa

35

zz3
FII
176930 FV
*612309

unicaria por rrio ramiiiar iipoi n i z u i u u


Urticaria por frio familiar tipo2 #U1762

.60641

NLRP12
*609648
AMELX
'300391

Determinacin de la dotacin cromosmica XY mediante 15


PCR
15
Deteccin de la presencia o ausencia mediante PCR

SRY *480000

Secuenciacin completa

30

Secuenciacin completa

30

Defeccin de grandes deleciones y10 duplicaciones


mediante MLPA

25

Secuenciacin completa

30

Varn XX, sindrome #400045 #400044

Von Gierke, enfermedad (Glucogenosis G6PC


+232200
Heptica) +232200
Von Hippel Lindau, sindrome #193300

MODALIDAD

ENFERMEDAD

VHL .608537

-Van Willebrand, enfermedad 193400


Williams-Beuren (WBS), sndrome
#194050

Wilson, enfermedad 277900

Wolf-Hirschhorn, sindrome #194190

X-Frgil (FRAXA) %O0624

52

VWF 193400

Secuenciacin completa

Chr7qll

Deteccin de deleciones en la regin genmica 7q11.2


mediante MLPA

25

ATP7B
'606882

Secuenciacin de los exones 6,8, 13, 14, 15, 16, 17 y


20

15

~ecuenciacincompleta

25

Estudio de la delecin 4p16.3 mediante MLPA

25

Estudio de la delecin 4p16 3 mediante CGHarray 60K

20

Deteccin expansin CGG mediante PCR y TP-PCR. si


orocede

20

2:;

;::p"y

FMRl
*309550

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