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Sonda molecular

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Una sonda es un fragmento de ADN (o raramente ARN) de pequeo tamao


(normalmente entre 100 y 1000 bases) usado en biologa molecular como herramienta
para detectar la presencia de ADN o ARN de secuencia complementaria parecida o igual.
En su uso, la sonda se une a la secuencia diana monocatenaria (ADN 1c ARN) mediante
un mecanismo de hibridacin que forma una estructura bicatenaria, una de las hebras
pertenece a la sonda, y la otra a la secuencia diana. Esta unin se establece porque tanto
la sonda como la diana tienen secuencias en parte o totalmente complementarias,
formndose pares de bases complementarias.
ndice
[ocultar]

1 Marcaje
o

1.1 Radiactividad

1.2 Inmunolgico

1.3 Southern y northern

Marcaje[editar]
Para visualizar las molculas diana se utiliza una sonda marcada, bien radiactivamente,
bien mediante marcaje inmunolgico. Para el uso de ADN de doble cadena primeramente
es necesario desnaturalizarlo mediante calor o en condiciones de alta alcalinidad. Esta
sonda de cadena simple marcada se une a la diana; y los lugares de unin se detectan
porque los mtodos de marcaje dejan una seal detectable mediante fotografa. En los
mtodos ms avanzados se utilizan marcajes mediantefluorescencia que emiten seales
detectadas mediante lser, como el utilizado en la PCR a tiempo real.
La sonda de ADN es una tcnica que permite cortar, repegar, multiplicar y seleccionar
fragmentos de ADN.

Radiactividad[editar]
Se puede marcar radiactivamente la sonda utilizado nucletidos que tengan alguno de sus
tomos con un istopo radiactivo, normalmente 32P, pero tambin es frecuente el uso
de tritio.

Inmunolgico[editar]
Aunque el marcaje radiactivo es muy sensible, conlleva el peligro asociado a la utilizacin
de radiactividad. Para evitar este peligro se desarrollaron otros mtodos de marcaje
basados en anticuerpos. Las sondas se marcan utilizando nucletidos que llevan unida
una molcula (digoxigenina), a la solucin se le aaden anticuerpos especficos que se

unen a esa molcula; y estos anticuerpos llevan asociado un


compuesto luminiscente o fluorescente (Como el CDP-Star) que deja impronta fotogrfica.

Southern y northern[editar]
Independientemente de la naturaleza de la sonda utilizada (ADN ARN), las hibridaciones
efectuadas sobre cidos nucleicos inmovilizados en membranas o in situ, sern de
tipo Southern cuando se use ADN como diana a detectar y de tipo northern cuando la
diana a detectar sea mayoritariamente de ARN. La sonda molecular se utiliza para la
bsqueda de genes especficos, de tal forma que construye una molecula que hace las
veces de detector de genes

Categoras:
ADN

ARN

Ingeniera gentica

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