Semana 6

Las clulas tienen cuatro necesidades esenciales:

Piezas de construccin molecular
Catalizadores qumicos denominados enzimas
Informacin que gue todas sus actividades y Energa para impulsar las diferentes
reacciones y procesos esenciales para la funcin biolgica y para la vida
Molculas que necesitan las clulas: aminocidos, nucletidos, azucares y lpidos. A estos
aadiremos agua, sales inorgnicas, iones metlicos, oxgeno y dixido de carbono
Enzimas: aceleran la velocidad de las reacciones
La informacin esta codificada en los nucletidos de las secuencias de ADN y ARN y se
expresa en la sntesis de protenas especficas. La informacin gentica que se almacena,
trasmite y expresa como ADN, ARN y protenas determina qu clase de reacciones
qumicas puede llevar a cabo una clula, que clase de estructuras es capaz de formar y que
clase de funciones puede realizar
La energa es necesaria para impulsar las reacciones qumicas implicadas en la
informacin de componentes moleculares y para propulsar las numerosas actividades que
realizan estos componentes. La capacidad para obtener, almacenar y usar la energa es una
de las caractersticas ms evidentes de los seres vivos
La importancia de la energa
La energa se define como la capacidad de realizar un trabajo, la energa es la capacidad de
causar cambios especficos
Las clulas necesitan energa para impulsar seis tipos de cambios diferentes: Seis
categoras de cambios que definen seis clases de trabajo:
1. Trabajo de sntesis
2. Trabajo mecnico
3. Trabajo para concentrar molculas
4. Trabajo elctrico
5. Trabajo necesario para generar luz
6. Trabajo para generar calor
Trabajo de sntesis: cambios en los enlaces qumicos. La biosntesis es una actividad que
realizan todas las clulas durante todo el tiempo, que tiene como resultado la formacin de
nuevos enlaces y la generacin de nuevas molculas
El trabajo de sntesis es necesario para mantener las estructuras
La mayora de los componentes estructurales existen en la clula se encuentran en un
estado de renovacin constante. Las molculas que determinan la estructura son degradadas
y sustituidas de forma continua

Casi toda la energa que la clula requiere para el trabajo de biosntesis se destina a
conseguir molculas orgnicas ricas en energa a partir de materiales iniciales ms simples
Los niveles de complejidad estructural ms elevada se producen por autoensamblaje
espontaneo, sin mayor aporte energtico
Trabajo mecnico: cambios en la localizacin y orientacin de una clula o de su
estructura subcelular. El trabajo mecnico implica un cambio fsico en la posicin u
orientacin de la clula o de parte de ella
Este movimiento requiere la presencia en la clula de algn tipo de apndice mvil como
un cilio o un flagelo
Trabajo de concentracin: movimiento de molculas a travs de una membrana en
contra de un gradiente de concentracin. El trabajo de concentracin es acumular
sustancias dentro de la clula o de algn compartimiento subcelular o bien retirar
subproductos de la actividad celular que no pueden seguir siendo utilizados por la clula y
que podran ser incluso txicos si se les permitiera acularse en el interior celular
Trabajo elctrico: movimiento de iones a travs de la membrana en contra de un
gradiente electroqumico. El trabajo elctrico se considera un caso especial de trabajo
de concentracin debido a que tambin implica movimientos a travs de membranas. En
este caso los iones se transportan y el resultado no es solo un cambio en la concentracin de
iones sino tambin el establecimiento de un potencial elctrico a travs de la membrana
El trabajo electico es tambin importante en el mecanismo por el cual los impulsos se
conducen en las clulas nerviosas y musculares
Electroplacas: cada una de las cuales pueden generar un potencial de membrana de
alrededor de 150 milivoltios (mV)
Calor: un aumento de temperatura que puede ser til para los animales de sangre
caliente. El calor es una fuente de energa principal en los homeotermos (animales que
regulan sus temperatura corporal independientemente del entorno)
A 37 Code temperatura el cuerpo funciona de manera eficaz
Bioluminiscencia: la produccin de luz. Bioluminiscencia como otra forma en la que las
clulas utilizan la energa. La luz se genera por la reaccin del ATP con compuestos
luminiscentes especficos y usualmente es de color azul plido
La mayora de los organismos obtienen la energa de la luz del sol o de las molculas
orgnicas de los alimentos
La energa solar llega a la parte superior de la atmosfera de la Tierra a una tasa de 1.94
cal/min por centmetro cuadrado de superficie trasversal, un valor que se conoce como
constante solar

Los organismos pueden ser clasificados en dos grupos basndose en sus fuentes de energa.
El primer grupo organismos capaces de captar la energa luminosa por medio de sistemas
de pigmentos fotosintticos, que almacenan la energa en forma de molculas orgnicas
como la glucosa. Tales organismos se denominan fottrofos (literalmente comedores de
luz) en incluyen plantas, algas, cianobacterias y ciertos grupos de bacterias capaces de
realizar la fotosntesis
Segundo tipo de organismos denominados quimitrofos (literalmente comedores de
qumica), debido a que requieren la ingesta de compuestos qumicas tales como
carbohidratos, grasas y protenas. Todos los animales, protistas, hongos y la mayora de las
bacterias son quimitrofos
Los fottrofos aunque pueden utilizar la energa solar cuando est disponible son
tambin capaces de funcionar como quimitrofos y de hecho lo hacen cuando no estn
iluminados
La energa fluye continuamente a travs de la biosfera
Quimitrofos y fottrofos difieren en la forma de energa que pueden utilizar. Los
quimitrofos requieren molculas orgnicas, mientras que los fottrofos captan las
radiaciones solares y las convierten en la energa de los enlaces qumicos
La energa solar es captada por los fottrofos y utilizada para convertir dixido de carbono
y agua durante el proceso de la fotosntesis
Los productos inmediatos de la fijacin de carbono en la fotosntesis son azucares
Los quimitrofos son incapaces de utilizar la energa solar directamente y dependen de la
energa qumica de las molculas oxidables. Las necesidades de energa de los quimitrofos
se pueden satisfaces anaerbicamente (en ausencia de oxigeno) por fermentacin o
aerbicamente (en presencia de oxigeno) por la oxidacin completa de compuestos
qumicos en el proceso de la respiracin aerobia
Los quimitrofos dependen completamente de la energa que los fottrofos empaquetan en
las molculas fermentables u oxidables de los alimentos
Tanto los fottrofos como los quimitrofos utilizan energa para realizar trabajo
La energa se pierde en forma de calor, el calor se disipa en el entorno y se pierde
Los animales de sangre caliente usan el calor para mantener la temperatura corporal a un
nivel constante, normalmente por encima de la temperatura ambiente
El flujo de energa a travs de la biosfera va acompaado de un flujo de materia
La energa entra en la biosfera desprovista de materia (como fotones de luz) y abandona la
biosfera de manera similar (como perdida de calor y aumento de entropa)

BIONERGETICA
Los principios que gobiernan el flujo de energa e incluyen en una rea de la ciencia que el
qumico fsico denomino termodinmica. La termodinmica se ocupa de las leyes que
gobiernan las transacciones de energa que inevitablemente acompaan a la mayora de los
procesos fsicos y a todas las reacciones qumicas
La bioenergtica se puede considerar como una termodinmica aplicada, se ocupa de la
aplicacin de los principios de la termodinmica a las reacciones y procesos del mundo
biolgico
Para entender el flujo de energa necesitamos comprender los sistemas, el calor y el
trabajo
La energa no simplemente es la capacidad de hacer un trabajo sino especficamente como
la capacidad de causar cambios
La porcin limitada de universos que uno desea considerar en el momento se denomina
sistema y al resto del universo le denominamos entorno
Los sistemas pueden ser abiertos o cerrados, dependiendo de si pueden o no intercambiar
energa con su entorno. Un sistema cerrado est aislado de su entorno y no puede recibir
ni liberar energa en ninguna forma. Un sistema abierto puede recibir o perder energa
Se dice que un sistema est en un estado especfico si cada una de sus propiedades
variables (tales como temperatura, presin y volumen) se mantienen constantes con un
valor especfico
Esta es una propiedad muy til debido a que permite calcular las variaciones de energa
partiendo solamente del conocimiento de los estados inicial y final
Esto quiere decir que tres de las variables ms importantes del sistema de las que se ocupan
los fisicoqumicos temperatura, presin y volumenEl intercambio de energa entre un sistema y su entorno se produce de dos formas: como
calor y como trabajo.
El calor es la transferencia de energa de un lugar a otro como resultado de una diferencia
de temperatura entre los dos sitios. La transferencia es siempre espontanea desde el lugar
ms caliente al ms frio
Sistemas isotrmicos carecen de los gradientes de temperatura necesarios para convertir el
calor en otras fuentes de energa. Como resultado el calor no es una fuente de energa til
En los sistemas biolgicos, el trabajo es el uso de la energa para realizar cualquier proceso
distinto del flujo de calor

En qumica bilgica las variaciones de energa se expresan usualmente en trminos de

calora (cal) que se define como la cantidad de energa necesaria para calentar un gramo de
agua un gramo centgrado (concretamente desde 14.5 Co hasta 15.5 Co) a 1 atmosfera de
presin
Una unidad alternativa de energa, el julio (J). La conversin es sencilla 1 cal = 4.184 J o 1
J = 0.239 cal
Calor nutricional se usa frecuentemente para expresar el contenido energtico de los
alimentos. La calora nutricional se representa con una C
La primera ley de la termodinmica nos dice que la energa se conserva
La primera ley de la termodinmica es llamada ley de conservacin de la energa.
Establece que en todo cambio qumico o fsico la cantidad total de energa en el universo
permanece constante, aunque la forma de la energa puede cambiar. O en otras palabras,
la energa puede convertirse de una forma en otra pero nunca puede crearse o destruirse
Aplicada a un sistema cerrado, la primera ley significa que la cantidad total de energa
presente en todas sus formas debe ser la misma antes y despus de que ocurra cualquier
proceso o reaccin. Aplicada a un sistema abierto, la primera ley dice que durante el
curso de cualquier reaccin o proceso, la cantidad total de energa que sale del sistema debe
ser exactamente igual a la energa que entra
La energa total almacenada dentro de un sistema se denomina energa interna del sistema
representada por el smbolo E
Incremento de la energa interna E que ocurre durante un proceso dado. Ees la
diferencia entre la energa interna del sistema antes del proceso y despus del proceso
Entalpia o cantidad de calor. La entalpia se representa por el smbolo H y se relaciona
con la energa interna E por un trmino que combina tanto la presin (P) como el volumen
(V): H=E+PV
Si la cantidad de calor de los productos es menor que la de los reactivos, H ser negativo
y se dice que la reaccin es exotrmica. Si la cantidad de calor de los productos es mayor
que la de los reactivos H serpositiva y la reaccin es endotrmica
La segunda ley de la termodinmica nos dice que las reacciones tienen direccionalidad
Espontaneidad termodinmica es una medida de si la reaccin o el proceso puede
producirse pero no dice nada de si se producir
La segunda ley de la termodinmica o la ley de la espontaneidad termodinmica. La
segunda ley se puede expresar de diferentes maneras. La ms sencilla es la que nos dice que
en cada cambio fsico o qumico, el universo siempre tiende hacia el mayor desorden o
aleatoriedad

Ningn proceso ni reaccin desobedece la segunda ley de la termodinmica

La entropa y la energa libre son dos medios alternativos para evaluar la
espontaneidad termodinmica
Entropa o energa libre
Entropa: medida de aleatoriedad o desorden. La entropa se representa por el smbolo S.
Para cualquier sistema, el incremento de entropa S, representa un cambio en el grado de
aleatoriedad o desorden de los componentes del sistema
La variacin de la entropa como medida de la espontaneidad termodinmica
Todos los procesos o reacciones que ocurren espontneamente producen un aumento en la
entropa total del universo
Energa libre: representada con el smbolo G por Willard Gibbs
La variacin de la energa libre, DG, se relaciona con las variaciones de la entalpia y la
entropa
La segunda ley: todos los procesos o reacciones que suceden de manera espontnea
obtiene como resultado una disminucin de la energa libre del sistema. En el valor para el
Gsistemaes negativo para cada reaccin o proceso real
Tales procesos o reacciones se denominan exergnicos que quiere decir liberadores de
energa. Se refiere especficamente a la variacin en la energa libre . Estos valores pueden
ser negativos, positivos o cero para una reaccin dada
Cualquier proceso o reaccin que tuviese como resultado un aumento de la energa libre del
sistema se denomina endergnico (que requiere energa)
Por cada mol de glucosa oxidada se liberan 673 kcal de calor
Cuando se define una reaccin como espontanea termodinmicamente, simplemente se
quiere decir que es un acontecimiento energticamente factible que liberara energa libre si
se produce
ENTENDER EL G
La constante de equilibrio es una mediad de la direccionalidad
Constante de equilibrio Keq, es la relacin entre las concentraciones de los productos y de
los reactivos en equilibrio

G es una medida de la espontaneidad termodinmica para una reaccin en la direccin en

la que est escrita (de izquierda a derecha) a las concentraciones de reactivos y productos
especificadas
Variacin estndar de la energa libre y se designa como G 0, en donde el superndice (0)
hace alusin a condiciones estndar de temperatura, presin y concentracin y el apostrofe
() enfatiza que para los bioqumicos, la concentracin de iones hidrogeno estndar es 10 7
M no 1.0 M
Semana 7.
El signo de G nos dice si una reaccin es posible en la direccin indicada, y la magnitud
de G indica la cantidad de energa que puede ser liberada mientas que la reaccin tiene
lugar en esa direccin
Catlisis enzimtica prcticamente todas las reacciones o procesos celulares son mediados
por protenas (o en ciertos casos ARN) catalizadores llamados enzimas
ENERGIA DE ACTIVACION Y EL ESTADO METAESTABLE
La barrera de activacin energtica debe ser superada antes de que se pueda verificar
una reaccin qumica
Energa de activacin especfica (EA), definida como la cantidad mnima de energa que
los reactivos deben tener antes de que la colisin entre ellos tenga xitos, dando origen a los
productos
Los reactivos necesitan alcanzar un estado qumico intermedio llamado estado de
transicin, cuya energa libre es mayor que la de los reactivos iniciales
Go mide la diferencia en la energa libre entre los reactivos y los productos, mientras
EAindica el mnimo de energa requerida para que los reactivos alcancen el estado de
transicin y por tanto sean capaces de dar lugar a los productos
Si no fuera por el estado metaestable, todas las reacciones tenderan rpidamente al
equilibrio y la vida sera imposible tal como la conocemos
Sistemas isotrmicos: Temperatura constante
Catalizador: Agente que aumenta la velocidad de una reaccin, disminuyendo la energa
de activacin
Enzima catalasa: Una protena que contiene hierro. La catalasa contiene tomos de hierro
retenidos en estructuras qumicas llamadas porfirinas
ENZIMAS COMO CATALIZADORES BIOLOGICOS
Independientemente de su naturaleza qumica, todos los catalizadores comparten tres
propiedades bsicas:

1.Un catalizador incremente la velocidad de una reaccin permitiendo que una reaccin
termodinmicamente factible, tenga lugar a una velocidad razonable, sin necesidad de
activacin trmica
2. Un catalizador funcin con molculas de sustrato
3. Un catalizador cambia solo la velocidad a la que se consigue el equilibrio, no tiene efecto
sobre la posicin del equilibrio
Todas las catlisis en las clulas se llevan a cabo por molculas orgnicas (protenas en la
mayora de los casos) llamadas enzimas
La mayora de las enzimas son protenas
Uno de los primeros nombres aplicados a lo que ahora llamamos enzimas fue el de
fermentos. Hubo que esperara hasta 1926 para obtener la primer enzima cristalizada la
ureasa (a partir de las alubias, por james B. Summer)
Ciertas molculas de ARN llamadas ribosomas tienen tambin actividad cataltica
El sitio activo: Donde ocurre el evento cataltico del cual esa enzima es responsable.
Normalmente, el sitio activo es un surco o bolsillo
La lisozima es una enzima que rompe las uniones glicosdicas en los peptidoglicanos de las
paredes bacteriana, conduciendo a las lisis (ruptura) y muerte de las bacterias. Las
carboxipeptidasa A es una enzima que modifica los polipptidos eliminando un
aminocido cada vez desde el extremo C-terminal del polipptido
Los aminocidos cistena, histidina, serina, aspartato, glutamato y lisina. Pueden participar
en la unin del sustrato al sitio activo durante el proceso cataltico y la histidina, el
aspartato y el glutamato, sirven tambin como donantes o aceptadores de protones
Algunas enzimas pueden portar tambin componentes no proteicos. Estos componente
llamados grupos prostticos, normalmente son molculas orgnicas pequeas o iones
metlicos, tales como el hierro de la enzima catalasa. Funcionan como aceptadores de
electrones
Diversidad enzimtica y nomenclatura: Algunas se denominaron segn el sustrato o
segn sus funciones.
Comisin enzimtica (EC)
Las seis clases principales de enzimas son:
1. Oxidorreductasas
2. Transferasas
3. Hidrolasas

4. Liasas
5. Isomerasas
6. Ligasas
Sensibilidad a la temperatura: Mamferos o aves son homeotermos capaces de regular la
temperatura corporal independientemente del medio ambiente. Sin embargo, los animales
inferiores, las plantas, los protistas y las bacterias, funcionan a la temperatura de su medio
ambiente
Las principales categoras de enzimas
Clases
Oxidorreductasas
Transferasas

Tipo de reaccin
Reacciones de xido-reduccin
Trasfiere grupos funcionales desde una molcula a otra

Hidrolasas

Ruptura hidroltica de una molcula en dos

Liasas

Eliminacin de un grupo desde, o adicin de un grupo

a, una molcula con redistribucin de electrones
Desplazamiento de un grupo funcional dentro de una
molcula.
Unin de dos molculas para formar una nica
molcula

Isomerasas
Ligasas

La unin del sustrato, la activacin y la reaccin se producen en el sitio activo

Las enzimas son catalizadores muy eficaces, gracias a que los sustratos encajan de forma
precisa con el sitio activo de las enzimas
En el sitio activo ocurren la unin, activacin y trasformacin qumica del sustrato
La unin del sustrato: La unin del sustrato suele realizarse a travs de aminocidos
cargados, por medio de puentes de hidrogeno o enlaces inicos (o ambos)
La fuerza de unin entre una enzima y una molcula de sustrato, suele encontrarse en el
rango de 3-12 Kcal/mol
Durante muchos aos, los enzimlogos consideraron el sitio activo como una estructura
rgida. Comparaban el ajuste de un sustrato dentro del sitio activo a una llave dentro de una
cerradura, analoga sugerida por el bioqumico alemn Emil Fischer
Modelo de ajuste inducido propuesto en 1985 por Daniel Koshland. Este modelo supone
que la unin inicial de la(s) molcula (s) de sustrato al sitio activo deforma la enzima y el
sustrato, estabilizando a las molculas de sustrato en su estado de transicin y permitiendo
que los enlaces crticos sean ms susceptibles a ataques catalticos

Activacin del sustrato: El papel del sitio activo no es solo reconocer y unir el sustrato
apropiado sino tambin activarlo
Los tres mecanismos ms comunes son los siguientes:
1.El cambio en la conformacin enzimtica inducida por la unin del inicial sustrato al sitio
activo, no solo causa una mejor complementariedad y un ajuste ms estrecho enzimasustrato, sino que tambin deforma uno o ms de sus enlaces, debilitando as dichos
enlaces, hacindolos ms susceptibles al ataque cataltico
2. La enzima tambin puede aceptar o donar protones incrementando la reactividad qumica
del sustrato
3. Las enzimas tambin pueden aceptar o donar electrones, formando de ese modo enlaces
covalentes temporales entre la enzima y su sustrato
CINETCA ENZIMATICA
Las nicas reacciones que probablemente ocurren en las clulas a velocidades razonables,
son aquellas para las cuales las enzimas especficas estn al alcance de la mano
La simple presencia de la enzima apropiada en la clula no asegura que una determinada
reaccin pueda ocurrir a una velocidad adecuada, hay factores que pueden influir en la
actividad enzimtica, tales como la temperatura o el pH
Cintica enzimtica la cintica concierne a las velocidades de reaccin y la manera en que
esas velocidades estn influidas por varios factores, pero especialmente por la
concentracin del sustrato, de los productos y de los inhibidores
Los inhibidores enzimticos actan irreversible o reversiblemente
Las nicas sustancias en las clulas que afectan a las actividades de las enzimas son sus
sustratos. Sin embargo, las enzimas tambin estn influidas por productos, sustratos
alternativos, sustratos anlogos, drogas, toxinas y una clase importante de reguladores
llamados efectores alostricos. Muchas de estas sustancias tienen un efecto inhibidor en la
actividad enzimtica, reduciendo (o incluso anulando) la velocidad de reaccin con el
sustrato deseado
Esta inhibicin de la actividad de la enzima es importante por varias razones. La primera
y principal es que la inhibicin enzimtica desempea un papel vital como mecanismo de
control en las clulas
Anlogos de sustratos, compuestos que se asemejan al sustrato pero que son
qumicamente incapaces de llevar a cabo la reaccin
Inhibidor irreversible se une a la enzima covalentemente, causando una perdida
irrevocable de la actividad cataltica. Normalmente txicos para las clulas

La inhibicin de la actividad acetilcolinesterasa lleva a una parlisis rpida de las funciones

vitales y por tanto a la muerte
El antibitico penicilina es un inhibidor irreversible de las sern-enzimas implicadas en la
sntesis de la pared celular bacteriana. La penicilina, por tanto es eficaz en el tratamiento de
infecciones bacterianas
Un inhibidor reversible se une a una enzima de forma disociable, no covalente, de manera
que las formas libres y unidas del inhibidor existen en equilibrio las unas con las otras
Las dos formas ms comunes de inhibidores reversibles se clasifican como:Inhibidores
competitivos e inhibidores no competitivos. Un inhibidor no competitivo se une a la
superficie de la enzima en una posicin diferente del sitio activo. Por tanto, no bloquea la
unin del sustrato pero sin embargo inhibe la actividad de la enzima
REGULACION ENZIMATICA
La regulacin que depende directamente de las interacciones entre los sustratos y los
productos con la enzima se llama regulacin por el sustrato. Los incrementos en la
concentracin de sustrato tienen como resultado un aumento en la velocidad de reacciones.
Po el contrario, los incrementos en la concentracin de producto reducen la velocidad a la
cual el sustrato se convierte en producto
En la mayora de las rutas, las enzimas se regulan tambin mediante otros mecanismos. Dos
de los ms importantes son la regulacin alostricay la modificacin covalente. Estos
mecanismos permiten a las clulas conectar o desconectar a las enzimas o ajustar sus
velocidades de reaccin
Las enzimas alostricas se regulan por molculas diferentes de los reactivos y los
productos
La regulacin alostrica es el nico mecanismo importante de control
Retroinhibicin: Una retroinhibicin sucede cada vez que un producto metablico inhibe
(Prohibir, estorbar o impedir) a una de las enzimas implicada en la va por la cual ese
producto se sintetiza
Regulacin alostrica: El termino alostricoderiva del griego otra forma (o estado)-,
indicando que todas las enzimas con capacidad de regulacin alostrica, pueden existir en
dos estados diferentes. En una de las dos formas, la enzima tiene una afinidad alta por su(s)
sustrato(s), mientras que en la otra, tiene poca o ninguna afinidad. Las enzimas con esta
propiedad se llaman enzimas alostricas
El que se favorezca la forma activa o inactiva de una enzima alostrica depende de la
concentracin celular de la sustancia reguladora apropiada llamada efector alostrico. Un
efector alostrico es una pequea molcula orgnica que regula la actividad de una enzima,
para la cual no es ni el sustrato, ni el producto inmediato

Sitio activo que se une el sustrato y un sitio alostrico que se une el efector. La unin de
un inhibidor alostrico cambia el equilibrio entre las dos formas de la enzima para
favorecer el estado de baja afinidad. La unin de un activador alostrico por otra parte
cambia el equilibrio a favor del estado de alta afinidad
Las enzimas tambin se pueden regular por la adicin o eliminacin de grupos qumicos
Fosforilacin/Desfosforilacin: La adicin de grupos fosfato, es decir, la fosforilacin
suele producirse por transferencia de un grupo fosfato desde el ATP al grupo hidroxilo de
un residuo de serina, treonina, tirosina de la protena enzimtica. Las enzimas que catalizan
la fosforilacin de otras enzimas se llaman proten-quinasa
La desfosforilacin est catalizada por enzimas llamadas proten-fosfatasas e implican la
eliminacin de un grupo fosfato desde la protena fosforilada
Ruptura proteoltica: Un tipo diferente de activacin covalente de enzimas consiste en la
eliminacin irreversible de un fragmento de la cadena polipeptdica, mediante una enzima
proteoltica (que degrada protenas). Este tipo de modificacin llamada ruptura
proteoltica, es el que tiene lugar en las enzimas proteolticas del pncreas, tripsina,
quimiotripsina y carboxipeptidasa
RIBOZIMAS: MOLECULAS DE ARN CON ACTIVIDAD ENZIMATICA
Catalizadores constituidos por ARN denominados ribozimas
Ribonucleasa una enzima que degrada ARN, pero no se afectaba por proteinasa K, una
enzima que degrada protenas
Semana 8
Los organismos quimitrofos tanto los animales como la mayora de los
microorganismos, obtienen energa de la comida que ingieren
Las reacciones en las clulas estn catalizadas por enzimas y que la velocidad de una
reaccin catalizada enzimticamente depende de varios factores, como la temperatura, el
pH y las concentraciones de sustratos y productos
RUTAS METABOLICAS
Cuando consideramos todas las reacciones qumicas que ocurren dentro de la clula,
hablamos de metabolismo (de la palabra griega metaballein, que significa -cambiar-)
Rutas metablicas: cada una de ellas para una operacin concreta

Desde la perspectiva de los bioqumicos, la vida a nivel celular se puede definir como una
red integrada de reacciones metablicas cuidadosamente acopladas en la que cada una de
ellas contribuye a la suma de las actividades que la clula debe llevar a cabo
Las rutas metablicas son de dos tipos generales:las rutas en las que se sintetizan
componentes celulares se denominan rutas anablicas (utilizando el prefijo griego ana que
significa -hacia arriba-), mientas que aquellas implicadas en la degradacin de
constituyentes celulares se denominan rutas catablicas (usando el profijo griego kata que
significa hacia abajo-). Las rutas anablicas normalmente implican un incremento
sustancial del orden molcula (y por lo tanto una disminucin local de la entropa) y son
endergnicas (requieren energa). Las rutas catablicas, por otro lado son exergnicas
(liberan energa), debido a que implican una disminucin en el orden molecular
(incremento de entropa). Las rutas catablicas tienen dos papeles en la clula: Liberar la
energa libre necesaria para las funciones celulares y generar las pequeas molculas
orgnicas o metabolitos, que son los ladrillos de construccin para la biosntesis
Las reacciones catablicas pueden tener lugar tanto en presencia como en ausencia de
oxgeno. La produccin energtica es mucho mayor en presencia de oxigeno
ATP: EL ACOPLADOR UNIVERSAL DE ENERGIA
Las reacciones anablicas son las responsables de los procesos de crecimiento y
reparacin en las clulas, mientras que las reacciones catablicas liberan la energa
necesaria para llevar a cabo las reacciones anablicas y otras reacciones celulares
La molcula ms comnmente utilizada como intermediario energtico es el compuesto
fosforilado adenosina trifosfato (ATP). El ATP es en otras palabras la -divisa- (seal)
energtica del mundo biolgico
El ATP tiene dos enlaces fosfoanhdridos ricos en energa
El ATP es una molcula compleja que contiene la base aromtica adenina, el azcar de 5
carbonos ribosa y una cadena de 3 grupos fosfato. Los grupos fosfato estn conectados
entre s por puentes fosfoanhdrido y la ribosa por medio de un enlace fosfoster
El compuesto formado por la unin de adenina y ribosa se denomina adenina. La adenina
puede encontrarse en la clula de forma no fosforilada o con uno, dos o tres fosfatos unidos
al carbono 5 de la ribosa, formando adenosina monofosfato (AMP), difosfato (ADP) y
trifosfato (ATP)
Hidrolisis es el trmino general para las reacciones en las que un enlace molcula se rompe
por reacciones con el agua
En este tipo de reacciones se generan dos productos: uno recibe un H de una molcula de
agua y el otro gana un grupo OH
Se requiere energa para la sntesis de ATP a partir de ADP y esta energa es liberada de
nuevo en la hidrolisis del ATP

La hidrolisis del ATP e altamente exergnica debido a la repulsin electroesttica y a

la estabilizacin por resonancia
La hidrolisis del ATP en ADP y P i(fosfato inorgnico) es exergnica debido a la repulsin
electrosttica entre los grupos fosfato adyacentes cargados negativamente y a la
estabilizacin de los dos productos (ADP y fosfato orgnico) por resonancia
Repulsin electrosttica cargas negativas se repelen entre s, distendiendo el enlace
covalente que mantienen los grupos fosfato
Estabilizacin por resonancia: Electrones presentan la mxima deslocalizacin, una
molcula se encuentra en su configuracin ms estable (de mnima energa) y se dice que
est estabilizada por resonancia
Ruta glucoltica punto de partida del metabolismo energtico quimitrofo en
prcticamente todas las formas de vida
El movimiento de un grupo qumico de una molcula a otra se denominan reacciones de
trasferencia de grupo
El ATP puede funcionar como donador de fosfato en algunas reacciones biolgicas y su
forma desfosforilada, el ADP, puede ser aceptor de fosfato en otras reacciones
METABOLISMO ENERGETICO QUIMITROFO
Son las rutas y reacciones mediante las cuales las clulas catabolizan nutrientes y
conservan, en forma de ATP, parte de la energa libre que se libera en ellas
Oxidacin la mayora de las reacciones del metabolismo energtico quimitrofo implican
reacciones oxidativas que producen energa. Es la perdida de electrones
Las oxidaciones biolgicas normalmente implican la eliminacin de electrones y
protones y son altamente exergnicas
Los carbohidratos, grasas o protenas son fuentes de energa para la clula, significa que
son compuestos orgnicos oxidables
La nica diferencia en la qumica biolgica es que la oxidacin de molculas orgnicas
normalmente implica la eliminacin, no solo de electrones, sino tambin de iones
hidrogeno (protones), de manera que el proceso es tambin una deshidrogenacin
Un electo ms un protn es equivalente a un tomo de hidrogeno
La mayora de las enzimas que catalizan reacciones oxidativas en las clulas son
deshidrogenasas

La reduccin es lo opuesto a la oxidacin y se define como la ganancia de electrones. En

las oxidaciones los electrones suelen ir acompaados de protones y la reaccin global es
por tanto una hidrogenacin
Los tomos de hidrogeno nunca se liberan realmente en la solucin sino que se trasfieren de
una molcula a otra
Las coenzimas como el NAD+ funcionan como aceptores de electrones en las
oxidaciones biolgicas
Las coenzimas son molculas pequeas que funcionan junto con las enzimas, como
trasportadores de electrones o de pequeos grupos funcionales. Las coenzimas funcionan
realmente como sustratos en las reacciones en las que participan. Sin embargo, no son
consumidas, sino recicladas dentro de la clula
La coenzima ms comn implicada en el metabolismo energtico es la nicotinamida
adenina dinucletido (NAD+)
La nicotinamida del NAD+ es un derivado de la niacina conocida como vitamina B
La glucosa es uno de los sustratos oxidables ms importantes del metabolismo
energtico
Glucosa, azcar de seis carbonos (C6H12O6). La glucosa es el azcar mayoritario en la
sangre, y por lo tanto la principal fuente de energa para las clulas del cuerpo. La glucosa
de la sangre procede de carbohidratos ingeridos, como la sacarosa o el almidn o de la
degradacin del glucgeno, un polmero de la glucosa
Qumicamente, la glucosa es una aldohexosa, un azcar de seis carbonos que tiene un
grupo carbonilo terminal
La oxidacin de la glucosa es altamente exergnica
La glucosa es una buena fuente potencial de energa porque su oxidacin es un proceso
altamente exergnico, con un valor de G0 de -686 kcal/mol, en la combustin completa
de la glucosa a dixido de carbono y agua
El catabolismo de la glucosa produce mucha ms energa en presencia que en ausencia
de oxigeno
La oxidacin completa de la glucosa en dixido de carbono y agua, en presencia de oxigeno
se denomina respiracin aerobia o respiracin
Glicolisis: Ruta que no requiere oxgeno. Uno de los intermediarios de la ruta pierde
electrones pero ms tarde otro intermediario de la misma ruta los recupera, este proceso
anaerbico se denomina fermentacin. En algunas clulas animales y en muchas bacterias,
el producto final es el lactato de manera que el proceso del catabolismo anaerobio de la

glucosa se denomina fermentacin lctica. En la mayora de las clulas vegetales y en

microorganismos como las levaduras, el proceso se denomina fermentacin alcohlica
porque el producto final es el etanol, un alcohol
Basndose en sus requerimientos de oxgeno, los organismos son aerobios, anaerobios
o facultativos
Los organismos se pueden clasificar en funcin a sus requerimientos de oxgeno y a su
utilizacin como aceptor de electrones en el metabolismo energtico.
La mayora de los organismos tiene una necesidad absoluta de oxgeno y se denominan
aerobios estrictos. No pueden usar oxigeno como aceptor final de electrones bajo ninguna
condijo. De hecho, el oxgeno es toxico para estos organismos. Los anaerobios ms
estrictos son las bacterias, incluyendo a los agentes causales de la gangrena de las
intoxicaciones alimentarias y de la produccin de metano
Los organismos facultativos pueden desarrollarse tanto en condiciones aerobias como
anaerobias. En condiciones de disponibilidad de oxigeno la mayor parte de los facultativos
llevan a cabo la respiracin aerobia. Sin embargo, pueden cambiar al modo fermentativo en
cantidades limitantes o nulas de oxgeno. Muchas bacterias y hongos, asico como moluscos
y anlidos (gusanos) son organismos facultativos. Algunos organismos aerobios tambin
pueden, en ausencia o con escasez temporal de oxgeno, funcionar como facultativos si es
necesarito
GLICOLISIS Y FERMENTACION: PRODUCCION DE ATP EN AUSENCIA DE
OXIGENO
La molcula de glucosa se degrada dando lugar a 2 molculas de tres tomos de carbono,
que es suficientemente exergnica para generar 2 molculas de ATP por cada molcula de
glucosa fermentada
Anoxia: Falta de oxigeno
La glicolisis genera ATP por catlisis de la glucosa a piruvato
Gluclisis tambin llamado ruta glucoltica, es una secuencia de reacciones de diez pasos
que convierte una molcula de glucosa en dos molculas de piruvato, un compuesto
tricarbonado. La ruta glucoltica ha sido considerada la principal ruta metablica
Visin general de la glucolisis: La separacin se da en la reaccin Gly-4, cuando el azcar
de seis carbonos se escinde en dos molcula de tres tomos de carbono. Una de estas
molculas, el gliceraldehido-3-fosfato, es la nica molcula que se oxida en esta ruta
Ruta general en tres fases:
1.Los pasos de preparacin y ruptura (Gly-1 a Gly-5)
2.La secuencia oxidativa, que tambin genera ATP (Gly-6 a Gly-7)
3.y la segunda reaccin de sntesis de ATP (Gly-8 a Gly-10)

Fase 1: Preparacin y ruptura: El resultado neto de las tres primeras reacciones es la

conversin de una molcula no fosforilada (glucosa) en una molcula doblemente
fosforilada (fructosa-1, 6-bifosfato)
El enlace formado por la fosforilacin de la glucosa es una enlace fosfoster, mientas el
enlace por el que el fosfato terminal se une al ATP e un enlace fosfoanhdrido
La enzima que cataliza esta primera reaccin se denomina hexoquinasa, cataliza la
fosforilacin de otras hexosas (azucares de seis carbonos)
Fosfofructoquinasa-1 (PFK-1), una enzima de especial importancia en la regulacin de las
glucolisis
La enzima aldolasa rompe la fructosa-1, 6-difosfato dando lugar a dos triosas (azucares de
tres tomos de carbono), llamadas dihidroxiacetona fosfato y gliceraldehido-3-fosfato
(reaccin Gly-4)
Fase 2: Oxidacin y sntesis de ATP: En la fase 1 se han consumido dos molcula se ATP
por cada molcula de glucosa
En la fase 2 (reacciones Gly-6 y Gly-7), la produccin de ATP esta acoplada directamente a
una oxidacin y en la fase 3 (Gly-8 a Gly-10), una forma fosforilada del piruvato, de alta
energa, sirve para la produccin de ATP
La produccin de ATP, por la trasferencia directa al ADP, de un grupo fosfato de alta
energa procedente de un sustrato fosforilado se denomina fosforilacin a nivel de
sustrato, forma de sntesis de ATP
Fosforilacin oxidativa la fosforilacin del ADP se debe a la trasferencia exergnica de
electrones desde coenzimas reducidas al oxigeno
Por cada molcula de glucosa, deben ser reoxidadas dos molculas de NADH, para generar
el NAD+ necesario en la oxidacin del gliceraldehido-3-fosfato. Esto significa tambin que
la inversin inicial de dos molculas de ATP en la fase 1 se recupera aqu en la fase 2, de
manera que el rendimiento neto de ATP en este punto es cero
Fase 3: Formacin de piruvato y generacin de ATP: En este estado, el grupo fosfato
est unido al tomo de carbono por un enlace fosfoster de baja energa libre de hidrolisis
Formas enol y ceto. Estas dos formas se diferencian solo en la localizacin del doble enlace
El destino del piruvato depende de si el oxgeno se encuentra o no disponible
En presencia de oxgeno, el piruvato se oxida a otra molcula denominada acetil coenzima
A (acetil CoA) que sucesivamente se puede oxidar completamente a Co 2. As la ruta
glucoltica se convierte en la primera de las componentes principales de la respiracin
aerobia

En condiciones anaerobias, no es posible la oxidacin del piruvato, no se forma acetil

coenzima A y no se genera ATP adicional. En lugar de oxidarse, el piruvato se reduce
aceptando los electrones (y protones) que se eliminan del NADH. Los productos ms
comunes de la reduccin del piruvato son el lactato (parte b) o el etanol y el dixido de
carbono (parte c)
En ausencia de oxgeno, el piruvato entra en la ruta fermentativa y regenera NAD+
La ruta glucoltica acaba en la formacin del piruvato
La conversin de glucosa en piruvato requiere que una molcula de NAD+ se reduzca en
NADH por cada molcula de piruvato generada
La conversin de NAD+ en NADH durante la glucolisis podra causar una perdida muy
rpida de NAD+ si no existiera un mecanismo de regeneracin de NAD+
Fermentacin del lactato: El proceso anaerobio que termina con la formacin de lactato
se denomina fermentacin lctica. El lactato se genera por la trasferencia directa de
electrones del NADH al grupo carbonilo del piruvato
La fermentacin del lactato es la principal fuente energtica para la mayora de las
bacterias anaerobias, as como para las clulas animales que se encuentran en condiciones
anaerobias o de hipoxia (carencia de oxigeno). La fermentacin del lactato es tambin muy
importante para nosotros a nivel comercial, ya que la produccin del queso, yogurt y otros
productos comunes dependen de la fermentacin microbiana de la lactosa, el principal
componente de la leche
La acumulacin de lactato resultante es lo que causa el dolor muscular que aparece
tras el ejercicio intenso
El lactato producido de esta forma se trasporta por el sistema circulatorio desde el musculo
al hgado. All se convierte de nuevo en glucosa por el proceso denominado
gluconeognesis. La gluconeognesis es esencialmente la reaccin opuesta a la
fermentacin lctica
Fermentacin alcohlica: En condiciones anaerobias las clulas vegetales, as como las
levaduras y otros microorganismos pueden llevar a cabo la fermentacin alcohlica. En
este proceso el piruvato pierde un tomo de carbono (como CO 2) para dar lugar al
compuesto de dos carbonos acetaldehdo. La reduccin del acetaldehdo por NADH da
lugar al etanol, el alcohol que da nombre al proceso. Esta secuencia de reacciones
reduccin esta catalizada por do enzimas, la piruvato descarboxilasa y el alcohol
deshidrogenasa
La fermentacin libera solo una pequea fraccin de la energa libre del sustrato pero
conserva esa energa eficientemente como ATP

Una caracterstica fundamental de todos los procesos fermentativos es que no hay un

aceptor de electrones externo y no se da una oxidacin total. Tanto en la fermentacin
alcohlica como en la lctica
SUSTATOS ALTERNATIVOS PARA LA GLUCOLISIS
La glucosa es el punto inicial de la gluclisis. La glucosa es un sustrato fundamental tanto
para la fermentacin como para la respiracin en muchos organismos y tejidos
El glicerol y otros azucares se catabolizan tambin por la ruta glucoltica
Un disacrido consta de dos hexosas, glucosa y fructosa y el azcar de la leche (lactosa)
contiene glucosa y galactosa
Los polisacridos se degradan para dar lugar a azucares fosfato que entran en la ruta
glucoltica
La glucosa suele encontrase en forma de polisacridos de reserva, en forma de almidn en
la plantas y glucgeno en los animales
GLUCONEOGENESIS
Las clulas catabolizan glucosa, carbohidratos, azucares y polisacridos.
El proceso de sntesis de glucosa se denomina gluconeognesis que literalmente significa
genes o formacin de glucosa o proceso por el que las clulas animales sintetizan glucosa
El material inicial ms comn es el piruvato o el lactato en el que se convierte el piruvato
en condiciones anaerbicas
La reaccin es exergnica en la direccin glucoltica gracias a la entrada de una molcula
de ATP. En la direccin gluconeognica, se asegura que la reaccin es exergnica por la
hidrlisis del enlace fosfoster
La gliclisis requiere dos molculas de ATP pero genera 4 ATPs, con un rendimiento neto
de dos molculas de ATP por molcula de glucosa catabolizada
La gluconeognesis requiere cuatro ATPs y dos GTPs por glucosa o lo que es lo mismo se
consumen el equivalente a seis molcula de ATP por cada molcula de glucosa sintetizada
Semana 9.
Respiracin celular o Respiracin: Cuando se dispone de un aceptor de electrones
externo, se puede dar la oxidacin completa del sustrato, obtenindose ms ATP
Respiracin celular: el flujo de electrones en o a travs de una membrana, desde
coenzimas reducidas hasta un aceptor de electrones, normalmente acompaado de la
produccin de ATP

La coenzima reducida que se genera por el catabolismo glucoltico de los azcares o

compuestos relacionados es el NADH
FAD (Dinucletido de adenina y flavina) y coenzima Q (o ubiquinona), tambin
recogen los electrones, que se liberan desde compuestos orgnicos oxidables y los
transfieren al aceptor final de electrones
El aceptor final de electrones es el oxgeno, la forma reducida de este aceptor es el agua y
se conoce al proceso en su conjunto como respiracin aerobia. La respiracin aerobia
representa la fuente principal del metabolismo energtico en el mundo aerobio
Los procesos respiratorios que incluyen aceptores de electrones, no necesitan el oxgeno
molecular y son por tanto ejemplos de respiracin anaerobia
Pondremos especial atencin en la mitocondria porque la mayor parte de la produccin
aerobia de ATP tiene lugar dentro de este orgnulo
La respiracin aerobia produce mucha ms energa que la fermentacin
Los productos terminales de la respiracin aerobia son el dixido de carbono y el agua.
Estas son las mismas molculas con las que comienza la fotosntesis
El rendimiento energtico de la respiracin aerobia es considerablemente mayor que el de
la fermentacin. En vez de dos molculas de ATP por cada molcula de glucosa, la
respiracin aerobia puede producir potencialmente hasta 38 molculas de ATP por molcula
de glucosa en procariotas y entre 36 y 38 molculas de ATP por cada molcula de glucosa
en eucariotas
La respiracin aerobia incluye, tanto rutas de oxidacin en las que se liberan los electrones
de sustratos orgnicos y transferidos a coenzimas trasportadores como procesos
concomitantes (Que acta, acompaa o colabora en el mismo sentido que otra cosa) en los
que las coenzimas reducidas (portadoras de electrones) son reoxidadas por el trasporte de
electrones al oxgeno, con la produccin indirecta de ATP
La respiracin incluye la gluclisis, el ciclo del TCA, el transporte de electrones y la
sntesis de ATP
Consideraremos la respiracin aerobia en cuatro etapas, dos que se refieren a los procesos
oxidativos mediados por coenzimas y otros dos que incluyen la reoxidacin de las
coenzimas y la reproduccin de ATP
La etapa 1 es la ruta glucoltica. La gluclisis tiene el mismo resultado en condiciones
aerobias y anaerobias: la oxidacin de la glucosa a piruvato. Pero el destino del piruvato es
diferente en presencia de oxgeno. En lugar de servir de aceptor de electrones como en la
fermentacin, el piruvato es oxidado posteriormente a un compuesto denominando acetil
coenzima A (acetil CoA), que entra en la etapa 2, el ciclo del cido tricarboxlico (TCA).

Esta ruta cclica oxida completamente los carbonos entrantes a CO 2 y conserva la energa
en forma de coenzimas reducidas que son en s mismos compuestos ricos en energa
La etapa 3 consiste en el trasporte de electrones es decir, la transferencia de electrones
desde coenzimas reducidas hasta el oxgeno, acoplado a un transporte activo o bombeo, de
protones a travs de una membrana. La transferencia de electrones desde las coenzimas
hasta el oxgeno es un proceso exergnico y aporta la energa que dirige el bombeo de
electrones a travs de la membrana en la que estn embebidos (Absorber un cuerpo slido
algn lquido) los transportadores, generando un gradiente electroqumico de protones a
ambos lados de la membrana
En la etapa 4 la energa de este gradiente de protones se usa para impulsar la sntesis de
ATP. Este modelo de sntesis de ATP dependiente de oxigeno se denomina fosforilacin
oxidativa
LA MITOCONDRIA DONDE TIENE LUGAR TODO EL PROCESO
La mitocondria la mayor parte del metabolismo energtico aerobio ocurre dentro de este
orgnulo.
Debido a esto, la mitocondria es frecuentemente llamada la central energtica- de la clula
eucariota. Rudolph Kolliker describi la presencia de lo que l llam una serie ordenada
de partculas- en las clulas musculares. Estas partculas se hinchan en el agua, lo que llev
a la conclusin de que estas partculas estaban rodeadas de una membrana semipermeable.
Mitocondrias se cree que provienen de bacterias que fueron englobadas por clulas ms
grandes, tambin tiene la participacin en procesos oxidativos
Otto Warburg mostr que estos orgnulos podan consumir oxgeno
Sin embargo, la mayor parte de nuestro conocimiento acerca de la funcin de la
mitocondria en el metabolismo energtico proviene del desarrollo de la centrifugacin
diferencial desarrollado por Albert Claude
Las mitocondrias se encuentran con frecuencia en los lugares en los que la necesidad
de ATP es mayor
Las mitocondrias estn presentes en todas las clulas aerobias de los organismos eucariotas.
Las mitocondrias se encuentran, tanto en las clulas quimitrofas como en las fottrofas y
por lo tanto son elementos comunes no slo en los animales, nio tambin en las plantas.
Su presencia en clulas fottrofas nos recuerda que tambin los organismos fotosintticos
pueden llevar a cabo la respiracin
Muchas veces las mitocondrias se encuentran agrupadas en las regiones celulares con
mayor actividad metablica, donde los requerimientos de ATP son mayores. Las clulas
musculares son un buen ejemplo de esto. En estas clulas, las mitocondrias se encuentran
organizadas en columnas a lo largo de las fibrillas responsables de la contraccin tambin
se observan en los cilios y flagelos o en la cola de los espermatozoides

Son las mitocondrias redes interconectadas en vez de orgnulos independientes?

Cuando se observan mitocondrias en micrografa electrnicas, suelen aparecer como
estructuras ovaladas, con forma de salchicha, con una longitud de varios micrmetros y con
un dimetro de 0.5-1.0 kg. Las mitocondrias son entidades separadas y que son orgnulos
grandes y muy numerosos. Representa el orgnulo ms grande despus del ncleo en la
mayora de las clulas animales
En las clulas vegetales, los cloroplastos y algunas vacuolas son normalmente ms
grandes incluso que las mitocondrias
Se estima que cada hepatocito de mamfero contiene alrededor de 500-1000
mitocondrias
Las clulas vivas contienen mitocondrias grandes y ramificadas en un estado de flujo
dinmico, con segmentos separndose por gemacin y fusionndose con otra mitocondria
Las membranas externa e interna definen dos compartimientos separados
La presencia de dos membranas llamadas membranas externa e interna es una
caracterstica distinta. La membrana externa no representa una barrera de permeabilidad
significativa para el paso de iones y molculas pequeas, ya que dispone de unos canales
proteicos transmembranosos denominados porinas, que permiten el paso de solutos de un
peso molecular de hasta 5,ooo kg
Espacio intermembrana entre la membrana externa y la interna de la mitocondria o del
cloroplasto, es esencialmente continuo con el citosol, las enzimas localizadas en el espacio
intermembranas se encuentran all porque las enzimas son demasiado grandes para pasar a
travs de las porinas
La membrana interna de la mitocondria s representa una barrera para la permeabilidad
separando por tanto los espacios intermembrana y del interior del orgnulo en dos
compartimientos separados
La membrana interna de la mayora de las mitocondrias presenta unas invaginaciones
caractersticas llamadas crestas que aumentan enormemente su superficie
Las protenas representan hasta el 75% del peso de la membrana interna
Las partes trasmembranosas de las protenas implicadas en el trasporte de solutos, en el
trasporte de electrones y en la sntesis de ATP
Las clulas del corazn, el rin o los msculos presentan actividades respiratorias
elevadas y en correspondencia un elevado nmero de crestas
El interior de la mitocondria est relleno de una matriz semifluida. En la matriz se
encuentran muchas de las enzimas involucradas en la funcin mitocondrial al igual que
molculas de ADN y ribosomas

En la mayor parte de los mamferos, el genoma mitocondrial consiste en una molcula

circular de ADN de entre 15,000 y 20,000 pares de bases que codifican ARNs ribosomales,
ARNs de trasferencia y alrededor de una docena de subunidades polipeptdicas de protenas
de la membrana interna
Las funciones mitocondriales tienen lugar en membranas especificas o dentro de los
compartimientos
Localizacin de las funciones metablicas dentro de la mitocondria
Membrana o
compartimiento

Funciones
metablicas

Membrana externa

Sntesis de fosfolpidos
Insaturacin de cidos grasos
Elongacin de cidos grasos

Membrana interna

Transporte de electrones
Fosforilacin oxidativa
Trasporte metablico

Matriz

Oxidacin del piruvato

Ciclo del TCA
-Oxidacin de lpidos
Replicacin del ADN
Sntesis de ARN (transcripcin)
Sntesis de protenas

(traduccin)
Sobresaliendo desde la membrana interna hacia la matriz se encuentran unas esferas con
forma de puno que se llaman complejos F1. Cada complejo consiste en seis polipptidos
ensamblados. Los complejos F1 tienen un dimetro aproximado de 9nm y son
especialmente
abundantes
en
las
crestas.
Cada complejo F1 est unido mediante un pequeo tallo proteico a un complejo Fo(Se
demostr que el complejo Fo confera resistencia al antibitico oligomicina). La asociacin
de un complejo F1y otro Fo se conoce como complejo FoF1y se considera como una ATP
sintetasa, porqu sa es su funcin habitual en el metabolismo energtico. El complejo F o
F1 es de hecho el responsable de la mayor parte de la produccin de ATP que tiene lugar en
la mitocondria
Tincin negativa: Tiene como resultado una imagen clara sobre un fondo oscuro
El los procariotas, las funciones respiratorias se localizan en la membrana plasmtica
y en el citoplasma
Los procariotas no tiene mitocondrias y sin embargo la mayora de las clulas procariotas
son capaces de realizar la respiracin aerobia

Bsicamente, el citoplasma y la membrana plasmtica de una clula procariota realizan las

mismas funciones que la matriz mitocondrial y la membrana interna. En las clulas
procariotas, por tanto, la mayora de las enzimas de la gluclisis, del ciclo del TCA y del
catabolismo de cidos grasos y aminocidos, se encuentran en el citoplasma, mientras que
las protenas del transporte de electrones, se localizan en la membrana plasmtica. El
complejo FoF1 est tambin en la membrana plasmtica de los procariotas con el
componente Fo incrustado en la membrana y el componente F 1 sobresaliendo desde la
membrana hacia el citoplasma
EL CICLO DEL ACIDO TRACARBOXILICO: A VUELTAS CON LA OXIDACION
En presencia de oxgeno, el piruvato se oxida completamente a dixido de carbono y la
energa liberada en el proceso se usa para promover la sntesis de ATP
Un intermediario importante en estas series de reacciones cclicas es el citrato que tiene
tres grupos carboxlico y por lo tanto es un cido tricarboxlico. Por esta razn esta ruta se
denomina ciclo del cido tricarboxlico (TCA). Este ciclo tambin se conoce
habitualmente como ciclo de Krebs en honor a Hans Krebs
El ciclo del TCA metaboliza acetil coenzima A, que consiste en un acetato unido a
transportador llamado coenzima A. (La coenzima A fue descubierta por Fritz Lipmann)
El acetil CoA proviene de la descarboxilacin oxidativa del piruvato o de la ruptura
oxidativa de los cidos grasos
El acetil CoA trasfiere su grupo acetato a un aceptor de cuatro carbonos llamado
oxalacetato formndose de esta manera citrato
Cada vuelta del ciclo de Krebs implica la entrada de dos carbonos (el acetato del acetil
CoA), la liberacin de dos carbonos en forma de dixido de carbono y la regeneracin
de oxalacetato. La oxidacin tiene lugar en cinco etapas:
Cuatro dentro del mismo ciclo y una en la reaccin que convierte el piruvato en acetil
CoA. En todos los casos los electrones son captados por coenzimas. Los sustratos del ciclo
de Krebs son por tanto el acetil CoA, las coenzimas oxidadas del ADP y el Pi, y los
productos son dixido de carbono, coenzimas reducidas y una molcula de ATP
El piruvato se convierte en acetil coenzima A mediante la descarboxilacin oxidativa
El paso de piruvato a acetil CoA requiere la actividad de la piruvato deshidrogenasa
(PDH), un complejo multiproteico enorme, con peso molecular de 4.6x106, que consta de
tres enzimas, cinco coenzimas y dos protenas reguladoras
La oxidacin del piruvato tiene lugar en el tomo de carbono 2

Vitamina B cido pantotnico. El cido pantotnico se clasifica como una vitamina porque
los hombrees y otros vertebrados la necesitan como parte de una coenzima esencial que no
pueden sintetizar por s mismos
La coenzima A esta diseada para el trasporte del acetato o de otros grupos acilo. (De hecho
el -A- de su nombre viene de su funcin trasportadora de grupos acilos)
El ciclo del TCA comienza con la entrada de acetato en forma de acetil CoA
El ciclo del TCA comienza con la entrada de acetato en forma de acetil CoA. En cada
vuelta del ciclo del TCA, entran dos tomos de carbono en la forma orgnica (como
acetato) y salen dos tomos de carbono en forma inorgnica (como dixido de carbono)
En dos reacciones de oxidacin del ciclo del TCA se forma NADH y se libera CO2
Cuatro de las ocho etapas de TCA son oxidaciones. En cuatro de las reacciones intervienen
coenzimas que entran en forma oxidada y salen en forma reducida
La reaccin TCA-2 convierte al citrato en un compuesto relacionado, el isocitrato, mediante
la aconitasa. A diferencia del citrato, el isocitrato tiene un grupo hidroxilo que puede ser
fcilmente oxidable
El isocitrato es oxidado por la enzima isocitrato deshidrogenasa a un compuesto de seis
carbonos llamado oxalosuccinato
La produccin directa de GTP (o ATP) tiene lugar en una etapa del ciclo del TCA
El succinil CoA tiene un enlace tioster, cuya hidrlisis es altamente exergnica
La energa de este enlace tioster se usa para generar una molcula de ATP (en las
mitocondrias de bacterias y de clulas vegetales) o GTP (en las mitocondrias en las clulas
animales)
La oxidacin del -cetoglutarato en forma de un enlace tioster, una vez hidrolizado, es
capaz de generar ATP o GTP.
De esta manera, el resultado neto de la hidrlisis del succinil CoA es la produccin de una
molcula de ATP
Las reacciones oxidativas finales del ciclo del TCA generan FADH2 y NADH
La oxidacin de un enlace carbono-carbono libera menos energa que la oxidacin de un
enlace carbono-oxgeno
El dinucletido de flavina y adenina (FAD) posee una vitamina del complejo B como
parte de su estructura, riboflavina, en este caso. El FAD acepta dos protones y dos
electrones, por lo que la forma reducida se indica como FADH2

El doble enlace del fumarato es hidratado, formndose malato catalizada por la enzima
fumarato hidratasa
En resumen: Los productos del ciclo del TCA son co2, ATP, NADH y FADH2
1.El acetato entra en el ciclo como acetil CoA y se une a una molcula aceptora de cuatro
tomos de carbono para formar citrato, un compuesto de seis carbonos
2. La descarboxilacin ocurre en dos etapas del ciclo por lo que la entrada de dos carbonos
en forma de acetato se compensa por la prdida de dos carbonos en forma de dixido de
carbono
3. La oxidacin tiene lugar en cuatro etapas, con el NAD+ como aceptor de electrones en
tres casos y el FAD en uno de ellos
4. El ATP se genera en un solo momento con el GTP como intermediario en las clulas
animales
5. Se completa una vuelta del ciclo con la regeneracin del oxoalacetato, el aceptor original
de cuatro carbonos
Dos molculas de acetilo CoA derivan de una nica molcula de glucosa
Varias enzimas del ciclo del TCA estn sujetas a una regulacin alostrica
La mayor parte del control consiste en la regulacin alostrica de cuatro enzimas clave,
por medio de molculas efectoras, las molculas efectoras pueden ser tanto inhibidoras
como activadoras
Piruvato deshidrogenasa (PDH)
Para apreciar el significado de la regulacin del ciclo del TCA, recuerde que usa acetil
CoA. NAD+, FAD y ADP como sustratos y genera como productos NADH, FADH2, CO2 y
ATP. Tres de estos productos ADH, ATP y acetil CoA- son importante efectores de una o
ms enzimas. Adems NAD+, ADP y AMP activan cada uno al menos a una de las enzimas
reguladoras
La disponibilidad general de acetil CoA est determinado principalmente por la actividad
del complejo PDH que es inhibido por NADH, ATP y acetilo CoA y es activado por NAD +,
AMP y CoA libre
El ciclo del TCA desempea un papel central en el catabolismo de grasas y protenas
La glucosa como el sustrato principal de la respiracin celular
La grasa como una fuente de energa: Las grasas son compuestos altamente reducidos
que liberan ms energa por gramo tras su oxidacin que los carbohidratos

Triacilgliceroles (tambin llamados triacilglicridos) que son tristeres neutros de

glicerol y cidos grasos de cadena larga. El catabolismo de los Triacilgliceroles comienza
con su hidrlisis en glicerol y cidos grasos libres
El catabolismo de cidos grasos a acetil CoA se denomina oxidacin porque el
acontecimiento oxidativo inicial en el tomo de carbono que se encuentra en la posicin
del cido graso
Los cidos grasos derivados de las grasas, al igual que el piruvato derivado de los
carbohidratos, se convierten por oxidacin en acetil CoA, que ser posteriormente
catabolizado por el ciclo del TCA
Las enzimas de la oxidacin de los cidos grasos estn localizadas en la mitocondria en las
clulas eucariotas
Las protenas como una fuente de energa y de aminocidos: Las protenas, tambin
pueden ser catabolizadas para generar ATP si es necesario, especialmente cuando los
depsitos de grasas y de azcares estn vacos o no estn disponibles
Los aminocidos en los que una protena se degrada pueden ser reciclados en protenas o
ser degradados oxidativamente para obtener energa
El catabolismo de las protenas comienza con la hidrlisis del enlace peptdico que
mantienen a los aminocidos unidos en una cadena polipeptdica. El proceso se denomina
protelisis y las enzimas que lo llevan a cabo proteasas
De los 20 aminocidos que se pueden encontrar en las protenas, tres dan lugar a
intermediarios del ciclo del TCA de una maneara directa. Estos aminocidos son la
alanina, el aspartato y el glutamato, que pueden ser convertidos en piruvato, oxoalacetato
y -cetoglutarato
El ciclo del TCA constituye una fuente de precursores para rutas anablicas
La funcin principal del ciclo del TCA es el catabolismo
Debido a que el ciclo del TCA representa un nexo entre rutas catablicas y anablicas, a
menudo se le denomina como la ruta anfiblica
El succinil CoA el punto de partida para la sntesis del grupo hemo
TRASPORTE DE ELECTRONES: FLUJO DE ELECTRONES DESDE LAS
CONZIMAS AL OXGENO
Las dos primeras etapas de la respiracin aerobia la gluclisis y el ciclo del TCA
La oxidacin completa de la glucosa a CO2 puede producir 686 kcal/mol

Cerca del 90% de la energa potencial libre que est presente en una molcula de glucosa se
conserva en las 10 molculas de NADH y en las 2 molculas de FADH 2, que se forman
cuando se oxida una molcula de glucosa a CO2
El proceso de reoxidacin de las coenzimas mediante la trasferencia de electrones al
oxgeno se conoce como trasporte de electrones. El trasporte de electrones es la tercera
parte del metabolismo respiratorio
El sistema de trasporte de electrones consiste en cinco tipos diferente de
trasportadores
Los trasportadores que constituyen el sistema son flavoprotenas, ferrosulfoprotenas,
citocromos, citocromos que contiene cobre y una quinona denominada coenzima Q
Casi todas las trasferencias de electrones ocurren en las membranas, por lo que no es
sorprendente que la mayor parte de estos transportadores sean molculas hidrfobas. La
mayora de estos intermediarios aparecen en la membrana como parte de grandes complejos
de protenas llamados complejos respiratorios
Flavoprotenas: Usan como grupo prosttico al dinucletido de flavina adenina (FAD),
al mononucletido de flavina (FMN). El FMN en esencia es la media molcula de FAD
Una caracterstica importante de las flavoprotenas (y de la coenzima NADH tambin) es
que trasfieren, tanto protones, como electores a medida que son oxidados y reducidos
reversiblemente
Ferrosulfoprotenas: Tambin llamadas ferredoxinas (protenas frricas sin grupo
hemo), forman parte de una familia de protenas que consiste en tomos de hierro y azufre
asociados con las protenas ferrosulfurosas no toman o ceden protones mientras cambian
entre los estados oxidados y los reducidos
Citocromos: Los citocromos tambin contienen hierro, pero formando parte del grupo
prosttico de una porfirina llamado hemo componente del hemoglobina
Existen al menos cinco tipos diferentes de citocromos en el sistema de trasporte de
electrones, designados como citocromos b, c, c1, a y a3. El tomo de hierro del grupo
prottico hemo sirve como trasportador de electrones en los citocromos. Los citocromos
son tambin transportadores de un nico electrn, sin trasferir protones. Mientras que los
citocromos b, c1, a y a3son protenas integrales de membrana, el citocromo c es una
protena perifrica de membrana
Citocromos que contiene cobre: Los citocromos a y a3 tambin contienen un tomo de
cobre unido al grupo hemo del citocromo
Coenzima Q: El nico componente no proteico de la ETS, es una quinona. Debido a su
carcter ubicuo (Que est presente a un mismo tiempo en todas partes, omnipresente, que

vive en continuo movimiento para no perderse nada) en la naturaleza, se conoce a la

coenzima Q como ubiquinona
Forma quinona (CoQ)
La coenzima Q no forma parte de un complejo respiratorio
Los transportadores de electrones funcionan en una secuencia que bien determinada
por sus potenciales de reduccin
El potencial de reduccin estndar E0, es una medida, en voltios (V) de la afinidad que
tiene un compuesto por los electrones. Describe la facilidad de un compuesto para ganar
electrones y reducirse
Tener un valor positivo de E0 significa que la forma oxidada tiene una gran afinidad por los
electrones y un valor de E 0 negativo quiere decir que es un aceptor de electrones malo es
decir un buen donador de electrones
Constante de Faraday 23,062 cal/mol
La mayora de los trasportadores estn organizados en cuatro grandes complejos
respiratorios
El complejo I transfiere los electrones desde el NADH a la coenzima Q y se denomina
complejo NADH-coenzima Q oxidorreductasa (o complejo NADH deshidrogenasa). El
complejo II trasfiere a la CoQ los electrones derivados del succinato de la reaccin TCA-6.
Este complejo se conoce como complejo succinato-coenzima Q oxidorreductasa. El
complejo III se denomina complejo coenzima Q-citocromo oxidorreductasa porque
acepta los electrones de la coenzima Q y los pasa al citocromo c. El complejo IV trasfiere
los electrones desde el citocromo c al oxgeno y se llama citocromo c oxidasa
Los tres complejos necesarios para la oxidacin del NADH complejos I. III y IV
La funcin de la citocromo c oxidasa: Slo la citocromo c oxidasa al final del sistema de
trasporte de electrones es una oxidasa terminal capaz de trasferir directamente los
electrones al oxgeno
Los complejos respiratorios se mueven libremente dentro de la membrana interna
Los complejos proteicos de la membrana mitocondrial interna son mviles y pueden
difundir libremente a lo largo del plano de la membrana
El NADH, la coenzima Q y el citocromo c son intermediarios clave en el proceso de
trasferencia de electrones. El NADH une la ETS con las reacciones de deshidrogenacin
(oxidacin) del ciclo del TCA y con casi cualquier otra reaccin de oxidacin que tenga
lugar en la matriz mitocondrial

La coenzima Q acepta los electrones tanto del complejo I como del II. Se ha estimado que
existen alrededor de 10 molculas de citocromo c y 50 molculas de ubiquinona por cada
complejo I
SINTESIS DE ATP: JUNTANDO LAS PIEZAS
Cuarta y ltima fase de la respiracin aerobia: la sntesis de ATP
La energa de un sustrato oxidable como la glucosa, se trasfiere a coenzimas reducidas
durante las reacciones de oxidacin de la gluclisis y el ciclo del cido tricarboxlico (fase1
y 2) y cmo se utiliza despus para generar un gradiente electroqumico de protones a
travs de la membrana mitocondrial interna (fase 3)
Los complejos F1 que pueden verse a lo largo de la superficie interna de las crestas
Las partculas F1 tienen actividad ATP sintasa
Partculas submitocondriales estas partculas fueron capaces de llevar a cabo el transporte
de electrones y la sntesis de ATP
Factores de acoplamiento son conocidas por ser las estructuras responsables de la
actividad de sntesis de ATP en la membrana mitocondrial interna y en la membrana
plasmtica bacteriana
El complejo FoF1: el transporte de protones a travs de Fo permiten que F1 sintetice
ATP
El complejo Fo funciona como trasportador de protones
El complejo FoF1 es la ATP sintasa funcional Pmf fuerza motriz del gradiente
electroqumico de protones
El componente F1 lleva a cabo la sntesis de ATP gracias a la energa generada por este
gradiente de protones
El sitio cataltico de sntesis e hidrlisis del ATP se localiza en la subunidad ; la
subunidad sirve como sitio de unin ATP/ADP
El modelo quimiosmtico implica un trfico de protones dinmico a travs de la
membrana
Se requieren 3 protones para la sntesis de 1 molcula de ATP, entonces tiene sentido que la
produccin sea de 3 ATP por NADH y 2 ATP por FADH2
LA RESPIRACION AEROBI: RESUMEN GLOBAL

El mximo rendimiento de ATP en la respiracin aerobia es de 36-38 ATPs por

molcula de glucosa
La oxidacin completa de la glucosa a dixido de carbono por la gluclisis y el ciclo del
TCA tiene como resultado la produccin de 4 molculas de ATP por fosforilacin desde
sustratos. La mayor parte de la energa libre restante de la oxidacin de la glucosa se
almacena en las 12 molculas de coenzima -10 de NADH y 2 de FADHPor qu el rendimiento mximo de ATP en las clulas eucariotas vara entre 36 y 38
ATPs por cada glucosa?
La glucosa se cataboliza aerbicamente en una clula eucariota, la gluclisis genera, en el
citosol, 2 molculas de NADH por cada glucosa, mientras que el catabolismo del piruvato
genera otras ocho molculas de NADH en la matriz mitocondrial
Un sistema de trasporte de electrones consta de uno o ms transportadores de electrones
que pueden ser reducidos reversiblemente
Semana 10.
Gregor Mendel concluyo que la informacin hereditaria se trasmita en forma de unidades
diferenciadas que en la actualidad llamamos genes. Actualmente, sabemos tambin que los
genes consisten en secuencias de ADN que codifican productos funcionales que
normalmente son cadenas proteicas, pero que en algunos casos pueden ser molculas de
ARN que no codifican protenas
Se destaca el hecho de que la informacin que lleva el ADN fluye entre generaciones de
clulas y dentro de cada clula individual
Durante el primero de estos dos procesos la informacin almacenada en las molculas de
ADN de una clula se somete al proceso de la replicacin, generando dos copias de ADN
que se distribuyen a las clulas hijas cuando la clula se divide
El ncleo es el orgnulo que aloja a los cromosomas de las clulas eucariotas
Las instrucciones almacenadas en el ADN se utilizan en un proceso de dos etapas
denominadas transcripcin y traduccin. Durante la transcripcin el ARN se sintetiza en
una reaccin enzimtica que copia informacin a partir del ADN. Durante la traduccin, la
secuencia de bases de las molculas de ARN mensajero resultante se utiliza para determinar
la secuencia de aminocidos de las protenas
Son las protenas particulares sintetizadas por una clula que finalmente determinan la
mayora de las caractersticas estructurales de sta, as como las funciones que realiza
NATURALEZA QUIMICA DEL MATERIAL GENETICO

Friedrich Miescher en 1869 inform sobre el descubrimiento de una sustancia que ahora
conocemos como ADN, justo unos aos antes de que el bilogo celular Walter Flemming
observase por primera vez los cromosomas al microscopio
El descubrimiento del AN por Miescher condujo a propuestas contradictorias sobre la
naturaleza qumica de los genes
Una vez extrados los ncleos con lcali, descubri una sustancia inusual, a la que
denomin nuclena que es en gran medida ADN
El ncleo supone ms del 90% de la masa de una clula espermtica tpica y de que adems
el ADN supone la mayora de la masa de las clulas espermticas
Avery demostr que el ADN es el material gentico de las bacterias
Neumococo: Causa una neumona fatal en animales. Existe en dos formas denominadas
cepa S y Cepa R. Cuando crece en un medio de agar slido la cepa S produce colonias
lisas y brillantes debido al moco. La presencia del polisacrido en la cubierta de la cepa S
protege a la bacteria del ataque del sistema inmune. La cepa R carece de la capacidad para
fabricar la cubierta mucosa y por tanto produce colonias que muestran un lmite rugoso
Desoxirribonucleasa: Enzima que degrada el ADN
ADN es tambin el material gentico de un virus, el bacterifago T2
Hershey y Chase demostraron que el ADN es el material gentico de los virus
Los bacterifagos o fagos son virus que infectan a bacterias
El virus T2 est formado solamente por dos clases de molculas: ADN y protenas
El Virus T2 como la mayora de las protenas contiene azufre pero no fsforo,
mientras que el ADN viral contiene fsforo pero no azufre
Las reglas de Chargaff revelan que A=T y que C=G
Cuatro bases en el ADN Adenina (A), Guanina (G), Citosina (C) y Timina (T)Chargaff descubri que para tosas las muestras de ADN el nmero de adeninas era igual al
nmero de timinas (A=T) y el nmero de guaninas igual al nmero de citosinas (C=G),
esto significaba que el nmero de purinas era igual al nmero de pirimidinas (A+T = C+T)
LA ESTRUCTURA DEL ADN
La estructura tridimensional del ADN fue proporcionada en 1953 por Watson y Crick
Watson y Crick descubrieron que el ADN es una doble hlice

En la doble hlice de Watson y Crick los esqueletos de azcar fosfato de las dos hebras
estn en el exterior de la hlice y las bases miran hacia el interior, hacia el centro de la
hlice formando los escalones de un escalera circular a la que se parece la estructura. La
hlice es dextrgira (la hlice se curva hacia arriba- y hacia la derecha). Contiene diez
pares de nucletidos por vuelta y avanza0.34 nm por cada par de nucletidos.
Consecuentemente cada vuelta completa de la hlice aade 3.4 nm a la longitud de la
molcula. El dimetro de la hlice es de 2 nm
Las dos hebras se sostienen por puentes de hidrgeno entre las bases de hebras opuestas.
Los puentes de hidrgeno se ajustan entre la base de adenina (A) en una de las cadenas y
timina (T) en la otra, o entre la base guanina (G) en una cadena y citosina (C) en la otra.
Las dos cadenas de la doble hlice de ADN son complementarias
La base A en la hebra molde definira la insercin de la base T en la hebra de nueva
formacin, la base G especifica la insercin de la base C, la base T concreta la insercin de
la base A y la base C implicara la insercin de la base G
La forma en la que giran las dos hebras crea un surco mayor y un surco menor. Estos
surcos desempean un papel importante en las interacciones del ADN con varias de
molculas
Si se unen el carbono 5 de un nucletido al carbono 3del siguiente nucletido se dice que
tiene una orientacin 5--3
La hlice dextrgira de Watson y Crick es una versin idealizada de lo que denomina BADN. El B-ADN es indudablemente la forma principal del ADN en las clulas
La roma A-ADN tiene una configuracin en hlice dextrgira que es ms corta y ms
gruesa que la forma B-ADN. La forma A-ADN se puede crear de manera artificial
deshidratando el B-ADN
La forma Z del ADN es una doble hlice levgira. Su nombre deriva del patrn en zigzag
que sigue su esqueleto de azcar fosfato y es ms larga y delgada que la forma B del ADN.
La forma Z del ADN surge con mayor facilidad en aquellas regiones del ADN que
contienen o bien purinas alternando con pirimidinas o bien citosinas metiladas
El ADN puede transformarse en formas relajadas y superenrolladas
En muchas situaciones del AN de doble hlice puede girar sobre s mismo para formar
ADN superenrollado
Molculas de ADN circular se han encontrado en bacterias, mitocondrias y cloroplastos
Una molcula de ADN puede ir hacia atrs o hacia delante entre el estado de
superenrollamiento y el estado de no superenrollamiento o estado relajado

Un trozo de cuerda que consista en dos hebras giran juntas formando una hlice dextrgira,
ste es el equivalente a una molcula de ADN lineal relajada. La cuerda ahora es circular
pero todava est en el estado relajado. Pero si ante de sellar los extremos, se le da a la
cuerda una vuelta extra en la direccin en la cual las hebras estn entrelazadas, la cuerda
entra en un superenrollamiento positivo. En cambio, si antes de sellar los extremos, a la
cuerda se le da una vuelta extra en la direccin opuesta, la cuerda entra en una
superenrollamiento negativo
La interconversin entre la forma relajada y la forma superenrollada del ADN est
catalizada por enzimas denominadas topoisomerasas, que se clasifican en tipo I o en tipo
II. Ambos tipos catalizan la relajacin del ADN superenrollado, pero las enzimas del tipo I
lo hacen introduciendo corte transitorios en una sola hebra del ADN, mientras que las
enzimas tipo II introducen rupturas transitorias en la doble hebra de ADN. Las
topoisomerasas de tipo I y tipo II se utilizan para eliminar superenrollamiento del ADN
Los procariotas tienen una topoisomerasa de tipo II denominada ADN girasa que puede
inducir tanto la relajacin como el superenrollamiento del ADN. La ADN girasa es una de
las enzimas implicadas en la replicacin del ADN. La ADN girasa requiere ATP para
generar el superenrollamiento
Las dos hebras de una doble hlice de ADN se pueden separar por desnaturalizacin y
volver a unirse por renaturalizacin
La doble hlice de ADN se mantienen unidas por enlaces no covalentes relativamente
dbiles
La separacin de las hebras se puede inducir de manera experimental teniendo como
resultado la desnaturalizacin del ADN, el proceso inverso, que restablece una doble
hlice a partir de hebras separadas de ADN, se denomina renaturalizacin del ADN
Una forma de desnaturalizar ADN en el laboratorio es aumentando la temperatura
Temperatura de fusin del ADN (Tm): La temperatura a la cual se alcanza la mitad del
cambio de absorbancia. El valor de la temperatura de fusin refleja la fuerza con la que se
mantiene unida la doble hlice de ADN
El ADN desnaturalizado se puede renaturalizar disminuyendo la temperatura para permitir
el restablecimiento de los puentes de hidrgeno entre las dos hebras
LA ORGANIZACIN DEL ADN EN GENOMA
El genoma de un organismo o de un virus comprende el ADN (o para algunos virus ARN)
que contiene una copia completa de toda la informacin gentica de ese organismo o virus.
Para muchos virus y procariotas, el genoma reside en una nica molcula o en nmero
pequeo de molculas de ADN lineal o circular. Las clulas eucariotas tienen un genoma
nuclear, un genoma mitocondrial y en el caso de plantas y algas, tambin un genoma
cloroplstico. Los genomas de mitocondrias y cloroplastos son molculas sencillas de
ADN, normalmente circular, que se parecen a los de las bacterias. El genoma nuclear

generalmente consiste en mltiples molculas de ADN dispersas en un juego haploide de

cromosomas. Un juego haploide de cromosomas consiste en un representante de cada tipo
de cromosomas, mientras que un juego diploide consiste en dos copias de cada tipo de
cromosoma, una copia de la madre y otra del padre
El tamao del genoma normalmente aumenta con la complejidad del organismo
El tamao del genoma normalmente se expresa como el nmero total de bases nucleotdicas
emparejadas o pares de bases (pb). Kb (Kilobases), Mb (Megabases) y Gb (Gigabases) se
utilizan para referirse a miles, millones o billones de pares de bases
Las enzimas de restriccin cortan las molculas de ADN por sitios especficos
Enzimas de restriccin: Enzimas, aisladas a partir de bacterias, que cortan las molculas
de ADN extrao en sitios especficos. La accin de corte de una enzima de restriccin
genera un grupo especfico de fragmentos de ADN denominados fragmentos de
restriccin
Cada enzima de restriccin rompe ADN de doble cadena slo en aquellos lugares donde
encuentra una secuencia especfica a la que reconoce, denominada sitio de restriccin
Separacin de los fragmentos de restriccin mediante electroforesis en gel
Electroforesis en gel: El mismo mtodo utilizado para separar protenas y polipptidos.
Los pequeos fragmentos de ADN, normalmente se separan en geles de poliacrilamida
Cada enzima de restriccin de forma individual corta el ADN en dos fragmentos indicando
que el ADN slo contiene un sitio de restriccin para cada enzima
Mapa de restriccin: Representa la localizacin de todos los sitios de restriccin en el
ADN original
Existen procedimientos rpidos para secuenciar ADN
Dos mtodos para secuenciar ADN es decir para determinar el orden lineal de las bases en
el ADN
El mtodo de Maxam-Gilbert denominado el mtodo qumico, estaba basado en el uso de
compuestos qumicos (no proteicos) que cortan el ADN de manera proferente en bases
especficas, mientas que el procedimiento de Sanger denominado el mtodo de
terminacin de cadena utiliza dideoxinucletidos (nucletidos a los que les faltan un
grupo hidroxilo en 3) que interfieren con la sntesis enzimtica normal del ADN
Cuando una dideoxinucletido se incorpora en una cadena de ADN en crecimiento, en lugar
de deoxinucletido normal, la sntesis de ADN se detiene antes de tiempo debido a la
ausencia del grupo hidroxilo en 3

Cada vez que se incorpora un dideoxinucletido se detiene la sntesis de ADN para esa
hebra en particular
Para nosotros, como seres humanos, el logro ms importante de la secuenciacin del ADN
es por supuesto el genoma humano. El genoma nuclear humano contiene alrededor de
3.2 billones de bases
El 1 el 2% del genoma humano codifica protenas normalmente
La funcin de la mayora de los genes es producir protenas y estas protenas son las
responsables de la mayora de las funciones celulares
Proteoma la estructura y propiedades de cada protena producida por el genoma
Identificar el enorme nmero de protenas producidas por el genoma ha sido ms fcil por
la espectrometra de masas de alta velocidad, una tcnica extremadamente sensible que
utiliza capos magnticos y elctricos para separar protenas o fragmentos de protenas,
basndose en diferencias de masa y carga
Las bases pueden variar de una persona a otra, creando caractersticas que nos hacen
individuos nicos. Estas variaciones en la secuencia de bases entre individuos se
denominan polimorfismos de un nico nucletido o SNPs
Roy Britten y David Kohne condujeron al descubrimiento de las secuencias repetidas del
ADN
ADN repetidas estn presentes en mltiples copias
ADN no repetido est presente en una sola copia por genoma. En las clulas bacterianas
prcticamente todo el ADN es no repetido
ADN repetido en tndem: Una de las categoras ms importantes de ADN repetido se
denomina ADN repetido en tndem, las mltiples copas se colocan una al lado de la otra
en una fila
Cul es la funcin del ADN repetido de secuencia simple (ADN satlite)?: Podran ser
responsables de proporcionar propiedades fsicas especficas a ciertas regiones del
cromosoma
Centrmeros: desempean un papel importante en la distribucin de los cromosomas
durante la divisin celular
Los telmeros son secuencias de ADN localizadas en los extremos de los cromosomas. Los
telmeros protegen a los cromosomas de la degradacin de sus extremos vulnerables
durante cada ciclo de replicacin. Los telmeros humanos contienen entre 250-1,500 copias
de la secuencia TTAGGG

Huellas genticas de ADN (ADN fingerprint): El ADN para comparar sitios distintos del
genoma de dos o ms individuos. Es una manera de identificar individuos tan precisa como
el estudio de la huella gentica convencional
La enfermedad de Huntington una enfermedad neurolgica devastadora que aparece a
mediana edad y que invariablemente es fatal. El gen de la enfermedad de Huntington
contiene el trinucletido CAG repetido en tndem entre 11 y 34 veces. Son embargo los
genes de los individuos afectados poseen ms de 100 copias de esa unidad repetidas
El sndrome del X frgil causa retraso mental y la distrofia miotnica, que afecta a los
msculos, se encuentran entre las enfermedades neurolgicas que se originan como
consecuencia de la amplificacin de otro triplete de secuencias repetidas
ADN repetido disperso: La segunda categora principal de secuencias de ADN repetido, es
el ADN repetido disperso. Las unidades repetidas de este tipo de ADN estn esparcidas
por todo el genoma
Trasposones: Crean alteraciones genticas de las que se cree que contribuyen a la
adaptabilidad evolutiva del genoma
EMPAQUETAMIENTO DEL ADN
Una clula tpica de E. coli mide alrededor de 1mm de dimetro y 2 mm de longitud
Los procariotas empaquetan el ADN en cromosomas bacterianos en plsmidos
Lo fundamental del genoma bacteriano el cromosoma bacteriano
Cromosomas bacterianos: Generalmente, el cromosoma bacteriano es una molcula de
ADN circular
Nucleoide: No est rodeado por membrana
Se piensa que los bucles se mantienen en su sitio por el ARN y las molculas proteicas
El cromosoma bacteriano consiste en ADN superenrollado unido a pequeas protenas
bsicas y plegado en dominios con bucles
Plsmidos bacterianos: Plsmidos son pequeas molculas de ADN circular que porta
genes tanto para su propia replicacin, como para una o ms funciones celulares
(normalmente funciones no esenciales). La mayora de los plsmidos estn superenrollados.
Los plsmidos se replican de forma autnoma
Los eucariotas empaquetan el ADN en cromatina y cromosomas
Cada cromosoma eucariota contiene una nica molcula de ADN lineal de tamao enorme.
En las clulas humanas slo una de estas molculas de ADN puede tener 10 cm o ms de
largo

Cuando se une a protenas, el ADN se convierte en fibras de cromatina que miden de 10 a

30 nm de dimetro que normalmente estn dispersas en el ncleo. Estas fibras se condensan
y se pliegan en estructuras compactas
La protena que tiene el papel ms comportante en la estructura de la cromatina son las
histonas, un grupo de protenas relativamente pequeas cuyo contenido elevado en
aminocidos lisina y arginina les aporta una fuerte carga positiva
Las histonas se dividen en cinco grupos principales, designados como H1, H2A, H2B, H3
y H4. La cromatina contiene aproximadamente igual nmero de molculas de histonas
H2A, H2B, H3 y H4 y cerca de la mitad de esa cantidad de molculas del tipo H1
Los nucleosomas son la unidad bsica de la estructura de la cromatina
Los nucleosomas se empaquetan para formar fibras de cromatina y cromosomas
La formacin de nucleosomas es slo el primer paso en el empaquetamiento del ADN
nuclear
La histona H1 facilita el empaquetamiento de los nucleosomas en fibras de 30 nm
EL NUCLEO
ADN material gentico de la clula
Genoma un juego completo de instrucciones de ADN para las clulas de una especie en
particular
Cromosoma manera fsica de empaquetar el ADN dentro de las clulas
Ncleo lugar dentro de la clula eucariota donde se localizan y se replican los cromosomas
y donde se trascribe el ADN que contienen. Adems es el almacn de la mayora de la
informacin gentica de la clula. El ncleo es uno de los rasgos ms prominentes y
caractersticos de las clulas eucariotas
La verdadera esencia de una clula eucariota es su ncleo rodeado de membrana
La envuelta membranosa forma los lmites del ncleo
Poros perforan la envuelta
El ncleo est rodeado por una envuelta nuclear de doble membrana
La microscopa electrnica de transmisin revel que el ncleo estaba rodeado por una
envuelta nuclear compuesta por dos membranas la membrana nuclear interna y externaseparadas por el espacio perinuclear que mide alrededor de 20-40 nm de un extremo a
otro. Cada membrana tiene entre 7 y 8 nm de espesor
La membrana nuclear interna se apoya sobre una red de fibras de soporte denominadas
lmina nuclear

La membrana nuclear externa contina con el retculo endoplsmatico proporcionando

continuidad entre el espacio perinuclear y el lumen del RE. Al igual que las membranas del
RE rugoso, la membrana externa est con frecuencia cubierta de ribosomas
Una de las caractersticas ms distintivas de la envuelta nuclear es la presencia de aperturas
especializadas denominadas los poros nucleares. Cada poro es un canal cilndrico pequeo
que se extiende a travs de ambas membranas de la envuelta nuclear proporcionando as
continuidad entre el citosol y el nucleoplasma el espacio interior del ncleo (aparte de la
regin del nuclolo)
En cada poro, las membranas interna y externa de la envuelta nuclear se fusionan,
formando un canal que est alineado con una estructura proteica intrincada denominada el
complejo del poro nuclear (CPN). El dimetro del complejo de poro en su conjunto es de
unos 120 nm
Transportador mueve macromolculas a travs de la envuelta nuclear
Las molculas entran y salen del ncleo a travs de los poros nucleares
Orgnulos ribosomas, mitocondrias, lisosomas y microtbulos
La envuelta nuclear protege a los ARNs (cidos ribonucleicos) recin sintetizados de la
actuacin de los orgnulos citoplasmticos y de la enzimas antes de que se haya procesado
por completo
Todas las enzimas y otras protenas requeridas para la replicacin y trascripcin del ADN
en el ncleo, se deben importar desde el citoplasma y todas las molculas de ARN y los
ribosomas parcialmente ensamblados que se necesitan para la sntesis proteica en el
citoplasma se deben obtener del ncleo
Canales de difusin acuosos se mueven libremente las partculas y molculas pequeas,
tienen unos 9 nm de dimetro. Son una barrera de permeabilidad para molculas con un
peso molecular significativamente mayor de 20,000 daltons
Seales de localizacin nuclear (SLN): Son secuencias de aminocidos que permiten que
la protena sea reconocida y trasportada por el complejo de porno nuclear. Una SLN tiene
normalmente una longitud de 8 a 30 aminocidos
Importina se une a la SLN y media el movimiento de la protena que contiene la SLN
hacia el poro nuclear
Seales de exportacin nuclear(SEN): Dirigen a la protena y por extensin al ARN que
lleva unido, para exportarlo a travs de los poros nucleares. Las secuencias SEN se
reconocen por protenas receptoras del transporte nuclear denominadas exportinas que se
unen a molculas que contienen secuencias SEN y median su trasporte hacia el exterior
La matriz nuclear y la lmina nuclear son estructuras de soporte del ncleo

Entre el 80 y 90% de la masa nuclear est constituida por fibras de cromatina

Matriz nuclear o nucleoesqueleto: Ayuda a mantener la forma del ncleo y proporcionaba
un esqueleto organizador para las fibras de cromatina
Lmina nuclear: Red de fibras densa y fina que limita la superficie interna de la
membrana nuclear interna y que ayuda a sostener a la envuelta nuclear. La lmina nuclear
tiene un espesor de entre 10 y 40 nm y est constituida con filamentos intermedios
fabricados por protenas denominadas lminas
El nuclolo est implicado en la formacin de los ribosomas
Nuclolo la fbrica de ribosomas de la clula, el nuclolo est implicado en la produccin
de ribosomas
Regin organizadora del nuclolo un tramo de ADN que lleva copias mltiples de los
genes para ARNr, el genoma humano tiene cinco regiones organizadoras del nuclolo por
cromosoma haploide o diez por ncleo diploide