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Tema 5
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Tema 5.
Neutros o apolares
Polares sin carga
Polares con carga negativa
Polares con carga positiva
Neutros o Apolares. Son 8 los aminocidos que se clasifican como poseedores de cadenas
laterales no polares. La alanina, valina, leucina e isoleucina, poseen cadenas laterales de
hidrocarburos alifticos. La metionina posee una cadena lateral de ter tilico (C-S-C). La
prolina es el nico aminocido cclico, pues el grupo -R se cierra sobre el N del grupo amino (realmente es un amina secundaria). Por su parte, la fenilalanina y el triptfano
contienen grupos aromticos.
Polares sin carga. Siete son los -aminocidos cuyo resto -R es polar pero sin carga. La
glicina posee la cadena ms simple, un tomo de hidrgeno. La serina y la treonina son
portadores de un grupo hidroxilo (-OH). La asparragina y la glutamina, poseen cadenas
laterales portadoras de un grupo amida, y por hidrlisis dan lugar, respectivamente, a
aspartato y glutamato, dos aminocidos con carga negativa. La tirosina posee un grupo
fenlico y la cistena debe su polaridad a la presencia de un grupo tilico (-SH).
Polares con carga negativa. Existen dos -aminocidos cuyo resto polar posee carga
negativa a pH fisiolgico, debida a la presencia de un grupo carboxilo (-COOH), el cido
glutmico y el cido asprtico.
Polares con carga positiva. Tres son los -aminocidos que poseen restos -R cargados
positivamente a pH fisiolgico. La lisina posee una cadena lateral de butilamonio, la
arginina presenta un grupo -R de guanidina y la histidina es portadora de un grupo -R de
imidazolio.
En resumen:
Neutros polares, polares o hidrfilos: Serina (Ser, S), Treonina (Thr, T), Cistena (Cys, C),
Asparagina (Asn, N), Glutamina (Gln, Q) y Tirosina (Tyr, Y).
Neutros no polares, apolares o hidrfobos: Glicina (Gly, G), Alanina (Ala, A), Valina (Val,
V), Leucina (Leu, L), Isoleucina (Ile, I), Metionina (Met, M), Prolina (Pro, P), Fenilalanina
(Phe, F) y Triptfano (Trp, W).
Con carga negativa, o cidos: cido asprtico (Asp, D) y cido glutmico (Glu, E).
Con carga positiva, o bsicos: Lisina (Lys, K), Arginina (Arg, R) e Histidina (His, H).
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Aromticos: Fenilalanina (Phe, F), Tirosina (Tyr, Y) y Triptfano (Trp, W) (ya incluidos en los
grupos neutros polares y neutros no polares).
Esta clasificacin se ha realizado en base al grupo -R, pero es importante indicar que a pH
fisiolgico (pH 7,3), el grupo -amino se encuentra cargado positivamente y el grupo -carboxilo
lo est negativamente, por esta razn estos grupos aparecen siempre cargados.
Dentro del conjunto de los aminocidos naturales, existen unos que pueden ser sintetizados
por las clulas humanas a partir de otras sustancias, pero tambin hay aminocidos que deben de
ingerirse con el alimento, ya que algunos animales, incluidos los humanos, no pueden sintetizarlos
o, cuando menos, no en cantidad suficiente para satisfacer la demanda del organismo; se conocen
con el nombre de aminocidos esenciales y son valina, leucina, isoleucina, treonina, metionina,
fenilalanina, triptfano y lisina.
2. Propiedades cido-base de los aminocidos y los pptidos
El pH del medio en el que se encuentre el aminocido es esencial para determinar sus
propiedades cido-base, aspecto importante pues de ello dependen las propiedades qumicas y la
funcionalidad biolgica de los pptidos y protenas que forman.
Las propiedades cido-base de un aminocido vienen determinadas por los grupos
protonables que posea. Un aminocido puede actuar bien como cido o como base (sustancias
anfteras), pudiendo tener hasta tres grupos con carcter cido-base: el -amino, el -carboxilo y,
en algunos casos, el resto -R. Lo importante es que estos grupos poseen un carcter cido-base
dbil, lo que hace que, dependiendo del pH, el correspondiente equilibrio pueda desplazarse en
un sentido o en otro (hacia la forma protonada o hacia la forma desprotonada).
La expresin que regula la proporcin entre las formas protonada y desprotonada es la
siguiente:
pH = pK a + log
DP
P
COO
NH3
CH
CH
CH3
CH3
Si se consideran los grupos por separado, a continuacin se detalla como les afectara a cada
uno el pH.
El grupo -amino presentara dos formas, una protonada (P) y cargada positivamente (NH3+), y otra desprotonada (DP) y sin carga (-NH2), segn el siguiente equilibrio:
NH 3+ NH 2 + H +
donde el pK a (= log K a ) 8
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COOH COO + H +
donde el pK a (= log K a ) 2
En funcin del pH, la proporcin de forma protonada (con carga 0) o forma desprotonada
(con carga -1) variar, respetando siempre la constante de ionizacin del grupo en cuestin si la
temperatura se mantiene constante.
Si dicho aminocido se encuentra en una solucin a pH 1; en estas condiciones de elevada
concentracin de protones en el medio ambos equilibrios estaran desplazados en un 100 % hacia
las formas protonadas. Si aumentamos el pH los equilibrios comenzaran a desplazarse hacia la
derecha hasta llegar a un pH muy bsico, momento en el que las formas dominantes (al 100 %)
seran las desprotonadas.
Pero, qu ocurre a pHs intermedios?. Para ello se debe de tener en cuenta la Ka para cada
equilibrio, o mejor dicho su pKa (que sera el logKa, que es el logaritmo negativo de la constante
de disociacin de un cido dbil). El grupo -amino de la valina tiene un pK de 8, y esto quiere
decir que a pH 8 el 50 % de los grupos amino estarn protonados (de 100 molculas de valina, 50
tendrn el grupo amino protonado y 50 lo tendrn desprotonado, al menos tericamente, segn se
desprende de la constante de ionizacin). Por su parte el grupo -carboxilo de la valina, que tiene
un pK de 2, estar protonado al 50 % cuando el pH del medio sea 2.
En general se asumen las siguientes consideraciones, para determinar el porcentaje de
protonacin de un grupo ionizable en un aminocido:
Si el pH < pK-1 el grupo esta al 100 % protonado
Si el pH > pK+1 el grupo est al 100 % desprotonado
Si el pH = pK el grupo est al 50 % protonado
Existe un pH al cual la carga neta del aminocido es cero (si se coloca en un campo elctrico
no se desplazar hacia ninguno de los polos, esta tcnica se llama isoelectroenfoque). El pH al cul
un aminocido posee carga neta cero recibe el nombre de punto isoelctrico (pI), que es la media
aritmtica de los valores de pK1 y pK2 que delimitan la forma con carga cero.
3. El enlace peptdico
Los aminocidos se encuentran unidos en los pptidos y las protenas mediante un enlace
amida (-CO-NH-):
Este enlace se forma por reaccin entre el grupo -COOH de un aminocido y el -amino
del siguiente (con prdida de una molcula de agua) y recibe el nombre de enlace peptdico.
Entre los aos 1930-1940, Pauling y Corey, mediante el estudio de Rayos X de cristales de
aminocidos, dipptidos y triptidos, dilucidaron la estructura tridimensional del enlace peptdico.
As, descubrieron que la unin C-N del enlace peptdico era ms corta que en la mayor parte de
los dems enlaces C-N y llegaron a la conclusin de que el enlace deba tener algn carcter de
doble enlace, por la aparicin de dos formas resonantes:
Dedujeron que los 4 tomos que rodeaban al enlace peptdico C-N (O, C, C, H) estaban
situados en el mismo plano, de tal manera que el oxgeno del grupo carbonilo y el hidrgeno del
N-H estaran en posicin trans. Esta ordenacin es rgida, y es el resultado de la estabilizacin por
resonancia de las formas anteriormente citadas.
Partiendo de estos dos hechos, puede describirse el armazn de una cadena polipeptdica
como constituido por una serie de planos, con posibilidad de giro en los C. De esta forma
podemos escribir la estructura de un pptido como una sucesin de planos en la que los grupos -R
se van alternando.
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4. Secuenciacin de un pptido
La secuencia de un pptido tiene gran importancia porque entre otras cosas condiciona los
siguientes niveles estructurales. La insulina bovina fue la primera protena que se secuenci
completamente por Sanger en 1953, lo que le vali el premio Nobel. La determinacin de la
secuencia de la insulina fue el resultado del trabajo de muchos cientficos durante 10 aos, desde
entonces se han secuenciado miles de protenas.
La secuencia de un pptido, si conocemos el gen del que proviene, puede secuenciarse
indirectamente, secuenciando dicho gen. Pero tambin puede hacerse la secuenciacin qumica
directa.
Los pasos a seguir son:
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Funcin
Estructural
Enzimtica
Hormonal
Insulina y glucagn
Hormona del crecimiento
Calcitonina
Hormonas tropas
Defensiva
Inmunoglobulina
Trombina y fibringeno
Transporte
Hemoglobina
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Hemocianina
Citocromos
Contrctil
Reserva
En la Hlice-
la cadena polipeptdica adopta una conformacin helicoidal. Las estructuras
helicoidales se caracterizan por el numero de aminocidos por vuelta (n) (3,6 restos en la
Hlice-) y por su paso de rosca (p), o distancia entre vueltas (5,4 para la Hlice-). Esta
conformacin se estabiliza por puentes de hidrgeno (R-C=O H-N-R) intracatenarios
(dentro de la hlice). Adems, los restos -R de los aminocidos se disponen hacia fuera de
la hlice evitando las interacciones estricas (por grupos voluminosos) y estabilizando la
conformacin. Por otro lado, la hlice- se distorsiona o pierde la conformacin cuando en
la secuencia aparece una prolina, nico aminocido ciclado por su grupo -amino.
En la conformacin- la cadena adopta una ordenacin lineal en la que los restos -R, de los
aminocidos, se van alternando por encima y por debajo (zig-zag) del plano del enlace
peptdico. Esta conformacin se estabiliza con puentes de hidrgeno entre varias cadenas
de protenas con conformacin-. El resultado de estas interacciones es la hoja plegada ,
que puede presentar un plegamiento paralelo, (en el que las cadenas vecinas se desarrollan
en la misma direccin), o bien un plegamiento antiparalelo con cadenas vecinas en
direcciones opuestas.
Aunque las dos conformaciones (hlice- y hoja plegada-) son posibles dentro de una
misma protena (como se ver en la estructura terciaria), existen tambin protenas que presentan
slo una de las dos.
La -queratina es una protena que aparece en todos los vertebrados superiores y es el
componente principal del pelo, la lana, las uas o los cuernos. El pelo est construido por clulas
muertas, cada una de las cuales contiene macrofibrillas empaquetadas que se orientan
paralelamente a la fibra del pelo. stas estn formadas por microfifrillas, que es una asociacin de
protofibrillas que continen dos cadenas de hlice- que se retuercen en un arrollamiento hacia la
izquierda. Las -queratinas poseen un alto contenido de Cys (R= -CH2-SH) de tal manera que las
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interacciones entre las hebras se producen a travs de puentes disulfuro (-S-S-) dando una gran
resistencia e insolubilidad al conjunto. Aunque la insolubilidad de las -queratinas impide que la
mayor parte de los animales la puedan digerir, la polilla, posee una concentracin elevada de
mercaptanos, que rompen los puentes disulfuro, en su tracto digestivo, y por lo tanto pueden
digerir la lana.
Por su parte, la fibrona de la seda es una agrupacin de -queratinas en conformacin hoja
plegada- antiparalela unidas por enlaces de hidrgeno intracatenarios. La fibroina y otras queratinas son muy ricas en aminocidos poco voluminosos (gly y ala), lo que facilita que las hojas
se apilen unas sobre otras, de tal modo que se alternan zonas de contacto entre glicinas y zonas de
contacto entre alaninas, interaccionando mediante fuerzas dbiles de van der Waals. Este hecho
hace posible que la seda pueda extenderse en fibras fcilmente separables (separando hojas) pero
relativamente difciles de romper (implicara romper los enlaces peptdicos).
Por otro lado, existe la posibilidad de transformar la -queratina en -queratina. As, cuando
el pelo o la lana se someten a la accin del vapor (calor + humedad) pueden incluso duplicar su
longitud. Lo que ocurre es que se rompen los puentes de hidrgeno de la hlice- y las cadenas
polipeptdicas adoptan una conformacin-; no obstante los grupos -R de las -queratinas son muy
voluminosos, lo que hace que la conformacin- se desestabilice y al poco tiempo adopte de
nuevo la conformacin en -hlice con lo que el pelo o la lana recuperan su longitud original.
c) Estructura terciaria: hace referencia al modo en que se curvan o pliegan en el espacio los
segmentos de hlice- y/o conformacin-, que presenta una cadena polipeptdica de los protenas
globulares. La conformacin espacial de las protenas depende lgicamente de su estructura
primaria, as las cadenas laterales de los aminocidos en las protenas globulares se hallan
distribuidas espacialmente de acuerdo con sus polaridades, de tal forma que:
Los restos no polares aparecen, casi siempre, en el interior de la protena, para no
entrar en contacto con el disolvente acuoso que la envuelve, creando un ambiente
hidrofbico.
Los residuos polares con carga se hallan situados, normalmente en la zona externa,
interaccionando con el medio acuoso. A veces, se requiere de estos centros en la parte
interna de la protena y en estos casos tambin ocurre que estn directamente
implicados en alguna funcionalidad de la protena, bien a nivel estructural o bien a
nivel cataltico.
Los grupos polares sin carga, aparecen distribuidos por la totalidad de la cadena, si
bien mayoritariamente, tambin aparecen en las partes externas, en contacto con la
disolucin acuosa.
Como consecuencia de esta distribucin de restos, las protenas globulares son muy
compactas, hay poco espacio en el interior, de modo que el agua difcilmente accede a dicho
espacio.
Algunas protenas, como le ocurre a la mioglobina estn constituidas solo por hlices-. La
estructura terciaria de la mioglobina, se trata de una protena globular que contiene una sola
cadena polipeptdica, constituida por ocho segmentos de hlice- . La mioglobina se halla,
principalmente, en las clulas de los msculos esquelticos y es especialmente abundante en los
mamferos buceadores, en los que no slo acta almacenando oxgeno, sino tambin
contribuyendo al aumento de la velocidad de difusin del oxgeno. La protena, adems, contiene
un componente no proteico, el grupo hemo que permite la oxigenacin y desoxigenacin de
forma reversible.
d) Estructura cuaternaria: Muchas protenas globulares son oligomricas, es decir estn
formadas por ms de una subunidad polipeptdica. La posicin espacial que ocupa cada una de
estas subunidades respecto a las otras queda determinada por la estructura cuaternaria. La
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estructura cuaternaria de la hemoglobina (Hb) estara formada por cuatro subunidades (iguales dos
a dos) cada una con su grupo hemo, necesario para el transporte de oxgeno.
Existen varias mutaciones de las molculas de Hb, en las que la secuencia de
aminocidos difiere un poco de la secuencia de la Hb normal (conocida como HbA). La mayora
de estas mutaciones son inofensivas, pero algunas causan graves enfermedades, como es el caso de
la Hb de las clulas falciformes (HbS).
La diferencia entre la HbA y la HbS radica slo en que en la secuencia una molcula de
ac. glutmico (polar con carga) es sustituida por una Valina (apolar). Este pequeo cambio (1 de los
146 aas de las cadenas- ) tiene un profundo efecto sobre el resto de niveles estructurales. Esto
hace que las molculas se agreguen y precipiten en las clulas. Como consecuencia, los glbulos
rojos (normalmente con forma de disco) adoptan una forma de media luna, obstruyendo los
capilares ms delgados, restringiendo el flujo sanguneo y provocando entre otras complicaciones
dolores severos y sudoracin.
7. Las enzimas
La vida depende de la existencia de unos catalizadores muy potentes y altamente
especficos denominados enzimas. De hecho, todos los pasos de todos los procesos metablicos
estn catalizados por enzimas y la capacidad cataltica se considera, junto con la capacidad de
autorreplicacin, una de las caractersticas fundamentales de la vida. Con la excepcin de un
pequeo grupo de molculas de RNA cataltico (los ribozimas), todas las enzimas conocidas son
protenas.
El nombre de enzima ("en la levadura") no se emple hasta 1877, pero mucho antes ya se
sospechaba que ciertos catalizadores biolgicos intervenan en muchos procesos. As en 1850,
Louis Pasteur concluy que la fermentacin de azcar en alcohol por levaduras estaba catalizada
por lo que llam fermentos, que l consideraba inseparable de las clulas de levadura vivas. En
1897, Bchner, consigui extraer las enzimas que catalizaban la fermentacin alcohlica de las
clulas de levadura, terminando as con la teora vitalista. No obstante hubo que esperar hasta
1926, cuando Sumner consigui purificar y cristalizar por primera vez una enzima, la ureasa, para
demostrar su naturaleza proteica. En la actualidad se conocen ms de 2000 enzimas diferentes,
muchas de las cuales se han aislado en forma pura. Se utilizan potentes tcnicas de purificacin y
secuenciacin, tcnicas de difraccin de rayos X, RMN, etc., para conocer su estructura, y tcnicas
de mutagnesis dirigida para conocer ms sobre su funcionalidad y sus mecanismos de actuacin.
8. Las enzimas como catalizadores
La funcin principal de las enzimas es actuar como catalizadores de las reacciones de los
seres vivos; como tales catalizadores tienen ciertas caractersticas que se van a estudiar a
continuacin. Todas las reacciones qumicas tienen lugar porque cierta fraccin de la poblacin de
molculas reactantes poseen la suficiente energa como para alcanzar un estado activado, llamado
estado de transicin, en el que es muy elevada la probabilidad de que se rompan o se establezcan
enlaces para formar los productos. Este estado de transicin reside en la cima de la barrera
energtica que separa los reactantes de los productos. En ella se observa el diagrama de energa
para una reaccin qumica, no catalizada y catalizada, donde la energa libre de activacin es la
cantidad de energa necesaria para llevar todas las molculas de un mol de sustancia, a una
temperatura determinada, al estado de transicin.
Existen dos mtodos generales mediante los cuales puede acelerarse la velocidad de una
reaccin qumica. Uno de ellos es la elevacin de la temperatura (ya que provoca un incremento
en la velocidad de las molculas); el otro consiste en utilizar un catalizador. El catalizador se
combina con los reactantes de modo transitorio activndolos, produciendo un estado de transicin
de menor energa que en la reaccin no catalizada. Una vez formados los productos el catalizador
queda libre, y puede ser de nuevo utilizado.
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protena restante, que por s misma es inactiva catalticamente, se designa con el nombre de
apoenzima.
En las enzimas el cofactor puede actuar como centro cataltico primario, grupo puente
para reunir el sustrato y la enzima agente estabilizante de la actividad enzimtica (conformacin).
Por su parte cada uno de los coenzimas catalogados suele contener en su estructura,
alguna vitamina (sustancias orgnicas que, en cantidades mnimas, son vitales para el
funcionamiento de todas las clulas, y deben figurar en la dieta de algunas especies) o molcula
derivada de ella. Los coenzimas actan por lo general como transportadores intermedios de
tomos especficos o de electrones.
11. Modelos de actuacin de las enzimas
Para explicar la actividad cataltica de las enzimas, se ha propuesto un mecanismo general,
en dos etapas:
S + E
ES
P + E
En la primera etapa, la enzima (E) se une a la molcula de sustrato (S), para formar el
complejo enzima-sustrato (ES). En una segunda etapa, el complejo se fragmenta dando lugar al
producto (P) y a la enzima (E), que vuelve a estar disponible para reaccionar con otra molcula de
sustrato. Por lo general, la molcula de enzima es mucho mayor que la del sustrato por lo que slo
una pequea parte de la enzima est implicada en la formacin del complejo; esta regin que
interacciona con el sustrato y en la que tiene lugar la reaccin, se denomina centro activo de la
enzima. El centro activo es una regin tridimensional de la enzima con una distribucin de los
grupos nica para posibilitar la unin a su sustrato especfico. Dichos grupos del enzima no tienen
por qu ser necesariamente consecutivos en la secuencia de la protena y reciben el nombre de
centros catalticos.
El modelo ms conocido sobre el mecanismo de reaccin de las enzimas es el de Fischer,
quien propuso que la molcula de sustrato se adapta al centro activo de la enzima del mismo
modo que lo hara una llave al encajar en una cerradura, es decir, que tienen una relacin
estructural complementaria. No obstante, esta hiptesis tiene ciertas limitaciones: si el centro
activo posee una estructura prediseada para el sustrato, en caso de que sea reversible el proceso
dicho debera estar perfectamente diseado para que tambin encaje el producto de la reaccin.
De la misma forma, la teora de la llave-cerradura tampoco explica bien el fenmeno de la
inhibicin enzimtica.
Otra hiptesis ms aceptada actualmente es la del enzima flexible o de ajuste inducido
(modelo de Koshland), que sugiere que el sitio activo no necesita ser una cavidad geomtricamente
rgida y preexistente, sino que dicho sitio activo debe tener una disposicin espacial, precisa y
especfica, de ciertos grupos de la enzima que en presencia del sustrato se adaptan a su estructura
cuando interaccionan con l.
Independientemente del modelo, una vez formado el complejo enzima sustrato, mediante un
mecanismo de distorsin, se activan los enlaces que hay que romper y se aproximan los grupos
que hay que enlazar, favoreciendo la formacin del producto resultante de la reaccin catalizada y
quedando la enzima libre para comenzar de nuevo el proceso cataltico. En el caso de una enzima
carboxipeptidasa, que puede usarse para ilustrar el modelo de Koshland, en ella se puede ver
como en el sitio activo, en el que se encuentran los centros catalticos (Arg-145, Glu-270, tyr-248)
y el cofactor (Zn), posee una conformacin inicial que se modifica al interaccionar con el sustrato y
formal el complejo [ES].
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Los trminos Vmax (velocidad mxima) y Km (constante de Michaelis) son dos parmetros
cinticos caractersticos de cada enzima, que pueden determinarse experimentalmente. La
velocidad mxima se obtiene cuando la velocidad de reaccin se hace independiente de la
concentracin de sustrato. Este valor depende de la cantidad de enzima presente en la reaccin. La
Km nos indica la concentracin de sustrato a la cul la velocidad de reaccin es la mitad de la
velocidad mxima, este parmetro es independiente de la concentracin de enzima, y es
caracterstico de cada enzima segn el sustrato utilizado (si tiene varios). La Km tambin indica la
afinidad que posee la enzima por el sustrato, siendo sta mayor, cuanto menor es la Km. Cuanto
menor sea la Km menor ser la cantidad de sustrato necesaria para alcanzar la mitad de la velocidad
mxima, por lo que mayor ser la afinidad del enzima hacia ese sustrato.
A partir de la ecuacin de Michaelis-Menten se puede explicar matemticamente las tres
fases de la curva de Michaelis.
A baja [S] (es decir, si Km >>> [S]) el trmino Km+[S] podemos aproximarlo a la
Km, quedando un expresin del tipo: V = k [S]. Esta es una cintica de primer
orden, que se caracteriza por una variacin lineal de la V respecto al tiempo.
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A altas [S] (es decir, Km<<<<[S]) despreciaramos Km frente a [S], con lo que V =
Vmax (que sera constante); la cintica es de orden cero y se habra alcanzado la
saturacin por sustrato.
El tramo intermedio, en el que la [S] Km correspondiente a una cintica de orden
mixto y se ajusta a la ecuacin de Michaelis.
En muchos casos es de vital importancia conocer estos parmetros cinticos. En principio,
podran obtenerse de forma poco rigurosa a partir de la curva de Michaelis Menten, pero existen
mtodos grficos ms fiables que facilitan el clculo preciso de la Km y la Vmax. Los clculos se
hacen en base a transformaciones matemticas de la ecuacin de Michaelis; una de las expresiones
ms utilizadas es la representacin de Lineweaver-Burk, tambin conocida como de dobles
inversos. En esta forma de clculo se representa 1/V frente a 1/S, obtenindose una recta cuya
interseccin con el eje X es 1/Km y con el eje Y es 1/Vmax, siendo la pendiente Km/Vmax.
13. Inhibicin enzimtica
Existen sustancias que pueden impedir que la enzima desarrolle su actividad cataltica,
ralentizando o paralizando la reaccin enzimtica. A estas sustancias se las denomina inhibidores
enzimticos. Teniendo en cuenta que las reacciones qumicas en la clula estn catalizadas por
enzimas, es fcil intuir el papel de muchos inhibidores enzimticos que actan como frmacos,
antibiticos o conservantes; otros pueden ser txicos, potentes venenos. Por ejemplo, la aspirina
(acetilsalicilato) inhibe la enzima que cataliza el primer paso en la sntesis de prostaglandinas,
implicadas en la produccin del dolor.
Se conocen dos tipos principales de inhibicin: la reversible y a la irreversible. La primera
implica una unin no covalente del inhibidor y, por lo tanto, siempre puede revertirse. En la
inhibicin irreversible, el inhibidor se une al enzima de forma covalente y permanente.
Inhibicin reversible: los distintos modelos de inhibicin reversible implican en todos los
casos la unin no covalente del inhibidor con la enzima, pero difieren en los mecanismos por
medio de los cuales reducen la actividad enzimtica y en la forma en que afectan a la cintica de la
reaccin. Entre ellos estn la inhibicin competitiva, la acompetitiva y la no competitiva.
El inhibidor competitivo, es una sustancia similar en estructura al sustrato, con quien
compite por el sitio activo de la enzima.
Como consecuencia, aunque la velocidad mxima no se altera, para alcanzarla sera
necesario poner ms cantidad de sustrato en el medio de reaccin, lo que se refleja en la
correspondiente curva de Michaelis como un aparente aumento de la Km (la enzima en
presencia del inhibidor perdera afinidad por el sustrato).
La eficacia de un inhibidor competitivo depende de su concentracin respecto a la del
sustrato. Si hay un exceso de inhibidor ste bloquear los centros activos de las molculas
de enzima, resultando una inhibicin total. No obstante, el proceso es reversible si se
procura exceso de sustrato, que desplazara totalmente al inhibidor.
El inhibidor acompetitivo reacciona con la enzima en un punto distinto al centro activo,
pero slo en el caso de que sta est unida al sustrato formando el complejo ES; de esta
forma impide que la enzima desarrolle su actividad cataltica. Tanto la Vmax como la Km
se alteran en la misma proporcin. Se observa cmo se produce, aparentemente, una
disminucin de la Vmax y un incremento de la Km.
El inhibidor no competitivo puede combinarse tanto con la enzima libre como con el
complejo enzima-sustrato, sin afectar al sitio activo de la enzima. Al no unirse el inhibidor
al sitio activo, no se afecta la afinidad de la enzima por el sustrato y en este caso la Km no
se altera y la Vmax disminuye.
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Nivel de sntesis: que haya ms o menos molculas de la enzima (Se puede regular a nivel
de traduccin de protenas).
Nivel de actividad: que las molculas de enzima existentes estn ms o menos activas.
Puede llevarse a cabo por factores extrnsecos a la enzima, pH, T, [S], [I], o por factores
intrnsecos a la propia enzima; en este caso se conocen como enzimas reguladoras,
enzimas que por su propia naturaleza tienen mecanismos especiales de regulacin. Estn
especializadas en regularse respondiendo de forma muy sensible a seales externas.
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En la clula las enzimas operan en grupo, en rutas constituidas por varios pasos
enzimticos. En cada ruta hay al menos una enzima reguladora que determina la velocidad de
toda la ruta. La modulacin de las enzimas reguladoras ocurre mediante diferentes
mecanismos:
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Pan. En la industria panadera se utiliza la lipoxidasa, una enzima que acta como
blanqueador de la harina y contribuye a formar una masa ms blanda, mejorando su
comportamiento en el amasado. Generalmente se la aade como harina de soja o de otras
leguminosas, que la contienen en abundancia. Tambin es utilizada la amilasa que degrada
el almidn a azcares ms sencillos que pueden ser utilizados por las levaduras en la
fabricacin del pan. Tambin se emplean proteasas para romper la estructura del gluten y
mejorar la plasticidad de la masa, principalmente en la fabricacin de bizcochos.
Cerveza. Al igual que en la fabricacin del pan el uso de amilasas que degradan el
almidn, presentes en la malta, es fundamental en la fabricacin de la cerveza. Tambin se
emplea la enzima papana para fragmentar las protenas presentes en la cerveza y evitar
que sta se enturbie durante el almacenamiento o la refrigeracin.
Vinos. Uno de los problemas que se pueden presentar en la fabricacin de vinos es la
presencia del hongo Botrytis cinerea que produce beta-glucanos, un polmero de glucosa
que pasa al vino y entorpece su clarificacin y filtrado. Este problema se soluciona
aadiendo enzimas con actividad beta-glucanasa que lo degradan. Tambin se utilizan
enzimas para mejorar el aroma, las cuales liberan los terpenos de la uva, dndole un mejor
bouquet al vino.
Jugos concentrados. A veces la pulpa de las frutas y restos de semillas hacen que los jugos
concentrados sean turbios y demasiado viscosos, lo que ocasiona problemas en la
extraccin y la concentracin. Este efecto se debe a la presencia de pectinas, que pueden
degradarse por la accin de enzimas pectinasas presentes en el propio jugo o bien
obtenidas y aadidas de fuentes externas.
La siguiente tabla resume algunos ejemplos de enzimas que se emplean en diferentes procesos de
la industria alimenticia:
INDUSTRIA ENZIMAS
USOS
Lctea
Tripsina.
Lactasa
Quesera
Quimosina
(renina)
Lactasa
Lipasa
Helados
Lactasa
Glucosaisomerasa
Crnicas
Amilasa
Proteasa
Panificacin
Lipoxidasa
Lactasa
Cervecera
Amilasas
Papana,
Pepsina
Vinificacin
Pectinasas
Mejoran la clarificacin y extraccin de jugos.
Glucosa-oxidasa Evitan el oscurecimiento y los sabores desagradables.
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Tema 5
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Tema 5.
-Bioqumica. .2002. Christopher K. Mathews, K. E. Van Holde, Kevin G. Ahern. Addison Wesley.
Recomendado. (ref. en Biblioteca de la UAL: 577-MAT-bio).
-Lehninger Principios de Bioqumica. 2009. David L. Nelson y Michael M. Cox. Omega.
Recursos web
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