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DORLANS
COLE DOCTORALE SCIENCES DE LHOMME ET DE LA SOCIT
LABORATOIRE CEDETE
THSE
prsente par :
Sommaire
________________________________________________________________________________________________________________
SOMMAIRE
LISTE DES ABREVIATIONS _____________________________________________________________ 3
DEDICACE ____________________________________________________________________________ 5
REMERCIEMENTS _____________________________________________________________________ 6
INTRODUCTION GENERALE ____________________________________________________________ 9
PREMIERE PARTIE : __________________________________________________________________ 15
CADRAGE THEMATIQUE, DEMARCHE SCIENTIFIQUE ET METHODE ______________________ 15
CHAPITRE I : ETAT DE LART, DEFINITION DU CHAMP CONCEPTUEL ET POSITIONNEMENT
SCIENTIFIQUE _______________________________________________________________________ 17
CHAPITRE II : BIO-ECOLOGIE DAAn. gambiae AU BURKINA FASO : UNE RELATION A
FORMALISER ________________________________________________________________________ 40
CHAPITRE III : APPROCHE METHODOLOGIQUE DE LETUDE _____________________________ 68
DEUXIEME PARTIE ___________________________________________________________________ 96
STRUCTURATION DES DONNEES, ELABORATION ET EVALUATION DES MODELES ________ 96
CHAPITRE IV : ORGANISATION ET STRUCTURATION DE LA BASE DE DONNEES ___________ 98
CHAPITRE V : DISTRIBUTION SPATIALE DES MEMBRES DU COMPLEXE An. gambiae :
STRUCTURES GLOBALES ET CONFIGURATIONS LOCALES ______________________________ 123
CHAPITRE VI : MODELISATION DE LA DISTRIBUTION SPATIALE ________________________ 156
CONCLUSION GENERALE ____________________________________________________________ 181
ANNEXES __________________________________________________________________________ 191
ANNEXE 1 : METHODES DE COLLECTE DES MOUSTIQUES SUR LE TERRAIN ______________ 192
ANNEXE 2 : IDENTIFICATION DES FORMES MOLECULAIRES ____________________________ 194
LISTE DES FIGURES _________________________________________________________________ 199
LISTE DES TABLEAUX _______________________________________________________________ 202
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
ACP
ADN
Acide Dsoxyribonuclique
ANCOVA
Analyse de Covariance
ARN
Acide Ribonuclique
AVHRR
BDOT
BNDT
CEDETE
CIT
Convergence Intertropicale
CNRFP
CRDI
CTA
DDT
Dichorodiphnyltrichlorothane
ESRI
ETM+,
ETP
Evapotranspiration
FAO
FIT
Front intertropical
GIS
GPS
IBC
IDW
INSD
IRD
ISO
LISA
LIV
LocClim
Local Climate
LPI
MCD
MCT
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MTI
NDVI
NIH
NOAA
OCEAC
OMD
OMS
PCIME
PCR
PNLP
RBF
SIG
SNIS
SPOT
TM
Thematic Mapper
TPI
USGS
UTM
WHO
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Ddicace
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DEDICACE
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Remerciements
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REMERCIEMENTS
Nous arrivons tous dans ce monde dans les mains des Hommes et nous dpendons des Hommes
pendant les premires annes de notre vie. Quand nous quittons ce monde, cest encore les
Hommes qui soccupent de la gestion de notre dpouille mortelle. Nul succs nest donc possible
sans la contribution des Hommes et nul mrite ne peut senvisager en dehors des opportunits
cres par les Hommes. Nous sommes tous, puissants comme faibles, redevables des autres dans
nos succs et nous devons faire preuve de gratitude.
Mais qui remercier et qui laisser ? Dans tous les cas, il est impossible de citer tout le monde. Et
pour ne frustrer personne, jen tais arriv me questionner sur la ncessit dun mot de
remerciement.
Mais une sagesse africaine dit : Les yeux voient mais ils ne peuvent raconter. La bouche ne voit
pas mais elle raconte ce quelle ne peut voir. Telle est la ralit de notre existence terrestre. Les
honneurs ne reviennent pas toujours celui quils sont dus.
Jai alors pens que le pire, cest de ne rien faire. Ne rien faire, cest refuser de reconnatre les
contributions diverses qui mont permis darriver ce rsultat. Ce serait injuste car de nombreuses
personnes se sont donnes tant de peine pour que ce travail voie le jour. Pour que jamais elles ne
regrettent davoir pris de linitiative, davoir compatie, davoir espr pour moi et avec moi,
davoir pri et souffert, je me suis dcid leur adresser quelques mots de remerciement.
Les penses et les paroles sont cratrices de force, dengagement. Les penses positives
engendrent la force, le courage, lidal dune humanit plus harmonieuse, plus juste, plus
quitable. Ce que je voudrais, cest que ces mots de remerciement crent en toute personne qui les
lira, un dragon puisant de sagesse et de paix ; un esprit si puissant que tout leur tre matriel et
subtil transpire damour et de charit. Alors, vous tous qui avez tant donn pour moi, lami dun
jour, le fils, le collgue, le pre, le mari, le nouvel ami et mme le parfait infortun inconnu,
jadresse ma profonde gratitude. Je pris la Toute Puissance Divine, la Cration elle-mme, Celle de
qui nous provenons tous, mauvaises comme bonnes gens, de vous inspirer toujours cet lan
transcendant vers lautre pour un avenir de paix et de grce.
Les grandes choses commencent par la petite ide qui jaillit de la pens pure de tout tre. Alors,
que nul estime que ce quil a fait est peu ou pas assez, du moment o il a eu cette petite ide de
faire quelque chose de bien. La montagne est constitue de roches, la roche, de minraux, le
minral de molcules, la molcule datomes et latome de cette nergie invisible mais combien
puissante qui donne lessence de toute chose. Vous croyez sans doute que vous vous tes sentis
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
Remerciements
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impuissant et vous avez souffert de votre impotence en vous disant : voil ce que je ferai pour
laider si javais t dcideur. H bien ! Lunivers nest pas rest sourd. Il a entendu les
complaintes qui montent de votre cur meurtri et dcider que votre compassion porte le fruit
dont voil la matrialisation. Grce vous le miracle sest ralis !
Ce mmoire ne peut donc se rduire son contenu scientifique. Il est porteur de force, de
persvrance, de joie, desprance. Il est galement un intgral dnergie, de combat, de foi en
lhomme et en lamour. Il est donc une proprit de luniversel de la persvrance, de lamour
infini, de lexistence cratrice dune humanit grandissante et en qute dharmonie.
Amour et sagesse, lumire et vrit en vous et autour de vous, pour lavnement dun monde
meilleur sur la terre des hommes.
Je voudrais citer des noms pour quils incarnent les interactions multiples que jai eues avec les
tres de tout bord. Chacun ressentira ma gratitude selon ce quil aura fait dans sa conscience. Un
nom dans cette liste ne fait pas de vous un homme de bien ou de mal, car lultime jugement vous
sera fait par votre conscience qui est expression de la prsence de lhumanit en vous. Si vous
navez pas trouv votre nom dans cette liste alors que vous pensez avoir fait quelque chose de
bien, ne men voulez pas car ce document vous appartient. Vous avez vu le nom dune personne
indigne vos yeux, ne vous en faites pas, cest pour que les sentiments de joie que vous dgagez le
purifie afin quil devienne lui aussi un jour, pour un autre commun des mortels, un artisan de la
paix universelle. Sans prsance, merci vous :
-
Dapola Evariste Constant Da, Tanga Pierre Zoungrana, P. Honor Som et Stanislas
Ouaro, de lUniversit de Ouagadougou,
Hlne Gurgel Da Costa, Maureen Douka, Joachim Etouna, Gervais Wafo, Raphal PinDiop tous doctorants ou ancien doctorant en accueil au Centre IRD dOrlans
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Remerciements
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Carlo Costantini, Didier Fontenille, Frdric Simard, Frdric Huynh, Evelyne Poncet,
Jocelyne Petit, Christine Chauviat, Christophe Mahuzier, Jean-Marie Fotsing, Kenji Ose de
lIRD
Paul
Gnies,
Joseph
Wth,
Amadou
Hama
Maga,
Sina
Thiam,
Salimata
Kadidiatou Som/Ouattara, mon pouse, Biauviel Som notre fils, Flicien et Bernadette
Som mon pre et ma mre,
Feu Jean-Franois Som, Feu Jean-Franois Dabir, Pascal Som, Urbain Dabir,
Thomson et Alice Somda, Serges et Zenabou Som, Ghislain Dabir, Abdon et Gisle
Hien, Zan Traor, Mamou Bayala, Dsir Pal, Bamassi Fayama, Tchani, Franois et
Marie-Rose Maurin, Soir Konat, Mathieu Kientga, Arlette Dabir, Lydie Wafo, Issiaka
Sombi, Dramane et Elsa Sanon, Fabrice et vronique Bogo, Evariste Oudraogo, Estelle
et Douada Barro, Boubacar Diaby, Alkassim Bah, Labasse Koumar, Camara Papou et
Maude et Gustave Yamogo, Arsne et Audrey Dabir et tous les autres parents et amis en
France et au Burkina dont les noms nont pu tre cits.
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Introduction gnrale
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INTRODUCTION GENERALE
Contexte et justification
Lenvironnement agit quotidiennement sur notre sant par le biais du milieu qui nous entoure : eau,
air ou sol. En cas de dtrioration brutale de lenvironnement, comme dans les camps de rfugis par
exemple, les impacts sanitaires sont dailleurs considrables 1, affirme la Fondation Nicolas Hulot
pour la Nature et l'Homme. Pour le Centre International de Recherche sur le Dveloppement (CRDI),
Sant des cosystmes gale sant humaine .
Cette mise en miroir de la sant et de lenvironnement nest pas nouvelle. Le fondateur de la
mdecine moderne, Hippocrate, (v. 460 - 377 av. J.-C.) ne disait-il pas que pour approfondir la
mdecine, il faut considrer d'abord les saisons, connatre la qualit des eaux, des vents, tudier les
divers tats du sol et le genre de vie des habitants2 . La dcouverte par Louis Pasteur en 1865, du
microbe et le dveloppement de la microbiologie ont conduit la strilisation, lhygine du milieu
et lassainissement dont limpact sur lesprance de vie de lhomme est indniable. Dans les annes
1980, lmergence de la mdecine environnementale et de lco-toxicologie sinscrit dans cette
dynamique de prise en compte de lenvironnement dans les questions de sant et du bien-tre des
hommes.
La communaut internationale a reconnu ce lien inextricable entre environnement et sant et la dj
exprim de faon trs formelle plusieurs reprises. Cest le cas aux points 3 et 4 du prambule et
aux principes 1 et 7 de la dclaration de la Confrence des Nations Unies sur lEnvironnement, tenue
Stockholm du 5 au 16 juin 1972. Cette reconnaissance est raffirme Rio de Janeiro dans la
dclaration de Confrence des Nations Unies sur lEnvironnement et le Dveloppement du 3 au 14
juin 1992.
Daprs le rapport O.M.S., (2006), plus de 13 millions de dcs sont dus annuellement des causes
environnementales vitables. Prs du tiers des dcs et des maladies qui surviennent dans les rgions
les moins dveloppes sont provoqus par l'environnement. Plus de 40% des dcs des suites du
paludisme et environ 94% des dcs provoqus par des maladies diarrhiques, deux des principaux
tueurs d'enfants au niveau mondial, pourraient tre vits par une meilleure gestion de
http://www.fnh.org/francais/doc/en_ligne/sante/dossier1_intro.htm
D'aprs "Airs, eaux, lieux", in Hippocrate - De l'art mdical, Le livre de poche classique
http://www.fnh.org/francais/doc/en_ligne/sante/dossier1_art1.htm
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Introduction gnrale
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http://www.who.int/mediacentre/news/releases/2006/pr32/fr/index.html
http://www.aidh.org/sante/sante-environn.htm
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Introduction gnrale
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premiers succs de cette bataille dans les annes 1950, avec lutilisation des insecticides de synthse
comme le Dichorodiphnyltrichlorothane (DDT) et la dieldrine, ont suscit un espoir dradication
du paludisme.
Cependant, lobjectif dradication na pas t atteint, parce que les vecteurs ont vite dvelopp une
rsistance aux insecticides. Ce qui a contribu la rsurgence de la maladie partout o elle avait
connu un recul Greenwood et Mutabingwa, (2002), Trape et al., (1996). Rien dtonnant que de
nouvelles initiatives soient prises pour limiter le contact homme-vecteur. Actuellement la lutte antivectorielle sattache aussi rduire laccs des vecteurs lhomme par lutilisation de matriaux
imprgns dinsecticides. Toutefois, cette option pose la question des consquences de la rduction
de la transmission du Plasmodium sur limmunit des enfants en bas ge dans les zones hyper
endmiques DAlessandro et al., (1995) ; Snow et Marsh, 1995 ; Binka et al., (1996) ; Nebie, (2002).
Aussi, la lutte gntique sinscrit-elle parmi les initiatives dveloppes pour le contrle de la
population vectorielle. Elle vise le remplacement de la population de vecteurs sauvages par des
moustiques rfractaires au Plasmodium Collin et Besansky, (1994).
Il est largement admis aujourdhui quune lutte anti-vectorielle ne sera efficace long terme qu la
condition dune connaissance approfondie des cycles de transmission, de la biologie et de lcologie
des vecteurs. La non prise en compte de lhtrognit comportementale des vecteurs impliqus
dans le systme de transmission, cest--dire, la mconnaissance de la biologie et de lcologie des
vecteurs, a t sans doute la base des checs enregistrs dans lradication du paludisme en Afrique
Chauvet et al., (1969). Ltat actuel des connaissances sur lcologie des anophles reste insuffisant
pour permettre la mise en place de mesures efficaces de contrle vectoriel. Par exemple, les causes
de lhtrognit spatiale observes dans labondance et la distribution des membres du complexe
Anopheles gambiae sont encore mconnues. Il en est de mme pour les mcanismes qui interviennent
dans la rgulation des populations.
Il est devenu ainsi ncessaire, dans la perspective du contrle de la population des vecteurs, de
prendre en compte cette diversit spcifique et de rpondre efficacement un certain nombre de
questions telles que :
-
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Introduction gnrale
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Compte tenu des effets dvastateurs de cette maladie sur la sant de la population mondiale, de
nombreux projets ont t initis. Ils visent une meilleure connaissance de la biologie, de lcologie et
de lthologie de cette espce, voire de ce complexe despces, pour plus defficacit dans le contrle
de la population vectorielle. Ainsi, un projet de NIH5 Ecological genomic of An. gambiae, qui
porte la fois sur le Burkina Faso et le Cameroun, est initi conjointement par lUniversit Notre
Dame aux Etats-Unis, le CNRFP6, lOCEAC7 et lIRD8. Ses objectifs sont :
-
tudier et identifier les paramtres du milieu favorisant la prsence de lune ou lautre de ces
deux formes.
Pour atteindre ces objectifs, le projet Ecological genomic of An. gambiae a mis en place un
protocole de recherche plusieurs niveaux dont laire dapplication la plus dtaille (le niveau micro
gographique) doit concider avec une zone de sympatrie, cest--dire une zone o cohabitent,
proportion presque gale, An. gambiae forme molculaire M et An. gambiae forme molculaire S.
Sujet
Le projet Ecological genomic of An. gambiae dont drive ce travail dtude et de recherche, vise
donc rsoudre un problme de sant dans lequel intervient lenvironnement en tant que cadre de
vie du vecteur. Cette problmatique soulve un aspect important, celui de la distribution spatiale des
formes molculaires M et S dAnopheles gambiae, do le titre que porte cette tude :
modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S dAnopheles gambiae
sensu stricto au Burkina Faso par les SIG et lanalyse spatiale.
Aussi, ce travail de recherche sinscrit-il dans la problmatique environnement et sant , dans le
volet lutte contre les vecteurs. Il ne sagit pas dune recherche pidmiologique, encore moins de
mdecine, mais plutt une tude dont le but est de contribuer la lutte contre le paludisme par une
meilleure connaissance de la gographie des anophles. La prsente tude propose une rflexion sur
la distribution spatiale des vecteurs. Son ambition est de rpondre des questions essentielles dans la
dfinition de politique et de stratgie de lutte anti-vectorielle. Ces questions sont les suivantes :
comment sont reparties, sur le territoire burkinab, les formes molculaires M et S An. gambiae ?
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Introduction gnrale
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Objectifs et hypothses
Ce travail a pour objectifs de :
-
Il sappuie sur trois hypothses : la distribution non alatoire des formes molculaires M et S dAn.
gambiae au Burkina Faso, la dtermination de lorganisation spatiale par les facteurs cologiques et
la contribution diffrentielle des diffrents facteurs environnementaux. Les deux dernires
hypothses ouvrent la perspective dune formalisation mathmatique partir de donnes empiriques.
Ces objectifs et hypothses invitent la gographie une rflexion plus globale, celle de la chorologie
des espces, particulirement celles impliques dans la transmission de certaines maladies. La
biogographie est la branche de la gographie dont lobjet dinvestigation est la rpartition spatiale
des espces et les causes de cette rpartition. Elle dispose dun ensemble de concepts, de mthodes
et doutils qui pourraient tre renouvels sur le plan oprationnel avec lapparition de techniques
nouvelles de traitement de linformation spatiale. Il sagit en loccurrence des systmes
dinformation gographique, de la tldtection et de lanalyse spatiale. Si la biogographie peut
fournir un cadre thorique pour larticulation de lensemble du travail, il ne peut suffire ni du point
de vue technologique ni du point de vue thmatique.
Approche mthodologique
Aussi ce travail sinscrit-il dans une approche pluridisciplinaire qui intgre la fois : la
biogographie, comme cadre thorique de structuration de ltude, lentomologie, comme discipline
qui fournit les connaissances sur les formes molculaires M et S dAn. gambiae. Lanalyse spatiale,
le systme dinformation gographique et lanalyse de donnes statistiques peuvent tre apprhends
comme des mthodes et techniques de structuration et de traitement de donnes.
Ce travail sinscrit dans une dmarche de construction dune structure formalise qui rend compte
des relations spatiales entre les formes molculaires M et S dAn. gambiae s.s. et le milieu. Il doit
permettre une reprsentation formelle simplifie de la distribution spatiale de chaque forme
molculaire dAn. gambiae s.s. travers une fonction mathmatique et une carte de distribution. Le
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Introduction gnrale
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processus de construction de ces modles offre une approche de problmes anciens (la chorologie
des espces) avec des outils nouveaux et des mthodes ractualises par les nouvelles technologies
de traitements de linformation spatiale.
Plan du mmoire
Ce mmoire est structur en deux parties. La premire, intitule Cadrage thmatique, dmarche
scientifique et mthodes ,pose les bases de la rflexion. Elle est compose de trois chapitres. Le
premier chapitre, Etat de lart, dfinition dun champ conceptuel et positionnement scientifique ,
dfinit, lissu dun tat de lart, le champ dinvestigation. Il permet une analyse des concepts et
insre ltude dans une discipline scientifique. Ce qui est indispensable lorientation de la
rflexion. Le second chapitre Bio-cologie dAn. gambiae au Burkina Faso : une relation
formaliser est une prsentation du paludisme, des anophles et du Burkina Faso. Ces trois lments
constituent les objets de ltude, les porteurs de la problmatique et des informations traites dans ce
mmoire. Leur connaissance est indispensable la comprhension du problme tudi, au traitement
des donnes, llaboration de la mthodologie et linterprtation des rsultats. Dans le troisime
chapitre Approche mthodologique sont prsentes la dmarche mthodologique, les mthodes
et les techniques de collecte et de traitement des donnes.
La deuxime partie de ce travail, structuration des donnes, laboration et valuation des
modles , est tourne vers la vrification des hypothses et lvaluation des objectifs. Elle est
compose de trois chapitres. Elle prsente les rsultats du travail travers la structuration de la base
de donnes et des processus au chapitre IV. Le chapitre V contient la prsentation de lorganisation
spatiale des formes molculaires M et S dAn. gambiae s.s. au Burkina Faso et les facteurs
dterminants de cette organisation. Le chapitre VI propose les modles de distribution et leur
valuation.
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PREMIERE PARTIE :
CADRAGE THEMATIQUE, DEMARCHE
SCIENTIFIQUE ET METHODE
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Cette premire partie sappuie sur la revue de la littrature scientifique pour situer ce travail de
recherche dans une discipline scientifique : la gographie. Elle contient aussi une prsentation du
paludisme, de lanophle et du Burkina Faso. Elle prsente enfin la mthodologie de ltude. Cette
partie a pour but de cadrer ce travail de recherche tant sur le plan thmatique, thorique,
mthodologique que gographique. Elle rpond aux questions suivantes : dans quelle perspective est
conduite cette tude ? O se situe le site de ltude et quelles sont ses proprits ? Comment
envisager la ralisation de cette tude ? Quels sont les techniques et les outils qui sont utiliss ?
Cette partie est compose de trois chapitres :
-
Le premier vise fixer les limites de nos ambitions partir de la littrature scientifique ;
Le second est une prsentation des anophles et du Burkina Faso (la zone dtude).
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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comptence de la gographie, de montrer comment elle interagit avec les autres disciplines pour
contribuer une rflexion sur les questions de sant.
Cette analyse du rle de la gographie dans ltude des questions de sant se fonde sur trois axes :
-
laxe conceptuel qui repose sur une volution de la perception de la lutte contre les maladies
en gnral et les maladies transmission vectorielle en particulier ; et offre lopportunit
dune nouvelle contribution de la gographie la rsolution des problmes de sant,
laxe mthodologique fond sur lapproche gographique dans le contexte de la lutte contre
les maladies,
laxe technologique orient sur lutilisation des outils propres au gographe dans ltude des
problmes de sant.
I.1.1
Comment la gographie peut-elle intervenir dans la rflexion sur les problmatiques lies la sant ?
A travers son objet dtude : lespace. Ce paragraphe dveloppe cette rponse et se subdivise en deux
sous paragraphes. Le premier est consacr la dfinition de lobjet de la gographie. Le second se
focalise beaucoup plus sur la relation entre cet objet et les questions de sant.
I.1.1.1
Durant son volution sur plus de 2500 ans, la gographie a connu de nombreuses remises en cause et
de nombreuses reconstructions de son objet. Lunanimit au sein mme de la discipline nest pas
dfinitivement acquise. Toutefois, la tendance actuelle laquelle nous souscrivons et qui semble
fdrer une grande partie de la communaut des gographes, consiste dire que lobjet de la
gographie, cest lespace et son organisation. Comme beaucoup dautres, nous pensons que lobjet
de la gographie contemporaine porte sur lespace et son organisation. [] Lespace est form, soit
par des lieux dfinis par leurs coordonnes gographiques, soit par des portions plus ou moins
tendues de la surface terrestre dont les lments sont des lieux unis par des relations fonctionnelles
que leur confrent ou leur ont confr les socits humaines . Chamussy et al., (1977) cit par
Ciattoni et al., (2005). Cette dfinition de lobjet de la gographie base sur lespace est sans doute la
plus rpandue aujourdhui dans lenseignement suprieur, mme si lacceptation de la notion
despace est aussi sujette discussion.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Lespace est [] en ralit, lensemble des lieux rpertoris et qualifis par les gographes, la
totalit des signes quils identifient et interprtent pour diffrencier les objets, les phnomnes la
surface de la terre. Les gographes linventorient, le dcoupent et le ramnent des lments
isolables et combinables, parlant par exemple despaces naturels, ruraux, urbains, perus, vcus, etc.
Ils le cartographient, en extraient les structures directrices, en dcryptent les formes, les fonctions et
les dynamiques []. La gographie permet de rpondre aux questions suivantes qui sont essentielles
dans tout processus humain : quoi ressemble la terre ? O sommes-nous sur la terre et quest-ce
quil y a sur la terre ? La gographie donne aux hommes la connaissance de lespace dans lequel ils
se situent et les cls pour dchiffrer ses fonctionnements Bavoux, (2007). La notion despace se
conoit donc comme milieu gographique, cest--dire un espace dot de proprits dfinies en
fonction des problmatiques. Dans le cadre de ce travail, lespace milieu de vie, habitat des
anophles, influence leur rpartition. Sa dimension gomtrique (forme, taille) comme ces
caractristiques biophysiques, participe la distribution des frquences de ces vecteurs du paludisme
dans lespace.
I.1.1.2
Lespace tant lobjet dtude de la gographie, la lutte contre la maladie sinscrit en partie dans les
comptences du gographe. En effet, la maladie affecte les socits et les hommes qui sont situs
quelque part sur la terre. Le gographe peut y observer la diffusion, les rgularits, les singularits et
les discontinuits. Cette relation de la gographie la rflexion sur les problmes de sant est
particulirement loquente dans le cas du paludisme qui est une maladie transmission vectorielle.
Sa propagation au sein des humains nest possible que par lintermdiaire dun vecteur dont la survie
dpend normment du milieu gographique, de lenvironnement. La lutte contre les maladies,
surtout celles transmission vectorielle, tire dnormes intrts de la gographie qui permet de
caractriser lespace. Lintrt de la gographie pour la rsolution des questions mdicales est bien
antrieur celui des gographes pour la question de sant. La gographie de la sant s'appuie sur
une trs longue tradition, initie par Hippocrate lui-mme qui avanait le rle du climat et de
l'environnement, mais aussi de la localisation gographique, sur l'apparition des maladies 9. La
gographie mdicale est linitiative dun mdecin, lAllemand Leonhard Ludwig Finke (17471837).10 Cest ce quexprime Barrett Frank, (2000) en titrant leur article, Finke's 1792 map of
human diseases: the first world disease map? Le fondateur de lpidmiologie, le Britannique John
http://www.scienceshumaines.com/-0ales-sciences-humaines-et-la-sante-0a_fr_13795.html
Barrett A., Frank (2000) "Finke's 1792 map of human diseases: the first world disease map?" Social Science &
Medicine 50 915-921. http://www.csiss.org/classics/content/106
10
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Snow11 (1813-1858) ntait pas non plus un gographe. Son fameux essai sur la propagation de
l'pidmie de cholra en 1854 et l'hypothse d'une dissmination de celle-ci par l'intermdiaire de la
distribution d'eau en utilisant les cartes le consacre comme utilisateur de la gographie pour la
rsolution des questions de sant. Ce qui caractrise ces prcurseurs de lusage de la gographie dans
le domaine de la sant, cest la prise en compte de lespace. La place de la gographie dans la lutte
contre la maladie se situe dans la spatialisation des phnomnes morbides et dans lintelligibilit de
lespace pour les questions de sant.
Lespace, porte dentre du gographe dans ltude des phnomnes, donne une autre dimension et
un autre angle dattaque dans la lutte contre la propagation des maladies. La gographie peut alors
contribuer avec efficacit la planification de lutte. Cette contribution de la question spatiale dans la
lutte contre les maladies est de plus en plus exige par les spcialistes de la sant et les tudes
intgrant la dimension spatiale ou msologique de la maladie sont lgions. Lmergence du concept
cosant procde de lintgration de la lutte contre les maladies dans un systme global qui prend
en compte lenvironnement (espace gographique) travers ses diffrentes dclinaisons. Ainsi,
lusage de plus en plus courant de mthodes et outils traditionnellement connus comme
gographiques est perceptible dans les sciences de la sant. Le concept de complexe pathogne12
dvelopp par M. Sorre en 1933 a impos aux plus sceptiques la ncessit dintgrer les phnomnes
morbides dans un systme plus large. 13Le-Bras et Malvy, (2004) confirment cet avis en soutenant le
fait que le concept de complexe pathogne dfini par le gographe Maximillien Sorre en 1933
mrite d'tre revisit la lumire des nouveaux outils permettant de mieux identifier les
dterminants biologiques (gntique molculaire), d'environnement (systme d'information
gographique), des comportements, dpendants des activits des services de soins. Son utilisation
invite porter sur toute menace de maladie un regard l'chelle du monde et envisager les
consquences des bouleversements de l'poque tels que la mondialisation des personnes, des denres
et des biens, la dynamique dmographique, l'urbanisation rapide, l'industrialisation, la dforestation,
l'volution rapide des comportements, la capacit d'efficacit mais aussi de nuisance des systmes de
sant . En exemple, nous citons des publications darticles dans des revues spcialises comme Bio-
11
http://fr.wikipedia.org/wiki/John_Snow
Linterdpendance des organismes mis en jeu dans la production dune mme maladie infectieuse permet de
dgager une unit biologique dun ordre suprieur : le complexe pathogne. Il comprend, avec lhomme et lagent
causal de la maladie, ses vecteurs et tous les tres ou facteurs qui conditionnent ou compromettent leur existence
Sorre, 1961, cit par Raphal Pin-Diop 2006.
12
13
Le Bras M et Malvy J-M. D., Le complexe pathogne tropical : Regard nouveau sur un concept ancien, Mdecine
tropicale 2004, vol. 64, no 6, pp. 613-618 (http://cat.inist.fr/?aModele=afficheN&cpsidt=16594466 )
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
20
Med : Costantini et al., (2009)14, Thomas et al., (2003)15, de Mushinzimana et al., (2006),16 de
Ratana et al., (2005)17, et de Valle et al., (2007)18, Sabatier et al., (2004)19. Si donc on retrouve la
gographicit dans de nombreuses questions scientifiques, cest parce que [la gographie] est belle,
utile et aise tout ensemble. On peut dire quelle est ncessaire tout le monde20. Cest parce que
son objet est associ des questions existentielles, pratiques, que lusage des produits de la
gographie sert tout le monde un certain moment.
En somme, de par son objet, ses domaines de comptences, la gographie doit apporter sa
contribution aux questions de sant et ce travail de recherche participe de cette dynamique. Elle est
gographique par ses objectifs et par son approche mthodologique. Si lespace fait partie intgrante
de lobjet de la gographie, tout usage de lespace nest pas forcement gographique. La gographie a
son originalit dans lusage de lespace comme moyen de lecture et comprhension des phnomnes.
I.1.2
Lobjet de la gographie justifie son implication dans la recherche sur les questions de sant.
Lapproche des phnomnes spatiaux en gographie a cependant des spcificits. En effet,
lapproche mthodologique des gographes, en tant que spcialistes du spatial, diffre sans doute des
autres disciplines scientifiques et constitue une deuxime raison de limplication de la gographie
dans le domaine de la lutte contre les maladies. Comment lespace intervient-il au plan
14
Costantini, C., Ayala, D., Guelbeogo, W.M., Pombi, M., Som, C.Y., Bassole, I.H., Ose, K., Fotsing, J.-M., Sagnon, N.F.,
Fontenille, D., Besansky, N.J., et Simard, F., 2009, Living at the edge: biogeographic patterns of habitat segregation conform to
speciation by niche expansion in Anopheles gambiae: BioMed Center Ecology, v. 9:16.
15
Thomas P Eisele, Joseph Keating, Chris Swalm, Charles M Mbogo, Andrew K Githeko, James L Regens, John I Githure, Linda
Andrews et John C Beier, 2003, Linking field-based ecological data with remotely sensed data using a geographic information system
in two malaria endemic urban areas of Kenya, Malaria Journal 2003, 2:44, BioMed Central
16
Emmanuel Mushinzimana1, Stephen Munga1, Noboru Minakawa, Li Li, 2006Chen-chieng Feng, Ling Bian, Uriel Kitron, Cindy
Schmidt, Louisa Beck, Guofa Zhou, Andrew K Githeko1 et Guiyun Yan, 2006, Landscape determinants and remote sensing of
anopheline mosquito larval habitats in the western Kenya highlands , BioMed, Malaria Journal2006, 5:13
17
Ratana Sithiprasasna, Won Ja Lee, Donald M Ugsang et Kenneth J Linthicum, Identification and characterization of larval and
adult anopheline mosquito habitats in the Republic of Korea: potential use of remotely sensed data to estimate mosquito distributions,
BioMed Central, International Journal of Health Geographics 2005, 4:17
18
Julie Valle, Marc Souris, Florence Fournet, Audrey Bochaton, Virginie Mobillion, Karine Peyronnie and Grard Salem, 2007,
Sampling in health geography: reconciling geographical objectives and probabilistic methods. An example of a health survey in
Vientiane (Lao PDR) BioMed Central, Emerging Themes in Epidemiology 4:6 doi:10.1186/1742-7622-4-6 http://www.eteonline.com/content/4/1/6
19
P. Sabatier, Babouchkine, J.-M., Morvan, J., Polidori, L., Lacaux, J.-P., Braak, L., Dubois, M.A., et Chaude, H., 2004, S2.Dengue.
Surveillance spatiale et de la dengue. Conception doutils dacquisition, de cheminement, danalyse et de prvision pidmiologique:
ITBM-RBM v. 25 (2004) p. 292-296.
20
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
21
Arnaud Banos, A propos de lanalyse spatiale exploratoire des donnes , Cybergeo : European Journal of
Geography [En ligne], Systmes, Modlisation, Gostatistiques Systmes, Modlisation, Gostatistiques,]-->,document
197, mis en ligne le 18 octobre 2001. URL : http://www.cybergeo.eu/index4056.html
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
22
larmature urbaine dun pays nutilise pas les mmes concepts que celle relative lorganisation
agraire, mme si ces deux tudes peuvent interfrer dans certains cas. Ainsi lespace est territoire,
biotope ou cosystme et autre chose en fonction des circonstances. Il est peru, vcu ou construit. Il
est physique ou conceptuel. Cette diversit dapprhension de lespace en gographie sintgre dans
diffrents schmes dont les branches de la discipline sont porteuses. Lespace est donc un lment de
fcondit dans lentreprise scientifique du gographe. Il est la fois diversement utilis selon les
circonstances et porte toujours en lui une source dexplication et de comprhension des phnomnes
tudier.
Dans le cadre de ce travail, lespace, lieu de vie du complexe Anopheles gambiae, vecteur du
paludisme, prsente une variabilit dtat qui le rend plus ou moins propice la vie de ce culicid.
Lespace contribue plus ou moins directement lamplification ou la rduction de la transmission
du paludisme. Nul ne peut donc comprendre la propagation du paludisme en excluant lespace qui
dtermine, au moins en partie, le cycle de transmission de la maladie. Cette vision de lespace, milieu
de vie, provient de la biogographie et a t dterminante dans la conceptualisation de la dmarche
de cette tude. Ainsi, lanalyse spatiale en tant quapproche gographique a pris corps dans le
paradigme biogographique et a permis de proposer une perception objective de la distribution
spatiale de membre du complexe An. gambiae.
Roger Brunet; confrence prononce le 24 novembre 1999 et publie dans le Bulletin de la Socit de Gographie de
Lige, 2000, n2, p. 21-30.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
23
dapparition des modles de diffusion associs au calcul des probabilits. Cest aussi lpoque des
modles de simulation qui visaient reproduire des systmes dynamiques. Ces modles
sintressaient anticiper les chances ou les effets d'un changement. Cest encore lavnement des
modles de configurations spatiales, notamment de rseaux et graphes sagittaux, visant modliser
des systmes. La gographie, travers la statistique spatiale exploratoire et lanalyse des
configurations spatiales, a prouv son importance dans la comprhension des problmes de sant et
dans la lutte contre les maladies.
Lorsquil sagit de maladies transmission vectorielle, comme cest le cas dans ce travail de
recherche, lanalyse de la rpartition spatiale des espces vectrices de maladies peut apporter une
contribution importante dans la comprhension de la survenue et de la dynamique des phnomnes
morbides. Cette comprhension soutient la conception des plans de riposte efficace. La contribution
de ce travail, la comprhension de la distribution des formes molculaires M et S dAn. gambiae
s.s., sintgre dans une perspective de recherche de solution efficace pour lutter contre la
transmission vecteur/homme du paludisme. En mettant en relief les facteurs dterminants de la
distribution des diffrentes formes molculaires au Burkina Faso, cette tude ouvre le champ
dautres investigations comme lutilisation de mthode biologique dans le contrle des populations
danophles, la mise en place de pesticides plus adapts la population culicidienne, etc.
Lapproche spatiale de la gographie apporte certes une contribution intressante la connaissance et
la lutte contre les maladies. La mise en uvre de cette approche est possible grce lutilisation des
technologies dont il convient galement danalyser la contribution la rsolution des problmatiques
lies la sant.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
24
communaut scientifique. Cest ce que lon prsente trs succinctement dans les sous paragraphes
suivants.
Loutil cartographique
Le cartographe par dfaut est devenu, dans certaines contres, certaines priodes, le gographe.
Ainsi, du XVe au XVIIe sicle, dans le contexte des grandes dcouvertes maritimes, la figure du
gographe et celle du cartographe se confondent en Europe Zaninetti, (2005). La cartographie
dsigne la ralisation et l'tude des cartes. Elle mobilise un ensemble de techniques servant la
production des cartes. La cartographie constitue un des moyens privilgis pour l'analyse et la
communication en gographie. Elle sert mieux comprendre l'espace, les territoires et les paysages.
Elle est aussi utilise dans des sciences connexes, comme la dmographie, lconomie, dans le but de
proposer une lecture spatialise des phnomnes (Encyclopdie scientifique en ligne) 23.
Outils de spatialisation par excellence, la cartographie est la fois pour le gographe, un outil
danalyse et un puissant moyen de communication. Cest outil de communication graphique qui
sappuie sur un langage visuel et qui permet une vision simultane et synthtique des phnomnes
spatiaux. Les travaux comme ceux de Jacques Bertin
24
smiologie graphique27 pour une utilisation de la carte en tant que mdia, en tant que moyen de
communication mais galement en tant que mthode danalyse en sont une preuve. Les cartes
servent reprsenter des phnomnes gographiques, c'est--dire des phnomnes dont la
configuration spatiale produit du sens (Encyclopdie scientifique en ligne). La cartographie
reconnue plus ou moins unanimement comme un outil privilgi du gographe est lune des
techniques qui a introduit la discipline gographique dans de nombreux champs de recherche et
particulirement celui de la sant. Lvolution technologique, travers lavnement de la
tldtection et du SIG, a facilit la ralisation des cartes.
23
http://www.techno-science.net/?onglet=glossaire&definition=2569
Jacques Bertin, 1967, smiologie graphique : les diagrammes, les rseaux, les cartes, EHESS, dition originale, 2005
4me dition, 452 pages
25
Serge Bonin, 1975, initiation a la graphique, EPI, 172 p.
26
Brunet Roger: la carte mode d'emploi. FAYARD / RECLUS, 1987, 270 p.
27
On appelle smiologie graphique l'ensemble des rgles permettent l'utilisation d'un systme graphique de signes
pour la transmission d'une information Bguin, Michle et Pumain, Denise (1994), La reprsentation des donnes
gographiques. Statistique et cartographie. Paris, Armand Colin.
24
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25
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Nous sommes coauteur avec les autres membres du projet de cet article.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
26
Les SIG, dans leur fonction de stockage et dintgration de donnes, utilisent bien souvent des
informations provenant de la tldtection, la plus grande source actuelle de donnes spatiales.
La tldtection
En tant quensemble de mthodes et de techniques permettant dacqurir des informations sur les
surfaces sans contact direct avec celles-ci Bonn, (1991), la tldtection a permis au cours des trois
dernires dcennies de produire une grande quantit de donnes spatiales Bouzou et al., (2001);
Som, (2000). Lapplication de la tldtection la surveillance et au contrle des vecteurs de
maladies remonte 1949, lorsque Audy utilisa des photographies ariennes en noir et blanc pour
dterminer les foyers endmiques de typhus en Asie du sud-ouest, partir de la distribution dun
certain type de vgtation Pin-Diop, (2006). Depuis le lancement des premiers satellites civils
dobservation de la terre dans les annes 1970, les progrs scientifiques dans le domaine de la
tldtection sont normes. Les rsolutions spatiales, spectrales et temporelles sont en progrs. Les
mthodes de traitement des donnes issues de la tldtection se sont galement beaucoup
amliores. Les logiciels sont de plus en plus performants et intgrent une grande diversit dindices
(indice de vgtation, indice minralogique, indice ferrugineux, indice hydrologique, etc.). Ceux-ci
sont rattachs des surfaces spcifiques qui peuvent avoir un intrt dans le profil pidmiologique
de certaines maladies. Par son caractre rptitif, synoptique et diversifi du point de vue des
thmatiques, la tldtection est une source dinformation indispensable dans la prvention et le suivi
de certains phnomnes qui affectent la sant des populations. La tldtection, en permettant le suivi
de certains paramtres environnementaux, constitue une source dinformation importante pour
ltude de certaines maladies. Ainsi, et de plus en plus, les capteurs de tldtection sont mme de
fournir aux pidmiologistes linformation pertinente sur le milieu pour ltude et la surveillance des
maladies lies des conditions environnementales particulirement les maladies transmission
vectorielle Tran, (2004). Son impact sur les intervenants dans le domaine de la sant a conduit
lmergence du concept de Tlsant qui sappuie la fois sur la tldtection, les SIG, lanalyse
cartographique et dautres technologies de linformation et de la communication (Internet,
tlcommunication) dont Sabatier et al., (2004), Valle et al., (2007) en sont des illustrations.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
27
de rappropriation de concept et des outils est effectu dans ces disciplines. Il est vident, au regard
de ce qui prcde, que les termes qui constituent le thme de ce travail de recherche peuvent faire
lobjet dune interprtation plurielle. Une mme dfinition dans une mme discipline peut cacher
des paradigmes, mthodologies et enjeux diffrents, voire divergents ou contradictoires, et une mme
posture thorique dans deux disciplines diffrentes peut recourir des mots diffrents Langlois,
(2005). Il convient, en raison des interprtations auxquelles ils sont sujets, de les redfinir dans le
contexte de ce travail. De prime abord, trois concepts sont essentiels : la modlisation, lanalyse
spatiale et le SIG.
I.2.1
28
molculaire associ une formule chimique, une carte associe aux valeurs dun tableau statistique).
Le modle - schma est une reprsentation du modle - structure Langlois et Reguer, (2005). Elle
peut permettre la mise en forme empirique dobservations non encore expliques. Dans cette
perspective, nous ignorons si ce que nous disons a un sens, mais cest vrai Langlois et Reguer,
(2005). La dmarche, dans ce cas, est de partir dun jeu de donnes observes ou dun systme dj
formalis pour construire une reprsentation dun phnomne de faon en simplifier soit la
description, soit lexplication, soit linterprtation.
Quelle que soit la perspective, la modlisation procde de :
-
linterprtation : le modle en tant que rsultat dun processus cognitif, dbouche sur une
interprtation cest--dire quil doit donner un sens Brunet, (2000a).
comprendre : saisir les motivations qui ont un sens pour chaque homme ;
interprter : donner une signification par la mise en relation dun champ de reprsentation
(signifi) avec un autre (signifiant).
Le sens du concept de modlisation, dans ce travail de recherche, ne scarte pas du contenu qui lui
est donne ci-dessus. Il faut donc entendre par modlisation une dmarche de construction dun
modle. Le modle est la fois une structure formalise pour rendre compte dun ensemble de
phnomnes qui possdent entre eux des relations et une reprsentation formelle et pure du rel ou
d'un systme de relations des fins d'interprtation.
Le processus de la modlisation, tel que dfini, sappuie sur une dmarche scientifique qui comprend
la fois le choix des donnes, le choix des chelles, de la mtrique pour lobservation et la collecte
des donnes, leur structuration, leur organisation. Pour cela, la modlisation recourt, dune certaine
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
29
I.2.2
LANALYSE SPATIALE
Lanalyse spatiale est ltude formalise de la configuration et des proprits de lespace produit et
vcu par les socits humaines Pumain et Saint-julien Thrse, (1997). Elle est aussi un ensemble
de mthodes mathmatiques et statistiques visant prciser la nature, la quantit et la qualit
attaches aux lieux et aux relations quils entretiennent lensemble constituant lespace en
tudiant simultanment attributs et localisation Brunet, (2000a). Elle recouvre un ensemble de
thories gographiques et de mthodes provenant de la physique, des mathmatiques et de
linformatique Mathian et Piron, (2001). Lanalyse spatiale est donc la fois cadre de penses et
ensemble de mthodes. En tant que cadre de penses, elle considre lespace la fois comme support
dexistence et comme produit de laction. A ce titre, lespace peut servir de justification et
dexplication scientifique autonome. En tant quensemble de mthodes, lanalyse spatiale regorge de
moyens (procdures, modles, techniques, indices, etc.) qui permettent la fois la transformation des
donnes, leur analyse et leur interprtation dun point de vue spatial.
Lanalyse spatiale est utilise dans le cadre de cette tude la fois comme mthode et technique de
traitement de donnes (analyse des sries gostatistiques, choix des techniques destimation,
dextrapolation, etc.) et comme mthode danalyse gographique. Elle doit permettre de montrer sil
existe une organisation / une structuration dans lespace des populations d'An. gambiae s.s. au
Burkina Faso. Elle devra, si cette organisation existe, fournir les outils pour mettre en exergue les
facteurs dorganisation permettant d'expliquer la configuration observe.
Lanalyse spatiale, dans le cadre de cette thse, ne peut donc se concevoir en dehors de la thmatique
qui est la distribution spatiale d'An. gambiae s.s.. En liaison avec le concept de modlisation, il sagit
de trouver un modle qui reprsente la faon dont les configurations spatiales des populations du
complexe An. gambiae sexpriment. Ce modle, reprsentation simplifie de cette configuration, doit
permettre de la comprendre et de lexpliquer. Lespace est une composante importante de cette
modlisation, cest pourquoi, lanalyse spatiale est retenue comme mthode. Encore faut-il des outils
pour lapplication des techniques !
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
30
I.2.3
Parmi les nombreuses dfinitions des SIG, nous retenons celle de Thriault, (1995) pour qui, le SIG
est dfini comme un ensemble de principes, de mthodes, dinstruments et de donnes rfrence
spatiale, utilis pour saisir, conserver, transformer, analyser, modliser, simuler et cartographier les
phnomnes et les processus distribus dans lespace gographique.
Les SIG ont deux composantes structurelles :
-
la composante informatique qui regroupe les ordinateurs, les logiciels SIG et les
priphriques spcifiques tels que les systmes de radio positionnement, les scanners,
imprimantes, tables numriser, etc.
Par sa composante utilisateur, le SIG sert de cadre dorganisation de la collecte de donnes et de leur
structuration pour la formalisation de la distribution spatiale d'An. gambiae s.s.. Par sa composante
informatique, il offre lanalyse spatiale des outils de structuration et de stockage des donnes en
vue den faciliter laccs. Il concentre des outils dapplication des techniques (statistique, calcul
dindice, interpolation et estimation, reprsentation cartographique, etc.).
En synthse de cette analyse conceptuelle, ce travail de recherche sinscrit dans une dmarche de
construction dune structure formalise qui rend compte des relations spatiales entre An. gambiae s.s.
et le milieu. Elle vise une reprsentation formelle simplifie pour permettre dexpliquer, de faire
comprendre les configurations spatiales observes. Cette synthse permet non seulement une
meilleure dfinition des objectifs, mais aussi dinscrire cette tude dans un champ scientifique qui
fournira les outils la ralisation des objectifs.
I.2.4
PARADIGME
BIOGEOGRAPHIQUE :
UNE
MATRICE
31
I.2.4.1
Objectifs de recherche
Lobjectif global de ce travail est dtudier la distribution spatiale des formes molculaire M et S An.
gambiae s.s. et les causes de cette rpartition au Burkina Faso en utilisant les SIG et lanalyse
spatiale. Cest, en quelque sorte, lautcologie d'An. gambiae s.s. au Burkina Faso avec lutilisation
des SIG et de lanalyse spatiale. Il sinscrit dans la perspective de lutte contre les maladies
transmission vectorielle qui se dcline par le biais du contrle de la population de vecteurs. Elle se
dcompose en trois objectifs spcifiques :
1. dcrire la distribution spatiale d'An. gambiae s.s. au Burkina Faso. Ce premier objectif doit
permettre de rpondre aux questions suivantes : comment se repartissent, sur le territoire
burkinab, les formes molculaires M et S An. gambiae s.s. ? Y a-t-il une structure ou une
direction particulire, une tendance des regroupements ou toute autre forme dorganisation
dans la rpartition spatiale des membres du complexe An. gambiae ?
2. identifier les facteurs environnementaux qui dterminent la distribution spatiale des formes
molculaires M et S d'An. gambiae s.s. au Burkina Faso. Ce qui intresse, dans ce second
objectif, ce sont les causes de la distribution observe et dcrite. Nous cherchons donc une
explication ou plutt une justification de la distribution spatiale dcrite.
3. modliser la distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae au Burkina Faso. Il
sagit de formaliser la description obtenue en mettant contribution lexplication qui en
dcoule. Ce modle doit permettre de reproduire la distribution sans tre contraint
lobservation directe sur le terrain tout en minimisant le plus possible les carts avec la
ralit. Il doit permettre dexpliquer la distribution des espces concernes.
Latteinte des objectifs ci-dessus cits nest envisageable que si lon sinscrit dans une perspective
thorique en positionnant le thme dans une dmarche scientifique prouve. Pour cela, il convient
de choisir un champ disciplinaire. Cest de cela quil sera question dans le paragraphe
Positionnement scientifique .
En effet, celui qui ambitionne de dcrire, de comprendre et dexpliquer un phnomne sur le plan
scientifique, doit sadosser une science existante, moins den crer une autre. Modlisation,
analyse spatiale et SIG nont donc de pertinence que sils sinscrivent dans un champ disciplinaire
appropri qui leur confre un encrage thmatique. Ce dernier permet de disposer dindicateurs qui
ont un sens pour la mesure des relations, davoir des mthodes dlaboration des mesures, etc. Le
champ disciplinaire qui apparat le plus convenable dans le cadre de cette tude est la biogographie
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
32
parce quelle est la branche de la gographie qui sintresse la rpartition des tres vivants la
surface de la terre ainsi quaux causes de cette rpartition.
I.2.4.2
Il est aujourdhui tabli que la distribution des espces animales et vgtales la surface de la terre
nest ni uniforme, ni homogne, ni isotrope. Chacune y occupe une aire qui lui est propre, cest-dire une surface dtendue variable, continue ou discontinue, qui circonscrit lensemble des localits
o les populations despces se rencontrent ltat spontan Lacoste et Salanon, (2006). Cest ce qui
permet la dlimitation des aires de distribution gographique des espces ainsi que celles des autres
units taxonomiques des organismes vivants.
La biogographie qui sintresse la rpartition des espces la surface de la terre en a fait son objet
dtude. De ce fait, elle a dvelopp un paradigme, cest--dire un ensemble de concepts
fondamentaux, dhypothses thoriques gnrales, de dmarches mthodologiques et de techniques
qui font consensus et qui guident la recherche scientifique en son sein Bavoux, (2007). Ainsi, le
paradigme biogographique nous offre un cadre de pense, une perspective thorique et une matrice
conceptuelle dans laquelle nous trouvons les concepts de base ncessaires la thorisation de notre
objet dtude. La plupart des modles cologiques dvelopps tirent leur origine dans ce paradigme
biogographique ainsi que le confirme Guisan et Zimmermann, (2000) en affirmant : The core
theory of predictive modeling of biotic entities originates from major trends published in the field of
biogeography.
Dans cette perspective biogographique, la distribution spatiale des organismes vivants est le rsultat
de linfluence de facteurs tant internes quexternes ceux-ci.
Les facteurs internes aux organismes qui dterminent leurs aires de distribution sont :
-
la capacit de propagation,
lamplitude cologique,
le potentiel dvolution.
La capacit de propagation dun organisme vivant est sa capacit dexpansion. Elle dpend la fois
de son potentiel reproductif et de sa capacit de dissmination. Son potentiel reproductif est son
aptitude produire de nouveaux individus en un temps donn dans des conditions optimales. Ce
potentiel reproductif nexprime pas la capacit de reproduction totale car cette dernire dpend
dautres paramtres comme la longvit, la dure de vie fconde, etc. La capacit de dissmination
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
33
exprime laptitude de lorganisme se dplacer, se disperser dans lespace, soit de faon passive,
soit de faon active.
Lamplitude cologique est la capacit dun organisme occuper une diversit dhabitats. A la
capacit de propagation se combine donc la valence cologique pour dterminer laire potentielle de
rpartition dun organisme vivant, dune espce. La valence cologique exprime la tolrance dune
espce par rapport un facteur de lenvironnement dtermin, tant donn que tout processus
biologique participant au dveloppement dun organisme ne peut seffectuer que dans des limites de
tolrance dtermines pour un facteur donn. Aussi, existe-t-il une limite minimale et une limite
maximale entre lesquelles tout processus biologique est possible dans un milieu donn par rapport
un facteur environnemental. Entre ces limites se situe le prfrendum ou loptimum cologique. Pour
une espce donne, il est possible de dfinir, en sappuyant sur les prfrenda de lensemble des
paramtres, lenvironnement optimal de dveloppement de lespce : la niche cologique thorique
ou potentielle. Dans la nature, il est toutefois difficile de faire concider cette niche potentielle avec la
niche ralise.
Le potentiel volutif recouvre la plasticit intraspcifique, cest--dire la variabilit des caractres
plus ou moins rversibles lintrieur des individus dune mme espce et lis des conditions du
milieu. Il induit tous les phnomnes dadaptation, de slection, de mutation, dhybridation
observables lintrieur dune espce et qui permettent de sadapter efficacement la pression
exerce par les facteurs environnementaux. Le potentiel volutif tient donc compte des phnomnes
de slection et des stratgies adaptatives.
Le milieu constitue un facteur externe dans la distribution des espces la surface de la terre
travers les conditions quil offre. Pour lessentiel, les principaux facteurs externes sont constitus, des
facteurs cologiques que lon dfinit comme tout lment du milieu, biotique ou abiotique,
susceptible dagir sur les tres vivants, au moins durant une phase de leur cycle de dveloppement
(Dajoz, 2006). Les facteurs cologiques peuvent tre regroups en trois types : les facteurs
abiotiques, les facteurs biotiques et les facteurs historiques.
Les facteurs abiotiques sont lensemble des facteurs cologiques non lis un organisme vivant,
comme le climat, le relief, les sols, etc. A loppos, les facteurs biotiques relvent du vivant. Cest
par exemple la comptition pour les ressources (eau, air, lumire, etc.), les phnomnes de prdation,
etc. La distribution actuelle ne peut toutefois sexpliquer entirement que par des facteurs actuels. Le
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
34
recours des faits historiques peut concourir lexplication des distributions actuelles des tres
vivants la surface de la terre.
De la synthse sur les facteurs internes et externes de la distribution des espces la surface de la
terre mergent deux lois : la loi du minimum de Liebig (1840)29 et la loi de tolrance de Shelford
(1911)30. Celles-ci supportent la conception thorique en autcologie, ltude des rapports entre une
espce et lenvironnement.
Par gnralisation de la loi du minimum de Liebig, un facteur cologique est une contrainte pour le
dveloppement de lespce lorsquil est absent ou rduit au-dessous dun seuil critique ou bien sil
excde une limite maximale.
La loi de Shelford dit que chaque tre vivant prsente vis--vis des divers facteurs cologiques des
limites de tolrance entre lesquelles se situe un optimum. Cette loi a trois pour corollaires :
1. une espce a des frquences rduites ou est compltement absente dans un milieu lorsque les
facteurs cologiques de celui-ci ont des intensits proches des limites de tolrance ou lorsque
les limites de tolrance sont dpasses ;
2. en raction aux facteurs cologiques dfavorables, les espces peuvent modifier leur cycle de
dveloppement ;
3. lintrieur dune mme espce, mergent des stratgies adaptatives qui sexpriment en
termes daccommodation, de mutation, dcotypage ou de spciation.
Ces lois contribuent, toutes deux, donner un contenu opratoire au concept de facteur limitant qui
dsigne lensemble des facteurs cologiques qui constituent vis--vis dune espce ou dun taxon
donn, un frein, une contrainte au dveloppement de lespce ou du taxon et jouent donc la fois sur
les frquences de population et sur les stratgies adaptatives.
Nous retenons An. gambiae forme molculaire M et An. gambiae forme molculaire S comme des
espces ayant chacune leurs exigences cologiques propres et le territoire du Burkina Faso comme
milieu ayant une varit de conditions environnementales. Lobjectif tant de modliser la
distribution spatiale dAn. gambiae forme molculaire M et dAn. gambiae forme molculaire S,
nous nous appuyons sur ltude des relations qui existent entre ces espces. Chaque forme est tudie
29
La croissance dun vgtal nest possible que dans la mesure o tous les lments indispensables pour lassurer sont
prsents en quantits suffisantes dans le sol. Ce sont les lments dficitaires, proches du minimum limitant, qui
conditionnent la production des cultures http://agora.qc.ca/mot.nsf/Dossiers/Justus_von_Liebig ;
http://fr.wikipedia.org/wiki/Justus_von_Liebig
30
Pour tout facteur de lenvironnement existe un domaine de valeurs (ou intervalle de tolrance) dans lequel tout
processus cologique sous la dpendance de ce facteur pourra seffectuer normalement
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
35
dans ses relations avec diffrents paramtres du milieu. La biogographie, sous ses aspects
autocologiques, est en phase avec la problmatique et sert de cadre thorique et thmatique.
En adquation avec ce paradigme de la biogographie et lobjectif de cette thse, plusieurs
hypothses peuvent tre formules.
I.2.4.3
La premire hypothse, qui mane du paradigme biogographique et qui est pertinente, est quil
existe une structure dans la distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae au Burkina
Faso. Il est possible dobserver, dans ce pays, une variation de la densit des diffrents membres du
complexe en fonction des conditions environnementales. Les populations des diffrents membres du
complexe sont dautant plus leves dans un milieu que celui-ci prsente des conditions proches de
leur niche cologique thorique. Elles satisfont alors aux exigences cologiques des formes
molculaires, conformment aux lois de Schelford et de Liebig.
La deuxime hypothse est que tous les facteurs cologiques ne contribuent pas de la mme faon
la dtermination de cette structure spatiale observe. Certains facteurs environnementaux peuvent
devenir plus facilement que dautres, une contrainte importante, des facteurs limitant pour le
dveloppement et la propagation de lespce.
De la troisime hypothse, nous retiendrons quil est possible dexprimer les frquences de
population en fonction des paramtres les plus dterminants dans la distribution spatiale des membres
du complexe An. gambiae.
Soient P(m), P(s) les frquences de population respectivement dAn. gambiae de forme molculaire M
et de forme molculaire S.
Soient Em et Es, les facteurs environnementaux dterminants de la distribution respectivement des
formes molculaires M et de S dAn. gambiae s.s. ;
P(m) = f(Em)
P(s) = f(Es)
Es= - Em
Cette hypothse signifie quil est possible, connaissant certains paramtres dun milieu, danticiper
sur les frquences de population de forme molculaire M et S dans ce milieu. Elle suppose galement
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I.2.4.4
31
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
37
Lexistence dune structure spatiale dans la distribution des formes molculaires M et S dAn.
gambiae s.s., en tant quhypothse, repose sur la mise en rapport de la diversit des milieux et des
exigences cologiques. Aussi, une confirmation de cette hypothse renvoie-t-elle une interrogation
sur la caractrisation du milieu qui met en rapport facteurs cologiques et exigences des populations
dAn. gambiae forme molculaire M et forme S, essence mme de la deuxime hypothse. La
question qui se pose est : quels sont les paramtres qui dterminent la distribution spatiale de la
population dAn. gambiae de forme molculaire M et S ? Ces paramtres sentendent alors comme
facteurs cologiques de distribution des espces cibles.
Il sagit moins didentifier la structure des donnes relatives la fois aux populations dAn. gambiae
forme molculaire M et S que de mesurer limpact des facteurs environnementaux sur leur
distribution spatiale. Pour cela, la statistique exploratoire multidimensionnelle est mise contribution
sous sa composante analyse des axes principaux. Compte tenu des objectifs, de la structure et du type
des donnes, lanalyse en composantes principales est retenue comme mthode danalyse des
donnes. En sortie, cette analyse met en exergue les corrlations entre les variables, les axes de
ressemblance et de dissemblance. Elle servira de premire base de tri de variables pertinentes entrant
dans la dfinition de la niche cologique ralise pour chaque forme molculaire M et S An. gambiae
s.s.. Elle ouvre vers la modlisation de la distribution spatiale des membres du complexe.
Lanalyse en composantes principales a permis de rvler la structure des donnes. Lhypothse
relative la mise en relation des facteurs environnementaux et la rpartition spatiale des populations
des formes molculaires An. gambiae s.s. est plus envisageable. La rgression ou lanalyse de la
covariance (ANCOVA) sont des techniques statistiques appropries pour cela. La rgression met en
quation les frquences transformes des formes molculaires prises individuellement et les facteurs
environnementaux. Elle permet dvaluer la possibilit dune prdiction des frquences en fonction
dun ou de plusieurs paramtres environnementaux. Le seuil de confiance retenu pour la rgression
est de 95%. Lapplication dune analyse de la covariance est indispensable si une ou plusieurs
variables nominales se rvlent dterminantes dans la distribution de ces vecteurs du paludisme.
Cette tude vise donc trois objectifs : la description de la distribution spatiale des formes
molculaires M et S dAn. gambiae s.s., lexplication de cette distribution et sa formalisation. Elle
sappuie sur la biogographie qui fournit les hypothses. Lanalyse spatiale et lanalyse de donnes
sont retenues comme mthodes de traitement de linformation pour la vrification des hypothses.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
38
CONCLUSION DU CHAPTIRE I
De ce chapitre, nous retenons que la gographie, de par son objet, son approche et ses outils apporte
une contribution indispensable la connaissance des problmes de sant. Ce travail sinsre dans
cette dynamique douverture de la gographie sur les problmatiques de sant en abordant la
distribution spatiale des vecteurs de maladie en loccurrence les formes molculaires M et S, vecteurs
principaux du paludisme au Burkina Faso. Cela va consister formaliser, travers des modles, les
relations entre ces deux formes molculaires et lenvironnement / lespace. Le paradigme
biogographique savre efficace fournir un cadre thorique et des hypothses prouves afin de
fdrer les contributions des autres disciplines scientifiques et techniques pour atteindre les objectifs
de description, didentification des dterminants environnementaux et de modlisation de la
distribution spatiale des formes molculaires M et S dAn. gambiae au Burkina Faso.
Ce chapitre a ainsi permis de cadrer ce travail de recherche tant au plan conceptuel quau plan
thorique. Toutefois, la dlimitation du thme resterait incomplte tant que le champ dapplication
naurait pas t dfini. Cest lobjet du chapitre suivant consacr la prsentation de lanophle et de
son environnement, le Burkina Faso.
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39
40
15 000 dcs dclars chaque anne surtout parmi les enfants de 0 5 ans CNLP (1994). Daprs la
Banque Mondiale32 citant le Programme national de lutte contre le paludisme du Burkina (PNLP),
environ 5 450 000 cas de paludisme ont t enregistrs, en 2007, dans lensemble des formations
sanitaires du pays. 12 000 cas de dcs sont recenss sur ce nombre soit un taux de ltalit de 2 %.
Chez les enfants de 0 5 ans qui ne reprsentent que 19% de la population,
2 615 000 cas de paludisme ont t enregistrs. En moyenne, chaque enfant de cette tranche dge a
consult un mdecin ou un agent de sant au moins une fois pour le paludisme. Le total des cas de
paludisme enregistrs chez les femmes enceintes est de 154 000 et 94 en sont dcdes. Plus de la
moiti des cas et des dcs par paludisme surviennent pendant la saison pluvieuse, entre aot et
novembre (correspondant la saison de forte transmission de la maladie).
Selon le Programme National de lutte contre le Paludisme (PNLP, 2007)33 au Burkina Faso, cette
maladie reste une endmie stable dans tout le pays, avec une recrudescence saisonnire (mai
octobre). Selon les donnes statistiques du systme national dinformation sanitaire (SNIS), le
paludisme est la premire cause de consultation (35%), dhospitalisation (41%) et de dcs (37%) en
2005. Les enfants de moins de 5 ans restent les plus touchs durant lanne 2005. Dans cette tranche
dge, le paludisme reprsente 45% des motifs de consultation, 55% des hospitalisations et 57% des
dcs.
II.1.2 LA LUTTE CONTRE LE PALUDISME
Au Burkina Faso, le plan stratgique 2006-2010 de lutte contre le paludisme, estim prs de 45
milliards de francs CFA, se rsume en 13 points :
1. rendre disponible et accessible le traitement aux Combinaisons Thrapeutiques base
d'Artmisinine (CTA) au niveau des formations sanitaires et de la communaut ;
2. promouvoir les Interventions Base Communautaire (IBC) par la clarification du statut et
rle des relais communautaires ;
3. rendre accessible le traitement du paludisme grave dans les centres de rfrence ;
4. acclrer le passage lchelle de la Prise en Charge Intgre des Maladies de lEnfant
(PCIME) ;
5. promouvoir la lutte intgre contre les vecteurs (LIV) ;
32
http://web.worldbank.org/WBSITE/EXTERNAL/ACCUEILEXTN/PAYSEXTN/AFRICAINFRENCHEXT/BURKI
NAFASOINFRENCHEXTN/0,,contentMDK:21744044~pagePK:1497618~piPK:217854~theSitePK:463455,00.html
33
PNLP, 2007, Plan stratgique de lutte contre le paludisme 2006-2010,
http://209.85.129.132/search?q=cache:T1SAeMEEo0YJ:www.rollbackmalaria.org/countryaction/nsp/burkina.pdf+PNL
P+Burkina+p%C3%A9riode+de+transmission&cd=7&hl=fr&ct=clnk&gl=fr&client=firefox-a
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
41
6. rendre disponibles et accessibles les moustiquaires traites aux insecticides (MTI) travers
diffrents canaux (Secteur public, priv) ;
7. mettre lchelle le traitement prventif intermittent (TPI) chez la femme enceinte ;
8. renforcer le plaidoyer, la mobilisation sociale et la communication pour le changement de
comportement CNLP, (2007) ;
9. renforcer les capacits institutionnelles du PNLP ;
10. renforcer le partenariat et la collaboration multisectorielle dans la lutte contre le paludisme;
11. orienter les domaines de recherche adapts aux besoins de gestion du programme ;
12. contribuer la ralisation des travaux de recherche sur le paludisme ;
13. renforcer le systme de suivi valuation.
La lutte antipaludique a t dfinie comme lensemble des mesures destines supprimer, ou tout au
moins rduire, la mortalit et la morbidit dues au paludisme O.M.S, (1974). Elle comporte des
actions curatives fondes sur la chimiothrapie des malades, et des actions prventives bases sur la
chimioprophylaxie et/ou la rduction du contact homme/vecteur.
II.1.2.1
La lutte contre le parasite repose sur la chimiothrapie des malades et la chimioprophylaxie pour les
groupes risques (femme enceinte, enfant de moins de 5 ans et personnes provenant de zones non
impaludes). Cette chimiothrapie connat des limites aujourd'hui cause de lapparition de souches
de Plasmodium rsistantes aux antipaludiques Charmot, (1987); Wernsdorfer, (1991).
II.1.2.2
La lutte anti-vectorielle repose actuellement sur deux types de mthodes savoir : les mthodes de
lutte anti-larvaire et celles contre les adultes. La lutte anti-larvaire consiste rduire les populations
danophles
leur
source
de
production.
Trois
mthodes
sont
couramment
utilises :
-
les mthodes physiques, par suppression des gtes larvaires Mouchet et Carnevale, (1991) ;
les mthodes chimiques, par utilisation de substances chimiques (huile, vert de Paris ou
acetoarsenite de cuivre) qui dtruisent les larves Service, (1993) ;
les mthodes biologiques, par levage de poissons larvivores (Gambusia affinis, Poecillia
reticulata) ou par pandage dans les gtes, de bactries (Bacillus thuringiensis israeliensis,
Bacillus sphaericus) empchant le dveloppement des larves Lacey et al., (1984).
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
42
Les mthodes de lutte contre les anophles adultes reposent sur lutilisation de barrires physiques,
de rpulsifs ou dinsecticides Diabat, (1999); Ilboudo-Sanogo, (2001). Lusage des matriaux
imprgns dinsecticides pose la question de la consquence de la rduction de la transmission du
Plasmodium sur limmunit des enfants en bas ge dans les zones hyper-endmiques Binka et al.,
(1996); Nbi, (2002); Snow et Marsh, (1995). Tous ces problmes font quil existe aujourdhui peu
doutils efficaces pour lutter contre le paludisme, do la ncessit denvisager dautres mthodes de
lutte en attendant la mise en place dun vaccin.
II.1.2.3
Face aux doutes de la communaut scientifique vis vis de leffet des matriaux imprgns
dinsecticides Binka et al., (1996); Nbi, (2002); Quinones et al., (1997); Snow et Marsh, (1995);
Trape et Roger, (1996) et dans lattente dun vaccin efficace et financirement accessible, il apparat
ncessaire de dvelopper dautres mthodes de contrle vectoriel. Parmi ces mthodes, la lutte
gntique apparat comme une alternative intressante.
La lutte gntique envisage est le remplacement ventuel des populations vectrices sauvages par
dautres trans-gniques incapables de transmettre le parasite par lintroduction de gnes de rsistance
au Plasmodium au sein de la population vectorielle Curtis, (1996); Carlson et al., (1995). Avec le
squenage du gnome dAnopheles gambiae publi en 2002 Holt et al., (2002), il devient possible
de dvelopper de nouvelles cibles pour le contrle de la transmission.
Quelle que soit la stratgie de lutte anti-vectorielle adopte, la caractrisation exacte des espces, la
connaissance de leur bio-cologie, du flux gntique entre elles et leur rpartition spatio-temporelle
constituent un pralable si lon veut rendre la lutte plus slective et plus efficace.
II.1.3 LE CYCLE DE TRANSMISSION DU PALUDISME
Le cycle de dveloppement des Plasmodium comporte deux phases : une chez le moustique et une
autre chez lHomme (figure 1).
Chez lhomme, par sa piqre, la femelle de lanophle infeste inocule des centaines de parasites (les
sporozotes) qui gagnent rapidement le foie o ils se multiplient. Au bout de 9 18 jours selon
lespce de Plasmodium, les parasites qui se trouvent sous une forme appele mrozote, passent
dans le sang, envahissent les hmaties et se multiplient nouveau. Aprs un certain nombre de
multiplications, certains mrozotes se transforment en gamtocytes mles et femelles.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Le moustique sinfeste en piquant une personne dont le sang contient des gamtocytes. Le
dveloppement des parasites dans lorganisme de linsecte aboutit une nouvelle gnration de
parasites, les sporozotes qui migrent vers les glandes salivaires o ils demeurent jusqu ce que
linsecte pique de nouveau un individu. Et un nouveau cycle reprend ainsi.
.
Figure 1 : cycle du plasmodium, http://www.traveldoctor.co.uk/malaria.htm
II.2
Connatre la bio-cologie dune espce est une condition sine qua non ltude de sa rpartition dans
un espace donn. Il est difficile de saisir les rapports entre un milieu et un organisme sans connatre
loffre cologique de ce milieu et les exigences vitales de lespce. Ce paragraphe est un expos sur
la bio-cologie dAnopheles gambiae. Mme si la connaissance de ce complexe despces par
rapports aux diffrents facteurs cologiques pris individuellement nest pas toujours trs prcise, une
synthse de celle-ci constitue une avance significative dans la conduite de ce projet.
Ce point, consacr la bio-cologie des anophles, sarticule autour de la position zoologique de
celles-ci, de leur cycle de dveloppement et de leur cologie diffrents stades de dveloppement.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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est constitue de 3 genres (Bironella ; Chagasia ; Anopheles). Le genre Anopheles est le plus
important sur le plan mdical. Il regroupe 400 espces dont 70 sont des vecteurs de maladies
humaines Bruce-Chwatt et Zulueta, (1985).
chromosomiques polymorphes mises en vidence par coloration des chromosomes gants isols des
glandes salivaires des larves au stade IV ou des ovaires des femelles semi-gravides Green, (1972).
Les progrs de la biologie molculaire ont alors permis le dveloppement de sondes ADN
spcifiques Collins et al., (1987); Crampton et Hill, (1993) qui ont dbouch sur la mise au point
dun test diagnostic bas sur lamplification par PCR des gnes codant pour les ARN ribosomaux
Scott et al., (1993). Ce test permet lidentification rapide des spcimens collects sur le terrain, quels
que soient le sexe et le stade de leur dveloppement. Il ncessite trs peu de matriel de dpart. Son
34
Un complexe despces est un ensemble despces jumelles parce que morphologiquement trs voisines, voire indiffrentiables, dont lidentification
demande lutilisation de critres mixiologiques, cytogntique, biochimique ou molculaire. Chaque espce dun complexe prsente des
comportements, une cologie et des comptences vectorielles spcifiques. (J. Mouchet et al. 2004)
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46
II.2.3.1
Cette phase dbute avec la ponte des ufs la surface de leau. Les ufs au nombre de 30 300 par
ponte sont dposs un un la surface de leau et flottent jusqu lclosion. Sous les tropiques, les
ufs closent habituellement 2 3 jours aprs la ponte Rodhain et Perez, (1985). La larve merge en
utilisant une dent duf place en position postro-dorsale sur sa tte. Elle possde les trois
tagmes caractristiques des insectes, cest dire la tte, le thorax et labdomen. La larve est
dpourvue de pattes mais possde de nombreuses soies qui recouvrent tout le corps. Elle est capable
de nager dans leau grce des mouvements ondulants de son corps. Elle respire lair extrieur par
des stigmates dorsaux situs lextrmit de labdomen, ce qui lui impose une position de repos
parallle la surface de leau.
Les larves ne se dveloppent pas en continu, elles passent par quatre stades diffrents. La petite larve
qui merge de luf est appele larve de premier stade ou larve de stade I. Elle mesure environ 1,5
mm de long et subit trois mues successives qui la transforment en larve de stade II, III et enfin de
stade IV. La larve de 4e stade mesure environ 8 10 mm de long. La vie larvaire dure de 8 12 jours
dans des conditions favorables Rodhain et Perez, (1985).
La larve de quatrime stade, au terme de son dveloppement, se transforme en une nymphe, dont la
forme gnrale est celle dune virgule. La nymphe ne se nourrit pas, elle reprsente un stade
intermdiaire. Elle subit de trs profondes transformations morphologiques et physiologiques pour
36
Yazoum Y, 2005, Incorporating environmental factors in modelling malaria transmission in under five children in rural Burkina Faso, doctor
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
47
donner un moustique adulte arien aprs une priode de 1 4 jours sous les tropiques Rodhain et
Perez, (1985).
II.2.3.2
Ladulte ou imago qui merge de la nymphe est un insecte au corps long et grle, dot de longues
pattes et de longues pices buccales en forme daiguille. Peu aprs leur mergence, les adultes (mles
et femelles) senvolent et les femelles saccouplent aussitt avec des mles plus gs qui essaiment
au-dessus de leau. En gnral, les femelles ne saccouplent quune seule fois dans leur vie, mais
pondent priodiquement pendant toute leur existence. Les spermatozodes sont stocks dans une
spermathque o ils conservent leur pouvoir fcondant jusqu la mort de la femelle Bruce-Chwatt et
Zulueta, (1985).
Aprs 24 48 heures de vie adulte, la femelle va la recherche de son premier repas sanguin. Elle a
besoin de sang comme source de protines pour le dveloppement et la maturation de ses ufs. Ds
la fin du repas, commence la digestion et simultanment les ovaires se dveloppent. Les femelles
gravides se mettent en qute dun lieu favorable la ponte. La fcondation de lovule a lieu lors de la
ponte. Une fois quelles ont dpos leurs ufs, elles retournent prendre un autre repas de sang pour
aller pondre nouveau et le cycle reprend. La longvit de ladulte est estime une vingtaine de
jours, gure plus dun mois dans les conditions habituelles Robert et al., (1989). La priode allant du
repas sanguin la ponte est appele cycle gonotrophique. Elle dure environ 48 heures dans les
conditions de tempratures comprises entre 23C et 25C Bruce-Chwatt et Zulueta, (1985).
Le cycle gonotrophique comprend trois phases :
- la recherche de lhte et la prise du repas de sang,
- la digestion du sang et la maturation ovarienne,
- la recherche du lieu de ponte par la femelle gravide.
La ponte a lieu gnralement au crpuscule. Les caractristiques physico-chimiques de leau des
gtes sont analyses par des chmorcepteurs situs sur les pattes.
48
Les anophles prsentent galement des choix pour leur repas sanguin. De nombreuses espces
danophles se nourrissent la fois sur lhomme et sur lanimal. Certaines espces prennent leur
repas sanguin principalement sur les animaux. Ce sont des zoophiles. Dautres ne se gorgent
pratiquement que sur lhomme. Ce sont des anthropophiles. Les espces anthropophiles ont un taux
dinfection plus lev que les zoophiles White, (1974).
Les vecteurs de paludisme sont ingalement repartis sur les continents. En Afrique subsaharienne,
Anopheles gambiae sensu lato et Anopheles funestus sont les vecteurs majeurs du paludisme
Mouchet et Carnevale, (1991). Anopheles gambiae s.s. et An. arabiensis sont les deux espces du
complexe les plus rpandues Tour, (1988). Leurs aires de rpartition se chevauchent partiellement :
An.gambiae s.s. est classiquement adapt aux zones de forts et de savanes humides alors quAn.
arabiensis peuple les environnements plus secs jusquen bordure du Sahara Chauvet et al., (1969);
Coluzzi et al., 1979; Coz, (1973).
En zone de savane, ils sont souvent en sympatrie et trs bien adapts lhomme et son
environnement. Ils se comportent comme des espces endophiles et anthropophiles. Cest auprs de
lhomme quelles trouvent les gtes larvaires et ceux de repos qui leur conviennent le mieux Coluzzi,
(2002); Gillies et Meillon, (1968). Cependant An. arabiensis est plus zoophile et exophile
quAn.gambiae s.s. Costantini et al., (1998); Robert et Carnevale, (1984); White, (1974). Daprs
Rajagopalan et al., (1991), la plupart des anophles se dispersent dans un rayon denviron un
kilomtre autour de leur gte. Pour An. gambiae s.s., ce rayon de dispersion autour des gtes varie en
moyenne entre 1 et 1,6 km. Ce rayon est de 0,8 km pour An. funestus.
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Une htrognit temporelle dans la composition des gtes a t observe au Mali Sangar, (2000);
Tour et al., (1998). Pour Le-Sueur et Sharp, (1988), les paramtres tels que le pH, loxygne
dissous, la turbidit nexpliquent pas la distribution des membres du complexe An. gambiae deau
douce au Natal.
Dautres tudes nont pu mettre en vidence une relation entre les facteurs environnementaux et la
rpartition des membres du complexe An. gambiae Minakawa et al., (1999); Robert et al., (1998);
Ye-Ebiyo et al., (2003). Pour Minakawa et al., (1999), labondance dAn. gambiae s.s. serait associe
la proximit des concessions. Koenraadt et al., (2004), ont mis en vidence les effets de la
prcipitation et de lvapotranspiration sur la dynamique temporelle des membres du complexe An.
gambiae au Kenya.
Au Burkina Faso, les larves An. arabiensis et An. gambiae tendent occuper des gtes spcifiques.
Selon Sagnon, (1999), il est probable, au regard des statistiques sur la structure de la population
larvaire des trois taxa, que An. gambiae forme molculaire M se reproduit prfrentiellement dans
des gtes de nature plus permanente. La reproduction dans les gtes temporaires reprsente pour cette
espce seulement un deuxime choix, tandis que An. arabiensis et An. gambiae forme molculaire S
sont plus adapts se reproduire dans les gtes temporaires.
Cette diffrence dans loccupation des gtes par ces trois taxa du complexe An. gambiae pourrait
sexpliquer par des proprits de rpulsion inter-spcifique des derniers stades larvaires Guelbeogo,
(1999); MC-Crae, (1984). Dans tous les cas, linfluence des facteurs environnementaux dans cette
rpartition nest pas encore bien connue Charlwood et Edoh, (1996); Sagnon, (1999). La
connaissance de la bio-cologie des larves savre indispensable si lon veut laborer des stratgies
efficientes de lutte antivectorielle.
Fort de cette prsentation de la bio-cologie du complexe An. gambiae, nous pouvons dfinir son
environnement.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
50
partir dune synthse de son cycle de vie. Cette synthse sur la bio-cologie du complexe nous
permet de prsumer des facteurs environnementaux qui peuvent influencer sa prolifration.
Trs souvent, les facteurs climatiques comme les prcipitations, les tempratures, et linsolation sont
considrs. La disponibilit et laccessibilit en eau sont deux autres paramtres importants parce
quelles intervenent dans la biologie des larves. La qualit de leau (taille, Ph, stabilit, coulement,
etc.) dpend du contexte physique. Ce sont autant dlments qui obligent intgrer des paramtres
tels que la topographie (altitude) et la disponibilit de la matire organique. La prsence humaine
(ncessit dun repas sanguin pour la maturation des ufs) et la vgtation (alimentation en jus sucr,
lutte contre les prdateurs) interviennent aussi dans la dfinition de lenvironnement du vecteur.
Lenvironnement dAn. gambiae s.s., simple premire vue, est plus complexe quil ne le parait.
Cette complexit est lie la ncessit dune variation des exigences en fonction du stade de
dveloppement double dune variation en fonction du membre du complexe concern. Prendre en
compte la forte variabilit saisonnire de certains paramtres environnementaux tels que la
disponibilit en eau, le climat, conduit un niveau trs lev de complexit. De plus, la mesure ou
lvaluation objective de certains paramtres ne sont pas videntes compte tenu de lextension
spatiale de la zone dtude.
De cette prsentation sur les anophles, nous retenons quil ny a pas un vecteur du paludisme mais
plutt des vecteurs du paludisme au regard de la diversit des espces qui composent le complexe An.
gambiae.
Les tudes sur la biologie et lcologie des vecteurs du paludisme sont trs riches mais non
spcifiques aux espces cibles dans cette tude. Ainsi, ltat de la connaissance sur la
bio-cologie des anophles est-il ouvert et la dfinition dun biotope prcis pour les anophles
devient trs complexe. A cette diversit spcifique des anophles, sajoutent, pour une mme espce,
des exigences cologiques variables en fonction du stade de dveloppement. Le niveau de complexit
devient alors trs lev et impose de rduire le champ dinvestigation, do la limitation aux formes
molculaires S et M. Le contrle de la population vectorielle ne pouvant se concevoir en dehors de
lenvironnement de vie de celle-ci, il est indispensable de comprendre les dterminants msologiques
de distribution des formes molculaires S et M dAn. gambiae. Cest lobjet de la section trois de ce
chapitre.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
51
II.3
Le Burkina Faso est un pays situ au cur de lAfrique occidentale, entre 530 de longitude ouest et
240 de longitude, est et entre 930 et 1515 de latitude nord. Il est limit au nord et au nord-ouest
par le Mali, lest par le Niger, au sud-est par le Bnin, au sud par le Togo, le Ghana, et au sud-ouest
par la Cte dIvoire (Figure 3). Sa superficie38 est de 274 200 km2. Quelles sont les caractristiques de
ce pays, tant au plan physique quhumain, qui pourraient contribuer mesurer et expliquer la
distribution spatiale des populations des deux formes molculaires An. gambiae s.s. ?
37
Les lments utiliss pour la prsentation du Burkina Faso, le site de ltude, ont t retenus sur la base de leur
contribution la comprhension de la rpartition des formes molculaires M et S dAn. gambiae (section prcdente).
Nous avons choisi de faire une prsentation trs visuelle, graphique parce que nous voulons faire un modle spatial.
Cette forme est plus efficace dans la communication. Cest pourquoi, nous avons prfr utiliser des cartes, des
graphiques et des tableaux.
38
http://www.primature.gov.bf/burkina/infopratique/fsites.htm
http://www.inforoute-communale.gov.bf/col_cadre1.htm
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
52
Le Burkina Faso est compos de 8 200 villages39 et secteurs repartis en 351 communes/dpartements,
45 provinces et 13 rgions qui sont des circonscriptions administratives et des collectivits
territoriales dcentralises.
II.3.1
LA POPULATION
La population du Burkina Faso est de 13 117 100 habitants40. Cette population est compose de plus
de 72 ethnies classes en 7 groupes linguistiques : langues Berbre, Dogon, Kru, Ouest Atlantique,
Gur ou Voltaque, Manden, Nilo Saharien (Figure 4)
Ces ethnies ont des organisations sociales et politiques diffrentes. Certaines sont des socits trs
hirarchises et sdentarises qui formaient, avant la colonisation, de puissants empires. Cest le lieu
de citer lempire des Mosss, le royaume des Gulmacma, les Emirats du Liptako et du Yagha,
etc. Ces entits politiques fortes occupent aujourdhui les parties centre, nord et est du pays. Les
rgions sud et ouest du pays sont occupes par des socits plutt segmentaires, avec des systmes
politiques trs peu centraliss, et sont connues sous le nom de socit acphale ou anarchiquo-
39
Les villages sont des localits dotes du statut de village dans lorganisation du territoire au Burkina Faso. Il nest pas
confondre avec la localit qui est plus gnrique.
40
http://www.insd.bf/
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
53
dmocratique. Ce sont les ethnies comme les Lobi, les Dagara, les Bwa, les Gourounsi, les Pougouli,
les Dioula, les Senoufo, etc.
La consquence dune telle diversit culturelle et politique est la structuration spatiale des densits de
populations et des implantations humaines (Figure 5). La distribution de centres urbains et les
dcisions de politique damnagement interviennent pour nuancer cette rgle de distribution des
densits. La densit moyenne de la population du Burkina en 200641 est de 47 habitants au km2. Elle
cache cependant des disparits. Les densits de population sont beaucoup plus fortes dans les rgions
danciens empires dans la partie centrale du pays. La Rgion Centre du Burkina a la densit la plus
leve du pays avec 460 habitants au km2, dans la province du Kadiogo. En plus dabriter le plus
grand centre urbain (Ouagadougou, plus dun million dhabitants), cette rgion tait le ple de
convergence et la capitale politique de lempire des Mosss.
Les densits les plus faibles sont observes dans la Rgion de lEst, avec les provinces de la
Komondjari et de la Kompienga qui comptent respectivement 9 et 12 habitants au km2. A lest, le
41
http://www.insd.bf/donnees/donnees_structurelles/T0317.htm
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
54
classement de nombreuses zones en parcs nationaux justifie sans doute les faibles densits de
population. Plus de 60% des aires protges du Burkina Faso sont situes dans cette rgion.
Lextrme nord connat de faibles densits de population. Mme si lEmirat du Liptako sy trouve,
cette partie du pays est plus propice lactivit dlevage qu lagriculture. Les populations y
partiquent plutt une activit pastorale transhumante.
Par contre, le sud et louest concentrent, en dpit des densits de populations relativement faibles, de
forte dimplantations humaines. Ce qui est rvlateur du caractre trs segmentaire des structures
sociopolitiques. En outre, cette zone tait jadis trs peu hospitalire en raison de son infestation par
de grandes endmies comme la ccit de rivires ou la maladie du sommeil.
Du point de vue de la rpartition des populations, les densits diminuent du centre vers les
extrmits. Lhistoire du peuplement et
pays sont
vraisemblablement les causes de cette organisation spatiale des densits de population. Le milieu
biophysique prsente une organisation et une structure diffrentes. Cest lobjet de la suite de cette
section consacre la prsentation du milieu qui sarticule autour de la gomorphologie, du climat,
de lhydrographie et de la vgtation.
II.3.2
LE RELIEF
Le Burkina Faso se caractrise par un relief plat, quasi monotone. Cest une vaste pnplaine
parseme dlvations de quelques dizaines de mtres de commandement. Le point le plus haut du
pays, le Mont Tnakourou, culmine 749 mtres. L'altitude moyenne est de 400 m. Prs de la moiti
du pays se situe entre 250 et 350 mtres daltitude et plus de 98 % entre 160 et 480 m. La dnivel
maximale ne dpasse pas 600 m (Figure 6).
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
55
Dun point de vue gologique, le Burkina Faso est situ sur le craton Ouest Africain. Cinq grandes
priodes marquent la mise en place des formations gologiques du Burkina Faso :
-
de
granito-migmatiques.
Ces
formations
couvrent
plus
de
Du faonnement de ces roches, nous retenons quatre grands domaines gomorphologiques (Figure 7).
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
56
1- le domaine granitique. Il est plat avec, par endroit des reliefs rsiduels de type chaos de blocs
issus de lrosion diffrentielle lie lintrusion des venues volcaniques ;
3- le domaine sdimentaire, dominance grseuse, stend sur louest et lextrme est du pays.
Il domine les formations du socle avec des altitudes allant de 450 500 m. Le contact trs
marqu avec les formations du socle a permis de dgager des escarpements trs abrupts ;
LES SOLS
Les sols sont trs diversifis au Burkina Faso. La carte pdologique du Burkina Faso au
1/500 000 compte 11 classes42 (Tableau 1).
42
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
57
Superficie en km2
% de la superficie
14481,25
7624,3
5,32
2,8
68263,12
25,07
12911,9
8854,53
48081,52
4729,6
12684,72
84185,05
2180,01
8311,52
4,74
3,25
17,66
1,74
4,66
30,92
0,8
3,05
II.3.4
LE CLIMAT
Le climat du Burkina Faso est rgl par trois vents dominants issus de trois zones de haute pression
que sont les anticyclones : lanticyclone de Ste Hlne, lanticyclone des Aores et lanticyclone
temporaire du Sahara qui renforce le prcdent
Le premier de ces vents, communment appel Mousson, est un aliz provenant de lanticyclone de
Ste Hlne dans locan Atlantique. Il souffle du sud-ouest vers le nord-est dans lhmisphre Nord.
Cest un vent humide. Le second, lHarmattan, est galement un aliz. Il est issu de lanticyclone du
Sahara. Cest un vent temporaire sec et desschant, froid la nuit et chaud le jour. De direction nordest / sud-ouest dans lhmisphre Nord, il souffle en sens oppos celui provenant de Ste Hlne. Il
relaie le vent issu de lanticyclone des Aores, au large des ctes portugaises. La rencontre de ces
deux vents cre le front intertropical (FIT) ou convergence intertropicale (CIT). Le balancement du
FIT, conjugu avec la position en latitude, dtermine un gradient climatique de direction nord-nordest sud-sud-ouest. La Figure 8 illustre cela.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
58
Ces deux courbes reprsentent, le long dun transect de 800 km orient nord-nord-est sud-sudouest, les valeurs moyennes des prcipitations et des tempratures. Sur ce transect, les prcipitations
augmentent du nord-nord-est vers le sud-sud-ouest. Les tempratures diminuent, quant elles, en
sens oppos. Les prcipitations passent ainsi de plus de 1000 mm de pluie par an Loumana,
Banfora, Farakoba, Legmoin, Bati, au sud-ouest moins de 500 mm Dori, Gorom-Gorom,
Markoye, Djibo au nord. La pluviosit densemble du pays est de 777 mm. La droite de tendance
spatiale du profil des prcipitations a une pente ngative, avec une diffrence denviron 650 mm de
pluie entre lextrme nord et lextrme sud-ouest. A loppos, les tempratures moyennes
augmentent de 27,6C Dibougou, 29,45C Dori, soit une amplitude peine suprieure 2,5C.
La droite de tendance du profil des tempratures est largement positive.
Sur le plan des tempratures, 4 saisons thermiques se distinguent :
-
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
59
La station de Dori est situe au nord du pays, celle de Kamboinc au centre et celle de Farakoba au
sud-ouest. Sur ces trois stations, les courbes de tempratures sont bi-modales. Le premier maximum
se situe entre le mois davril et le mois de mai, et le second entre le mois de septembre et doctobre.
Les moyennes des tempratures maximales observes entre 1975 et 2005 sont toujours suprieures
25C pour lensemble des stations. Elles varient entre 42,2C Dori au nord et 29,3C Bobo
Dioulasso au sud-ouest.
Les minima sont observables au mois daot puis entre les mois de dcembre et de janvier pour
toutes les stations et demeurent toujours suprieures 10C. Les moyennes des tempratures
minimales, quant elles, varient de 28,1C Dori 13,3C dans la valle du Kou au sud-ouest.
Lamplitude thermique moyenne annuelle est de 13,3C. Elle varie galement du nord au sud-ouest,
entre 16,4C Dionkl, au centre-nord et 11,3C Niangoloko, lextrme sud ouest.
Sur le plan des prcipitations, la courbe est uni-modale, avec un maximum au mois daot pour
lensemble des stations. Cela tmoigne de lexistence, au plan pluviomtrique, de deux saisons
fortement contrastes par rapport aux saisons thermiques. La premire est pluvieuse et intervient
entre mars et juin. La seconde est sche et se manifeste entre septembre - octobre et avril - mai.
La mise en rapport des tempratures et des prcipitations, travers des climogrammes dans trois
stations (Figure 10), permet dobserver des courbes dallure trs allonge.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
60
La droite dquation (P=2t) permet de dlimiter deux saisons : la premire, humide, appele
hivernage, longue de 3 5 mois; elle intervient entre la troisime dcade davril et la troisime
dcade doctobre au sud-ouest et entre la troisime dcade de juin et la premire dcade doctobre au
Nord. La dernire, sche contraste avec lhivernage. Dune dure de 7 mois au sud-ouest contre 9
mois au nord, elle occupe le reste de lanne (Figure 11).
Le Burkina Faso est donc un pays chaud. Il est caractris par des tempratures toujours leves avec
des amplitudes thermiques faibles. Les prcipitations marquent fortement les diffrences entre les
saisons et varient entre 1 200 mm lextrme sud-ouest et 450 mm au nord. Cest un climat tropical
allant du pr-guinen humide dans lextrme sud-ouest au sahlien dans le nord. Entre ces deux
extrmes, les variantes observes reposent essentiellement sur les volumes des prcipitations et sur la
dure de la saison pluvieuse.
Le climat, travers les prcipitations et lvaporation, influence normment la dynamique des cours
deau.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
61
II.3.5
LHYDROGRAPHIE43
Le rseau hydrographique du Burkina relve de trois bassins internationaux que sont : la Volta, le
Niger et la Como auxquels sajoute un systme endorique. Ces trois bassins correspondent,
lintrieur du pays, quatre bassins nationaux que sont : le Mouhoun, le Nakamb, la Como et le
Niger. Chacun de ces systmes hydrographiques est compos des principales rivires dont les bassins
versants structurent le drainage des eaux.
Dans le Tableau 2, ci-dessous, sont prsents les diffrents bassins versants internationaux, les bassins
nationaux, les sous bassins hydrographiques, ainsi que les bassins endoriques.
Tableau 2 : Les bassins hydrographique du Burkina Faso
Bassin international
Bassin national
Sous-bassin national
Superficie (km2)
Comoe
Comoe
Como-Lraba
17 590
Niger
Niger
83 442
Beli
15 382
Gorouol
7 748
Darjol
1 709
Faga
24 519
Sirba-Gouroubi
11 946
Bonsoaga
7 231
Dyamangou
3 759
Tapoa Mekrou
5 707
Banifing
5 441
VOLTA
172 968
Nakamb
81 932
Pendjari-kompienga
21 595
Nakamb
41 407
Nazinon
11 370
Sissili
7 559
Mouhoun
Bassin endroique
Bassin endroique
91 036
Mouhoun suprieur
20 978
Mouhoun infrieur
54 802
Sourou
15 256
Bassin endroique
300
BURKINA FASO
274 300
bassin
de
la
Como,
qui
couvre
une
superficie
de
43
Cette prsentation de lhydrographique sappuie essentiellement sur la Carte de LAfrique de lOuest, 1 : 500.000,
Institut Gographique National; Paris ; le Rapport sur lEtat de lEnvironnement au Burkina de 2002, la Banque
nationale de donnes topographique Burkina et Programme GIRE
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
62
17 590 km, comptait en 2000, 27 barrages et 20 lacs naturels. Le bassin du Nakamb qui a une
superficie de 81 000 km, abrite plus de 400 barrages dont les plus importants du pays. Il abrite : les
barrages hydrolectriques de Bagr et de la Kompienga et le barrage de Ziga. Sy retrouvent aussi de
nombreux lacs naturels comme celui de Dem, de Bam. Daprs la Direction des Ressources en Eau
du Burkina, plus de 800 barrages fonctionnels ont t inventoris en 2006.
La Figure 12 prsente lhydrographie du Burkina Faso travers les grandes rivires, leurs affluents et
leurs bassins versants.
Figure 12 : Les principaux cours deau et leur bassins versants au Burkina Faso
Il apparat sur ce rseau que les cours deau les plus importants se situent tous dans la partie ouest et
sud du pays. Par ailleurs, la plupart de ces cours deau, lexception du Nakamb, prennent leur
source sur les hautes terres du sud-ouest, dans la rgion des Hauts Bassins. Ceci renforce le caractre
pluvial des rgimes hydrologiques.
Ce rseau hydrographique du Burkina Faso est compos essentiellement de cours deau rgime
pluvial tropical, fortement tributaire des prcipitations. Ceux-ci sont, pour lessentiel, intermittents
avec des coulements qui sarrtent quelques jours quelques semaines seulement aprs les
prcipitations Som, (2000). Moins dune dizaine d'entre eux sont permanents et coulent toute
lanne. La plupart des cours deau connaissent leur dbit maximum en fin aot dbut septembre,
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
63
pendant la priode de maximum pluviomtrique. En contrepartie, les tiages sont trs svres. Ils
interviennent juste avant le dbut de la saison de pluies qui se situe entre la fin du mois davril et le
dbut du mois de juin selon la position gographique. Il arrive souvent que les coulements arrttent
compltement. Dans un milieu o la disponibilit en eau constitue une contrainte majeure,
lorganisation du couvert vgtal est fortement influence par le climat et lhydrographie.
II.3.6
LA VEGETATION
Le premier couvre environ 35% du territoire et se situe au nord du pays, partir du 13me parallle.
Sa limite sud, la plus pluvieuse, concide plus avec lisohyte 650 mm. Le second, occupe un peu
plus de la moiti sud du pays, au sud du 13me parallle. Lisohyte 650 mm correspond sa limite la
plus sche. Des diffrences de facis sont perceptibles dans les diffrents domaines
phytogographiques (Figure 14).
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Le domaine sahlien est celui des steppes. Les formations steppiques prsentent des variantes allant
dune steppe presque sans espces ligneuses celle arbustive, voire arbore. Elles ont deux facis
majeurs appels secteurs :
-
le secteur nord sahlien caractris par des steppes herbeuses Aristida spp et des steppes
herbeuses arbustives Cenchrus biflorus, Combretum glutinosum, Balanites aegyptiaca ;
le secteur sud sahlien, plus humide est le domaine de steppes avec une prsence
relativement plus abondante de ligneux. Ce sont des steppes arbustives arbores truffes de
fourres et domines essentiellement par des combretacs et des espces arbustives du genre
Acacia (Acacia tortilis ssp. Acacia raddiana, Acacia laeta, Combretum spp.). Les valles de
ce secteur abritent quelques savanes arbores Butyrospermum parkii44, Lannea microcarpa,
Acacia albida.
Le domaine soudanien est celui de la savane, avec un tapis herbac haut et continu comparativement
au domaine sud sahlien. Cette savane prsente de nombreux facis regroups en deux secteurs
phytogographiques : le secteur nord soudanien et le secteur sud soudanien.
-
Le secteur nord soudanien est constitu pour lessentiel de savanes fortement anthropises du
fait des densits de population leves. Il correspond des savanes arbustives arbores
Combretum spp, Anogeisus leiocarpus, Butyrospermum parkii, Laenna spp. Il renferme aussi
des savanes parcs domines par des espces arboricoles trs utilitaires et protges. Ce sont
en gnral les parcs Butyrospermum parkii, Parkia biglobosa, Adansonia digitata et
Tamarindus indica.
Le secteur sud soudanien, quant lui, est constitu pour lessentiel de savane arbore
boise avec comme espces dominantes Burkea africana, Butyrospermum parkii,
Pterocarpus erinaceus, Parkia biglobosa. Il abrite aussi des forts claires avec des espces
dominantes telles que Isoberlinia doka, Burkea africana, Terminalia spp. Les valles des
principales rivires tels comme Mouhoun sont colonises des forts galeries trs denses,
Berlinia grandifolia, Daniellia oliveri, Mitragyna inermis et quelques reliques de palmiers
rafia.
La vgtation est donc organise suivant un gradient nord-nord-est sud-sud-ouest comme le climat.
44
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66
CONCLUSION DU CHAPITRE II
Au Burkina Faso, le paludisme constitue un problme majeur de sant publique. La stratgie de lutte
contre cette maladie y est multiforme et intgre la lutte contre le vecteur, lanophle. Les anophles
constituent un complexe despces. A cette diversit spcifique des anophles, sajoutent, pour une
mme espce, des exigences cologiques variables en fonction du stade de dveloppement. Compte
tenu du niveau de complexit de la question et de la ncessit de rduire le champ dinvestigation,
nous limitons notre tude aux formes molculaires M et S.
Le Burkina Faso est un pays de transition entre le dsert du Sahara et les zones forestires trs
humides du Golf de Guine. Sur moins de 600 km vol doiseau, il stend du Sahel, o les
prcipitations sont de lordre de 300 mm par an, la zone soudanienne pr-guinenne, avec plus de
1 200 mm/an, soit 900 mm dcart. Ce pays se caractrise galement par son relief plat, une diversit
au niveau gomorphologique et un rseau hydrographique dense qui effacent la monotonie sousjacente. Il prsente aussi une diversit culturelle double dune variation de densits rgionales de
population. Ces densits oscillent entre 10 et prs de 500 habitants au km2 et sont lies lhistoire et
aux politiques damnagement du territoire.
Un complexe despces aux exigences cologiques variant dun type un autre et en fonction du
stade de dveloppement, dans un environnement offrant une diversit de conditions cologiques, tel
est le visage du champ dapplication de ce travail de recherche. Un tel schma, dans une tude
portant sur la modlisation, impose la dfinition dune dmarche mthodologique adapte, objet du
chapitre suivant.
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67
III.1
APERU DES METHODES DE MODELISATION DE LA
DISTRIBUTION SPATIALE DES ESPECES VIVANTES UTILISANT
LANALYSE SPATIALE ET LES SIG
Une vieille sagesse enseigne que rares sont les situations vraiment nouvelles et que dautres ont
dj su rsoudre les nouveaux problmes que nous rencontrons Le-Moigne, (1990). Les
modles de la distribution spatiale des espces, et particulirement des espces qui sont des vecteurs
de maladies, sont nombreux et varis en raison de la diversit des sites, de lcologie et de ltiologie
des espces. Cette fcondit de la recherche dans le domaine de la modlisation est lie sans doute
aux usages dont les modles font lobjet, au caractre bien souvent utilitaire et pragmatique des
modles. Quels sont ces usages ? Quelles sont les mthodes utilises pour le processus de
modlisation ? Cette section vise rpondre ces deux questions. Elle a pour but de prsenter les
usages qui sont faits des modles de distribution spatiale des espces et les diffrents types de
modles. Cette prsentation devrait contribuer faire comprendre la dynamique de modlisation dans
laquelle sinscrit ce mmoire de recherche. Elle doit galement permettre de faire comprendre les
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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choix qui sont faits en ce qui concerne les mthodes et donnes. Elle est compose de deux
paragraphes :
-
le premier est un expos sur les impacts des usages des modles sur le processus de
modlisation
III.1.1
Et quoiquon en dise, dans la vie scientifique, les problmes ne se posent nous deux-mmes.
Cest prcisment ce qui donne la marque du vritable esprit scientifique Sil ny a pas eu de
question, il ne peut y avoir de connaissance scientifique. Rien ne va de soi. Rien nest donn. Tout
est construit G. Bachelard, 1938-1978, cit par Le-Moigne, (1990). Le modle est le fruit du
raisonnement de son auteur qui cherche, travers lui, prsenter et expliquer les points saillant
dun phnomne. Le modle est une uvre produite par limagination au sens le plus strict puisque
cest la prise en compte dlments slectionns entre lesquels sont tablies des relations pertinentes.
Ladquation du modle une partie de la ralit est lexpression de limagination scientifique
Raffestin, (1983) in Gumuchian et Marois, (2000). Les modles sont donc des constructions de
lesprit et comme tels, ils sont objectivs, cest--dire quils visent un ou plusieurs objectifs. Nous
retenons de prsenter deux types dobjectifs dans le domaine du contrle des populations
vectorielles. Ce choix est li au fait que ces objectifs dteignent sur le choix de donnes. En
complment lassertion de Bachelard sur lesprit scientifique, nous disons avec les mots de LeMoigne, (1990) sappuie lui-mme sur le Discours de lesprit positif dAuguste Comte 1843, que
les donnes du problme sont donnes par le problme que rencontre le modlisateur .
III.1.1.1
Les plans de lutte contre les maladies transmission vectorielle intgrent, bien souvent et dailleurs
trs logiquement, le contrle, voire lradication des vecteurs. La mise au point de tels programmes
ncessite de disposer dinformation sur la bio-cologie du vecteur et surtout sur la rpartition dans
lespace. Ceci explique le recourt frquent des modles spatiaux. Ces modles servent la
dfinition de politiques ou de stratgies de contrle ou dradication du vecteur. Ceux utiliss de
telles fins couvrent gnralement de grands espaces. Ce sont des modles couvrant de grands
espaces, des tendues continentales nationales Pin-Diop, (2006). Or, la modlisation sappuie bien
souvent sur des observations. Lobservation est une mesure dans le temps et dans lespace et fait
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
69
appel la notion dchelle. Elle est lie la mesure de lespace ou du temps. Passer dune chelle
une autre consiste changer dunit de mesure 45Pav A (1994) cit Mathian et Piron, (2001). La
taille des objets gographiques dans lespace et la taille de lespace couvrir ne sont pas sans effets
sur lutilisation des donnes dans les travaux de recherche, particulirement en modlisation spatiale.
Le choix de lchelle gographique oriente et influence les rsultats. En effet, les rsultats changent
selon lchelle gographique : cest le problme de lunit spatiale modifiable bien connu sous
lacronyme MAUP en anglais. Les conclusions dduites une chelle gographique ne sont pas
ncessairement valables une autre chelle Gumuchian et Marois, (2000). Les chelles influent
aussi sur les cots financiers, temporels et matriels. Ces modles destins llaboration de
politiques et de stratgies gnrales utilisent principalement des donnes provenant dimages
satellites basse rsolution comme les AVHRR NOAA, HRR Meteosat, avec des rsolutions spatiales
de lordre de 1 km 1,5 km. Ils utilisent galement des donnes mtorologiques et des modles
numriques de terrain comme GOTO30. Leur objectif en gnral est didentifier et de cartographier
les zones risque de manire ce que les efforts de contrle et les stratgies dintervention soient les
plus efficaces et cibls possible Tran et al., (2005). Ils sont appels, en raison de la faible rsolution
spatiale de donnes, des modles petite chelle. Les exemples sans doute les plus cits dans la
littrature spcialise concernent les glossines/la trypanosomiase et la Fivre de la Valle du Rift en
Afrique de lEst. Pin-Diop, (2006) fait un expos assez exhaustif des travaux dvelopps dans le
cadre de la lutte contre la trypanosomiase et le contrle de la population de glossines avec les travaux
suivants: Hendrickx et al., (2001); Hendrickx et al., (1989); Robinson et al., (1997); Rogers et
Randolph, (1993); Rogers et Williams, (1993). Pour la Fivre de la Valle du Rift, elle utilise les
travaux de Anyamba et al., (2001); Davies et al., (1992); Linthicum et al., (1999); Linthicum et al.,
(1987); Linthicum et al., (1990).
III.1.1.2
La dfinition de politiques gnrales ou de stratgies globales nest pas la seule utilisation des
modles spatiaux dans le contrle de populations vectorielles. Les modles spatiaux sont galement
recherchs pour lintervention, pour laction ou pour les ripostes contre la prolifration de certains
vecteurs. Dans ce cas, il est inopportun de se contenter de donnes basse rsolution spatiale des
modles petite chelle. Lusage des modles spatiaux pour laction requiert des donnes plus
prcises et sur des espaces beaucoup plus restreints. Les tendues spatiales comme les villes, les sous
bassins versants sont raisonnables. Les rsolutions spatiales de lordre de quelques dizaines mtres
45
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
70
(30 m) sub-mtriques (60 cm) sont les plus appropries. Dans ce cas, les donnes proviennent
dobservations de terrain et de traitements dimages satellites, haute rsolution trs haute rsolution.
Les images comme LandSat TM et ETM+, SPOT XS, XI, Ikonos et QuikBird sont adaptes ce type
de modlisation. Les informations recherches en ce qui concerne les vecteurs de maladies sont par
exemple loccupation des terres, les gtes de reproduction, les gtes de repos et des lments
beaucoup plus prcis sur la vgtation comme la composition floristiques. Les travaux de
Mushinzimana et al., (2006) utilisant les Images LandSat 7 au Kenya, Ratana et al., (2005) en Core
avec galement des images LandSat 7 tous relatifs au vecteur du paludisme, Pin-Diop, (2006) pour
les vecteurs de la fivre de la valle du Rift partir dimages satellites Landsat 7 au Sngal
Septentrional, en sont des illustrations.
Que les travaux se ralisent au niveau local ou global, pour des raisons daction ou pour des raisons
dlaboration de politiques gnrales, les mthodes restent les mmes. Cest principalement le type
de donnes et les usages des rsultats qui changent. Les chercheurs utilisent soit des modles
rhtoriques, soit des modles mathmatiques, soit des modles iconiques, soit enfin un mlange de
deux ou des trois. Cette synthse introduit au paragraphe consacr aux mthodes de modlisation.
III.1.2
Il existe de nombreux auteurs qui classent les modles suivant le critre des mthodes. Cest le cas de
Tran et al., (2005) qui proposent une classification en deux groupes : les modles conceptuels qui
sattachent expliquer de manire qualitative un phnomne et les modles mathmatiques. Les
modles mathmatiques comprennent les modles statistiques / empiriques et les modles thoriques.
Un troisime groupe de modlisation, que lon pourrait appeler modle informatique, runit les
programmes dvelopps pour faire de la cartographie automatique de la distribution spatiale des
espces. Nous pouvons citer aussi, Guisan et Zimmermann, (2000) qui prsentent les Predictive
habitat distribution models in ecology . Cet article propose une analyse des mthodes de
modlisation en cologie et peut inspirer les chercheurs qui sintressent ce domaine.
Cependant, nous nous adosserons dans cette prsentation sur celle de Brunet, (2000a) qui semble
plus complte et intgre de faon plus ou moins directe la plupart des classifications suivant la
mthode. En outre, en tant que gographe, Roger Brunet tient compte de la spcificit de la
discipline. Il distingue trois groupes de modles : les modles rhtoriques, les modles
mathmatiques et les modles iconiques. Ce paragraphe est structur autour de ces trois groupes de
modles.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
71
III.1.2.1
Ce type de modle procde une description des phnomnes et sexprime par des textes, des
discours. Cest une formalisation par le discours. Il prsente les grands traits des phnomnes par des
textes. Il runit par le discours un ensemble de faits et de donnes qui donnent les caractristiques
essentielles des phnomnes. Il sappelle aussi modle conceptuel. En cologie, ce type est trs
utilis et consiste faire un rapprochement entre les lments du paysage et lcologie du vecteur. La
dmarche, dans le cas de la modlisation conceptuelle, sappuie sur la recherche documentaire. Elle
vise acqurir de linformation pour produire un modle discursif sur lhabitat du vecteur. Ces
modles rhtoriques sont trs usits en smiologie mdicale, en taxonomie et plus gnralement en
systmatique. Ils servent souvent traduire certaines thories. Par exemple, la loi du minimum de
Liebig fournit un modle pour le raisonnement sur la productivit vgtale.
Ce type de modle est souvent appuy par dautres types de modle, comme les modles
mathmatiques.
III.1.2.2
Les modles mathmatiques s'expriment par des formules : quelque chose entre image et texte
(Brunet, 2000a). Ils visent dcrire de manire quantitative le fonctionnement dun systme, en
crivant sous forme dquations les lois qui le rgissent Tran et al., (2005). La modlisation en
langage mathmatique atteint assurment le degr suprieur dabstraction, du moins du point de vue
du langage, qui nest pas le seul prendre en compte Durand-Dasts, (2001). Elle est considre
par beaucoup dauteurs comme le plus haut niveau dabstraction, le niveau le plus labor du modle.
Il existe cependant une difficult pour raliser un compromis partir dun langage mathmatique :
il sagit dun langage qui se fonde sur lexactitude et tend vacuer toute approximation, imprcision
ou ambigut pour raliser un compromis avec dautres disciplines pour ltude dun objet naturel,
chaque discipline tant porteuse dun point de vue. () Lart de la modlisation (mathmatique) est
de trouver le meilleur compromis entre la simplicit des formes mathmatiques et le respect des
lments saillants et identitaires du phnomne tudi Franc, (2001). Parmi ces derniers, on
distingue encore les modles empiriques (ou statistiques), bass sur les donnes, et les modles
mcanistes (ou thoriques), qui sont bass sur les concepts Tran et al., (2005). Il convient dajouter
la liste des dveloppements actuels de modules informatiques proposant des outils intgrer sur les
logiciels de SIG et visant llaboration de carte de distribution spatiale.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
72
73
catarrhale ovine en Corse soutenue en 2007, les travaux de Thomas et al., (2003) sur Linking
field-based ecological data with remotely sensed data using a geographic information system in two
malaria endemic urban areas of Kenya, Mushinzimana et al., (2006), (Ratana et al., (2005)
Identification and characterization of larval and adult anopheline mosquito habitats in the Republic
of Korea: potential use of remotely sensed data to estimate mosquito distributions.
Lhypothse sous-jacente ces modles est que la prsence () des vecteurs dpend fortement de
lenvironnement : type de vgtation, conditions climatiques (temprature, prcipitations), etc. qui
dterminent leur habitat. [] La mthode consiste donc rechercher des corrlations entre la
distribution des vecteurs et des paramtres environnementaux. Linversion de la relation statistique
observe, condition de pouvoir justifier le lien vecteur/environnement, permet dextrapoler les
rsultats pour obtenir des cartes de la rpartition des vecteurs Tran et al., (2005). Dans ces cas, les
logiciels de SIG doivent disposer dautres fonctions de calcul de statistiques spatiales et tre soutenus
par des logiciels danalyse statistique de donnes, lorsque la structure des donnes lautorise (par
exemple, en absence dautocorrlation spatiale). Les SIG servent dans ce type de modle comme
outils danalyse. Mais bien souvent dans ce cas, les logiciels de SIG sont trs peu outills pour
prendre en charge certaines analyses Joost, (2006). Do la cration de module informatique
intgrant des fonctions pour permettre la ralisation de la modlisation mathmatique dans les SIG.
Les modles mathmatiques informatiques
Il sagit de modles beaucoup plus gnriques consistant palier les insuffisances des logiciels de
SIG comme Arcview de Esri, MapInfo de Claristas ou SAVANE de lIRD dvelopp sous la
supervision de Marc Souris46. Ils proposent des modules complmentaires ddis spcifiquement la
ralisation de la cartographie de distribution des espces en gnral. Ce qui pourrait tre fort utile
dans la modlisation de la distribution spatiale des vecteurs de maladies. Les logiciels SIG offrent
des fonctions classiques de traitements de linformation gographique souvent trs riches mais dont
lusage spcifique dans la modlisation de la distribution spatiale des espces en biogographie et en
cologie en gnral est trs peu vidente. Joost, (2006) met ainsi en vidence le faible niveau
dintgration des outils danalyse spatiale dans les logiciels de SIG : the lack of integration between
GIS and spatial analysis, by picking out that GIS, despite being widely used in different types of
spatially explicit studies, are still deficient in integrating generic statistical procedures for predictive
purposes.
46
http://www.th.ird.fr/publications/publications_auteurs_souris.html
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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III.1.2.3
Les modles iconiques passent par le dessin, qu'il s'agisse d'une courbe, d'un profil ou d'une
configuration spatiale. [] Le modle iconique offre une vision panoptique, ou synchrone si l'on
prfre ; il montre d'un coup les relations rciproques des lieux : il les met en situation. Il permet de
comprendre, grce au dessin, les effets d'interfrence des formes, la dformation rciproque des
modles. [] Il est commode et mme fcond ; il n'exclut en rien la quantification, ni mme la
mathmatisation ; il les appelle d'ailleurs, comme moyens de contrle Brunet, (2000a). La carte est
lexemple mme de modle iconique. Elle peut atteindre des niveaux dabstraction trs levs. Par
exemple, la carte disobare couramment utilise est fonde sur un calcul de correction des
observations et atteint un trs haut niveau dabstraction Durand-Dasts, (2001). Chormatique,
chorme et chorotype sont des termes qui voquent par la schmatisation, un niveau dabstraction
plus lev que celui de la carte.
Les modles iconiques procdent la mise en image des phnomnes pour faciliter leur
comprhension et leur prsentation. Cette mise en image se traduit lorsque la dimension spatiale
entre en jeu, par les cartes ou les chormes. La traduction sous forme de carte de phnomne rpond
une double exigence : la fidlit et la lisibilit. Llaboration des cartes relve donc de la
modlisation spatiale. Elle sappuie souvent sur des modles mathmatiques ou rhtoriques/discursif.
47
http://www2.unil.ch/biomapper/
http://openmodeller.sourceforge.net/index.php?option=com_frontpage&Itemid=1
49
http://www.mbr-pwrc.usgs.gov/software/comdyn.html
48
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
75
Ainsi, la cartographie de distribution de lespce peut-elle tre la recherche dans lespace (zone
dtude) des sites qui rpondent au modle dcrit de lhabitat. Linformation spatiale
environnementale provient en gnral du traitement dimage de tldtection/photographie arienne,
dobservations sur le terrain, de linterpolation de donnes climatique etc. En sappuyant sur un SIG,
de simples requtes permettent de slectionner des espaces rpondant la description de lhabitat du
vecteur et sa cartographie. Dans certains cas, les SIG servent aux traitements dinformations
spatiales (gorfrencement des informations, interpolations et estimations, extrapolations). Comme
le dit Y, (2005), The power of GIS is its ability to integrate and manipulate multiple layers or
themes of spatial data for a large area and from different sources at different scales [] For malaria
research and control, GIS has great potential since it has the capacity to integrate information on all
aspects of malaria including the environmental factors, infrastructure and demography [.] it is a
good tool of communication to support the decision making process. Cest donc la capacit des SIG
intgrer des donnes multisources, multimdia et croiser ces informations travers des requtes
spatiales qui est fortement utilise. Les fonctions ddition cartographique et daide la dcision sont
galement intressantes pour la restitution des rsultats.
76
problmatique, de ses objectifs, des moyens dont il dispose etc. Comment a-t-on fait la modlisation
dans ce travail, cest lobjet de la seconde section de ce chapitre.
III.2
En rappel, ce travail a pour objectifs: de dcrire lorganisation spatiale des deux formes molculaires
M et S dAn. gambiae au Burkina Faso, didentifier les dterminants de cette organisation et de la
modliser. Un tel objectif implique de combiner des comptences relatives des domaines divers, les
uns lis la thmatique, les autres la technique ou la mathmatique Sanders, (2001). Au plan
thmatique, cette tude met contribution la biogographie qui oriente et donne la perspective
thorique et lentomologie qui fournit linformation ncessaire la connaissance des anophles. Au
plan technique, elle met profit lanalyse spatiale, lanalyse de donnes statistiques et le systme
dinformation gographique. Lapproche pluridisciplinaire simpose dans une telle situation. Mais si
une telle approche est stimulante et enrichissante dans le processus de modlisation, une utilisation
dsordonne des contributions des diffrentes disciplines scientifiques peut porter prjudice la
logique et la comprhension du raisonnement. Do la ncessit de cette section destine la
prsentation de larticulation densemble de la mthodologie et aux usages faites des mthodes et des
techniques. Cette section est structure en cinq paragraphes : le premier svertue montrer la
perspective et larticulation de la recherche et les quatre autres sappesantissent sur les mthodes
utilises chaque tape du processus dinvestigation.
77
spatiale An. gambiae s.s. et lenvironnement. Cette formulation des hypothses constitue la
premire phase de la modlisation.
2. la perspective tant mathmatique / empirique, il sagit didentifier sur des observations de
terrain les rgularits et de les exprimer sous forme simplifie, sans en trahir lesprit. Pour cela, il
est indispensable de procder une conceptualisation qui permet didentifier des objets pertinents
et de procder la quantification, cest--dire associer chaque objet une liste de variables qui
permet de le dcrire le plus exactement possible (voir paragraphe univers de variables ). Il
arrive souvent que des modles soient disponibles et facilitent ce travail de conceptualisation.
Cest le cas, dans ce mmoire, de lutilisation des modles dinterpolation et destimation dans
lajustement des donnes aux besoins de ltude, de lemploi de modles danalyse des
configurations et structures spatiales (ellipse de dviation standard, indice dautocorrection de
Morin etc.) et de la mise contribution de certains modles de calcul statistiques.
3. la formalisation est la troisime tape et consiste en lexpression du modle sous un langage
dtermin. Deux types de langages sont viss dans le cadre de ce travail. Il sagit du langage
iconique et du langage mathmatique. Les modles issus de ce travail sont prsents sous forme
de fonctions mathmatiques et sous forme de cartes par inversion des fonctions mathmatiques.
Lanalyse spatiale et la statistique multidimensionnelle/lanalyse de donnes sont les deux
mthodes utilises cette tape.
4. la dernire tape de cette dmarche consiste en lvaluation de la qualit du modle. Il sagit de
contrler la qualit du modle et, si besoin, de procder son amlioration par retour sur une ou
plusieurs tapes prcdentes. Deux mthodes sont utilises pour lvaluation de la qualit du
modle : une valuation partir de lanalyse des rsidus du modle et une valuation par
comparaison des donnes produites par les modles des donnes empiriques externes aux
modles.
La mise en uvre de cette dmarche ncessite des donnes de bonne qualit. Encore faut-il avoir un
tat des besoins en donnes bien labor !
III.2.2 UNIVERS
DES
VARIABLES
ET
ENTITES
OBJETS
GEOGRAPHIQUES
Les hypothses et les indicateurs devant permettre de les vrifier, mettent en jeu un certain nombre
de concepts. Il faut pouvoir les rendre opratoires travers une dfinition de leurs caractristiques.
Cest le rle de la variable que Jambou M., (1999), dfinit comme toute caractristique dune
personne ou dune chose qui peut tre exprime par un nombre . Lunivers des variables est
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
78
lensemble des informations visant caractriser le plus possible les phnomnes tudis. Il rpond
la question suivante : quelles sont les informations ncessaires pour renseigner les indicateurs ? Ce
qui implique aussi de sinterroger sur les objets sur lesquels les informations doivent tre collectes
(objets gographiques, priodes, acteurs).
Lobjectif de ltude est, rappelons-le, de modliser la distribution spatiale des membres du complexe
An. gambiae au Burkina Faso pour comprendre et faire comprendre la distribution des membres de
ce complexe despces travers lidentification des facteurs environnementaux les plus dterminants.
En dautres termes, nous cherchons expliquer la variabilit des frquences dans des lieux donns,
compte tenu de la variabilit de lenvironnement.
En nous appuyant sur le paradigme biogographique, la bio-cologie du complexe An. gambiae
(section I, chapitre II), nous construisons le diagramme de cause effet (ou diagramme en arte de
poisson ou encore diagramme Ishikawa), pour inventorier lensemble des variables prendre en
compte (Figure 15).
Figure 15 : Diagramme dIshikawa des facteurs environnementaux influenant les frquences dAnopheles gambiae
s.s., ralisation SOME Y. S. Corentin
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
79
Ce diagramme prsente trois grands groupes de facteurs qui contribuent la distribution spatiale des
espces : les facteurs actuels et passs, les facteurs internes lespce et les facteurs externes
lespce.
Dans le cadre de cette tude, lintrt est port sur les facteurs externes. Ces derniers constituent le
milieu dans lequel vivent les membres du complexe. Ces facteurs externes sont les facteurs
environnementaux.50 Ils peuvent tre subdiviss en trois classes : les facteurs gographiques, les
facteurs climatiques et les facteurs biotiques.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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S, chacune exprimant la population dune forme molculaire dnombre en un lieu. Ce sont les
variables entomologiques. Les variables explicatives sont les variables environnementales ou
cologiques. Nous les appelons aussi variables co-gographiques. Elles peuvent tre classes en
trois sous groupes :
-
les variables climatiques qui regroupent la temprature, les prcipitations, lETP, les vents,
linsolation, la pression de vapeur ;
Certaines dentre elles sont dvaluation si courante que leurs units sont connues et les mthodes de
leur valuation ne sont pas nombreuses. Dautres ont des contenus dinterprtations peu videntes par
rapport lobjectif de ltude. Do lintrt de prciser les units. Dans le Tableau 3 sont consignes
les variables retenues ainsi que leurs contenus.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Variables
Units
Contenus
Temprature
Degr Celsius
Prcipitation
Millimtre
Insolation
Fraction
Vent
Mille/second
ETP
Millimtre
Pression
Hectopascal
Tension de vapeur
Qualit de l'atmosphre
Hydrographie
Mtre
Relief
Mtre
Amnagement
Localits
Mtre
Vgtation
Proche infrarouge/rouge
Nombre d'habitants/
kilomtre carr
Nombre de M
Nombre de S
Prsence humaine
Population de M
Population de S
Vitesse du vent
La vapeur d'eau potentiellement produite du
fait de la transpiration et de l'vaporation
Densit de la population
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52
La localit correspondant tout regroupement humain, dot ou non dun statut juridique au niveau national. Elle est
diffrente du village qui lui est une implantation humaine reconnu comme tel par ladministration publique.
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Les localits se dfinissent comme toute implantation humaine sans lien avec son statut juridique (village, ville,
hameau de culture lieu dit etc.)
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La seconde phase consiste en un maillage du site, avec des cellules de 5 x 5 km54, soit 11 321
mailles. Ces mailles sont indexes. Parmi elles, 4 315 rpondent au critre de distance par rapport
laxe du transect. De celles-ci 300 sont tires au sort. Le tirage est stratifi de manire
proportionnelle la longueur du circuit. Ainsi, sur le circuit de 547 km, 50 cellules sont tires au sort
et sur les deux autres circuits, 125 cellules sont choisies au hasard.
La troisime phase consiste tirer au sort, une localit et une seule, dans chacune de 300 cellules.
Les coordonnes de ces localits sont remises lquipe dentomologistes du Centre National de
Recherche et de Formation sur le Paludisme (CNRFP) en vue de la capture et du dnombrement
dAn. gambiae s.s.. Les mthodes de capture et didentification des formes molculaires dAn.
gambiae sont prsentes en annexe 1 et 2. La Figure 16 prsente les diffrents aspects de cet
chantillonnage. Les captures et les identifications ont t effectues par lquipe dentomologique
du CNRFP.
III. 2.5.2
La revue de littrature est utilise pour faire le point sur les donnes relatives aux variables cogographiques, la mthodologie, la bio-cologie des vecteurs et aux diffrentes techniques de
54
Certains paramtres lis cet chantillonnage ont t dfinis dans le document du projet NIH. Il sagit du nombre de
sites de dnombrement (300) et de la taille des sites de prlvement (5km x 5km).
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et la littrature scientifique. La prcision temporelle est lheure avec une rptitivit, toutes les
semaines la mme heure de prlvement. Le choix de la semaine sappuie sur le cycle
gonotrophique qui est dun maximum de 7 jours. Cette rptitivit devrait permettre de suivre la
variabilit spatio-temporelle de population des vecteurs et du milieu au cours dune anne. La
prcision spatiale est le kilomtre. En effet, le kilomtre correspond la distance de vol de
lanophle. Les sources, moins dtre produites dans le cadre direct de cette tude, doivent provenir
au moins de structures officielles.
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Paramtres
Donnes valuer
Prcipitation
Temprature
vent
insolation
pression
ETP
Hydrographie
Topographie (Altitude)
Amnagement
localit
population humaine
vgtation
population de M
population de S
Qualit Interne
Exhaustivit
Non
Non
Non Non
Non
Non Non
Non
Non
Non
Non
Non
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Non
Non
Non Non
Non
Non Non
Non
Non
Non
Non
Non
Non
Non
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Cohrence
logique
Exactitude
spatiale
Exactitude
temporelle
Exactitude d
attributs
Oui
Oui
Qualit externe
Dfinition
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Couverture
Non
Non
Non Non
Non
Non Non
Non
Non
Non
Non
Non
Non
Non
Gnalogie
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Non
Oui
Non
Oui
Oui
Prcision
Non
Non
Non Non
Non
Non Non
Non
Non
Non
Non
Non
Non
Non
Lgitimit
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Accessibilit
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Oui
Non
Non
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89
III.2.7.1
Les donnes disponibles ne couvrent pas lensemble des sites et prsentent aussi des rfrentiels
techniques diffrents. Pour rsoudre ces problmes, nous appliquons des mthodes de transformation
gomtrique/topologique et des mthodes dinterpolation et destimation spatiales. Ces traitements
sont appliqus lorsque les donnes ont des rfrentiels techniques htrognes ou lorsquelles ne
couvrent pas lensemble des points chantillonns (Cf. tableau 4).
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
90
91
III.2.7.2
La simultanit souhaite pour les variables co-gographiques et les frquences des vecteurs et la
rptitivit de la caractrisation constituent un niveau de prcision et dexactitude temporelle
extrmement difficile atteindre. Aussi, le recours des valeurs moyennes caractrisant les
diffrents facteurs est-il une solution !
Lusage des donnes les plus rcentes
Certains paramtres connaissent une grande stabilit et des mesures forte rptitivit dans le temps
napporteront pas de grands changements. Cest le cas du relief, de lhydrographie et des localits.
Cest pourquoi, pour ces variables, les donnes nont subi aucun traitement au niveau temporel.
Dautres sont destimation tellement coteuse que leur production est difficilement envisageable la
priodicit souhaite. Cest le cas des statistiques sur la population et de la cartographie de
loccupation des terres. Pour ce qui est de la population, une estimation a t faite pour lanne de
collecte des donnes entomologiques partir du taux daccroissement naturel. Pour ce qui concerne
loccupation des terres, la donne cartographique la plus rcente a t retenue comme significative
pour la priode de collecte des donnes entomologiques.
Les mthodes statistiques
Concernant les autres variables, pour lesquelles il existe une production journalire des informations
et qui intressent les facteurs climatiques et la vgtation, nous considrons les tats moyens. Pour
les facteurs climatiques, le recul statistique ncessaire est de 30 ans. Cette condition na pas toujours
pu tre respecte. Dans de tels cas, nous prenons en compte le recul maximum pour les stations
disponibles.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
92
Ainsi, lorsque la srie le permet, les valeurs moyennes pour tous les paramtres ont-elles t
calcules sur 30 ans. Sinon, lensemble de la srie est pris en compte. Pour ce qui concerne la
vgtation, la moyenne des indices dcadaires normaliss de vgtation, calcule sur lensemble de la
priode de collecte qui stend de juillet octobre 2005, a t retenue.
En somme, sur le plan temporel, la solution a t dutiliser les caractristiques moyennes. Cet tat
moyen a t obtenu soit par calcul soit par prise en compte des caractristiques propres de la variable
considre.
Nous
regroupons
les
logiciels
en
cinq
classes :
SIG
et
analyse
spatiale,
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
93
Les logiciels de tldtection ont t utiliss principalement pour le traitement des images NDVI. Ces
traitements ont consist gorfrencer les images, les dcouper et calculer un NDVI moyens sur
12 images obtenues. Lusage galement de deux solutions logicielles est li galement des
fonctionnalits spcifiques que nous recherchions. Ainsi, le gorfrencement et le dcoupage des
images ont t effectus avec le logiciel ERDAS Imagine. Pour le calcul de limages arithmtique
correspondant au NDVI moyen sur les 12 images, il a t effectu sur Winchips qui offre un module
de calcul trs simples et trs accessibles.
Logiciels danalyse de donnes
Les logiciels danalyse de donnes ont servi la fouille des donnes. Il sagit principalement des
traitements lis lACP, aux diffrentes rgressions, la ralisation de certains tests et calculs
comme le test de Kolmogorov-Smirnov et le calcul de pourcentage des diffrentes formes
molculaires par site de capture. Les logiciels utiliss sont XL-Stat 2003, en extension Microsoft
Excel 2003, de Microsoft Corporation et Tanagra de Universit de Lyon II.
Logiciel de modlisation
Ce logiciel a servi llaboration des modles conceptuels de donnes et de traitement. Cest le
logiciel Power AMC-Designor de Sybase qui a t utilis.
Logiciels pour GPS
La collecte de donnes entomologiques ncessitait que lquipe de terrain dispost des coordonnes
gographiques sur les localits chantillons pour y aller. De plus, de retour du terrain, il fallait
galement tlcharger les donnes du GPS aux ordinateurs. Pour cela, les logiciels suivants ont t
mis contribution : GPS track maker, de Odilon Ferreira Junior, Individual resident in Belo
Horizonte MG Brazil, et Mapsource de Garming.
La collecte des donnes, effectue travers deux types de mthodes que sont la revue de
littrature et le transect,
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
94
Lanalyse de qualit des donnes qui appuie sur la norme ISO 19113 reformule par
Devilliers et al., (2005) avec pour objectif, lidentification du terrain nominal partir dune
connaissance a priori des besoins en information et en traitement,
Les mthodes de traitement qui regroupent les mthodes de traitement spatial et a-spatial et
les mthodes de calcul des indicateurs.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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DEUXIEME PARTIE
STRUCTURATION DES DONNEES, ELABORATION
ET EVALUATION DES MODELES
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Cette partie fait une synthse sur les donnes collectes et leurs traitements. Elle fait aussi le point de
lorganisation spatiale dAn. gambiae s.s. au Burkina Faso et des facteurs environnementaux qui
dterminent les structures et configurations spatiales mises en exergue.
Aussi, a-t-elle pour but dvaluer les indicateurs pour vrifier les hypothses de recherche et
apprcier le niveau datteinte des objectifs. Elle est compose de trois chapitres :
-
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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55
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
98
Priode
Date mesure D
Catgorie
Nom A20
0,n
1,n
Mesurer
Valeur DC3,2
concerner
0,n
Variables
code variable
Nom variable
Unit variable
Type variable
Sites
Code
Nom du site
Longitude
Latitude
A5
A20
0,n
A10
A20
A5
A20
DC7,7
DC7,7 1,n
Le modle conceptuel contient 14 groupes dinformation (Tableau 5) repartis entre les entits et les
associations.
Tableau 5 : Liste des informations
Nom
Catgorie
Code
code variable
Date mesure
Latitude
Longitude
Nom
Nom du site
Nom variable
Type variable
Code
CATEGORIE
CODE
CODE_VARIABLE
DATE_MESURE
LATITUDE
LONGITUDE
NOM_CATEGORIE
NOM_SITE
NOM
TYPE_VARIABLE
Unit variable
Valeur
UNITE
VALEUR
Type
A15
A5
A5
D
DC7,7
DC7,7
A20
A20
A20
A20
A10
DC3,2
Contenu
Classification des sites selon les variables mesures
Code de la catgorie
Code de la variable
Date de collecte des donnes
Latitude du lieu de collecte
Longitude du lieu de collecte
Nom du lieu de collecte
Nom de la variable collecte
Rpartition des variables entre variables explicatives
variables expliquer. Type de variable (entomologiqu
environnementale
Unit de la variable
Valeur prise par la variable
Lentit est un objet dfini au sein du systme d'information et au sujet duquel vous voulez
conserver des informations Sysbase, (1994). Notre systme en compte quatre (Tableau 6).
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Code
CATEGORIE
Priode
Sites
Variables
PERIODE
SITES
VARIABLES
Signification
La catgorie permet de distinguer/classer les sites de collecte de donn
par variables
Priode pendant laquelle les donnes ont t collectes
Lieu de collecte des donnes
Les variables
Code
CATEGORIE_SITE
VARIABLES_SITE
Nombre
0
0
Sur la base de ce modle, les variables sont mesures sur des sites et plusieurs dates durant une
priode. Ces variables sont regroupes par catgorie.
Chaque entit a des proprits qui sont des lments dinformation lis lentit. Cest lensemble
des lments qui permettent de dcrire les entits.
IV.1.1
LENTITE CATEGORIE
La catgorie correspond un jeu de sites dcrivant une mme variable. Par exemple, les sites de
mesure de la temprature vont correspondre la catgorie temprature. Elle est dcrite par la
proprit nom de catgorie. La catgorie est associe lentit site. Dans cette association, un site
relve d'une catgorie et une catgorie peut concerner un ou plusieurs sites. Cest une relation de 1
plusieurs qui lie lentit catgorie et lentit site.
IV.1.2
LENTITE SITES
Le site est le lieu dvaluation dune variable. Il correspond par exemple au poste pluviomtrique,
la localit de collecte des donnes entomologiques, ou la densit de vgtation sur une surface dun
km2. Les proprits du site, cest--dire les lments qui le caractrisent dans le systme, sont : le
nom du site, son code et ses coordonnes gographiques en longitude et en latitude. Le nom du site
correspond au nom du lieu de collecte et le code est un identifiant qui lui est affect. Ces
coordonnes permettent didentifier sa position dans le rfrentiel gographique.
Le site est en relation avec deux entits : lentit catgorie qui permet de classer le site selon la
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
100
variable qui y est mesure et lentit variable qui est lensemble des lments mesurs sur le site.
Ainsi, sur un site, peuvent tre mesures plusieurs variables et une variable peut tre mesure sur
plusieurs sites. Lassociation entre lentit site et lentit variable est de type plusieurs plusieurs.
Ces mesures peuvent tre effectues plusieurs dates durant une certaine priode, do lexistence
dune entit priode.
IV.1.3
LENTITE PERIODE
Cette entit contient les informations relatives aux dates dvaluation ou de mesure des variables sur
les sites. Par exemple, pour les tempratures, les prcipitations, linsolation ou lindice de vgtation,
il est ncessaire de savoir quand et o les observations / mesures ont t effectues. Lentit priode a
deux proprits : la date et le code. Elle est en relation avec deux entits que sont : lentit site et
lentit variable.
La relation entre lentit priode et lentit variable est de type plusieurs plusieurs. Une variable
peut donc tre mesure en zro ou plusieurs dates et une date, zro ou plusieurs variables peuvent
tres mesures.
La relation entre lentit priode et lentit site est galement de type plusieurs plusieurs. En effet,
plusieurs dates de mesure peuvent tre effectues sur un site et plusieurs sites peuvent tre des lieux
de mesure la mme date.
IV.1.4
LENTITE VARIABLES
La variable est un facteur qui rentre dans l'valuation de la qualit de l'environnement par rapport aux
exigences cologiques dAn. gambiae s.s. ou dans le dnombrement des frquences dAn. gambiae
s.s.. Cest par exemple, la temprature, lvapotranspiration potentielle (ETP), la densit de
population, le vent, la pression, lhydrographie, le relief, la prsence humaine, la population de S.
Lentit variable est dcrite par quatre proprits (Tableau 8) : le nom de la variable, le code de la
variable, lunit dvaluation de la variable et le type de variable.
Tableau 8 : Proprit de lentit variable
Nom
Code variable
Nom variable
Unit variable
Type variable
Code
CODE_VARIABLE
NOM
UNITE
TYPE_VARIABLE
Contenu
Code de la variable
Nom de la variable
Unit de mesure de la variable
Rle de la variable
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
101
Lentit variable est en relation avec les entits priode et site. La relation entre lentit
variable et lentit priode est de type plusieurs plusieurs. Une variable peut tre mesure
plusieurs dates et une mme date plusieurs variables peuvent tre mesures. Il en va de mme de la
relation entre lentit variable et lentit site. Plusieurs variables peuvent alors tre mesures sur un
mme site et sur plusieurs sites peut tre mesure une mme variable.
Ainsi modlises, les donnes servent des traitements et le modle conceptuel de traitement permet
de les anticiper.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Dans le cas de cette tude, les traitements peuvent tre subdiviss en trois processus :
-
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
104
par le tri et le regroupement les anophles capturs par unit spatiale de collecte (site) le
renseignement dune fiche synthtique. Cette fiche permet de connatre, par site dobservation, le
nombre dAn. gambiae forme molculaire S, le nombre dAn. gambiae forme molculaire M, le
nombre dAn. arabiensis, les coordonnes en longitude et en latitude des sites dobservation. Ces
actions de lopration dpouillement/analyse de laboratoire clturent le processus collecte de
donnes entomologiques.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
105
IV.2.3
Ce processus vise llaboration de carte de distribution des deux formes molculaires M et S dAn.
gambiae au Burkina Faso, en sappuyant sur les observations de terrain, les caractristiques du milieu
et la bio-cologie des anophles. Pour cela, ce processus doit permettre, par identification des
rgularits, de formaliser la relation entre la distribution des diffrentes formes molculaires et
lenvironnement. Cette formalisation sert de support pour la production de carte de distribution. Ce
processus compte de cinq oprations :
1. Lopration formatage du tableau de synthse . Il sagit de faire le formatage des tableaux de
donnes analyser en regroupant en un seul les synthses des processus collecte de donnes
entomologiques et collecte de donnes secondaires . Il sagit galement de
vrifier
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Lvaluation de la contribution des variables qualitatives est faite avec des tests statistiques.
5. Lopration rgression suppose que lANCOVA montre une faible contribution des variables
qualitatives. Dans ce cas, toutes ces variables qualitatives sont limines. A cela suit le calcul de
diffrents coefficients et certains tests statistiques : tests de Fisher, coefficient de dtermination,
analyse de rsidus, composition dune fonction de rgression etc. Par ces actions, lanalyse de rsidus
permet une valuation de la qualit du modle. La fonction de rgression est inverse au niveau
spatial pour produire une carte de distribution. Une comparaison est ensuite ralise entre des
donnes issues du modle et des observations empiriques. Elle permet de juger de la qualit du
modle et confirmer lvaluation par lanalyse des rsidus.
de
modlisation
du
MCT.
Les
donnes
co-gographiques constituent les facteurs externes de la rpartition spatiale des espces. En fonction
de leur nature et de leur impact sur la bio-cologie des membres du complexe An. gambiae, elles ont
t regroupes en trois types : les facteurs gographiques, les facteurs biotiques et les facteurs
climatiques. Les donnes collectes ne sont pas homognes par groupe de facteurs et ne prsentent
pas non plus le mme niveau de conformit par rapport au besoin de ltude (terrain nominal). Aussi,
les donnes co-gographiques ont-elles t reparties en trois catgories en fonction des traitements
effectus.
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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IV.3.1.1
Les donnes de prcipitation proviennent de deux sources : la base de donnes LoClim de la FAO et
la base de donnes de la Direction Gnrale de la Mtorologie du Burkina. Les donnes utilises
couvrent la priode de 1975-2005 et concernent 157 stations dont 140 lintrieur du Burkina Faso
et 17 dans les pays voisins (Niger, Mali, Togo, Bnin, Cte dIvoire, Ghana). Les valeurs archives
sur ces stations qui ont t utilises sont les prcipitations annuelles. Les stations sont implantes en
point et sont repres par des coordonnes angulaires sexagsimales (degr, minute, seconde) en
longitude / latitude.
Les traitements effectus sur les donnes de prcipitation sont :
-
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Variogramme
Pas de saut lorigine, pas deffet de ppite,
Fonction dajustement : Tretraspherical
Mean: 0,2571
Root-Mean-Square: 62,78
Average Standard Error: 65,59
Mean Standardized:
0,00937
Root-Mean-Square Standardized: 1,306
Samples: 157 of 157
Rgression fonction : 0,969 * x + 23,273
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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IV.3.1.2
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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IV.3.1.3
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Semi-variogramme
Mean: 0,5494 ;Root-Mean-Square: 16,66 ;Average Standard Error:
- Pas de saut lorigine, pas de deffet d Mean Standardized: 0,01635 ; Root-Mean-Square Standardized: 0,6671
ppite,
Samples: 38 of 38
- Fonction dajustement : exponentielle
27,6
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
112
IV.3.1.4
Les donnes de pression de vapeur proviennent de la base de donnes LocClim de la FAO. Elles
couvrent galement la priode allant de 1975 2005. Pour notre zone, 40 points dobservations dont
7 lintrieur du site sont disponibles. Le gorfrencement de ces points est fait en coordonnes
gographiques avec les units en degrs sexagsimaux.
Les traitements effectus sur ces donnes sont :
-
le calcul des valeurs moyennes annuelles des pressions sur lensemble des sites
dobservation ;
Figure 25 : Droite de rgression des pressions de vapeur moyennes annelles au Burkina Faso
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
113
IV.3.1.5
Les donnes dinsolation proviennent de la base de donnes LoClim de la FAO. Les donnes
dobservation couvrent 41 stations, dont 7 sont situes sur le territoire burkinab. Ces stations sont
repres par des coordonnes gographiques en degrs sexagsimaux. Les relevs couvrent la
priode 1975-2005 et sont en moyennes mensuelles. Les traitements subis par ces donnes
concernent la fois ladaptation au rfrentiel technique gographique et au niveau dchelle
temporelle. Aprs la spatialisation, une re-projection des donnes en UTM Clarke 1880, Zone 30
tendue 31 est applique. Au niveau temporel, linsolation moyenne annuelle par station a t
calcule. Pour la question de couverture et dexhaustivit, une interpolation avec la mthode Global
Polynomial Interpolation a t adopte (Figure 27, Figure 28).
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
114
IV.3.1.6
Les donnes relatives la vitesse du vent ont t extraites de la base de donnes LocClim de la FAO.
39 stations dobservation ont t mises contribution dont 7 au Burkina Faso. Le gorfrencement
de ces stations est fait avec des coordonnes gographiques en units sexagsimales. Les donnes
enregistres sont des vitesses moyennes mensuelles. Les traitements appliqus aux donnes extraites
sont :
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
115
ladaptation au niveau dchelle temporelle retenue (qui est lanne) par le calcul des vitesses
moyennes annuelles par station ;
Figure 30 : Rpartition des vitesses moyennes annuelles des vents au Burkina Faso
IV.3.1.7
Laltitude:
des
donnes
sources
aux
donnes
interpoles
Les donnes dentre des altitudes proviennent de la Banque Nationale de Donnes Topographiques
(BNDT) du Burkina Faso. Elles sont constitues de lensemble des points cts de la carte
topographique au 1/200 000. 5 381 points cots ont t utiliss et tous se situent sur le territoire
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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117
adaptes ce type de donnes et permettent davoir une meilleure prcision. Lestimation concerne
trois donnes co-gographiques : les populations, lhydrographie et les localits. Pour les
populations, ce sont les densits qui sont recherches. Pour lhydrographie et les localits, les
distances en tous points du site par rapport ces objets gographiques sont requises.
IV.3.2.1 Population : des effectifs de population aux densits en tout
point
Les donnes de population proviennent du recensement gnral de la population et de lhabitat de
1996. Ce sont des donnes sur les effectifs des populations humaines par villages. Elles ne sont pas
gorfrences et ne couvrent que les villages administratifs du Burkina en 1996. Pour le
gorfrencement de ces donnes de recensement, une jointure avec les localits de la base de
donnes topographiques a t effectue. Au total, 7 733 villages ont t identifis et joints aux
localits de la base de donnes topographiques. Les statistiques attaches ces points datent de
1996. Elles ont t rvalues en appliquant le taux daccroissement naturel du pays qui est de 3,3%
pour la priode 1985 1996. Pour rpondre la question dexhaustivit et dtendue, une
estimation des Densits lisses par dsagrgation des effectifs de population affects aux diffrents
points reprsentant les villages a t applique. Les statistiques sur les distances entre deux villages
sont les suivantes :
-
distance minimum56 entre deux localits voisines : 427 m soit environ 0,5 km ;
distance moyenne entre deux localits voisines : 4 148 m soit environ 4,1 km ;
distance maximum entre deux localits voisines : 22 471 m soit environ 22,5 km.
Le diamtre moyen des localits est donc de 8 396 m soit 8,5 km. Cest cette distance qui est
retenue comme estimateur de la zone de rpartition des effectifs autour de chaque point. La Figure 33
donne le rsultat de ces traitements.
56
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IV.3.3
Les donnes classifies concernent les donnes qualitatives. Ce sont les donnes relatives aux sols,
la vgtation et loccupation des terres. Elles proviennent respectivement de la carte de
reconnaissance pdologique du Burkina, de la carte de vgtation du Burkina et de la Base de
Donnes sur lOccupation des Terres (BDOT) du Burkina. La nomenclature utilise dans le cadre
de ces bases de donnes est trs dtaille. Ces donnes sont de production trs coteuse et il ny a
pas une srie. Elles nont par consquent subies que deux types de traitement : le changement de
projection et la classification. Ce dernier traitement a consist en la rduction du nombre de
modalits.
CONCLUSION AU CHAPITRE IV
La base de donnes utilise a un modle conceptuel de donnes assez simple qui comprend quatre
entits et trois processus. Elle stocke cependant une grande quantit dinformations en raison de
lentit variable qui regroupe lensemble des informations qui seront utilises dans le cadre de cette
tude. Lentit variable et le processus de traitement des donnes entomologiques engendrent 13
couches dinformation gographique supplmentaires et autant en donnes tabulaires non
gographiques.
A partir de ce riche jeu de donnes, rien de plus normal que dentreprendre lanalyse de la structure
et des configurations spatiales. Il s'agira de calculer nos indicateurs et valuer nos deux premires
hypothses (Chapitre 1) qui sont la distribution non alatoire des formes molculaires M et S dAn.
gambiae au Burkina Faso et la contribution diffrentielle des facteurs environnementaux
lorganisation spatiale de ces vecteurs du paludisme. Cest lobjet du chapitre V.
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
122
Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
________________________________________________________________________________________________________________
V.1
Cette tude postule de lexistence dune structure dans la distribution spatiale des espces et de
limpact de quelques facteurs environnementaux majeurs dans cette distribution. En dautres termes,
lespace gomtrique (la proximit, distance,) ne peut pas expliquer entirement la distribution
observe. Pour le vrifier, trois statistiques spatiales comme indicateurs sont retenues. Il sagit de
statistiques descriptives (centrographique et de dispersion) et de lautocorrelation spatiale. La
statistique spatiale descriptive est destine rsumer lessentiel des observations. La seconde,
lautocorrelation spatiale vise tudier lorganisation et la structuration dAn. gambiae s.s..
Lorganisation spatiale dAn. gambiae s.s. au Burkina est aborde dabord globalement, puis chaque
forme molculaire est analyse de faon indpendante. Au pralable, une prsentation des donnes
utilises pour les analyses est ncessaire. Cette section est subdivise en quatre paragraphes : le
premier est consacr la prsentation des donnes, les trois autres la structure spatiale des deux
formes molculaires prises individuellement et An. gambiae s.l.
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
123
Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
________________________________________________________________________________________________________________
V.1.1
LES
STATISTIQUES
GENERALES
SUR
LES
DONNEES
ENTOMOLOGIQUES COLLECTEES.
La collecte de donnes a t effectue de juillet octobre 2005 dans trois cents localits du Burkina
Faso. Au total, 5 496 moustiques capturs ont t identifis par la PCR Fanello et al, (2002). Une
moyenne de 18,32 individus a t identifie par localit avec un cart type de 6,01. Le maximum de
capture identifi est de 39 et a t ralis Pimpindiang au nord du Burkina. Le minimum a t
ralis Mati et Tlkaya, galement dans le nord Burkina.
Ces indicateurs globaux se dcomposent au plan spcifique conformment la Figure 37 ci-dessous.
An. Arabienis
29%
An. Gambiae
Forme S
44%
An. Gambiae
Forme M
27%
Figure 37 : Rpartition des captures dAnopheles gambiaes.l. au Burkina Faso de juillet octobre 2005
Sur les 5 496 anophles capturs, 2 422 appartiennent An. gambiae forme molculaire S, soit 44%,
1 505 An. gambiae forme molculaire M, soit 27% et enfin 1 569 An. arabiensis soit 29%.
Daprs ces statistiques, An. gambiae forme molculaire S reprsente presque la moiti des captures
dans le complexe. An. arabensis et An. gambiae forme molculaire M sont en proportion presque
gale. 3 929 soit 71 % des captures appartiennent An. gambiae s.s..
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
124
Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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V.1.2
Au plan spatial, quelques calculs de statistiques descriptives permettent une premire caractrisation
des donnes collectes (Figure 38). Il sagit du barycentre, du centrode et de lellipse de dviation
standard. Le barycentre de la distribution des points de collecte se situe pratiquement au centre du
pays quelques kilomtres de Ouagadougou. Il se superpose presque parfaitement avec le centrode
des points de collecte, une distance infrieure 3 km et largement infrieure la distance moyenne
entre deux points dobservation qui est de 15 km. Cette quasi superposition du barycentre de
distribution et du centrode suggre une faible influence de la localisation sur les frquences.
La distance standard permet dobserver une dispersion de 221,1 km autour du barycentre. Lellipse
de dviation standard, quant lui, est tire en direction nord-est/sud-ouest et sur une superficie de
119 290,49 km2. Le grand rayon a une longueur de 282,35 km contre 134,5 pour le petit, soit
pratiquement le double du second, pour un angle de rotation de 65,41. Ces statistiques indiquent une
orientation dans la distribution spatiale dAn. gambiaes.l. qui est tire dans la direction nord-est/sudouest. 175 points de collecte sur les 300 sont recouverts par lellipse de dviation standard, soit 58%
des points de collecte contre 42% qui se situent en priphrie. La dispersion des frquences des
moustiques est donc normale.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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Si la distribution semble normale au regard des indicateurs statistiques prsents, des interrogations
demeurent : quelle est le rle de lespace dans la distribution des frquences sur les lieux de
collecte ? Existe-t-il des agrgats spatiaux ? Lexistence dune orientation mise en exergue par
lellipse de dviation standard pose galement une question sur lexistence dune anisotropie. En
somme, deux proccupations restent en suspend. La premire concerne lautocorrelation spatiale et la
seconde la configuration spatiale.
Le calcul57 de lindice dautocorrelation spatiale effectu sur les 300 points de collecte et les
frquences observes sur ces points prsentent les rsultats suivants : Indice dautocorrelation
spatiale de Moran = 0,014316 ; Indice attendue = -0,003344 ; Variance = 0,000074 ; Z Score =
2,046.
Lindice de Moran est trs proche de 0. La ralisation de la variable alatoire rgionalise est donc
indpendante. Cela signifie que les frquences dAn. gambiaes.l. en un point de collecte ne sont pas
influences par les frquences observes dans les points voisins. Il nest donc pas possible de prdire
les frquences en un point, connaissant les frquences observes en un autre point, appuyant sur la
distance qui les spare.
Cette indpendance observe dans la ralisation peut tre le fruit du hasard et na de valeur que pour
lchantillon qui a servi au calcul. Il est donc ncessaire de faire un test pour vrifier la validit de
cette indpendance spatiale pour la variable spatiale dans sa totalit. Ce test statistique
dindpendance de la variable rgionalise donne un Z score gale 2,05 au seuil de confiance de
95%. Il se situe en dehors de lintervalle de confiance [-1,96 ; 1,96]. Il est difficile den dduire
labsence totale dautocorrelation spatiale sur lensemble de la variable. Il existe sans doute des
agrgats spatiaux exprimant lexistence locale dautocorrelation spatiale.
Le calcul des concentrations des valeurs fortes et des valeurs faibles de Getis-Ord General G prsente
les rsultats suivants : Gnral G Observ = 0,000007 ; Gnral G attendus = 0,000007 ; Variance de
Gnral G = 0,000000 ; Z Score = -1,35. Ces indicateurs statistiques montrent que les agrgats
observs sont le fait du hasard ; lhypothse nulle de concentration des faibles et fortes valeurs
alatoires tant accepte au seuil de 95%.
57
Le type de distance utilis dans le calcul de lindice dautocorrelation spatiale de Moran est la distance euclidienne.
La conception des relations spatiales entre les frquences dAn. gambiae l.s. dnombr sur les diffrents points de
collecte, sappuie sur la distance inverse.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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Lindice de Getis-Ord General G montre quil y a indpendance spatiale dans la distribution dAn.
gambiae s.l., cest--dire que les frquences observes en un point ne sont pas influences par la
valeur des frquences observes dans les points voisins. Lorientation spatiale mise en exergue par
lellipse de dviation standard ne trouve pas dexplication dans les relations de voisinage. Il est donc
important de recourir dautres facteurs qui expliquent cette orientation observe. De plus,
linfirmation statistique de la dpendance spatiale de la variable alatoire rgionalise observe avec
lindice de Moran, impose de pousser lanalyse en vrifiant les relations entre les frquences
observes et lenvironnement.
Mais avant, il faut se demander si ces conclusions au niveau An. gambiaes.l. sont exactement les
mmes lorsquon sintresse lune ou lautre forme molculaire du complexe An. gambiae :
An. gambiae forme molculaire S et An. gambiae forme molculaire M.
V.1.3
LA
STRUCTURE
SPATIALE
DAnopheles
gambiae
FORME
MOLECULAIRE S
Au plan de la statistique spatiale descriptive, le barycentre de la distribution spatiale dAn. gambiae
forme molculaire S se situe compltement au sud du pays une distance denviron 125 km au sudouest du centrode. Les frquences dAn. gambiae de forme molculaire S ont donc fortement
influenc la position du barycentre. Ce dcalage met galement en exergue une tendance la
concentration dAn. gambiae de forme molculaire S dans la partie sud du site dobservation. La
distance standard est de 236,04 km. Lellipse directionnelle a un rayon de 96,45 km observable en
abscisse, un rayon en ordonne de 319,57 km et un angle de rotation 75,41. Lellipse de dviation
standard couvre une superficie de 96813,72 km2 et recouvre 155/300 points dobservation, soit
51,66% de la distribution. Cette rpartition des points dobservation par rapport lellipse de
dviation standard montre une distribution assez normale (Figure 39).
Lindice dautocorrlation spatiale de Moran utilis pour mesurer le niveau de dpendance spatiale
donne les rsultats suivants : Indice de Moran = 0,28 ; Expected Index = -0,0033 ; Variance =
0,000075 ; Z score = 32,73.
La valeur de lindice de Moran est trs proche de 0. Il ny a donc pas autocorrlation spatiale dans la
distribution observe.
Cependant, le test statistique devant valider cette indpendance spatiale pour lensemble de la
variable alatoire rgionalise donne un Z score de 32,72 qui relativise linterprtation de lindice
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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En somme, dAn. gambiae forme molculaire S a tendance se concentrer au sud du Burkina Faso,
dans les rgions des Cascades, du Sud-Ouest et des Hauts Bassins. Cette zone correspond la partie
o les prcipitations sont les plus abondantes, les tempratures basses, la vgtation la plus dense.
Cest la partie la plus humide du pays. Nous pensons donc une prfrence par rapport lhumidit.
La distribution des frquences se dgrade fortement du sud-ouest vers le nord-est. Nous percevons
une similitude entre le front de dgradation des frquences et celui de lhumidit (Figure 8, Chapitre
2).
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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Les frquences observes en un point ne sont pas dpendantes des points leur voisinage. Il nest pas
convenable de driver les frquences en tous points sur la base de la position de points connus.
Toutefois, la concentration au sud cre des agrgats, des zones dans lesquelles les frquences peuvent
avoir des similarits. Le sud-ouest et louest du Burkina Faso prsentent sans doute des conditions
cologiques plus favorables An. gambiae forme molculaire S. Quen est-il pour la forme
molculaire M dAn. gambiae ?
V.1.4
LA
STRUCTURE
SPATIALE
DAnopheles
gambiae
FORME
MOLECULAIRE M
La distribution spatiale dAn. gambiae forme molculaire M (Figure 40) se caractrise par les
statistiques suivantes : un barycentre dcal par rapport au centrode de 112 km au nord-est, pour une
distance standard de 176,7 km. Il y a donc tendance une concentration dans la partie nord du site.
Lellipse de direction a un rayon en abscisse de longueur gale 122 km, un rayon de 218 km en
ordonne et un angle de rotation de 56,84. Lellipse couvre 138 points dobservation sur 300 soit
44% des frquences sur une superficie de 83695,12 km2. Nous en dduisons lexistence dune
direction dans la distribution des frquences dAn. gambiae forme molculaire M. Cette orientation
dans la direction permet de souponner une dpendance spatiale dans la distribution des frquences
dAn. gambiae forme molculaire M, do la ncessit de tester lautocorrelation spatiale.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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Lvaluation de lindice dautocorrelation de Moran donne les rsultats suivants : Indice de Moran =
0,18 ; Indice attendu = -0,0033 ; Variance = 0,000074 ; Z Score = 22,08. Lindice dautocorrelation
de Moran tant proche de 0, il y a indpendance spatiale pour cette ralisation de la variable alatoire
rgionalise. Le Z score indique lexistence de corrlation spatiale localise travers des agrgats
spatiaux. Lexistence de ces agrgats spatiaux est acceptable au seuil de confiance de 99%. Lindice
de concentration des valeurs fortes et des valeurs faibles de Getis-Ord General G, avec les rsultats
suivants, renforce linterprtation du Z score de lindice de Moran : Gnral G Observ = 0,000009 ;
Gnral G attendu = 0,000007 ; Variance du Gnral G = 0,000000 ; Z Score = 6,71. Daprs ces
statistiques, il y a indpendance spatiale sur les observations effectues. Il existe toutefois des
agrgats spatiaux lintrieur desquels peut sexprimer une autocorrelation spatiale.
En somme, An. gambiae forme molculaire M a tendance se concentrer au nord du Burkina. Ses
frquences diminuent du nord-est vers le sud-ouest. Cette partie du Burkina correspond celle o les
prcipitations sont les plus faibles, les tempratures les plus leves, la vgtation la moins
luxuriante. Cest le domaine des steppes. Cest la partie la plus aride du pays. Nous pensons donc
une prfrence par rapport laridit. Il y a une similitude entre le front daggradation des frquences
et celui de laridit.
Malgr cette orientation, il ny a pas dautocorrlation spatiale mme sil existe des agrgats
spatiaux. Puisquil y a indpendance spatiale double dune forte concentration des frquences au
nord-est, le nord du pays semble avoir de meilleures conditions cologiques dAn. gambiae forme
molculaire M que le sud.
Nous retenons de lanalyse des structures spatiales une tendance lallopatrie entre les deux formes
molculaires M et S. La forme S prsente de fortes concentrations au sud-ouest et louest du pays,
dans les rgions des Cascades, du Sud-Ouest et des Hauts Bassins. La forme molculaire M, quant
elle, est plus dominante au nord et au nord-est, dans les rgions du Sahel, du Nord et du Centre-Nord.
Ce rsultat doccupation diffrentielle de lespace est en conformit avec celui de Costantini et al.,
(2009)58 qui a t ralis au Burkina Faso dont nous sommes coauteurs. Il est aussi en phase avec
celui de Torre et al., (2005) bas sur des observation au Ghana et au Burkina Faso, daprs lequel M
and S have different geographical and micro-geographical distributions. The differentiated microgeographical distribution in dry savannah regions of west Africa may be associated with a diverse
ability of the two forms to exploit man-made breeding sites. Pour Onyabe et al. (2003), parlant de la
distribution spatiale des formes molculaire M et S An. gambiae au Nigeria, both molecular forms
58
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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occurred throughout the country, with no apparent relationship to the ecological transition from dry
savannah in the north to humid forest in southern Nigeria. In all localities, however, 1 form or the
other occurred virtually exclusively. Cette forte prdominance dune forme molculaire sur lautre
voque galement des zones doccupation prfrentielle.
Lanalyse de la structure spatiale a galement montr labsence dautocorrelation spatiale. Toutefois,
elle laisse entrevoir, malgr lindpendance spatiale globale, la prsence dagrgats spatiaux,
tmoignant de lexistence, au niveau local, dautocorrlation spatiale. En dautres termes, cette
analyse suggre lexistence de lieux o les frquences observes semblent trs proches. Il convient
donc didentifier ces agrgats et rechercher les facteurs de ces concentrations de valeurs similaires en
certains points.
V.2
O se situent les sous ensembles spatiaux ? Rpondre cette question est lobjectif de cette seconde
section. Elle sinscrit dans la continuit de la prcdente pour identifier les agrgats spatiaux. Les
indices locaux dassociation spatiale dAnselin Local Moran et Getis-Ord Gi* sont retenus comme
mthodes didentification des agrgats spatiaux. Lindice dAnselin Moran permet de quantifier le
niveau de similarit/dissimilarit entre points voisins et met en exergue les zones valeurs
homognes ou htrognes. Le Gi* de Getis-Ord quant lui permet de faire lanalyse des
concentrations (hot pot). Cette section est compose en 6 paragraphes. Chaque forme molculaire est
analyse avec lindice local dAnselin Moran et du point de vue de lindice Gi* de Getis-ord aprs
une tude globale de An. gambiaes.l..
V.2.1 ANALYSE
DES
CONFIGURATIONS
SPATIALES
LOCALES
DAnopheles gambiaes.l.
Le calcul de lindice Local dAnselin et Moran est effectu sur les frquences de An. gambiaes.l. en
vue didentifier les zones de similarit. Les statistiques sur les valeurs de Z score de lindice local
dAnselin et Moran pour An. gambiaes.l. sur les points dobservation se prsentent de la faon
suivante : effectif total : 300 ; minimum : -9,08 ; maximum : 5,95; total : 62,21 ; moyenne : 0,2 ;
dviation standard : 1,62.
La classification de ces valeurs en seuil naturel de Jenks en trois classes et leur spatialisation permet
dobtenir la Figure 41.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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Les valeurs fortes du Z score reprsentent les plus fortes similarits des frquences. Il y a quatre
zones de concentration de valeurs fortes. Ces zones de concentration sont disperses sur lensemble
du territoire burkinab. La plupart des points ont des valeurs de Z score moyennes et occupent
lessentiel du pays. Il y a donc un cart entre le zonage et le gradient nord-est/sud-ouest rvl par
lellipse de dviation standard au niveau de lanalyse globale. Ce mme cart sobserve entre le
gradient nord-est/sud-ouest mis en exergue dans lanalyse du milieu physique. Le facteur dterminant
des concentrations doit alors tre fortement localis et li des conditions trs particulires. Cette
conclusion nest pas forcment valable pour les formes molculaires M et S dAn. gambiae s.s.,
prises individuellement.
V.2.2 ANALYSE
DES
CONFIGURATIONS
SPATIALES
LOCALES
Les valeurs de Z scores de lindice local dAnselin et Moran pour An. gambiae forme molculaire S
pris sur les points dobservation, se caractrisent par un effectif total de 300 individus, un Z score
minimum de -4,34 et un Z score maximum de 20,76 pour une moyenne de 3,52, un cart type de 4,08
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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et un cumul total de 1058,25. La classification des 300 points dobservation en fonction des Z scores
en 3 classes au seuil naturel de Jenks rvle des zones de forte ressemblance (Figure 42).
Les Z score qui ont les valeurs les plus leves (Z score compris entre 7,75 et 20,77) constituent un
agrgat dans lextrme sud-ouest du pays avec quelques points isols dans la partie nord. Il y a donc
une forte similarit entre les valeurs du Z score dans la partie sud-ouest de la zone dtude. Ces
points isols Z score levs sont noys dans des Z scores moyens, (Z score compris entre 2,13 et
7,75) dominant dans la partie nord du Burkina. Dans cette partie du pays, la similarit des valeurs est
moyenne. Les Z scores les plus faibles abondent dans le sud, le centre et lest du pays. Ces parties
constituent donc une zone trs htrogne. Les valeurs entre les points proches y sont trs diffrentes.
Cette configuration indique que le sud-ouest prsente des conditions assez homognes par rapport
aux exigences dAn. gambiae de forme molculaire S. Dans la moiti nord du Burkina, il y a une
variabilit relativement plus leve par rapport au sud-ouest. Dans cette zone, les conditions
cologiques sont moins homognes par rapport aux exigences dAn. gambiae forme molculaire S.
Dans le centre, les frquences sont trs diffrentes entre deux points proches. La configuration de la
distribution spatiale dAn. gambiae forme molculaire S est donc plus visible par rapport celle du
complexe An. gambiae.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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An. gambiae de forme molculaire M a-t-il lui aussi des agrgats trs distincts ?
V.2.3 ANALYSE
DES
CONFIGURATIONS
SPATIALES
LOCALES
Le nombre dindividus ayant fait lobjet de lvaluation du Z score est de 300. Les valeurs prises par
le Z score sur ces 300 points varient de -4,13 (le minimum) 31,11 (le maximum) pour une moyenne
de 2,5 et un cart type de 5,46. Le cumul de Z score sur lensemble des 300 points est de 752,28. La
classification en trois classes en seuil naturel de Jenks dgage trois grandes zones de concentrations
des valeurs faibles et fortes. Dans le nord, les Z scores sont les plus levs. Ce qui indique une zone
homogne. Lextrme sud-ouest du pays prsente les valeurs moyennes de Z score. Lhomognit
des valeurs des Z scores est moins forte que dans le nord. Le centre, le sud et lest sont trs
htrognes. Les Z scores y sont les plus faibles.
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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Les agrgats dAn. gambiae forme molculaire M sont galement plus marqus que ceux dAn.
gambiaes.l. La position spatiale des agrgats est linverse dAn. gambiae forme molculaire S.
Lopposition des configurations spatiales dAn. gambiae forme molculaire S et An. gambiae forme
molculaire M permet de comprendre labsence dagrgats marqus pour lensemble du complexe.
Lexpression localise dagrgats doit provenir de linfluence trs peu marque dAnopheles
arabiensis, un autre membre du complexe.
Il convient cependant danalyser de plus prs les agrgats. Cest ce que vise lutilisation de lindice
de GI* de Getis-Ord. Avec cet indice, nous analysons le niveau dhomognit des agrgats travers
les similarits qui existent entre deux points voisins dobservs.
V.2.4 CONFIGURATIONS SPATIALES SELON LINDICE GI* DE GETISORD POUR Anopheles gambiaes.l.
Le Z score de GI* de Getis-Ord prsente les statistiques suivantes pour les 300 points dobservation
pour An. gambiae sl. Le Z score de GI* minimum est de -2,87, son maximum de 3,43 pour une
moyenne de 0,0019 et un cart type de 1,001 ; le cumul de lensemble des valeurs tant de 0,57. La
classification des Z de GI* en trois classes au seuil naturel de Jenks et la spatialisation donnent la
Figure 44.
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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Cette carte montre un fort mlange des valeurs fortes et des valeurs faibles, de sorte quil y a une
grande mosaque de petits agrgats spatiaux. La distribution des agrgats est alatoire et conforte
linterprtation faite de lanalyse effectue avec lindice local dAnselin et Moran. Les agrgats
spatiaux ne sont pas marqus et il est difficile, compte tenu de lorganisation du milieu, denvisager
une relation entre lenvironnement dAn. gambiaes.l. ce niveau de prcision (chelle). Cette analyse
pourrait tre envisage un niveau dchelle beaucoup plus fin, comme les gtes. La diversit des
exigences spcifiques des membres du complexe An. gambiaes.l. est certainement la cause de cette
absence de structuration spatiale bien marque. La rduction de la diversit, en considrant que
chaque membre du complexe, pourrait prsenter une structure spatiale plus visible et des conditions
de mise en relation plus favorables, compte tenu de la diversit du milieu.
V.2.5 CONFIGURATIONS SPATIALES SELON LINDICE GI* DE GETISORD POUR Anopheles gambiae FORME MOLECULAIRE S
Pour An. gambiae forme molculaire S, les rsultats de lvaluation de lindice GI* de Getis-Ord
donnent les statistiques suivantes pour les 300 points dobservation : Minimum : -2,87 ; Maximum :
3,43 ; Moyenne : 0,001907 ; Ecart type : 1,001 et cumul de 0,57. La classification de Z score de GI*
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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en trois classes au seuil naturel de Jenks et la spatialisation des rsultats donnent la Figure 45.
Figure 45 : Configuration spatiale dAnopheles gambiae forme molculaire S selon lindice Getis et Ord
Cette carte met en exergue deux grands ensembles spatiaux avec une dmarcation presque brusque le
long de la latitude 1230. En dessous de cette latitude, se concentrent les valeurs fortes et moyennes
de Z de GI*. Cest donc une zone de forte concentration An. gambiae forme molculaire S. Audessus de 1230, les valeurs Z de GI* sont trs faibles et expriment une forte dispersion des
frquences. Deux grands ensembles bien marqus se distinguent clairement. Cette dmarcation
observe correspond grosso modo la dmarcation entre le domaine soudanien et le domaine
sahlien. De plus, les valeurs sont orientes dans le mme sens que celui de lellipse de dviation
standard et lessentiel des paramtres du milieu biophysique. Lhypothse de lexistence dune
structuration dans la distribution spatiale des frquences de la forme molculaire M est donc vrifie.
Il existe la fois une orientation dans la distribution spatiale des frquences et, mieux, une
orientation dans la distribution spatiale des agrgats. La distribution nest donc pas le fait du hasard.
Cette hypothse est-elle galement vrifie pour An. gambiae de forme molculaire M ?
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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V.2.6 CONFIGURATIONS SPATIALES SELON LINDICE GI* DE GETISORD POUR Anopheles gambiae FORME MOLECULAIRE M
Pour An. gambiae forme molculaire M, les statistiques du Z de Getis pour les 300 points
dobservation sont les suivants : le minimum est de -1,13 ; le maximum de 3,67 ; la moyenne de 0,002 ; lcart type est de 1,002 et le cumul de -0,67. Discrtiss en trois classes au seuil naturel de
Jenks et spatialiss, nous obtenons la Figure 46.
Figure 46 : configuration spatiale dAnopheles gambiae forme molculaire M selon lindice Getis et Ord
Deux zones se dgagent lobservation. Une zone de Z de GI* moyen lev, situe au dessus de la
latitude 1230 et une zone de Z de GI* faible en dessous de la latitude 1230. Il existe dans la partie
sud, quelques points isols valeurs moyennes. Une structure est tout de mme visible : au nord, des
niveaux de Z scores relativement identiques et plus levs dans leur ensemble par rapport au sud. Il y
a une orientation nord-est/sud-ouest galement dans la disposition des agrgats. Cette orientation est
conforme celle observe avec lellipse de dviation standard effectue sur les frquences. Cette
disposition suit lorganisation du milieu physique. Elle est inverse dans lensemble par rapport
celle observe avec An. gambiae de forme molculaire S. Lexistence de quelques points de valeurs
moyennes dans la partie sud o prdominent des valeurs de Z score faible, suggre un niveau de
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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An. gambiae forme molculaire S est trs bien structur avec des agrgats marqus et bien
repartis dans lespace ;
An. gambiae forme molculaire M est galement bien structur mais quelques bruits sont
observables dans la zone sud ouest avec lapparition de quelques agrgats ;
Ces rsultats permettent de dire que lhypothse de distribution spatiale non alatoire des formes
molculaires S et M d'An. gambiae s.s. est vrifie. Une direction et des agrgats ont t galement
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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identifis. Les tests dautocorrelation ont mis en vidence lindpendance spatiale et le fait que
lespace (absolu) est insuffisant pour expliquer la distribution observe.
Si la disposition des objets dans lespace nexplique pas la configuration spatiale observe du fait de
lindpendance spatiale lchelle de collecte, lexistence dagrgats spatiaux pourrait sexpliquer
par un ou plusieurs facteurs msologiques ou leur combinaison. Lanalyse des relations entre la
distribution spatiale des frquences observes et la distribution spatiale des facteurs
environnementaux pourrait donner une explication des configurations spatiales observes.
V.3
SPATIALE
DES
VECTEURS
ET
LES
FACTEURS
ENVIRONNEMENTAUX
Lespace gomtrique, la position relative des points de collecte les uns par rapport aux autres
nayant pas t suffisantes pour expliquer la structure spatiale observe, la prise en compte des
proprits de lespace pourrait le faire. Il sagit donc de considrer plutt lespace comme
environnement, cest--dire milieu de vie. A ce titre, lespace offre des conditions cologiques qui
savrent plus ou moins contraignantes au dveloppement dune espce. Ce sont les facteurs
environnementaux. Est-ce que loffre cologique nest pas en dfinitive le dterminant de la structure
spatiale observe ? Est-ce que ces facteurs environnementaux ne sont pas finalement les dterminants
qui structurent la distribution spatiale des membres dAn. gambiae s.s. ? Cest lobjet de cette section.
V.3.1
Si lespace dans sa dimension gomtrique est insuffisant pour expliquer la distribution des
frquences observes, certaines de ses caractristiques peuvent tre plus pertinentes. Il convient donc
de vrifier la relation entre les attributs de lespace en tant que milieu de vie, environnement des
formes molculaires M et S d'An. gambiae s.s., et les frquences observes. Lenvironnement se
positionne dans cette perspective comme facteur susceptible dexpliquer la distribution observe. Il
joue donc le rle de variable explicative.
Lenvironnement est la rsultante de plusieurs facteurs physiques et humains qui jouent de faon
diffrentielle sur la qualit de vie des espces. Analyser les rapports entre une espce et
lenvironnement devient peu confortable si lon se situe au niveau global, car le concept nest pas
opratoire. Le retour sur lanalyse des relations entre le complexe despces et les diffrents facteurs
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140
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de lenvironnement se prsente comme une alternative pour identifier linfluence des diffrents
facteurs et valuer la qualit globale de lenvironnement par rapport au complexe despces.
Lenvironnement se dcline travers 11 paramtres. Ces derniers sont classs en deux groupes
de variables : les variables quantitatives et les variables qualitatives. Les variables quantitatives au
nombre de 9 reprsentent 84,61% des variables contre 15,39% pour les variables qualitatives. De
plus, les variables expliquer sont quantitatives. Elles ont t transformes pour tre continues par le
calcul des abondances relatives (frquences relatives). En raison de cette forte prdominance des
variables quantitatives, lanalyse en composante principale avec variables complmentaires a t
utilise.
V.3.2
Lanalyse en elle-mme est une analyse en composante principale (ACP norme avec une variance
en 1/n), sans axe de rotation. Le coefficient de corrlation est celui de Pearson. Le seuil de
signification est de 0,05.
Le tableau soumis lanalyse compte 13 variables quantitatives et 2 variables qualitatives
supplmentaires. Le nombre de variables associes une valeur propre non triviale est de 13.
La premire variable complmentaire, relative la pdologie, compte 6 modalits que sont : sols
hydromorphes, sols isohumiques, sols ferrugineux tropicaux, sols peu volus et les minraux bruts
ou dgrads, sols mull, vertisols.
La seconde variable complmentaire, relative loccupation des terres, compte 8 modalits : champ,
fort sche, habitat rural, savane, steppe, territoire agro-forestier, zone humide et zone nue. Les
variables quantitatives prsentent les caractristiques statistiques suivantes (Tableau 9).
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Contenu
STATISTIQUES
Moyenne
Maximum
PERCENT_S
44,42
37,23
100
PERCENT_M
26,58
28,39
100
ETP
168,52
13,24
143,86
218,51
VENT
1,83
0,22
1,17
2,72
TOPO
Topographie/ altitude
320
56
157
556
TEMPER
Temprature moyenne
28,01
0,42
26,9
28,9
PRESSION
18,31
1,26
15,17
21,24
POP
Densit de population
81
93
4,12
1152
PLUIE
783
183
327
1133
LOCALITE
1489
2012
10510
SOLEIL
Insolation
0,68
0,03
0,61
0,73
HYDRO
492
446
3324
135,87
22,39
75
173
NDVI
chlorophyllienne
Conformment lchantillon, le nombre dindividus est de 300 pour les variables quantitatives. Les
modalits des variables qualitatives dans ce type danalyse interviennent comme individus. Il y a de
ce fait, respectivement 6 et 8 individus supplmentaires provenant des variables qualitatives
associes aux sols et loccupation des terres.
V.3.3
Le test de sphricit de Bartlett sur lensemble des donnes donne les valeurs suivantes (Tableau 10) :
Tableau 10 : Les rsultats des tests de sphricit de Bartlett
Khi (valeur observe)
Khi (valeur critique)
ddl
p-value unilatrale
Seuil de signification Alpha
4138,618
99,617
78
< 0,0001
0,05
Ce test permet de vrifier lhypothse nulle selon laquelle toutes les corrlations seraient gales
zro. Il permet donc de savoir si les donnes sont factorisables ou pas. Il assure par un test de khi2
que les variables sont suffisamment corrles pour autoriser lanalyse en composante principale. Les
rsultats de ce test permettent de rejeter lhypothse nulle au seuil de signification de 0,05. Cela
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permet daccepter lhypothse dexistence de corrlation significative entre les variables. En dautres
termes, les corrlations qui existent entre les variables sont significatives.
V.3.3.1
Le Tableau 11 permet dobserver les corrlations. Elles sont positives plus de 0,8 entre le
pourcentage dAn. gambiae forme molculaire S, les prcipitations, la vgtation et les pressions. A
loppos, elles sont ngatives entre les mmes pourcentages et les variables insolation (-0,82),
temprature (-0,70) et ETP (-0,55).
Tableau 11 : Matrice des corrlations entre les variables
1
PERCENT_S
PERCENT_M
-0,73
ETP
-0,55
0,65
VENT
-0,33
0,19
0,39
TOPO
0,36
-0,25
-0,22
-0,18
TEMPER
-0,70
0,57
0,68
0,20
-0,56
PRESSION
0,80
-0,71
-0,75
-0,42
0,23
-0,74
POP
-0,20
0,04
-0,00
0,03
-0,09
0,22
-0,14
PLUIE
0,80
-0,69
-0,75
-0,37
0,39
-0,85
0,96
-0,15
LOCALITE
0,05
0,00
0,11
0,05
-0,16
0,092
-0,04
-0,16
-0,08
SOLEIL
-0,82
0,2
0,73
0,46
-0,42
0,84
-0,92
0,21
-0,95
0,01
HYDRO
-0,19
0,04
0,04
0,16
-0,08
0,10
-0,18
0,11
-0,18
-0,07
0,19
NDVI
0,803
-0,75
-0,73
-0,31
0,28
-0,79
0,88
-0,15
0,89
-0,03
-0,86
-0,18
PERCENT_S
PERCENT_M ETP
VENT
TOPO
TEMPER
PRESSION
POP
PLUIE
1
NDVI
En fond jaune, valeurs significatives (hors diagonale) au seuil alpha de 0,050 (test bilatral)
A loppos dAn. gambiae forme molculaire S, An. gambiae forme molculaire M a une forte
corrlation positive avec lETP (0,65), linsolation (0,62) et les tempratures (0, 57). Le niveau de
corrlation avec ces variables natteint pas celui dAn. gambiae de forme molculaire S. En
corrlation ngative, ce sont la vgtation (-0,75), les pressions (-0,71) et les prcipitations
(-0,69) qui sont les plus leves pour An. gambiae forme molculaire M.
Nous remarquons que la corrlation entre lETP, linsolation, les tempratures et la forme
molculaire M est dautant plus leve que la zone est aride. Cela laisse prsager une association de
la forme molculaire M laridit. A loppos, la forme molculaire S semble sassocier aux facteurs
voquant plutt lhumidit comme la pression, la prcipitation, la vgtation. Il y a donc, en premire
analyse des corrlations, une opposition entre la forme molculaire M et la forme molculaire S.
Cette opposition semble se construire le long dun axe aridit humidit. Nous constatons cependant
que les corrlations entre le ple de lhumidit et la forme molculaire S sont plus leves que celles
entre le ple de laridit et la forme molculaire M.
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143
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V.3.3.2
Le Tableau 12
contient, pour 13 facteurs issus de lanalyse, les valeurs propres, les pourcentages de
fournit une reprsentation graphique. La moyenne des valeurs propres est gale 1.
F2
F3
F4
F5
F6
F7
F8
F9
F10
F11
F12
F13
Valeur propre
6,84
% variance
52,63
9,90
8,27
7,93
6,11
5,58
3,45
2,80
1,14
1,03
0,74
0,25
0,09
% cumul
52,63
62,54
70,82
78,75
84,87
90,46
93,91
96,71
97,86
98,89
99,64
99,90
100,00
1,28
1,07
1,03
0,79
0,72
0,44
0,36
0,14
0,13
0,09
0,03
0,01
Le premier axe reprsente 52,63 % de linertie. Les deux premiers axes reprsentent eux seuls
62,54% de linertie. En nous rfrant au critre empirique de Cattel, le critre du Coude, nous
retenons comme pertinents les 4 premiers facteurs. Il y a, en effet, une forte rupture de la variation
entre laxe 4 et laxe 5 comparativement la pente entre les axes 2, 3 et 4. Le critre de Kayser, qui
veut que soient considrs les axes dont les valeurs propres sont suprieures la moyenne, conduit
retenir les axes 1, 2, 3 et 4. Il confirme galement la dcision prendre daprs le critre du coude de
Cattel.
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144
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V.3.3.3
Le Tableau 13 contient les coordonnes des variables sur les quatre premiers axes factoriels retenus au
terme de critre de Cattel et de Kayser Lebart et al., (2006). Ces quatre premiers axes comptent
78,75% des variances. Les coordonnes centres rduites reprsentent les corrlations entre les
variables et les diffrents axes factoriels.
Tableau 13 : Coordonnes des variables
F1
F2
F3
F4
PERCENT_S
VARIABLE \ AXE
0,870
0,144
-0,041
0,057
PERCENT_M
-0,776
0,074
0,271
-0,174
ETP
-0,803
0,224
0,219
0,057
VENT
-0,438
0,019
-0,027
0,656
TOPO
0,441
-0,157
0,723
0,136
TEMPER
-0,872
0,042
-0,226
-0,227
PRESSION
0,943
0,012
-0,168
-0,065
POP
-0,189
-0,652
-0,347
-0,308
PLUIE
0,968
-0,028
-0,005
0,009
LOCALITE
-0,060
0,732
-0,384
0,132
SOLEIL
-0,961
-0,054
-0,041
0,036
HYDRO
-0,201
-0,467
-0,252
0,612
NDVI
0,929
0,019
-0,130
0,054
A la lecture des valeurs absolues des coordonnes des variables, nous observons que les variables
Pourcentage (abondance relative) dAn. gambiae forme molculaire M, Pourcentage
(abondance relative) dAn. gambiae forme molculaire S, ETP, temprature, pression, prcipitation
et vgtation sont fortement corrles laxe 1 avec des coefficients allant en valeur absolue de
0,776 0,968. En dehors de la variable pourcentage dAn. gambiae forme molculaire M , les
coordonnes sont toutes suprieures 0,8.
A laxe factoriel 2 sont corrls les facteurs population (0,652) et localits (0,732). laxe factoriel 3
est corrl la topographie (laltitude) avec un coefficient de 0,723 et laxe factoriel 4, les vents
(0,656) et lhydrographie (0,612).
La prise en compte du signe dans linterprtation met en lumire des oppositions entre les variables
sur les diffrents axes. La Figure 48 montre bien ces oppositions sur les axes factoriels 1et 2
lintrieur du cercle de corrlation.
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Variables (axes F1 et F2 : 62,54 % )
1
LOCALITE
0,5
ETP
PERCENT_S
PERCENT_M
TEMPER
VENT
PRESSION
NDVI
PLUIE
SOLEIL
TOPO
HYDRO
-0,5
POP
-1
-1
-0,5
0
-- axe F1 (52,64 % ) -->
0,5
Ainsi, sur laxe factoriel 1, sopposent les abondances relatives des 2 formes molculaires dAn.
gambiae s.s.. Sy opposent galement deux groupes de facteurs environnementaux. Le premier est
constitu de la prcipitation, de la pression de vapeur et de la vgtation. Le second groupe runit
lETP, la temprature, linsolation et le vent. Le premier groupe de facteurs fait penser aux zones
humidit assez leve o les tempratures sont assez fraches. A loppos, se trouvent les facteurs
climatiques qui voquent lasschement, laridit. Sur laxe 2 sopposent les localits et les densits
de population.
Sur laxe 3 reprsent sur la Figure 49 avec laxe 1, nous observons la forte corrlation avec la
topographie (altitude).
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Variables (axes F1 et F3 : 60,92 % )
1
TOPO
0,5
PERCENT_M
ETP
PLUIE
VENT
PERCENT_S
NDVI
SOLEIL
TEMPER
PRESSION
HYDRO
POP
LOCALITE
-0,5
-1
-1
-0,5
0
-- axe F1 (52,64 % ) -->
0,5
Figure 49 : Reprsentation des variables sur les plans factoriels 1 et 3Enfin, sur laxe 4 reprsent
laxe 1 sur la Figure 50, les vents et lhydrographie sont trs corrls.
avec
VENT
HYDRO
0,5
LOCALITE
TOPO
SOLEIL ETP
0
NDVI
PERCENT_S
PLUIE
PRESSION
PERCENT_M
TEMPER
POP
-0,5
-1
-1
-0,5
0
-- axe F1 (52,64 % ) -->
0,5
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Nous retenons lopposition entre la forme molculaire M et la forme molculaire S dAn. gambiae
s.s., trs remarquable sur laxe factoriel 1. Cet axe factoriel constitue un axe sur lequel sopposent
galement deux ples de facteurs environnementaux. Le premier ple regroupe les facteurs NDVI,
pluie, pression, topographie (altitude), constitue le ple humide et est associ An. gambiae forme
molculaire S. Le second ple regroupe les facteurs ETP, insolation, temprature, vent et constitue le
ple aride.
Laxe factoriel 2, semble ne pas influencer tellement les deux formes molculaires. Il oppose les
localits lhydrographie et aux densits de population. Nous en dduisons que ces trois derniers
facteurs environnementaux ne sont pas associs la distribution des membres du complexe
An. gambiae s.s..
Laxe factoriel 3 semble avoir la mme structure que laxe factoriel 2, la seule diffrence, que la
topographie (altitude) nest plus associe la rpartition des membres du complexe An. gambiae.
Laxe factoriel 4 exclut les vents comme facteur environnemental associ aux membres du complexe
An gambiae.
V.3.3.4
La qualit de la reprsentation des diffrentes variables par rapport laxe factoriel sexprime
travers les valeurs de cosinus de variables qui sont consignes dans le Tableau 14.
Tableau 14 : Cosinus carrs des variables
VARIABLES \ AXES
F1
F2
F3
F4
PERCENT_S
0,756
0,021
0,002
0,003
PERCENT_M
0,602
0,005
0,074
0,030
ETP
0,645
0,050
0,048
0,003
VENT
0,192
0,000
0,001
0,430
TOPO
0,194
0,025
0,523
0,019
TEMPER
0,761
0,002
0,051
0,052
PRESSION
0,890
0,000
0,028
0,004
POP
0,036
0,426
0,120
0,095
PLUIE
0,938
0,001
0,000
0,000
LOCALITE
0,004
0,536
0,148
0,018
SOLEIL
0,923
0,003
0,002
0,001
HYDRO
0,040
0,218
0,063
0,374
NDVI
0,862
0,000
0,017
0,003
Lanalyse de ce tableau rvle que les pourcentages (abondance relative) dAn. gambiae forme
molculaire S, la temprature, la pression, les prcipitations, linsolation, la vgtation sont trs bien
reprsents sur laxe 1, les carrs de leurs cosinus tant suprieurs 0,6 sur cet axe. Les variables
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pourcentage dAn. gambiae forme molculaire M et ETP y sont moyennement bien reprsentes
avec des carrs de cosinus compris entre 0,4 et 0,65. Sur laxe factoriel 2, les localits avec un
cosinus carr gale 0,536 et les densits de population avec un cosinus carr de 0,426 sont
moyennement bien reprsentes. Aucune variable ny est bien reprsente. Cette mauvaise
reprsentation de variables sobserve sur les deux autres axes : laxe 3 et laxe 4. Sur ces deux
derniers axes, la variable topographie (altitude) a une bonne reprsentation sur laxe factoriel 3 et les
vents sur laxe factoriel 4.
V.3.3.5
Les contributions des variables aux axes factoriels sont consignes dans le Tableau 15. La Figure 51 en
donne une reprsentation graphique.
F1
F2
F3
F4
LOCALITE
0,052
41,646
13,727
1,696
POP
0,524
33,059
11,160
9,221
HYDRO
0,591
16,962
5,880
36,255
VENT
2,804
0,028
0,066
41,645
TOPO
2,837
1,904
48,610
1,797
PERCENT_M
8,801
0,426
6,849
2,926
ETP
9,421
3,905
4,438
0,320
PERCENT_S
11,053
1,605
0,155
0,310
TEMPER
11,117
0,139
4,754
5,007
NDVI
12,600
0,027
1,577
0,281
PRESSION
13,004
0,011
2,624
0,408
SOLEIL
13,493
0,223
0,158
0,125
PLUIE
13,702
0,062
0,003
0,009
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50
F1
F2
F3
F4
45
40
35
30
25
20
15
10
5
0
PLU IE
SO LEIL
PR ESSION
NDV I
T EM PER
PER C EN T _ S
ET P
PER C EN T _ M
T O PO
V EN T
HY D R O
PO P
LO C A LIT E
VARIABLES
Les contributions maximales laxe factoriel 1 ne dpassent gure 13,5%. De nombreux facteurs
contribuent donc la dfinition de cet axe. Nous distinguons trois groupes de variables sur laxe 1 :
-
les variables dont les contributions varient entre 15% et 12,5% constitues des prcipitations,
de linsolation, la pression et la vgtation ;
les variables dont les contributions varient entre 12,5% et 7,5% avec les variables
tempratures, pourcentage dAn. gambiae forme molculaire S, ETP, pourcentage dAn.
gambiae forme molculaire M ;
les variables avec des contributions trs faibles, infrieures 7,5%, que sont, la topographie
(altitude), les vents, lhydrographie, les densits de population et les localits.
Nous considrons donc que les variables prcipitation, insolation, pression et temprature contribuent
au premier axe factoriel et auquel sont galement associes les formes molculaires M et S.
Les autres axes factoriels disposent de deux ou trois variables aux contributions trs leves par
rapport aux restes de variables dpassant parfois les 40% des contributions. Ainsi, sur laxe factoriel
2, les localits reprsentent plus de 40% des contributions. Celles-ci, associes lhydrographie et
la population, reprsentent plus de 90% des contributions. Pour laxe factoriel 3, prs de la moiti des
contributions est dtenue par la topographie (altitude). Aprs la topographie (altitude), les
contributions les plus leves des autres variables natteignent pas les 15% et concernent seulement
deux variables : localit et population. Sur laxe factoriel 4, des vents (41,64%) et de lhydrographie
(36,25%) sont dominants. Les variables hydrographie, population, localit et vent ont des
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Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
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contributions intressantes sur les axes sur lesquels la contribution des formes molculaires M et S
dAn. gambiae s.s. sont trs faibles. Nous en dduisons que les formes molculaires M et S ne sont
pas associes ces axes. Les variables qui contribuent aux axes 2, 3, 4 contribuent donc peu la
dtermination de la distribution des formes molculaires M et S dAn. gambiae s.s.. Loccupation des
terres a t prsente comme un facteur cologique pouvant influencer la distribution spatiale dAn.
gambiae s.s.. Aussi, est-il important dapprcier le positionnement des modalits de cette variable
qualitative par rapport aux diffrents axes factoriels.
V.3.3.6
Les coordonnes des variables supplmentaires sur les 4 premiers axes factoriels sont reprsentes
dans le Tableau 16.
Tableau 16 : Les coordonnes des variables supplmentaires
VARIABLES \ AXES
F1
F2
F3
F4
Champ
0,065
-0,006
-0,117
0,034
Fort sche
2,449
-0,007
1,123
0,455
Habitat rural
-0,072
-0,564
0,943
-0,186
Savane
0,644
0,103
-0,172
0,081
Steppe
-3,572
0,755
0,359
-0,276
Territoire agro-forestier
0,755
-0,113
0,055
-0,027
Zone humide
-0,737
0,237
-0,640
-1,424
Zone nue
-3,980
0,334
1,121
-0,363
Les Figure 52, Figure 53 et Figure 54, ci-dessous prsentent la distribution des individus supplmentaires
(puisque la variable supplmentaire est nominale) sur les 4 axes factoriels.
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
151
Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
________________________________________________________________________________________________________________
Champ
Fort sche
4
Habitat rural
Savane
Steppe
Territoire agroforestier
-- axeF2(9,90%
) -->
Zone humide
Zone nu
-2
Barycentre de
Champ
Barycentre de
Fort sche
-4
Barycentre de
Habitat rural
Barycentre de
Savane
-6
Barycentre de
Steppe
Barycentre de
Territoire agroforestier
Barycentre de
Zone humide
-8
-10
Barycentre de
Zone nu
-12
-10
-8
-6
-4
-2
0
-- axe F1 (52,64 %) -->
Champ
8
Fort sche
Habitat rural
6
Savane
Steppe
4
Territoire agroforestier
Zone humide
Zone nu
Barycentre de
Champ
Barycentre de
Fort sche
-2
Barycentre de
Habitat rural
Barycentre de
Savane
-4
Barycentre de
Steppe
Barycentre de
Territoire agroforestier
Barycentre de
Zone humide
-6
Barycentre de
Zone nu
-8
-8
-6
-4
-2
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
152
Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
________________________________________________________________________________________________________________
Individus (axes F1 et F4 : 60,57 %)
Champ
Fort sche
6
Habitat rural
Savane
4
Steppe
Territoire agroforestier
Zone humide
0
Zone nu
Barycentre de
Champ
-2
Barycentre de
Fort sche
Barycentre de
Habitat rural
-4
Barycentre de
Savane
Barycentre de
Steppe
-6
-8
-8
-6
-4
-2
- - a xe F 1 ( 5 2 ,6 4 %) - - >
Barycentre de
Territoire agroforestier
Barycentre de
Zone humide
La position des barycentres des individus supplmentaires issus de la variable nominale occupation
des terres le long de laxe factoriel 1, et lopposition entre steppe, zone nue et fort sche,
confirment laridit comme lment fondamental de sparation des variables. Elle met aussi et
surtout en exergue l'opposition entre An. gambiae forme molculaire M et An. gambiae forme
molculaire S.
De cette analyse en composantes principales, nous dduisons :
1. quil existe des relations entre les facteurs de lenvironnement et la distribution des formes
molculaires M et S dAn. gambiae s.s. ;
2. quil existe une opposition entre les prfrences des formes molculaires M et S dAn.
gambiae. La forme molculaire M est associe aux facteurs environnementaux voquant
laridit comme la temprature, lETP, linsolation et la steppe. Elle prfre visiblement les
rgions les plus arides, correspondant au nord du Burkina Faso. An. gambiae forme
molculaire S quant lui est associ aux facteurs environnementaux qui voquent lhumidit
comme la prcipitation, la pression, les savanes et le NDVI. Il prfre donc les rgions
humides du pays c'est--dure le sud-ouest du Burkina Faso. Le ple de laridit et celui de
lhumidit constituent les extrmits dun axe qui se prsente premire vue comme le
paramtre dterminant de cette opposition ;
3. que la liaison entre les facteurs environnementaux et An. gambiae forme molculaire S est
plus vidente que celle davec An. gambiae forme molculaire M ;
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
153
Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
________________________________________________________________________________________________________________
retenir lanalyse des covariances (ANCOVA) comme technique de modlisation. Elle est
adapte la modlisation incluant des variables qualitatives. Toutefois, elle est remplace si
la contribution de ces variables qualitatives la modlisation est faible et insuffisante.
CONCLUSION DU CHAPITRE V
Les donnes entomologiques collectes sont analyses trois niveaux : le niveau An. gambiae sl, le
niveau An. gambiae forme molculaire S et le niveau An. gambiae forme molculaire M. La
distribution des frquences observes dAn. gambiae sl est assez normale. Celle dAn. gambiae forme
molculaire M est centre au nord-est tandis que celle dAn. gambiae forme molculaire S est plutt
centre au sud-ouest. Toutes ces distributions sont spatialement indpendantes lchelle de collecte
des donnes. Toutefois, elles prsentent localement des dpendances spatiales. Lanalyse des agrgats
et des configurations spatiales rvle une homognit spatiale au nord pour An. gambiae forme
molculaire M et au sud pour An. gambiae forme molculaire S.
Les statistiques spatiales descriptives, en loccurrence les ellipses de dviation standard, les
barycentres et les centrodes ont permis de mettre en exergue le caractre orient et non alatoire de
la distribution spatiale des frquences du complexe et de ses membres. Lutilisation des indices
locaux dassociation spatiale, en loccurrence lindice dAnselin et Moran et Gi*de Getis et Ord ont
permis de montrer l'existance d'agrgats spatiaux orients dans la mme direction que celle des
ellipses de dviation standard pour les membres du complexe pris individuellement. Ces indices ont
rvl galement trois niveaux de structuration spatiale des frquences :
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
154
Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et configurations locale
________________________________________________________________________________________________________________
An. gambiae forme molculaire S est trs bien structur avec des agrgats marqus et bien
repartis dans lespace ;
An. gambiae forme molculaire M est galement bien structur mais il y a quelques bruits
dans la zone sud-ouest;
Ces rsultats permettent de dire que lhypothse de distribution spatiale non alatoire des formes
molculaires S et M d'An. gambiae s.s. est vrifie. Une direction et des agrgats ont t galement
identifis. Les tests dautocorrelation montre lindpendance spatiale et le fait que lespace (absolu)
est insuffisant pour expliquer la distribution observe.
Les principaux rsultats de lanalyse des relations entre la distribution spatiale des frquences
observes et la distribution spatiale des facteurs environnementaux obtenus sont la mise en exergue
des zones de colonisation prfrentielle opposes entre la forme molculaire M et la forme
molculaire S dAn. gambiae au Burkina Faso. La forme molculaire S prfre les rgions du sud les
plus humides tandis que la forme molculaire M prfre les rgions du nord arides.
Les facteurs les plus dterminants de la distribution spatiale de la forme molculaire S sont : lETP,
linsolation et le NDVI. Les deux premiers sont ngativement corrls avec labondance de la forme
molculaire S. Labondance relative de S est positivement corrle au NDVI et exprime la prfrence
de cette forme pour les milieux les plus humides du pays.
Pour la forme molculaire M, les facteurs les plus dterminants dans la distribution spatiale sont :
laltitude, la pression, linsolation et la densit de vgtation (NDVI). Laltitude, la pression et le
NDVI sont tous dautant plus levs que le milieu est humide et sont tous en corrlation ngative
avec labondance de la forme molculaire M. Linsolation qui voque laridit est en liaison positive
avec labondance de la forme molculaire M, indiquant la prfrence de cette forme pour les milieux
arides.
Compte tenu de la lisibilit de ces tendances observes, il est tout fait possible que cette distribution
des formes molculaires puisse tre dcrite de faon formelle par une fonction. Cest lobjet du
chapitre 6 dans lequel nous procdons lexpression des abondances relatives des deux formes
molculaires M et S en fonction des facteurs environnementaux.
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
155
VI.1
Variable
Nbre de
Nbre de
Nbre de valeurs
Somme
des poids
Moyenne
Ecart-type
POURCENT_M
255
255
255
27,755
28,448
POURCENT_S
255
255
255
42,066
37,135
Les variables explicatives sont au nombre de 13, dont 11 quantitatives et 2 qualitatives. Le rsum des
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
156
variables explicatives quantitatives59 pour les deux variables expliquer est contenu dans le Tableau 18.
Tableau 18 : Statistiques descriptives sur les variables explicatives
VARIABLE
PARAMETRE REPRESENTE
MOYENNE
ECARTTYPE
169
13
ETP
VENT
1,841
0,221
TOPO
Topographie/ altitude
320
54
TEMPER
Temprature moyenne
28
0,41
PRESSION
18,257
1,264
POP
Densit de population
79
72
PLUIE
776
183
LOCALITE
1543
2083
SOLEIL
Insolation
0,68
0,03
HYDRO
496
452
NDVI
134
22
Quant aux variables explicatives qualitatives, elles sont rsums dans le Tableau 19.
Tableau 19 : Statistiques descriptives sur les variables qualitatives
VARIABLE
OCTER_NOMA
NOMBRE DE
PARAMETRE REPRESENTE
MODALITES
15
Champ
180
Territoire agro-forestier
27
Steppe
10
Zone nue
Savane
17
Zone humide
Fort sche
Sols Hydromorphes
Sols peu volus, minraux bruts o
Formation pdologique
DOBSERVATION
Habitat rural
SOL
FREQUENCES
MODALITES
dgrads
93
68
67
Sols Mull
14
Vertisols
12
Sols Isohumiques
59
composantes principales ont t maintenues comme variables, car les modules de calcul
disposent de test danalyse de leur contribution aux modles.
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
157
LANCOVA est effectue de faon spare pour chaque forme molculaire dAn. gambiae s.s.. Aussi, la
prsentation des rsultats est-elle faite de manire reflter cette sparation entre les deux formes
molculaires.
VI.1.2.1
LANCOVA donne les rsultats suivants pour An. gambiae forme molculaire S :
Pour An. gambiae forme molculaire S, nous obtenons, un coefficient de corrlation R = 0,880, un
coefficient de dtermination R2 = 0,774, un coefficient de dtermination ajust Raj.= 0,751 et un
SCR = 79193,944. Nous retenons de ce rsultat que 77% de la variance observe dans la distribution
dAn. gambiae forme molculaire S sexplique par les 11 variables dentres quantitatives.
Le test de Fisher associ lANCOVA dans son ensemble permet dvaluer dabord la significativit de
la quantit des informations fournies par les 13 variables (quantitative et qualitative) au modle. Les
rsultats du test sont contenus dans le Tableau 20.
Source
ddl
Carr moyen
F de Fisher
Probabilit > F
Modle
23
271070,777
11785,686
34,378
< 0,0001
Rsidus
231
79193,944
342,831
Total
254
350264,722
La probabilit associe au test de Fisher est infrieure 0,0001. Il y a donc moins de 0,1% de chance de
se tromper en disant que les variables explicatives utilises sont pertinentes pour expliquer la variance de
pourcentages dAn. gambiae forme molculaire S.
Les tests prcdents permettent de vrifier que les variables prises dans leur globalit apportent une
quantit dinformations significatives au modle. Si cela est avr au niveau global, en est-il de mme
vrai pour chacune delles ? Lvaluation de la significativit de lapport de chaque variable au modle
est effectue avec le test de Fisher type I SS et type III SS et les rsultats sont contenus dans les
Tableau 21
et Tableau 22
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
158
Tableau 21 : Analyse du modle (Type I SS) : test de Fisher sur les variables dans lordre de slection
Source
ddl
F de Fisher
Probabilit > F
ETP
108868,911
108868,911
317,559
< 0,0001
VENT
7289,890
7289,890
21,264
< 0,0001
TOPO
16962,617
16962,617
49,478
< 0,0001
TEMPER
49930,813
49930,813
145,643
< 0,0001
PRESSION
58172,652
58172,652
169,683
< 0,0001
POP
2697,595
2697,595
7,869
0,005
PLUIE
334,621
334,621
0,976
0,324
LOCALITE
3414,847
3414,847
9,961
0,002
SOLEIL
8582,472
8582,472
25,034
< 0,0001
HYDRO
236,964
236,964
0,691
0,407
NDVI
10486,994
10486,994
30,589
< 0,0001
OCTER_NOMA
803,819
114,831
0,335
0,937
SOL
3288,584
657,717
1,918
0,092
Tableau 22 : Analyse du modle (Type III SS) : test de Fisher sur les variables quel que soit lordre de slection
ddl
Carr moyen
F de Fisher
Probabilit > F
ETP
3377,367
3377,367
9,851
0,002
VENT
624,765
624,765
1,822
0,178
TOPO
3695,415
3695,415
10,779
0,001
TEMPER
182,119
182,119
0,531
0,467
PRESSION
2041,856
2041,856
5,956
0,015
POP
14,189
14,189
0,041
0,839
PLUIE
893,095
893,095
2,605
0,108
LOCALITE
1512,114
1512,114
4,411
0,037
SOLEIL
3252,624
3252,624
9,488
0,002
HYDRO
7,962
7,962
0,023
0,879
NDVI
11368,180
11368,180
33,160
< 0,0001
OCTER_NOMA
1254,919
179,274
0,523
0,817
SOL
3288,584
657,717
1,918
0,092
Source
Daprs les rsultats de ces tests, les variables qualitatives, (occupation des terres et sols) napportent pas
une quantit dinformation significative au modle. Pour le premier test, il y a respectivement 93 % et
9,2 % de chance de se tromper en disant que loccupation des terres et les sols apportent une information
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
159
0,835
R (coefficient de dtermination)
0,697
0,666
SCR
62372,707
Au regard de ces coefficients, les variables retenues expliquent 70% de la variabilit observe. Les 30%
restant sont lis dautres facteurs ou des erreurs de mesure. La significativit des informations
fournies par les variables dans leur ensemble est galement bonne comme le confirment les rsultats du
test de Fisher consigns dans le Tableau 24 ci-dessous.
Tableau 24 : test de Fisher sur la significativit de la quantit de donnes par rapport au modle
Source
ddl
Carr moyen
F de Fisher
Probabilit > F
23,057
< 0,0001
Modle
23
143188,133
6225,571
Rsidus
231
62372,707
270,012
Total
254
205560,840
Ainsi, y a-t-il plus de 99% de chance que les variables apportent une information de quantit
significative au modle, car la probabilit associe au test de Fisher est de 0,0001.
La pertinence des variables prises individuellement par rapport au modle a fait lobjet dun test de
Fisher de Type I SS et dun test de Fisher de Type III SS. Les rsultats de ces tests sont consigns dans
les Tableau 25 et Tableau 26.
Tableau 25 : Analyse du modle (Type I SS) : test de Fisher sur les variables dans lordre de slection
Somme des
Source
ddl
carrs
Carr moyen
F de Fisher
Probabilit > F
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
160
ETP
87770,956
87770,956
325,064
< 0,0001
VENT
712,121
712,121
2,637
0,106
TOPO
2174,481
2174,481
8,053
0,005
TEMPER
3517,021
3517,021
13,025
0,000
PRESSION
25029,875
25029,875
92,699
< 0,0001
POP
35,273
35,273
0,131
0,718
PLUIE
1365,148
1365,148
5,056
0,025
LOCALITE
652,732
652,732
2,417
0,121
SOLEIL
4146,747
4146,747
15,358
0,000
HYDRO
582,817
582,817
2,158
0,143
NDVI
13339,163
13339,163
49,402
< 0,0001
OCTER_NOMA
2506,583
358,083
1,326
0,239
SOL
1355,217
271,043
1,004
0,416
Tableau 26 : Analyse du modle (Type III SS) : test de Fisher sur les variables quel que soit lordre de slection
Somme des
Source
ddl
carrs
Carr moyen
F de Fisher
Probabilit > F
ETP
2639,968
2639,968
9,777
0,002
VENT
826,599
826,599
3,061
0,082
TOPO
6677,828
6677,828
24,732
< 0,0001
TEMPER
513,079
513,079
1,900
0,169
PRESSION
3408,675
3408,675
12,624
0,000
POP
301,586
301,586
1,117
0,292
PLUIE
4,016
4,016
0,015
0,903
LOCALITE
1596,891
1596,891
5,914
0,016
SOLEIL
5345,737
5345,737
19,798
< 0,0001
HYDRO
1048,351
1048,351
3,883
0,050
NDVI
12245,092
12245,092
45,350
< 0,0001
OCTER_NOMA
2374,138
339,163
1,256
0,273
SOL
1355,217
271,043
1,004
0,416
La contribution des variables en rouge dans les deux tableaux ci-avant nest pas significative. Lapport
de ces variables nest donc pas significatif dans la qualit du modle. Les deux variables qualitatives
(loccupation des terres et sols) font partie des variables contribution faible, peu significative au
modle. Puisque ce sont elles qui ont justifi lutilisation de lANCOVA comme technique de
modlisation, leurs faibles contributions autorisent utiliser seulement les variables quantitatives. Ainsi,
plutt que lANCOVA, une rgression multiple est utilise pour la modlisation dAn. gambiae forme
molculaire M.
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
161
VI.2
Moyenne
Ecart-type
POURCENT_S
255
255
255
42,066
37,135
POURCENT_M
255
255
255
27,755
28,448
Les variables explicatives retenues sont toutes les variables quantitatives de lANCOVA. Le Tableau 28
ci-dessous contient la liste des variables explicatives et leurs rsums statistiques.
Tableau 28 : Rsum pour les variables explicatives
Variable
60
Signifiant de la variable
Moyenne
Ecart-type
ETP
Evapo-transpiration
169
13
VENT
Vitesse du vent
1,84
0,22
TOPO
Topographie / Altitude
320
54
TEMPER
Temprature moyenne
28
0,41
PRESSION
Pression
18,25
1,26
POP
Densit
79
72
PLUIE
Pluviomtrie
776
183
La rgression linaire semble avoir les meilleurs rsultats en terme de dtermination de la relation entre lenvironnement et la distribution molculaire M
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
162
SOLEIL
Insolation
0,68
0,03
LOCALITE
1543
2083
HYDRO
496
NDVI
134
22
Chaque rgression utilise un minimum de deux variables. Le maximum de variables utilises par
rgression est de 3 pour An. gambiae forme molculaire S et de 4 pour An. gambiae forme molculaire
M. Le seuil de confiance est de 95% et le critre dvaluation de la rgression est le coefficient de
dtermination (R2). Les tests de Fisher de type I SS et type III SS sont associs au traitement pour
lvaluation de la significativit de la quantit de linformation apporte par les diffrentes variables la
modlisation.
SOLEIL, NDVI
0,720
0,746
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
163
Daprs ce Tableau 29, les trois meilleures variables qui permettent dexpliquer la variance observe sont :
linsolation, la vgtation et lvapotranspiration potentielle, en dpit de la colinarit61. Le Tableau 30, cidessous, donne les coefficients dajustement du meilleur modle, le modle 2.
Tableau 30 : Coefficients d'ajustement du modle 2
R (coefficient de corrlation)
0,864
R (coefficient de dtermination)
0,746
0,743
SCR
89081,950
Le coefficient de dtermination atteint jusqu 0,746. Cela signifie que 74,6% de la variance sont
expliqus par la combinaison linaire des trois variables que sont linsolation, lETP et la vgtation. Le
test de Fisher sur lanalyse de la significativit de la quantit dinformation apporte par les variables
prises dans leur globalit confirme que les variables fournissent suffisamment dinformations
llaboration du modle (Tableau 31).
Tableau 31 : Le test de Fisher sur lanalyse de la significativit de la quantit dinformation apporte par les variables
la rgression pour Anopheles gambiae forme molculaire S
Source
ddl
Carr moyen
Modle
261182,772
87060,924
Rsidus
251
89081,950
354,908
Total
254
350264,722
F de Fisher
Probabilit > F
245,305
< 0,0001
La probabilit associe au test F de Fisher est de 0,0001 soit moins de 1% de chance de se tromper en
considrant que la quantit dinformation apporte par lETP, linsolation et la vgtation est
significative pour le modle.
Les Tableau 32 et Tableau 33 contiennent les rsultats de test de Fisher de type I SS et de type III SS.
Tableau 32 : Test de Fisher de type I SS
Source
ddl
Carr moyen
F de Fisher
Pr > F
ETP
108868,911
108868,911
306,752
< 0,0001
SOLEIL
138071,254
138071,254
389,034
< 0,0001
61
La rgression repose sur des postulats dont labsence colinarit entre les variables explicatives. Toutefois, ce postulat est
viol mais la qualit du modle et sa conformit au terrain ont conduit conserver dans la fonction des variables lies sans
altrer la pertinence du modle. Cette situation est bien connue dans la littrature scientifique avec par exemple Kennedy,
P., 1992, A Guide to Econometrics, Blackwell Publishers, 410 p. et Conlisk, J., 1971, When collinearity is desirable:
Western Economic Journal, v. 9, p. 393-407.
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
164
NDVI
14242,607
14242,607
40,130
< 0,0001
ddl
Carr moyen
F de Fisher
Pr > F
ETP
8839,892
8839,892
24,908
< 0,0001
SOLEIL
34816,671
34816,671
98,101
< 0,0001
NDVI
14242,607
14242,607
40,130
< 0,0001
Les probabilits associes ces tests sont toutes infrieures 0,0001. Ce qui permet de dire que les trois
variables, dans un ordre ou non, apportent chacune une quantit dinformations significatives au modle.
Puisque les variables sont pertinentes par rapport au modle du fait de la significativit de la quantit
dinformations apportes, les paramtres du modle peuvent tre prsents (Tableau 34).
Valeur
Ecart-type t de Student
Pr > t
Borne infrieure 95 %
Borne suprieure 95 %
Constante
382,484
67,080
5,702
< 0,0001
250,372
514,596
ETP
0,713
0,143
4,991
< 0,0001
0,431
0,994
SOLEIL
-813,672
82,151
-9,905
< 0,0001
-975,465
-651,878
NDVI
0,701
0,111
6,335
< 0,0001
0,483
0,919
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
165
De la rgression ralise entre les pourcentages de la forme molculaire M dAn. gambiae et les donnes
environnementales, les trois modles se dgagent (le Tableau 35).
Variable(s)
ETP NDVI
0,594
0,617
0,641
0,800
R (coefficient de dtermination)
0,641
0,635
SCR
73851,489
Il savre, la lecture de ce tableau, que 64,1% de la variance observe dans les pourcentages dAn.
gambiae forme molculaire S sexpliquent par la combinaison linaire de quatre variables que sont la
topographie (altitude), la pression, la vgtation et linsolation. Ces variables apportent une quantit
dinformations statistiquement significatives au modle. En tmoigne le test de Fisher ralis pour
valuer la qualit de linformation apporte par les variables. Les rsultats sont consigns dans le Tableau
37.
Tableau 37 : Evaluation de la valeur de l'information apporte par les variables (H0 = Y=Moy(Y))
Source
ddl
Carr moyen
F de Fisher
Pr > F
Modle
131709,350
32927,338
111,465
< 0,0001
Rsidus
250
73851,489
295,406
Total
254
205560,840
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
166
Il ressort, la lecture de ce tableau, que la probabilit associe au test de Fisher est infrieure 1%. Les
variables apportent une quantit dinformations significatives au modle plus de 99%.
Cette apprciation gnrale de la contribution des variables dans leur globalit pourrait cacher la faible
contribution dune des quatre variables intervenant dans le modle. Les tests de Fisher de Type I SS et
de Type III SS sont effectus pour valuer la contribution de chaque variable, dabord, dans lordre puis
de faon quelconque. Les rsultats de ces tests sont reports dans les Tableau 38 et Tableau 39.
Tableau 38 : Analyse du modle (Type I SS)
Somme des
Source
ddl
carrs
Carr moyen
F de Fisher
Pr > F
TOPO
13648,055
13648,055
46,201
< 0,0001
PRESSION
94782,658
94782,658
320,856
< 0,0001
SOLEIL
5452,629
5452,629
18,458
< 0,0001
NDVI
17826,008
17826,008
60,344
< 0,0001
ddl
carrs
Carr moyen
F de Fisher
Pr > F
TOPO
4907,930
4907,930
16,614
< 0,0001
PRESSION
11375,484
11375,484
38,508
< 0,0001
SOLEIL
10053,822
10053,822
34,034
< 0,0001
NDVI
17826,008
17826,008
60,344
< 0,0001
Ils nous permettent de conclure, au regard des probabilits associes au test de Fisher, que les variables,
prises individuellement et quelque soit lordre, apportent une quantit dinformation significative au
modle. En effet, le test de probabilit associe chacune des variables prises dans lordre ou non est
infrieur 1%. Nous affirmons plus de 99%, que les variables altitude, pression, insolation et
vgtation apportent une quantit dinformations significatives llaboration du modle.
Fort de cette significativit de linformation utilise et de la contribution de chacune des variables, les
paramtres du modle sont les suivants (Tableau 40).
Valeur
Ecart type
t de Student
Pr > t
Borne infrieure 95 %
Borne suprieure 95 %
958,241
128,165
7,477
< 0,0001
705,820
1210,662
TOPO
-0,098
0,024
-4,076
< 0,0001
-0,146
-0,051
PRESSION
-17,389
2,802
-6,205
< 0,0001
-22,908
-11,870
Constante
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
167
SOLEIL
NDVI
-687,661
117,874
-5,834
< 0,0001
-919,814
-455,508
-0,832
0,107
-7,768
< 0,0001
-1,042
-0,621
VI.3
Lanalyse de la contribution globale puis individuelle des variables et celle des coefficients permettent
dapprcier la qualit de linformation par rapport au modle. Lvaluation du modle aide apprcier la
compatibilit du modle par rapport la ralit du terrain. Cette valuation va se faire de deux
manires : lanalyse des rsidus et la comparaison des rsultats du modle thorique avec des donnes
empiriques.
168
Pour An. gambiae forme molculaire S, les valeurs de rsidus centrs rduits sont reprsentes sur la
Figure 55.
Rsidus centrs-rduits
Ouezzindo ug
Tchemo ko
Salbisgo
Ouo lo nko to
M o gueya
Lao le
Kaniagara
Gado
Danpan
B o ro mo
B adado ugo u
Yibi
Tapo a
B o uno u
P o uytenga
M atiaco ali
Ko ualo u
Go udrin
Dwana
B o umtenga
B assambili
To nga
P issiga
Lere
Gassel P art
A ribinda
-5
-4
-3
-2
-1
R s idus c e nt r s - r duit s
Figure 55 : Histogramme des rsidus centrs rduits pour An. gambiae forme molculaire S
Le Tableau 41 contient la liste des localits qui ont des pourcentages dAn. gambiae forme molculaire S
anormaux.
Tableau 41 : Liste des localits ayant des rsidus anormaux pour An. gambiae forme molculaire S
Rsidus
%S
Individus Poids empirique % S (Modle)
Rsidus
rduits
Moy.
Moy.
Ind.
Ind.
Koassa
88,235
34,459
53,776
2,854
32,001
36,918
-2,725
71,644
Lantaogo
88,889
35,321
53,568
2,843
32,840
37,801
-1,865
72,506
Tapoa
19,231
77,968
-58,737
-3,118
70,792
85,143
40,177
115,758
Zinekwe
84,211
42,301
41,910
2,225
38,870
45,731
5,040
79,562
Alana
44,444
91,558
-47,114
-2,501
84,254
98,862
53,743
129,373
Mogueya
4,348
83,045
-78,697
-4,177
79,093
86,997
45,732
120,358
Monkui
0,000
53,876
-53,876
-2,860
50,905
56,846
16,654
91,097
Rabyiri
77,778
30,941
46,837
2,486
27,796
34,085
-6,295
68,176
Tomo
92,857
39,354
53,503
2,840
35,508
43,200
2,052
76,655
Timba
54,167
95,185
-41,018
-2,177
87,977
102,393
57,389
132,981
Sur les 255 individus de lchantillon, 10 ont des rsidus centrs rduits situs en dehors de lintervalle
]-1,96 ; 1,96[, soit 4%. Puisque 4% est infrieure 5%, le modle est donc une bonne approximation de
la distribution et reste valable au seuil de confiance de 95%.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
169
Ce premier niveau de validation du modle donne la possibilit de production dune carte thorique de la
distribution de la forme molculaire S dAn. gambiae s.s. au Burkina Faso (Figure 56). Nous observons
sur cette carte des zones trs homognes de pourcentage de la forme molculaire S dAn. gambiae s.s..
En dehors de quelques lots trs restreints, surtout dans la partie nord du pays, les pourcentages prdits
sont disposs en bandes, avec une augmentation quasi rgulire du nord vers le sud-ouest. Cette
structure rubane est trs semblable celle que prsentent certains lments du milieu physique comme
les
tempratures,
les
prcipitations,
la
vgtation
(Figure
6,
Figure
8,
Figure 56 : Prdiction de la distribution spatiale des abondances relatives dAn. gambiae forme molculaire S
Nous pouvons donc dire que lenvironnement prsente une qualit dcroissante pour An. gambiae forme
molculaire S au fur mesure que lon va du nord vers le sud-ouest. Le nord nest donc pas favorable
la prolifration de la forme molculaire S. Toutefois, une mosaque de peuplements isols se trouve dans
certaines parties du nord (Figure 57).
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
170
Ces discontinuits observes correspondent lexistence de bas-fonds importants. Lhumidit est ainsi
confirme comme le facteur dterminant de la distribution dAn. gambiae forme molculaire S. Cette
mme continuit sera-t-elle observable pour An. gambiae forme molculaire M, si le modle est valid
au plan statistique ?
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
171
-2
-1
R s idus c e nt r s - r duit s
Figure 58 : Histogramme des rsidus centrs rduits pour An. gambiae forme molculaire M
Certains individus, sur ce graphique, ont des valeurs situes lextrieur de lintervalle de]-1,96 ; 1,96[.
Le tableau suivant contient les informations sur les individus de la distribution qui ont des valeurs
anormalement leves ou anormalement basses.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
172
Tableau 42 : Liste des localits ayant des rsidus anormaux pour An. gambiae forme molculaire M
Rsidus
Individus
Poids
%_M
%_M (Modle)
Rsidus
centrs-
Interv. Inf.
Interv. Sup.
rduits
Moy.
Moy.
Interv. Sup.
Interv. Inf. In Ind.
Niounougou
90,909
44,819
46,090
2,682
41,698
47,941
10,825
78,813
Ouenbouloug
81,250
40,459
40,791
2,373
37,270
Tougouri
88,000
52,946
35,054
2,040
49,591
43,647
6,459
74,459
56,300
18,930
86,962
Belmin
60,870
26,633
34,237
1,992
22,693
Fingla
63,158
19,286
43,872
2,553
15,219
30,572
-7,446
60,712
23,354
-14,808
53,380
Goumaogo
44,444
-0,599
45,044
2,621
-5,824
4,626
-34,850
33,652
Tamassogo
88,000
53,826
34,174
1,988
50,278
57,374
19,790
87,862
Tapoa
53,846
16,480
37,366
2,174
9,674
23,287
-18,048
51,008
You
5,263
47,106
-41,843
-2,434
41,362
52,849
12,771
81,440
Alana
55,556
21,248
34,308
1,996
14,379
28,117
-13,293
55,788
Badara
88,235
45,372
42,863
2,494
40,279
50,465
11,140
79,603
Iboudie
66,667
32,399
34,268
1,994
29,362
35,435
-1,588
66,385
Monkui
71,429
36,709
34,720
2,020
32,116
41,302
2,548
70,870
Sandimisso
43,750
6,104
37,646
2,190
1,363
10,845
-28,077
40,285
Sur les 255 individus que compte la distribution, 14 ont des valeurs hors de lintervalle de confiance soit
5%. Nous retenons donc que le modle, dans lintervalle de confiance retenu, est une bonne
approximation de la distribution. Ce rsultat en validant statistiquement le modle permet de produire
une carte de distribution de la forme molculaire M dAn. gambiae s.s. (Figure 59).
Figure 59 : Prdiction de la distribution spatiale des abondances relatives dAn. gambiae forme molculaire M
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
173
La distribution des abondances relatives de la forme molculaire M dAn. gambiae s.s. prsente
galement une forme rubane mais moins lisse, comparativement An. gambiae forme molculaire S. Il
y a, en effet, beaucoup plus de poches de peuplement dans la zone dfavorable du sud-ouest. Au regard
de la densit des poches observes, le sud-ouest nest pas totalement dfavorable la forme molculaire
M dAn. gambiae. Une observation plus pousse permet de remarquer que ce sont les zones daltitudes
les plus leves du pays qui ont des valeurs nulles. Ces poches correspondent galement des rserves
(forts classes). Elles prsentent les conditions les moins favorables lcologie de la forme
molculaire M, puisque le modle y prdit des abondances relatives nulles. Au fond, il sagit des zones
les plus humides. Cela suggre une plus grande plasticit cologique de la forme molculaire M par
rapport la forme molculaire S. Cela montre galement la sensibilit de la forme molculaire M par
rapport des conditions dhumidit trs leves. En effet, les facis introduient par la topographie
(altitude) et la vgtation (les zones de rserve ont les NDVI les plus levs) voquent les conditions
dhumidit les plus fortes (Figure 60).
Figure 60 : Discontinuit de la rpartition de la forme molculaire M dAn. gambiae s.s., Altitude et NDVI
Cette situation permet de comprendre la prise en compte des altitudes dans la dtermination de la
distribution. Elle montre galement que les facteurs cologiques invoquant lhumidit/aridit demeurent
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
174
les dterminants les plus importants dans la rpartition des formes molculaires S et M dAn. gambiae
s.s.. Toutefois, la forme molculaire M prsente une plus grande capacit dadaptation lhumidit que
la forme molculaire S laridit.
Lanalyse des rsidus a conduit une validation statistique de fonctions qui modlisent la distribution
spatiale des formes molculaire S et M dAn. gambiae s.s.. Lanalyse des cartes issues de ces modles
confirme les paramtres associs laridit et lhumidit comme les facteurs cologiques les plus
dterminants dans la distribution spatiale de ces vecteurs du paludisme. Il apparat galement lanalyse
que la forme molculaire M est plus rsistante la variabilit du milieu que la forme S.
Sur le plan statistique, ces modles sont valables. Mais cette validit peut-elle tre confirme par les
donnes empiriques, non utilises dans la modlisation. Comment se comportent les modles face aux
donnes de terrain ?
VI.3.2 CONFRONTATION DES DONNEES DES MODELES AUX DONNEES
EMPIRIQUES
Pour confronter les rsultats aux modles, 45 points ont t tirs au hasard sur les 300 points que
comptait le transect. Ces 45 points, soit 15% de lchantillon, ont t rservs pour confronter les
modles aux donnes empiriques.
VI.3.2.1
vrit terrain
Pour An. gambiae forme molculaire S (Figure 61), le coefficient de corrlation entre la distribution
observe et la distribution prdite est de 0,81. Le coefficient de corrlation est positif et trs lev. Ce
qui signifie que les valeurs voluent dans le mme sens que les valeurs observes.
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
175
120
100
DONNEES OBSERVEES
M PREDIT X S PREDIT
80
60
40
20
R = 0,816
0
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
-20
Variable
POURC_S
Observation
45
S_PREDIT
45
Obs. sans
donnes
manquantes
45
Minimum
0,000
45
-12,573
50,874
33,473
0,244
P-value
alpha
0,115
0,05
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
176
1
0,9
Frquence cumule
0,8
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
-10
10
30
50
POURC_S
70
90
S_PREDIT x OBSERVE
Figure 62 : Comparaison des pourcentages observs avec des pourcentages prdits de la forme molculaire S
La diffrence D entre les deux chantillons est 0,244 sur une chelle de 0 1. La diffrence est proche
de 0, le niveau de ressemblance maximum, le niveau didentit parfaite. La p-Value est aussi suprieure
au seuil de confiance. Les carts entre la distribution calcule et la distribution observe ne sont donc
pas significatifs. Ce dernier contrle confirme la validit du modle pour la forme molculaire S dAn.
gambiae s.s..
VI.3.2.2
vrit terrain
100
DONNEES OBSERVEES
90
80
M PREDIT X M OBSERVE
70
60
50
40
30
20
R = 0,737
10
0
-10
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
Pour la forme molculaire M (Figure 63), la corrlation entre les valeurs de pourcentages prdits par le
modle et celles observes sur le terrain est de 0,73.
__________________________________________________________________________________________________________________________________
Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
177
Ce coefficient est galement positif. Les donnes prdites sont trs bien corrles avec les donnes
observes. Les modles sont donc de bons prdicateurs des valeurs observes. Le Test de KolmogorovSmirnov sur deux chantillons / test bilatral effectu entre les donnes calcules avec le modle et les
donnes empiriques est effectu. Lobjectif de ce test est de vrifier sil y a une diffrence significative
entre elles. Les donnes utilises pour ce test prsentent les caractristiques suivantes (Tableau 45).
Variable
Observations
POURC_M
M_PREDIT x
OBSERVE
Obs. avec
Obs. sans
donnes
donnes
manquantes manquantes
Minimum
Maximum
Moyenne
Ecart-type
45
45
100
19
27
45
45
-2,8
87,5
20,5
22,5
0,200
0,295
0,05
1
0,9
0,8
Frquence cumule
0,7
0,6
0,5
0,4
0,3
0,2
0,1
0
-5
15
35
55
POURC_M
75
95
M_PREDIT x OBSERVE
Figure 64 : Comparaison des pourcentages observs avec les frquences prdites de la forme molculaire M
La diffrence D sur une chelle de 0 1, entre les deux chantillons est 0,244. Cette diffrence est faible
car plus proche de 0 (valeur au cas didentit parfaite). La P-value est de 0,295 et est suprieure au seuil
de confiance qui est de 0,05. La diffrence entre les donnes calcules et les donnes observes nest pas
significative. Ce test confirme que le modle est valable pour lvaluation de la distribution spatiale de la
forme molculaire M dAn. gambiae s.s..
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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Il est bon dobserver (Figure 65) que les valeurs prdites par le modle de S et celles prdites par le
modle M ont un coefficient de corrlation de -0,84.
90
80
70
M PREDIT x S PREDIT
PREDIT S
60
50
R = - 0,848
40
30
20
10
0
-10
10
30
-10
PREDIT M
50
70
90
Cela signifie que le modle produit pour la forme molculaire S dAn. gambiae s.s. est pratiquement
loppos de celui produit pour la forme molculaire M dAn. gambiae s.s.. Lorsque le pourcentage dAn.
gambiae forme molculaire S augmente en un lieu, celui dAn. gambiae forme molculaire M diminue.
Nous en dduisons une opposition des prfrences cologiques entre les formes molculaires M et S
dAn. gambiae s.s.. La forme molculaire S prfre les milieux humides alors que la forme molculaire
M prfre les milieux plus arides.
Ces derniers rsultats confirment lhypothse de dpart selon laquelle il est possible de prdire la
population des deux formes molculaires M et S dAn. gambiae s.s., partir dune connaissance des
facteurs environnementaux les plus dterminants dans leur distribution spatiale. Ces paramtres sont le
NDVI, linsolation, lETP, la pression et la topographie (altitude). Ils confirment galement lopposition
entre les deux formes molculaires dAn. gambiae s.s. comme nous la montr la forte corrlation
ngative entre les valeurs prdites par les deux modles ainsi que la distribution spatiale oppose.
CONCLUSION DU CHAPITRE VI
Ce chapitre rvle lexpression des abondances relatives des formes molculaires M et S en fonction de
quatre et trois facteurs environnementaux. Il a cependant t plus difficile de modliser la forme
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
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molculaire M par rapport la forme molculaire S. Il a fallu plus des paramtres pour modliser la
distribution spatiale de la forme molculaire
M que
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
180
Conclusion Gnrale
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CONCLUSION GENERALE
Lintrt de ce travail est de contribuer la lutte contre lune des maladies les plus meurtrires de
notre temps, en menant des investigations sur lun des maillons de sa chane de transmission : les
vecteurs. Maladie parasitaire, maladie transmission vectorielle, la stratgie de lutte contre le
paludisme ne peut se soustraire du contrle de la faune anophlienne, qui elle dpend, pour une part
importante, de la capacit de lenvironnement lui offrir les conditions cologiques favorables sa
survie et sa reproduction.
Cette tude a eu pour objectifs de dcrire lorganisation spatiale des formes molculaires M et S
dAn. gambiae au Burkina Faso et den identifier les facteurs dterminants. Elle visait galement
produire des modles de distribution spatiale des espces vises.
Le paradigme de la biogographie, enrichi des apports indispensables de lentomologie et des outils
et mthodes de lanalyse spatiale, de lanalyse de donnes statistiques et des systmes dinformation
gographique, a permis de structurer la rflexion autour de la distribution spatiale des formes
molculaires M et S dAn. gambiae s.s. dans une perspective pluridisciplinaire.
Ce travail de recherche a montr que les formes molculaires M et S dAn. gambiae s.s. sont reparties
au Burkina Faso en trois grandes zones. Le nord et le nord-est du pays, correspondant aux rgions
administratives du Sahel, du Centre-Nord et du Nord, est la zone o prdomine la molculaire M.
Dans le sud-ouest et le sud du Faso ouvrant les rgions du Sud-Ouest, des Cascades et des HautsBassins, la forme molculaire S est largement dominante. Entre ces deux zones de concentrations
stend une zone de transition.
Deux groupes de facteurs environnementaux opposs caractrisent les zones de concentration et
influencent de faon significative la distribution spatiale des deux formes molculaires. Le premier
groupe de facteurs est li lhumidit et se compose de la prcipitation, de la vgtation et de la
pression. Le second groupe voque plutt laridit et se compose de linsolation, de la temprature,
de lvapotranspiration potentielle et du vent. Les deux formes molculaires prsentent des gradients
opposs dans leurs abondances relatives le long de laxe humidit aridit.
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
181
Conclusion Gnrale
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A partir de ces facteurs dterminants de lorganisation spatiale des deux formes molculaires, deux
modles de distribution spatiale (un modle pour chaque forme molculaire) ont t raliss. Ces
modles ont permis, par inversion des fonctions, la ralisation dune carte de distribution spatiale des
abondances relatives des formes molculaires M et S sur lensemble du Burkina Faso.
Au regard de ces rsultats, nous pouvons affirmer que lhypothse de distribution non alatoire de
formes molculaires M et S est prouve. Les facteurs environnementaux sont les dterminants de
cette distribution. Ils y contribuent toutefois de faon diffrentielle, certains facteurs tant moins
dterminants que dautres. Ceci confirme la seconde hypothse de cette tude. La troisime
hypothse, celle de la possibilit de mise en quation des abondances et des facteurs
environnementaux est aussi dmontre. Lopposition entre prfrences cologiques des formes
molculaires M et S est galement vrifie, mme si la fonction de rpartition de lun nest pas
loppos sensu stricto de lautre. Les objectifs fixs au dpart de ce travail de recherche sont atteints.
Des descriptions cartographiques et statistiques de la distribution spatiale des deux formes
molculaires M et S, sont disponibles. Des modles de distribution spatiale valids la fois au plan
statistique et au plan empirique ont t mis au point.
Le niveau datteinte des objectifs et de validation des hypothses voudrait que lon regarde la
mthodologie utilise avec intrt. Elle met en uvre un ensemble de processus qui pourraient tre
rpliqus bon escient sur dautres sites et pour dautres vecteurs de maladies. En combinant dans
une dmarche gographique, lanalyse spatiale, lanalyse de donnes, les systmes dinformation
gographique et lentomologie, ce travail constitue un point de renouvellement
des mthodes
gographiques dans lanalyse des problmes de sant, particulirement dans leurs aspects
environnementaux.
En dpit de ces rsultats, ce travail a des limites quil convient de relever. La premire porte sur la
temporalit et la seconde sur la variation des chelles. Pour ce qui concerne la temporalit, une
question simple portant sur la validit du modle en saison sche peut tre pose. En effet, les
conditions environnementales de la zone nord du pays pendant la saison pluvieuse pourraient tre
ralises en saison sche dans certaines rgions du sud-ouest. Il pourrait tre intressant denvisager
un suivi dans le temps et de prendre en compte la variable temporelle dans la modlisation. Pour ce
qui concerne les niveaux gographiques, la mise en vidence dagrgats spatiaux sur des tendues de
superficie rduite mrite que lon sinterroge sur les conditions particulires qui justifient de telles
singularits. En effet les rsidus du modle ont mis en exergue des localits atypiques qui
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Conclusion Gnrale
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mriteraient une attention particulire et cela nest pas envisageable au niveau dchelle auquel cette
tude a t ralise.
Ce travail, au del des limites qui viennent dtre voques, ouvre des perspectives de recherche
aussi bien en entomologie quen gographie. Il sagit dune rflexion sur les possibilits d'adaptation
des mthodes de lutte antivectorielle en fonction des espces en prsence. En dautres termes, une
rgionalisation des techniques est envisageable. Cela suppose des tudes plus approfondies sur
lthologie des vecteurs, sur la sensibilit des formes molculaires aux diffrentes mthodes de lutte,
depuis le choix des insecticides pour la pulvrisation intra domiciliaire jusquaux moustiquaires
imprgnes en passant par les priodes de pulvrisation, la gestion des plans deau, etc.
Sans vouloir sinstaller dans un mirage dradication du paludisme et de contrle immdiat de la
population anophlienne au Burkina Faso, cette tude veut apporter un autre regard sur les questions
environnement et sant en clairant, sous un angle gographique, les dcideurs et les chercheurs
qui sinvestissent dans la lutte antivectorielle.
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Annexes
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ANNEXES
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Annexes
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Photo 2 : Sance de capture par pulvrisation intradomicilaire : Etape de ramassage des moustiques
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Annexes
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600
An. melas
.TT..TTC
An. merus
T..TTT
An. quadriannulatus
T.TT.
...ATT..
Figure 66 : Structure de lADN ribosomal des membres du complexe An. gambiae (Scott et al, 1993).
LADN ribosomal de certains membres du complexe An. gambiae comporte galement des sites
de restrictions reconnus par des enzymes, tel que HhaI et CfoI. Ces dernires qui sont des enzymes
de restriction capables de cliver lADNr dAn. gambiae s.s.. Cet ADNr est organis en tandem.
Chaque unit rptitive est forme dans lordre de lextrmit 5vers 3, dun espace transcrit
externe (ETS), des rgions codant pour les acides ribonucliques ribosomaux (ARNr) 18S et 28S
qui sont spars par un espace transcrit interne (ITS) contenant la rgion codante pour lARNr
5,8S (Figure 67). Ces motifs sont spars entre eux par des espaces inter gniques (IGS).
La PCR permet une identification des membres du complexe An. gambiae, mais aussi des formes
molculaires dAn. gambiae s.s.. Les amorces utiliss pour lidentification des diffrentes espces
dAn. gambiaes.l. sont :
-
lamorce Universelle (UN) commune toutes les espces, dont la squence est
(5-GTG TGC CCC TTC CTC GAT GT-3).
lamorce gambi (GA) spcifique An. gambiae s.s. dont la squence est
(5-CTG GTT TGG TCG GCA CGT TT-3).
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Annexes
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Enfin lamorce arabiensis (AR) spcifique An. arabiensis, qui a pour squence (5AAG TGT CCT TCT CCA TCC TA-3)
UNITE REPETEE
CISTRON
ETS
ITS
18 S
ITS
5,8 S
IGS ETS
28 S
MODE OPERATOIRE
Ces techniques didentification molculaire ncessitent trois grandes tapes : lextraction de
lADN, lamplification de lADN et llectrophorse.
EXTRACTION DE LADN
LADN de la tte, des pattes et des ailes a t extrait. Le matriel biologique est broy dans 50l
de solution tampon de cassage (grinding buffer) dont la composition est la suivante 5M de NaCl,
0,5M dEDTA, 1M deTris-HCl, 10% de SDS pH 7,5. Lhomognat obtenu est incub 65C au
bain marie pendant 30mn. Puis 7l dactate de potassium 8M est ajout pour prcipiter les
protines. Aprs agitation la solution est incube -20C pendant 30mn. La temprature basse
acclre la prcipitation des protines. Le mlange est ensuite centrifug 14000 rpm pendant
15mn. Le surnageant obtenu est alors transvas dans un tube contenant 100l dthanol absolue
(100%) pralablement prpar (portant le numro didentification du moustique). Lalcool
solubilise les lipides et facilite la prcipitation des acides nucliques. Le mlange obtenu est incub
-20C pendant 30mn, puis centrifug 14000 rpm pendant 15mn. Le surnageant est vid sur du
papier buvard et 100l dthanol (70%) sont ajouts au culot. Cette solution est centrifuge
14000rpm pendant 5mn. Le surnageant est encore vid sur du papier buvard et les tubes sont
schs dans un dcicateur sous vide pendant 10 15mn. Le culot obtenu est dissout dans 300l
deau distille strile et incub 65C pendant 10mn. La solution finale obtenue est conserve
4C jusqu lamplification de lADN.
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Annexes
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LAMPLIFICATION DE LADN
Pour lidentification des espces, An. gambiae s.s. et An. arabiensis, lADN extrait est amplifi
dans 9.2l dune solution mixte compos dun tampon PCR (10X), du chlorure de magnsium
MgCl2 (25mM), de desoxyribonuclotides triphosphate dNTPs (10mM), dune amorce universelle
UN, dune amorce GA spcifique lespce An. gambiae s.s. (2pM), dune amorce AR spcifique
lespce An arabiensis (6,2pM) et 0,35 unit de Taq polymrase. A cette solution mixte 0,8 l
dADN amplifier est ajout et le mlange est incub dans un thermocycleur de type PTC100,
PTC200 ou Mastercycler. Le programme damplification est le suivant : 2mn 95C pour activer
la DNApolymrase suivies de 30 cycles dont chacun consist en 30 secondes de dnaturation
95C, 30secondes 50C pour lappariement des amorces et enfin 30 secondes dlongation
72C. Les produits de lamplification sont maintenus 72C pendant 7mn pour parfaire les
diffrentes phases dlongation (Figure 68).
3
5
5
3
Dissociation des
brins parentaux
5
3
B
Brin
Dnaturation de
lADN
Ajout des
amorces
Amorces
3
Hybridation des
amorces
Elongation par la
Taq polymrase
70-72C
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Annexes
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LA RESTRICTION
Pour lidentification des formes molculaires dAn. gambiae s.s, une enzyme de restriction a t
ajout aux produits damplification. Cet enzyme est appel CfoI et est utilis selon le protocole
tabli par Fanello et al,( 2002). Pour cela, 1l dune solution mixte contenant un tampon buffer
(b4), de leau distille strile et de lenzyme (CfoI) a t ajout chaque produit damplification.
Les tubes ont t ensuite incubs 37C pendant 3heures.
LELECTROPHORESE
Les produits obtenus ont t soumis une lectrophorse sur gel dagarose 1,5% contenant du
bromide dthidium 3%.
Pour la prparation du gel, 1,5g dagarose est dissout dans 100ml de tampon TEB 0,5M. le
mlange est chauff jusqu' bullition dans un four micro-onde. Le gel est refroidi environ
45C et 3l de bromide dthidium est ajout. Le bromide dthidium se fixe sur les ponts
hydrognes des acides nucliques, ce qui rend les bandes dADN fluorescentes. Le mlange est
ensuite coul dans un bac lectrophorse contenant des peignes et laiss la temprature
ambiante pour la solidification.
Aprs la solidification du gel, les peignes sont retirs. Le gel est dpos dans un bac rempli de
TBE 0.5M et 12l de mlange (2l de tampon de migration plus 10l de lADN amplifi) est log
dans chaque puits. Le tampon de migration est appel loading buffer. Les puits extrmes (le
premier et le dernier puits) sont chargs avec un marqueur de poids molculaire qui est la
rfrence. Le gel est alors soumis une tension lectrique de 80mV pendant 45mn.
La lecture des bandes dADN se fait par rvlation aux rayons UV 460nm. Pour cela le gel est
plac sur un appareil qui met des rayons ultraviolets. Grce la fluorescence du bromide
dthidium, des bandes dADN apparaissent sur le gel. Une photographie du gel est prise et
transfr dans lordinateur pour interprtation.
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201
202
Tableau 29 : Valeur du coefficient de dtermination pour les 2 meilleurs modles __________ 163
Tableau 30 : Coefficients d'ajustement du modle 2 __________________________________ 164
Tableau 31 : Le test de Fisher sur lanalyse de la significativit de la quantit dinformation
apporte par les variables la rgression pour Anopheles gambiae forme molculaire S ____ 164
Tableau 32 : Test de Fisher de type I SS ___________________________________________ 164
Tableau 33 : Analyse du modle (Type III SS) ______________________________________ 165
Tableau 34 : Paramtres du modle de distribution dAn. gambiae forme molculaire S _____ 165
Tableau 35 : Valeur du coefficient de dtermination pour les 2 meilleurs modles __________ 166
Tableau 36 : les coefficients dajustement pour le modle 3. ___________________________ 166
Tableau 37 : Evaluation de la valeur de l'information apporte par les variables (H0 =
Y=Moy(Y)) __________________________________________________________________ 166
Tableau 38 : Analyse du modle (Type I SS)________________________________________ 167
Tableau 39 : Analyse du modle (Type III SS) ______________________________________ 167
Tableau 40 : Paramtres du modle ______________________________________________ 167
Tableau 41 : Liste des localits ayant des rsidus anormaux pour An. gambiae forme molculaire
S __________________________________________________________________________ 169
Tableau 42 : Liste des localits ayant des rsidus anormaux pour An. gambiae forme molculaire
M _________________________________________________________________________ 173
Tableau 43 : Caractristiques des donnes utilises pour le test de Kolmogorov-Smirov _____ 176
Tableau 44 : Test de Kolmogorov-Smirnov pour la forme molculaire S _________________ 176
Tableau 45 : Caractristiques des donnes test de Kolmogorov-Smirnov pour la forme molculaire
M _________________________________________________________________________ 178
Tableau 46 : Test de Kolmogorov-Smirnov pour la forme molculaire M _________________ 178
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Modlisation de la distribution spatiale des formes molculaires M et S d'Anopheles gambiae s.s. par les SIG et l'analyse spatiale au Burkina Faso
203
I.1.1
I.1.1.1
I.1.1.2
I.1.2
I.1.2.1
I.1.2.2
I.1.2.3
I.2.
I.2.1
I.2.2
I.2.3
I.2.4
I.2.4.2
I.2.4.4
Le paludisme une maladie de sant publique dont lanophle est le vecteur _______ 40
II.1.2.2
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II.1.2.3
II.2.3.2
III.1.1.1 Les usages des modles pour llaboration des politiques et dfinition de
stratgies 69
III.1.1.2 Limpact des usages des modles pour laction _______________________ 70
III.1.2
III.2.1
III.2.2
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III.2.3
III.2.4
III.2.5
IV.1.2
IV.1.3
IV.1.4
IV.2.1
IV.2.2
IV.2.3
IV.3.1
IV.3.1.1 Les prcipitations : des donnes sources aux donnes interpoles ________ 108
IV.3.1.2 Les tempratures : des donnes sources aux donnes interpoles_________ 110
IV.3.1.3 LEvapotranspiration potentielle : des donnes sources aux donnes interpoles
111
IV.3.1.4 La pression de vapeur : des donnes sources aux donnes interpoles _____ 113
IV.3.1.5 Linsolation : des donnes sources aux donnes interpoles ____________ 114
IV.3.1.6 La vitesse du vent : des donnes sources aux donnes interpoles ________ 115
IV.3.1.7 Laltitude: des donnes sources aux donnes interpoles _______________ 116
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206
IV.3.2
IV.3.3
Chapitre V : Distribution spatiale des membres du complexe An. gambiae : structures globales et
configurations locales ________________________________________________________ 123
V.1.1 les statistiques gnrales sur les donnes entomologiques collectes. _________ 124
V.1.2 la structure spatiale dAnopheles gambiaes.l. ____________________________ 125
V.1.3 La structure spatiale dAnopheles gambiae forme molculaire S _____________ 127
V.1.4 La structure spatiale dAnopheles gambiae forme molecuLaire M ____________ 129
V.2.1 Analyse des configurations spatiales locales dAnopheles gambiaes.l. ________ 131
V.2.2 Analyse des configurations spatiales locales dAnopheles gambiae forme molculaire
S
132
207
VI.2
VI.2.1
VI.2.2
VI.3.1
VI.3.1.1 Analyse des rsidus pour An. gambiae forme molculaire S ____________ 168
VI.3.1.2 Analyse des rsidus pour An. gambiae forme molculaire M____________ 172
VI.3.2
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Rsume / Abstract
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RESUME
MODELISATION DE LA DISTRIBUTION SPATIALE DES FORMES MOLECULAIRES M ET S
Danopheles gambiae sensu stricto AU BURKINA FASO AVEC LES SIG ET LANALYSE SPATIALE
La lutte anti-vectorielle est une composante importante de la lutte contre les maladies transmission vectorielle. La
connaissance des populations vectorielles, tant dans leur composition spcifique que dans leur rpartition spatiotemporelle, est fondamentale pour la conception des stratgies de lutte contre ce type de maladie.
Cette thse a modlis la distribution spatiale des formes molculaires M et S dAnopheles gambiae s.s., des vecteurs
majeurs du paludisme au Burkina Faso. La modlisation a t faite partir de lanalyse dune srie dobservations portant
la fois sur les vecteurs et lenvironnement. Elle procde dune combinaison de concepts et mthodes de biogographie
avec des techniques et outils danalyse spatiale, danalyse des donnes et des systmes dinformations gographiques.
Nous retenons de ce travail de recherche que labondance de la forme molculaire S dAnopheles gambiae s.s., diminue au
fur et mesure que lon volue des rgions humides du sud et du sud-ouest vers celles les plus arides du nord et du nordest. Le NDVI, lETP, et linsolation sont les facteurs les plus dterminants de sa distribution spatiale. Par contre,
labondance de la forme molculaire M dAnopheles gambiae s.s. augmente des rgions humides du sud et du sud-ouest
vers celles plus arides du nord et du nord-est. Laltitude, la pression, linsolation, la densit de vgtation sont les facteurs
les plus dterminants de cette rpartition spatiale. De ces rsultats, ont t drivs deux modles qui ont servi
llaboration des cartes de distribution des formes molculaires M et S dAnopheles gambiae s.s.
Enfin, cette thse rvle le rle de lapproche gographique dans la rflexion sur les questions de sant et sa mthodologie
pourrait tre teste sur dautres sites et pour dautres vecteurs de maladies.
Elle peut senrichir dune analyse multi chelle et dune modlisation de la variabilit temporelle.
Mots Cls : Anopheles gambiae, Modlisation, Analyse spatiale, SIG, Burkina Faso
ABSTRACT
MODELLING THE SPATIAL DISTRIBUTION OF THE MOLECULAR FORM M AND S OF Anopheles
gambiae s.s. IN BURKINA FASO WITH GIS AND SPATIAL ANALYST
The anti-vectorial fight is an important constituent for vectorial borne diseases control. The knowledge of the vectors
populations as well as their specific composition and spatiotemporal distribution is fundamental for the conception of the
strategies of fight against this type of disease.
This thesis modeled the spatial distribution of the molecular forms M and S of Anopheles gambiae s.s., major vectors of
malaria in Burkina Faso. The modeling was made from the analysis of a series of observations concerning both the vectors
and the environment.
It proceeds of a combination of concepts and methods of biogeography with techniques and tools of spatial analysis, data
analysis and the geographical information systems.
We retain of this research work that the abundance of the molecular form S of Anopheles gambiae s.s., decreases as we
move from wet regions of the south and the southwest to those the driest of the north and the northeast. The NDVI, the
ETP, and the sunshine are the most determining factors of its spatial distribution.
In contrast, the abundance of the molecular form M of Anopheles gambiae s.s. increases from the wet regions of the South
and the southwest to those drier of the north and the northeast. The temperatures, the pressure, the sunshine and the NDVI
are the most determining factors of this spatial distribution.
Of these results, were diverted two models which we use to elaborate the Maps of distribution of the molecular forms M
and S of Anopheles gambiae s.s.
This thesis highlights also the role of the geographical approach in the reflection on health issues and its methodology
could be tested on the other sites and for the other vectors of diseases. This methodology could be improved by multi-scale
analysis and of temporal variability modeling.
Key Words: Anopheles gambiae, Modeling, spatial analyst, GIS, Burkina Faso
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