UNIDAD 6:

Biorremediacin

Bibliografa:
Brock. 10ma ed. Cap 19.
Brock. 12va ed. Cap. 24.

Un camino de mil kilmetros comienza con un paso

Lixiviado microbiano
Extraccin de metales valiosos de menas de minerales por microorganismos.
El S se combina con metales y forma compuestos insolubles.
Ej.: sulfuro de cobre.
Si la concentracin del metal es baja, no conviene por medios qumicos.
Es posible el lixiviado microbiano.

VIDEO
http://www.biology.ualberta.ca/facilities/multimedia/?Page=289
Ej. Acidithiobacillus ferrooxidans

Biorremediacin microbiana
Eliminacinde contaminantes (sustancias txicas) del ambiente mediante el uso de
microorganismos (bacterias, arquea, plantas y hongos).

Contaminantes naturales: estn presentes en la naturaleza pero en menores

concentraciones. Ejemplos:
petrleo
metales pesados (uranio, mercurio)
fosfatos

Xenobiticos: compuestos sintetizados qumicamente que no existen en la naturaleza.

Ejemplos:
pesticidas
herbicidas
plsticos
PCB (organoclorado)

Los xenobiticos son ms difciles de degradar que los contaminantes naturales

Biorremediacin microbiana
Las bacterias pueden degradar los contaminantes mediante:
- Respiracin aerobia
- Respiracin anaerobia
- Fermentacin

Biodegradacin del petrleo por:

- arqueas halfilas, oxidndolo a CO2 por respiracin arobica.
- bacterias anaerbicas, por respiracin anaerbica.

VIDEO

Biorremediacin microbiana
Las bacterias pueden degradar los contaminantes utilizando otra fuente
de energa.

Ejemplos:
Biodegradacin del uranio por bacterias:

degradation
products

contaminant

La reduccin de uranio soluble lo

convierte en uranio precipitado.
Esto permite la inmobilizacin del
contaminante.

bacterium
Transformacin del mercurio de formas
txicas a formas no txicas por la
bacteria Pseudomonas aeruginosa
(plsmido con genes mer)

corn
starch

VIDEO

CO2 + H2O

Biorremediacin microbiana
Uno de los problemas que se presentan en el deterioro de la calidad
del agua es por txicos que que se vierten al drenaje
Ejemplo: aceites usados (de autos).
Existen bacterias que son capaces de degradar este tipo de aceites.

Ejercicio en clase:
Nombrar los procesos claves (red/ox)
relacionados con:
- N
- C
- S
- Fe

Traer o no?:
Brock. 10ma ed. Cap 19.
Brock. 12va ed. Cap. 24.

Agregar estados de
oxidacion de cada uno!

Nombrar el tipo de metabolismo de los organismos involucrados, identificando si

representa una fuente de Energa, un dador de e-, un aceptor de e Tener en cuenta la asimilacin de estos macronutrientes.
Dar ejemplos de los microorganismos involucradros.
Dnde intervienen los eucariotas?

UNIDAD 6:
Ciclos Biogeoqumicos

Bibliografa:
Brock. 10ma ed. Cap 19.
Brock. 12va ed. Cap. 24.

Un camino de mil kilmetros comienza con un paso

Ciclos biogeoqumicos
Conjunto de transformaciones qumicas llevadas a cabo por organismos o
por agentes qumicos. Implica reacciones redox.

Los microorganismos tiene un rol esencial en los siguientes ciclos:

Ciclo del Carbono

Ciclo del Nitrgeno
Ciclo del Azufre
Ciclo del Hierro
Todos los organismos vivos estn involucrados:

Bacterias, Archaea y Eucarya

Ciclo del Carbono

El carbono es reciclado en todos los ambientes.
Mayor reservorio en rocas y corteza: pero es muy lento.
El CO2 atmosfrico est ms disponible para los organismos.
El carbono orgnico se encuentra en organismos vivos
(gran parte en plantas) y en carbono fsil (la mayor parte).
Unicas vas para producir C orgnico es por fotosntesis o quimiolitotrofa.
Liberacin de CO2 por humanos:
Uso de combustibles fsiles

Fijacin de CO2 por auttrofos:

Fotosntesis > quimiolitotrofos
Liberacin de CO2 por descomposicin:
quimioorgantrofos

Carbono orgnico es nicamente generado por organismos autotrofos:

- en ambientes iluminados: los fottrofos fijan mayor cantidad que los quimiolitotrofos
- en ambientes oscuros: los quimiolitotrofos son los nicos productores primarios.
- en ambientes terrestres: las plantas son los auttrofos ms importantes
- en ambientes acuticos los microorganismos son los ms importantes.

Ciclo del Carbono

Fijacin por fotosintesis o
quimiolitotrofa
Degradacin por
microorganismos: metano y CO2.
Metanotrofos: oxidan metano a
CO2.
Produccin de CO2 por
quimioorgantrofos (resp.
aerobia, anaerobia, ferm.).

- Oxidaciones (amarillo)
- Reducciones (rojas)

Ciclo del Nitrgeno

Estados de oxidacin del N

VOLATIL
GAS

SOLUBLE EN AGUA

N2 es la forma ms estable (triple enlace)

Atmsfera es el mayor reservorio utilizable.

Ciclo del Nitrgeno

Nitrificacin
- oxidacin de compuestos de N (NH3 y NO2-) a nitrato (NO3-) por bacterias
nitrosoficantes y nitrificantes (quimiolittrofas aerobias).
Desnitrificacin: compuestos de N como aceptores de e- en la respiracin
anaerbica (reduccin de compuestos de N; e.g. nitrato a xido nitroso o N2).
Fijacin de N:
- Gran cantidad de E para romper N2.
- Solo algunos microorganismos son capaces.
Asimilacin:
-Absorcin de compuestos inorgnicos de N
(NH3, etc.) como nutriente.
- Nitrato NO3- es facilmente asimilable por
plantas.
Amonificacin:
- Descomposicin de compuestos orgnicos
de N produce amonaco (NH3 o NH4+ pH 7).

- Oxidaciones (amarillo)
- Reducciones (rojas)

Ciclo del Nitrgeno

Quimiolitotrofas

B. nitrificantes

B. nitrosificantes

B. Fijadoras de N de
vida libre
e.g. Cianobacterias

B. Fijadoras de N: rojas
y verdes fototroficas

Respiracion anaerobia:
Bacillus, Pseudomonas

Ciclo del Nitrgeno

Ciclo del Nitrgeno

Beneficioso en tratamiento de aguas

residuales y perjuicios: agricultura y
lluvia cida

En agricultura, se adiciona el suelo

con amonio anhidro con un inhibidor
de la nitrificacion

Nitrificacion es perjudicial en
agricultura porque el nitrato es
soluble en agua y se pierde.

Ciclo del Azufre

El ciclo es ms complejo porque el S tiene ms estados de oxidacin y porque
muchas transformaciones ocurren de forma abitica.
Estados de oxidacin del S:

Solo 3 estados son significativos

en la naturaleza

SULFHIDRILO HS-, HAY A pH>7

SULFURO DE H2 : GAS VOLATIL, TOXICO
S ELEMENTAL ES INSOLUBLE

- Mayor parte de S en la Tierra est en sedimentos y roca en minerales de sulfato y sulfuro

(pirita FeS2)
- Ocanos: fuente ms significativa de S en la biosfera (se encuentra como sulfato).

H2S se genera por:

- reduccin bitica de sulfato
- fuentes geoqumicas

Ciclo del Azufre

- Oxidaciones (amarillo)
- Reducciones (rojas)

En cond. xicas, el H2S se oxida espontneamente.

B. Quimiolitotrofas estan generalmente cerca de la interfase anxico/xico.

B.QUIMIOLITOTROFAS: B. OXIDANTES
DEL S: THIOBACILLUS, BEGGIATIOA

ARQUEAS QUIMIOLITOTROFAS:
Sulfolobales
B.QUIMIOLITOTROFAS: B. OXIDANTES
DEL S: THIOBACILLUS, BEGGIATIOA

RESP ANAEROBIA:
DESULFUROMONAS,
DESULFOVIBRIO,
ARCHAEA hipertermofilas
B.FOTOTROFICAS: B. VERDE DEL S:
CHLOROBIUM
B.FOTOTROFICAS

B.FOTOTROFICAS: B. ROJAS DEL

S: CHROMATIUM, THIOSPIRILLUM
B.QUIMIOLITOTROFAS: B. OXIDANTES
DEL S: THIOBACILLUS.

- Oxidaciones (amarillo)
- Reducciones (rojas)

Ciclo del Hierro

Hierro es el elemento ms abundante de la corteza terrestre, e.g. pirita.

Existe en 2 estados: frrico y ferroso.
El estado Fe0 es el resultado de actividades humanas.
Quimiolitotrofos aerobios:
- a pH cido (Acidithiobacillus)
- en interfase xico/anxico
(Galionella)

Respiracin anaerbica
Oxidacin qumica
espontnea a pH >7 y
cond. xicas.

Pirita FeS

Preguntas
Qu relacin hay entre la respiracin aerobia y fotosntesis oxignica?
Qu ocurrira si se extinguieran los fijadores de N2?
Cmo se forma nueva materia orgnica en la naturaleza?
El H2S es un sustrato o un producto de las bacterias quimiolitotrofas del S?

UNIDAD 6:
Interacciones biticas

Bibliografa:
Brock. 10ma ed. Cap 19.
Brock. 12va ed. Cap. 24.

Un camino de mil kilmetros comienza con un paso

Competencia y cooperacin
Competencia entre microorganismos por los recursos disponibles.
Colaboracin entre microorganismos para lograr una actividad conjuntamente.
Sintrofia: dos o ms organismos que que colaboran para llevar a cabo una
transformacin determinada, que no pueden realizar individualmente.

Ejemplos:
bacterias nitrosificantes y nitrificantes.
bacterias que conviven en el rumen de
mamferos herbvoros

Rumen
Organo digestivo de rumiantes, donde ocurre la digestin de celulosa y
otros polisacridos con la ayuda de microorganismos.
La mayora de los animales carecen de
enzimas para digerir la celulosa.
El rumen posee:
- temperatura constante (39C)
- pH constante (5.5-7)
- ambiente anxico
1- Bacterias celulolticas liberan glucosa.
2- Fermentadores primarios: oxidan glucosa
a cidos grasos volatiles (a la sangre), H2,
y CO2
3 Fermentadores secundarios pueden
oxidar los cidos grasos.
4- Bacterias metangenas consumen el H2.

Ruminobacter amylophilus
Succinomonas amylolytica

Lquenes
Simbiosis de dos organismos: un hongo + alga/cianobacteria que
forman organismos incrustantes o foliceos.
Relacin poco especfica.
Fotobionte: produce materia orgnica.
Micobionte: proporciona anclaje, proteccin
de la desecacin, facilita incorporacin de
agua, absorbe nutrientes inorgnicos de las
rocas.
Acidos liqunicos estimulan la disolucin de
nutrientes
Colonizan nuevos ambientes.
Crecimiento lento.

Micorrizas (hongo de la raiz)

Simbiosis entre races de plantas y hongos
Hay 2 clases:
Ectomicorrizas: hongos forman vaina alrededor de la raiz y rodean a las clulas.
- principalmente en rboles en bosques (conferas, robles) en zonas templadas.
- en 10% de familias de plantas
Endomicorrizas: micelio del hongo incrustado en el tejido radical, invagina la membrana
celular de las clulas radiculares de las plantas.
- muy comunes.
- micorrizas arbustivas existen en races del 80% de las familias de plantas.

Micorrizas (hongo de la raiz)

Los hongos de las races:
Usan carbohidratos simples de la planta para su crecimiento.
Requieren vitaminas.
Se los conoce slo asociados a plantas (simbiontes estrictos).
Producen sustancias para el crecimiento de las plantas.
Alteran la morfologa radicular.
Tienen poca especificidad.
Plantas con micorrizas crecen mejor en suelos pobres; absorben nutrientes con ms
eficiencia.
Ectomicorriza de pino

Ndulos radicales de plantas leguminosas

Simbiosis de bacterias fijadoras de N2 con plantas leguminosas
Ejemplos:
Plantas leguminosas (plantas con vaina): soja, trebol, alfalfa, arvejas, porotos.
Bacterias: Rhizobium, Bradyrhizobium, Azorhizobium
Alta especificidad en la relacin.

Ndulos radicales de plantas leguminosas

Bacterias fijadoras de N2:
Bacterias Gram Proteobacterias: alpha y beta.
Bacilos mviles, flagelacin polar.
Quimioorgantrofas.
Aerobios: microaerfilos.

La interaccin promueve la formacin de ndulos radicales.

Independientemente, ninguno es capaz de fijar N2.

Interaccin leguminosa y bacteria.

La bacteria necesita compuestos

orgnicos como fuente de E y
fuente de eSe requiere un medio microaeroflico.
Nitrogenasa es inhibida por el O2
Concentraciones de O2 estn controladas por
la leghemoglobina.
Slo es sintetizada en los ndulos.
En la leghemoglobina, el Fe3+ se reduce a Fe++
y se une al O2, manteniendo la [O2] baja.
Factores Nod inducen divisin celular en la planta.
Formacin de ndulos en la planta