ACIMED

ISSN 1024-9435 versin impresa

ACIMED v.11 n.4 Ciudad de La Habana jul.-ago. 2003

Como citar este

artculo

Contribuciones Cortas

Impacto de la Bioinformtica en las ciencias biomdicas

Ligeya Perezleo Solrzano1 Ricardo Arencibia Jorge2 Clara Conill Gonzlez3 Gudelia Achn Veloz4 Juan
A. Arajo Ruiz5
Resumen
Durante la ltima dcada del siglo XX, los avances de la ingeniera gentica y las nuevas tecnologas de la
informacin, condicionaron el surgimiento de una disciplina que cre vnculos indisolubles entre la
Inform tica y las ciencias biolgicas: la Bioinformtica. Se realiz un anlisis bibliomtrico en la base de
datos Medline con vistas a medir su impacto en las ciencias mdicas. Sus principales aplicaciones, segn los
resultados obtenidos, fueron la gestin de datos en los laboratorios, la automatizacin de experimentos, el
ensamblaje de secuencias contiguas, la prediccin de dominios funcionales en secuencias gnicas, la
alineacin de secuencias, las bsquedas en bases de datos de estructuras, la determinacin y prediccin de la
estructura de las macromolculas, la evolucin molecular y los rboles filogenticos. Las especialidades
mdicas que recibieron una mayor influencia de la Bioinformtica fueron la Gentica Mdica, la
Bioqumica Clnica, la Farmacologa, las Neurociencias, la Estadstica Mdica, la Inmunologa, la
Fisiologa y la Oncologa.
Descriptores (DeCS): INFORMATICA MDICA; BIOLOGIA COMPUTACIONAL; MEDLINE;
BIBLIOMETRIA
Descriptores (DeCI): INFORMATICA MEDICA; TECNOLOGIA DE LA INFORMACION; MEDLINE;
BIBLIOMETRIA
Abstract
The advances reached by the genetic engineering and the development of new information technologies
during the last decade, conditioned the emergence of a discipline that has created indissoluble bonds
between the Computer Sciences and the Biological Sciences: the Bioinformatics. The present work
demonstrates the impact of the Bioinformatics in the Medical Sciences, through the bibliometric analysis of
MEDLINE, the most important database of the biomedical environment at the present time. The main
applications of this discipline in the registrations obtained in MEDLINE were directed to the data
management in the laboratory, the automation of experiments, the assembling of contiguous sequences, the
prediction of functional domains in gene sequences, the alignment of sequences, the searches in databases of
structures, the structure determination and prediction of macro-molecules, the molecular evolution and the
phylogenetic trees. The medical specialties mostly influenced by the Bioinformatics were the Medical
Genetics, Clinical Biochemistry, Pharmacology, Neurosciences, Medical Statistic, Immunology, Physiology
and Oncology.
Subject headings (DeCS): MEDICAL INFORMATICS;COMPUTATIONAL BIOLOGY; MEDLINE;
BIBLIOMETRICS
Subject headings (DeCI): MEDICAL INFORMATICS; INFORMATION TECHNOLOGY; MEDLINE;

BIBLIOMETRICS
El desarrollo de la ingenier a gentica y las nuevas tecnologas de la informacin durante la ltima dcada
del siglo XX, condicionaron el surgimiento de una disciplina que gener vnculos indisolubles entre la
Inform tica y las Ciencias Biolgicas: la Bioinformtica.
Ella se encuentra en la intersecci n de las ciencias de la vida con las ciencias de la informacin. Es un
campo cientfico interdisciplinario que se propone la investigacin y el desarrollo de sistemas que faciliten
la comprensin del flujo de informaci n desde los genes a las estructuras moleculares, su funcin
bioqumica, su conducta fisiolgica y finalmente su influencia en las enfermedades y la salud.1
Entre los principales factores que han favorecido el desarrollo de esta disciplina, se encuentra el
impresionante volumen de datos sobre secuencias generadas por los distintos proyectos genoma (tanto el
humano como el de otros organismos); los nuevos enfoques experimentales, basados en biochips que
permiten obtener datos genticos a gran velocidad, bien de genomas individuales (mutaciones,
polimorfismos), o de enfoques celulares (expresin gnica); as como el desarrollo de Internet y la World
Wide Web, que permite el acceso mundial a las bases de datos de informaci n biolgica.
El trmino Bioinformtica es relativamente reciente, y apareci en la literatura a principios de 1990, cuando
comenzaba a estructurarse el llamado "Proyecto Genoma Humano" y el National Center for Biotechnology
Information de los Estados Unidos, daba sus primeros pasos. En los primeros momentos, su vinculaci n con
la Informtica Mdica (IM) se debi solamente a la similitud sintctica, as como al indispensable uso de las
computadoras por parte de ambas disciplinas.2
La IM es la disciplina que se preocupa por el anlisis y la diseminacin de datos mdicos mediante la
aplicacin de las computadoras a varios aspectos de la prctica sanitaria, incluye sistemas automatizados de
diagnstico, terapia y comunicacin de informaci n de salud. Se relaciona con casi todas las especialidades
mdicas y configura un sector multidisciplinario con ramificaciones en la epidemiologa, evaluaci n de la
tecnologa, economa, gestin sanitaria y tica mdica. Tiene ms de 40 aos de existencia, y se ha
convertido en una ciencia m dica bsica que comprende los aspectos tericos y prcticos relacionados con
el procesamiento y la comunicacin de informaci n derivada de procesos mdicos y relacionados con la
salud.3
La Bioinformtica, por su parte, tiene como reto principal ofrecer una respuesta a la avalancha de datos
procedentes de la Genmica. Mientras, que hace unos aos, los resultados de los experimentos podan
interpretarse sobre el cuaderno de laboratorio, hoy se necesitan bases de datos y tcnicas de visualizacin
slo para almacenarlos y comenzar a estudiarlos. Ella evolucion desde un conjunto de tcnicas hacia una
verdadera ciencia, al aportar el componente de anlisis, para entender la genmica e integrar sus datos que
permitieran crear modelos predictivos para los sistemas biol gicos.1,3-4
No obstante, con el advenimiento del nuevo milenio, el procesamiento de la informacin gentica
(bioinform tica) y de la informacin clnica (informtica mdica) amenaza con fundir ambas disciplinas en
una sola, que algunos autores han definido como Informtica Biomdica. En la medida que se genera
informacin sobre el genoma humano y sta se vincula con el conocimiento mdico de las enfermedades,
esta definicin ha comenzado a hacerse realidad. Los datos que maneja la bioinformtica tienen cada vez
ms presencia en la prctica mdica; por tanto, conseguir la unificacin de la informacin clnica con la
informacin molecular representa el desaf o ms importante de esta disciplina durante el presente siglo.5
Con el presente trabajo, se pretende demostrar el impacto de la Bioinformtica en las ciencias mdicas, a
partir de un anlisis bibliomtrico, realizado con la base de datos Medline, la ms popular del entorno
biomdico actual.
Mtodos
Para la recopilacin de la informacin, se utiliz como fuente primaria la base de datos Medline, en su
versin para Internet, denominada PubMed, que genera la Nacional Library of Medicine de los Estados
Unidos.

Se realiz una bsqueda general, con el objetivo de recuperar todos los registros que tuvieran, entre sus
descriptores principales, las siguientes materias:
No. Descriptor Campos
1 Medical Informatics All
2 Bioinformatics All
Cada una de las estrategias de bsqueda se analizaron por separado. Los registros obtenidos se exportaron a
Procite, con el fin de elaborar los ndices de frecuencia de las variables estudiadas.
De los registros sobre Informtica Mdica se seleccion solamente el ao de publicacin.
De los registros sobre Bioinformtica, las siguientes variables:
Direccin del autor principal
Descriptores principales
Ao de publicacin
Resultados y discusin
La base de datos Medline, desde el ao 1960 hasta el 29 de enero del 2003, fecha en que se cerr la recogida
de datos, proces un total de 281 572 registros que abordan desde diferentes puntos de vista el campo de la
IM. La cantidad de registros por quinquenio mostr un crecimiento exponencial durante las ltimas cuatro
dcadas del pasado siglo, y en los dos primeros aos del nuevo milenio, la cifra de registros alcanz la
mitad de los procesados por esta base de datos durante el quinquenio 1996-2000, que ascendi a 95 917,
cifra que representa ms del 30 % del total de registros (figura 1).

FIG 1. Comportamiento de la produccin de artculos sobre Informtica Mdica en Medline, 1960-2003.

La Bioinformtica, por su parte, mostr un crecimiento vertiginoso a partir de 1990, alcanzando un total de
3 649 registros hasta diciembre del 2002. Durante el ltimo lustro se recogieron un total de 2 121 registros,
el 58,1 % del total (figura 2).

FIG. 2. Comportamiento de la produccin de artculos sobre Bioinform tica en Medline, 1990 - 2002.
Durante la dcada de los aos 90, se observ un crecimiento exponencial de los artculos sobre
Bioinformtica, en contraste con el crecimiento estable de los artculos sobre IM. Ello demuestra el
desarrollo progresivo de esta nueva disciplina y su impacto cada vez mayor en las ciencias biom dicas.
(figura 3)

FIG. 3. Comportamiento a escala logartmica de la produccin de artculos sobre Informtica Mdica y

Bioinformtica en la base de datos Medline, 1990 - 2002.
La Gentica Mdica constituye la especialidad que ha recibido mayor influencia de la Bioinformtica desde
su aparicin en 1990 (42,5 % de los trabajos), seguida por la Bioqumica Clnica (19,5 %), as como por las
Ciencias Farmacuticas (5,8 %), la Filogentica (4,2 %), las Neurociencias (3,8 %), la Inmunologa (3,2 %),
la Estadstica Mdica (2,5 %), la Fisiologa (2,5 %) y la Oncologa (2,3 %)(tabla 1).
Tabla 1. Especialidades biom dicas que reciben una mayor influencia de la Bioinformtica, 1990 - 2002
Especialidad
Gentica Mdica
Bioqumica Clnica
Farmacologa
Filogentica
Neurociencias
Inmunologa
Estadstica Mdica
Fisiologa
Oncologa
Microbiologa

Total de artculos
1550
713
212
153
137
118
91
90
84
58

%
42,5
19,5
5,8
4,2
3,8
3,2
2,5
2,5
2,3
1,6

Estados Unidos y Gran Bretaa son los pases con mayor presencia en los trabajos sobre Bioinformtica
indizados por Medline, con el 62 % bajo su autora. Japn (6,3 %), Alemania (6,0 %), Francia (4,1 %),
Canad (2,4 %), Italia (2,1 %), China (1,8 %), Australia (1,7 %) y Suecia (1,4 %), completan la decena de
pases con mayor cantidad de artculos. La supremaca de las grandes potencias econmicas mundiales en el
desarrollo de esta disciplina es evidente (tabla 2).
Tabla 2. Pases que publicaron mayor cantidad de artculos sobre Bioinform tica, 1990 - 2002
Pases
Estados Unidos
Reino Unido
Japn
Alemania
Francia
Canad
Italia
China
Australia
Suecia

Total de artculos
1657
604
231
220
151
88
75
67
62
50

%
45,4
16,6
6,3
6,0
4,1
2,4
2,1
1,8
1,7
1,4

El anlisis por continentes puso de manifiesto la hegemona de Amrica del Norte y los pases de Europa
sobre el resto de las regiones del mundo (86,6 % de los artculos), aunque se destaca el progreso del
continente asi tico, encabezados por Japn, China, Israel, Singapur y la India (10,82 %),segn se aprecia en
la figura 4.

FIG. 4. Comportamiento por continentes de la produccin de artculos sobre Bioinformtica en Medline,

1990 - 2002
La diversificacin de los objetivos de la Bioqumica y la Biologa Molecular ha promovido una importante
interdisciplinariedad entre especialidades como la Gentica, la Microbiologa, la Inmunologa y la
Fisiologa, entre otras. Esta interdisciplinariedad, sumada al impresionante aumento de secuencias genticas
obtenidas a travs de los proyectos genoma, ha permitido el surgimiento y desarrollo de la Bioinformtica
como una especialidad independiente.
La Bioinformtica comprende tres reas:
l

Error! Marcador no definido.Investigacin y desarrollo de la infraestructura, sistemas de informacin

y de comunicaciones que requiere la biologa moderna. Comprende las redes y bases de datos para el
genoma, estaciones de trabajo para procesamiento de imgenes. Es la Bioinformtica en sentido
estricto.
Comprensin de cuestiones biolgicas bsicas, a partir de la aplicacin de la Error! Marcador no
definido, computacin, mediante la modelacin y simulacin. Abarca los sistemas de vida artificial,
algoritmos genticos, redes de neuronas artificiales, etctera. Es la Biologa Molecular
Computacional.
Error! Marcador no definido.Desarrollo y utilizacin de sistemas computacionales basados en
modelos y materiales biolgicos. Incluye biochips, biosensores, computaci n basada en ADN, entre
otros. Las computadoras basadas en DNA se emplean para la secuenciacin masiva y el pesquizaje de
diversas enfermedades, explotan su caracter stica de procesamiento paralelo implcito. Es la
Biocomputacin.

Como resultado del presente estudio, se identificaron las principales formas de utilizacin de la
Bioinformtica, as como sus principales campos de aplicacin.
Bsicamente, los sistemas bioinformticos se utilizan en las ciencias biomdicas para la adquisicin de
datos; la creacin de programas para la visualizacin de datos y el control de reactivos y otros materiales; la
generacin y ensamblaje de secuencias genticas; la elaboracin de programas para anlisis de datos y
secuencias genticas; la prediccin de estructura de protenas; la generacin de paquetes de integracin y
ensamblaje de mapas genticos, programas para la clasificacin y comparacin y tcnicas de la Inteligencia
Artificial; la gestin de datos en bases de datos especializadas y su distribucin mediante las redes de
comunicaciones.
Las principales aplicaciones de esta disciplina, segn los resultados obtenidos del anlisis en Medline,
fueron: la gestin de datos en el laboratorio, la automatizacin de experimentos, el ensamblaje de secuencias
contiguas, la predicci n de dominios funcionales en secuencias gnicas, la alineacin de secuencias, las
bsquedas en bases de datos de estructuras, la determinacin y prediccin de la estructura de
macromolculas, la evolucin molecular y los rboles filogenticos.
Las especialidades mdicas que recibieron una mayor influencia de la Bioinform tica fueron: la Gentica
Mdica, la Bioqumica Cl nica, la Farmacologa, las Neurociencias, la Estadstica Mdica, la Inmunologa,
la Fisiologa y la Oncologa.

La Bioinformtica ofrece la posibilidad de comparar y relacionar la informacin gentica con fines

deductivos, as surgen respuestas que no parecen obvias a la vista de los resultados de los experimentos. En
los ltimos aos, se aprecia el crecimiento de una corriente de investigacin y desarrollo de nuevas tcnicas
para la extraccin del conocimiento, la minera de datos y la visualizacin, cuyo objetivo es acelerar los
descubrimientos cientficos, a partir de la reduccin de los costos y el aumento del nmero de experimentos.
Estas nuevas tcnicas, tiles para la investigacin de distintas enfermedades y el diagnstico clnico,
establecen el camino a seguir por bioinformticos e investigadores durante siglo XXI, el cual se ha dado en
llamar por los especialistas como "el siglo de las tecnologas de la informaci n."
Referencias bibliogrficas
1. Martn Snchez F, Lpez Campos G, Ibarrola de Andrs N. La convergencia de la informtica mdica
y la bioinformtica: impactos en la prctica clnica y en la educacin de los profesionales de la salud.
En: Servicios de Salud: estrategias o tecnologas?. Madrid: Editorial Mdica Panamericana, 1999.
2. Hagen JB. The origin of bioinformatics. Nat Rev Genet 2000;1(3):231-6.
3. Miller PL. Opportunities at the intersection of bioinformatics and health informatics: a case study. J
Am Med Inform Assoc 2000;7(5):431-8.
4. Gonzalo Claros M. Bioinformtica o cmo perder el tren sin darse cuenta. [En lnea]
http://www.ciencias.uma.es/publicaciones/encuentros/ENCUENTROS61/bioinformatica.html
[Consulta: 2 enero 2003].
5. Kohane IS. Bioinformatics and clinical informatics: the imperative to collaborate. J Am Med Inform
Assoc 2000;7(5):512-6.
Recibido 3 de mayo del 2003 Aprobado 8 de junio del 2003
Tec. Ligeya Perezleo Solrzano
Departamento de Informacin Cientfica Centro Nacional de Investigaciones Cientficas
Avenida 25 y Calle 158. Cubanacn, Playa. Ciudad de La Habana, Cuba. Apartado Postal 6414.
Correo electrnico: ictcnic@biocnic.cneuro.edu.cu

1 Tcnico Medio en Informacin Cientfico-Tcnica y Bibliotecologa. Centro Nacional de Investigaciones

Cientficas.
2 Tcnico Medio en Informacin Cientfico-Tcnica y Bibliotecologa. Centro Nacional de Investigaciones
Cientficas.
3 Tcnico Analista de Informacin. Centro Nacional de Investigaciones Cientficas.
4 Tcnico Analista de Sistemas. Centro Nacional de Investigaciones Cientficas.
5 Ingeniero en Telecomunicaciones. Jefe del Dpto de Informacin Cientfica. Centro Nacional de
Investigaciones Cientficas.
2004 2000, Editorial Ciencias Mdicas
Calle E No. 452 e/ 19 y 21, El Vedado, La Habana, 10400, Cuba.

acimed@infomed.sld.cu