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Prolina
en
posicin
166).
Las
flechas
de
color
naranja
por
flechas
negras.
Como
puede
apreciarse,
las
las
mutaciones
presentes
en
enfermedades
humanas
encontramos que las transiciones son ms frecuentes. Esto es debido a que en general las
transiciones provocan una alteracin menos severa del producto proteico, por lo que la presin selectiva
contra ellas es menor. Adems, el dinucletido CpG suele estar metilado en la citosina, y la desaminacin espontnea de una metil-citosina da lugar a una transicin del tipo CT. Como este
como 112_117>TG)
3. En repeticiones en tandem, se asigna por convenio el cambio a la ltima repeticin (la que ocupa una
poscin ms 3): por ejemplo, la delecin de un dinucletido TG en la secuencia ACTGTGTGCC (siendo A
el nucletido 1991) se describira como 1997-1998del ( 1997-1998delTG).
4. La variabilidad en microsatlites se designa contando la posicin de la primera repeticin. Si la
secuencia del ejemplo anterior fuese polimrfica, se designara 1993(TG)3-22, para indicar que en
posicin 1993 comienza un dinucletido TG que se encuentra en la poblacin repetido entre 3 y 22
veces.
5. En intrones (cuando no se conoce la secuencia genmica), se seala la posicin dentro del intrn con
referencia al exn ms cercano (utilizando nmeros positivos comenzando con la G de la secuencia de
ayuste GT donante, y nmeros negativos contando desde la G de la secuencia AG aceptora). Se puede
usar tanto la sigla IVS como sinnimo de intrn, como la numeracin correspondiente a la secuencia
del ADNc. Ejemplos:
IVS3+1G>T c.621+1G>T (621 es el ltimo nucletido del exn 3, luego +1 es la G de la
secuencia donante GT del intrn 3)
IVS6-5C>A c.1781-5C>A (1781 es el primer nucletido del exn 7, luego 1 es la G de la
secuencia aceptora AG del intrn 6, -2 es la A, y as sucesivamente hasta llegar a -5).
b)
con delecin de dos bases en el ARNm y la interrupcin del marco de lectura que produce una protena
truncada y es causa de algunos casos de enfermedad de Alzheimer.
Este enlace nos lleva a Virtual Cell Animation Collection, un sitio educativo
creado por la National Science Foundation y el U.S. Department of
Education. Haciendo click aqu, accedemos directamente al video que
muestra el proceso de ayuste (splicing).
Como se puede suponer, en un genoma eucariota hay miles de sitios que cumplen el consenso de
secuencia necesario para funcionar como sitio de ayuste, pero sin embargo slo unos pocos participan
en el procesamiento normal de los genes. De hecho, uno de los temas ms interesantes en la regulacin
del ayuste es cmo se definen exactamente los lmites de exones e intrones, de modo que la
maquinaria de ayuste los reconozca como tales. Aunque todava quedan incgnitas por resolver, hoy en
da sabemos que hay otros elementos que cooperan para estabilizar el ayusteosoma y permitir que se
lleve a cabo el proceso. Entre estos elementos destacan la protenas SR (llamadas as por ser ricas en
los aminocidos Serina y Arginina), que interaccionan con distintos componentes del ayusteosoma y se
unen a secuencias moduladoras como son los potenciadores exnicos del ayuste. Del mismo modo,
algunos tipos de ribonucleoprotenas nucleares heterogneas (hnRNP) se unen a silenciadores del
ayuste, tanto exnicos como intrnicos. Todas estas interacciones tienen lugar antes de la unin de las
RNPnp U4/6 y RNPnp U5, y son muy importantes para definir los lmites de exones e intrones.
Figura 6.7 Este video explica la forma en que se definen los exones e
intrones, dependiendo de las secuencias presentes en el ARN.
Una ventaja del mecanismo de ayuste es que hace posible que distintas clulas utilicen distintas
combinaciones de exones para dar lugar a mensajeros ligeramente diferentes, que se traducen en
protenas distintas. Este fenmeno por el cual un mismo gen puede sufrir distintos patrones de ayuste
dependiendo del tejido del tipo celular en que se lleva a cabo, se denomina ayuste alternativo. Es
muy comn en mamferos, y aade un nivel ms de complejidad a la capacidad codificante del genoma.
Por ejemplo, se estima que al menos el 90% de los ARN mensajeros humanos estn sujetos a
ayuste alternativo, bien en distintos tejidos bien durante el desarrollo embrionario. Esto da una idea de
la importancia de este proceso, y la necesidad de comprender bien cmo se regula.
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resultado la falta de funcionalidad de esta secuencia de ayuste, con lo que se salta el exon
precedente.
Figura 6.10 Este video ilustra el ejemplo del gen COLQ, en el que una
mutacin en la posicin +3 del intrn 16 tiene el mismo efecto que una
mutacin que destruya la secuencia de ayuste 5'. Esto se explica porque
la secuencia que rodea a la secuencia de ayuste 5' no es totalmente
complementaria a la secuencia del ARN nuclear pequeo U1, por lo que
la mutacin de la posicin +3 (que habitualmente no debera tener
ningn efecto) hace que la unin del ARNnp U1 sea ineficaz y el proceso
de ayuste no se lleve a cabo correctamente.
Finalmente, existen mutaciones que, sin afectar directamente a secuencias consenso de ayuste,
pueden activar un lugar crptico en un intrn y producir un exn ms grande y posiblemente un
cambio en el marco de lectura.
Figura 6.11 Este video muestra el proceso por el que una mutacin
puede activar una secuencia de ayuste crptica en un intrn. Si esta
secuencia es ms fuerte que la secuencia de ayuste original, se puede
alterar el patrn normal de ayuste de esa regin.
Como regla general, podemos afirmar que las mutaciones que afectan al mecanismo de ayuste son ms
raras que las substituciones, aunque algunos genes tienen una estructura exnica que les otorga
una tendencia especial a sufrir mutaciones de este tipo: se trata, habitualmente, de genes con
muchos intrones y con exones pequeos, como sucede con los genes que codifican cadenas del colgeno
(COL7A1, por ejemplo, tiene 118 exones), o bien genes con muchos sitios crpticos de ayuste (como es
el caso del gen de la beta-globina).
Como hemos visto en el apartado anterior, los ESE ESS (potenciadores o silenciadores exnicos del
ayuste) y los ISE ISS (potenciadores o silenciadores intrnicos) constituyen secuencias de unin para
protenas SR (las que se unen a los potenciadores de ayuste) o para protenas hnRNP (las que se unen
a los silenciadores). Por tanto, estas protenas regulan el proceso de ayuste y determinan si un exn va
a estar presente en el transcrito final o, por el contrario, se va a saltar. Es importante tener en cuenta
que algunas mutaciones en estos motivos, aunque sean silenciosas porque no cambian el aminocido
(o porque se localizan en intrones), pueden sin embargo tener efectos sobre el mensajero, haciendo que
un exn se pierda y alterando as la estructura de la protena o rompiendo el marco de lectura. De
hecho, en algunos genes (ATM o NF1, por ejemplo) se ha estimado que el 50% de las mutaciones que
originan enfermedades afectan a regiones que cambian el patrn de ayuste sin cambiar la
secuencia de aminocidos. Un buen ejemplo para ilustrar esta situacin es una enfermedad llamada
Atrofia Muscular Espinal, debida a deleciones y/o mutaciones del gen SMN1. Cerca de este gen hay
un gen parlogo casi idntico llamado SMN2, en el que un cambio C
(sin cambiar la secuencia de aminocidos) y hace que el exn 7 se pierda, dando lugar a una protena
truncada no funcional. De todas formas, un pequeo porcentaje de las molculas siguen un ayuste
normal (con el exn 7) y producen protena normal a partir del gen SMN2. Por tanto, aunque no haya
ninguna copia funcional de SMN1 (como sucede en enfermos con atrofia muscular espinal) la
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enfermedad tiene distinta gravedad segn el nmero de copias de SMN2 presentes. De hecho, se piensa
que esta circunstancia podra utilizarse para corregir la sintomatologa de los pacientes con Atrofia
Muscular Espinal.
Figura 6.12 El video ilustra los distintos patrones de ayuste de los genes
SMN1 y SMN2, debidos a un cambio nucleotdico que destruye un
potenciador exnico de ayuste en el exn 7 del gen SMN2.
Otro tipo de mutaciones del ADN no-codificante intragnico son las que afectan a la seal de poliadenilacin, que se encuentra en la regin no traducida 3 de un gen. Estas mutaciones pueden
originar protenas defectuosas llevar a la degradacin del ARNm. Por ejemplo, una mutacin en la seal
de poliadenilacin del gen que codifica la hemoglobina alfa-2 (alelo HBA2 0024) convierte la seal
AATAAA en AATGAA, con lo que el ARNm no se poli-adenila correctamente, el ARNm se degrada y se
desarrolla la enfermedad alfa-talasemia por ausencia de cadenas de hemoglobina alfa-2.
Finalmente, las substituciones en el ADN no codificante intergnico sern silenciosas excepto
cuando afecten a elementos reguladores de la expresin gnica (promotores, potenciadores, etc) o a
otros elementos necesarios para el correcto procesamiento del ARNm. Por ejemplo, mutaciones que
afectan a la Regin de Control del Locus de las alfa- y beta-globinas (un conjunto de potenciadores
situados unas 4060 kb en direccin 5' de los genes respectivos) tambin provocan talasemias, por la
sntesis deficiente de globinas.