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INVESTIGACIN
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El genoma oculto
Cuando se daban por conocidos casi todos los datos del ADN,
han aparecido dos capas amplias de informacin en los cromosomas,
en buena parte ocultas, que afectan a la herencia,
el desarrollo y la enfermedad
W. Wayt Gibbs
JAMIE KRIPKE
H
1. LOS LUNARES DE COLOR
MARRON OSCURO del iris
podran deberse a la accin del
genoma oculto. Hay rasgos que
no se transmiten mediante los
genes, sino a travs de modificaciones qumicas de los cromosomas, cambios que se regulan
en parte por fragmentos del
ADN redundante. A diferencia
de las mutaciones genticas,
estos rasgos heredables son a
menudo reversibles; aparecen
en unas clulas y no en otras.
(La esfera blanca en el iris no
es ms que el reflejo de la luz
que ilumina el ojo.)
ace unos veinte aos, los astrnomos estaban convencidos de que la rotacin de las galaxias no se
poda explicar slo a partir de las leyes de la gravedad y la posicin de los cuerpos celestes. Poco a
poco empezaron a admitir que el universo no estaba tan vaco como pareca, sino que deba contener algn tipo de materia obscura. Aunque se desconocan su
composicin qumica y su funcionamiento, no faltaban indicios
de su existencia. La investigacin de la materia oscura y, ms
recientemente, la energa oscura oblig a revisar teoras admitidas; incluso a sustituirlas. Al propio tiempo, sin embargo, se
dio un nuevo impulso a la astrofsica y la cosmologa.
Un fenmeno parecido comienza ahora a producirse en la gentica molecular. En 2003 se celebr el quincuagsimo aniversario del descubrimiento de la doble hlice; el Proyecto Genoma
Humano anunci tambin la terminacin del borrador de la secuencia del ADN de Homo sapiens. Se haba logrado domear
el ADN in vitro. Eso se crea. Sin embargo, cuando se compara
el genoma de especies sin parentesco prximo y se escudria el
funcionamiento de los cromosomas in vivo, se observan fenmenos inexplicables en el marco de las teoras vigentes.
Las revistas y los congresos cientficos han empezado a hacerse eco de nuevos datos que contradicen la idea aceptada de
que los genes, segmentos de ADN que codifican protenas,
constituyen la nica fuente de herencia y encierran los planos
de la vida. Del mismo modo en que la materia oscura influye
sobre el destino de las galaxias, el genoma oculto ejerce un control del desarrollo y de los rasgos distintivos de los organismos,
desde las bacterias hasta el hombre. El genoma contiene mucho ms que genes codificadores de protenas.
Resumen/Genes ocultos
dente es que slo 244 de estos segmentos se encuentran en el interior de una secuencia nucleica codificadora de protenas. Alrededor de dos tercios de las secuencias conservadas residen en intrones; el resto se
encuentra disperso entre el ADN intergnico.
No sera de extraar que el concepto de ADN chatarra se convierta en un ejemplo clsico de cmo la
doctrina admitida puede desvirtuar la interpretacin de
las observaciones. Haber ignorado la posibilidad de que
estas secuencias no codificadoras transmitieran informacin paralela en molculas de ARN ha constituido
uno de los grandes errores sufridos por la biologa
molecular.
INVESTIGACIN
Ms que un mensajero
Progresin de la gentica
DESDE QUE LA INVENCION de la tcnica del ADN
recombinante posibilit el desarrollo de la ingeniera gentica, la investigacin opera hacia atrs.
Se escoge un gen de inters, se le estudia en un
cultivo celular o en un organismo, se observan los
cambios provocados con su presencia y, por fin, se
deduce la funcin del gen. Se trata de un enfoque
reduccionista, clsico y potente.
Pero a medida que la fraccin oculta del genoma
(las secuencias funcionales del ADN que se suponan
redundantes) gana protagonismo, se pone sobre el
tapete un problema desconocido, a saber, que esa
gentica retrgrada desemboca en un tnel. De ah
el inters creciente por un nuevo enfoque de sentido contrario: progresivo. Se trata de identificar los
genes, clsicos o no, con unas tcnicas que miran
hacia adelante.
En este contexto, la compaa Phenomix, de La
Jolla, ha puesto en funcionamiento una lnea de
produccin de ratones mutantes. En cada grupo de
ratones, las mutaciones aleatorias de su genoma
desactivan no slo genes que codifican protenas,
sino tambin otros genes ocultos que slo producen formas activas de ARN.
Photomix ha comenzado a la vez con ratones sanos y con otros con patologas anlogas a las humanas diabetes, asma, artritis o enfermedad de
Parkinson. Algunas mutaciones inducen o alivian
los sntomas de estas alteraciones en el ratn. Se
realiza entonces un barrido gentico para determinar
las mutaciones responsables de tales efectos. Est
todava por ver si este nuevo enfoque inspirar un
diseo de frmacos ms eficaz. De momento, esa
gentica progresiva ha sacado ya a la luz fenmenos genticos insospechados: los pseudogenes
funcionales, por ejemplo.
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GENES SINGULARES
LOS GENES, de acuerdo con la doctrina admitida,
constituyen segmentos de ADN que codifican protenas funcionales. Sin embargo, esas secuencias integran slo un 2 por ciento del genoma humano. El
resto corresponde a ADN que no se dedica a ese
Ncleo celular
El ARN antisentido se origina a partir de la hebra del ADN complementario situada en el lado opuesto de un gen codificador. Los ARN
antisentido pueden interceptar el ARN mensajero transcrito a partir
del gen (ARNm), evitando la traduccin a protena.
Gen
codificador
de protena
ARNm
ADN complementario
ARN antisentido
Seccin codificadora
Intrn
ARNm maduro
El mecanismo
de interferencia del ARN
procesa el microARN...
Intrn
degradado
MicroARN
ARNm interceptado
TERESE WINSLOW
Gen
INVESTIGACIN
Secuencia codificadora
de protena
Estado
activo
Secuencia
no codificadora
Estado
inactivo
Molcula
diana
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Analgico y digital
HUGH MORGAN
INVESTIGACIN
La visin global
tado completo para el hombre o cualquier otra especie superior. A diferencia de los genes productores de
protenas, cuya secuencia est limitada por seales de inicio y fin,
los genes de slo ARN varan tanto,
que los programas informticos no
consiguen detectarlos en las secuencias de ADN.
Para estimular la tcnica, el Instituto estadounidense de Investigaciones del Genoma Humano ha invertido 36 millones de dlares en
un ambicioso proyecto: la Enciclopedia de Elementos de ADN. En
tres aos, se pretende catalogar todo
tipo de protenas y ARN sintetizados a partir de un escogido uno por
ciento del genoma humano.
Nadie sabe todava qu panorama
gentico se nos abrir una vez salga
a la luz esa capa de informacin
ahora oculta. El ADN redundante
que antao se desech por ignorarse
su funcin, podra quiz convertirse en el fundamento de la complejidad humana. As lo avalan pseudogenes, ARN antisentido, microARN
y riboconmutadores. El ARN activo,
como se empieza a saber ahora, contribuye a controlar la estructura general de los cromosomas y algunas
de sus modificaciones qumicas cruciales; dicho de otro modo, constituye una nueva capa de informacin
epigentica.
Bibliografa complementaria
NON-CODING RNA GENES AND THE
MODERN RNA WORLD. Sean R. Eddy
en Nature Reviews Genetics, vol. 2,
pgs. 919-929; diciembre de 2001.
AN EXPANDING UNIVERSE OF NONCODING RNA S . Gisela Stortz en
Science, vol. 296, pgs. 1260-1263;
17 de mayo de 2002.
WIDESPREAD OCCURRENCE OF ANTISENSE T RANSCRIPTION IN THE H U MAN G ENOME . Rodrigo Yelin et al.
en Nature Biotechnology, vol. 21,
pgs. 379-385, abril del 2003.
CHALLENGING THE DOGMA: THE HIDDEN L AYER OF N ON -P ROTEIN -C O DING RNA S IN C OMPLEX O RGA NISMS. John S. Mattick en BioEssays,
vol. 25, pgs. 930-939, octubre de
2003.
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