Flujo de informacin en la clula

Transcripcin
Proceso de sntesis de ARN
dirigido por el ADN.
Una hebra es copiada (hebra
molde)
Relacionado con expresin
gnica
Algunas regiones que se
transcriben no son traducidas a
protenas (ARNr, ARNt, ARNpn)
Proceso similar a replicacin

Tipos de ARN

Diferencias con replicacin:

Uso de ribonucletidos

Propiedades comunes:
Todos son producidos por transcripcin
Todos cumplen un papel en la sntesis proteica
Generalmente con estructuras secundarias y
terciarias complejas

Uracilo por Timina

Adicin de nucletidos por
RNA Polimerasa
Formacin temporal de un
duplex ADN-ARN
El producto es de cadena
simple

Caractersticas de la transcripcin

ARN celulares,
abundancia y
funcin

Dirigido por una ARN Polimerasa

La transcripcin
est fuertemente
regulada.
Apenas un 0.01%
de los genes se
est expresando
en una clula
eucariota en un
momento dado.

66 %
%

80%
80%
10%
10%
44 %
%

Una hebra de ADN sirve de molde

La enzima no requiere cebador
La enzima elonga una cadena en direccin 5`-3`
Formacin de enlace 3-5fosfodister
La sntesis slo se inicia en secuencias especficas llamadas
promotores
Desenrrollamiento parcial del ADN

ARN polimerasa bacteriana

Nomenclatura transcripcional
Una hebra de ADN sirve de molde (hebra molde)

Unica ARNPolimerasa bacteriana

Multmero de varias subunidades
subunidad 70 se une a secuencias
especficas en las posiciones 10 y 35
del promotor

El transcripto es igual a la hebra codificante y complementario a la hebra molde

la subunidad queda en posicin

upstream
las subunidades b y b se asocian con
el sitio de inicio

(Sense)

CCTTACTTACTGTTACGCCG
GGAATGCCTGACAATGCGGC

el sitio de inicio de la transcripcin es

+1
downstream = direccin de la
transcripcin

(Antisense)

CCUUACUUACUGUUACGCCG

Promotores bacterianos

Modelo de la ARN Polimerasa bacteriana

El modelo muestra la
interaccin de la holoenzima
con el promotor formando el
complejo abierto. Hebra
molde en gris

10

Transcripcin en bacterias: iniciacin

El proceso
de la
transcripcin

1. Reconimiento de la hebra molde

Unin de la polimerasa al promotor (Formacin de un complejo cerrado)
Formacin de una burbuja de ADN de cadena simple (complejo abierto)
2. Iniciacin
Sntesis de los primeros 9 o 10 nucletidos
Varios eventos abortivos, donde el ARN es liberado
Pasado este punto (10 nucletidos) se libera sigma y comienza la longacin
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Terminacin transcripcional en bacterias

Transcripcin en bacterias: elongacin

Reconocimiento de seales particulares que indican donde terminar la sntesis

La burbuja de transcripcin se desestabiliza y colapsa liberndose el ARN
Rho dependiente

Rho independiente

protena Rho se une al ARN

bucle autocomplementario

Varios eventos abortivos, donde el ARN es liberado

Pasado este punto (10 nucletidos) se libera sigma y comienza la elongacin
Adicin de nucletidos al extremo 3 hidroxilo de la cadena creciente

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Diferencias entre la transcripcin

procariota y eucariota

ARN polimerasas eucariotas

INCAPACES DE RECONOCER EL PROMOTOR

ARNm policistrnico
transcripcin y traduccin
acopladas
ARN Polimerasa nica

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ARNm monocistrnico
transcripcin y procesamiento
acoplados
3 ARN Polimerasas diferentes

Polimerasa
Pol I
Pol II
Pol III

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localizacin
nucleolo
nucleoplasma
nucleoplasma

genes transcritos
ARNr
ARNm , ARNpn
ARNt, ARNr 5S

inhibicin por a-amanitina

insensible
muy sensible
sensible

La polimerasa II eucariota es similar a la

bacteriana.....

17

.....aunque ms
compleja

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Transcripcin en eucariotas

Iniciacin en eucariotas

Protenas
ARN Polimerasas
Factores de Transcripcin
Modificadores

Todas las polimerasas

eucariotas necesitan
Factores Transcripcionales
basales para reconocer los
promotores e iniciar la
transcripcin

Polimerasa II
Factores
generales

Factores
especficos

Modificadores

Seales
19

Promotores
Potenciadores

20

Promotores regulados eucariotas

Factores transcripcionales
Protenas de unin a sitios especficos de ADN

Secuencias de
reconocimiento especfico
para Factores de
Transcripcin

Se asocian a Promotores y potenciadores

Estructura modular:

dominios de activacin

Estructura modular

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dominios de unin al ADN

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Los Factores Transcripcionales son protenas de

unin al ADN

Potenciadores
Activacin de la Transcripcin

Reconocen secuencias especficas en promotores y potenciadores

Se ensamblan cooperativamente sobre el ADN mediante interacciones
protena-protena

Potenciadores (enhancers)
reguladores en cis
Funcin a distancia
Independientemente de
orientacin
Sitios de union a factores de
transcripcin

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24

Los factores de transcripcin especficos colaboran

en el ensamblado del complejo de iniciacin

Existen activadores, represores y mediadores

Factores especficos colaboran para colocar los

FBasales en el promotor y stos posicionan las
polimerasas

La mayora de los
genes regulados por
factores
transcripcionales
mltiples

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Los factores basales se ensamblan

secuencialmente y posicionan la ARN polimerasa

Elongacin en eucariotas, el papel del CTD

CTD- CARBOXI TERMINAL DOMAIN de la RNA Polimerasa II
c/repetidos de 7 pptidos (26-52aa)
Unicos a pol II
Su fosforilacin es esencial para la elongacin
La fosforilacin depende de uno de los factores generales

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28

PROCESAMIENTO DE ARN EN EUCARIOTAS

El ciclo transcripcional
eucariota

Todo ARN se procesa.

Los ARNr se transcriben juntos y por corte se
generan fragmentos menores.
Los ARNt se procesan y sufren modificaciones
de bases.
Los ARNm sufren 4 tipos de modificaciones:
- Capping.
- Cola poli A.
- Corte y empalme de intrones (Splicing)
- Editing.

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Unidad Transcripcional Ribosomal

Transcripcin Y Procesamiento de ARNr

31

Genes dispuestos en tndem: aproximadamente 200 copias

de genes de ARNr en Genoma Humano (Cromosomas con
satlites).

Transcriptos como un gran precursor policistrnico de 13000 nt (ARNr 45S).

En interfase se ven como Nucleolos: zonas de transcripcin y

unin a protenas ribosmicas.

Procesados secuencialmente (degradacin de las secuencias intermedias)

Los transcriptos son metilados

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Transcripcin y Procesamiento del ARNt

Modificaciones de bases
en el ARNt

Transcriptos como mono o policistrnicos

Los transcriptos son procesados secuencialmente
Formacin del trbol
Degradacin de extremos y adicin de brazo aceptor CCA
Eliminacin de intrones
Modificacin de bases

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Procesamiento de los ARN mensajeros

Capping

Estructura de la Caperuza 5

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El mecanismo de la Poliadenilacin

Poliadenilacin en extremo 3

Proceso secuencial dependiente de :

Reconocimiento de secuencias en el transcripto
Interaccin ARN-proteinas especficas
Interaccin protena-protena

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Hibridacin ADNADN-ARN

Corte y empalme (splicing

(splicing)) de intrones y exones

el gen de la ovoalbmina

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El proceso de corte y empalme

Ensamblado secuencial de partculas riboproteicas (SNURPs)
Apareamiento de bases con el mRNA

Tipos de intrones

Corte y empalme
Liberacin del intrn
U1 snRNP

U2 snRNP
Pre mRNA
intron

GU

AG

Salida del
U4, U6, U5
snRNP

intron
Ligacion de
los exones

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Reconocimiento de seales de procesamiento

El spliceosoma
Estructura riboproteica
encargada del
procesamiento de los
intrones

Apareamiento de bases del ARN precursor con el ARN del SNURP

Ensamblado secuencial de partculas riboproteicas (SNURPs)
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El splicing consiste en dos

transesterificaciones sucesivas

Ribozimas
TIPO I Algunos genes de ARNr

ARN que elimina sus propios intrones

ARN que elimina intrones de otros ARN
ARN que cataliza su propia replicacin

Estructura terciaria de un intron tipo

I de un ARN de Tetrahymena que
se autoelimina del resto del ARN.

TIPO II Mitocondria y cloroplastos

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Una visin moderna de la expresin gnica

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