Bio de Pollution

1
Universit de Provence
AIX-Marseille 1
E.S.G.B.M.A - E.S.I.L.
Luminy
Introduction la bioremdiation
des sols, des eaux et de l'air
Pierre ROGER
et
Vincent JACQ
Laboratoire de Microbiologie IRD

Institut de Recherche pour le
Dveloppement
IRD (ex ORSTOM)
Dec. 2000
2
TABLE DES MATIERES
1. INTRODUCTION
2. DEFINITIONS
3. LES PRINCIPAUX POLLUANTS
3.1 LES POLLUANTS DANS LES MILIEUX NATURELS (NAPPES ET SOLS)
3.2 POLLUANTS RECALCITRANTS ET POLLUANTS BIODEGRADABLES

3.2.1 Biodgradabilit ou rcalcitrance
3.2.2 Demi-vie et persistence
11
11
14
3.3 DOSES ADMISSIBLES ET NORMES
18
4. LES PRINCIPAUX TYPES DE POLLUTION
22
4.1 DEVENIR DES POLLUANTS DANS L'ENVIRONNEMENT
22
4.2 POLLUTIONS PONCTUELLES
25
4.3 POLLUTIONS DIFFUSES
26
4.4 LES SITES POLLUES
27
5. CONSEQUENCES ET MODE D'ACTION DE LA POLLUTION
30
5.1 EFFETS DIRECTS: CONTACT, INGESTION, INHALATION
30
5.2 BIOCONCENTRATION DANS LES CHAINES ALIMENTAIRES
30
6. BIODEPOLLUTION PAR LES MICROORGANISMES
33
6.1 INTRODUCTION
6.1.1 Spcificit et non spcificit
6.1.2 Adaptation microbienne la dgradation des polluants
6.1.2.1 Seuils infrieur et suprieur
6.1.2.2 Adaptation et phase de latence
6.1.2.3 Synergies et dgradations successives
33
34
37
37
37
38
6.2 MECANISMES MICROBIENS DE LA BIODEPOLLUTION

6.2.1 Minralisation
6.2.2 Comtabolisme
6.2.3 Transformations dtoxifiantes
6.2.3.1 Hydrolyse
6.2.3.2 Hydroxylation
6.2.3.3 Dhalognation
6.2.3.4 Dmthylation et autres dalkylations
6.2.3.5 Mthylation
6.2.3.6 Rduction d'une fonction NO 2
6.2.3.7 Dsamination
6.2.3.8 Clivage d'une liaison ther (C-O-C)
6.2.3.9 Conversion d'un nitrile en amide
6.2.3.10 Conjugation
6.2.3.11 Ouverture de cycles (composs benzniques)
6.2.3.12 Ractions multiples
6.2.3.13 Transformations non dtoxifiantes
40
40
40
42
42
42
43
44
45
45
45
45
45
46
46
46
46
3
6.2.4 Bioconcentration
47
6.3 PARAMETRES ENVIRONNEMENTAUX QUI AFFECTENT LA BIODEPOLLUTION
7. LES DIFFERENTES METHODES DE BIOREMEDIATION
54
7.1 ASPECTS MICROBIOLOGIQUES

7.1.1 Les deux approches possibles
7.1.2 Choix de la technologie appliquer en fonction du biotope
7.2 ASPECTS TECHNOLOGIQUES
7.2.1 Gnralits
7.2.2 Biormdiation du sol
7.2.2.1 Le traitement par pandage ("landfarming")
7.2.2.2 Le compostage
7.2.2.3 Les racteurs boues
7.2.2.4 Lagunage
7.2.2.5 Phytoremdiation
7.2.3 Biormdiation des pollutions profondes: sous sol et eaux de nappe
7.2.3.1 Percolation et traitement in situ
7.2.3.2 Extraction et traitement ex-situ des polluants
7.2.4 Biormdiation des effluents gazeux
7.2.4.1 Les absorbeurs
7.2.4.2 Les units de traitement biologique: biolaveurs et biofiltres
7.2.4.3 Potentialits et orientations de choix
48
55
55
58
58
58
59
59
60
61
61
Erreur! Signet non dfini.
62
62
63
64
66
67
69
7.3 ETUDES DE FAISABILITE

7.3.1 Apprciation de la faisabilit
7.3.2 Changement d'chelle (Scalling-up)
7.3.3 Vrification de l'efficience de la mthode
8. EXEMPLES PRATIQUES
71
71
73
73
77
8.1 INTRODUCTION: LES SUCCES DE LA BIOREMEDIATION
77
8.2 BIOREMEDIATION DU SOL EX SITU
78
8.3 BIOREMEDIATION DU SOUS-SOL ET DES NAPPES PHREATIQUES

8.3.1 Biormdiation in situ
8.3.2 Percolation et traitement ex-situ du percolat
78
78
79
8.4 BIOREMEDIATION DES EFFLUENTS GAZEUX
81
9. ASPECTS FINANCIERS, RENTABILITE
83
9.1 LE MARCHE DE LA DEPOLLUTION
83
9.2 LES COUT RELATIF DES METHODES
83
10. CONCLUSION: AVANTAGES, LIMITATIONS ET PERSPECTIVES
85
10.1 AVANTAGES DE LA BIOREMEDIATION
85
10.2 LIMITES TECHNIQUES

10.2.1 Biodgradabilit des composs et rcalcitrance
10.2.2 Adaptabilit des souches introduites
10.2.3 Effets ngatifs de la biotransformation
85
85
85
86
10.3 ASPECTS LEGAUX
86
4
10.4 PERSPECTIVES
87
11. LES ENTREPRISES DE DEPOLLUTION
88
12. POUR EN SAVOIR PLUS
89
12.1 OUVRAGES
89
12.2 ARTICLES DE VULGARISATION DANS LA PRESSE SPECIALISEE
89
13. GLOSSAIRE
90
1. INTRODUCTION
Au cours des vingt dernires annes on a assit une augmentation spectaculaire de l'intrt pour
les mcanismes de biodgradations orientes vers la protection de l'environnement.
Parmi les nombreux faits qui expliquent cette recrudescence d'intrt pour la biodpollution,
on peut citer:
la prise de conscience de l'importance de l'accumulation des pollutions domestiques (dtergents),
industrielles et agricoles.
le courant des ides cologiques dans les pays occidentaux,
des d'accidents cologiques spectaculaires et mdiatiss, par exemple:
- les naufrages du Torrey Canyon et de l'Amocco Cadiz,
- l'accident de Seveso,
- la pollution de la baie de Minamata,
- divers rejets massifs dans des rivires,
des actes de guerre:
- emploi d'agents dfoliants au Vietnam
- l'pandage de ptrole brut au Koweit et dans le Golfe Persique,
Une impulsion importante au niveau industriel est celle de l'industrie du papier, soucieuse de se
dbarrasser de faon conomique et efficace de la lignine limine au cours du blanchiment des
ptes papetires. Le traitement traditionnel, base de chlore, engendre des composs secondaires
qui constituent un risque majeur de pollution.
Les tudes portent notamment sur:
- les polluants des nappes phratiques utilises pour la production d'eau potable
- la biodgradation des organochlors
- les rejets mtalliques (mercure, cadmium, cuivre,...)
Dans les milieux agricoles, une attention particulre est porte au dveloppement durable et
la ncessit d'utiliser des pratiques culturales n'ayant pas d'effets dfavorables court et long
terme sur l'environnement. On s'intresse aux consquences de l'utilisation incontrole des engrais
azots et des pesticides, spcialement les organophosphors et les organochlors.
L'volution des lgislations exerce une pression salutaire sous forme de surveillance de l'air
et des eaux, et d'interdictions portant sur la fabrication ou la diffusion de produits considrs
comme dangereux.
La biodpollution est une technique ancienne qui a t abondamment utilise dans des
systmes clos tels que les bassins de dcantation, les systmes de dpollution arobie des eaux uses
ou les digesteurs anarobies. Par contre la biormdiation, qui est l'utilisation volontaire de la
biodpollution pour miminer les agents polluants du sol, du sous-sol, des nappes phratiques et de
l'air, est une technique rcente qui ncessite une approche multidisciplinaire en raison de la
complexit des agents polluants et des milieux traiter. Contrairement aux systmes de traitements
de dchets urbains et d'eaux industrielles ou agro-industrilles qui portent sur des milieux
monophasiques homogniss et de composition connue, la biormdiation s'adresse des milieux
htrognes, souvent polyphasiques, dans lesquels les polluants sont distribus galement de faon
trs htrogne. La mise au point de processus de bioremdiation demande alors les comptences
conjointes d'ingnieurs, de microbiologistes, de gologues, d'hydrologues, d'cologistes et de
chimistes.
On distigue deux grands types de mthodes de bioremdiation. Les mthodes ex-situ
ncessitent l'extraction du matriel contamin pour son traitement dans un dispositif spcifique, si
possible install sur ou proximit du site d'extraction. Les mthodes in situ traitent sur place le
matriel contamin. Les techniques les plus communes sont dfinies au chapitre suivant sous la
rubrique "Bioremdiation".
6
Ce cours est une introduction la bioremdiation des sols, du sous-sol et des nappes
phratiques. Il aborde tout d'abord les aspects fondamentaux de la bioremdiation, puis fait
l'inventaire des diffrents procds thoriquement utilisables. Il donne ensuite des exemples de
bioremdiations effectivement utilises. La conclusion considre les limitations et les perspectives
des mthodes de bioremdiation.
2. DEFINITIONS
Pollution:
Dfinition simplifie: introduction dans un milieu de substances ou d'nergie susceptibles
d'avoir des effets indsirables ou toxiques sur l'homme et son environnement.
Toutefois, le terme de pollution recouvre des acceptions fort diverses et qualifie une
multitude d'actions qui dgradent le milieu naturel. Il dsigne les effets des composs toxiques
rejets par l'homme dans l'environnement, mais s'applique galement d'autres altrations du milieu
de nature physique ou chimique (mission de gaz carbonique dans l'atmosphre par exemple) qui,
sans tre nocives par elles-mmes pour la sant humaine, sont susceptibles de provoquer des
perturbations cologiques d'ampleur catastrophique.
Parmi les nombreuses dfinitions de la pollution ont peut retenir celle de l'EPA
(Environment Protection Agency, USA):
La pollution est une modification dfavorable du milieu naturel qui apparat en totalit ou en partie
comme le sous-produit de l'action humaine, au travers d'effets directs ou indirects altrant les
modalits de rpartition des flux d'nergie, des niveaux de radiation, de la constitution physicochimique du milieu naturel et de l'abondance des espces vivantes. Ces modifications peuvent
affecter l'homme directement ou au travers des ressources en produits agricoles, en eau et autres
produits biologiques. Elles peuvent aussi l'affecter en altrant les objets physiques qu'il dtient, les
possibilits cratrices du milieu ou encore en enlaidissant la nature.
D'autres dfinitions, plus restrictives, limitent l'usage du terme de pollution au rejet de
produits chimiques ou radioactifs dans l'environnement et dsignent sous le vocable gnral de
"nuisance" les autres altrations du milieu ambiant provoques par l'homme (on parlera alors, par
exemple, de nuisance sonore ou de nuisance esthtique...).
Dpollution: limination ou inactivation spontane ou intentionnelle d'un polluant par des agents
physiques, chimiques ou biologiques.
Biodgradation: dcomposition partielle ou totale d'un produit par un agent biologique.
Le terme de biodgradation sous-entend l'limination complte d'un compos avec comme seuls
rejets des produits simples tels que H 2O, CO2, CH4, H2, chlorure (pour un organochlor), ou encore
de l'actate, des produits de fermentation. Elle est souvent mise en vidence par l'emploi de
molcules marques par le 14C et la production de gaz carbonique radioactif.
On parle de minralisation du produit si l'tape ultime est la formation de CO2. Cette notion
implique gnralement qu'une partie du substrat a t assimile par l'organisme concern, ce qui est
vident lorsque ce substrat est la seule source de carbone dans le milieu.
Biodpollution: dpollution biologique spontane ou mise en uvre par l'homme. Elle peut rsulter
(1) d'une biodgradation ou (2) d'une inactivation du polluant par biotransformation.
Biotransformation: transformation d'un produit par un agent biologique. Cette notion implique
gnralement un mtabolisme incomplet du substrat dfaut d'une vritable assimilation par la
cellule. Une oxydation, une hydrolyse ou le remplacement d'un atome de chlore par un hydroxyle
raliss dans une molcule par un microorganisme sont des biotransformations.
Biormdiation: mise en oeuvre intentionnelle par l'homme d'un processus de biodpollution
Bioaugmentation (inoculation): Addition de cultures bactriennes pour stimuler la biodgradation:
utilis dans les bioracteurs et les systmes ex situ.
Biofiltres: Dispositifs pour la biodpollution des effluents gazeux (ex situ)
Biostimulation: stimulation de la microflore autochtone pour favoriser la biodpolluton (ex situ ou
in situ)
Bioracteurs: bac ou racteur (liquides ou boues ex situ) utilis pour la biodgradation.
Bioventilation (bioventing): augmentation de la biodpollution par la microflore arobie par
injection d'oxygne dans le sol.
Compostage: traitement arobie d'un sol contamin mlang avec un matriau adquat.
8
"Landfarming": traitement d'une phase solide in situ ou dans un dispositif construit spcialement.
Xnobiotiques ( - : trangers au monde vivant) dsigne les composs qui ne sont pas
reprsents dans l'environnement ou chez les tres vivants, en dehors de l'activit humaine. Les
micro-organismes ont donc volu au cours des temps gologiques sans jamais avoir t en contact
avec ces drivs, et leurs enzymes risquent d'tre inaptes les attaquer.
3. LES PRINCIPAUX POLLUANTS

3.1 LES POLLUANTS DANS LES MILIEUX NATURELS (NAPPES ET SOLS)
Les polluants sont de nature trs diverse. Ils comprennent une grande varit de composs
organiques, certains mtaux et des gaz. L'importance relative accorde un polluant a gnralement
t dicte par sa toxicit directe pour l'homme. Toutefois, la nouvelle perception des problmes
plantaires lis l'activit anthropique amne maintenant considrer comme polluants majeurs des
composs sans action directe sur l'homme, mais dont l'accumulation peut avoir des effets
significatifs sur l'environnement (les CFC par exemple).
La CEE a tabli une "liste noire" des composs et produits considrs comme les plus
dangereux et une liste grise de ceux qui sont considrs comme moins dangereux (Tableau 1). De
faon similaire, aux USA, l'Agence pour la Protection de l'Environnement (EPA) a tabli une liste
de 129 produits chimiques considrs comme agents polluants importants (Tableau 2).
Les produit rpertoris sur la liste noire de la CEE et sur la liste de l'EPA ne sont pas
seulement fortement toxiques, mais ils sont souvent persistants et peuvent donner lieu des
phnomnes de bioaccumulation.
Tableau 1. Listes "noire" et grise" des polluants, selon la CEE
(d'aprs Mason, 1991; cit par Hardman et al., 1993)
Liste N1 (Liste noire)
1. Composs organo-halogns, et substances susceptibles de les produire, dans les environnements
aquatiques.
2. Composs organo-phosphors.
3. Organotines.
4 . Substances qui manifestent un effet carcinogne dans les environnements aquatiques (les
substances de la liste grise ayant un effet carcinogne sont inscrites en liste 1).
5. Mercure et composs mercuriels.
6. Cadmium et composs contenant du cadmium.
7. Huiles minrales et hydrocarbures rcalcitrants.
8. Composs synthtiques rcalcitrants.
Liste N 2 (Liste grise)
1. Les mtaux et mtallodes suivants (et les composs qui en contiennent): Antimoine ; Arsenic ;
Barium ; Bryllium; Bore; Chrome ; Cobalt ; Cuivre; tain; Molybdne; Nickel ; Plomb; Slnium ;
Tellurium; Thalium ; Titane ; Uranium ; Vanadium ; Zinc.
2. Biocides et les produits qui en drivent non cits en "Liste Noire".
3. Composs ayant un effet dsagrable sur le got ou l'odeur des aliments en provenance des
environnements aquatiques, ou l'origine de la prsence de telles substances dans les eaux.
4. Composs silicons, toxiques ou rmanents, ou produits gnrateurs de tels composs dans les
eaux, l'exception des produits inertes sur le plan biologique, ou rapidement transforms en
substances inoffensives.
5. Phosphore lmentaire, et composs inorganiques phosphors.
6. Huiles minrales et hydrocarbures non rmanents.
7. Cyanures et fluorures.
8 Composs dont la prsence dans les eaux a pour consquence une diminution des teneurs en
oxygne (en particulier: ammonium et nitrates)
10
Tableau 2. Liste des 129 polluants considrs comme les plus significatifs par
l'Environmental Protection Agency (d'aprs Keith & Telliard, 1979)
31 composs organiques liminables
Acroline
Acrylonitrile
Benzne
Tolune
Ethylbenzne
Ttrachlorure de carbone
Chlorobenzne
1,2-Dichlorothane
1,1,l -Trichlorothane
1,l-Dichlorothane
1,1-Dichlorothylne
1,1,2-Trichlorothane
1,1,2,2-Ttrachlorothane
Chlorothane
2-Chlorothyl vinyl ther
Chloroforme
1,2-Dichloropropane
1,3-Dichloropropne
Chlorure de mthylne
Chlorure de mthyle
Bromure de mthyle
Bromoforme
Dichlorobromomthane
Trichlorofluoromthane
Dichlorodifluoromthane
Chlorodibromomthane
Ttrachlorothylne
Trichlorothylne
Chlorure de vinyle
1,2-trans-Dichlorothylne
Bis(chloromthyl) ther
46 composs organiques extractibles en milieu basique ou neutre

1,2-Dichlorobenzne
Fluorne
1,3-Dichlorobenzne
Fluoranthene
1,4-Dichlorobenzne
Chrysne
Hexachlorothane
Pyrne
Hexachlorbutadine
Phnanthrne
Hexachlorobenzne
Anthracne
1,2,4-Trichlorobenzne
Benzo(a)anthracne
Bis(2-Chlorothoxy)mthane
Benzo(b)fluoranthne
Naphthalne
Benzo(k)fluoranthne
2-Chloronaphthalne
Benzo(a)pyrne
Isophorone
Indno(1,2,3-c,d)pyrne
Nitrobenzne
Dibenzo(a,h)anthracne
2,4-Dinitrotolune
Benzo(g,h,f)perylne
2,6-Dinitrotolune
4-Chlorophnyl ph nyl ther
4-Bromophnyl phnyl ther
3.3'-Dichlorobenzidine
bis(2-Ethylhexyl) phthalate
Benzidine
Di-n-octyl phthalate
bis(2-Chloroethyl)ther
Dimthyl phthalate
1,2-Diphnylhydrazine
Dithyl phthalate
Hexachlorocyclopentadiene
Di-n-butyl phthalate
N-Nitrosodiphnylamine
Acnaphthylne
N-Nitrosodimthylamine
Acnaphthne
N-Nitrosodi-n-propylamine
Butyl benzyl phthalate
bis(2-Chloro-isopropyl) ther
11 composs organiques extractibles en milieu acide
Phnol
p-Chloro-m-crsol
2-Nitrophnol
2-Chlorophnol
4-Nitrophnol
2,4-Dichlorophnol
2,4-Dinitrophnol
2,4,6-Trichlorophnol
4,6-Dinitro-o-crsol
2,4-Dimthylphnol
Pentachlorophnol
11
Tableau 2 (Suite). Liste des 129 polluants considrs comme les plus significatifs par
l'Environmental Protection Agency (d'aprs Keith & Telliard, 1979)
26 pesticides ou polychlorobiphnyls (PCB)
-Endosulfan
-Endosulfan
Endosulfan sulfate
-BHC
-BHC
-BHC
-BHC
Aldrine
Dieldrine
4,4'-DDE
4,4'-DDD
4,4'-DDT
Endrine
Endrine aldhyde
Heptachlor
Heptachlor poxide
Chlordane
Toxaphne
Aroclor 1016
Aroclor 1221
Aroclor 1232
Aroclor 1242
Aroclor 1248
Aroclor 1254
Aroclor 1260
2,3,7,8-Ttrachlorodibenzo-p-dioxine
(TCDD)
13 mtaux
Antimoine, Arsenic, Argent, Bryllium, Cadmium, Chrome, Cuivre, Mercure, Nickel, Plomb,
Slnium, Thallium et Zinc.
Divers
Tous les cyanures,
Tous les phnols
Amiante (fibreuse).
3.2 POLLUANTS RECALCITRANTS ET POLLUANTS BIODEGRADABLES

3.2.1 Biodgradabilit ou rcalcitrance
Un compos est qualifi de rcalcitrant (ou de persistant) quand son limination biologique est trs
lente ou mme impossible mesurer. On rencontre bien videmment des substances rcalcitrantes
parmi les xnobiotiques , en particulier parmi les polymres tels que le PVC et les tflons et les
composs organiques polychlors tels que les PCB, le DDT et le pentachlorophnol (PCP) (Tableau
3). Par contre, de nombeux xnobiotiques peuvent tre dgrads par des microorganismes; pour
certains cette dgradation peut mme tre trs rapide.
Il existe galement des substances naturelles rcalcitrantes dont les meilleurs exemples sont
la lignine du bois et surtout les constituants trs htrognes et mal dfinis de l'humus du sol, en
particulier les acides humiques et l'humine, qui ne se dcomposent que trs lentement (turn-over de
plusieurs sicles). Un xnobiotique n'est donc pas ncessairement rcalcitrant et rciproquement,
des composs naturels peuvent se montrer rcalcitrants.
Les composs xnobiotiques rcalcitrants sont indsirables dans l'environnement pour
plusieurs raisons:
- leur prsence permanente augmente les risques de toxicit pour les espces sensibles
- de nombreux composs rcalcitrants ne sont pas toxiques aux concentrations o ils sont
prsents dans le sol ou les eaux, mais les phnomnes de bioaccumulation dans les chaines
trophiques les rendent potentiellement dangereux.
- les composs rcalcitrants mobiles sont les plus dangereux. A long terme, on les retrouve dans
les aquifres utiliss pour la production d'eau potable et fort loin de leur zone d'origine dans
des endroit initialement non contamins (DDT en Arctique).
12
Tableau 3. Grands types de produits chimiques et leur possibilit de biodgradation

(d'aprs Baker et Anderson, 1994)
Type de produits
Exemples
Biodgradabilit
Hydrocarbures aromatiques
Benzne, tolune
Arobie et Anarobie
Ctones et esters
Actone, MEK
Arobie et Anarobie
Hydrocarbures du ptrole
Mazout
Arobie
Solvants chlors
TCE, PCE
Arobie (mthanotrophes)
Anarobie (dchorination rductive)
Hydrocarbures polyaromatiques Anthracne, crosote
Arobie
Polychlorobiphnils (PCB)
Arochlors
Peu biodgradables
Polymres de synthse
PVC
Souvent non biodgradable
Cyanures organiques
Arobie
Mtaux
Cadmium
Non biodgradable
Biosorption possible
Matires radioactives
Uranium, plutonium
Non biodgradable
Agents corrosifs
Acides inorganiques
Non biodgradable
Amiante
Non biodgradable
- les polymres persistants non biodgradables (Tableau 4) ne sont gnralement pas toxiques
mais leur accumulation pose des problmes de dcharges ou de nuisance dans
l'environnement. Des effets nfates sur la faune marine commencent se manifester
(ingestion de sacs plastiques et de polystyrne expans par les mammifres marins).
- enfin une cause d'inquitude majeure est le manque de connaissance des effets des substances
rcalcitrantes moyen et long terme sur l'environnement.
Tableau 4. Polymres rcalcitrants (d'aprs Alexander, 1973)

Actate de cellulose (entirement actyl); Actate-butyrate de cellulose
Actate de rayonne (Estron); Acrylonitrile-Chlorure de vinyle (Dynel)
Carboxymthylcellulose haut degr de substitution
Chlorure de poly-vinyle (PVC); Chlorure de poly-vinylidne
Chlorure et actate de poly-vinyle
Copolymre de chlorure de vinylidne et de chlorure de vinyle (Saran)
Phnol-formaldhyde (nylon; )Poly-acrylonitrile (Orlon)
Poly-styrne; Poly-dichlorostyrne
Poly-thylne haut PM; Poly-thylne-glycol
Poly-isobutylne haut PM
Poly-mthyl-mthacrylate.
Poly-monochlorotrifluorthylne
Poly-ttrafluorothylne (Tflon)
Poly-urthane (polyther polymris)
Poly-vinyl butyral
Rsines de silicone
Rsorcinol-formaldhyde
Trphthalate (Dacron)
Zein formaldhyde (Vicara)
13
Fig. 1. Effet de la structure chimique sur la rcalcitrance (d'aprs Hardman et al., 1993)
a) nature du groupe substitu: Propham et Propachlor
b) position du groupe substitu: 2,4-D et 2,4,5-T
O
HN-C-O-CH
CH 3
3 2 Cl
Propham
3 C3
biodgradable
Cbi
od
gra
dabl
O-CH 2 COOH
er
calc
Cl
itra
2,4-D
nt2
biodgradable
CO
OH 2
Cl
CO
OH
H3 C
CH
H C -N -C -C H 2 C l
H3 C
Propachlor
rcalcitrant
O-CH 2 COOH
Cl
Cl
2,4,5-T
rcalcitrant
Cl
Les composs rcalcitrants peuvent tre classs en trois groupes:

ceux qui sont rsistants toute attaque microbienne et ne sont mtaboliss sous aucune condition
connue;
ceux qui sont gnralement mtaboliss trs lentement dans la nature, mais qui peuvent tre
dgrads rapidement dans une culture dense de microorganismes appropris;
ceux qui in situ sont mtaboliss rapidement dans certains environnements et trs lentement dans
d'autres (exemple: arobiose, anarobiose).
Alexander (1994) considre que six conditions doivent tre runies pour qu'un substrat soit
biodgradable:
1. un enzyme capable d'effectuer la dgradation existe (la non-spcificit des enzymes est la cause
pricipale de biodgradation de xnobiotiques);
2. le microorganisme possdant cet enzyme doit tre prsent dans le mme environnement que le
substrat;
3 . la molcule dgrader doit tre sous une forme disponible pour son utilisation par le
microorganisme (les molcules adsorbes ne sont pas biodgrades);
4. si l'enzyme est intra-cellulaire, ce qui est le cas pour de nombreux substrats faible poids
molculaire, le substrat doit pntrer l'intrieur de la cellule. Exemple: les polythylnes haut
PM ne sont pas dgrads alors que ceux a faible PM le sont (le PM n'est pas le seul facteur, la
forme de la molcule ou la permabilit de la membrane sont aussi impliques);
5. dans le cas d'enzyme inductible, les conditions d'induction doivent tre runies (concentration
suffisante de substrat ou prsence d'un autre substrat permettant le comtabolisme. En particulier
un substrat dgrad rapidement au laboratoire par comtabolisme ne sera pas dgrad in situ par
manque d'un autre substrat; et
14
6. les conditions de milieu doivent tre favorables la croissance du microorganisme (cas classique
de l'arobiose vs anarobiose).
La rcalcitrance d'un compos peut donc rsulter des caractristiques stucturelles de la
molcule concerne (Fig 1), de limites physiologiques des organismes vivants et des proprits de
l'environnement ou ce compos est introduit. Les tudes de rcalcitrance doivent donc prendre en
compte les facteurs, chimiques, microbiologiques et environnementaux.
3.2.2 Demi-vie et persistence
La demi-vie d'un compos dans un environnement donn est le temps ncessaire pour voir
sa concentration diminuer de moiti.
Le tableau 5 prsente des estimations de demi-vies de composs organiques dans des
aquifres non fortement pollus (d'aprs Van Beelen, 1990):
Un certain nombre de valeurs faibles, proches de la journe, sont observes pour des
composs naturels comme le glucose (0,6 j), mais galement pour quelque rares
composs de synthse (acide nitriloactique: 0,05-0,7j), halogns (p-chlorophnol: 1,5;
di-bromo-thane: 0,6j ) et aromatiques (p-crsol: 0,5j; tolune:1,6j).
Une cinquantaine de valeurs sont comprises entre 10 jours et un an.
Les valeurs exprimes en annes ne sont pas l'exception (13 valeurs).
La grande variabilit des valeurs estimes pour un mme compos indique clairement
l'importance des facteurs environnementaux dans la biodgradation des composs
organiques. Par exemple des valeurs allant de 1,6 540 jours sont rapportes pour le
tolune et des valeurs allant de 80 jours 8 ans sont rapportes pour le chlorobenzne.
Les demi-vies dans les sols ou l'activit biologique est intense est gnralement nettement
plus courte que dans les aquifres. Le tableau 6 prsente les demi-vies de pesticides
appliqus dans des sols de rizire submergs. Les valeurs s'chelonnent entre 1 et 104 j.
La persistence d'un compos est gnralement estime par le temps ncessaire pour que la
concentration initiale diminue de 90%. Cette valeur est grossirement gale 3,5 fois la demi-vie.
Toutefois certains auteurs dfinissent la persistance comme tant le temps pendant lequel un
compos reste dtectable dans l'environnement. Il est bien vident que cette dfinition est fortement
imprcise dans la mesure o elle dpend directement de la sensibilit des mthodes de dtection du
compos tudi.
Le Tableau 7 prsente des valeurs de persistence de pesticides dans des sols agricoles
exonds, estimes comme tant le temps aprs lequel un compos est encore prsent dans le milieu.
Les valeurs s'chelonnent entre 3 et 21 ans.
Il est intressant de comparer les valeurs de persistence du tableau 7 avec les valeurs de
demi-vie du tableau 6 en gardant prsent l'esprit que la persitence devrait tre gale environ 3,5
fois la demi-vie et que la dgradation des pesticides est souvent plus rapide en sol submerg
(anarobie) qu'en sol exond (arobie) (voir Fig. 17) .
15
Tableau 5. Biodgradation de composs organiques dans des aquifres

non fortement pollus (d'aprs Van Beelen, 1990)
Compos
Composs naturels
Glucose
Environnement
Demi-vie
en jours
Limon et sable, Ontario

0,6-1,1
Sable, Caroline du Sud
1
Sable, Holland
1
Sable, Oklahoma
9 ans
Glucosamine-HCl
Sable, Oklahoma
5 ans
Glutamate
Nappe phratique, Ohio
0,46-0,75
0,30-0,75
Actate
0,36
Sable, Oklahoma
10
Sable, Pays-Bas
1-7
Mthanol
Argile et limon, Virginie
58-260
Acide starique
3,4-13
Acides amins
Argile, Oklahoma
0,3-3
Sable, Oklahoma
2,5
Acide cinnaminique Sable, Oklahoma
220
Cellulose
Sable, Oklahoma
160
Composs synthtiques
Mthyl parathion
Limon et sable
>17
Acide nitriloactique Limon et sable
3,6-6,7
Sable
0.05-0.7
1,3
Mthyl-thylctone
Nappe phratique, Floride
2
Alcool tert. butylique Argile et limon, Virginie 1,5 -98 annes
Composs halogns
Bromodichloromthane Argile sableuse, Oklahoma >240
Bromoforme
Sable, Canada
23
1,2-dibromothane
Sable, Oklahoma
0,69
Sable, Oklahoma
0,6
Ttrachloromthane Sable, Ontario
>5400
Hexachlorothane
Sable, Ontario
40
Sable, Ontario
25
1,2-dichlorothane
Argile sableuse, Oklahoma >77
1,1,2-trichlorothane Argile sableuse, Oklahoma >77
1,1,1-trichlorothane Argile sableuse, Oklahoma > 490
Ttrachlorothylne Sable, Ontario
>5400
Argile sableuse, Oklahoma 540-2400
Trichlorothylne
Argile sableuse, Oklahoma >77
Chlorobenzne
Argile sableuse, Oklahoma > 540
Gravier, Oklahoma
81-240
Sable, Oklahoma
8 annes
Sable, Oklahoma
>490
1,2-dichlorobenzne Sable, Ontario
85
Sable, Suisse
0,7-1,4
Trichlorobenzne
Sable, Oklahoma
>490
Sable, Oklahoma
160
p-chlorophnol
Sable, Oklahoma
1,5
Sable, Oklahoma
15
Acide 2,4-dichloro
phnoxyactique
>250
Rfrences
Ward, 1985
Phelps et al., 1989a
Van Beelen et al., 1989b
Swindoll et al., 1988a
Ventullo & Larson, 1985
Ward et al., 1985
Ward et al., 1985
Van Beelen et al. 1989b
Hickman & Novak, 1989
Ward, 1985
Dobbins & Pfaender, 1988
Swindoll et al. 1988a
Ward, 1985
Ward, 1985
Kuhn et al., 1987
Ventulo & Larson 1985
Delfino & Miles, 1985
Hiekman & Novak, 1989
Wilson et al., 1983b
Roberts et al., 1982
Aelion et al, 1987
Roberts et al, 1986
Criddle et al., 1986
Roberts et al., 1986
Wilson et al. 1983a
Wilson et al. 1983a
Wilson et al. 1983b
Roberts et al. 1986
Wilson et al.,1983b
Wilson et al. 1983a
Wilson et al. 1983b
Wilson et al. 1986
Swindoll et al. 1988a`
Aelion et al, 1987
Roberts et al, 1986
Kuhn et al., 1985
Aelion et al., 1987
Aelion et al., 1987
Swindoll et al . 1 988a
Ventulo et al., 1985
16
Tableau 5 (Suite). Biodgradation de composs organiques dans des aquifres non fortement
pollus (d'aprs Van Beelen, 1990)
Composs aromatiques
Aniline
Sable, Oklahoma
3,7-12
Sable, Oklahoma
470
m-Aminophnol
Sable, Oklahoma
9,7-16
Acide benzoque
Limon et sable
0,30
1,7
m-Crsol
Argile, Oklahoma
290-2900
Sable, Oklahoma
56
Sable, Oklahoma
9,9
p-Crsol
0,5
p-Nitrophnol
Sable, Oklahoma
>970
Sable, Oklahoma
0,26
Phnol
Sable, Oklahoma
0,3
Limon argileux, Virginie
80-400
Acnaphthne C 12H10 Sable, Texas
>160
Benzne
Sable, Texas
>160
Sable, Ontario
35
Fleuve Oklahoma
24
3
Dibenzofuran
Sable, Texas
>49
Ethylbenzne
Fleuve Oklahoma
24
Fluorne
Sable, Texas
>50
2-Mthylnaphtalne Sable, Texas
>60
Naphtalne
Sable, Texas
>490
Sable, Oklahoma
3000
1
Nappe phratique, Texas
8
Styrne
Sable, Oklahoma
120-240
Argile, Louisiana
50
Tolune
Sable, Oklahoma
9-540
Sable, Oklahoma
120
Gravier, Oklahoma
>490
Sable, Oklahoma
1,6
Sable abiotic, Texas
120
Fleuve Oklahoma
24
o-Xylne
Sable, Texas
>160
Sable, Oklahoma
24
m-Xylne
Sable, Texas
>97
Fleuve Oklahoma
24
p-Xylne
Sable du fleuve Oklahoma
24
3-Mthylpyridine
Nappe phratique, Colorado 14
2,5-Dimthylpyridine
31
2,4,6-Trimthylpyridine
environ 60
Butylpyridines
environ 60
Pentylpyridines
18-31
Hexylpyridine
18
Aelion et al., 1987

Aelion et al., 1987
Ward, 1985
Ventullo et al., 1985
Dobbins & Pfaender, 1988
Aelion et al., 1987
Delfino et al., 1985
Aelion et al., 1987
Aelion et al., 1987
Hickman & Novak, 1989
Wilson et al., 1985
Wilson et al., 1986
Major et al., 1988
Mahadevaiah & Miller, 1986
Wilson et al., 1985
Wilson et al., 1985
Thomas et al., 1987
Wilson et al 1985
Wilson et al., 1983a,b
Wilson et al., 1983a,b
Wilson et al., 1986
Wilson et al., 1986
Wilson et al., 1986
Wilson et al., 1986
Rogers et al., 1985
17
Tableau 6. Demi-vie (jours) de pesticides appliqus dans des rizires inondes

(d'aprs Roger et Bhuyian, 1995).
Pesticide
2-4-5-T
2-4-D
BHC
Amiprophos
Basagran
Benefin
Bentazon
Benthiocarb
BHC
BHC
Buprofezin
Butachlor
Carbaryl
Carbofuran
Chlomthoxynil
Chlordane
CNP
DCNA
DDT
BHC
Diazinon
Disulfoton
Endrin
BHC
Heptachlor
Hinosan
Isoxathion
Kitazin
Mtoxychlor
Mtoxychlor
Molinate
Nitrofen
Ordram
Parathion
PCNB
PCP
Phorate
Picloram
Propanil
Pyrazoxyfen
Sevin
Swep
Trifluralin
1/2 vie
(jours)
17-45
28-36
22-42
10
3
4
3
>80
22-65
20
104
1 -12
14-49
19-70
15
>90
15
5 30
>45
32-50
13-15
25
7 - 55
12 -40
75-90
4
<20
14
>90
90
2 - 96
11
6
4 - 23
20
30
20
60
1
4 - 34
13
2
10
Rfrences
Yoshida 1975
Yoshida 1975
Mac Rae et al. 1967, Fereira and Raghu 1981
Tomizawa 1975
Higashi and Crosby 1987
Probst and Tepe 1969
Nakamura et al 1977
Yoshida and Castro 1970
Funayama et al. 1986
Chen 1980
Gill and Yeo 1980, Sethunathan 1984
Siddaramappa et al. 1979, Venkateswarlu et al. 1977
Matsunaka and Kuwatsuka 1975
Castro & Yoshida 1971
Wang and Broadbent 1973
Sethunathan & MacRae 1969, Sethunathan and Siddaramappa 1978
Agnihotri 1978
Gowda & Sethunathan 1976
Mac Rae et al. 1967, Raghu & MacRae 1966, Fereira & Raghu 1981
Rajaram and Sethunathan 1976
Nakagawa et al. 1975
Tomizawa et al. 1976
Deul et al. 1978, Higashi and Crosby 1987
Reddy and Sethunathan 1983, Sethunathan 1973 b, Sethunathan and
Yoshida 1973c
Wang and Broadbent 1973
Agnihotri 1978
Yoshida 1975
Arita and Kuwatsuka 1991
Sethunathan and Siddaramappa 1978
Probst et al. 1967
18
Tableau 7. Persistence de diffrents composs, principalement des pesticides,
dans le sol (d'aprs Alexander, 1994)
Pesticide
Acide 2,3,6-trichlorobenzoque
Azinphosmthyle
BHC
Chlordane
Chlorfenvinphos
DDT
Dibenzo-p-dioxine polychlorine
Dibenzofuranes polychlorins
Dicamba
Dieldrine
EDB
Endrine
Heptachlore
Isodrine
Lindane
Mirex
Monuron
Paraquat
Picloram
Simazine
Tordon
Toxaphne
Trifluraline
Persistence
(Annes)*
4
8
16
16
4
21
8
8
4
21
19
16
16
16
21
12
3
6
5
20
5
16
3
Rfrence
Burnside et al. (1965)
Staiff et al. (1975)
Nash and Harris (1973)
Chisholm (1975)
Martin et al. (1993)
Hagenmaier et al. (1992)
Hagenmaier et al. (1992)
Steinberg et al. (1987)
Carlson et al. (1976)
Birk (1955)
Fryer et al. (1975)
Scribner et al. (1992)
Golab et al. (1979)
* Compos encore prsent dans le sol aprs le nombre d'annes indiqu.

3.3 DOSES ADMISSIBLES ET NORMES
Le dcret du 3 Janvier 1989 dfinit le taux maximum admissible de divers polluants dans les eaux
de consommation. La plupart des pesticides ne doivent pas dpasser 0,1 g par litre, la tolrance
tant abaisse 0,03 g pour l'aldrine et la dieldrine et 0,01 g pour l'hexachlorobenzne. Par
comparaison la plupart des hydrocarbures polycycliques sont tolrs jusqu' 0,2 g par litre.
Ces valeurs ont t choisies avec l'objectif d'assurer la protection de la sant publique avec
une marge de scurit juge suffisante en fonction des connaissances actuelles.
La pollution de l'air en France est rgie depuis 1993 par un texte de loi qui concerne la
quasi- totalit des secteurs industriels et fixe les limites suprieures des concentration en polluants
(CO2, NOx, HCl, C.O.V. .... ) contenus dans les effluents gazeux en fonction des flux rejets dans
l'atmosphre. Deux seuils ont t fixs: 100 mg/m3 quand le flux est infrieur 1kg/h et 50 mg/m3
quant il est suprieur. Les nouvelles installations disposent d'un dlai d'un an pour tre conformes
la loi, les installations existantes bnficient d'un dlai de cinq ans.
Le tableau 8 donne un exemple des doses admissibles (mg/m3 d'air) d'organochlors dans les
locaux industriels. Il fournit des informations sur l'utilisation et la toxicit de ces polluants ainsi que
leur biodgradabilit par des bactries mthanotrophes (comtabolisme en arobiose) et
mthanognes (biodpollution anarobie) .
Le tableau 8bis donne des exemples des valeurs limites de pollution au del desquelles une
dcontamination du sol doit tre ralise. Les valeurs varient significativement dun pays lautre
!
19
Tableau 8. Polluants organochlors: usages, toxicit pour l'homme et doses admissibles dans
l'air des locaux industriels
Formule
Principaux
usages
Toxicit pour
l'homme
CH4
Carburant
chloromthane*
CH3Cl
1,1-dichloromthane*
CH2Cl2
trichloromthane *
CHCl3
1,1-dichlorothane*
CH2Cl-CH2Cl
Silicones,
arosols,
rfrigrants
Dcapant,
dgraissant,
solvant
Solvant,
matires
plastiques
Dcapant
1,2-dichlorothane*
CH2Cl-CH2Cl
mthane*
1,1,1-trichlorothane*
1,1,2,2-ttrachlorothane*
CH3-CCl3
CHCl2-CHCl2
chlorure de vinyle *
(= chlorothylne)
1,1- dichlorothylne*
CH2=CHCl
1,2-dichloro-thylne*
CCl 2=CH2
trichlorothylne (PCE)*
CHCl=CCl2
ttrachlorothylne *
(= per-,PCE)
trans-1,3-dichloropropylne *
CCl 2=CCl2
ttrachloromthane
trichlorobenznes (3 isomres)
CCl 2=CH2
ClCH2CH=CHCl
CCl 4
C6H3Cl3
hexachlorobenzne (HCB)
C6Cl6
trichlorophnol (2,4,6 TCP)
C6H2Cl3OH
pentachlorophnol (PCP)
C6Cl5OH
* = dgrad par des bactries mthanotrophes;

= utiliss par des bactries mthanognes
Limites
par m3
d'air
Vapeurs
toxiques
210 mg
Vapeurs
toxiques
1.800 mg
Vapeurs
toxiques
250 mg
Synthses
(PCV)
Dgraissant,
dissolvant,
colles
Fabrication du
TCE
Polymrisant
des PCV
Solvant,
rfrigrant
Solvant
Vapeurs
toxiques
Mutagne,
cancrigne
dgraissant,
solvant
Diluant ,
dtachant
Sous-produit
de synthses
Synthses,
polymrisant
Insecticide,
colorants,
rfrigrant
?
Vapeurs
toxiques
Mutagne,
cancrigne
?
1080 mg
Mutagne,
cancrigne
peu
pathogne
60 mg
Bactricide,
antifongique
Bactricide,
antifongique,
herbicide
Vapeurs
toxiques
Hautement
cancrigne
?
?
40 mg
250 mg
35 mg
3 ppm
?
?
335 mg
?
40 mg
effet indirect
non
dtermin
0,5 mg
vapeurs
toxiques
20
Tableau 8bis: Valeurs limites de pollution des sols au del desquelles une dcontamination
doit tre ralise
(Source BRGM, cit dans lEnvironnement Janv. 1997 p32)
Polluant (ppm)
Arsenic
Benzne
Brome
CCl4
Chlorobenznes
Cuivre
Cyanure total
Etain
HAP
Hydrocarbures
Mercure
Nickel
Organochlors
PCB
Pesticides
Phnol
Plomb
Tolune
Xylne
USA
0,37
2,5
nc
1,5
170
nc
nc
nc
nc
nc
23
1600
nc
nc
1,9
nc
nc
150
97
BadeWurtemberg
Hambourg
Land de
130
0,1
nc
0,001
nc
nc
150
nc
nc
nc
40
300
0,2
3
nc
nc
4000
nc
nc
100
nc
nc
nc
nc
3000
nc
nc
nc
nc
200
4000
nc
nc
nc
nc
3000
nc
nc
Pays Bas
Finlande
Canada
55
1
300
1
30
190
20
300
40
5000
10
210
9
1
4
40
530
130
25
50
5
300
50
20
500
500
300
200
5000
10
500
70
10
20
10
600
nc
nc
50
5
nc
nc
10
680
500
300
nc
800
10
500
50
50
nc
10
1000
nc
nc
21
Le tableau 9 prsente l'tat de la lgislation de la CEE, en 1990, concernant les informations
fournir sur les catactristiques et les effets environnementaux possibles d'un produit chimique, en
fonction de la quantit de produit commercialis. (On peut s'interroger sur la reprsentativit des
mesures demandes !!!).
Tableau 9. Lgislation de la CEE, en 1990, concernant les informations fournir sur les
catactristiques et les effets environnementaux possibles d'un produit chimique, en fonction
de la quantit de produit commercialis
(d'aprs Moriarty, 1990; cit par Hardman et al., 1993)
Quantit commercialise (tonnes)
Par an
<1
1 ou plus
10 ou plus
Totale
moins de 50
50 ou plus
100 ou plus
1000 ou plus
500 ou plus
5000 ou plus
Informations requises
Simple dclaration
Information minimale
Information minimale ou
niveau 1
Niveau 1
Niveau II
Information minimale
(1) Description du compos, formule et structure, spectre(s).
(Les impurets contenues dans le produit
ralement
sont pas
gn dcrites, ni
aux niveaux suivants).
(2) Informations sur l'utilisation, les quantits utiliser et les prcautions respecter lors de
l'utilisation .
(3) Proprits physico-chimiques , incluant le coefficient de rpartition entre le n-octanol et
l'eau.
(4) Toxicologie (toxicit pour l'homme).
(5) Ecotoxicologie.
(a) LC50 pour une espce de poisson.
(b) LC5o pour une espce de Daphnia.
(c) Taux de dgradation biotique et abiotique*.
ni ce
*Les taux de dgradation biotique et abiotique sont mesurs en arobiose dans des conditions
standard. Lorsqu'ils sont plus adapts, des tests anarobies peuvent tre demands par certains pays.
Niveau 1
Information minimale ci-dessus, plus:
1. Un test de toxicit d'au moins 14 jours pour une espce de poisson .
2. Un test de toxicit d'au moins 14 jours pour une espce de Daphnia.
3. Une tude prolonge de biodgration.
4. Un test d'inhibition de croissance. Gnralement tude de l'effet sur la division cellulaire d'une
micro-algue.
5. Un test de bioaccumulation. Habituellement avec une espce de poisson .
6. Un test de toxicit pour une espce de ver de terre.
7. Un test de toxicit pour une plante suprieure. Lemna, la lentille d'eau, est gnralement
utilise, ce qui satisfait les dispositions lgales, mais ne peut srieusement tre considr comme
reprsentatif.
niveau
22
4. LES PRINCIPAUX TYPES DE POLLUTION

4.1 DEVENIR DES POLLUANTS DANS L'ENVIRONNEMENT
Les polluants entrant dans l'environnement sont soumis des processus de dgradation qui diffrent
suivant les compartiments de l'cosytme et sont transports entre ces compartiments (Fig 2 ).
Fig.2. Schma des transferts et transformations des composs chimiques dans
l'environnement (d'aprs Yoshida et al., 1983, et Hardman et al., 1991)
Matire
premire
Xnobiotiques et polluants
Utilisation
et rejet
Production
Environnement
Air
Eau
H
Biodgradation
Photolyse
Hydrolyse
Accumulation
Oxydation
Photolyse
BCF
Biota
Mtabolisme
tra nsforma tion
d gra da tion
min ra lisa tion
Ka
Rcalcitrants
Sdiments
Biodgradation
Dgradation chimique
Adsorptiondsorption
Accumulation
Bioaccumulation
Dgradation
chimique
Adsorptiondsorption
H =AccumulationSol
constante de Henry
Ka =
coefficient dadsorption par le sol
PhotolysePhotol
BCFyse
= facteur de bioconcentration
Hydrolyse
Fig.3 . Devenir des hydrocarbures dans l'environnement.
23
(d'aprs Morgan et Watkinson, 1989)
Volatilisation
INT ERMDIA
IRES 2 morte 2
O2
Photo-oxydation
HYDROCARBURES
Adsorption
SOL
Percolation
MICROORGANISMES
Adsorption
pH
Nutriments
Humus
H2
T emprature
O2
COMPOSES
INT ERMEDIAIRES
NAPPE PHREAT IQUE
Biomasse
morte
CO 2
T ransfert horizontal
Les composs amens au contact des biota, et en particulier de la microflore, peuvent tre
transforms, dgrads, minraliss ou bioaccumuls (voir section 62).
Les composs dans l'air sont soumis l'oxydation et la photolyse.
Les composs dans la phase aqueuse sont soumis des dcompositions chimiques par oxydation,
hydrolyse et, dans la zone photique, par photolyse.
Les composs dans le sol ou le sous-sol peuvent aussi tre dgrads par des processus abiotiques.
En fonction des proprits physico-chimiques des composs, les changes entre les diffrents
compartiments des cosystmes sont plus ou moins rapides et se font par:
dissolution (air -> eau et sol -> eau);
24
volatilisation (sol -> air et eau -> air); et
ingestion (air, sol, eau -> biota).
Dans les phases solides (sol et sous-sol) des immobilisations permanentes ou temporaires
peuvent se produire par adsorption ou adsorption/ dsorption en particulier dans les sols sur les
argiles et la matire organique humifie. Ceci est en particulier observ pour les pesticides qui
peuvent se retrouver dans le sol plusieurs annes aprs que leur utilisation ait t interrompue.
Les composs rcalcitrants s'accumulent dans l'eau, le sol, et dans les biota ou cette
accumulation peut conduire une bioconcentration par l'intermdiaire des chanes trophiques.
Les transports sur de grandes distances des polluants se font travers l'atmosphre, les eaux
de ruissellement, les eaux souterraines et les nappes phratiques, les cours d'eau et les chaines
alimentaires. En particulier le transport dans latmosphre est lune des principales voies
dintroduction des pesticides dans lenvironnement conduisant des tranferts sur des distances
considrables et des concentrations dans les eaux de pluie qui peuvent dpasser les normes
europennes de tolrance dans leau potable (cf. Les pesticides voyagent dans les nuages.
LEnvironnement Mars 1997, pp. 45-46).
Les figures 3 et 4 prsentent des schmas du devenir d'une pollution ponctuelle
d'hydrocarbures dans l'environnement.
Fig. 4. Reprsentation schmatique du devenir d'une pollution ptrolire la surface du
sol.(d'aprs Morgan et Watkinson, 1989)
25
Tableau 10. Exemples de pollutions ponctuelles dans des aquifres sableux-graveleux des
Etats Unis d'Amrique (d'aprs Mac Kay et Chery, 1989)
Localisation et forme
de la zone contamine
Ocean City (NJ)
Origine
de la
pollution
Volume
de la zone
contamine
(x 1000 m3)
Estimation
de la quantit
de contaminant
(litre)
d e TCE
TCA
TER
5.700
15.000
Usine
d e TCE
fabrication de TCA
composants
lectroniques
6.000
9.800
Infiltration de TCE
bassins
d e PER
dcantation
Dtergents
40.000
1.500
dtergents
exclus
Traverse City (Mi)
Stockage
carburants
d'aviation
400
1.000
Gloucester (ON) Can.
Dcharge
publique
spcialise
1,4-dioxane
Fron 113
DEE, THF
102
190
Usine
de
fabrication de
composants
electroniques
Aroport
d'entrainement
TCA
Fron 113
1,1-DCE
5.000
130
TCE
TCA
DBCP
4.500
80
Mountain View (CA)
Cape Cod (MA)
San Jose (CA)
Denver (CO)
Usine
produits
chimiques
Contaminant
principal
d e Tolune
Xylne
Benzne
TCE: trichlorthylne; TCA: 1,1,1-Trichlorothane; PER: Per-ttrachlorothylne; 1,1-DCE: 1,1dichlorothylne; DEE: Dithylther; THF: Ttrahydrofuran; DBCP: dibromo-chloro-propane.
4.2 POLLUTIONS PONCTUELLES
Les pollutions ponctuelles sont gnralement lies une activit industrielle localise ou un
accident.
Si l'agent polluant est libr en surface et facilement dispersable sous forme de particules, on
peut observer des zonations concentriques autour du centre de la zone de pollution, traduisant des
niveaux de pollution dcroissants.
Un exemple classique est celui des usines de traitement de minerai et les fonderies. Mme
les installations les plus modernes, qui utilisent des filtres lectrostatiques capables de prcipiter
98% des particules contenant des mtaux, mettent des quantits importantes de mtal dans
l'atmosphre. Une fonderie produisant 100 000 tonnes de Zn, 40 000 t de Pb et 300 t de Cd par an
dans le sud-ouest de l'Angleterre, met environ 6kg de Zn, 4 kg de Pb et 0,4 kg de Cd par heure
dans l'atmosphre. Les particles de plus de 10m sont dposes dans un rayon de 1km autour de
l'usine, alors que les particules plus petites sont transportes des distances considrables. Des
contaminations sont videntes dans la vgtation et les sols dans un rayon de 25 km autour de la
fonderie. Elles affectent la croissance des plantes, la production primaire, la microflore, la
biodiversit et les cycles de transformation de la matire organique.
26
Les pollutions par des produits liquides ou en solution donnent naissance des zones
pollues profondes dont la taille et la forme dpendent des proprits gologiques du sous-sol et des
proprits de la nappe phratique.
Le tableau 10 prsente des exemples de pollutions de ce type aux Etats Unis, dans des sables
et graviers aquifres, c'est dire dans des environnements relativement favorables la dispersion
des polluants. Les zones contamines peuvent s'tendre sur plusieurs kilomtres et concerner des
volumes de plusieurs millions de m 3 avec des quantits de contaminants qui vont de la centaine aux
milliers de litres.
4.3 POLLUTIONS DIFFUSES
Les pollutions diffuses concernent gnralement des cosystmes de grande tendue et rsultent soit
des effets long terme de pollutions massives, soit de pollutions rptitives sur le long terme.
Un exemples classique est celui du bassin rhnan. Les bombardements des usines
allemandes (chimiques ou productrices de carburants de substitution) pendant la seconde guerre
mondiale a eu pour premire consquence visible une pollution massive des cours d'eau, puis du
Rhin et de ses principaux affluents.
La "premire vague de polluants" a t limine progressivement par le Rhin jusqu' la mer
du Nord. Mais une part importante s'est infiltre par percolation travers les sols et le sous-sol,
conduisant la pollution des aquifres profonds. Cette pollution "secondaire", qui se caractrise par
sa complexit (elle comporte de nombreux composs, de familles chimiques diffrentes) ne s'est
rellement fait connatre que prs de cinquante ans plus tard, quand ces nappes ont du tre pompes
pour produire de l'eau potable, ou quand cette eau a rapparu en surface par les sources.
Lamlioration des techniques de dosages ont volu et montr que ces "traces" sont
suprieures aux doses admissibles. Ces polluants, comportant dj un certain nombre de
xnobiotiques (benznes et drivs: tolune, o-et p-crsol et des composs phnols) pigs une
certaine profondeur, dans des nappes froides et trs peu oxygnes, n'avaient t que peu dgrads
par l'auto-puration naturelle (qui pour ces produits, se fait essentiellement en arobiose), et
contribuent pour une bonne part la pollution actuelle du Rhin, se faisant sentir en aval jusqu'aux
Pays Bas (Tableau 11).
Parmi les 30 micropolluants rencontrs des concentrations suprieures 0.5ppm dans les
nappes phratiques utilises aux Pays Bas pour la production d'eau potable, 27 sont rencontrs dans
moins de 5% des nappes, par contre le trichloromthane (chloroforme) se rencontre dans 7,6% des
nappes, le dimethylbenzne dans 10,2 % et le trichlorothylne (TCE) dans 13,2 %.
Une pollution similaire est connue actuellement en ex-RDA, o, aux causes prcdentes,
s'ajoute 50 ans de fonctionnement d'usines chimiques ayant rejet tous leurs effluents sans aucun
contrle. Cette pollution massive de nappes de valles est galement signale en Pologne et en
Roumanie ( zone dite le Triangle noir).
27
Tableau 11. Micropolluants organiques dans les nappes phratiques utilises pour la
production d'eau potable aux Pays-Bas
(d'aprs Veenendaal et al., 1986; cit par Van Beelen 1990)
Compos
% des nappes avec une
concentration > 0,5g l-1
Trichloromthane (chloroforme)
7,6
Ttrachloromthane
0,3
Bromodichloromthane
0,3
Chlorobromomthane
0,3
Tribromomthane
0,3
1,1,2-trichlorothane
0,3
0,7
1,2-dichlorothane
5,3
1,2-dichloropropane
2,3
Ttrachlorothane (Perchlorthylne)
1,3
Trichlorothylne (TCE)
13,2
Dichlorothylne
5,3
Dichlorobenzne
2,6
Bis(chloro(iso)propyl)ether
4,9
Benzne
3,0
Tolune
4,6
Ethylbenzne
1,0
Dimethylbenzne
10,2
Mthyldioxalane
2,0
Mthylthyldioxalane
1,0
Di-isopropylther
1,3
Aldhyde C8-C10
0,3
Terpne C10 H16
1,0
Ttrahydrothiophne
0,3
Dimthylsulphide
0,3
N-undcane
0,3
Pentylbenzne
0,3
Mthylpentanone
0,3
Dipropoxythane
0,3
Tetrahydropyrane
0,3
C10H20, isomres
0,3
Paraldhyde
0,3
4.4 LES SITES POLLUES
La terminologie du Ministre de l'Environnement franais distingue trois grandes familles de sites
pollus:
Les anciennes dcharges ralises sans respecter les rgles techniques actuelles et
notamment les dcharges situes sur des sous-sols fragiles et pour lesquelles une
pollution des eaux souterraines a t constate.
Les dpts de produits chimiques abandonns la suite de faillite d'entreprise ou rsultant
de pratiques frauduleuses d'importation ou d'limination de dchets.
Les sols pollus par des retombes, des infiltrations ou des dversements de substances
polluantes lies l'exploitation passe ou prsente d'une installation industrielle ou un
accident de transport.
L'inventaire des sites pollus est un problme ayant de fortes implications politiques et
conomiques. Les disparits entre les valeurs avances dans les rapports officiels et les articles de
la presse spcialise rsulte en partie du fait que l'on fait indifframment rfrence des sites pour
lesquels la contamination a t dmontre et des sites "potentiellement contamins" inventoris
par des enqutes administratives sans mesures de confirmation. Les enqutes administratives pour
28
inventaire de sites potentiellement pollus utilisent les archives dpartementales et tous les les
inventaires disponibles tels que les demandes dindemnistion de dommages de guerre faisant
rfrence des destructions dusines.
Des kits de tests rapides de pollution des sols ont t mis sur le march. Ils sont fournis avec
des kits rapides dextraction et sont utilisables, entre autres, pour des explosifs (TNT ou RDX), des
hydrocarbures (BTX), les PCB (isolants de transformateurs), des HAP (hydrocarbures aromatiques
polycycliques) (cf. Dcision Environnement Oct. 96 p. 107).
En 1997, la DRIRE avait inventori 896 sites pollus en France dont 150 dans le Nord Pas
de Calais. En 1998, le pr-inventaire de la Gironde remis la DRIRE Aquitaine ferait tat de 4500
sites potentiellement pollus dans cette rgion. Un chiffre comparer aux 48 sites officiellement
rpertoris par le ministre de l'Environnement pour cette mme rgion dans son recensement 1996.
(Source L'Environnement Janv/Fev. 1998 p 9).
Parmis les sites pollus clairement identifis, 467 sites pollus par les anciennes usines
gaz ont t identifis en 1996. (Source: Dcision Environnement Oct. 1997 p16 ). Les dcharges
constituent galement des sites pollus. Leur nombre ne diminuera sans doute que trs lentement
dans la mesure ou la mise en dcharge reste actuellement le principal mode de traitement des
dchts mnagers et industriels (Tableau 11bis)
Tableau 11 bis. Mode de traitement des dchets mnagers et industriels banals en France en
1995-96*
(Source: Atlas des dchets en France, ADEME, Juin 1998, 24p.)
Mode de traitement
1995
kt
Mthanisation
Tri
Compostage
Incinration sans rcupration d'nergie
Incinration avec rcupration d'nergie
Dcharge
Total
72
1461
1994
2860
8464
20575
35425
%
0,2
4,1
5,6
8,1
23,9
58,1
100
1996
kt
76
2154
2288
2631
8198
21857
37204
%
0,2
5,8
6,1
7,1
22
58,7
100
* Pendant la mme priode la masse des dchets industriels spciaux (DIS) stocks en dcharge de classe 1
taient de l'ordre de 700 kt et celle de ceux traits dans des centres collectifs tait de 1600 kt dont 80%
traits par incinration.
Depuis 1980 les USA ont rpertori 35000 sites pollus dont 1200 figurent aujourd'hui sur la liste
nationale des priorits.
Le service Central hollandais de traitement des sols value 110 000 le nombre de sites
potentiellement contamins aux Pays Bas.
En Allemagne on dnombre 70 000 points noirs dont 4500 sur le territoire de Berlin. (Source
L'Environnement Avril 1995 p34)
En raison du cot lev de la dpollution, il apparait de plus en plus que lidentification des sites
pollus doit faire intervenir une hirarchisation des sites traiter en priorit.
A lheure actuelle linventaire des sites pollus et de la pollution des nappes phrariques (Figen
France est loin dtre achev. Par contre des ventes de terrains construire ont t annules pour
cause de pollution trop importante. Et pourtant il nexiste pas encore de normes europennes
concernant le niveau de dpollution des sites en fonction de leur utilisation ! Actuellement la France
sest aligne sur les normes nerlandaises (Tableau ***).
29
Fig. 4bis. Pollution des nappes phratiques en France (Dcision Environnement Nov 98 p 18)
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
X
Les cercles indiquent la dure de non conformit des eaux au cours de lanne:
cercle plein noir: 100% des sites non conformes pendant plus dun mois par an
Couleur des dpartements: prsence de pesticides dans: > 60% / 30 50% /15 30% / 0 15 % des
chantillons
Zones marques x: donnes non communiques)
30
5. CONSEQUENCES ET MODE D'ACTION DE LA POLLUTION

5.1 EFFETS DIRECTS: CONTACT, INGESTION, INHALATION
Les xnobiotiques sont souvent trs toxiques pour les mammifres en gnral, et l'homme en
particulier. Trois types d'effets immdiats lis sont rpertoris:
1. au contact avec la peau, et surtout les muqueuses (brulure chimique, effet corrosif; intoxication
par passage dans les tissus); ceci s'ajoutent, terme, des effets carcinognes;
2. l'ingestion directe: des intoxications trs svres peuvent survenir; les toxicits d'ingestion
accidentelle sont frquentes avec les pesticides et les composs benzniques ou phnols.
3. enfin, et sutout, par inhalation: cette forme d'intoxication par vapeurs toxiques est souvent
mortelle quand sont respirs des composs soufrs (hydrogne sulfur et mercaptans), certains
composs organochlors volatils, surtout les solvants (Tableau 8). Ces produits sont neurotoxiques ou ont pour effet un blocage respitoire. Enfin, un nombre limit de ces composs,
ingrs des doses trs faibles, mais cumulatives, sont hautement mutagnes et, de ce fait, sont
cancrignes (le chlorure de vinyle en est un exemple-type, comme quelques alcnes ou alcanes
organochlors).
A ces effets directs, s'ajoutent une grande inflammabilit, et un risque d'explosion quand il
s'agit d'alcanes (utiliss comme carburants, mais aussi en tant que gaz propulseurs dans certains
arosols) ou de solvants/dtachants (cas de la plupart des organochlors). Une intoxication indirecte
par inhalation de vapeurs de chlore a aussi t signale pour les organo-chlors aprs
dhalognation spontane ou provoque.
5.2 BIOCONCENTRATION DANS LES CHAINES ALIMENTAIRES
La circulation des polluants par l'intermdiaire des chanes trophiques donne lieu ce que l'on a
appel "l'intensification biologique" de leurs effets.
Le D.D.T., par exemple, employ pour la dmoustication, fut pandu par avion et pendant
plusieurs annes conscutives sur certains marais de Long Island, USA. Les faibles concentrations
utilises avaient t choisies pour ne provoquer aucun effet toxique immdiat sur les poissons et la
sauvagine. En dpit de ces prcautions, on constata peu peu une modification de la faune.
Fig 5. Structure d'une chaine trophique montant les biomasses respectives des diffrents
niveaux
Carnivores secondaires
Carnivores primaires
10
Herbivores
67
Production primaire
335
0
100
200
300
Biomasse (unit arbitraire)
400
31
Fig. 6. Reprsentation simplifie (!) des relations trophiques dans un marais salant. (d'aprs
Hardman et al. 1993)
C a rnivore s
et
C ha mpigno
nssup rie u
re strophiqu
Ma mmif re s e s Oise a ux
H omme
Poissons
Ba ct rie s
Ma mmif re s
Oise a ux
Arthropode s
Mollusque s
M iofa une
M iofa une
Ann lide s
Arthropode s
Pla nte s
Algue s
D tritus
N ive a ux
trophique s
N utrime nts
N utrime nts
S dime nts e t e a u
Le dosage des organochlors dans divers compartiments de l'cosystme aquatique a montr

qu'alors que l'eau ne contenait que 0,000.05 ppm (partie pour un million) d'insecticide, les
concentrations taient de 0,23 0,94 ppm dans les poissons herbivores, de 1,33 2,07 ppm dans les
poissons carnivores, de 3,57 26,4 ppm dans les oiseaux piscivores et de 13,8 ppm dans les ufs
d'un rapace diurne.
Ainsi l'insecticide non biodgradable se concentrait au fur et mesure de son passage le long
des chanes alimentaires (Figure 5) et les doses initiales inoffensives pour les individus se rvlaient
la longue ltales pour les populations.
Le mme phnomne a t mis en vidence pour les isotopes radioactifs. L'eau d'un petit lac
canadien dans lequel on dversait des rsidus atomiques trs dilus ne contenait que trs peu de
strontium 90, mais les plantes aquatiques en renfermaient 300 fois plus, les poissons herbivores
1.000 fois plus et le squelette des poissons carnivores 3 000 fois plus. En raison de la complexit
des chaines trophiques (Fig. 6) il est cependant trs difficile de prvoir le devenir des polluants dans
les diffrents organismes ou compartiments d'un cosystme.
32
Tableau 12. Demi-vies calcules pour la dhalognation par rduction chimique, de quelques
composs halogns prsents dans un aquifre contenant 0,01% de carbone et conditions de
potentiel rdox correspondantes (d' aprs Van Beelen & Peijnenburg, 1989c; cit par Van
Beelen 1990)
Compos
Demi-vie
Conditions de redox
Rfrences
calcule
et processus biologique
Bromodichloromthane
5 jours
Dnitrification
Bouwer & McCarty, 1983a
Tribromomthane
5 jours
Dnitrification
Chlorobromomthane
15 jours
Ttrachloromthane
112 jours
Dnitrification
Ttrachlorothylne
270 jours
Chloroforme
333 jours
Sulfato-rduction
Egli et al., 1987
335 jours
346 jours
Sulfato-rduction
Egli et al., 1987
Trichlorothylne
790 jours
Sulfato-rduction
Barrio-Lage et al., 1987
Bis[chloro(iso)propyl]ther 903 jours
1,2-Dichlorothane
1049 jours
1,2-Dichloropropane
1199 jours
Dichlorothylne
2512 jours
Mthanognse
Fathepure et al., 1987
Dichlorobenzne
17636 annes
Mthanognse
Holliger et al., 1988
Fig.7. Comparaison de la demi-vie de treize pesticides dans des sols striles (autoclavs) et
non striles. (d'aprs Roger et Bhuiyan 1995)
Demi-vie dans un sol autoclav
120
100
80
60
40
20
0
0
20
40
60
80
100
Demi-vie dans un sol non autoclav
120
33
6. BIODEPOLLUTION PAR LES MICROORGANISMES

6.1 INTRODUCTION
De nombreux agents polluants et pesticides peuvent tre transforms ou dcomposs la fois par
des ractions physico-chimiques et biologiques. Toutefois dcomposition et transformations sont
gnralement plus rapides dans des environnements comportant une microflore que dans les
environnements striles.
Le tableau 12 prsente des calculs de demi-vies pour la dhalognation chimique de
composs halogns rencontrs dans les aquifres. On constate que les valeurs sont gnralement
trs leves et augmentent lorsque le rH du milieu diminue.
La figure 7 prsente la comparaison des valeurs de demi-vies de treize pesticides
dtermines dans des sols striliss et non striliss. On observe une dgradation gnralement
nettement plus rapide en prsence d'une microflore.
L'implication des microorganismes dans la dgradation des polluants est indirectement
tablie par l'existence d'une phase de latence suivie d'une disparition plus rapide correspondant
une adaptation de la microflore et au fait que l'application rpte d'un polluant ou d'un pesticide
provoque assez frquemment un racourcissement de la phase de latence (Fig 8).
Enfin, la dmonstration du rle des microorganismes dans la dgradation des polluants est
faite par l'isolement de souches capables de dcomposer ces produits en culture pure. Le tableau 13
prsente une compilation des microorganismes isols de sols de rizire, capables de dcomposer des
pesticides utiliss en riziculture. Les tableaux 20 et 21 indiquent un certain nombre de
microorganismes capables de transformer ou dgrader des polluants en arobiose ou en
anarobiose.
Fig. 8. Reprsentation schmatique de l'adaptation des bactries du sol un pesticide ou un

xnobiotique
Concentration
du xnobiotique
Premire
introduction
Introductions
suivantes
Temps
34
Tableau 13. Microorganismes dgradant des pesticides, isols dans des sols de rizire
(d'aprs Roger et Bhuiyan, 1995)
Pesticide
Benzne hexachloride
Carbaryl
Carbofuran
"
"
Diazinon
"
"
"
"
BHC
"
HCH
Heptachlor
Lindane
Metoxychlor
Parathion
"
"
"
"
Pentachlorophenol
"
"
Microorganisme
Clostridium sp.
Pseudomonas cepacia
Arthrobacter sp.
Bacillus sp.
Micrococcus sp.
Arthrobacter sp.
Arthrobacter sp.
Flavobacterium sp.
Flavobacterium sp.
Steptomyces sp.
Clostridium rectum
Clostridium sp.
Clostridium sphenoides
Clostridium sp.
Clostridium sp.
Clostridium sp.
Bacillus sp.
Bacillus sp.
Flavobacterium sp.
Pseudomonas sp.
Pseudomonas sp.
Mycobacterium sp.
Pseudomonas sp.
Pseudomonas sp.
Rfrence
Sethunathan et al. 1969
Venkateswarlu et al. 1980
Rajagopal et al. 1984
Sethunathan & Pathak 1971
Sethunathan et al 1982
Yoshida 1971
Sethunathan 1972
Sethunathan & MacRae 1969
Ohisha & Yamaguchi 1978b
Sethunathan & Yoshida 1973b
Heritage & MacRae 1979
MacRae et al. 1969
Siddaramappa et al. 1973
Sudhakar-Barik et al. 1976
Sethunathan & Yoshida 1973a
Siddaramappa et al. 1973
Sudhakar-Barik et al. 1976
Suzuki 1983a et b
Watanabe 1973b
Suzuki 1983a et b
D'une faon gnrale, bactries, actimomyctes et champignons sont impliqus dans la dgradation
des polluants et des pesticides dans les sols exonds. Dans les sols submergs et les environnements
anarobies, ce sont surtout des bactries qui sont impliques. Dans la zone photique, cyanobactries
et micro-algues peuvent parfois dgrader certains polluants, dont des pesticides, mais sont surtout
impliques dans des processus de bioconcentration.
6.1.1 Spcificit et non spcificit
Les donnes actuelles identifiant les microorganismes dgradant un mme polluant ou les diffrents
polluants pouvant tre dgrads par un mme microorganisme ne sont pas extrmement
nombreuses. Les donnes disponibles indiquent cependant que la spcificit polluant /espce ou
genre microbien n'est, dans certains cas, pas trs marque.
Par exemple, un mme pesticide peut tre dgrad par diffrents microorganismes (cf. le
Diazinon et le Parathion dans le Tableau 13) . Rciproquement un mme microorganisme peut
dgrader un nombre lev de substrats (cf. Methylosinus OB3b, Tableau 14).
La spcificit microbienne est bien entendu corrle avec la spcificit enzymatique. Un cas
bien tudi de faible spcificit enzymatique est celui des mthane-mono-oxygnases (MMO). Des
prparations brutes de la MMOs de Methylococcus capsulatus catalysent l'incorporation d'un
oxygne diatomique dans un spectre trs large de substrats, permettant cet organisme de dgrader
des alcanes, haloalcanes, alcnes, thers et autres composs alicycliques, aromatiques et
htrocycliques .
Les MMO soluble et membranaire des bactries mthanotrophes peuvent dgrader des
hydrocarbures saturs, insaturs, linaires, branchs ou cycliques (benzne, tolune, styrne,
naphtalne) et jusqu' environ 8 atomes de carbone, des alcools et des crsols (Tableau 14).
35
Tableau 14. Composs polluants transforms ou dgrads par la mthane mono oxygnase
de bactries mthanotrophes. (D'aprs Floriani et Orio, 1995)*
Produit initial
dichloromthane
Produit de
transformation
dcel
chlorure
chloroforme
chlorure
1,1-dichlorothane
chlorure
1,2-dichlorothane
chlorure
trichlorothanol
1,2-dichloro-propane1,2-dichloropropane
2-ol
1,1-dichlorothylne
ND
cis-1,2dichlorothylne
trans-1,2dichlorothylne
cis-poxydes
trichlorothylne
trans-1,3dichloropropylne
2-chlorobiphnyl
4-chlorobiphnyl
2,4-dichlorobiphnyl
4-hydroxy-2chlorobiphnyl
trans-poxydes
chlorure,
trichlorothanol,
trichloroactaldhyde
chlorure
hydroxydichlorobiphnyl
dihydroxychlorobiphnyl
* Etude bibliographique ESGBMA, 1995
Bactries
MMOs
Methylosinus
OB3b
Methylomonas
Methylosinus
OB3b
Methylomonas
Methylosinus
OB3b
Methylomonas
Methylosinus
OB3b
Methylomonas
Methylosinus
OB3b
Methylosinus
OB3b
Methylosinus
OB3b
Methylosinus
OB3b
Methylomonas
Methylosinus
OB3b
Methylomonas
Methylosinus
OB3b
Methylomonas
Methylosinus
OB3b
souche CSC1
Methylomonas
souche CSC1
Methylomonas
souche CSC1
Methylomonas
souche CSC1
Methylomonas
oui
non
oui
non
oui
non
oui
non
oui
oui
oui
oui
non
oui
non
oui
non
oui
oui
oui
oui
oui
MMOm
oui
oui
oui
oui
oui
oui
oui
oui
oui
oui
oui
oui
oui
oui
oui
oui
oui
oui
non
oui
non
oui
non
oui
non
oui
Taux de
dgrad.
(%)
>98
86
>98
>99
96
91
<10
12
97
>98
>98
>98
62
10
>99
51
40
18
>98
56
24
>98
>98
>98
>99
<10
<10
85
48
40
<10
30
<10
25
<10
15
<10
36
Tableau 14. Concentrations de diffrents composs pour laquelle la biodgradation ne se

produit pas ou est plus lente que prvue.
(d'aprs Alexander, 1994)
Compos
Environnement
2,4-D
Sevin
Aniline
4-Nitrophnol
2,4-Dichlorophnol
Styrne
Phnol
Carbofuran
2,4,5-T
1,2-, 1,3- et 1,4Dichlorobenznes
Cours d'eau
Cours d'eau
Lac
Lac
Lac
Lac
Lac
Sol
Sol
Biofilm sur verre
Concentration
(g par litre d'eau
ou kg de soil)
2,2
3,0
0,1
1,0
2,0
2,5
0,0015
10-100a
100
0,2-7,1b
Rfrence
Boethling et Alexander, I979a
Boethling etAlexander, 1979a
Hoover et al., 1986
Hoover et al., 1986
Hoover et al., 1986
Fu et Alexander, 1992
Rubin et Alexander, 1983
Chapman et al., 1986
McCall et al., 1981
Bouwer et McCarty, 1982
a Concentration qui n'a pas provoqu une augmentation de la population suffisante pour permettre le dcomposition
rapide d'un second apport de carbofuran.
b Concentration dans l'effluent d'une colonne de billes de verre servant de support des microorganismes capables de
dgrader ces composs.
Tableau 15. Dgradabilit de diffrents xnobiotiques

(d'aprs Jrgensen, 1991)
Compos
Hydrocarbones aliphatiques
Benzne
Tolune
o-xylne
m et p-xylne
Dgradation*
Arobie
1
2
3
+
+
+
+
+
Dgradation*
Inhibition
-1
Anarobie(mg l )
1
2
3
+
+
92
+
29-200
+
+
-
Phnol
o-crsol
m-crsol
p-crsol
+
+
+
+
Naphtalne
Phnanthrne
Pyrne
Benz()pyrne
+
+
Dichlorothane
Dichloromthane
Ttrachloromthane
Ttrachlorothylne
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
64-2000
33-60
11-600
16-1000
+
+
+
6-11
9
10
0,06
+
+
+
+
+
*1: forte dgradabilit; 2: dgradabilit moyenne; 3: dgradabilit faible
125
93
_
37
Tableau 16. Dure de la phase de latence de la dgradation de composs organiques

Compos
Aromatiques divers
Chlorure de dodcyltrimthyl-ammonium
4-nitrophnol
Amitrole
Chlorobenznes
DNOC
PCP
Mecoprop
NTA
Halobenzoates
2,4,5-T
Divers
Environnement
Sol
Eau douce
Dure de
l'acclimatation
10-30 h
24 h
Rfrences
Kunc et Macura 1966
Ventullo et Larson 1986
Eau/sdiment
Sol
Biofilm
Sol
Eau de fleuve
Enrichissement
Estuaire
Sdiment anarobie
Sol
Nappe phratique
40-80 h
7 jours
10 jours 7 mois
16 jours
31-35 jours
30-37 jours
50 jours
21 -180 jours
4-10 semaines
> 16 semaines
Spain et Van Veld 1983

Riepma 1962
Bouwer et McCarty 1984
Hurle et Rademacher 1970
Pignatello et al 1986
Lappin-Scott et al 1986
Pfaender et al 1985
Likfield et al 1989
Rosenberg et Alexander 80
Wilson et al 1986
6.1.2 Adaptation microbienne la dgradation des polluants

6.1.2.1 Seuils infrieur et suprieur
De nombreux polluants sont prsents de trs faibles concentrations dans les sols et les
eaux. Ils n'en restent pas moins dangereux, en particulier en raison des phnomnes de
bioconcentration. L'tude des problmes lis la dgradation de composs prsents de trs faibles
concentrations est relativement rcente et a mis en vidence l'existence d'un seuil infrieur en dea
duquel la microflore ne peut plus se multiplier et aucune dgradation n'est observe (Tableau 14).
A l'oppos, une concentration trop leve en polluants peut causer une inhibition de la
microflore (Tableau 15).
6.1.2.2 Adaptation et phase de latence
Avant le dmarage de la dgradation d'un polluant, on note gnralement une priode de
latence qui correspond une phase d'adaptation de la microflore. La liste des composs pour
lesquels une telle phase a t rapporte est longue et comprend des herbicides (2,4-D, MCPA,
Mecoprop, TCA, amitrole, dalapon, monuron, chlorpropham ... ), des insecticides (methyl
parathion, azinphosmethyl), des aromatiques polycycliques (naphtalne, anthracne), et des produits
divers tels que le phnol, des chlorophnols, des chlorobenznes etc. (Tableau 16).
La dure de la phase de latence peut varier dans de larges limites entre une heure et plusieurs
mois. Elle varie avec la nature des produits mais galement avec leur concentration et les conditions
environnementales. Elle est souvent trs longue pour les molcules chlores en anarobiose.
Actuellement il n'existe aucune mthode permettant de prdire la dure de la phase de
latence de la biodgradation d'un compos dans un environnement donn.
Lors d'une seconde addition de polluant on observe gnralement une diminution ou mme
une disparition de la phase de latence mais ceci n'est pas une rgle absolue. Un aspect important de
cette adaptation de la microflore est une diminution de l'efficience de certains pesticides.
38
Tableau 17. Diffrents types d'interactions dans les communauts microbiennes

(d'aprs Slater et Lovatt, 1982; cit par Hardman et al. 1993)
Echange rciproque de nutriments spcifiques
Colimination, de mtabolites inhibiteurs
Amlioration de paramtres individuels de croissance
Capacits mtaboliques complmentaires
Ralisation d'une tape comtabolique dans un mtabolisme complmentaire
Transfert interespce d'hydrogne
Utilisateurs primaires et secondaires
6.1.2.3 Synergies et dgradations successives
De nombreuses biodgradations, pour tre effectives, ncessitent l'action conjuge de plusieurs
microorganismes. Plusieurs types d'interactions existant entre bactries (Tableau 17) peuvent
expliquer les synergies observes avec de nombreux composs:
- Une ou plusieurs espces bactriennes produisent une ou des substances de croissance
ncessaire(s) aux autres (en particulier vitamine B et acides amins)
Fig.9. Associations bactriennes effectuant la dgradation complte du dodcylcyclohexane
(Feinberg et al. 1980), de l'acide 6-aminonaphtalne 2-sulfonique (Nrteman et al. 1986) et du
4-chlorobiphnyl (Sylvestre et al., 1985); (d'aprs Alexander, 1994)
Arthroba cte r sp.
Rhodococcus
sp.2 ) 1 1 CH 3 2 CO
OHcyclohexan
rhodochrous
eacetique
spsulfonique 1
(C H 2 ) 1 1 C H 3 2
Dodcylcyclohexane
C H 2 C OOH
Acide
cyclohexaneactique
Pse udomona s 2
Pse udomona s 1
Acide 6-aminophtalene 2
sulfonique
Acide 5-aminosalicylique
Pse udomona s sp.
S ouche 1
Cl
Cl
4-chlorobiphnile
COOH
4-chlorobenzoate
39
Fig. 10. Associations bactriennes dans lesquelles la seconde espce se dveloppe sur le produit
du comtabolisme du TCE (Uchiyama et al., 1992), du DDT (Pfaender et Alexander, 1972),
du parathion (Daughteton et Hsieh, 1977) et du cyclohexane (de Klerk et van der Linden,
1874) (d'aprs Alexander 1994).
Me thylocystis
Xa nthoba cte rr
C C l 3 C OOH
C C l 2 =C lC H
C H C l 2 C OO H
T CE
Pseudomonas
Cl
C H 2 C OOH
Cl
CH
l
C C l3
spI
CCl3
sp 3 CH 2 O 3 CH 2
O 2 2 COOH 2 =
ClCH 3 COOH 2
COOHArthrobacter
Acide 4 -chlorophe noxya c tique
DDT
S
C H 3C H 2O
C H 3C H 2O
Parathion
N O2
Cl
C H 2 C OOH
Pse udomona s
a e ruginosa
Pse udomona s
stutze ri
Pse udomona s 2
Pse udomona s 1
OH
Cyclohexane
C yclohe xa nol
- Une premire espce effectue la dgradation partielle du substrat qui est dgrad par une seconde
espce en l'absence de laquelle le produit intermdiaire s'accumulerait dans le milieu. La Figure 9
prsente trois exemples de minralisation de polluants faisant intervenir des associations de deux
bactries fonctionnant suivant ce procd.
Un aspect particulier est lorsque l'intermdiaire produit par le premier partenaire microbien
devient inhibiteur pour ce microorganisme. La synergie augmente alors de faon spectaculaire la
dgradation du polluant.
- Un autre cas est celui d'une premire espce qui comtabolise un substrat qu'elle ne peut plus
ensuite transformer et qui est utilis son tour par une seconde espce. La figure 10 prsente quatre
associations bactriennes dans lesquelles la seconde espce se dveloppe respectivement sur le
produit du comtabolisme du TCE, du DDT, du parathion, et du cyclohexane .
Dans certains cas diffrents microorganismes peuvent dgrader une molcule en s'attaquant
diffrents sites spcifiques de la molcule (voir section 6.2.3.12).
40
6.2 MECANISMES MICROBIENS DE LA BIODEPOLLUTION

6.2.1 Minralisation
La minralisation est une forme de biodgradation complte des produits aboutissant la
formation de CO2. Gnralement une partie du substrat est assimile par l'organisme concern, ce
qui est vident lorsque ce substrat est la seule source de carbone dans le milieu.
De nombreux polluants peuvent tre minraliss; toutefois les phnomnes de diauxie
peuvent tre un obstacle la minralisation des polluants. En particulier on s'est aperu que
l'addition de glucose et d'amino-acides des aquifres pollus par des contaminants tels que le
tolune, le phnol, le dibromure d'thylne et le p-nitrophnol, inhibait la minralisation des
polluants, sans doute cause d'une utilisation prfrentielle des substrats facilement mtabolisables.
6.2.2 Comtabolisme
Le comtabolisme est un mtabolisme bactrien dans lequel un substrat dgrad ne peut subvenir
seul la croissance cellulaire (il ne constitue pour le microorganisme ni une source de carbone, ni
une ressource nergtique) et sa dgradation est conditionne par la prsence d'un deuxime
substrat.
Un exemple classique est celui de la dgradation du TCE par les bactries mthanotrophes,
qui ne s'effectue qu'en prsence de mthane (Figure 11).
Fig. 11. Comtabolisme du TCE par la mthane monooxygnase en prsence de mthane.

(d'aprs Mac Farland et al., 1992)
Cl
Cl
C =C
Cl
1.
2.
3.
4.
TC E
H
M tha ne monooxyg na se
M tha nol d shydrog na se
Forma ld hyde d shydrog na se
Formia te d shydrog na se
H 2O
CH4
2
3 Otha ne
m
H2O
22.
MN
t AD H
ha n +
ol H +
d s
hyd
rog
na
se
3.
For
ma l
2
C H 3 OH
m tha nol
3
HCHO
forma ld hyde
Formia te
N AD H
+
H+
+
N AD
Cl
C - C
Cl
C O2
H C OOH
+
N AD
+
N AD
Cl
N AD H
+
H+
H
C - C
TC E poxide
3 Cl -
O
OH
Acide glyoxylique
C O2
41
Le comtabolisme peut tre considr comme une conversion fortuite et due uniquement
une faible spcificit enzymatique.Trois explications sont donnes pour expliquer l'origine du
comtabolisme, en relation avec cette faible spcificit enzymatique :
le substrat entre dans la cellule en quantit trop faible pour dclencher la synthse des
enzymes aptes le mtaboliser. L'attaque est alors trop lente pour alimenter la machinerie cellulaire
en carbone ou en nergie
le substrat xnobiotique est dgrad en composs inutilisables pour le mtabolisme de
synthse (voie en impasse). Le deuxime substrat compense alors cette lacune, fournit l'nergie et
la matire premire dont la cellule a besoin pour se dvelopper
la dgradation du xnobiotique comporte une rduction et les lectrons doivent provenir
d'une autre source, ncessairement reprsente par un second substrat; l'attaque de celui-ci
rtablissant l'quilibre du budget.
Tableau 18. Comtabolisme de diffrents substrats en culture pure.
Substrat
Ttrachlorothylne
Benzothiophne
3-hydroxybenzoate
Cyclohexane
3-chlorophnol
Chlorobenzne
Bis(tributyltin) oxide
3-nitrophnol
Trinitroglycrine
Parathion
4-chloroaniline
Metamitron
Propane
2-butanol
Phnol
DDT
n-xylne
2,4,5-T
4-fluorobenzoate
4,4'-dichlorodiphnyl-mthane
2,3,6-trichlorobenzoate
3-chlorobenzoate
m-chlorotolune
Kepone
4-trifluoromthyl-benzoate
dihydroxybenzoate
Produit
Trichlorothylne
Benzothiophne-2,3-dione
2,3-dihydroxybenzoate
Cyclohexanol
4-chlorocatchol
3-chlorocatchol
Dibutyl tin
Nitrohydroquinone
1- et 2-nitroglycrine
4-nitrophnol
4-chloroactanilide
Desaminometamitron
Propionate, actone
2-butanone
cis,cis-muconate
DDD, DDE, DBP
Acideo-toluic
2 ,4,5-trichlorophnol
4-fluorocatchol
Acide 4-chlorophnylactique
3,5-dichlorocatchol
4-chlorocatchol
Benzyl-alcool
Monohydrokpone
4-trifluoromthyl-2,3-
Rfrence
Fathepure et Boyd (1988)
Fedorak et Grbic-Galic (1991)
Daumy et al. (1980)
de Klerk et van der Linden (1974)
Engelhardt et al. (1979)
Klecka et Gibson (1981)
Barug (1981)
Raymond et Alexander (1971)
Cornell et Kaplan (1977)
Daughton et Hsieh (1977)
Engelhardt et al. (1977)
Engelhardt et Wallnfer (1978)
Leadbetter et Foster (1959)
Patel et al. (1979)
Knackmuss et Hellwig (1978)
Pfaender et Alexander (1973)
Raymond et al. (1967)
Rosenberg et Alexander (1980)
Clarke et al. (1979)
Focht et Alexander (1971)
Horvath et Alexander (1970a)
Horvath et Alexander (1970b)
Higgins et al. (1979)
Orndorff et Colwell (1980)
Engesser ett al. (1988)
42
Un grand nombre de composs organiques peuvent tre comtaboliss.
En plus des composs prsents dans le tableau 18, on peut citer:
le cyclohexane (Beam and Perry, 1974),
les polychlorobiphnyls [PCB] (Brunner et al., 1985),
le 3-trifluoro-mthylbenzoate (Knackmuss, 1981),
plusieurs chlorophnols (Liu et al., 1991),
la 3,4-dichloroaniline (You and Bartha, 1982),
le 1,3,5-trinitrobenzne (Mitchell et al., 1982),
des pesticides tels le Propachlor (Novick and Alexander, 1985), l'Alachlor (Smith and
Phillips, 1975), l'Ordram (Golovleva et al., 1978), le 2,4-D (Bauer et al., 1979), et le
Dicamba (Ferrer et al., 1985).
Les microorganismes qui effectuent ces ractions in vitro comprennent des souches de
Pseudomonas, Acinetobacter, Nocardia, Bacillus, Mycococcus, Achromobacter, Methylosinus, et
Arthrobacter en ce qui concerne les bactries, et de Penicillium et de Rhizoctonia en ce qui
concerne les champignons.
Un certain nombre de conversions comtaboliques n'impliquent qu'une seule enzyme qui
peut effectuer l'une des ractions suivantes : hydroxylation, oxidation, dnitratation, damination,
hydrolyse, acylation, ou clivages d'une liaison ther. Toutefois de nombreuses conversions
comtaboliques sont complexes et font intervenir plusieurs enzymes.
Certains substrats, qui permettent la croissance de microorganismes, peuvent tre dgrads
en culture pure par des bactries, sans incorporation de carbone dans les cellules (Schmitt et al.,
1992) ( prciser).
6.2.3 Transformations dtoxifiantes
6.2.3.1 Hydrolyse
Le clivage d'une liaison par addition d'eau est une raction frquente effectue par les
microorganismes et qui inactive un certain nombre de substances toxiques.
R-
O
II
CO-R' + H 2O -->
R-
O
II
C-OH + HO-R'
Ces ractions peuvent consister en la simple hydrolyse microbienne d'une liaison ester par une
carboxylase microbienne telle que dans le cas de l'inactivation de l'insecticide Malathion.
Une raction identique peut causer le clivage d'une anilide par une amidase.
R-NH-
O
II
C-CH2-R' + H2O --> R-NH2 + H-O-
O
II
C-CH2-R'
6.2.3.2 Hydroxylation
L'addition d'un ion OH une molcule aromatique ou aliphatique la rend gnralement moins
toxique. Par exemple, le simple remplacement d'un H par OH inactive le fungicide MBC et
l'herbicide 2,4-D
R-H --> R- OH
43
6.2.3.3 Dhalognation
De nombreux pesticides et des polluants industriels contiennent du chlore ou d'autres halognes.
L'enlvement de l'halogne dtoxifie gnralement ces composs. Les enzymes impliqus sont
appels dhalognases.
Ces ractions peuvent consister dans le remplacement de l'halogne:
soit par un ion H (dshalognation rductive):
R-Cl--> R-H
soit par un ion OH (dhalognation hydrolytique):
R-Cl --> R-OH

Elles peuvent galement rsulter dans l'enlvement de l'halogne et d'un H adjacent (deshydrodhalognation) :
R-CH2-CH-Cl-R' --> R-CH = CH-R'

Dans ces ractions, l'halogne est libr sous la forme inorganique.
Des exemples de dhalognations qui inactivent des produits toxiques sont ceux:
de l'insecticide DDT transform en DDE inactif en tant qu'insecticide
DDE
DDT
H
I
C
I
CCl3
Cl
Cl
Cl
Cl
C
II
CCl2
de l'insecticide lindane transform en 2,3,4,5,6-penta chloro 1-cyclohexane inactif:
LINDANE
Cl
Cl
1cy
Cl
cl
oh
ex
Cl
2,3,4,5,6,- penta-chloro
1-cyclohexane
Cl
Cl
Cl
Cl
Cl
Cl
Cl
44
de l'herbicide Dalapon transform en acide pyruvique inactif:
DALAPON
Cl
l
CH 3 - C - CCOOH
l
Cl
ACIDE PYRUVIQUE
O
ll
CH 3 -C-COOH
Le clivage de certaines des liaisons C-halogne est surprenant dans la mesure en raison de la force
de ces liaisons. Par exemple le clivage d'une liaison C-F demande une nergie considrable (116
kcal/mole).
6.2.3.4 Dmthylation et autres dalkylations
De nombreux pesticides contiennent des radicaux mthyl ou alkyl lis un N- ou un O-. Une
dalkylation du N- ou du O- gnralement inactive ces pesticides. Dans le cas du Diuron,
l'enlvement d'un premier radical mthyl conduit au driv monomthyl nettement moins actif
comme herbicide que le Diuron. L'enlvement du second radical mthyl rend la molcule
compltement inefficace.
Une transformation du mme type se produit avec l'atrazine et d'autres herbicides du groupe
des triazines par perte d'un groupement N-thyl.
Un autre exemple (ci-dessous) est l'inactivation du chlorone par O-dmthylation.
Fig. 12. Exemples d'inactivations d'herbicides par dmthylation.
DIURON
O
33
32
NHCN
3
Cl
Cl
CH 3
Cl
CH 3
33
OCH 3
CH 3 O
O
O
CHLORONEB
Cl
CH 3
Cl
NHCN
Cl
Cl
OH
O
Cl
NHCNH 2
Cl
CH 3 O
Cl
45
6.2.3.5 Mthylation
La raction inverse (addition d'un groupe mthyle peut inactiver les phnols toxiques.
ROH --> RO-CH3

Par exemple les fungicides penta- et ttra-chlorophnols peuvent tre inactivs par l'addition d'un
o-mthyl. D'autres exemples de dtoxification par mthylation sont ceux du penta-chloronitrobenzne (fungicide) transform en pentachloroaniline et du parathion (insecticide) transform
en amino-parathion.
6.2.3.6 Rduction d'une fonction NO 2
Les composs organiques comportant un radical NO2 sont toxiques pour de nombreux organismes
suprieurs et infrieurs. Le remplacement du radical NO 2 par un radical NH2 diminue gnralement
la toxicit du produit.
R-NO2 --> R-NH2

6.2.3.7 Dsamination
L'herbicide Metamitron est inactiv par l'enlvement du radical NH2 .
NH 2
O
CH
23
Mtamitron
6.2.3.8 Clivage d'une liaison ther (C-O-C)
Les phnoxy herbicides contiennent des liaisons ther (C-O-C) dont le clivage inactive la molcule.
Un exemple surprenant est celui du 2,4-D pour lequel la transformation microbienne demande la
fourniture d'nergie par le microorganisme (l'nergie de liaison C-O est de 85,5 kcal/mole).
O(CH 2 )COOH
Cl
2,4-D
Cl
6.2.3.9 Conversion d'un nitrile en amide
L'herbicide slectif 2-6-dichloro-benzonitrile (nom commercial: Dichlobnil) est inactiv
par la microflore du sol qui le transforme en 2,6-dichloro-benzamide.
O
II
R-C=N --> R-C-NH2
46
6.2.3.10 Conjugation
Ce sont des ractions qui associent un compos courant des voies mtaboliques un compos
toxique dont elles provoquent l'inactivation. Par exemple Cunninghamella elegans peut conjuger le
pyrne avec du glucose. Certains organismes peuvent conjuger un fongicide de la famille des
dithicarbamates avec de l'acide butyrique produisant une conjugaison moins toxique que le
fongicide.
6.2.3.11 Ouverture de cycles (composs benzniques)
Les bactries mthanognes peuvent dgrader un certain nombre de composs benzniques
polycycliques (voir cours M. Garcia sur la dgradation anarobie des composs aromatiques).
6.2.3.12 Ractions multiples
Un microorganisme ou une communaut microbienne peuvent dtoxifier un compos de plusieurs
faons. L'exemple suivant est celui de l'insecticide malathion dont la molcule peut tre clive
diffrents endroits par des enzymes appartenant diffrents microorganismes.
CH 3 O
CH 3 O
P-S-CH-C-CH 2 -CH 3
Malathion
CH 2 -C-0-CH 2 -CH 3
O
6.2.3.13 Transformations non dtoxifiantes

Les ractions prsentes ci-dessus ne causent pas systmatiquement une dtoxication. Elles peuvent
parfois rsulter dans la formation d'un compos aussi toxique ou plus toxique que le compos
d'origine. Dans certain cas des pesticides, le produit transform peut perdre sa toxicit pour les
organismes qu'il tait destin controller et devenir toxique pour un autre type d'organisme (voir
section 10.2.3).
47
6.2.4 Bioconcentration
La proprit de certains organismes, en particulier les cyanobactries, les microalgues et certaines
plantes aquatiques, de concentrer dans leurs cellules les mtaux lourds ou des agents polluants tels
que le phosphore permet d'envisager leur utilisation pour la dpollution d'eaux charges en produits
toxiques.
Le tableau 19 prsente des exemples de biormdiation d'eaux pollues faisant appel une
tape de bioaccumulation. Toutefois, les mthodes prsentes liminent les mtaux de l'effluent
liquide en causant leur prcipitation, mais ne les laissent en place dans l'cosystme.
Tableau 19. Mcanismes et efficience de systmes naturels et artificiels dans le traitement
des effluents chargs en mtaux (d'aprs Hardman et al. 1993)
Ecosystme
Origine de la Organismes
pollution
Mcanismes
Efficacit
Rfrence
Lac
naturel
Rejets de
mines et de
fonderie
Bonne
Jackson
1978
Marcage
et bassins
artificiels
Eaux acides
de drainage
de mines
Biosorption par les algues

puis mort des algues et
sdimentation.
Prcipitation de sulfures
mtalliques (Zn, Cd, CU,
Fe) par les BSR.
Conversion microbienne
de Hg en dimthyle de Hg
Biosorption, puis
rcipitation de sulfures
mtalliques par les BSR en
anarobiose. Prcipitation
de Fe + Mn par oxydation
bactrienne en arobiose.
Biosorption par les algues
et les plantes.
Le rle des micro-organismes n'est pas
indiqu.
Fe, Pb, Cu,

Ni, Cd
limins
99%
Bassins
artificiels
Bassins
artificiels
ensemencs
en algues
Algues
Bactries
sulfatorductrices
(BSR)
Cyanobact.
Mousses
Sphaignes
Typha
Scirpus
Carex
BSR
Mine de
Chlorella,
plomb et
Oscillatoria,
traitement
Cladophora
du minerai
Spirogyra,
Rhizodonium
Potamogeton
Typha
Mine
Spirogyra
d'uranium
Chara
et traitement Oscillatoria
du minerai
BSR
Bonne:
Erickson
en 4 mois
et al.
limination 1987
de 69-90%
du Mn et
60% du Fe
Aprs des traitements

U 86%
physiques conventionnels, Se 96%
biosorption par les algues. Mo 65%
Le rle trs probable des
BSR n'est pas indiqu.
Gale
1986
Ashley et
Roach
1990
De nombeux essais ont t fait pour utiliser algues et plantes aquatiques pour la
biodpollution des eaux, l'utilisation de ces mthodes est limite par le volume de la biomasse
obtenue si l'on dsire liminer le polluant de l'environnement.
48
6.3 FACTEURS DE LENVIRONNEMENT QUI AFFECTENT LA BIODEPOLLUTION

Comme pour toute activit microbienne, le pH, le potentiel redox, la temprature, la teneur en eau,
les concentrations en lments nutritifs et les autre facteurs du milieu conditionnent la
biodgradation des polluants in situ..
La temprature a un effet prpondrant qui donne gnralement un effet saisonnier la
biodpollution dans les rgions tempres et la ralentit dans les pays froids.
On observe toutefois des exceptions . Un exemple intressant est celui de la dgradation du
2,4-D dans un fleuve de rgion tempre qui augmentait en hiver par suite de l'apport
supplmentaire de matire organique caus par la chute des feuilles et la formation d'un biofilm la
surface des feuilles en dcomposition au fond de l'eau.
La structure et la texture du sol et du sous-sol conditionne l'htrogneit de la dispersion du
polluant dans le biotope et sa circulation sous forme dissoute ou gazeuse. Dans les milieux trs
htrognes, soit au niveau granulomtrique, soit par suite de la prsence de failles ou de fractures,
la circulation (naturelle ou force) des fluides (gaz et eaux) utiliss pour une dpollution in situ se
fait uniquement par les zones plus permables, excluant de la dpollution une grande masse de sol.
La texture du sol et du sous-sol conditionne galement la dispersion et le transport des
polluants, mais l'aspect le plus important est sans doute celui de la nature et la quantit des argiles
contenues dans le milieu et qui conditionne les phnomnes d'adsorption-dsorption des polluants.
L'adsorption dans les feuillets d'argiles, en particulier des argiles gonflantes (Fig. 13) se
traduit par une protection des pesticides et polluants vis vis de la microflore (Fig. 14).
Ce phnomne peut se traduire par la prservation trs long terme de polluants ou de
pesticides dans les sols.
D'une faon gnrale il est ncessaire de comprendre ces facteurs afin de prvoir, ou
d'essayer de prvoir le devenir des polluants dans les environnements naturels, mais, l'exception
d'apport d'lments nutritifs et d'aration, il n'est gnralement pas financirement possible d'influer
sur ces facteurs in situ. Par contre il est nettement plus facile de les optimiser dans des dispositifs de
dpollution en racteur ou fermenteur.
Fig.13. Adsorption du Paraquat par les argiles.
(d'aprs Hardman et al., 1993)
Argile charge ngativement
+
H
+
H
+
H
Paraquat
C
+
H
F orces de Van der Waal
N C
+
H Echange
+d' dions
H io
n
s
49
Fig. 14. Minralisation de 14C Diquat dans une solution nutritive en prsence ou sans argile
(d'aprs Weber et Coble 1968; cit par Alexander 1993)
1 4CO 2
produit (CPM x 1000)
300
Contrle
+ Montmorillonite
250
Montmorillonite en excs
200
150
100
50
0
0
4
6
Semaines
10
Un proprit particulirement importante de l'environnement pour la bioremediation est le potentiel

redox.
D'une faon trs gnrale, un agent polluant entrain travers le sol et le sous-sol va
rencontrer, sur une distance trs variable, un gradient de potentiel redox le faisant passer de
l'arobiose l'anarobiose (Figure 15).
Dans un sol exond, ce passage peut demander plusieurs dizaines de mtres, alors que dans
un sol de rizire inond, il se fera sur 10-20 cm.
L'tude de la dgradation anarobie des polluants est relativement rcente. Elle a montr que
les microorganismes anarobies sont souvent trs versatiles et peuvent dtruire une grande varit
de composs.
Certains composs peuvent tre dgrads en arobiose et en anarobiose (voir Tableau 15)
D'autres ne sont dgrads qu'en anarobiose. Dans ce groupe on trouve les PCB haute
teneur en chlore, l'hexachlorobenzne, le 2-6 dinitro tolune, l'acide 3,5-dinitrobenzoique, le RDX
(explosif) et le DDT.
Parmi les principaux composs rsistant la dgradation anarobie ou peu dgradables en
anarobiose on trouve: l'anthracne, le naphtalne, les 2- et 4-chlorobenzoates, le benzne, le
chlorobenzne, l'aniline, la 4-toluidine, les 1- et 2-naphtol, la pyridine et des alkanes saturs. Par
contre, certains de ces composs sont dgrads en arobiose (Tableau 20)
50
Fig. 15. Potentiel rdox dans un sol engorg
700-500 mV
Bactries
arobies
Consommation
de l'oxygne
Rduction du nitrate
300 mV
Surface du sol
Bactries
anarobies
facultatives
Rduction du Mn
Bactries
anarobies
strictes
Rduction du fer
Sulfato-rduction
Eau d'infiltration
-200 mV
Mthanognse
Tableau 20. Dgradation arobie de quelque hydrocarbures aromatiques

polycycliques (d'aprs Baker et et Herson, 1994)
Compos
Naphtalne
Nombre
de cycles
2
Anthacne
Acnaphthne
Fluorne
Phnanthrne
3
3
3
Fluoranthne
Pyrne
4
4
Benzo(a)anthracne 4
Benzo(a)pyrne
5
Microorganismes
Nombre de
concerns
rfrences
Rhodococcus sp
1
Microorganismes telluriques
3
Pseudomonas marin
1
1
Microorganismes marins
1
1
1
Enrichissement d'eau d'estuaire
1
2
1
2
Mycobactrium sp.
1
Rhodococcus sp. UW1
1
3
3
Microorganismes d'eau d'estuaire 1
51
Il est rare qu'un microorganisme anarobie soit capable de dgrader compltement un
polluant. Dans la majorit des cas la dgradation demande l'action successive de deux ou plusieurs
souches.
Par exemple la dgradation du 3-chlorobenzoate demande l'action successive de trois
bactries qui transforment (a) le 3-chlorobenzoate en benzoate, (b) le benzoate en actate, H2 et
CO2 , et (c) H2 et CO2 en mthane.
Lorsque la dgradation anarobie conduit l'accumulation d'un compos intermdiaire non
dgradable en anarobiose, cet intermdiaire est gnralement biodgradable en arobiose.
Par exemple le monochlorobenzne rsultant de la dgradation anarobie de
l'hexachlorobenzne et des intermdiaires qui s'accumulent en anarobiose par dgradation des
PCBs peuvent tre dcomposs en arobiose.
Fig. 16. Dgradation anarobie de composs aromatiques: transformations initiales par

rduction (d'aprs Baker et Herson, 1994)
COOH
3H 2
H2
Benzoate
COOH
2H 2
H2
H2 O
A
COOH
OH
2-Hydroxycyclohexane
carboxylate
Cyclohexane
carboxylate
COOH
COOH
COOH
2 2 Ocar
2H
2
boxyla3H 2
OH
H2
tecycl H2
ohexa
ne
Benzoate
carbox
2-HydroxyCyclohexane
B
ylate 2 c
cyclohexane
carboxylate
arboxy
carboxylate
H
2O
late 2 cy
COOH
OH
Mtabolisme
clohex
intermdiaire
ane
COOH
carbox
+ CO 2
ylate 2 2
Adipate
Ointer
Cyclohexanone
mdiai
A. Le benzoate
et les composs analogues peuvent tre rduits pour former le compos alicyclique
correspondant en arobiose et anarobiose. A l'oppos de la transformation initiale des aromatiques
en arobiose, l'oxygne molculaire n'est pas utilis.
B. Rduction du benzoate par Moraxella sp. (tous les intermdiaires ne sont pas reprsents).
L'oxygne provient de l'eau
52
Les temps de latence observs pour la dgradation des polluants en anarobiose sont
extrmement variables mais des latences longues sont frquemment observes.
Par exemple, la dchloration rductive des chlorobenznes peut prendre plusieurs mois.
Les premires tapes de la dgradation anarobie peuvent tre des transformations
rductives (Fig 16) ou des transformation oxydantes accomplies par addition d'un groupement
hydroxyle provenant d'une molcule d'eau.
Le tableau 21 prsente une liste de composs aromatiques et aliphatiques dgrads en
anarobiose avec les microorganismes ou consortiums impliqus ainsi que les conditions d'oxydorduction auxquelles ces dgradations ont t observes.
Les pesticides sont apparemment souvent dgrads plus rapidement dans les sols submergs
que dans les sols exonds (Fig 17 ).
Fig. 17. Comparaison de la demi-vie de 36 pesticides dans des sols submergs et exonds
(d'aprs Roger et Bhuiyan, 1995).
Demi-vie en sol submerg (jours)

120
100
80
60
40
20
0
0
20
40
60
80
100
Demi-vie en sol exond (jours)
120
53
Tableau 21. Dgradation anarobie de composs aromatiques et aliphatiques
(d'aprs Baker et Herson, 1994)*
Compos
Organismes
Conditions de culture
Benzoate
Pseudomonas stutzeri
Desulfonema magnum
Non identifi(s)
Dnitrification
Sulfato-rduction
Mthanognse
Catchol
Non identifi(s)
Desulfobacterium cathecholicum
Mthanogne
Sulfato-rduction
P-crsol
Culture mixte
Non identifi(s)
Mthanognse
Dnirification
Sulfato-rduction
Mthanognse
Phnol
Non identifi(s)
Non identifi(s)
Desulfobacterium phenolicum
Non identifi(s)
Dnitrification
Sulfato-rduction
Mthanognse
Tolune
Culture mixte
Non identifi(s)
Culture mixte
Dnitrification
Mthanognse
o-Xylne
Culture mixte
Dnitrification
Chloroforme
Culture d'enrichissement
Mthanognse
Ttrachlorure de carbone
Methanobacterium sp.
Desulfobacterium sp.
Clostridium sp.
Pseudomonas
Mthanognse (2)
Mthanognse
Sulfato-rduction
1,2-Dichlorothane (DCA)
Consortium anarobie
(2)
Dichloromthane (DCM)
Consortium anarobie
Consortium actogne
Frons
Dnitrification
1,1,1-Trichlorothane (TCA)
Clostridium sp.
Dnitrification
Sulfato-rduction
Mthanognse
Trichlorothylne (TCE)
Consortium anarobie
(2)
Ttrachlorothylne (PCE)
Mthanognse (3)
Chlorure de vinyle
Consortium anarobie
Dnitrification
Dnitrification
* les rfrences, sous forme de numro, ont t supprimes. Les nombres d'articles sont indiqus entre parenthse.
54
7. LES DIFFERENTES METHODES DE BIOREMEDIATION

La bioremdiation est un ensemble de techniques mettant en uvre des procds de
biodpollution, utilisables pour rduire la toxicit, la mobilit ou le volume d'un contaminant dans
les sols, le sous-sol, les eaux et les effluents gazeux. Elle ne peut tre utilise pour confiner un
volume d'eau o de sol pollus. Elle peut s'effectuer directement dans l'environnement pollu (in
situ) ou aprs transfert de l'agent polluant (ex situ).
Ex situ
La mise en uvre de ces techniques passe par l'extraction soit du polluant, soit du polluant et du
matriau contamin, et leur traitement dans des dispositifs clos ou semi-clos.
Les effluents liquides ou gazeux pollus sont traits dans des bioracteurs (racteurs,
digesteurs, biofiltres, biolaveurs, etc)
Les sols contamins sont excavs, puis traits suivants des procds adapts (compostage,
traitement sous forme de boues, etc).
Dans ces dispositifs, on fait intervenir une microflore slectionne ou adapte au polluant.
In situ, on distingue deux approches:
l'approche cologique microbienne ("microbial ecology approach") qui a pour but
d'adapter certaines caractristiques physico-chimiques du site pour optimiser ou faciliter l'activit
microbienne dpolluante; et
le traitement microbien ("microbiological approach") qui consiste augmenter, dans le site
contamin, le niveau des populations microbiennes aptes dgrader le xnobiotique, soit par
renforcement des populations autochtones, soit par introduction de nouvelles populations
(inoculation).
Fig.18. Reprsentation schmatique de l'effet attendu de l'inoculation sur la dgradation des

polluants
Quantit de polluant restant

Inocul
Populations
naturelles
Temps
55
7.1 ASPECTS MICROBIOLOGIQUES

7.1.1 Les deux approches possibles
L'intervention des microbiologistes tend augmenter les populations de microorganismes dgradant
l'agent polluant pour en acclrer la dgradation (Figure 18) et peut prendre deux formes :
Le renforcement des populations autochtones aptes dgrader l'agent polluant par apport
d'lments nutritifs et modification des conditions de milieu, afin de diminuer la dure de la phase
d'acclimatation (ou de latence) et leur permettre de dgrader plus rapidement le contaminant.
Ces techniques sont regroupes sous l'expression "approche cologique microbienne".
L'inoculation microbienne qui peut utiliser des souches:
- slectionnes (extraites d'autres biotopes pollues par le mme contaminant) et choisies pour
leurs performances aprs une tude au laboratoire;
- adaptes, c'est--dire extraites de ce biotope, et dont on a (toujours au laboratoire) amlior les
possibilits en matire de dpollution;
- gntiquement modifies;
- inclues dans des produits commercialiss.
Souches gntiquement modifies: un peu de philosophie microbiologique.
Ce point amne une discussion qui n'est pas entirement cartsienne , d'o ce prambule, et un
sous-titre inhabituel.
On sait transfrer des gnes induisant la dgradation de xnobiotiques d'une bactrie dans une
autre (Tableaux 22 et 23). Le tranfert est facilit par le fait que les gnes concerns sont
frquemment plasmidiques (Tableau 22). Si les chances de crer la demande des
microorganismes aptes, dans un tube essai, dgrader un polluant dtermin sont, sinon une
certitude, du moins trs leves il convient toutefois de garder prsent l'esprit toutes les
limitations rencontres pour l'utilisation des bactries gntiquement modifies dans des
cosystmes naturels.
Tableau 22. Gnes plasmidiques transfrs d'une bactrie une autre
Activit code par le
plasmide transfr
Activit de la bactrie
modifie
Rfrences
Dgradation du 2,4-D
Mtabolise le 2,4-D sans croissance
Friedrich et al., 1983
Mtabolisme du benzne
Croissance sur benzne
Irie et al., 1987
Haloactate dhalognase
Mtabolise le chloro-actate
sans croissance
Kawasuki et al., 1981
Mtabolisme du naphthalne
Mtabolise le naphthalne
sans croissance
Oh et al., 1985
Mtabolisme du
3-chlorobenzoate
Croissance sur chlorophnols
Reineke et al., 1982
Cinq voies cataboliques
Croissance sur chlorobenzoates
Rojo et al., 1987
Comtabolisme du TCE
Dgradation du TCE
Winter et al., 1989
56
Tableau 23. Dgradations effectues par des bactries gntiquement modifies
Activit de la souche rceptrice
Activit de la souche d'origine
Composs mtaboliss
par la souche rceptrice
modifie
Pseudomonas croissant sur 3-chlorobenzoate 3-Chlorobiphnyl

Acinetobacter croissant sur biphnyls
Akaligenes utilisant les haloaromatiques
Pseudomonas utilisant le 4-chloro-2nitrophnol comme source d'azote
Rfrences
Adams et al., 1992
4-chloro-2-nitrophnol Bruhn et al., 1988

(utilis come source de C)
P. alcaligenes croissant sur benzoate

1,4-Dichlorobenzne
Pseudomonas putida croissant sur tolune
Krckel et Focht, 1987
Pseudomonas dgradant le chlorocatchol

Pseudomonas dgradant l'aniline
Latorre et al., 1984
Chloroanilines
Alcaligenes utilisant le phnol

2- et 3-chlorophnols
Pseudomonas utilisant le 4-chlorophnol
Schwien et Schmidt, 1982
P. cepacia croissant sur 4-chlorobenzoate

Dichlorobiphnyls
Pseudomonas putida croissant sur biphnyl
Havel et Reineke, 1991
Les informations disponibles sur l'tablissement de souches trangres, selectionnes ou

gntiquement modifies, inocules dans des sols, ne permettent gnralement pas de conclure un
succs d'tablissement et de multiplication des microorganismes non symbiotiques et ce,
principalement en raison de la comptition avec les souches autochtones. Dans des cosystmes
abiotiques ou ayant une microflore extrmement limite on peut par contre esprer introduire avec
succs de nouvelles souches.
Toutefois, dans la mesure ou l'on pourrait crer un microorganisme gntiquement modifi
capable de supplanter les populations autochtones dans un environnement naturel, on doit se
demander si ce microorganisme peut recevoir le label "non dangereux pour l'environnement" par les
commissions de scurit biologiques responsables de l'tablissement des autorisations d'importation
ou d'utilisation de telles souches.
L'utilisation de ces organismes dans des "dispositifs clos" se heurte gnralement au
problme du cot prohibitif des dispositifs permettant d'assurer que les microorganismes utiliss
dans le dispositif ne seront pas librs dans l'environnement.
Pour la bioremdiation de l'environnement, il semble prfrable, dans la majorit des cas,
d'utiliser la biodiversit naturelle et l'adaptabilit des souches plutt que de tenter d'utiliser des
organismes gntiquement modifis (Figure 19).
Des produit contenant des microorganismes sont commercialiss pour dgrader les
hydrocarbures dverss en milieu marin. Les formules de ces produits n'tant pas divulgues on ne
peut conclure si leur effet est du aux microorganismes qu'ils contiennent ou, plus probablement, aux
lments nutritifs qu'ils contiennent galement et qui permettent une activit accrue de la microflore
autochtone.
Quelque soit le type d'approche: renforcement des populations autochtones ou inoculation de
souches, on aboutit (ou l'on recherche) un accroissement de la biomasse et ventuellement de la
biodiversit microbiennes ("bioaugmentation") qui augmentent la vitesse de dgradation (Figure 18)
et souvent la gamme de polluants dgrads.
57
Fig. 19. Le problme de l'utilisation d'organismes gntiquement modifis

(OGM) pour la bioremdiation.
Peut-on fabriquer l' OGM adquat

pour le produit dgrader ?
OUI
NON
L'OGM peut-il se dvelopper in situ et

rsister la comptition des souches indignes
OUI
NON
L'OGM peut-il tre considr

Peut on utiliser l'OGM
comme dangereux pour
en dispositif confin
lenvironnement
Aspects
lgaux
OUI
NON
OUI
NON
Le cot du
confinement
est-il
acceptable
OUI
NON
Gagn !!!
PERDU !!!
Utiliser la biodiversit et ladaptabilit des
populations naturelles
58
7.1.2 Choix de la technologie appliquer en fonction du biotope

L'approche cologique microbienne ncessite:
- que l'on ait la preuve que le site abrite une population indigne apte dgrader le compos;
- que l'on ait rpertori les paramtres du milieu modifier pour augmenter, au moindre cot la
biodgradation microbienne;
- que par un suivi in situ, on puisse vrifier que cette activit augmente dans le temps.
Les techniques qui consitent augmenter l'activit de la microflore autochtone s'appliquent en
priorit aux sites prsentant une ou plusieurs des caractristiques suivantes:
- Des pollutions similaires se sont dj produites cet endroit (les populations indignes se sont
dj adaptes ce polluant);
- Des pollutions multiformes ont dj eu lieu (la microflore est plus complexe, le nombre de
souches efficaces est plus lev, et des consortiums peuvent exister);
- La concentration en contaminant est modre (le seuil de toxicit n'est pas atteint);
- On peut accepter une dpollution lente (qui ne serait qu'une acclration relative des processus
naturels);
- Le site comporte une nappe aquifre utilise pour la production d'eau potable (l'apport d'une
microflore exogne n'est pas souhaitable).
Au contraire, le traitement microbien sera prfr pour les sites:
- Pollus accidentellement (ne possdant pas a priori de microflore adapte au xnobiotique);
- A forte concentration en polluant (teneurs de l'ordre du %) ou forte pollution organique;
- Contenant, en plus, des mtaux lourds (ncessit d'utiliser des souches tolrantes);
- Pour lequel une dpollution rapide est obligatoire;
- Contenant un polluant inacceptable (trs dangereux), mme en faible quantit.
Les mthodes microbiologiques s'appliquent aux sols et aux eaux in situ , mais galement
aux technique faisant intervenir un lessivage du sol et/ou un pompage de la nappe phratique
profonde suivis d'un traitement ex situ de l'eau (pump & treat) (Voir section 723).
7.2 ASPECTS TECHNOLOGIQUES
7.2.1 Gnralits
Les sols (dfinis au sens agronomique du terme comme la partie suprieure de la lithosphre
modifie par des activits biologiques et anthropiques) ne sont gnralement pas traits in situ, mais
aprs excavation.
Ils sont dpollus "en tas", par des techniques de compostage, ou dans des dispositifs adapts
leur traitement sous la forme de boues.
La dpollution des zones contamines plus profondes (sous-sol et eaux des nappes
phratiques) peut se faire in situ et ex situ.
La dpollution de l'air et et des effluents gazeux est obligatoirement mise en uvre dans des
dispositifs ferms (biofiltres et biolaveurs), donc ex-situ.
59
Fig. 20. Schma synthtique des diffrentes mthodes de biodpollution du sol ex situ.
3
Solution de nutriments
1
Aration
Sol traiter
F ilm impermable
Drain
1: dispositif simple;
2: ajot d'un toit comme protection contre la dilution par les eaux de pluie;
3: dispositif enmur permettant la rcupration et le traitement en ligne des effluents gazeux.
7.2.2 Biormdiation du sol
Il est rare que les sols contamins soient traits en place. Aussi bien dans les mthodes physiques
que biologiques, le sol est excav puis trait. On distingue trois type de traitement:
7.2.2.1 Le traitement par pandage ("landfarming")
Cette mthode est surtout utilise pour traiter des sols pollus par des dchets ptroliers. Elle utilise
l'activit dpolluante de la microflore tellurique. L'ensemble du sol contamin, des nutriments (N,P
et K) et ventuellement, les hydrocarbures ramasss sous forme liquide ou pteuse, sont pandus
la surface du sol et sont brasss intervalles rguliers par des moyens mcaniques pour crer des
conditions d'arobiose. La consistance souhaite est intermdiaire entre celle du sol compost et une
boue fluide).
Cette technique est efficace, mais lente (il faut en gnral plusieurs mois de traitement). Elle
prsente l'avantage d'tre relativement peu onreuse. Cependant, utilise sans prcaution
particulire, elle prsente des effets nfastes:
les composs fortement rcalcitrants s'accumulent dans la zone traite.
Si le dispositif n'est pas clos, les zones voisines sont contamines par ruissellement des eaux
ayant travers la masse en traitement. C'est pourquoi il est conseill d'utiliser une sole tanche ou
un film plastique pour protger la couche suprieure du sol sous-jacent et les eaux souterraines.
Les eaux sont recueillies par un drain et peuvent tre traites sparment.
le brassage rgulier peut entraner la volatilisation de composs organiques volatils (COV) dans
l'atmosphre.
60
7.2.2.2 Le compostage
C'est un procd qui met en uvre des microorganismes arobies et thermophiles et qui est
traditionnellement utilis pour dgrader des dchets vgtaux issus de l'agriculture et les
transformer en un produit moins volumineux, appauvri en carbone, enrichi en lments nutritifs et
qui peut tre rutilis comme engrais.
Ce procd peut tre appliqu au sol. Le sol excav, est dispos sur un film impermable, et
travers de drains pour permettre une ventilation force dans la masse (Figure 20) . Les nutriments
favorables la microflore sont apports sous la forme de solution par des asperseurs. La phase
aqueuse, qui percole travers l'ensemble du tas de sol, est vacue dans sa partie la plus basse par
un drain. Le sol traiter peut galement tre enrichi en diffrents substrats organiques destins
favoriser l'aration du sol et promouvoir l'activit microbienne.
L'ensemble du dispositif peut tre (a) recouvert d'un toit qui protge le sol des pluies, et/ou
(b) enmur, ce qui permet de confiner la phase gazeuse, qui peut tre vacue par un extracteur
muni d'un filtre et subir si ncessaire un second traitement, en particulier par biofiltre.
Ce procd est appliqu aux sols contamins par des produits protecteurs du bois (PCP,
crosote), des carburants, des poudres propulsives et des explosifs. Il permet aussi de retraiter en
arobiose des boues issues du traitement des eaux.
Fig. 21. Reprsentation schmatique d'un racteur boue pour la dcontamination du sol.
(d'aprs Morgan et Watkinson, 1989)
Sol
contamin
bouesol/e
Phase
au 2 aqueus
eaqueuse
recycle
recycle
Racteur
Sparateur
sol/eau
Sol dcontamin
Nutriments
O2
61
Fig. 22 . Reprsentation schmatique de la combinaison du compostage et de l'extraction

aqueuse pour la dcontamination du sol (d'aprs Hardman, 1993).
Sol
contamin
Sol
dcontamin
Compostage
extraction
Eau contamine
Recyclage
de
la phase
aqueuse
Eau
Bioracteur
dcontamine
7.2.2.3 Les racteurs boues
Dans les racteur boues, (Figure 21) le sol excav est mlang une phase aqueuse pour obtenir
un produit fluide, homognis et enrichi en lments nutritifs, qui est ar par insufflation d'air. Le
polluant est dgrad dans ce mlange, mais peut aussi tre partiellement transfr la phase
aqueuse, que l'on traite aprs sparation des phases solides et liquides, et qui peut tre recycle.
Cette procdure se rapproche de la technique des boues actives qui est frquemment
utilise pour le traitement des eaux urbaines. Elle permet de maintenir en permanence le mlange
sol/phase liquide dans des proportions adquates et de contrler en continu les facteurs qui
permettent d'optimiser la biodgradation (niveau d'oxygne dissous, temprature, pH et
concentration des nutriments). Certains modles permettent la capture des composs organiques
volatils. Les plus performants sont inoculs par une souche choisie ou un mlange de
microorganismes.
Un lavage peut tre appliqu au sol avant passage dans le racteur. L'eau de lavage,
fortement charge en matriaux solides, peut tre partiellement rintroduite dans le racteur ou
traite part.
Les mthodes de dpollution en tas et de dpollution en bioracteur peuvent tre combines
en associant un compostage, une extraction et le traitement de la phase aqueuse dans laquelle est
transfre le polluant (Fig 22).
7.2.2.4 Lagunage et phytoremdiation
Certains sols pollus peuvent tre emboues et dpollus par lagunage. Le procd est moins
coteux que le traitement dans des racteurs boue. La phytoremdiation est principalement
utilise pour traiter des eaux usees, en particulier avec des plantations de roseaux. Toutefois on
peut galement envisager de dpolluer des les sols embous ou des sdiments de rivires ou de
mares par phytoremdiation.
62
7.2.3 Biormdiation des pollutions profondes: sous sol et eaux de nappe
7.2.3.1 Percolation et traitement in situ
Le traitement du sous-sol in-situ prsente l'avantage d'assainir un grand volume de sol sans pour
autant entraner les fortes dpenses (en quipement lourd et en main-d'uvre) lies l'excavation.
Elles permet de traiter simultanment les eaux de nappes et le matriau profond.
La mthode consiste essentiellement apporter au niveau de la zone contamine les
lments nutritifs et ventuellement l'oxygne ncessaire la stimulation de la microflore
autochtone. Le systme conceptuel (Figure 23), fonctionnant en boucle, comporte les lments
suivants:
Un systme physique permettant de rcuprer les produits non lis une phase non mobile;
Une tranche permettant de rcuprer la phase liquide (l'eau de nappe);
Une pompe amenant la phase liquide jusqu' un dispositif de rcupration o lui sont apport les
nutriments et o son pH est ajust si ncessaire et o elle elle peut tre are;
Un dispositif de rinjection diffrents niveaux dans la nappe superficielle ;
Des capteurs et des appareils de contrle permettant d'arrter le dispositif en cas d'urgence;
Des puits pour la vrification de routine du niveau de la nappe;
De tels systmes peuvent tre automatiss et amliors par l'addition d'un dispositif de
ventilation force pour augmenter l'oxygnation du milieu, et/ou un dispositif d'adjonction
d'inoculum (encore au niveau de la recherche ?).
Fig. 23. Reprsentation schmatique de la biodpolution du sous-sol et de la nappe par
stimulation de la microflore autochtone (d'aprs Baker et Herson, 1994)
R se rvoir
m la nge ur
Retour de l'ea u de pompa ge

Apport de nutriments,
corre ction du pH
Zone contamin e
63
7.2.3.2 Extraction et traitement ex-situ des polluants
On peut galement dpolluer le sous sol et les eaux de nappe par:
- percolation, pompage et biotraitement de l'effluent en surface
- extraction des composs volatils et traitement des effluents gazeux
La figure 24 prsente un schma synthtique d'un double dispositif qui utilise:
- une extraction par une pompe vide des effluents gazeux de la partie suprieure de la zone
pollue et traite ces effluents dans un biofiltre (voir section suivante) , et
- l'injection de nutrients dans la zone de pollution plus profonde et l'extraction des effluents
liquides qui sont traits en surface par un dispositif appropri (racteur ou digesteur).
Fig. 24. Schma synthtique d'un double traitement pour la dpollution d'un sous-sol et d'une
nappe contamins: extraction liquide et gazeuse et biotraitement des effluents.
(d'aprs Baker et Herson, 1994)
Apport de
nutriments
T raitement
de leau
Rseau d'apport de nutriments

Pompe
Entre
a vide
dair
T raitement Entre
des gaz
dair
Z one contamine
non sature
Z one contamine
sature
nutrimentsde l'eaudes gaz vided'aird'airsaturenon sature
64
Fig.25. Combinaison de technologies pour le traitement ex situ d'eaux de nappe contamines

par des COV (d'aprs Hardman et al., 1993)
Colonne
de
lavage
Humidificateur
Biofiltre
Air charg
en C.O.V.
Garnissage
Phase
gazeuse
pure
Pige
CO2
Pompe
air
Eaux uses
Eau
contamine
La figure 25 prsente une mthode de bioremdiation d'une eau contamine par des composs
organochlors volatils (COV). La premire tape est un traitement physique par insufflation d'air
travers l'eau pompe dans une colonne de lavage. L'eau traiter est ainsi dbarrasse du polluant
volatil qui est entrain par la phase gazeuse. La phase gazeuse est ensuite humidifie et traite par
passage, de bas en haut, sur une srie de biofiltres. Les produits de condensation des biofiltres sont
rcuprs en bas de colonne pour traitement additionnel ventuel, et la phase gazeuse pure est
galement dbarrasse de son gaz carbonique.
7.2.4 Biormdiation des effluents gazeux
Les mthodes connues de biopuration des effluents gazeux consistent faire absorber ou adsorber
les substrats traiter dans une phase liquide ou solide, puis les faire dgrader par une population
de microorganismes slectionns. Les microorganismes, une fois combins de faon approprie au
substrat traiter, en famille ou associs, s'avrent hautement efficaces contre les effluents soufrs
(H2S, SO2), chlors (HCl), ou organiques, en l'occurence les C.O.V. (composs organiques volatils)
responsables de la pollution photochimique de la plante et de la destruction de la couche d'ozone.
Mais ils sont aussi efficaces contre les odeurs (quelques microgrammes par m 3 suffisent pour la
dtection olfactive des mercaptans), autre domaine de prdilection de la biopuration.
Une unit de biodpollution d'effluents gazeux comporte donc une composante "absorbeur"
et une composante "module de traitement biologique", les deux composantes pouvant tre distinctes
ou combines.
65
Fig. 26 Reprsentation schmatique des principaux types d'absorbeurs et de laveurs colonne
Sortie
gaz
Effluent
liquide
Sortie
gaz
Effluent
liquide
Garnissage
2
1
Effluent
gazeux
Effluent
gazeux
Sortie du
liquide
pur
Sortie
gaz
Effluent
liquide
Sortie du
liquide
pur
Principaux types de
laveurs colonne
1: Colonne pulvrisations
2. Colonne garnissage
3. Colonne plateaux
3
Effluent
gazeux
Sortie du
liquide
pur
66
7.2.4.1 Les absorbeurs
Les absorbeurs peuvent se classer en deux grands groupes.
Les absorbeurs colonnes fonctionnent le plus souvent contre-courant et permettent des
temps de contact relativement longs entre la phase gazeuse et la phase d'absorption.
On en distingue trois types: pulvrisation, garnissage ou plateaux (Fig. 26). Ils sont
utiliss pour les ractions d'absorption lentes.
Les rendements d'limination des colonnes garnissage ou plateaux sont levs, mais les
possibilits de variations de dbit sont faibles.
Les absorbeurs colonnes peuvent soit tre relis un dispositif additionnel permettant une
biodpollution de la phase liquide, soit fonctionner directement comme biolaveurs.
Les absorbeurs venturi (Fig. 27), liquide ou gaz moteur fonctionnent co-courant
avec des temps de sjour trs courts, correspondant des ractions d'absorption de type instantan.
Ils assurent une bonne puration de l'ensemble des polluants particulaires ou vsiculaires.
Contrairement l'ensemble des autres laveurs, les absorbeurs liquide moteur fonctionnent de
faon satisfaisante dans une gamme de dbit trs tendue.
Les absorbeurs venturi ncessitent l'adjonction d'une unit de biodpollution.
Fig. 27. Schma d'un absorbeur venturi
Sortie
du gaz
Effluent
gazeux
Recyclage
de la phase
liquide
Venturi
jet
67
7.2.4.2 Les units de traitement biologique: biolaveurs et biofiltres
Les procds biologiques se distinguent en fonction de l'tat de la flore microbienne (cellules en
suspension ou immobilises) et de la phase aqueuse (mobile ou stationnaire).
Les biofiltres
Les biofiltres sont caractriss par une flore microbienne immobilise et une phase aqueuse
stationnaire. Les effluents gazeux sont purs lors de leur passage travers un milieu solide (tourbe,
compost, charbon actif) sur lequel sont fixs les microorganismes (Fig. 28). Une humidification
rgulire permet le maintien d'une activit de l'eau (Aw) compatible avec la biodgradation.
Les conditions arodynamiques doivent tre celles d'un racteur quasi-piston (coulement
homogne). Le flux de gaz y est ascendant. L'indice de vide du racteur a une valeur de 0,5 0,9
suivant le garnissage employ. La perte de charge y est faible. Pour la tourbe par exemple, elle
reprsente quelques centimtres d'eau. Le racteur reoit un gaz plus ou moins humide mais l'air
vacu exporte de l'eau, or la biomasse requiert une humidit maintenue. Il faut donc humidifier le
racteur, soit par humidification artificielle du gaz entrant, soit par arrosage du support. Les
substrats requis sont dtermins en fonction de la composition du gaz, des mtabolites forms, du
support employ et surtout de la biomasse choisie (en suspension dans l'eau ou fixe sur support).
Les travaux de recherche et dveloppement portent principalement sur l'emploi de tourbe en
vrac ou conditionne, allge et structure. Des matriaux inertes - pouzzolane, argiles, polymres et des matriaux consommables - carbonates compost - sont galement utiliss. Il est possible
d'employer le charbon actif, mais il reclame une comptence particulire.
Rustiques et peu onreux les biofiltres ont cependant pour inconvnient leur grand volume.
La figure 29 prsente le schma d'une installation destine liminer les effluents odorifrants
d'une usine d'une usine d'quarissage.
Fig. 28. Reprsentation schmatique d'un biofiltre

Ga z purifi
Apport a va l:
e a u, nutrime nts
Ga rnissa ge
Re cycla ge
ve ntue l
Ga z
pure r
Eva cua tion

Apport a mont
ve ntue l
68
Fig. 29. Exemple de projet d'installation pour biopuration des effluents gazeux d'un usine
d'quarissage par biofiltre sur tourbe.
1. Btiment
2. Arateur
3. Filtre poussires
4. Mlange de tourbe fibreuse
et de matriau structurant
5. Puisard
2
3
1. Batiment
4: Biofiltre
Pente < 2%
5
Les biolaveurs
Dans les biolaveurs, le solut dtruire est transfr un liquide appropri dans un racteur
colonne ou venturi. Le temps de contact entre les phases gazeuses et liquide est de l'ordre de 1
20 secondes avec des vitesses superficielles de 0,1 0,2 m/s.
Les biolaveurs fonctionnant l'eau sont adapts aux polluants hydrosolubles, de dbit faible
et assez constant.
Dans les biolaveurs pulvrisation et plateaux, les cellules sont en suspension, et l'on
procde par lavage du gaz l'aide d'eau charge en biomasse. L'eau recircule dans la colonne
d'absorption, avec une concentration en boue active comprise entre 1 et 10 g/l. La biodgradation
peut tre effectue dans un racteur annexe alors que la biomasse est recycle.
Les biolaveurs cellules immobilises sont constitus par une colonne garnissage qui
favorise la formation d'un biofilm. Le polluant est transfr de la phase gazeuse vers la phase
aqueuse, puis vers le biofilm. La phase aqueuse est recycle aprs dcantation sur le garnissage:
cette possibilit de rgnrer la phase liquide est un atout des biolaveurs. La technique a aussi
l'avantage d'liminer de faon continue les mtabolites toxiques forms lors de la minralisation du
polluant, de permettre la rgulation facile du pH et de la temprature, et de faire les apports en
nutriments.
69
Fig.30. Reprsentation schmatique des deux types de biolaveurs solvant organique

(d'aprs Martin, 1993)
Effluent
gazeux
Effluent
gazeux
Solvant
Transfert
et
puration
Transfert
Biopuration
Sparateur
solvant/eau
Purge
Sparateur
solvant/eau
Biopuration
complmentaire
ventuelle
Purge
Si le polluant n'est pas hydrosoluble, on utilise un systme de biolaveur ternaire, air-solvant

de transfert-racteur, en ralisant une rgnration du solvant. On adopte des racteurs dits phases
inverses, o un solvant organique appropi (huile de silicone , phtalates ...) qui a pour objet de
solubiliser le polluant et de constituer une phase tampon o la concentration en substrat peut tre
100 1.000 fois suprieure celle de la phase aqueuse, tout en vitant les phnomnes d'inhibition.
Le solvant doit avoir les proprits suivantes: ne pas tre biodgradable, possder une faible tension
de vapeur et bien solubiliser le polluant, ne pas tre miscible l'eau et enfin ne pas tre toxique pour
les microorganismes.
Aprs avoir assur le transfert du polluant, le solvant est rgnr au contact d'une biomasse.
Deux stratgies sont possibles: soit la recirculation d'un liquide pauvre en biomasse, soit la
recirculation d'une liqueur mixte (Figure 30).
Des essais raliss avec un laveur de gaz venturi travaillant en milieu biphasique eau/huile
de silicone ont montr que pour un dbit d'air de 350 vvh charg 1 g/m3 de tolune, on pouvait
dgrader 8 kg par m3 et par jour, avec une efficacit comprise entre 95 et 98%.
7.2.4.3 Potentialits et orientations de choix
La bioremdiation permet de traiter des effluents gazeux faible teneur en poussire, avec des
charges organiques infrieures 2 g/m 3 , et des tempratures comprises entre 10 et 45C. La
gamme des produits mtaboliss est importante. Parmi les composs traits avec succs, on peut
citer les alcools, les aldhydes, les ctones, les acides organiques, les amines, les thers, les esters,
les thiols, les hydrocarbures aromatiques et aliphatiques, et les mercaptans .
70
Les procds reposent sur le transfert du polluant gazeux un fluide ou un support humide
o sont fixs les microorganismes (ou un film liquide autour des microorganismes). Il dpend
aussi du mtabolisme du compos, de l'vacuation des mtabolites et enfin, de la maintenance d'une
biomasse efficace. Selon le contexte, les concentrations et les proprits des composs entrants et
forms on aura recours aux biofiltres ou aux biolaveurs. Si un compos entrant est toxique ou
gnant (car modifiant le transfert), on effectuera un prtraitement. Si le polluant est concentr, il
peut tre conomique de raliser un prlavage (avec ou sans oxydant) avant la biofiltration ou le
biolavage. Enfin, dans certaines situations, on pourra avoir recours des racteurs supports
consommables.
Les dgradations de solvants chlors (dichloromthane, ttra- et trichlorothylnes,
thichlorothane) conduisent la production d'acide chlorhydrique. Ce dernier est difficile
neutraliser dans les biofiltres, qui s'empoisonnent progressivement. Dans les biolaveurs, l'acide
chlorhydrique peut tre neutralis et la solution de lavage rgnre facilement.
Dans la gamme de concentrations indiques, l'efficacit des biofiltres et des biolaveurs est
souvent suprieure 90% pour des temps de rsidence variant entre 10 et 100 secondes, et les dbits
traits peuvent atteindre 100.000 m 3 par heure et par installation de traitement. Le contrle de
l'activit microbienne et du rapport croissance/minralisation est ralis par l'apport d'une solution
minrale permettant de travailler dans des conditions d'excs ou de dfaut d'azote et de minraux.
Tableau 24. Facteurs influenant la biodpollution et mthodes de caractrisation

(d'aprs Sturman et al. 1995)
Echelle
Mthodes de caractrisation
Facteurs
reprsentatives
Echelle microscopique:
Microorganismes
Voies de dgradation
Stochiomtrie des ractions
Cintique des ractions
Accepteurs d'lectrons
Nutiments
Inhibiteurs, toxicit
Activit de l'eau, pH
Ractions avec le sol
Ractions avec la matrice de l'aquifre
Equilibres chimiques
Sorpsion (quilibre)
Comptages directs et indirects, sondes gntiques

Etudes en batch
Etudes en batch
Etudes en batch
Analyses chimiques pour N et P
Analyses chimiques
Etudes en batch
Electrodes lectrochimiques
Etude des ractions abiotiques
Etude des ractions abiotiques
Etude abiotiques en batch
Echelle moyenne:
Sorption (non l'quilibre)
Attachement et dtachement des bactries
Diffusion
Colmatage/filtration
Transport entre phases
Etudes de biofims, numrations de organismes

Etudes en colonnes monophasiques
Etudes en colonnes multiphasiques
Echelle macroscopique:
Advection
Dispersion
Htrogneit spatiale
Proprits hydrologiques et limites
Etudes base de prlvements et de traceurs

Etudes base de traceurs
Carottages
Etudes base de prlvements et de traceurs
71
Fig. 31. Reprsentation schmatique des diffrentes chelles d'observation pour l'tude de la
biodpollution. (d'aprs Sturman et al. 1993)
Injection
Pompage
Sol et sous-sol
Nappe
Concentrations
l'entre:
Substrats
Cellules
Oxygne
Concentrations
la sortie:
Substrats
Cellules
Oxygne
Attachement/Dtachement
Adsorption/Dsorption
Filtration/colmatage
Flux
7.3 ETUDES DE FAISABILITE

7.3.1 Apprciation de la faisabilit
La faisablit d'un procd de bioremdiation est essentiellement fonction de(du):
- choix de la microfore mettre en uvre et l'adaptation de cette microflore au polluant;
- l'efficacit de la microflore, in situ ou dans un racteur;
- choix du procd, et de sa rentabilit sur le plan conomique.
A priori, il est plus facile de traiter:
- un polluant sur son site d'mission (un effluent en sortie d'usine, par exemple) que lorsqu'il
s'est dispers sur et dans le site;
- un effluent dans lequel le xnobiotique repr est le seul produit liminer. Le traitement
d'une contamination multiforme est bien plus complexe, car il doit se faire non plus par l'action d'un
seul groupe microbien, mais par celle d'une microflore multiple (des consortiums naturels ou des
cocultures, dont la composition est souvent mal dfinie, et varie en fonction des paramtres de
l'environnement).
Ceci n'est pas toujours possible (pollutions diffuses, intervention de plusieurs microflores),
ce qui conduit le plus souvent une tude prliminaire relativement complexe.
72
La complexit du suivi des processus de biodpollution dans les milieux naturels est donn
par l'analyse des 3 chelles d'observation dfinies par Sturman et al. (1995), applicables au cas o la
bioremdiation se fait in situ (Fig 31): chelle microscopique (quelques microns ou dizaines de
micron), chelle moyenne (celle de la taille des pores du sol et de la granulomtie de ses
constituants), chelle macroscopique (celle de l'observateur).
Le dtail des processus prendre en compte pour la bioremdiation et les mthodes pour
estimer les effets facteurs impliqus sont prsents au tableau 24.
D'une faon gnrale, l'estimation de la faisabilit passe par 4 tapes:
1 . Recherche du(des) microorganisme(s) - seul ou en mlange- le(s) plus
performant(s);
2. Tests de laboratoire pour dfinir les conditions optimales de la dgradation (2) et
le dispositif appropri;
3. Contrles de l'efficacit du procd.
4. Estimation financire: cot (par m 3 de fluide ou par tonne de sol) de l'installation
et des frais de fonctionnement.
1 - Recherche des microorganismes performants
Les micro-organismes provenant de collection sont adapter progressivement au substrat, en
utilisant un inoculum important apte se multiplier sur un milieu minimum.
Si des souches de collection ne sont pas disponibles, les microorganismes doivent tre isols
partir d'chantillons d'eaux uses, de nappe ou de sols. Dans ce cas, on effectue les isolements
partir de cultures d'enrichissement en prsence de polluant des concentrations comprises entre les
deux seuils dfinis prcdemment (seuil minimum, seuil de toxicit). Les cultures d'enrichissement
peuvent tre effectues en milieu liquide, dans des colonnes de percolation ou sur un support inerte.
Fig.32. Dispositif de laboratoire pour l'tude de la biodgrabilit en conditions anrobies et
arobies combines
Racteur
anarobie
Racteur
arobie
Biogaz
pH
mtre
Effluent
contamin
Effluent
dpollu
Effluent
partiellement
dcontamin
T ampon
phosphate
Air
73
2 - Dtermination des conditions optimales de la dgradation et du dispositif le plus appropri
Les tests de laboratoire ont pour but de dfinir:
les conditions optimales de croissance (temprature, pH, oxygnation),
les limites de viabilit des micro-organismes (seuls ou en association),
les chaines mtaboliques
la
composition
du
milieu
minral
minimum
(afin
dterminer
minimales des additifs ajouter l'eau ou au sol traiter).
les dispositifs le mieux adapt. On peut parfois tre amen dfinir des dispositifs complexes
comme celui reprsent la Figure 32, dans lequel on traite une eau contenant du 2,4, 6trichlorophnol (2,4,6-TCP) qui est d'abord dhalogne une premire fois par une microflore
non dfinie, en anarobiose, pour donner 100% du 4-chlorophnol (4-CP), lequel est ensuite
partiellement dhalogn, en arobiose, par des Pseudomonas.
3 - Contrles
Ils ont pour but:
de comparer les rsultats obtenus au laboratoire diffrents tmoins (milieux non inoculs ou
striliss, milieux contenant des particules pouvant fausser les rsultats par adsorption du
polluant, etc) ,
de suivre les cintiques de croissance microbienne et de disparition du polluant,
de dterminer la nature et les quantits rsiduelles des produits issus du mtabolisme, et
d'effectuer l'analyse cotoxycologique des fluides dpollus en bioracteurs (traitement ex
situ) ou celle des eaux traites in situ..
4 - Etude conomique
L'tude conomique commence quand les donnes prcdentes ont t obtenue au laboratoire. Elle
doit inclure le cot de ces tudes initiales, et le plus souvent, celui d'une tape intermdiaire,
galement onreuse, l'installation-pilote. Le passage par un pilote est aussi une ncessit technique.
7.3.2 Changement d'chelle (Scalling-up)
Le "scalling-up" (c'est--dire le passage une chelle de grandeur suprieure) consiste extrapoler
les rsultats obtenus au laboratoire des installations relles. Le problme se pose deux niveaux :
*1) Le passage du dispositif de laboratoire un bioracteur pilote, puis une installation de
taille industrielle, dans lequel les paramtres favorables peuvent tre plus difficiles matriser.
Tableau 25. Influence de l'chelle d'tude sur la demi-vie de diffrents polluants.
Demi-vies (jours)
Polluant
Rfrence
in vitro
in situ
rapport
42
397
9,5
Essence avion
Huling et Bledsoe, 1990
4
23
6,4
Essence et TPH
Block et al., 1991
28
111
4,0
Benzne
Barker et al., 1987
6
42
6,8
Tolune
Hutchins et al., 1991
6
55
9,8
m, p-xylnes
10
73
2,3
BTEX*
Chiang et al., 1989
BTEX = benzne, tolune, thylbenzne, o,m,p-xylnes; TPH = total petroleum hydrocarbons
* 2) Le passage une bioremdiation in situ prsente des difficults particulires, lies au
fait que l'on constate (Tableau 25) que la dure de demi-vie d'un polluant est gnralement
suprieure dans un biotope naturel que dans un dispositif de laboratoire dans lequel il est plus facile
de contrler tous les paramtres favorables la microflore mise en uvre.
7.3.3 Vrification de l'efficience de la mthode
La bioremdiation peut tre mise en vidence par diffrentes mthodes (Tableau 26):
la
74
1 . Diminution des teneurs en polluant ou sa disparition totale: Cette mthode est fiable au
laboratoire, condition qu'il n'y ait ni volatilisation ni adsorption du polluant, mais rarement
utilisable in situ, o de nombreux phnomnes physico-chimiques peuvent contribuer au pigage
du compos.
2. Apparition d'un mtabolite intermdiaire: Cette mesure est un bon indicateur de biodpollution
au laboratoire. In situ, il faut vrifier que ce produit n'tait pas dj prsent et apport par une
source de pollution.
3. Utilisation du 14 C: Le carbone marqu du compos initial se retrouve sur le CO 2 . Cette mthode
est parfaitement adapte aux biodgradations conduisant une minralisation, dans la mesure on
peut procder la rcupration des gaz. Elle est plus facile utiliser au laboratoire qu'in situ.
4. Augmentation de la biomasse dpolluante (autochtone ou introduite): Cette mthode est fiable au
laboratoire si l'on a montr, dans un modle simplifi, que le polluant est la source de carbone (et
la seule disponible dans le racteur) pour cette microflore et/ou une source d'nergie. Elle est
inutilisable si la dgradation du polluant se fait par comtabolisme.
5. Disparition d'un additif minral (azot ou phosphor) introduit pour stimuler la microflore: Cette
mthode est applicable au laboratoire, pour des microflores dfinies. In situ, elle ne constitue
qu'une prsomption de preuve, car des micro-organismes de la microflore autochtone incapables
de dgrader le polluant peuvent galement utiliser ces additifs.
6. Augmentation significative du rapport "fraction dgradable/ fraction rcalcitrante": Dans le cas
o l'effluent traiter contient plusieurs polluants, dont un au moins est connu pour tre
inaccessible la microflore teste, ce calcul indique que la dpollution est certaine dans un
dispostif de laboratoire, mais, in situ, dans le cas d'une inoculation, ne constitue pas une preuve
qu'elle est le fait de la microflore introduite.
7. Disparition d'un accepteur d'lectron: Cette mesure est surtout un indicateur de la dgradation de
la matire organique non contaminante et d'une activit microbienne en gnral.
8. Augmentation d'une microflore non implique dans la biodgradation, mais prdatrice de la
microflore dpolluante, ou inhibe par la prsence du contaminant dans le biotope: Cette
constatation, uniquement possible dans un biotope naturel, peut constituer une mesure indirecte
d'un effet dpolluant.
75
Tableau 26. Mthodes utilises pour dmonter la biodgradation d'un polluant.

Mthode
Validit et problmes
d'estimation de la
biodgradation
Diminution de la Au laboratoire: valide en fonction du
concentration en contrle. La volatilisation est souvent un
polluant
problme.
In situ: gnralement non utilisable en raison
des nombreuses causes de dgradation
abiotiques.
Perte d'un accepteur Au laboratoire et in situ: peut indiquer la
d'lecrons
dgradation de matire organique non
contaminante (en particulier aprs apport de
N et P). Un tmoin satisfaisant est difficile
raliser in situ.
Au laboratoire: meilleure mthode de
Dosage du 14CO2
dmonstration de minralisation si un bon
contrle est utilis
Rfrences
Barles et al., 1979
Dibble et Bartha, 1979
Kilbane et al., 1983
etc.
Zeyer et al., 1986
Chiang et al. 1989
Pfaender et
Bartholomew 1982
Spain et Van Veld, 1983
14
In situ: difficile utiliser (pigage du CO2 Kuhn et al., 1988
difficle).
etc.
Croissance
d e Au laboratoire et in situ: constitue une Wyndham et Costerton,
microorganismes
indication forte mais non une preuve de la 1981
capables de dgrader biodgradation, en particulier in situ.
Spain et Van Veld, 1983
le polluant
Epuisement
nutriments (N,P)
d e Au laboratoire: indication d'une activit

microbienne
In situ: constitue une indication et non une
preuve, surtout si des substrats alternatifs sont
prsents.
Production
d e Au laboratoire et in situ: mthode efficace si
mtabolites
l'on a pu vrifier initialement l'absence du
intermdiaires
mtabolite intermdiaire dans le milieu.
Rapport compos Au laboratoire et in situ: la mthode la plus
dgradable/compos
commune est le rapport C17/pristane. La
non dgradable
validit dpend de la persistence du pristane
dans le milieu.
Croissance
d e Au laboratoire et in situ: la croissance de
prdateurs
d e s protozoaires prdateurs est considre
microorganismes
comme une mesure indirecte de celle des
dgradant
l e microorganismes dgradant le polluant mais
contaminant
ces derniers ne sont pas les seuls a tre
utiliss par les protozoaires.
Jamison et al., 1975

Odu, 1978
Swindoll et al., 1988
Dasapa et Loer, 1991
Wilson et al., 1989
Pritchard et Costa, 1991
Madsen, 1991
76
Tableau 27. Polluants pour lesquels des procds de

biormdiation ont t employs avec succs
(d'aprs Skladany et Metting, 1993).
Ptrole brut
Hydrocarbures ptroliers
- Essence
- Diesel
- Essence avion
Benzne, xylne, tolune, thylbenzne (BTEX)
Produits protecteurs du bois
- Pentachlorophnol (PCP)
- Crosote
Solvants
- Actone
- Butanol
- Ethylne glycol
- Chlorure de mthyle
- Trichlorthylne (TCE)
77
8. EXEMPLES PRATIQUES
8.1 INTRODUCTION: LES SUCCES DE LA BIOREMEDIATION
Le Tableau 27 prsente la liste des polluants pour lesquels des procds de biormdiation
ont t employs avec succs dans des dispositifs in situ. Il s'agit surtout de produits ayant donn
lieu des pollutions spectaculaires et extensives ou frquentes et pour lesquels des procds de
dpollution ont t recherch depuis un certain nombre d'annes. Il s'agit essentiellement:
- de ptrole brut, le plus souvent dverss accidentellement dans les milieux marins (mares
noires) ou les sous-sols et les nappes, d'o ils peuvent tre enlevs sans difficults majeures, s'ils ne
constituent pas des dpts pteux avec les roches meubles.
- d'hydrocarbures ptroliers gnralement infiltrs dans le sous-sol des usines de traitement,
aires de stockage et aroports
- de produits de traitement du bois, qui ont donn lieu des pollutions du sol
particulirement importantes dans les ateliers de traitement des poteaux tlgraphiques, des
traverses de chemin de fer, et des bois de construction.
- de substances chimiques diverses rencontres dans les nappes: composs benzniques
(BTEX), solvants et deux organo-chlors, le tri-chlorothylne ou TCE tant la russite la plus
cite).
Cette liste est bien infrieure celle des produits polluants dont on a dmontr au laboratoire
qu'ils pouvaient tre biodgrads soit par des consortia produits partir du sol ou des eaux de nappe
phratique, soit par des souches pures. La gamme de produits polluants biodgradables en
arobiose (Tableau 20), en anarobiose (Tableau 21) ou dans les deux conditions (Tableau 15) est
trs tendue.
Tableau 28. Biormdiation de boues contenant des
rsidus ptroliers et des graisses par lagunage et
aration
d'aprs Vail, 1991; cit par Alexander, 1994
Compos
Benzne
Tolune
Ethylbenzne
Naphtalne
Phenanthrne
Pyrne
Anthracne
Benzoanthracne
Chrysne
Benzopyrne
Concentration (mg/kg)
Initiale
Finale
64.4
1.19
19.4
1.14
32.4
0.32
290
ND*
150
ND
540
0.03
20
0.02
91
ND
20
ND
100
0.01
78
8.2 BIOREMEDIATION DU SOL EX SITU

Le traitement par pandage ("landfarming") est utilis avec succs pour traiter des sols
pollus par des dchets ptroliers.
Le compostage est utilis avec succs sur des sols contamins par des produits protecteurs
du bois (PCP, crosote) des carburants, des poudres propulsives et des explosifs.
La dpollution de sols contamins par des rsidus ptroliers et des graisses a pu galement
tre ralise par lagunage (Tableau 28).
8.3 BIOREMEDIATION DU SOUS-SOL ET DES NAPPES PHREATIQUES
8.3.1 Biormdiation in situ
Semprini, Mc Carty et leurs collaborateurs ont mis au point une technique qui teste in situ
biodgrade les organochlors suivants : trichlorothylne, cis-dichlorothylne, trans dichlorothylne et un degr moindre le chlorure de vinyle, dans une nappe confine, situe sous
une base arienne de Californie (Tableau 29).
Tableau 29. Taux de transformation du chlorure de vinyle, trans-1,2-DCE ; cis-1,2-DCE et
TCE obtenu sur le Moffett Naval air Station, mountain View, California.
Puits
S1
S2
S3
P
Pourcentage de transformation (%)

Chlorure
de vinyle
85
96
95
87
trans-1,2dichlorothylne
85
90
90
80
cis-1,2dichlorothylne
31
41
43
47
TCE
10
17
19
10
Par injections alternes d'air ("bioventing") et de mthane, ils ont augment les niveaux de
population de bactries mthanotrophes qui dgradent ces produits par comtabolisme (cf. section
6.2.2). Des mesures successives dans des puits de prlvements ont confirm que la russite relative
du procd tait bien lie la cintique de la roxydation du mthane et que l'installation de
conditions d'arobiose tant un pralable la mise en oeuvre du processus. La dpollution est
cependant lente, puisque les niveaux acceptables ont t atteints aprs trois annes de traitement.
79
8.3.2 Percolation et traitement ex-situ du percolat
Un dispositif grande chelle a t mis au point pour dpolluer le sous-sol et les nappes phratiques
de la valle du Rhin soumis une pollution diffuse et rmanente rsultant des bombardements des
usines chimiques ou productrices de carburants de substitution pendant la seconde guerre mondiale.
(Fig. 33) Ces polluants, contenaient une grande varit de composs (benznes et drivs: tolune,
o-et p-crsol et des composs phnols) pigs en profondeur, dans des nappes froides et trs peu
oxygnes. Ils n'avaient t que peu dgrads par l'auto-puration naturelle qui pour ces produits, se
fait essentiellement en arobiose.
Fig. 33. Schma du dispositif de bioremdiation d'une zone contamine par des
hydrocarbures dans la valle du Rhin. (d'aprs Jrgensen, 1991).
Pompa ge de l'a quif re infrieur
Filtre s sable
N itrate
Aquifre suprieur
R ejet en
amont
Hydroca rbure s
a monten a va l
C ouche d'a rgile
Pompa ge
en
a va l
80
La figure 34 prsente un dispositif de biodpollution ex situ, mis au point pour biodgrader des
effluents aqueux contamins par du TCE. Le procd consiste favoriser le dveloppement de
bactries mthanotrophes par apport d'eaux charges en mthane et en oxygne.
Fig. 34. Dispositif de dpollution d'eaux uses charges en TCE, par stimulation de la
microflore mthanotrophe dans un racteur lit expans (Systme MAFEB)
d'aprs Nelson et Jewell 1992).
Effluent dpollu
(< 1mg N/l; < 1mg P:l)
Systme
d'alimentation
en mthane et de
recyclage
3300 m 3/jour
Z one de
clarification
Racteur
lit
expans:
temps de
rsidence:
3,6h
20g COV/l
p= 70 PSI
V = 40 m 3
67 m 3/mn
Effluent: 4000 m 3/jour
(30 mg N/l; 6 mg P:lP/l)
Systme
d'alimentation
en oxygne et de
recyclage
3300 m 3/jour
p= 70 PSI
V = 40 m 3
120 m 3/mn
Production de boues:
2000 kg VS/jour
81
8.4 BIOREMEDIATION DES EFFLUENTS GAZEUX

La bioremdiation permet de traiter des effluents gazeux faible teneur en poussire, avec des
charges organiques infrieures 2 g/m 3 , et des tempratures comprises entre 10 et 45C.
La gamme des produits mtaboliss est importante. Parmi les composs traits avec succs,
on peut citer les alcools, les aldhydes, les ctones, les acides organiques, les amines, les thers, les
esters, les thiols, les hydrocarbures aromatiques et aliphatiques, et les mercaptans.
Les biofiltres sont galement utiliss avec succs pour dsodoriser des effluents gazeux
provenant rseaux d'gouts, de stations d'puration des eaux, d'usines agro-alimentaires et
chimiques.
Dans les effluents gazeux provenants de rseaux d'gouts, la concentration d'hydrogne
sulfur peut varier de 20 mg/m3 150 mg/m3. Il faut donc utiliser des procds grande inertie.
Depuis une dizaine d'annes, l'usage de la procdure de biodsodorisation des effluents
gazeux de stations d'puration par passage sur lit de tourbe conditionne et structure avec apport
d'eau et de substrats s'est considrablement dvelopp en France (Tableau 30). Ce mme procd
peut tre utilis pour les btiments d'levage et fosses de stockage de djections animales.
Tableau 30. Bilan sur 24h de dsodorisation des effluents gazeux

d'une station d'puration des eaux
Composs
Sulfures totaux (mg H2 S/m3)
Sulfure d'hydrogne (mg/m3)
Mthyl-mercaptan (g/m3)
Dimthyle sulfure (mg/m3)
Ammoniac (mgN/m3)
Azote organique (mgN/m3)
Seuil olfactif (uo/m3 air)*
Amont du
lit de tourbe
4,10
3,30
1,07
>0,03
1,20
0,20
4064
Aval du
lit de tourbe
0,02
<0,01
<0,01
<0,03
0,02
0,01
154
Rendement
(%)
98,7
>99
>99
98,3
95,0
96,4
* : uo = units odeur
La biodpollution est aussi utilisable pour des effluents gazeux provenant d'ateliers o la
biomasse (ou les bioproduits) sont l'objet de premire ou de seconde transformation: laiterie,
fromagerie, atelier de fermentation de boissons, torrfaction, quarrissages, usine de transformation
de poissons, suiferie, cuisine industrielle.
Les composs mis diffrent selon les activits mais appartiennent toujours aux familles de
produits azots, soufrs, carbonyls, carboxyls et aux alcools... Quelques substances sont
htrocycliques, cependant les substances aliphatiques biopurables sont majoritaires.
La biopuration offre une alternative aux procds physico-chimiques (incinration,
adsorption, lavage oxydant ...). Le choix de la mthode (biofiltres ou biolaveurs) est dict par la
concentration, le dbit, l'environnement de l'usine et la technicit de l'entreprise. Gnralement, les
composs sont hydrosolubles, et il n'est pas alors utile d'employer un solvant tiers.
En France, plus d'une vingtaine de sites fonctionnent avec des racteurs tourbe ou des
biolaveurs (Tableau 31).
82
Tableau 31. Exemples de traitements par biofiltres (d'aprs Diks, 1992)
Usine
Dbit
de gaz
(m3/h)
Elimination
Nb d'
Temps Efficacit
tages de rsidence (%)
(*)
(secondes)
Glatine
Cacao-chocolat
Farine de poisson
Tabac
35 000
10 000
40 000
30 000
0,6 - 1
2
1
2
12 - 21
22
20
14
70 - 93
99
50 - 90
95
Traitement des eaux
10 000
29
90 - 95
Produits aromatiques
Peinture
Pharmaceutique
25 400
11 700
7 500
Odeurs non spcifies

Odeurs non spcifies
Odeurs: 230 mg C/m3
Odeurs: NH4 (1,5mg/m3 )
nicotine (3,5 mg/m3 )
Odeurs: 10mg/m3
Actone (8mg/m3 )
Odeurs (105 uo/m3 )*
Solvants org. (1,8 mg/m3 )
Solvants organiques
(aromatiques, aliphatiques,
et chlors)
Solvants org. (400 mg/m3 )
Odeurs d'huile (105 ou/m3 )
Ethanol
Benzne (9mg/m3 )
2
2
3
22
38
108
98
90
80
2
2
1
1
30
20
8
30
75
93
98
96
Film (production)
Alimentaire
Cramique
Fonderie
140 000
9 000
30 000
40 000
*: un tage = 1m de lit filtrant; ** : uo = units odeur
Sous la pression lgislative, les industries chimiques s'intressent aussi la bioremdiation

pour le traitement de leurs effluents contenant des COV. Leurs missions, en France, sont de l'ordre
de 2,5 millions de tonnes par an, dont 30% pour les seules industries utilisatrices de solvants
(peinture, imprimerie, chimie des plastiques. adhsifs...).
Les solvants d'imprimeries - actates et alcools des concentrations de 1000 5000 mg/m3
sont biopurs sur granules de tourbe. Les effluents d'industrie pharmaceutique, peintures, synthse
de rsines. etc. sont traitables sur biofiltre avec de bons rendements. Les gaz de fonderies sont
traits par des biolaveurs.
83
9. ASPECTS FINANCIERS, RENTABILITE

9.1 LE MARCHE DE LA DEPOLLUTION
Avec un chiffre daffaire en France de 138 milliards de francs en 1996 et prs de 300000 emplois,
les activits de protection de lenvironnement sont devenues une vritable industrie. Au niveau
communautaire, le march de lenvironnement tait estim en 1994 580 milliards de francs.
(Sourec: lEnvironnement n 1368/5 1997)
Selon l'UPDS (Union professionnelle de la dpollution de sites) le march franais de la
dpollution des sols, hors incinration et mise en dcharge, se chiffrerait en 1995 350 millions de
francs qui se dcomposent en 150 millions pour la partie ingnerie (diagnostic et maitrise d'oeuvre)
et 200 millions pour la ralisation des travaux proprement dite. (souce: L'usine nouvelle Janv. 1997
p33)
9.2 LES COUT RELATIF DES METHODES
La bioremdiation est souvent applicable sur le site (bioremdiation in situ) ou proximit
immdiate (quand des installations ex situ sont ncessaires), ce qui rduit les cots de transport et de
manutention.
Par contre, la bioremdiation est une technologie qui demande une approche scientifique
multidisciplinaire. Elle doit tre adapte cas par cas aux diffrentes situations. Pour cette raison, le
cot des tudes prliminaires pour la caractrisation du site dpolluer, et les tudes de faisabilit
sont gnralement nettement plus levs que ceux des mthodes conventionnelles.
Comme pour toutes les techniques de dpollution, il convient de d'effectuer un suivi du
procd. Par rapport aux mthodes classiques, le suivi de la bioremdiation doit ajouter des tudes
microbiologiques qui en augmentent le cot.
La comparaison de diffrentes mthodes de dpollution de sols et de nappes (Tableaux 32 et
33) montre que les processus de bioremdiations ont gnralement un cot relatif modr .
11Le cot de dpollution varie de 15 FF m-2 en friche minire 100 FF m-2 en zone urbaine.
Source: L'Environnement *** 1998 p 20-21.
Tableau 32. Estimation du cot de diffrentes mthodes de dpollution

(d'aprs Bull, 1992; cit par Harman et al. 1993)
Technologie
Dcharge (UK)
Dcharge (USA)
Incinration sur le site (USA)
Incinration hors site (USA
Lavage de l'air (air stripping)
Lavage du sol (soil washing)
Bioremdiation
Fourchette du cot par m3 (FF)

200 - 960
800 - 1600
600 - 2400
800 - 4000
160 - 400
280 - 800
40 - 600
84
Tableau 33. Cot relatif de diffrentes mthodes de dpollution des sols et des nappes.
(d'aprs Preslo et al., 1989; cit par Skladany et Metting, 1992)
Technologie
Cot
relatif
Conditions d'utilisation
Limitations
Mthodes in situ
Volatilisation
Bas
Appliquable seulement
aux COV
Biodgradation
Modr
Lessivage
Vitrification
Remdiation passive
Confinement
Modr
Elev
Bas
Bas
Modr
Mise en places de tuyaux de

ventilation (6-10m x 8) sans
traitement de l'effluent gazeux
Trois puits d'extraction et galeries
d'infiltration, dbit env. 3mm/sec
idem
Rserv aux produits radioactifs
Pas d'autre alternative
Utilisation d'un film plastique, de
sol, de benthonite. Pas de muret
Idem + muret
Modr
Sur site. Equipement spcifique
Une partie du pollant

reste sur place
Elev
Sur site. Equipement mobile lou
Ncessite des
quipements spciaux
Bitumage
(enrobage)
Solidification
Modr
Sur site. Frais de transport du

bitume ajouter
Modr
Traitement de la
nappe
Bas
modr
Extraction chimique
Excavation et mise en
dcharge
Elev
Modr
lev
Equipement lou. 30% de ciment

et 2% de silicate de Na
Insufflation d'air et de nutriments
carbons, sans traitement de
l'effluent
Sur site. Equipement mobile lou
Cots variables suivant le
transport et la proximit de la
dcharge
Mthodes ex situ
Bioremdiation par
compostage
Traitement thermique
Cot relatif: bas < 50F/m3 ; modr: de 50 500 F/m3 ; lev > 500F/m3 .
Processus lent initier

Rarement utilis
Cot lv
Rsultats variables !!!
Le polluant reste sur
place.
idem
Rarement utilis
Processus
gnralement lent
initier
Rarement utilis
Responsabilit sur le
long terme
85
10. CONCLUSION: AVANTAGES, LIMITATIONS ET PERSPECTIVES

10.1 AVANTAGES DE LA BIOREMEDIATION
Elle est souvent applicable sur le site (bioremdiation in situ) ou proximit immdiate (quand
des installations ex situ sont ncessaires), ce qui rduit les cots de transport et de manutention.
Elle perturbe gnralement moins le biotope que les mthodes physico-chimiques (sauf pour les
sols excavs).
Elle limine le polluant en permanence et, applique in situ, rend le biotope apte relancer un
processus d'auto-puration en cas de nouvelle pollution du mme genre.
Elle limine les effets long terme possibles avec les mthodes fondes sur le confinement.
On peut associer, dans une chaine de traitement, plusieurs techniques biologiques (exemples: un
composteur et un biofitre; deux ou plusieurs racteurs en cascade, etc)
Les techniques biologiques peuvent galement tre couples aux techniques de dpollution
physico-chimiques.
10.2 LIMITES TECHNIQUES
La bioremdiation se heurte des difficults techniques multiples lies :
la nature, la concentration et le volume des produits traiter. Les microflores sont plus
efficaces des dilutions relativement faibles, situes entre un seuil minimum ncessaire pour
induire l'activit enzymatique (ou un comtabolisme) et un seuil maximum inhibiteur de l'activit
microbienne .
la non existence ou aux difficults d'adaptation des souches indignes et/ou l'obtention de
souches efficaces in situ.
l'htrognit de la dispersion du polluant dans le biotope, lie elle-mme la nature du soussol et la porosit de celui-ci. Dans certains sols trs htrognes sur le plan granulomtrique, la
circulation (naturelle ou force) des fluides (gaz et eaux) utiliss pour une dpollution in situ se
fait uniquement par les zones de grande permabilit, excluant de la dpollution une grande
masse de sol.
aux modifications physico-chimiques qui surviennent dans ce biotope:
modifications des teneurs en oxygne et variations de temprature saisonnires qui
rendent la bioremdiation inefficace en hiver,
dilution due aux pluies, etc,
des effets ngatifs possibles sur l'environnement. Par exemple, la transformation microbienne
de polluants peut produire des composs plus toxiques que le compos d'origine; l'utilisation des
racteurs boue est destructrice de la structure du sol, etc..
Nous dveloppons ci-aprs trois de ces aspects:
10.2.1 Biodgradabilit des composs et rcalcitrance
Les bioremdiations sont impossible mettre en uvre pour les composs rcalcitrants, en
particulier certains polymres (Tableau 6) et composs organiques dont des halogns riches en
chlore (Tableaux 8 et 9)
Les xnobiotiques accessibles aux seules microflores arobies et ayant atteint une nappe
anarobie profonde ne peuvent tre traits in situ.
Les bioremdiations sont peu performantes vis--vis de certains produits forte
concentration, qui ncessitent une dilution importante pour descendre en-dessous du seuil de
toxicit. Ceci complique la bioremdiation dans les zones arides.
Elles sont difficiles mettre en uvre dans le cas de pollution multiforme massive.
10.2.2 Adaptabilit des souches introduites
86
D'une faon gnrale, il est extrmement difficile, sinon impossible, d'adapter in situ une souche,
surtout gntiquement modifie, un biotope dont elle n'est pas originaire. Il existe des
comptitions avec les souches indignes qui sont en faveur de ces dernires, mme dans le cas
d'inoculation massive. Par contre l'inoculation de souches peut se rvler efficace dans les systmes
clos o l'on peut effectuer des rgulations (temprature, pH, RH ...)
10.2.3 Effets ngatifs de la biotransformation
La transformation microbienne de certains composs chimiques produit des substances plus
toxiques et parfois plus mobiles que le produit d'origine (Tableau 34).
Cette transformation indsirable peut se faire soit directement par la microflore en place, soit
aprs une adaptation de la microflore autochtone rsultant d'applications rptes comme dans le
cas de certains pesticides.
Des exemples classiques sont ceux du PCE et de certains herbicides.
Le PCE en conditions anarobies subit une srie de deshalognations rductives
microbiennes qui aboutissent la formation de TCE relativement inoffensif mais aussi de chlorure
de vinyle, une substance hautement cancrigne.
L'herbicide slectif Ben(z)thiocarb (nom commercial: Saturn; formule: S-(p-chlorobenzyl)
diethyl carbamate) est gnralement biodgrad dans les sols par hydrolyse. Par contre, son
application rpte dans des rizires cause la multiplication de bactries anarobies qui transforment
le Benthiocarb par dchloration rductive formant un compos fortement phytotoxique pour le riz.
L'herbicide slectif qu'est le pentachlorobenzyl alcool induit, aprs applications rptes, le
dveloppement d'une microflore qui le transforme en une varit de substances (acides penta-,
2,3;4,6- , 2,3,5,6-tetra-, et 2,4,6-trichlorobenzoques) toxiques faible concentration pour de
nombreuses plantes cultives telles que la tomate, le concombre et le melon.
Des phnomnes similaires ont t rapports pour d'autres pesticides dont le spectre
d'activit est chang par transformation microbienne (atrazine, dichlorobnyl, avermectine,
bnomyl, triadimfon, captan, chlorothalonil).
Tableau 34. Changements de toxicit rsultant de la biotransformation de pesticides
Thiram
Fungicide
-->
Dimthylamine
Agent carcinogne
DDT
Insecticide
-->
2,4,5-T
Herbicide
-->
2,4,5-trichlorophnol
Produit gnotoxique
Propanil
Herbicide
-->
3,3',4,4'-ttrachlorobenzne
Produit gnotoxique
TCE
Polluant
-->
Chorure de vinyle
Produit carcinogne
Odeyemi et Alexander, 1977
1,1-dichloro-bis(4-chlorophnyl)thane
Produit toxique pour les poissons
Day, 1991
et acaricide
Matsumura et al., 1971
George et al., 1992
Prasad, 1970
10.3 ASPECTS LEGAUX

Un certain nombre de rgulations rgissent l'emploi de la bioremdiation. Elles concernent la
substance liminer, le site traiter et les microorganismes ventuellement ajouts dans le milieu.
Par exemple, aux USA tout projet de bioremdiation doit satisfaire, en ce qui concerne le site aux
rglements de trois organismes Fdraux :
- Resource Conservation and Recovery Act (RCRA)
- Comprehensive Environmental Response, Compensation and Liability Act (CERCLA), et
87
- National Pollution Discharge Elimination System (NPDES)
ainsi qu'aux rglement locaux des Etats.
Si des microorganismes, et plus particulirement des microorganismes gntiquement
modifis, sont utiliss, l'approbation des deux organismes suivants doit galement tre obtenue:
- Toxic substances Control Act (TSCA)
- Federal Plant Pest Act.
10.4 PERSPECTIVES
Les bioprocds prventifs et curatifs requirent des connaissances sur la composition des
effluents polluants, les voies mtaboliques des microorganismes impliqus, les limites toxiques, les
biomasses efficaces et leur croissance, mais aussi sur le gnie des procds impliquant la matrise
des dispositifs de traitement in situ et celle des racteurs, biolaveurs, biofiltres. Concevoir et
dimensionner des bioprocds ncessitent un nombre lev de comptences diverses. Les garanties
de performances impliquent que l'exploitation reste guide par des spcialistes.
D'un point de vue conomique les bioprocds sont intressants. Ils ne gnrent pas de sousproduits dont la gestion est complique et la biomasse ventuellement produite est d'un traitement
banal.
Aujourd'hui. il est vident que les bioprocds ont acquis une place significative dans
l'ventail technologique disponible pour la dpollution ou la prvention de la pollution. Leur
utilisation est sans doute loin d'avoir atteint le potentiel dmontr par les tudes de laboratoire et
semble devoir continuer se dvelopper. L'intrt croissant des socits pour la protection de
l'environnement et le fait que les techniques biologiques bnficient d'une perception favorable
devraient favoriser la recherche sur les bioremdiations et la prvention biologique de la pollution et
permettre le dveloppement de nouvelles techniques.
88
11. LES ENTREPRISES DE DEPOLLUTION

Sols pollus, qui fait quoi en 1996 (origine: LEnvironnement n 1547 mai 96)
Procds
biologiques
Prestataires
nb technol maxi
Apinor
Aprochim
Arios
ATE
CECA
Celtic technol (GB)
Colas
Ecotechniek (NL)
Enviro. Serv. Int..
Enviromax SA
Goclean,
Groupe Sch
GRS
ICF Environnement
Krebs
NMB Milieu (NL)
Nordac (D)
Pollution services
Serpol
Shanks & Mc
Evans (GB)
Sif Bachy
Soltanche
Valtech industry
Zublin (D)
R
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
Procds chimiques et physiques,

confinement, solidification, proc thermiques
HS
*
IS
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
Chim.
******
Phys.
*******
Cf.
****
Slf
***
****
****
*
*
****
*
****
***
******
******
***
****
*
******
*
*****
****
*******
******
******
****
**
*******
****
******
******
****
*******
******
*******
*****
****
******
*******
***
****
*****
******
***
****
******
******
*****
****
****
**
****
******
****
*****
****
**
******
*
****
****
***
****
****
****
***
*
****
Th.
***
**
**
*
***
*
**
*
**
*
*
**
*
*
*
**
***
***
*
*
****
***
*
*
***
*
**
*
**
**
89
12. POUR EN SAVOIR PLUS

12.1 OUVRAGES
Baker K H, Herson D S (eds.) (1994) Bioremediation. Mc Graw Hill Inc. Pub.
Hardman D, Mc Eldowney S, Waite S (1993) Pollution: ecology and biotreatment. Longman
Scientific & Technical, Harlowe, UK.
Alexander M (1994) Biodegradation and bioremediation. Acad Press Inc. San Francisco, Calif
King RB, Long GM, Sheldon JK (1997) Practical environmental bioremediation, the field guide.
Lewis (pub.) 184pp.
12.2 ARTICLES DE VULGARISATION DANS LA PRESSE SPECIALISEE
Nedey F. (1997) Dossier "Sols pollus". Ces technologies qui vont faire baisser les cots. Dcision
Environnement 62, Dcembre 1997 pp31-38.
Blouet A. (1996) Choisir un procd de dpollution des sols. Dcision Environnement n50 Oct
1996. pp 82-86
Cliquot de Mentque C. (1998) Dossier technique sols. Dpollution: les 12 techniques efficaces.
L'Environnementn1565, Mars 1998 pp 30-41.
90
13. GLOSSAIRE
Absorbeur: Bioracteurs pour le traitement d'effluents gazeux (absorbeurs venturi) ou liquides,
en contre-courant avec un effluent gazeux (absorbeurs colonnes). Ces colonnes sont de 3 types:
pulvrisation, garnissage ou plateaux.
Acclimatation: Priode pendant laquelle une population microbienne subit des transformations
phnotypiques et gntiques aprs avoir t mise en prsence de conditions nouvelles (par exemple,
un apport d'lments nutritifs ou encore la mise en contact avec un compos xnobiotique, un
pesticide, un antibiotique, etc). Souvent cit sous le terme plus gnral d'adaptation.
Adsorption: Phnomne de nature physique (forces de van der Wall) permettant l'adhrence d'un
compos sur des particules minrales (argiles).
Arobie: Organisme utilisant l'oxygne pour son mtabolisme. Contraire: Anarobie: organisme
par qui l'oxygne n'est pas utilis, ou pour qui il est ltal.
Arobiose: Condition rgnant dans un milieu contenant de l'oxygne gazeux ou dissous. A 20C,
une eau en quilibre avec l'atmosphre en contient, suivant la naure et les concentrations des autres
lments dissous, environ 0,24 mM doxygne. Si la teneur est 10 100 fois plus faible, on parle de
microarophilie.
Air-Stripping (Eng.): Littralement, "lavage de l'air". Toute technique consistant liminer un
polluant prsent sous une forme volatile ou sous la forme de fines particules dans de lair.
Ammonification: Production d'ions ammonium par dgradation des matires organiques.
Anarobiose (stricte): Condition rgnant dans un milieu totalement priv d'oxygne dissous.
L'anarobiose "facultative" dsigne la possibilit pour un microorganisme de vivre en anarobiose
stricte ou en prsence de traces d'oxygne.
Antibiotique: Produit biologique (ou ralis par synthse) agissant trs faible doses comme
inhibiteur pour des microorganismes.
Aquifre: Nappe d'eau souterraine (utilisable, si non pollue, pour la prparation d'eau potable).
Assimilation: Transformation d'un lment conduisant son incorporation dans les biomolcules.
Autotrophe: Organisme capable de synthtiser tous ses constituants uniquement partir d'lments
minraux (souvent le CO2 seul - dans ce cas, on parle de chimio-autotrophie - l'ammonium, les
sulfates, les phosphates, etc). Contraire: Htrotrophe: organisme exigeant des composs
organiques.
91
BCF: Facteur de biocentration. Voir ce terme.
Benzne: La plus simple des molcules organiques comportant un cycle insatur. De nombreux
composs xnobiotiques en drivent par synthse.
Bioaccumulation: Incorporation et rtention d'un lment ou d'un compos toxique par un
organisme. Des bioaccumulations successives dans une chane trophique (alimentaire) peuvent
contribuer, dans les cellules du dernier prdateur, dont l'homme, des niveaux hautement toxiques.
Voir aussi bioconcentration.
Bioaugmentation: Souvent synonyme d'inoculation. Addition (dans un bioracteur ou sur un site
pollu) de cultures bactriennes pour stimuler la biodgradation. Voir aussi biostimulation.
Biocide: Agent ltal pour les organismes vivants ou certains groupes d'organismes vivants. Tous les
pesticides et les antibiotiques sont des biocides, au-del d'une certaine concentration.
Bioconcentration: Augmentation cumulative de composs non biodgradables au cours de leur
transfert travers les diffrents niveaux d'une chane trophique. S'applique souvent aux mtaux
lourds, aux pesticides et aux composs phosphors.
Biodgradation: Dcomposition partielle ou totale d'un produit par un agent biologique et qui
conduit l'limination complte avec comme seuls rejets des produits simples tels H2 O, CO 2 , CH 4 ,
H2 , chlorures (pour un organochlor), ou encore de l'actate et d'autres produits de fermentation. On
parle de biodgradabilit si le compos dpolluer est accessible, dans certaines conditions, au
moins une microflore.
Biodpollution: Dpollution biologique spontane ou mise en uvre par l'homme. Elle peut
rsulter d'une biodgradation ou d'une inactivation du polluant par biotransformation.
Biofiltre: Bioracteur utilisant des microorganismes, gnralement fixs sur un support solide,
utilis pour dpolluer des effluents gazeux.
Biofilm: Couche mince (de 1 quelques dizaines de mm), plus ou moins compacte, de
microorganismes, le plus souvent cre sur un support minral. La notion de biofilm sous-entend la
notion d'activit bactrienne lie une surface de contact importante entre le substrat biodgrader
et la population de microorganismes.
Biolaveur ( solvant organique): Racteur colonne ou venturi, dans lequel le contaminant
traiter, prsent dans une phase gazeuse, est transfr dans une phase liquide contenant un solvant
(temps de contact de 1 20 secondes). La dpollution est assure par une microflore adapte
(prsente sous la forme d'un biofilm ou introduite dans un bioracteur spar).
Bioracteur: Dispositif contrl permettant de mettre en uvre un processus de biodpollution.
Gnralement utilis pour traiter des effluents liquides ou des boues.
92
Biosphre: Ensemble des tres vivants. Cette notion est gnralement tendue l'environnement
dans lequel se dveloppent les tres vivants, constituant la biomasse.
Biosorption: Passage d'un compos organique (ou un minral) dans les cellules d'un
microorganisme (algue, champignon, bactrie, etc), sans pour qu'il y ait pour autant une
modification chimique. Une forme particulire de bioaccumulation ou de bioconcentration.
Biostimulation: Toute technique permettant de stimuler l'activit de la microflore dpolluante
autochtone (prsente sur le site bioremdier).
Biotransformation: Transformation chimique d'un compos par un agent biologique. Cette notion
implique gnralement un mtabolisme incomplet du substrat et non une vritable assimilation. Une
oxydation, une hydrolyse, une dhalognation, un mthylation, etc, sont des biotransformations
quand elles sont ralises par un microorganisme.
Biotope: Milieu naturel favorable la vie. Par extension, certains dfinissent le "biotope" par un
ensemble de donnes physico-chimiques et climatiques, ou encore comme un milieu naturel
original par la nature des eaux, des sols et de la vgtation et favorable ou nfaste une population
dorganismes donns extension (mais dans ce cas, le terme appropri est l'cosystme).
Bioventilation (Eng.: Bioventing): Technique de dpollution des eaux et des sols faisant appel
une ventilation force pour stimuler l'activit et la croissance de la microflore arobie autochtone.
Ncessite des sols et sous-sols ayant une bonne porosit et relativement homognes.
BTEX (Eng.): Abrviation anglo-saxonne dsignant un ensemble des composs suivants: Benzne
(et ses drivs), Tolune, Ethylbenzne et Xylnes (3 isomres: o-, p- & m-). Ces composs sont
souvent associs dans les pollutions multiples d'origine chimique.
Chane trophique: Succession d'organismes (y compris, en dbut de chaine les micro-organismes),
dans laquelle chacun d'entre eux constitue la "proie" du suivant.
Cintique (de raction): Vitesse d'un vnement ractionnel. Par extension, suivi d'un processus
ou d'une raction en fonction du temps.
Clarification: Sparation, par gravit ou tout moyen mcanique, dans une boue ou un effluent
liquide ou pteux, de la phase solide et de la phase liquide. Suivant sa nature (tailles des particules,
solubilit, volatilit, etc), le polluant se retrouve principalement dans une des 2 phases.
Clone: Population dont tous les lments drivent d'un individu unique. Synonyme possible en
microbiologie: "souche".
Conjugation: Raction associant un compos courant des voies mtaboliques un compos
toxique dont elles provoquent ainsi l'inactivation.
93
Confinement: Sparation du matriau contamin, pour traitement dans une enceinte ferme
(aucune communication avec le milieu ambiant: atmosphre, eau et sol).
Constitutive (synthse): Se dit d'une synthse de protines un taux quasi-constant, dans toutesles
conditions physiologiques. Contraire: inductible: synthse qui ne peut se raliser qu'en prsence
d'un "inducteur".
Comtabolisme: Mtabolisme bactrien par lequel le substrat peut tre dgrad, mais qui ne peut
subvenir seul la croissance cellulaire (car il ne constitue pour le microorganisme ni une source de
carbone, ni une ressource nergtique).
Compostage (Eng.: Composting): Traitement arobie et thermophile dans lequel le matriau
contamin est mlang un matriel organique (paille, copaux de bois etc..) et enrichi en nu Ce
procd peut tre appliqu en piles statiques, en amas ars ou dans des racteurs aliments en
continu.
COV: Composs Organiques Volatils.
Crsol: Mthylphnol, 3 isomres: ortho, meta & para.
CV: Chlorure de V inyle (compos monochlor hautement cancrigne de trs faibles
concentrations : 3 ppm dans l'air).
DBCP: Di-Bromo-Chloro-Propane (compos halogn).
DBO/DCO: Demande Biologique/Chimique en Oxygne. En anglais: BOD/COD.
DCE: Di-Chloro-thylne (compos organochlor). Plusieurs isomres.
DEE: Di-Ethyl-ther.
Dchloration: limination d'un (ou plusieurs atomes) de chlore d'un compos organochlor.
Dhalognation: limination d'un (ou plusieurs atomes) d'halogne (Fluor, Chlore, Brome et Iode)
d'un compos. Cette raction dtoxifie gnralement certains organochlors, mais peut aussi
conduire la production de composs plus dangereux encore, tel le chlorure de vinyle.
Demi-vie: La demi-vie d'un compos dans un environnement donn est le temps ncessaire pour
que sa concentration diminue de moiti. Cette valeur varie suivant les conditions physico-chimiques
du biotope et en particulier suivant que le produit est plac en anarobiose ou en arobiose.
Dpollution: limination ou inactivation spontane ou intentionnelle d'un polluant par des agents
physiques, chimiques ou biologiques.
94
Dtoxification: Destruction ou inactivation, spontane ou provoque, d'un compos toxique.

Dsamination: Extraction d'un radical NH2 de la molcule.
Diauxie: Croissance en 2 phases, que l'on constater lorsque certaines bactries mtabolisent
compltement une source de carbone (voir substrat) avant d'en attaquer une seconde.
Digesteur: Terme rserv aux bioracteurs mettant en uvre une fermentation mthanique.
Dissimilation: Utilisation d'un substrat comme accepteur d'lectrons pour produire de l'nergie.
DL50 (en anglais LC50): Concentration moyenne d'un polluant (dfinie statistiquement) ltale
pour 50% des organismes exposs.
Efficience: En dpollution, apprciation de l'efficacit du procd mis en uvre. Souvent chiffre
par un pourcentage (concentration du produit limin par rapport la concentration initiale). On cite
aussi des taux de dpollution.
Effluent: Phase (gnralement aqueuse ou gazeuse) contenant le(s) produit(s) dpolluer (effuent
contamin), ou au contraire, dbarrass de ce produit (effluent dpollu). Voir rejet.
Enzyme: Protine dote du pouvoir de catalyser une ou plusieurs ractions sur des ractifs dfinis.
Mode d'action: voir synthse constitutive et inductive.
poxyde: Compos rsultant de l'addition d'un atome d'oxygne sur une double liaison, formant un
cycle triangulaire. Relativement instable: dure de demi-vie souvent trs faible.
puration: Toute technique permettant de se dbarrasser d'un polluant.
Eutrophisation: Modification progressive ou brutale, souvent indsirables, des proprits
physicochimiques et biologiques d'une eau de surface (lac, tang, rivire, lagune, etc) qui se
traduit dans un premier temps par le dveloppement de biomasses indsirables (algues, bactries
photosynthtiques, etc). Souvent provoque par un apport de composs facilement utilisables par
ces flores ou microflores (nitrates, matires organiques, composs phosphors, etc), et par une
augmentation simultane de la temprature. Gnralement nfaste la faune aquatique.
Faisabilit: tude des conditions techniques (mais aussi financires) dans lesquelles on pourrait
appliquer un procd (de dpollution).
Fermenteur: Bioracteur mettant en uvre un processus anarobie. Voir digesteur.
95
Gnome: Ensemble de tous les gnes prsents dans la cellule.
Gnotoxique (produit): Compos susceptible d'avoir des effets nfastes sur le gnome.
Halophile: Organisme capable de crotre des concentrations leves en NaCl (au-del de 1M, soit
58,5 g/litre). S'il ne supporte que des concentrations modres en sel (de l'ordre de 20 30 g/litre,
chiffres lgrement infrieurs la concentration moyenne de l'eau de mer, 33 g/litre), il est dit
halotolrant.
HAP: Hydrocarbures Polycycliques Aromatiques
HCB: HexaChloroBenzne.
Humus: Polymres complexes, souvent mal dfinis, mais de nature phnolique et quinonique,
provenant de la dgradation et de l'oxydation de la lignine. Ils sont gnralement rcalcitrants
toute attaque biologique.
Hydroxylation: Addition d'un ion OH une molcule. Cette raction, applique des composs
aromatiques ou aliphatiques, les rend gnralement moins toxiques.
Inoculation (Eng.: Bioaugmentation): En bioremdiation, addition de microorganismes dans un
milieu contamin. Technique utilise dans les bioracteurs et dans les systmes de bioremdiation
ex situ. La microflore apporte constitue un inoculum.
Lagunage: Technique de dpollution applique en phase liquide, dans des bassins l'air libre, o
agit la microflore de l'eau et des vases, indigne ou inocule.
Landfarming (Eng.): Traitement en phase solide d'un sol pollu. Il peut tre appliqu in situ, mais
il est appliqu le plus souvent un sol excav (extrait mcaniquement du site) et plac dans un
dispositif appropri.
Latence (phase de): Avant le dmarrage de la dgradation d'un polluant, on constate gnralement
une priode (parfois longue) d'adaptation de la microflore ce compos. Cette priode est la phase
de latence, caractrise par l'absence de multiplication du microorganisme. Voir aussi
acclimatation.
Lit expans: Procd de diffusion d'une microflore dans un bioracteur, pour lequel cette
microflore n'est pas fixe sur un support, mais maintenue, par agitation, en "expansion" dans la
phase liquide, o elle se multiple et augmente de volume. Contraire: lit fix. Un lit fluidis est un
systme qui remet priodiquement en suspension une biomasse dpolluante qui se sdimente.
Lessivage: Entrainement d'un polluant vers d'autres horizons du sol ou du sous-sol, par l'eau.
96
Msophile: Un microorganisme est dit msophile si les conditions optimales de croissance se
situent entre 20 et 45C (un tel germe est gnralement incapable de se multiplier au-de de 15C).
Ceux qui prfrent les basses tempratures sont psychrophiles. A l'inverse, sont considrs comme
thermotolrants les msophiles qui supportent des tempratures de 45 55-60C, et thermophiles
ceux qui sont aptes se multiplier au del de 60C.
Mthanogne: Microorganisme produisant du mthane (CH4 ). Tous les mthanognes connus sont
des archobactries, et sont en quasi-totalit, strictement anarobies. Trs utiliss en matire de
biodpollution.
Mthanotrophe: Microorganisme arobie utilisant le mthane (CH4 ) comme source de carbone et
dnergie.
Mthylation: Addition d'un groupe mthyle (-CH3 ) une molcule. Raction capable d'inactiver
les phnols. Contraire: dmthylation, raction souvent rencontre dans l'inactivation de certains
pesticides.
Minralisation: Biodgradation dans laquelle l'tape ultime est la formation de CO2 . Cette notion
implique gnralement qu'une partie du compos a t assimile par l'organisme concern (et pour
lequel il a constitu un "substrat").
Mixotrophe: Microorganisme se dveloppant en utilisant la fois le CO2 , des composs
organiques et minraux comme sources de carbone et d'nergie.
MMO: Mthane-Mono-Oxygnase. Enzyme prsent dans toutes les bactries mthanotrophes
(dgrade le CH4 ). Souvent utilisable pour dpolluer certains composs (dont des organochlors) par
comtabolisme.
Mutagnse: Action provoquant l'apparition d'une mutation.
Mutualisme: Symbiose pour laquelle chacun des 2 partenaires ne peut vivre sparment.
Neurotoxine: Toxine agissant comme poison du systme nerveux.
Nutriment: En microbiologie, produit (organique ou minral), ncessaire la multiplication de la
biomasse microbienne. Ne pas confondre avec substrat, plus restrictif, qui est pour cette microflore,
une source de carbone et d'nergie.
OGM: Organisme Gntiquement Modifi.
Organochlor: Compos (souvent xnobiotique) contenant un ou plusieurs atomes de chlore dans
sa molcule.
PCB: PolyChloroBiphnyls.
97
PCE: TtraChlorothylne, anciennement PerChlorothylne. Un compos organochlor.

PCP: PentaChloroPhnol.
Percolation: Passage, par gravit, d'une phase liquide travers un matriau poreux. Exemple:
percolation d'un aquifre travers une couche de sable.
Persistant (ou Rcalcitrant): Un compos est qualifi de rcalcitrant ou de persistant quand son
limination par des voies biologiques est impossible (rcalcitrant vrai), ou trs lente ou encore
qu'il n'a pas encore t possible de mesurer sa vitesse de dgradation, tant elle est lente ! Ces termes
s'appliquent le plus souvent aux produits xnobiotiques, mais des composs naturels peuvent aussi
tre rcalcitrants (exemple, l'humine). La persistence d'un compos est gnralement estime par le
temps ncessaire pour que sa concentration initiale diminue de 90%. Cette valeur est
approximativement gale 3,5 fois la demi-vie.
Phnol: Hydroxybenzne. Fonction phnol: hydroxyle sur un noyau aromatique.
Photo-oxydation/Photolyse: Oxydation physico-chimique/Destruction d'un compos sous l'effet de
radiations lumineuses (spectre de la lumire visible) ou de rayonnements UV.
Plume (Eng) : Cne de dispersion d'un polluant dans le sol et le sous-sol, partir du point de rejet.
Traduction propose : "Panache de pollution".
Pollution (dfinition simplifie): Introduction dans un milieu de substances ou d'nergie
susceptibles d'avoir des effets indsirables ou toxiques sur l'homme et son environnement. On
distingue plusieurs types de pollution: accidentelle (dversement inhabituel - mais parfois
volontaire - d'un produit indsirable); cumulative ("petits" dversements conscutifs dans le temps,
conduisant des teneurs finales dangereuses); diffuse (rpartie sur un grande surface ou une grande
profondeur; inverse: ponctelle: lie une activit industrielle trs localise ou un rejet non
contrl).
Potentiel redox: potentiel d'oxydo-rduction.
Racteur boues: Bioracteur conu pour dcontaminer un sol, dilu par addition d'eau ( laquelle
sont ajouts des nutriments, et si ncessaire des inoculums) et, souvent ar par insufflation d'air.
Recyclage: Deux dfinitions possibles. En dpollution: transformation d'un produit gnralement
mis en dcharge pour le valoriser sous la forme d'un autre produit (de prfrence commercialisable).
Dans un bioracteur: reprise d'un effluent pour un deuxime traitement dans le mme dispositif.
Rejet: Terme souvent utilis dans le sens dmission dans le mileu naturel de produits indsirables
(fume, gaz non brl, rsidu de fabrication, fraction minrale non utilisable, eaux de
refroissisement ou de lavage, etc ) par un tablissement industriel, un systme d'puration urbaine
ou une collectivit. Mais un rejet peut aussi tre constitu par des liquides ou des gaz dj
partiellement ou totalement dpollus.
98
Rsidence (Temps de): Dure de sjour d'un compos dans un bioracteur.

Scalling-up (Eng.): Changement d'chelle (d'observation) ou, en dpollution, passage d'un
prototype de laboratoire un dispositif de taille industrielle.
Seuils: Il existe gnralement un seuil infrieur de concentration du polluant, en-de duquel la
microflore ne s'y adapte pas (pas de multiplication cellulaire, ni de biodgradation), et un seuil
suprieur, correspondant une concentration trop leve, inhibant cette microflore, ou mme ltale
pour elle. Voir DL50.
Spcificit enzymatique: Pour l'enzyme produit (ou possd) par une microflore pour biodgrader
un polluant donn, attaque de ce seul compos. En gnral, la spcifit enzymatique polluant /
espce ou genre microbien est peu marque: un mme contaminant peut tre dgrad (dans des
conditions diffrentes) par plusieurs microorganismes, et inversement, un mme enzyme dgrade un
nombre lev de composs de la mme famille: c'est le cas de la MMO (voir ce terme) des bactries
mthanotrophes vis--vis des composs halogns et organochlors.
Soil Washing (Eng.) (lavage du sol): Terme anglo-saxon dsignant toute technique de lavage du
sol pour en liminer un polluant hydrosoluble, ou entrainable par un courant d'eau.
Substrat: Compos, organique ou minral, utilis par un microorganisme comme source de
carbone ou d'azote et/ou comme source d'nergie, et/ou comme accepteur d'lectrons. Voir aussi
nutriment.
Sulfato-rduction: Rduction biologique des sulfates par des bactries. Se fait en anarobiose et
conduit l'hydrogne sulfur (H2 S) trs toxique.
TCA:1,1,1- TriChlorothane.
TCE: TriChlorothylne.Un compos organochlor trs rpandu.
Tflon: Matire plastique du type polyfluorocarbone, produite par polymrisation du
ttrafluorothylne (exemple type du xnobiotique trs rcalcitrant).
TPH (Eng.): Total Petroleum Hydrocarbons, abrviation anglo-saxonne dsignant un ensemble
d'hydrocarbures drivant du ptrole.
Vadose zone (eng): soil above the water table
Vm (ou Vmax): Vitesse maximale d'une raction enzymatique pour un compos donn.
99
Volatilisation: Passage d'un compos volatil dans l'athmosphre (voir COV, par exemple). La
volatilisation d'un compos toxique ne conduit pas ncessairement sa neutralisation ou son
exclusion de la biosphre: exemples de la dioxine de Seveso et des vapeurs d'hydrocarbures.
Xnobiotique (): Traduit du grec: "tranger au monde vivant". Compos organique
rsultant de l'activit humaine (non naturel, et absent des biotopes naturels non pollus).
Xylne: Dimthylbenzne; 3 isomres (m-, o- & p-).

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Laboratoire de Microbiologie IRD

3. LES PRINCIPAUX POLLUANTS

3.1 LES POLLUANTS DANS LES MILIEUX NATURELS (NAPPES ET SOLS)

3.2 POLLUANTS RECALCITRANTS ET POLLUANTS BIODEGRADABLES

3.3 DOSES ADMISSIBLES ET NORMES

4. LES PRINCIPAUX TYPES DE POLLUTION

4.1 DEVENIR DES POLLUANTS DANS L'ENVIRONNEMENT

4.2 POLLUTIONS PONCTUELLES

4.3 POLLUTIONS DIFFUSES

4.4 LES SITES POLLUES

5. CONSEQUENCES ET MODE D'ACTION DE LA POLLUTION

5.1 EFFETS DIRECTS: CONTACT, INGESTION, INHALATION

5.2 BIOCONCENTRATION DANS LES CHAINES ALIMENTAIRES

6. BIODEPOLLUTION PAR LES MICROORGANISMES

6.2 MECANISMES MICROBIENS DE LA BIODEPOLLUTION

6.3 PARAMETRES ENVIRONNEMENTAUX QUI AFFECTENT LA BIODEPOLLUTION

7. LES DIFFERENTES METHODES DE BIOREMEDIATION

7.1 ASPECTS MICROBIOLOGIQUES

7.3 ETUDES DE FAISABILITE

8.1 INTRODUCTION: LES SUCCES DE LA BIOREMEDIATION

8.2 BIOREMEDIATION DU SOL EX SITU

8.3 BIOREMEDIATION DU SOUS-SOL ET DES NAPPES PHREATIQUES

8.4 BIOREMEDIATION DES EFFLUENTS GAZEUX

9. ASPECTS FINANCIERS, RENTABILITE

9.1 LE MARCHE DE LA DEPOLLUTION

9.2 LES COUT RELATIF DES METHODES

10. CONCLUSION: AVANTAGES, LIMITATIONS ET PERSPECTIVES

10.1 AVANTAGES DE LA BIOREMEDIATION

10.2 LIMITES TECHNIQUES

10.3 ASPECTS LEGAUX

11. LES ENTREPRISES DE DEPOLLUTION

12. POUR EN SAVOIR PLUS

12.2 ARTICLES DE VULGARISATION DANS LA PRESSE SPECIALISEE

3. LES PRINCIPAUX POLLUANTS

46 composs organiques extractibles en milieu basique ou neutre

Tous les phnols

3.2 POLLUANTS RECALCITRANTS ET POLLUANTS BIODEGRADABLES

Tableau 3. Grands types de produits chimiques et leur possibilit de biodgradation

Tableau 4. Polymres rcalcitrants (d'aprs Alexander, 1973)

Les composs rcalcitrants peuvent tre classs en trois groupes:

Tableau 5. Biodgradation de composs organiques dans des aquifres

Limon et sable, Ontario

Aelion et al., 1987

Tableau 6. Demi-vie (jours) de pesticides appliqus dans des rizires inondes

* Compos encore prsent dans le sol aprs le nombre d'annes indiqu.

trichlorophnol (2,4,6 TCP)

* = dgrad par des bactries mthanotrophes;

4. LES PRINCIPAUX TYPES DE POLLUTION

Fig.3 . Devenir des hydrocarbures dans l'environnement.

NAPPE PHREAT IQUE

Ocean City (NJ)

Traverse City (Mi)

Gloucester (ON) Can.

Mountain View (CA)

Cape Cod (MA)

San Jose (CA)

5. CONSEQUENCES ET MODE D'ACTION DE LA POLLUTION

Biomasse (unit arbitraire)

Le dosage des organochlors dans divers compartiments de l'cosystme aquatique a montr

Demi-vie dans un sol non autoclav

6. BIODEPOLLUTION PAR LES MICROORGANISMES

Fig. 8. Reprsentation schmatique de l'adaptation des bactries du sol un pesticide ou un

* Etude bibliographique ESGBMA, 1995