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Nivel subatmico
Nivel atmico
Nivel Molecular (monosacridos. Aminocidos, nucletidos, plsmidos)
Macromolecular (polisacridos, protenas, lpidos, cidos nucleicos)
Supramolecular (citoesqueleto, membrana, nuclolo, ribosomas, glicoprotenas,
priones, glicolipidos, complejos multienzimaticos, complejo enzimasustrato,
virus, nucleosoma, cromatina)
6. Orgnulos (ncleo, R.E, lisosomas, mitocondrias, complejo de golgi)
7. Clula procariota
8. Clula eucariota unicelular
9. Clula eucariota de mamferos (clulas tisulares: adipocitos, hepatocitos, linfocitos,
neuronas, cardiomiocitos)
10. Tisular (tejido conectivo, epitelial, muscular, nervioso
11. Orgnico
12. Sistmico
13. Organismos
14. Especie
15. Poblacin
16. Comunidad
17. Ecosistema
18. Biosfera
19. Universo
El hombre no cumple con todos los niveles de organizacin biticos, debido a que l es
parte de una poblacin, de una especie, de una comunidad, de un ecosistema y parte del
universo, pero no es capaz de crearlos.

La clula
Unidad funcional y estructural bsica para la vida. Su composicin molecular es 96%
carbono, oxgeno, hidrgeno y nitrgeno. Todas las clulas procariotas y eucariotas
poseen:
1- Membrana plasmtica: acta como barrera que separa a la clula de otras clulas
y su medio circundante, y como barrera selectiva de material y energa en los
procesos de intercambio.
2- Material gentico (ADN): donde se almacenan los planos de estructura y
funcionamiento de la clula.
3- Citoplasma: medio acuoso de la clula.
Todas las clulas sean eucariotas o procariotas:

Se autorregulan
Se adaptan y evolucionan
Poseen metabolismos energticos
Responden a estmulos
La informacin gentica en el ADN es procesada mediante cdigos genticos,
transcripcin y traduccin similares.

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Clulas procariotas

Son organismos vivos unicelulares (bacterias y algas verdes).


Son menos complejas que las clulas eucariotas.
Pueden tener formas esfricas, en espiral o bastn.
Su tamao vara entre 0,1 a 10 micras.
Carecen de envoltura nuclear y de procesos de endocitosis y exocitosis.
Poseen aproximadamente 705 ribosomas en el citoplasma y un cromosoma
celular nico.
Carecen de organelos citoplasmticas.

Se dividen en:

Arqueobacterias: grupo de bacterias principales.


Eubacterias: estn libres en el ambiente.
Cianobacterias: procariotas grandes y complejas.

Clulas eucariotas
Organismos vivos unicelulares (protozoos y levaduras) y pluricelulares (animales,
vegetales y hongos)

Ms complejas que las procariotas.


Reproduccin sexual
Presencia de dos copias de genes por clula (masculino y femenino)
Entre sus formas encontramos: esfricas, cilndricas, estrelladas y aplanadas.
Pueden medir de 10 hasta 100 micras.
Poseen envoltura nuclear, proceso de endocitosis y exocitosis
Tienen uno o ms cromosomas lineales y organelos citoplasmticos.

Metabolismos energticos
Todas las clulas sean eucariotas o procariotas, utilizan ATP como energa metablica,
producida por:

Glicolisis anaerbica: Degradacin de glucosa en ausencia de oxgeno. Produce


2ATP.
Fotosntesis: Convertir energa lumnica para sintetizar glucosa, reaccionando H 2O
y CO2.
Glicolisis Aerbica: Degradacin de glucosa en presencia de oxgeno. Produce de
36 a 38 ATP.

Virus
Agente potencialmente patgeno, incapaz de reproducirse por s mismo.

La interaccin entre protenas virales y las del husped determina la especificidad


del virus.

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Los virus estn por debajo de la vida.


El ADN viral integrado se denomina pro virus.
Son especficos para plantas, animales o humanos y no pueden afectar a otro ser
vivo que no sea el especifico.
Cuando el virus est integrado en el organismo, se llama provirus.

En su forma ms simple est compuesto por:

Genoma vrico: cidos nucleicos (ADN y ARN)


Cpside: capa proteica que envuelve y protege al genoma.

Se dividen en:

Adenovirus: virus de ADN que infectan animales y humanos.


Retrovirus: virus de ARN que infectan animales y humanos.
Bacterifagos: virus que infectan solo a las bacterias.

Su aplicabilidad biolgica yace en la produccin de vacunas. (Se purifica el virus para


formar una cepa capaz de bloquear la capacidad infecciosa del virus)
Vas de infeccin:

Va ltica: (Rpida, ejemplo: adenovirus) El virus paraliza las actividades de la


clula husped y las reorienta para que formen material gentico y protenas
virales, que posteriormente se ensamblarn y formarn virones, cuando todos los
virones se formen, la clula se romper (lisis) y los liberar, comenzando con el
ciclo infeccioso.
Va Lisogena: (Lenta. Ejemplo: VIH) el virus infecta su material gentico a los
cromosomas de la clula husped y se mantiene all hasta que un factor externo lo
active.

Priones
Agentes infecciosos compuesto de proteinas con su estructura secundaria alterada,
causantes de una gran cantidad de enfermedades degenerativas del sistema nervioso
central.

La protena prinica (PrP) transforma la protena normal en patolgica.


La protena prinica es insoluble, al precipitarse forma espacios espongiformes.
Resistente a la inactivacin
Las enfermedades prinicas pueden heredarse.
Entre los sntomas de las enfermedades prinicas, tenemos: demencia, perdida de
la coordinacin, insomnio familiar letal, muerte.

Plsmidos
Molculas de ADN extra cromosmicos, generalmente cerradas, de doble hlice, capaces
de replicarse y transcribirse independientemente del ADN cromosmico. Su aplicabilidad
biolgica se basa en su capacidad para replicarse lo que le hace muy til en la ingeniera

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gentica, se emplea como vector de la tcnica de ADN recombinante. El cdigo que hace
a las bacterias resistentes a los antibiticos est en los plsmidos. Cuando el plsmido es
insertado en la bacteria, se llama episoma.

ADN recombinante
Fragmentos de ADN de distintos orgenes celulares. La tcnica de ADN recombinante
consiste en la extraccin de un gen, que se colocar junto a un vector (plsmidos o virus)
en el interior de una bacteria, la bacteria se multiplicar y de esta manera se obtiene el
producto deseado que solo necesita purificarse.
Las enzimas de restriccin cortan el ADN en sitios especficos. Se producen de forma
natural en las bacterias.
Enzima de restriccin + plsmidos + ligasa = molcula de ADN recombinante
La ligasa une los bordes de la molcula de ADN mediante enlaces fosfodiester
La recombinacin se usa para:

Obtener vacunas
Pasos para realizar vacunas en base a ADN recombinante

Extraccin de ADN de virus + integracin de plsmido hibrido en la levadura, quien


fabrica protenas vricas con poder inmunolgico + inyeccin de protenas en un
chimpanc, quien produce agentes inmunolgicos

Producir protenas de inters comercial.

Pasos para producir protenas en base a ADN recombinante


Gen de insulina (por ejemplo) se inserta en plsmido bacteriano + la bacteria se
multiplica, produciendo insulina + extraccin y purificacin

El agua
Es el disolvente universal gracias a su constante dielctrica pues le permite
establecer puentes de hidrogeno.
Permite que en ella se realicen casi todas las reacciones bioqumicas.
Su elevado calor especifico permite absorber mayor cantidad de calor en el
organiso, para asi mantener la temperatura.
El carcter termorregulador producto del alto calor de vaporizacin permite
conseguir un equilibrio de temperatura en todo el cuerpo.
Evaporacin insensible: se realiza en todo momento a travs de los
poros de la piel.
Evaporacin superficial: formacin de sudor por las glndulas
sudorparas.

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Tiene una gran conductividad calrica: esto es responsable de la igualacin de la
temperatura en diferentes partes del cuerpo.
La ionizacin del agua ayuda a mantener el pH fisiolgico.
El agua tiene una caracterstica llamada tensin superficial, la cual es una gran
atraccin entre las molculas de su superficie, creando una tensin superficial que
se comporta como una capa fina y elstica que confiere cierta resistencia al
intentar romperla. Esta propiedad es incompatible con la vida, pues en el caso de
intercambio de gases de los pulmones, el gas no puede romper la tensin
superficial, por lo que se requiere de una glicoprotena para que el oxgeno rompa
la tensin superficial y pueda entrar al alveolo.
Es la mayor parte de la masa celular.
Como no es lineal, forma uniones intermoleculares.
Su densidad se incrementa cuando se enfra.

Carbohidratos
Biomolculas que constituyen la principal fuente de almacenamiento de energa
(producen 4kcal/g). Estn constituidos por C, H, O. Los humanos no los producen.
Clasificacin:

Monosacridos: azucares simples compuestos por 3 a 7 tomos de carbono. No


son hidrolizables. Son los monmeros a partir de los cuales se forman los dems
glcidos.
Aldosas: su grupo funcional es un aldehdo. La ms conocida es la
glucosa.
Cetosas: su grupo funcional es una cetona. La ms conocida es la fructosa.
Monosacridos de inters:
Glucosa: Combustible fundamental del cual dependen los procesos vitales.
Galactosa: es el ms abundante despus de la glucosa. Presente en las
glicoprotenas.
Manosa: presente en las glicoprotenas.
Fructosa: principal alimento de los espermatozoides.
Desoxirribosa: constituyentes del ADN.
Ribosa: constituyentes del ARN.
Gliceraldehdo: base de los fosfolpidos, base de las membranas.
(Azcares con ms de 5 carbonos pueden formar anillos)

Oligosacridos: polmeros formados a base de monosacridos, tienen entre 2 y 20


monosacridos. Entre los ms nombrados tenemos a los disacridos, y entre los
ms conocidos estn:
Sacarosa: Glucosa + Fructosa
Maltosa: Glucosa + Glucosa
Lactosa: Glucosa + Galactosa
Oligosacridos de inters:
cido Sialico: presente en la leche materna, mejora las conexiones
neuronales.

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Galactosamina: localizada en el cartlago, corneas, piel, tendones y
vlvulas cardacas.
Heparina: anticoagulante.
Las glicoprotenas son varios oligosacridos unidos de forma covalente a
cadenas laterales especficas de polipptidos.
Unidos al O de un OH de la serina o treonina.
Unidos al N de una asparragina.

Peptidoglicano: disacrido unido a aminocidos. Gracias a su enlace (1-4) es


muy resistente y protege a las bacterias de una ruptura osmtica en ambientes
acuticos y da a los tipos diferentes de bacterias su forma.
Los grupos sanguneos dependen del tipo de glicoprotena de la membrana de
los glbulos rojos.
Polisacridos: elevado nmero de azcares unidos para generar macromolculas.
Los ms resaltantes son:
Glucgeno: es la forma de depsito de los carbohidratos en las clulas
animales.
Almidn: almacenamiento en la mayora de las plantas.
Celulosa: No es de almacenamiento, es estructural, es el ms abundante
en la biosfera. Es el principal componente estructural de la pared celular de
las plantas. LOS HUMANOS NO LA DEGRADAN.
cido hialurnico: componente de la matriz extracelular.
Configuraciones:
: si el OH unido al C1 est en posicin trans (lado opuesto). (1-2), (1-4),
(1-6): tienen libertad de giro.
: si el OH unido al C1 est en posicin cis (mismo lado). (1-4), (1-6): no
tienen libertad de giro. Los humanos no podemos degradar los enlaces (1-4).

Los carbohidratos pueden tener dos isomeras, sern dextro cuando los OH
unidos al carbono quiral estn a la derecha y sern levo cuando estn a la
izquierda. Los carbohidratos en el organismo se encuentran en configuracin
dextro.
Funciones:

Almacenamiento de energa celular (rpida).


Componentes estructurales.
Intervienen en la formacin de cidos nucleicos y otros elementos vitales
como enzimas y hormonas.
Sealizacin y reconocimiento celular (hormonas, anticuerpos, toxinas,
comunicacin clula-clula, clula-medio extracelular)

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Lpidos
Biomolculas orgnicas insolubles en agua, pero solubles en sustancias apolares como el
benceno, ter y cloroformo. Formados por C, H y O. Pueden ser total o parcialmente
hidrofbicos. Interaccionan entre ellos con interacciones de Van der Waals y en su interior
con enlaces covalentes.
Clasificacin:

Simples: Formados solo por lpidos.


cidos Grasos: tipos de lpidos ms simples que se conocen, formado por
un grupo carboxilo terminal (-COOH) y una larga cadena hidrocarbonada
de 14 a 22 tomos de carbono (los ms comunes son de 16 y 18 tomos).
Son anfipticas, pues el grupo carboxilo es hidrofilico y la cadena lateral es
hidrofbica. Se dividen a su vez en:
Saturados: No poseen dobles enlaces.
Insaturados: Poseen dobles enlaces.
Esteroides: hidrocarburos tetraciclicos saturados. Los ms conocidos son
las hormonas sexuales, el colesterol y los cidos biliares.
Colesterol: Tiene 27 tomos de carbono y es el principal regulador
de la fluidez de la membrana (a bajas temperaturas impide que los
cidos grasos se compacten y por ende evita la solidificacin de la
membrana. A altas temperaturas aumenta la cintica y la membrana
comenzara a disociarse si no fuese por el colesterol). Es tan
hidrofbica que se encuentra casi completamente sumergida en la
membrana, entre fosfolpidos.
Terpenos: Constituidos por un hidrocarburo, llamado isopreno. Son
netamente hidrofbicos. Las vitaminas forman parte de este grupo.

Mientras ms corta la cadena y mayor nmero de insaturaciones, el punto de fusin es


menor y el cido graso pasar de estado slido a lquido con ms rapidez.

Compuestos: O lpidos de membrana, formados de lpidos con otros compuestos,


tales como nitrgeno, fosforo y azufre e incluso otra biomolcula, como un glcido
Acilglicridos: Formados por cidos grasos y glicerol, se clasifican en
mono, di y triglicridos dependiendo de cuantos cidos grasos estn unidos
al glicerol.
Triglicridos: forma en la que el organismo guarda las molculas
de cidos grasos en la sangre. Molculas totalmente hidrfobas.
Son los lpidos ms abundantes en la naturaleza, almacenamiento
de energa.
Cridos: Formados de cidos grasos y alcohol. Impermeabilizan y
protegen.
Fosfoglicridos: la molcula ms simple es el cido fosfatidico,
compuesto por un glicerol unido a dos cidos grasos y a un grupo fosfato, a partir

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de ste cido se sintetizan los dems fosfolpidos. Constituyentes de las
membranas.
Esfingolpidos: son los ms abundantes en los tejidos de los organismos
ms complejos
Glucolpidos: Carbohidratos unidos a lpidos. Componen la membrana
celular.
Prostaglandinas: son derivados de los cidos grasos de 20 carbonos que
contienen un anillo ciclopentano, funcionan como activadores biolgicos.

La fosfatidilcolina y la esfingomielina tienden a estar en la regin extracelular.


La fosfatidilserina y la fosfatidilinositol tienden a estar en la regin intracelular.
La fosfatidiletanolamina puede estar en ambos sitios pero tiende a estar en la
regin intracelular.

Funciones:

Principal componente de la membrana plasmtica.


Proporcionan una importante fuente de energa de reserva (a largo plazo) un
gramo de grasa produce 9,4kcal.
Permite el reconocimiento entre clulas, bien sea como hormonas esteroideas o
como mensajeros moleculares que trasladan seales desde los receptores en la
superficie celular hasta dianas dentro de la clula.
Forman vitaminas, como A, D, E y K.

Protenas
Macromolculas formadas por polmeros de 20 aminocidos distintos unidos mediante
enlaces peptdicos.

Aminocidos
Monmeros que conforman a las protenas, compuestos por un carbono quiral
unido a un grupo amino (-NH3), un grupo carboxilo (-COO), un hidrgeno y una
cadena lateral. Esta cadena lateral es particular para cada aminocido y es
quin le va a dar sus caractersticas fsico-qumicas.

Clasificacin:
No polares: La cadena lateral no presenta carga. No hace puentes de H con el
agua, se encuentran en el interior de las protenas. (Glicina, Alanina, Prolina,
Valina, Triptfano, Fenilalanina, Leucina, Isoleucina, Metionina)
Polares:
Con carga
cidos Cargados negativamente. Como son hidrfilos estarn
en la superficie de la protena. (Aspartato, Glutamato)
Bsicos Cargados positivamente. Como son muy hidrfilos
estarn en la superficie de la protena. (Histidina, Arginina,
Lisina)

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Sin carga: Forman puentes de hidrgeno con el agua, por lo tanto se


ubican en el exterior de la protena. (Treonina, Tirosina, Asparragina,
Glutamina, Serina, Cistena)

Los aminocidos son iones dipolares, es decir, son elctricamente neutros pero
tienen cargas positivas o negativas sobre tomos diferentes, es decir, que pueden
aceptar o dar electrones. A pH fisiolgico estarn en su forma neutro. A pH bsico
cargados negativamente y a pH cido cargados positivamente.
Cuando los aminocidos estn en solucin son llamados monmeros.
El arreglo tridimensional de la protena depender de las propiedades de la cadena
lateral y de los aminocidos que la conforman.
La unin de un bajo nmero de aminocidos da lugar a un pptido, y si el nmero
es alto, a una protena, aunque los lmites entre ambos no estn definidos.
Aproximadamente:
Oligopptido: de 2 a 10 aminocidos.
Polipptido: entre 10 y 100 aminocidos.
Protena: ms de 100 aminocidos.
Monomricas: con una sola cadena.
Multimricas: ms de una cadena.
El hecho de que las grandes protenas se hallen integradas por cierto nmero de cadenas
individuales en lugar de una cadena nica muy larga tiene ciertas ventajas. Una de ellas
es que la presencia de diversas cadenas pequeas disminuye el efecto de errores
fortuitos que pueden tener lugar en la biosntesis de las molculas proteicas.

Clasificacin de las protenas:

Simples: su hidrlisis slo produce aminocidos (insulina, colgeno).


Conjugadas: su hidrlisis produce aminocidos y otras sustancias como grupos
prosticos.

Estructura de las protenas:


Estructura primaria: Corresponde a la secuencia de aminocidos en su cadena
polipeptdica. Algunas pueden tener dos o ms cadenas polipeptdicas.
Estructura secundaria: Corresponde al ordenamiento regular de los
aminocidos. Este nivel est estabilizado por puentes de hidrgeno.
Hlices : Se debe a la formacin de enlaces de hidrgeno entre el C=O
de un aminocido y el NH- del cuarto aminocido que le sigue. Hay
aproximadamente 3,6 aminocidos por vuelta. La cadena lateral de los
aminocidos se proyectan hacia el exterior de la hlice. La ordenacin en
hlice tiene la ventaja de que permite la formacin de enlaces de
hidrgeno intracatenarios entre vueltas sucesivas de la hlice. Es estable
con tal que las cadenas laterales de la cadena polipeptdica no posean
carga y sean relativamente pequeas. Sin embargo, existen puntos de
inestabilidad en donde es probable que se curve la hlice como respuesta
a otras fuerzas.

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Lmina : permite la asociacin de dos o ms cadenas de aminocidos de


una misma protena dispuestas una al lado de la otra, logran su estabilidad
mediante puentes de H entre los grupos amino y carboxilo de cadenas
adyacentes. Todas las cadenas laterales en cada una de las cadenas
alternan, primero arriba del eje de la lmina, despus abajo del mismo, y
as sucesivamente. Estas cadenas no deben ser muy grandes, ni crear un
impedimento estrico, ya que se vera afectada la estructura de la lmina.
Cadenas
paralelas.
Aquellas
que
ambas
van
de
grupo amino a carboxilo.
Cadenas anti paralelas. Aquellas que una va de amino a carboxilo
y otra de carboxilo a amino.
Estructura terciaria: corresponde al plegamiento de la cadena polipeptdica en el
espacio, con los aminocidos apolares en el interior y los polares en el exterior,
confirindole identidad a la protena. Esta estructura es la mnima requerida para
que la protena sea funcional y, adems, proporciona el centro activo en las
enzimas.
Estructura cuaternaria: corresponde a la disposicin de varias cadenas
polipeptdicas en el espacio. Las fuerzas de interaccin son: fuerza van der Waals,
puentes de H y fuerzas electrostticas.

La conformacin nativa de una protena es la forma ms estable de todas las formas


posibles, es decir, el estado en que posee la mnima energa libre.
Los enlaces sencillos poseen potencialmente una libertad de rotacin completa, mientras
que los enlaces dobles y triples son rgidos.
Desnaturalizacin de las protenas:
Consiste en el desplegamiento de la cadena polipeptdica rompindose todas las uniones
de la estructura por accin de altas temperaturas o variaciones de pH. En estado
desnaturalizado las cadenas polipeptdicas se hallan onduladas o enrolladas
irregularmente y al azar.
Renaturalizacin de las protenas
Si la estructura secundaria no ha sido daada, cuando se reestablecen las condiciones de
temperatura y pH normales, las protenas pueden ser renaturalizadas. El plegamiento de
una protena desnaturalizada no necesita aporte de trabajo qumico externo alguno.
Funciones de las protenas:

Componentes estructurales de rganos y tejidos (colgeno: piel, tendones,


cartlago; queratina).
Transporte y almacenamiento de molculas pequeas, por ejemplo: transporte
de oxgeno por la hemoglobina.
Transmitir informacin entre las clulas: hormonas proteicas.
Proporcionar una defensa frente a la intoxicacin: anticuerpos.
Regulacin de la actividad celular o fisiolgica: la insulina regula el
metabolismo glucosdico.
Colaboran con el mantenimiento del pH.
Contraccin de los msculos: actina y miosina.

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Enzimas
Molculas que se encargan de acelerar las reacciones qumicas en los sistemas
biolgicos, debido a su capacidad de unirse especficamente a un gran nmero de
molculas.
La mayora de las enzimas son de naturaleza proteica, sin embargo, existen ARN con
actividades catalticas, como las ribozimas, quienes son molculas de ARN con
actividades catalticas, su sustrato es otra molcula de ARN.
Funcionan a travs de la disminucin de la barrera de energa de activacin, la cual se
define con el nivel de transicin. El estado de transicin es la fase donde se generan o se
rompen los enlaces para formar el producto.
Caractersticas:

Al acelerar reacciones qumicas no modifican su composicin.


No alteran el equilibrio qumico entre el sustrato y el producto.
Trabajan a temperatura y pH ptimo especfico para cada enzima.
Su poder cataltico es de 106 a 1012.

Estructura
Las enzimas son generalmente de estructura proteica, de tamao variable, conformadas
por una cadena lineal de 62 a 2500 aminocidos aproximadamente.

Centro/sitio activo/cataltico: es una hendidura en la superficie de la enzima, donde


los sustratos se unen a la enzima para ser catalizados. Est formado por grupos
que provienen de diferentes partes de la secuencia de aminocidos, incluso
residuos muy alejados de aminocidos en la secuencia pueden, al plegarse,
interactuar ms fuertemente que los adyacentes. Por ejemplo, en el caso de la
quimiotripsina, tres aminocidos especficos conforman su centro activo: la
Histidina (aminocido #57), el Aspartato (aminocido #102) la serina (aminocido
#195).
Sitio alostrico: sitio alejado del centro activo donde se le puede unir otra
sustancia, que impide o incrementa la velocidad de la reaccin enzimtica
(Estimuladores o inhibidores alostricos)
Cofactores: molculas orgnicas (coenzimas) e inorgnicas que aaden grupos
qumicos con reactividades adicionales. Muchas coenzimas contienen una molcula
de una vitamina especfica.
Apoenzimas: parte proteica de la enzima.
Holoenzimas: enzima completa + cofactor.

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Enzima conjugada: son aquellas enzimas que deben unrsele un cofactor para lograr
su actividad cataltica.
Grupo prosttico: componente no aminocido, que se enlaza de forma covalente a la
enzima.
Las enzimas suelen trabajar juntas, en secuencias encadenadas en que el producto de la
primera enzima es el sustrato de la siguiente y as sucesivamente. Las pequeas
molculas de sustrato encuentran muy deprisa su camino de una molcula enzimtica a la
siguiente.
Regulacin enzimtica
Las enzimas son reguladas segn las necesidades fisiolgicas que se presenten, si ya
hay suficientes productos y no es necesaria la produccin de ms por un tiempo
entonces el cuerpo buscar la manera de detener a las enzimas, los mtodos son:

Inhibicin por retroalimentacin: el producto de la va metablica inhibe a la


enzima.
Regulacin alostrica: una molcula reguladora se une a la enzima en el
sitio alostrico, al unirse, se produce un cambio en su composicin, lo que
genera un cambio en el centro activo y, por consecuencia, de la actividad
enzimtica.
Fosforilacin: unin de una enzima a un grupo fosfato que, dependiendo de
la enzima, va a actuar como un inhibidor o un estimulador.

Inhibicin enzimtica

Inhibicin reversible: no se cambia de forma permanente la composicin de la


enzima.
Competitivo: la enzima y el inhibidor compiten por el centro activo. Este tipo
de inhibicin se puede superar con concentraciones suficientemente altas
del sustrato, es decir, dejando fuera de competicin al inhibidor. Los
inhibidores competitivos son a menudo similares en estructura al sustrato
verdadero
Mixto: la enzima y el inhibidor se unen al mismo tiempo en el centro activo,
afectndose mutuamente.
No competitivo: el inhibidor se une a un sitio diferente del centro activo, la
unin del inhibidor con la enzima reduce su actividad pero no afecta la
unin con el sustrato. Como resultado, el grado de inhibicin depende
solamente de la concentracin de inhibidor.
Inhibicin irreversible: normalmente modifican una enzima covalentemente, con lo
que la inhibicin no puede ser invertida, sin embargo el inhibidor puede estar tan
fuertemente unido a la enzima que son verdaderamente irreversibles.

Clasificacin

xido-Reductasas: participan en los procesos de xido reduccin, donde se


transfiere un H de un donante a un receptor, usando coenzimas como la
NAD+.

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Transferasas: se transfiere un grupo funcional desde un donante a un


receptor.
Hidrolasas: Catalizan la hidrlisis en enlaces qumicos. Obtencin de
monmeros a travs de polmeros.
Liasas: forman dobles enlaces para romper enlaces C-C, C-N y C-O, tambin
pueden romper dobles enlaces aadiendo un grupo funcional.
Isomerasas: transforman ciertas sustancias en ismeros.
Ligasas: catalizan la unin de dos molculas usando energa.

La especificidad de una enzima viene determinada por su naturaleza proteica y su forma


tridimensional. Las enzimas suelen ser muy especficas tanto del tipo de reaccin que
catalizan como del sustrato involucrado en la reaccin. La forma, la carga y las
caractersticas hidroflicas/hidrofbicas de las enzimas y los sustratos son los
responsables de dicha especificidad.
Unin del sustrato con la enzima
Modelo de la llave y la cerradura: el sustrato se une a la enzima encajando
perfectamente.
Modelo de ajuste inducido: la unin del sustrato distorsiona tanto las
conformaciones tanto de la enzima como del sustrato. Esta distorsin aproxima al sustrato
a la conformacin del estado de transicin, acelerando la reaccin.
Factores que afectan la velocidad de reaccin

Temperatura: hasta cierto punto, a mayor temperatura, mayor velocidad de


reaccin. Sin embargo, cuando la temperatura supera los niveles ptimos, la
enzima se desnaturaliza.
pH: El pH ptimo de una enzima es donde tiene su velocidad mxima. A pH muy
bajo la enzima se desnaturaliza y los cambios de pH generan un cambio en la
conformacin de la enzima.
Concentracin de la enzima: a mayor concentracin, mayor rapidez, pues la
interaccin enzima-sustrato es mayor.
Concentracin del sustrato: A concentracin constante de enzima, a mayor
concentracin de sustrato mayor velocidad, sin embargo a cierto punto termina
estabilizndose la velocidad de reaccin.

Km: concentracin de sustrato a la cual la velocidad de reaccin es la mitad de la


velocidad mxima.
VR= Vmax x S
S + Km
Describe la afinidad de una enzima por un sustrato. A menor K m, mayor afinidad y
viceversa. Es particular para cada enzima.

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Hay enzimas que pueden reconocer varios sustratos y sustratos reconocibles para varias
enzimas.
Desnaturalizacin: la estructura terciaria de la enzima es modificada por temperaturas
muy altas o pH muy bajos.

Ncleo interfsico
Cuando hablamos de ncleo interfsico nos referimos al ncleo entre dos mitosis.
El ncleo es la organela ms sobresaliente en casi todas las clulas animales y vegetales.
Se encuentra cubierto por una doble membrana es esfrico y su tamao vara acorde al
tamao de la clula.
El nmero de ncleos en la clula puede ser variable, en el caso de los hepatocitos,
encontramos dos ncleos.
Cuando el ncleo no est en mitosis el material gentico se encuentra disperso.

Organizacin interna
Cromatina: ADN + protenas. (cromosoma)
Eucromatina: cromatinas descondensadas y dispersas en el
nucleoplasma. En esta fase los genes son transcritos y el ADN puede
replicarse.
Heterocromatinas: cromatinas que se encuentran en un estado muy
condensado, similar a cuando la clula est en mitosis. Son
transcripcionalmente inactivas y contiene muchas secuencias repetidas.
Por lo general se encuentra en la periferia del nucleo.
Heterocroma
tina
facultativa:
contiene
informacin
de todos los
genes que se
expresan
o
que pueden
expresarse en
algn
momento.
Heterocroma
tina
constitutiva:

~ 15 ~

la secuencia de ADN que nunca se transcribe, solo constituyen y


siempre estn inactivos.
Dominios funcionales: disposicin organizada de los cromosomas, desempea
un papel fundamental en la expresin de genes. En vez de encontrarse
aleatoriamente, los cromosomas ocupan un lugar especfico en el interior nuclear.
Motas nucleares: estructura encargada de hacer el proceso de maduracin del
ARN (splicing)
Nucleolo: sitio nuclear de transcripcin y procesamiento de ARN ribosomal y
ensamblaje de los ribosomas.
Cuerpos MPL: cuerpos esfricos dispersos en el nucleoplasma que desempean
un papel de regulacin de la transcripcin.
Cuerpos de Cajal: es la zona donde se ensamblan las ribonucleoprotenas
(ARN+protenas), estas son las que participan como ARNmensajero hasta el
citoplasma.
Niveles de compactacin de los cromosomas:
1. Nucleosoma: unidad bsica estructural de la cromatina. Se ve como un collar
de cuentas, en el que cada cuenta es una subunidad esfrica o globular que se
denomina nucleosoma, quienes se hallan unidos entre s mediante fibras de
ADN, donde se unen protenas especficas de secuencia que van a colaborar
con la compactacin. En la parte interna del nucleosoma abundan secuencias
en el ADN ricas en adenina y timina. Hacia los lados externos abundan pares
guanina y citosina, debido a la interaccin con los aminocidos acetilados.
2. Cromatosoma: unin de la histona H1 (la cual evita que el ADN se desenrolle)
al nucleosoma central. Est compuesto por 166 pares de bases de ADN.
3. Cromtida: unidad longitudinal que se une a su hermana para formar los
cromosomas. El centrmero es el sitio de unin.
4. Cromosoma: portadores de la mayor parte de material gentico y condicionan
la organizacin gentica y las caractersticas hereditarias de cada especie.
Estructura externa

Envoltura nuclear: el ncleo est delimitado por una bicapa fosfolipdica


conformada por dos membranas nucleares, la interna y la externa. La
externa se contina con el retculo endoplasmtico y puede tener
ribosomas adheridos a ella. La membrana interna est constituda por
protenas nicas especficas para el ncleo. La funcin principal de la
envoltura nuclear es actuar como barrera que separa el citoplasma del
contenido nuclear, impidiendo el paso libre de las molculas entre el ncleo
y el citoplasma. Las membranas nucleares internas y externas se unen a
travs de los complejos de poro nuclear.
Lmina nuclear: Es una estructura que se localiza subyacente a la
membrana nuclear interna. Se define como una red fibrosa que
proporciona
soporte estructural al ncleo, compuestas por
protenas fibrosas de 60 a 80kDa llamadas lamininas. Las lminas
se ensamblan entre ellas para formar filamentos. El primer nivel de
asociacin ocurre entre dos cadenas polipeptdicas para formar un
dmero; el segundo nivel ocurre cuando los dmeros se asocian por
sus colas y sus cabezas forman polmeros; finalmente la cadena de
polmeros se asocia paralelamente con otros polmeros y ocurre el

~ 16 ~

tercer nivel que son los filamentos. Una alteracin en la lmina


nuclear puede causar el sndrome de Hutchinson- Gilford.
Complejo de poro nuclear: son los nicos canales a travs de los
cuales las molculas pequeas, iones y macromolculas pueden
desplazarse desde el citoplasma al ncleo. Es una estructura
grande de aproximadamente 120 nanmetros de dimetro y un
peso molecular de aproximadamente 125 millones de daltons y
compuesto por 30 protenas distintas. Est formado por ocho radios
ensamblados alrededor de un canal central, estos radios se unen a
unos anillos, unos en la superficie nuclear y el otro en la superficie
citoplasmtica. Filamentos de protenas se extienden desde el anillo
citoplasmtico al nuclear, formndose una especie de cesta del lado
nuclear. Dependiendo de su tamao las molculas atravesarn el
poro nuclear por mecanismos diferentes.

Proceso pasivo: consiste en el libre paso de molculas pequeas y protenas menores a


80kDa por el complejo de poro en ambas direcciones.
Proceso activo: Consiste en los procesos necesarios para que las macromolculas
(protenas y ARN) atraviesen el complejo de poro nuclear.

Seales de localizacin nuclear


La mayora de estas secuencias son cortas y ricas en aminocidos bsicos como la lisina
y la arginina. Sin embargo, en otros casos, los aminocidos que forman la seal de
localizacin nuclear estn juntos pero no necesariamente contiguos en la secuencia
(secuencia bipartita). Algunas son muy distantes en la secuencia de aminocidos y
dependen del correcto plegamiento de la protena para su actividad.

Transporte de Protenas

Ran: Protena que unida a Ran GTP o Ran GDP participa en los procesos de
importacin o exportacin nuclear.
GTP: guanosina trifosfatada.
GDP: guanosina difosfatada.
Ran GAP: unida a los filamentos citoplasmticos del complejo poro nuclear,
estimula la hidrolisis del GTP.
Ran GEF: ubicada en el ncleo, estimula el intercambio del GDP unido a Ran por
GTP.
Importina y exportina: receptores proteicos, que reconocen las seales de
importacin y exportacin y dirigen los procesos de importacin y exportacin
correspondientemente.
Importe de protenas al ncleo
1. La protena que contiene la seal de localizacin nuclear se une a la importina.
2. El complejo importina/protena de transporte se une a protenas presentes en
los filamentos citoplasmticos del complejo de poro nuclear.

~ 17 ~
3. El transporte se produce mediante la unin secuencial a protenas especficas
del poro nuclear, localizadas cada vez ms cera de la cara nuclear del
complejo del poro.
4. En la cara nuclear del complejo de poro, el complejo protenas de
transporte/importina se separa por la unin de Ran-GTP. Esto produce un
cambio conformacional en la importina, que desplaza la protena de transporte
y la libera en el ncleo.
5. El complejo importina-Ran/GTP se exporta a continuacin a travs del
complejo de poro nuclear.
6. En el citoplasma el GTP es hidrolizado a GDP, liberando a la importina.
Ran-GTP es tpico del ncleo y Ran-GDP es tpico del citoplasma.
Exportacin de protenas
1. Se forma un complejo en el ncleo entre las protenas que contienen la seal
de exportacin nuclear, la exportina y Ran-GTP
2. Tras el transporte a travs del complejo de poro nuclear, Ran-GAP (RanGTPasa) induce la hidrlisis de GTP dando lugar a Ran-GDP y a la liberacin
de la protena exportada.
3. Se traslada la exportina al ncleo.
Transporte de ARN
La mayora de los ARN son transportados del ncleo al citoplasma, puesto que las
protenas se sintetizan en el citoplasma.
Los ARN son transportados a travs de la envuelta nuclear por complejos
ribonucleoprotenas (ARN + protenas), algunas protenas del complejo poseen seales
de exportacin que son reconocidas por los receptores de transporte nuclear (Exportinas)

Los ARN ribosmicos se asocian con protenas ribosmicas y protenas


especficas del procesamiento de ARN en el nuclolo.
Los preARNm y ARNm estn asociados con un conjunto de al menos 20 protenas
durante su procesamiento en el nucleo y posterior transporte al citoplasma.
Los ARNt son exportados del nulceo por la accin de la exportina-t.
Los ARN ms pequeos (ARN pequeos nucleares) se deben asociar a protenas
ubicadas en el citoplasma para ser funcionales y regresar al ncleo.

La exportacin del ncleo est medida por seales de exporte nuclear presentes en las
protenas del complejo.

cidos nucleicos
Son macromolculas o polmeros de nucletidos unidos por enlace fosfodiester.
Nucletidos: Molcula orgnica formada por la unin covalente de un
monosacrido (pentosa), una base nitrogenada y un grupo fosfato.
Nucleosido: parte del nucletido formado nicamente por el monosacrido y la
base nitrogenada. Se unen a travs del enlace glucosdico.

~ 18 ~
Bases nitrogenadas: Entre las purinas tenemos a la guanina y a la adenina, que
poseen dos anillos aromticos; entre las pirimidinas tenemos la citosina, la timina y el
uracilo, que poseen solo un anillo aromtico. La adenina se aparea con el uracilo (ARN) y
la timina (ADN), formando dobles enlaces de hidrogeno; y la guanina se aparea con la
citosina formando triples enlaces de hidrgeno.
ARN: molcula conformada por un monosacrido, en este caso la ribosa y las
bases (adenina, uracilo, citosina o guanina). Existen diferentes tipos de ARN: el
mensajero, el ribosmico, el de transferencia y los pequeos nucleares.
ADN: cido desoxirribonucleico, es una molcula compuesta por polmeros de
nucletidos que contiene la informacin gentica de una clula, compuesta por el
monosacrido desoxirribosa, un grupo fosfato y las bases nitrogenadas (adenina, timina,
guanina y citosina). Est conformado por una doble hlice antiparalela, una corre en
sentido 5 3 y la otra en sentido 3 5. Las bases nitrogenadas estn estabilizadas por
enlaces por puentes de hidrgeno, efecto hidrofbico o fuerzas de Van der Waals.
Replicacin del ADN
Es un proceso en el que cada hebra parental sirve como molde para la sntesis de una
nueva hebra hija. La principal enzima implicada es la ADN polimerasa.
Ori: es el origen de replicacin, la secuencia especfica de ADN que sirve como
sitio de unin para las protenas que inician el proceso de replicacin. El ADN de una
procariota requiere de un solo Ori para replicarse, en cambio en las clulas humanas
deben poseer aproximadamente 30.000 Oris.
ADN polimerasa: es un complejo compuesto por diversas subunidades que poseen
diferentes funciones, y que ayudan en el trabajo de la replicacin del ADN. Requieren de
un cofactor, el magnesio, para poder funcionar. Todas las polimerasas sintetizan en
direccin 5 3, aadiendo dNTP (desoxinuclesido trifosfato) a un grupo OH
proporcionado por un cebador, formndose el enlace fosfodiester. El cebador est unido a
la hebra por puentes de hidrgeno. Requiere de un cebador para iniciar la sntesis.
En la hebra discontinua hay mltiples cebadores.
Los segmentos (seales) de replicacin de ADN son ricos en Adenina y Timina.

ADN polimerasa de las procariotas

ADN polimerasa I: implicada principalmente en la reparacin de ADN, tiene


actividades exonucleasas (que rompen los enlaces del ADN).
ADN polimerasa II: reparacin del ADN
ADN polmerasa III: Principal polimerasa replicativa, asociada a protenas
accesorias.

ADN polimerasa de las eucariotas


ADN polimerasa : implicada principalmente en la reparacin de ADN, tiene
actividades exonucleasas (que rompen los enlaces del ADN).
ADN polimerasa : Tiene actividad exonucleasa 3 5, participa en la doble lectura
del nuevo ADN.

~ 19 ~

Protena RFC ancla la ADN polimerasa sobre el ADN. PCNA alberga las
polimerasas y permite que contine la sntesis del ADN.
ADN polimerasa : Reparacin del ADN, tambin se asocia a las protenas de
arriba.
ADN polimerasa : reparacin de ADN.
ADN polimerasa : reparacin del ADN mitocondrial.
Fen 1: exonucleasa 5 3, extrae los iniciadores de ARN.

Horquilla de replicacin
Regin de la sntesis de ADN, donde las hebras parentales se separan y ofrecen dos
nuevas hebras hijas.
Sntesis de la hebra conductora y discontinua
La sntesis de las nuevas hebras de ADN trajo consigo un enigma, las hebras del ADN
son anti paralelas, es decir, al momento de sintetizarse la nueva hebra una tendra que
sintetizarse en sentido 5 3 y la otra en 3 5, sin embargo las ADN polimerasa solo
sintetizan en sentido 5 3. Entonces cmo se sintetiza la otra hebra? El enigma fue
resuelto al demostrarse que solo una hebra se sintetiza de forma continua (5 3) y la otra
de forma discontinua a partir de pequeas piezas de ADN que se sintetiza al revs con
respecto al movimiento de la horquilla de replicacin.
Fragmentos de Okazaki
Frangmentos de ADN y ARN que son el resultado de la hebra discontinua. Los fragmentos
de okazaki se sintetizan a partir de ARN cebadores sintetizados por unas enzimas
llamadas primasas. Para formar la hebra tarda deben eliminarse los fragmentos de
okazaki y ser reemplazados por ADN.
Helicasa: enzima que abre y desenrolla la doble hlice en el sitio de origen.
Sntesis de ADN procariota
1. Helicasa: cataliza el desenrollamiento del ADN parental, a travs de la
hidrlisis de ATP.
2. Topoisomerasa I: corta solo una hebra para evitar el sper enrollamiento.
3. Protena de unin al ADN monocatenario (SSF): estabiliza y mantiene
extendido el ADN monocatenario.
4. Polimerasa III: sintetiza la hebra continua y discontinua, utilizando un
cebador colocado por una primasa.
5. Fragmento de Okazaki: por accin de la primasa tormando como molde la
hebra discontinua.
6. Polimerasa II: elonga la hebra tarda usando como cebador los fragmentos
de okazaki.
7. ARNasas: quita el ARN.
8. ADN pol I: coloca ADN
9. ADN ligasa: une la hebra.
Sintesis de ADN eucariota
1. Helicasa: cataliza el desenrollamiento del ADN parental, a travs de la
hidrlisis de ATP.

~ 20 ~
2. Topoisomerasa I: corta solo una hebra para evitar el sper enrollamiento.
3. Protena de unin al ADN monocatenario (RFA): estabiliza y mantiene
extendido el ADN monocatenario.
4. ADN polimerasa /: sintetiza la hebra continua y discontinua, requiere de
un cebador colocado por la primasa.
5. Fragmento de Okazaki: por accin de la primasa/Pol tormando como
molde la hebra discontinua.
6. ADN polimerasa /: elonga la hebra retardada usando como cebados los
fragmentos de okazaki.
7. Fen 1: elimina ARN
8. ADN pol : adiciona el ADN
9. ADN ligasa: une la hebra.
Topoisomerasas: adems de la topoisomerasa I, que corta solo una hebra para
evitar el super enrollamiento, tenemos la topoisomerasa II, que rompe las dos hebras de
ADN, en un proceso que requiere de ATP.
Fidelidad de la replicacin
Se debe a la doble lectura de las ADN polimerasa. Ellas disminuyen favorablemente el
error de la replicacin de ADN, esto es muy importante, pues un error en la molcula de
ADN puede causar mutaciones.
Accin de la telomerasa
Tenemos el ADN telomerico (telmero = extremos) con el extremo 3 suelto, y una hebra
tarda recin sintetizada, la telomerasa se une al extremo suelto colocando su ARN
telomerasa y realiza su actividad de transcripcin inversa, extendiendo a la hebra
conductora, con accin de primasa y polimerasa se extiende la hebra tarda, se elimina el
cebador colocado por la primasa y de esta manera se ha extendido la hebra tarda, al
momento de recortar no se perder informacin de la hebra conductora.
Reparacin del ADN
Reparacin directa: No intervienen nucleasas ni ADN-polimerasas.
Metilacin de guanina: la guanina transfiere su grupo metilo al sitio activo de una enzima
especfica que tiene un residuo de cistena, formndose metilcistena.
Reparacin directa de un dmero de Timina: Un dmero de timina se forma cuando el
doble enlace se satura, formando un enlace simple, un ciclobutano. Los daos son
inducidos por luz UV o por agentes qumicos y se pueden reparar mediante la
fotorreactivacin, en la que la energa producida por la luz visible se utiliza para dividir los
enlaces formados en el anillo ciclobutano. Este proceso es exclusivo de los vegetales.
Reparacin indirecta: Hay intervencin de nucleasas y ADN-polimerasas. Se
necesita hebra molde perteneciente al mismo cromosoma o al homlogo.
Escisin de base: Reparan casos de alteraciones puntuales en bases nitrogenadas. Se
origina un sitio AP y luego se retira el nucletido AP y se resintetiza la hebra. Con la
accin de una ADN glicosilasa, se elimina el enlace entre la base nitrogenada y el
sacrido pentosa, luego con una exonucleasa se rompe la cadena de ADN, la

~ 21 ~
desoxirribosa restante es eliminada por una desoxirribosafosfodiesterasa, acta el ADN
polimerasa y luego la ligasa
Escisin de nucletido: Similar al anterior. Generalmente inducido por bases alteradas o
mal apareadas. Una nucleasa escinde una porcin de la hebra prxima al lugar del dao.
Inmediatamente se resintetiza una nueva siguiendo el molde complementario.
Recombinacin de regiones homlogas/ Unin de fragmentos terminales de hebras rotas:
Reparan lesiones en las que se ven afectadas ambas hebras, o en las que no existe una
hebra complementaria que pueda actuar de molde fiable.

Aminocidos
No polares: son hidrfobos, no solubles en agua.
Triptfano: Aminocido esencial. En su cadena lateral tiene N y dos anillos. Provee la
mayora de la absorbencia UV y fluorescencia de las protenas.
Fenilalanina: Aminocido esencial. En su cadena lateral tiene un anillo. Provee la
mayora de la absorbencia UV y fluorescencia de las protenas. La fenilalanina se puede
transformar, por medio de una reaccin catalizada por la enzima fenilalanina hidroxilasa,
en tirosina.
Metionina: Aminocido esencial. En su cadena lateral tiene S. Todos los procesos de
transcripcin de protenas comienzan con este aminocido. La metionina es un
intermediario en la biosntesis de la cistena, la carnitina, la taurina, la lecitina, la
fosfatidilcolina y otros fosfolpidos.

Valina: Aminocido esencial.


Leucina: Aminocido esencial.

Se emplean en el organismo como reguladores de la


sntesis y degradacin de protenas y son precursores
clave en la sntesis de la glutamina y alanina. Su
oxidacin genera energa anaerbica en los

Isoleucina: Aminocido esencial. Tiene un centro quiral extra.

~ 22 ~
Glicina: Su cadena lateral est formada solamente por un H. El grupo C 2N de todas las
purinas se consigue gracias a la glicina. Los residuos de glicina pueden acomodarse en el
interior hidrofbico de las protenas; esto le confiere flexibilidad en el pliegue de las
protenas con tendencia a formar hlices y permite versatilidad en la estructura de los
receptores.
Alanina: Su cadena lateral est formada solamente por un metano (CH3). Es el miembro
menos hidrfobo de los aminocidos no polares, su grupo metil es muy poco reactivo. La
alanina es muy comn por transferir su grupo amino al piruvato y puede desempear un
papel en el reconocimiento del sustrato o especificidad, particularmente en interacciones
con otros tomos no reactivos como el carbono.
Prolina: Su cadena lateral forma un anillo con el radical amino. Se forma directamente a
partir de la cadena pentacarbonada del cido glutmico. Debido a que el nitrgeno del
enlace peptdico forma parte de un ciclo dificulta las estructuras secundarias alfa-hlice y
lmina-beta de las protenas produciendo curvaturas o codos. La prolina puede sufrir
hidroxilacin, formndose la hidroxiprolina, en cuyo proceso de formacin es necesaria la
vitamina C.
Cistena: Su cadena lateral tiene un SH. Muy reactivo. Puede establecer puentes
disulfuro. Dentro de la clula, los puentes disulfuros entre residuos de cistena actan de
soporte en la estructura secundaria de polipptidos. Al perder su grupo amino se convierte
en uracilo.
Polares: son ms solubles en agua que los no polares.
Treonina: Aminocido esencial. Tiene HCOH en su cadena lateral. La treonina se
descompone en glicina. Forma parte de las glicoprotenas. Se fosforila.
Tirosina: Su cadena lateral tiene OH y un anillo. A pH elevado se ioniza. Provee la
mayora de la absorbencia UV y fluorescencia de las protenas. Se fosforila.
Serina: En su cadena lateral tiene OH. Juega un importante papel en la funcin cataltica
de muchas enzimas. Se fosforila y forma parte de las glicoprotenas.
Glutamina: En su cadena lateral tiene un O= y un grupo amino. Derivado del glutamato.
Posee un efecto tampn que neutraliza el exceso de cido en los msculos.
Asparragina: En su cadena lateral tiene un O= y un grupo amino. Derivado del Aspartato.
La cadena lateral de la asparragina puede formar enlaces de hidrgeno con el esqueleto
del pptido, los residuos de asparragina suelen encontrarse al principio y al final de la
estructura de hlice alfa, y en vueltas en lminas beta. Colabora en la sntesis de las
glucoprotenas. Forma parte de las glicoprotenas.
Bsicos
Histidina: Aminocido esencial. Su cadena lateral tiene un anillo con 2 NH. Durante la
catlisis, el nitrgeno bsico de la histidina es capaz de captar un protn de la serina,
tirosina y cistena, por eso forma parte del centro cataltico de determinados enzimas.
Lisina: Aminocido esencial. Tiene NH3 al final de su cadena lateral. La lisina se
metaboliza en los mamferos para dar acetil-CoA. Sufre acetilacin, es un componenete
de las histonas.

~ 23 ~
Arginina: Aminocido esencial. Tiene NH2-C=NH2 al final de su cadena lateral, la cual es
la ms grande de todas. Es el ms fuerte como base, para disociarlo debe estar a pH 12
por lo que difcilmente pierde la carga positiva. Es un componente de las histonas.
cidos
Aspartato: Tiene COO- en su cadena lateral. Su biosntesis tiene lugar por
transaminacin del cido oxalactico.
Glutamato: Tiene COO- en su cadena lateral.

~ 24 ~
(Unidad bsica)

Clasificacin
Carbohidratos:

Monosacridos:
3 a 7 tomos de carbono
Oligosacridos:
2-20 monosacridos
Polisacridos: +20 monosacridos

Lpidos:

Simples
Solo lpidos
Compuestos cidos grasos + N, P, S o un glcido

Pptidos:

Oligopptidos 2 a 10 aminocidos
Polipptidos
10 a 100 aminocidos
Protenas
ms de 100 aminocidos
Monomricas con una sola cadena
Multimricas
con ms de una cadena

Enzimas:

Oxido-Reductasas
Liasas
Hidrolasas
Ligasas
Transferasas
Isomerasas

cidos Nucleicos

Nucletidos
Nuclesidos

Bases + Pentosa + Fosfato


Bases + Pentosa

~ 25 ~

Trminos de inters
Hidrofbico: no interacta con el agua.
Hidrofilia: tiene afinidad con el agua.
Anfiptica: molcula con un extremo hidrofbico y uno hidrofilico. En presencia de
agua forman micelas, con el extremo hidrofilico hacia afuera y el extremo
hidrofbico hacia dentro.
Hidrolisis: Descomposicin de sustancias orgnicas e inorgnicas complejas en
otras ms sencillas por accin de agua.
ADN circular: no tiene extremos libres.
Enlace fosfodiester: enlace covalente entre el hidroxilo y el fosfato (OH y PO4-3),
liberndose 1 H2O
Enlace glucosdico: Se establece en forma de ter, siendo un tomo de oxgeno
el que une cada pareja de monosacridos. Reacciona un OH de cada monmero,
produciendo una molcula de agua. Si la reaccin de los OH provienen de los dos
carbonos quirales, el disacrido ser dicarbonlico y no tendr poder reductor. Sin
embargo, si en el enlace participan los OH de un carbono quiral y de otro carbono
no quiral, el disacrido ser monocarbonlico y tendr poder reductor (ya que
queda un grupo OH libre en el otro carbono quiral)
Enlace peptdico: Es un enlace entre el grupo amino (NH2) de un aminocido y
el grupo carboxilo (COOH) de otro aminocido. Implica la prdida de una
molcula de agua y la formacin de un enlace covalente CO-NH.
Fuerza Van der Waals: fuerza atractiva o repulsiva entre molculas (o partes de
una molcula)
dipolo permanente - dipolo permanente
dipolo permanente - dipolo inducido
dipolo inducido instantneo - dipolo inducido
Soluciones amortiguadoras: resisten a los cambios de pH (plasma sanguneo:
pH de 7,4)
Impedimento estrico: Propiedad de la estructura espacial de una molcula que
impide o retarda la reaccin con otra molcula. Por motivos geomtricos, el
acercamiento o choque de los grupos reaccionantes es difcil o imposible.
pH: Medida de acidez o alcalinidad de una disolucin. El pH indica la
concentracin de iones hidronio [H3O+] presentes en determinadas sustancias.
Histonas: protenas pequeas, bsicas, responsables de la compactacin del
ADN nuclear. Tienen secuencias capaces de interactuar con el ADN nuclear. Las
histonas tienen un cuerpo y una cola. En la cola las lisinas sufren una acetilacin
Intracatenario: puentes intracatenarios son los que se forman entre dos
aminocidos de una misma cadena polipeptdica. Estabilizan la estructura
secundaria (hlices alfa y lminas beta) y la terciaria (estructura tridimensional del
polipptido plegado).
Intercatenarios: Los puentes intercatenarios estabilizan la estructura cuaternaria
de la protena, pues son los puentes que se dan entre aminocidos de las distintas
cadenas.
Hidroxilacin: Reaccin qumica en la que se introduce un grupo hidroxilo (OH)
en un compuesto reemplazando un tomo de hidrgeno.
dNTP: Nucletidos fosfatados. stos son la materia prima del DNA. Literalmente
son los "ladrillos" para construir una hebra de cido nucleico. La polimerasa toma

~ 26 ~
estos dNTPs y los va organizando sobre una cadena de hexosas (desoxirribosa en
el DNA), en una secuencia determinada.
1. Qu posibles consecuencias funcionales, tendra para las clulas si en la
molcula de celulosa se sustituyen los enlaces Beta 1-4 por enlaces alfa 1-4?
No tenemos la maquinaria necesaria para degradar los enlaces beta 1-4.
2. Explique por qu la estructura terciaria de una protena se considera como la
relacin tridimensional de los aminocidos separados en la estructura
primaria.
Porque las cadenas laterales de estas cadena de aminocidos (en su estructura
primaria) interaccionan entre s para plegarse en su estructura terciaria.
3. Cul es la aplicacin prctica de la constante cintica Michaeliana KM?
Esta constante tiene aplicacin prctica en determinar la afinidad del sustrato por
la enzima, a mayor km menor afinidad y a menor km mayor afinidad.
4. Cules son los grupos de molculas lipdicas halladas en las
biomembranas? Justifique su respuesta. Establezca una diferencia y una
semejanza.
Estos son: fosfolipidos y colesterol bsicamente.
Diferencias: los fosfolipidos poseen 2 cidos grasos unidos a un glicerol y el
colesterol posee 4 anillos hidrocarbonados.
Semejanzas: ambos son anfipticos, poseen un grupo polar.
5. Explique por qu el calor de vaporizacin del agua contribuye a mantener la
temperatura corporal.
Porque toda la energa metablica se drena rompiendo puentes de hidrogeno, al
romperlos se libera calor. Y de tal forma se mantiene la temperatura corporal de
nuestro cuerpo.
6. El glucgeno constituye la forma de almacenamiento de la glucosa en
clulas hepticas. Por qu no sea almacena como glucosa libre?
No se almacenara la glucosa libre porque nos subira la glucosa en sangre,
proporcionara una hiperglicemia.
7. Explica un ejemplo de aplicabilidad biolgica de ADN recombinante.
Reproduccin en laboratorio de un gen que codifica para una protena de inters
(ejemplo, gen que codifica para la insulina.)
8. Con respecto al cuadro responda. ( definicin e importancia biolgica) de:
Calor de
vaporizacin

Temperatura a la
cual el agua pasa de
estado lquido a
estado gaseoso.

Constante

Capacidad de una

Todo el calor que


entra en nuestro
cuerpo es absorbido
por el agua, sale por
el sudor y por lo
tanto nos ayuda a
controlar la
temperatura corporal
Solvente universal

~ 27 ~
dielctrica

Calor especifico

sustancia para
disociar dos
molculas
Es la cantidad de
calor necesaria para
elevar 1C a 1gr de
agua.

Buen conductor
trmico, si una zona
de nuestro cuerpo
se est enfriando
permite transmitir
calor a dicha zona.

9. Explique por qu un organismo humano no debe consumir maz o avena.


Porque el organismo humano no posee la maquinaria necesaria para degradar los
enlaces beta 1-4.
10. Cul es la causa especifica de la existencia de los cebadores?
El cebador aporta el extremo 3 para la polimerizacin de nucletidos y la
elongacin de la cadena.
11. por qu el ADN polimerasa no se sintetiza de Novo?
Porque no puede aadir dntp a la cadena sino existe ese extremo 3 libre para
realizar la reaccin.
12. Por qu los organismos solo aprovechan el 60% de los vegetales?
Porque no somos capaces de degradar enlaces beta 1-4.
13. Usted quiere combinar una secuencia de ADN que utilizara para este
mecanismo.
Para combinar la secuencia de ADN, utilizara la tcnica del ADN recombinante.
14. Qu consecuencia trae para una protena en cuanto a la interaccin con un
medio acuoso el cambio de un aminocido polar por un no polar?
Un cambio conformacional, ya que el aminocido no polar va a disminuir su
contacto con el agua y este cambio puede inactivar la protena.
15. En un laboratorio tenemos un cultivo de clulas mononucleares de sangre
perifrica se han generado clulas mutantes donde la importina beta no se
une con RAN. Explique la consecuencia de este efecto.
Quedara disfuncional en el ncleo, por lo tanto no cumple su funcin.
16. Qu sucedera si una protena NSL se le cambia una lys por una asp?
Cambia su conformacin debido al cambio de un aminocido bsico por un cido,
la secuencia se modifica y no podr interaccionar con la importina. Al no
interaccionar con la importina no entra al ncleo.
17. Un investigador cambio la formacin gentica de una glicoprotena y
procedi a insertarle un gen con secuencia NSL por delante. Explique porque
esta protena no se encontr en el ncleo sino en el citoplasma disfuncional.
Seguramente los carbohidratos aadidos a la protena hacen un impedimento para
unirse con la importina por eso se encontr en el citoplasma disfuncional (porque
se le aadi una secuencia que no era propia).

~ 28 ~
18. Explique una forma lgica de inhibir una enzima.
Por inhibicin alosterica, un sitio activo se le une una molcula que hace un
cambio conformacional en la enzima y produce que esta no se una al sustrato.
19. Por qu se dice que las enzimas son compuestos saturables?
Porque pueden interactuar con una cantidad de sustrato en un periodo de tiempo.
20. Explique el nivel ms importante de las protenas y cules son estos niveles
que la conforman.
El nivel primario debido a que de este depende la estructura y funcionabilidad de la
protena. Las dems son estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria.
21. Diferencia entre RAN atp: exportina y importina.

22. Qu consecuencia trae que una exportina no reconozca RAN gtp?


Sino reconoce a ran gtp la exportina, no puede salir del ncleo por lo tanto no
puede exportar la molcula.
23. Tu como mdico deseas realizar una recombinacin mdica para la
produccin de insulina en un paciente con deficiencia de la misma explique
detalladamente como realizaras dicho experimento tan vital para el paciente.
La secuencia de ADN que codifica para la insulina, la unira a un vector de ADN
(plsmido) y la inserto en la clula del paciente para que se reproduzca la insulina
dentro de la clula.
24. Considerando que la reaccin catalizada por enzimas ha alcanzado su Vmax.
Explique un mecanismo que permita salir de la velocidad mx. y continuar
con la reaccin.
Aadir ms cantidad de enzimas para que se salga de la velocidad mxima y se
haga ms rpida la reaccin.
25. Un prestigioso medico en uno de sus experimentos agrego un frmaco ff/gg
el cual contiene un inhibidor. Qu consecuencias inmediatas traera para
una reaccin catalizada por enzimas el que haya un inhibidor competitivo en
el medio?
Que inhiba la protena por lo tanto se produzca una inactivacin enzimtica.
a- Qu efecto tiene el pH?
Ninguno, ya que la enzima esta inhibida.
b- Qu efecto tiene la temperatura?
Ningn efecto porque la protena esta inhibida y no cumple su funcin.
26. Diferencia entre coenzima y enzima.
La coenzima es un grupo prosttico, mientras que la enzima es una protena
cataltica.
27. De qu manera ms sencilla se pueden romper los puentes de hidrogeno del
agua.

~ 29 ~
Con calor, el calor es cintica y el movimiento produce el rompimiento de los
puentes de hidrogeno.
28. explique dos ejemplos de la regulacin del transporte interno hacia el ncleo
29. en un experimento gentico se desea obtener un ratn transgnico, con el
objetivo de instalarle el gen GP91 PHOX a su genoma usted como
investigador usara un plsmido o un prion para insertar el gen GP91 PHOX
al genoma del ratn. Diga una respuesta lgica?
Un plsmido ya que es un vector de ADN que me permite replicar el gen GP91
PHOX al genoma del ratn, en cambio un prion no por el hecho de ser una
protena.
30. Un investigador sin cometer ningn error, hizo un cultivo celular donde evito
que se duplicara el ADN diga qu estrategia aplico para que no se diera la
duplicacin.

31. Explique la reorganizacin del nuclolo y su funcin basada en cada


molcula.

32. Diga un ejemplo de regulacin del factor de transcripcin de clulas


eucariotas.

33. Una protena del medio acido se le alcaliniza su medio. Diga que sucede en
cuanto a su:
a- Su estructura qumica: cambia
b- Naturaleza qumica: queda igual porque sigue siendo la misma protena en el
medio acuoso.
34. Que consecuencia trae que la ADN polimerasa pierda su funcin como
exonucleasa. Esta consecuencia a nivel transcripcional que consecuencia
trae.

35. Establezca tres diferencias entre clulas procariotas y eucariotas.


Diferencia:
Eucariota
Procariota
Envoltura nuclear
presente
ausente
ADN
lineal
circular
Divisin celular
mitosis y meiosis
excision bipartita.
36. Diga tres diferencias entre carbohidratos y lpidos.
1. Un lpido rinde energticamente ms que un carbohidrato.

~ 30 ~
2. Los carbohidratos tiene naturaleza hidrofilica mientras que los lpidos tienen
naturaleza hidrofobico.
3. Los lpidos son hidrocarburos y los carbohidratos aldosas y cetosas.
37. Diga cuales son los monosacridos constituyentes de los siguientes
disacridos.
a. Maltosa: _________________ y _______________
b. Sacarosa: __________________ y ______________
c. Lactosa: __________________ y _______________
38. Teniendo el siguiente pptido, diga cuales de estn en dominio trans membrana,
intra membrana y extra membrana.
Arg-Lys-Ser-Lys-Lys-Asn-His-Gly-Ala-Leu
Cys-Gly-Lys-Pro-Val-Pro-Gly-Pro-Leu-Ala
Val-Asp-Glu-Tyr-Glu-Ser-Asp-Tyr-Glu-Glu
Intramembrana, transmembrana, extra membrana.
39. Defina ADN recombinante, hidrfilico, hidrofobico, Apolar, bipolaridad del
agua, enlace glucosidico, enlace fosfodiester, enzima, coenzima, fuerzas de
van der walls, clula procariota, clula eucariota, km, retrovirus, enlace
peptidico.

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