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Laura Mendoza

El comportamiento de una clula est determinado no solo por su genoma sino tambin
por cuales de estos genes se expresan en un momento determinado. En esto se basa la
diferenciacin celular. La regulacin de la expresin gnica permite a las clulas
adaptarse a los cambios en el ambiente.
La transcripcin es el primer proceso de la expresin gnica, mediante el cual se
transfiere informacin del ADN hacia protenas, usando ARN como mediador. La cadena
de doble hlice que va a servir de codificadora depende de cada gen. Solo el 10 al 12%
del ADN son genes.
Existen genes de tipo constitutivo y adaptativo.

Genes constitutivos: son genes que se expresan continuamente pues codifican


para enzimas o protenas necesarias para el metabolismo bsico.
Genes adaptativos: son genes que se expresan solo en determinadas situaciones,
por ejemplo cuando la clula se adapta a una determinada situacin ambiental, y
codifican para enzimas o protenas que se necesitan en momentos concretos.

El cdigo gentico es universal (excepto en algunas bacterias), organizado en codones,


especfico (cada codn codifica un aminocido), no es solapado, se lee en sentido 5 3,
redundante y no ambiguo (hay varios codones para un aminocido)
ARN polimerasa
La ARN polimerasa es una enzima compuesta de mltiples cadenas polipeptdicas que
cataliza la polimerizacin de NTP dirigida por un molde de ADN, siempre en direccin 53. Sin embargo, la ARN polimerasa no requiere de un cebador pues la transcripcin
comienza de novo en secuencias especificas al principio de los genes.
Aunque la ARN polimerasa es diferente en eucariotas y en procariotas, todas emplean
mecanismos fundamentalmente similares para transcribir el ADN.

Transcripcin en procariotas
La ARN polimerasa intacta se compone de cuatro subunidades denominadas: , , , y
. La subunidad est unida de forma relativamente dbil y puede separarse de las otras
subunidades para buscar ms promotores, o quedarse pegada a un promotor si es un
gen que debe transcribirse constantemente.

Subunidad

(x2)

Funcin
Reconocer al promotor
Ensamblaje de la enzima y regulacin de la
expresin
Forman una pinza que sujeta el molde de
ADN mediante enlaces fosfodiester ().
Acomodan aproximadamente 20 pares de
bases en su interior y contienen el centro
activo ().
Ensamblaje de la enzima y regulacin de la
frecuencia de iniciacin pues se unen a
protenas y secuencias reguladoras

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Promotor
Es la secuencia de ADN a la que se une la ARN polimerasa para iniciar la transcripcin de
un gen.
Corriente arriba existen dos tramos de secuencias que son similares en muchos genes.
Estas regiones abarcan seis nucletidos cada una y se encuentran de -10 a -35 bases
corriente arriba del sitio +1 (sitio de inicio).
stas secuencias no son idnticas entre distintos promotores, pero tienen una similitud
suficiente para establecer secuencias de consenso, y su importancia funcional viene dada
en que los genes con promotores que difieren de la secuencia consenso son transcritos
de una forma menos eficiente y en que cualquier mutacin introducida en cualquiera de
las dos secuencias puede afectar la funcin promotora.
La ARN polimerasa por lo general se une a los promotores en una regin de unos 60
pares de bases, que van desde el nucletido -40 corriente arriba al nucletido +20
corriente abajo. La subunidad se une a los sitios -35 y -10 por el tamao de sigma.
Inicialmente el conjunto entre la ARN polimerasa y el promotor se denomina complejo
promotor cerrado pues el ADN no est desenrollado. La polimerasa despus desenrolla
unas 12-14 bases de ADN alrededor de sitio de inicio, formando un complejo promotor
abierto donde ya hay una hebra de ADN para servir como molde para iniciar la
transcripcin, agregndosele dos NTP. Tras la adicin de unos 10 nucletidos, se
separa y la polimerasa progresa sobre el molde de ADN para continuar con la elongacin.
La polimerasa desenrolla el ADN que tiene por delante y va enrollando el que queda atrs,
manteniendo una regin desenrollada de aproximadamente 15 pares de bases. En el
interior de esta porcin, 8-9 bases de la cadena creciente de ARN se encuentran unidas a
la hebra de ADN molde.
Terminacin de la transcripcin
Cuando la ARN polimerasa encuentra una seal de terminacin, se detiene la
transcripcin separndose el ARN, la polimerasa y el ADN.
Existen dos mecanismos para terminar la transcripcin, el ms simple y comn consiste
en una secuencia palindrmica rica en GC seguida de cuatro o ms residuos de A. La
secuencia palindrmica forma una horquilla y la transcripcin llega a su fin. Se cree que la
presencia de residuos de A facilita la disociacin del ARN del molde pues los enlaces A-U
son ms dbiles. Sin embargo, en algunos genes puede terminarse la transcripcin
gracias a una protena llamada , que se une a los segmentos mayores de 60 nucletidos
de ARN.
Control de la transcripcin
La mayora de la regulacin transcripcional en bacterias ocurre en la iniciacin, aunque
tambin puede regularse en la elongacin.
Los genes en procariotas estn organizados en operones, los cuales son un grupo de
genes estructurales cuya expresin est regulada por elementos de control o genes. Un
opern consiste en:

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Un operador: Controla el acceso de la ARN polimerasa al promotor.


Un gen regulador: Controla el tiempo y la velocidad de transcripcin de otros
genes. ste gen codifica para una protena que se une al operador, obstruyendo el
promotor. Cuando se remueve la protena represora, puede producirse la
transcripcin.
Un promotor.
Un gen estructural: segmento de ADN que codifica para un polipptido especfico.

Los modelos de regulacin de la transcripcin pueden ser:

Inducibles: Donde la protena reguladora es un represor que impide la expresin


de genes estructurales en ausencia del inductor. (ejemplo: cuando no hay lactosa)
Reprimibles: Cuando un producto metablico (ejemplo: triptfano) est en
cantidades suficientes, se pueden dejar de fabricar las enzimas que lo sintetizan.
En este sistema, el producto es el represor.

A su vez, el control de la transcripcin puede ser negativo o positivo.

Control negativo de la transcripcin: es cuando la protena represora detiene la


transcripcin. Por ejemplo, el opern lac. Cuando no hay lactosa en el medio, el
represor se une al operador y bloquea la transcripcin de los genes estructurales.
Control positivo de la transcripcin: es cuando el producto del gen regulador activa
la expresin de los genes. Por ejemplo, la glucosa se usa de forma preferencial
como fuente de energa, por lo tanto, si est disponible, no se expresan las
enzimas implicadas en fuentes alternativas de energa. La glucosa reprime al
opern lac incluso en presencia del inductor normal (lactosa). Esta represin
positiva depende de los niveles de AMPc.

Transcripcin en eucariotas
La transcripcin en eucariotas es mucho ms compleja que en procariotas. Esto se refleja
en tres diferencias fundamentales:

Las clulas eucariotas contienen varias ARN polimerasas que transcriben distintas
clases de genes.
Las ARN polimerasas en eucariotas interaccionan con un conjunto de protenas
especficas (factores de transcripcin) para iniciar la transcripcin.
La transcripcin en eucariotas tiene lugar sobre la cromatina y no sobre el ADN
libre.

Los factores de transcripcin son esenciales para la transcripcin pero no pueden


aumentar o disminuir su ritmo.
ARN polimerasa en eucariotas
Las tres ARN polimerasas nucleares son enzimas complejas que se componen de 12 a 17
subunidades cada una.

ARN polimerasa
I

Nro de subunidades

Tipos de ARN sintetizados

13 subunidades

-ARNr 28S, 18S, 5,8S

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12 subunidades

II

17 subunidades

III

-Genes
codificadores
protenas (ARNm)

de

-Transcribir
ARNmi

de

molculas

-ARNr 5S
-ARNt (ARNtransferencia)
-ARNsn y ARNsc

II y III
Mitocondriales
Cloroplsticas

-Genes mitocondriales
-Genes cloroplsticos

ARN polimerasa II
La polimerasa II solo es capaz de iniciar la transcripcin si se aaden protenas
adicionales a la reaccin, llamadas factores de transcripcin. Aproximadamente el 10% de
los genes codifica factores de transcripcin.
Promotores
Los promotores de los genes transcritos por la polimerasa II contienen varias secuencias
diferentes. El primer elemento descrito fue la caja TATA (TATAA) situada a 25-30
nucletidos corriente arriba, sin embargo esta secuencia solo aparece en el 10-20% de
los promotores de la ARN polimerasa II. Otras secuencias son el elemento iniciador (Inr),
los elementos de reconocimiento por TFIIB (BRE) y varios elementos localizados corriente
abajo (DPE, DCE, MTE).
Maquinaria de transcripcin
Se requieren cinco (o seis) factores generales de transcripcin para poner en marcha la
transcripcin por la polimerasa II (TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH) y un complejo proteico
mediador que consiste en ms de 20 subunidades distintas que interaccionan con los
factores generales de transcripcin y con la ARN polimerasa.

Nombre

Funcin

(TFIIA)

Forma un complejo con TBP y la caja


TATA.
Acta como puente para que la
polimerasa se una a TBP.
Se une a la secuencia BRE.
TBP se une a la caja TATA y las otras
subunidades se unen a Inr, DPE, DPC
y MTE.
Estabiliza la ARN polimerasa II
mientras est en contacto con TBP y
TFIIB

TFIIB

TFIID

TFIIF

Subunidades

Protena de unin a TATA (TBP)


14 polipptidos llamados factores
asociados a TBP (TAF)

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TFIIE
TFIIH

Induce la liberacin de la polimerasa


mediante la fosforilacin del CTD

Mediador

Estimula la transcripcin basal y


desempea una funcin en la
asociacin de los factores generales
de transcripcin
con los factores
especficos de transcripcin de ciertos
genes que regulan la expresin gnica.

Dos
subunidades
helicasas
necesarias tambin para la
escisin
y
reparacin
de
nucletidos.
Una protena quinasa que fosforila
20 subunidades distintas

1. Se forma un complejo entre TFIID y el promotor.


2. Se une TFIIB a la subunidad TBP de TFIID y a la secuencia BRE para actuar como
puente entre la polimerasa y TBP.
3. La polimerasa se une a TBP-TFIIB junto al tercer factor, TFIIF, que estabiliza el
complejo.
4. Se unen TFIIE y TFIIH, completando el complejo de preiniciacin.
5. Una subunidad de TFIIH fosforila determinadas secuencias repetidas en el dominio
C-terminal de la polimerasa II (CTD), el cual consiste en repeticiones en tndem
(27 en levaduras, 53 en humanos) de siete aminocidos con la secuencia Tyr-SerPro-Thr-Ser-Pro-Ser.
6. Las protenas mediadoras se liberan de la polimerasa.
7. La fosforilacin del residuo 5 de serina induce la liberacin de la polimerasa del
complejo de preiniciacin y da lugar al comienzo de la transcripcin.
8. El CDT fosforilado se une a otros factores de elongacin y procesamiento.
ARN polimerasa I
sta polimerasa transcribe genes de ARN ribosmico, que est presente en forma de
repeticiones en tndem. La transcripcin de estos genes da lugar a un pre-ARNr 45S de
gran tamao, que es procesado para dar los ARNr 28S, 18S y 5,8S. El promotor de los
genes de ARN ribosmico se extiende unos 150 pares de bases corriente arriba del sitio
de inicio de la transcripcin. Estas secuencias son reconocidas por los factores de
transcripcin UBF y SL1, que se unen al promotor y reclutan a la polimerasa I.
El factor de transcripcin SL1 contiene una subunidad TBP, aunque el promotor de los
genes de ARN ribosmico no contiene una secuencia TATA.
ARN polimerasa III
sta polimerasa transcribe los genes del ARNt, ARNr 5S y MicroARN a partir de tres
clases de promotores diferentes, dos de los cuales se encuentran en el interior de la
secuencia transcrita.

ARNr 5S:
1. El factor TFIIIA se une al promotor.
2. Se unen secuencialmente TFIIIC y TFIIIB y la polimerasa.

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ARNt: Los promotores de ARNt no contienen la secuencia de ADN reconocida por


el TFIIIA.
1. El factor TFIIIC se une a los promotores de los genes de ARNt.
2. Se unen secuencialmente TFIIIB y la polimerasa.
MicroARN: Los promotores se localizan por delante del punto de iniciacin de la
transcripcin. Contienen una secuencia TATA y un punto de unin para otro factor
llamado SNAP.
1. SNAP y TFIIIB se unen a los promotores (TFIIIB a la caja TATA mediante
TBP)
2. TFIIIB recluta a la polimerasa.

Regulacin de la transcripcin
En eucariotas la transcripcin tambin est controlada por protenas que se unen a
secuencias reguladoras especficas y modulan la actividad de la ARN polimerasa.
Adems, existen ARN no codificantes quienes tambin regulan la transcripcin en las
clulas mediante modificaciones de la estructura cromatnica.
Todas las clulas tienen el mismo genoma, pero existen ms de 200 tipos de clulas, es
decir que la diferenciacin celular est basada en la regulacin de la expresin de los
genes. No todas las clulas fabrican las mismas protenas.
Control transcripcional:
Secuencias reguladoras:
Enhancers o intensificadoras: Secuencias reguladoras de accin en cis que
pueden estar localizadas a miles de nucletidos corriente arriba o corriente abajo
del promotor, en un cromosoma homlogo e incluso en un intrn. Se le unen
protenas activadoras (factores especficos de la traduccin), quienes ayudan a
determinar cules genes sern encendidos y la tasa de transcripcin que
tendrn. Existen aisladores que dividen cromosomas en dominios individuales de
cromatina que no puede extenderse ms all del aislante y previenen que un
enhancer en un dominio acte sobre el promotor del dominio siguiente.
Las protenas activadoras constan de dos dominios: una regin que se une al ADN, la cual
ancla el factor de transcripcin en el sitio correcto del ADN; y otra regin que activa la
transcripcin interactuando con otras protenas, incluyendo el mediador u otros
componentes de la maquinaria de transcripcin.
Estos dominios de unin al ADN pueden ser:

Dominio de dedo de Zinc: contiene repeticiones cistena e histidina que ligan iones
de cinc y se pliegan en bucles que se unen al ADN. Los receptores de hormonas
esteroideas, que regulan la transcripcin en respuesta a hormonas como
estrgeno y testosterona, poseen dominios en dedos de zinc.
Hlice-giro-hlice: Una hlice est en contacto con el ADN y las otras estabilizan la
interaccin.
Cremallera de leucina: contiene cuatro o cinco residuos de leucina separados por
intervalos de siete aminocidos. Inmediatamente despus de esta cremallera
existe una regin rica en lisina y arginina, que se une al ADN.

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Hlice-bucle-hlice: es similar a la cremallera de leucina, pero sus dominios de


dimerizacin estn formados por dos regiones helicoidales, separados por un
bucle.

Distintos miembros de cremalleras de leucina y hlices-bucles-hlices pueden formar


dmeros, teniendo una importante funcin en la especificidad tisular.
Los dominios activadores de estos factores de transcripcin pueden ser ricos en Aspartato
y glutamato, otros pueden ser ricos en prolina o glutamina.
Los factores de activacin interactan con varios coactivadores que estimulan la
transcripcin modificando la estructura de la cromatina

Silencers o silenciadoras: Secuencias reguladoras de accin en cis que pueden


estar localizada a miles de nucletidos del promotor, que hacen ms lenta la
transcripcin. Se les unen protenas represoras (factores especficos de la
traduccin)

Algunas protenas represoras pueden simplemente interferir con la unin de otros factores
transcripcionales al ADN, otras compiten con los activadores por unirse a secuencias
especficas de regulacin. Otros contienen dominios especficos que inhiben la
transcripcin por medio de interacciones protena-protena (protenas activadoras
especficas, con el mediador, con factores de transcripcin generales o con co-represores
que modifican la estructura de la cromatina)
Los dominios represores pueden ser ricos en residuos de alanina, prolina o residuos
acdicos.
Regulacin de la elongacin: Tras el comienzo de la transcripcin, la polimerasa
sintetiza una secuencia corta de ARN y se detiene en un sitio cercano al comienzo
del gen, aproximadamente a unos 50 nucletidos del sitio de inicio. Esta parada
obedece a la asociacin de factores negativos como NELF y DSIF. La reanudacin
del proceso depende de la accin de otro factor, llamado P-TEFb, el cual fosforila a
los factores NELF, DSIF y a la serina del CDT de la polimerasa.
Modificacin de la cromatina:
Las protenas HMG afectan la estructura de la fibra de la cromatina. Se conocen tres
familias de estas protenas: HMGA, HMGB y HMGN. Las protenas HMGA y HMGB
pueden curvar la molcula de ADN para facilitar la unin de diversos factores reguladores
de la cromatina. HMGN se unen a los nucleosomas en sitios que se solapan con la unin
de la H1 y pueden inducir a la descondensacin de la estructura de la cromatina.
Las modificaciones de las histonas influyen en la expresin gnica tanto como
consecuencia de la alteracin de las propiedades de la cromatina como al crear sitios de
unin de otras protenas que activan o inhiben la transcripcin. stas modificaciones se
regulan entre si, es decir, un cambio que favorezca la activacin puede inducir otro
cambio que favorezca la activacin y ste inhibe un cambio que favorezca la represin. O
por el contrario, un cambio que favorezca la represin puede inhibir un cambio que

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favorezca la activacin. Esto es un mecanismo de herencia epigentica pues las histonas


modificadas pasan de los cromosomas parentales a los cromosomas hijos.

Aminocidos
acetilables:
lisina

Aminocidos
metilables:
lisina y arginina

Acetilacin de histonas: favorece la transcripcin. Las histonas estn cargadas


positivamente, al acetilarlas se neutralizan sus cargas positivas y reduce la
capacidad de unirse al ADN, expandiendo la cromatina. Algunos represores
genticos desacetilan las histonas y algunos activadores genticos las
acetilan. Tambin regulan la reparacin del ADN. Las histonas
acetiltransferasas se asocian a coactivadores transcripcionales y a TFIID. Los
residuos acetilados de lisina actan como sitio de unin de muchos otros
factores activadores.
Metilacin de histonas: Puede estar relacionado con la activacin o la
represin de la transcripcin. Algunas protenas activadoras se unen a
residuos metilados de lisina-4, mientras que la metilacin de las lisinas 9 y 27
de H3 se asocian a la condensacin y represin de la cromatina.
Fosforilacin de histonas: por lo general est relacionado con la activacin
transcripcional.

Aminocidos

fosforilables:
treonina, serina,
tirosina
La elongacin transcripcional a travs de la cromatina se ve facilitada por los factores de
elongacin asociados al dominio C-Terminal fosforilado de la polimerasa II. Entre estos
factores figuran enzimas modificadoras de histonas (acetiltransferasas y
metiltransferasas) y factores remodeladores de la cromatina, quienes son complejos
proteicos que aprovechan la energa de la hidrolisis del ATP para alterar los contactos del
ADN con las histonas. Los mecanismos de accin de estos factores pueden ser:
o
o

El desplazamiento de las histonas a lo largo de la molcula de ADN.


La induccin de cambios conformacionales en los nucleosomas: afectando la
capacidad de secuencias especficas de ADN de interaccionar con protenas
reguladoras transcripcionales.
Eliminar histonas del ADN.
Metilacin del ADN: Los residuos de citosina que preceden a guaninas en el
ADN son modificados por la adicin de grupos metilos en el carbono 5 para
reprimir la transcripcin. Es una forma de herencia epigentica.

Un papel regulador importante de la metilacin del ADN es la impresin genmica o


imprinting, que controla la expresin de algunos genes del desarrollo embrionario, pues
existen algunos genes cuya expresin depende de si se heredan de la madre o del padre.

Regulacin por ARN no codificante: Molculas de ARNsi (de interferencia) y


MicroARN suelen inhibir la traduccin o inducir la degradacin de ARNm
homlogos a travs de la induccin de modificaciones de histonas. Los ARNsi
se asocian a un complejo proteico RITS (complejo de silenciamiento
transcripcional inducido por ARN) que contiene protenas que inducen la
condensacin cromatnica y la metilacin de la lisina-9 de H3. Tambin puede
inducir la degradacin de un ARNm mediante el complejo RISC.

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Inactivacin del cromosoma X


El cromosoma X contiene unos 1000 genes que no estn presentes en el cromosoma Y,
sin embargo, las clulas femeninas y masculinas contienen cantidades equivalentes de
las protenas codificadas por genes del cromosoma X, pues existe un mecanismo de
compensacin de la dosis, en el que la mayora de los genes de uno de los cromosomas
X estn inactivados tras ser convertidos en heterocromatina en un estadio temprano del
desarrollo.
ste mecanismo tiene su clave en un ARN no codificante transcrito a partir de un gen
regulador llamado Xist, el cual recluta un complejo proteico que induce la metilacin de la
lisina-27 y 9 de la H3, provocando la condensacin de la cromatina.
Control post-transcripcional:
Empalme alternativo: Dos molculas de ARNm son procesadas de manera
diferente a partir del mismo gen.

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Maduracin y renovacin del ARN


La mayor parte del ARN de nueva sntesis debe ser modificado para convertirse en su
forma funcional, exceptuando el ARNm bacterianos, pues se usa mientras estn siendo
transcritos. La maduracin de ARNr y ARNt es similar en eucariotas y procariotas.
ARN ribosmico
Las procariotas poseen tres ARNr (23S, 16S, 5S), los cuales son obtenidos a partir de un
pre-ARN nico.
Las eucariotas poseen cuatro tipos de ARNr (28S, 18S, 5,8S y 5S), el nico que no es
casi procesado es el ARNr 5S pues se transcribe a partir de un gen distinto, mientras que
los otros tres provienen de un pre-ARN comn.
Maduracin del ARNr en bacterias:
1. Corte inicial del pre-ARN produce precursores separados para los tres ARNr.
2. Se producen escisiones secundarias hasta obtener los productos finales.
Maduracin en eucariotas: tiene lugar en el nuclolo.
1. Corte inicial en un sitio adyacente al ARNr 5,8S en su extremo 5, dando dos
precursores que contienen el ARNr 18S y el ARNr 28S y 5,8S
2. Escisiones posteriores dan lugar a los productos finales.
3. El ARNr 5,8S se une por puentes de H a la molcula de 28S
ARN de transferencia
Los ARNt eucariticos y bacterianos son sintetizados como pre-ARNt, algunas de las
cuales contienen secuencias de varios ARNt individuales.
En bacterias, algunos ARNt proceden de los transcritos pre-ARNr.

El procesamiento del extremo 5 de los pre-ARNt se realiza gracias a una


ribozima llamada ARNasa P, la cual contiene ARN como centro cataltico y
molculas protenicas sin las cuales no tiene el nivel de actividad mximo.
El procesamiento del extremo 3 de los ARNt se forma por la accin de una
ARNasa proteica, que, en caso de que no lo tenga ya, aade una secuencia
terminal CCA.

Aproximadamente un 10% de las bases de ARNt son alteradas para dar una serie de
nucletidos modificados en posiciones especficas. Algunos pre-ARNt tienen intrones que
son eliminados por corte y empalme mediado por enzimas proteicas convencionales
ARN mensajero en eucariotas
Las principales diferencias entre la maduracin del ARNm en procariotas y eucariotas son
que en las bacterias la traduccin ocurre de forma inmediata; que en eucariotas el ARNm

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debe ser transportado al citoplasma y que el pre-ARNm en eucariotas debe ser


ampliamente modificado en ambos extremos y se deben eliminar los intrones.
Estas reacciones estn acopladas a la transcripcin y el dominio CTD de la pol II sirve
como sitio de unin para los complejos enzimticos implicados en la maduracin. sta
asociacin es responsable de la especificidad de la pol II en el procesamiento del ARNm.
Las pol I y III no tienen CTD, por lo que sus productos no son procesados por los mismos
complejos enzimticos.
Pasos:
1. Modificacin del extremo 5 mediante la adicin de una caperuza o cap de 7metilguanosina: sta caperuza se forma por la adicin de una molcula de GTP
inversa al nucletido 5 terminal, luego se aaden grupos metilo a este residuo de
G y a las ribosa de uno o dos nucletidos 5. Las enzimas responsables de esta
reaccin son reclutadas al CTD fosforilado y la caperuza es aadida tras la
transcripcin de 20-30 nucletidos. sta caperuza estabiliza el ARN y alinea los
ARNm eucariticos sobre el ribosoma.
2. El extremo 3 de la mayora de los ARNm eucariticos se forma por el corte del
transcrito primario y la adicin de una cola de poli-A (poliadenilacin). Las seales
para este proceso incluyen un hexanucletido (AAUAAA) localizado entre 10 y 30
nucletidos corriente arriba del sitio de poliadenilacin y un elemento de
secuencias ricas en G-U corriente abajo, aunque algunos genes tienen estas
secuencias de G-U corriente arriba de AAUAAA. Estas secuencias son
reconocidas por un grupo de protenas, incluyendo una endonucleasa que corta la
cadena de ARN y una poli-A polimerasa que aade una cola de unos 200
nucletidos. stas enzimas se asocian con el CTD fosforilado y pueden viajar con
la polimerasa desde la iniciacin. Las colas de poli-A regulan la traduccin y la
estabilidad del ARNm.
Ambas modificaciones protegen al ARN de la degradacin.
Corte y empalme (splicing)
La mayor parte de los genes estn interrumpidos por mltiples secuencias no codificantes
llamadas intrones que son escindidas de forma precisa del ARN maduro. Los pre-ARNm
contienen mltiples exones cortos (150 nucletidos en humanos) separados por intrones
de aproximadamente 3500 nucletidos.
Las seales para el corte y empalme son secuencias consenso en cada sitio de corte y de
ramificacin.
El splicing tiene lugar en complejos llamados espliceosomas, compuestos de protena y
ARN. Estos ARN, llamados ARN pequeos nucleares (ARNsn) son de cinco tipos: U1, U2,
U4, U5 y U6, que tienen un tamao de entre 50 y 200 nucletidos, formando un complejo
con entre seis y diez molculas protenicas para dar RNPsn.

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Las RNPsn U1, U2 y U5 contienen cada una una molcula nica de ARNsn, mientras que
las RNPsn U4 y U6 estn unidas entre s formando una nica RNPsn.
1.
2.
3.
4.
5.

6.
7.

RNPsn U1 se une al sitio de corte 5 (secuencia GU).


RNPsn U2 se une al punto de ramificacin y a U1, convirtiendo al ARN en una
especie de bmeran.
Se incorpora U4/U6 y U5. La U5 se une a secuencias corriente arriba del punto
de corte 5 y a U1. U4/U6 se une a sitio de corte 3 (secuencia AG).
El pre-ARNm es cortado en el sitio de corte y empalme 5.
U4 y U1 se disocian del complejo, y U6 sustituye a U1 y hace un complejo con
U2, poniendo en contacto el punto de ramificacin (un nucletido de adenina
cerca del extremo 3) y el extremo 5 del intrn, formndose un bucle por el
vnculo inusual entre el extremo 5 del intrn y el grupo hidroxilo 2 de la adenina.
U5, an unido a las secuencias corriente arriba del punto de corte 5, se une a
secuencias del sitio de corte 3, mantenindose la alineacin entre los exones 5 y
3
Se corta en 3 y se unen los dos exones. El intron es escindido como un lazo y es
degradado en el ncleo.

El reconocimiento de los sitios de corte se realiza por apareamiento de bases entre la


secuencia del consenso del 5 y una secuencia complementaria en el ARNsn. Sin
embargo, los intrones contienen muchas secuencias parecidas a los puntos de corte y
empalme, la identificacin de los lugares correctos de splicing se logra mediante protenas
llamadas factores de corte y empalme, que se unen a secuencias especficas de ARN en
exones y reclutan las RNPsn U1 y U2 mediante interacciones protena-protena.
Los factores de corte y empalme tambin acoplan el corte y empalme a la transcripcin
mediante su asociacin con el CTD fosforilado de la pol II, para asegurar que los exones
se unan en el orden correcto a medida que se sintetiza el pre-ARNm.
Los ARNsn pueden catalizar la reaccin de corte y empalme de forma directa. Es decir,
determinados intrones en mitocondrias, cloroplastos y bacterias pueden autoempalmarse.
U2 y U6 pueden catalizar ambos pasos del corte y empalme del pre-ARNm en ausencia
de protenas.
Corte y empalme alternativo
Se puede regular la expresin gnica por medio del control de la maquinaria celular que
lleva a cabo el corte y empalme. Se pueden producir distintos ARNm partiendo del mismo
gen combinando los sitios de corte. Por ejemplo, ms del 50% de los genes humanos
producen transcritos que sufren corte y empalme alternativo, que podra aumentar la
diversidad de protenas que pueden ser codificadas pues los patrones de corte y empalme
alternativos pueden variar entre los distintos tejidos y en respuesta a seales
extracelulares.
Un gran grupo de protenas regulan el corte y empalme mediante la unin a secuencias
silenciadoras o activadoras.

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Laura Mendoza

Correccin del ARN


Son los procesos de maduracin que alteran las secuencias codificadoras de protenas de
algunos ARNm. La correccin del ARNm implica cambios de bases nicas, como la
desaminacin de citosina a uridina y de adenosina a inosina.
Un ejemplo de desaminacin de citosina a uridina es la correccin que da lugar a dos
formas distintas de la apolipoprotena B. Una forma de esta protena es ms corta, por lo
tanto tienen funciones diferentes, una se encuentra en el hgado y la otra en el intestino.
Un ejemplo de desaminacin de la adenosina en inosina tiene como resultado cambios
sencillos de aminocidos en los receptores de algunas molculas sealizadoras en las
neuronas, generando potencialmente 24 versiones diferentes del receptor. La importancia
de esto en el sistema nervioso radica en que la carencia de la enzima editora provoca
defectos neurolgicos en ratones y moscas.
Degradacin del ADN
La mayora de las secuencias transcritas en pre-ARNm son degradadas en el interior del
ncleo, pues ms del 90% de estas secuencias son intrones. Estos intrones se degradan
gracias a una enzima que reconoce el enlace caracterstico del punto de ramificacin y
gracias a otras enzimas que reconocen extremos 5 o 3 de ARN, catalizando la
degradacin en cualquier direccin.
Las clulas poseen un mecanismo de control de calidad que detecta y degradan ARNm
aberrantes generados por error. Uno de estos mecanismos de control es el decaimiento
de ARNm mediado sin sentido, degradando ARN que carecen de marcos completos de
lectura abierta, evitando la sntesis de protenas anmalas. ste mtodo se pone en
marcha cuando los ribosomas detectan codones de terminacin prematuros,
interrumpiendo la traduccin y degradando la molcula defectuosa de ARNm.
La degradacin citoplasmtica de la mayora de los ARNm eucariticos comienza con el
acortamiento de las colas poli-A, luego se degradan por nucleasas que actan a partir del
extremo 3 o la eliminacin de la caperuza en el extremo 5.
Los ARN degradados con rapidez contienen secuencias especficas ricas en AU cerca del
extremo 3 que actan como sitios de unin a protenas que pueden estabilizar o marcar
los ARNm para inducir su degradacin. Las actividades de estas protenas se regulan por
medio de seales extracelulares como factores de crecimiento u hormonas, haciendo a
las clulas capaces de controlar la velocidad de degradacin de ciertos ARNm como
respuesta a las condiciones ambientales.
Los ARNsi y ARNmi controlan la estabilidad, degradacin y traduccin del ARNm
El nivel intracelular de ARN est determinado por un equilibrio entre la sntesis y la
degradacin. Tanto los ARNr como los de transferencia son muy estables, por lo tanto hay
niveles elevados de ambos ARN en la clula, de aproximadamente 90%.

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Los ARN bacterianos se degradan en tan solo 2 o 3 minutos, para que la clula pueda
responder rpidamente a modificaciones de su entorno. En clulas eucariotas, el ARNm
tiene una vida de entre 30 minutos hasta 20 horas.
Los ARNm inestables suelen codificar para protenas reguladoras, como factores de
transcripcin, mientras que los ARNm que codifican para protenas estructurales tienen
vidas ms largas.

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Traduccin del ARNm


La traduccin es la sntesis de protenas guiada por un molde de ARNm. Todos los ARNm
se leen en direccin 5-3 y las cadenas polipeptdicas se sintetizan desde el extremo
amino terminal al carboxilo terminal, donde cada aminocido es codificado por un codn.
ARN de transferencia
Las distintas molculas de ARNt sirven como adaptadores en el proceso de alineacin de
aminocidos con el ARNm molde. Tienen una longitud de aproximadamente 70-80
nucletidos con una estructura en forma de hoja de trbol debido a apareamiento de
bases intracatenarios. Puede tener timina e incluso una base poco comn: la inosina. Su
plegamiento en forma de L es necesario para el correcto anclaje de los ribosomas.
Para poder cumplir su funcin, el ARNt necesita de dos regiones distintas y separadas,
adems de otros dos brazos

Brazo aceptor: la regin de unin al aminocido est formada por una secuencia
CCA ubicada en el extremo 3 donde los aminocidos se unen covalentemente al
OH de la adenosina.
Bucle bmeran: es el lazo de reconocimiento del ARNm, es una regin que
reconoce al ARNm mediante complementariedad de bases por un lazo anticodn.
Brazo TC: es el reconocimiento del ribosoma.
Brazo D: su secuencia es reconocida por una de las 20 enzimas (aminoacil ARNt
sintetasas) muy especficas que unen cada aminocido con su molcula de ARNt.

La incorporacin del aminocido correcto depende de la unin de cada uno al ARNt, asi
como de la especificidad del apareamiento entre codn y anticodn. La sintetasa
reconoce secuencias de nucletidos especficas (incluyendo el anticodn) que son nicas
de cada ARNt. Si el aminocil AMP es incorrecto, es hidrolizado antes de unirse al ARNt.
1. El aminocido es activado mediante una reaccin con ATP, donde es convertido a
AMP, formndose un intermediario aminocil AMP.
2. El aminocil AMP se une al extremo 3 del ARNt.
3. El aminocido se alinea en el ARNm molde por la complementariedad de bases
entre codn y anticodn.
La complementariedad de bases codn-anticodn es mucho menos estricta que la
complementariedad regular, pues el cdigo gentico es redundante. De los 64 codones
posibles, 3 son codones de terminacin y 61 codifican para aminocidos, provocando que
un aminocido sea codificado por ms de un codn. Adems de que algunos ARNt son
capaces de reconocer ms de un codn en el ARNm, como resultado de un
reconocimiento no estndar entre el anticodn del ARNt y la tercera base de algunos
codones pues hay un apareamiento de bases dbil. Si la inosina aparece en el anticodn,
un ARNt puede reconocer 3 codones en el ARNm.

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Anticodn ARNt 5
A
U
C
G
I

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Codn ARNm 3
U
AoG
G
UoC
U, C o A

Ribosomas
Son partculas subcelulares donde se sintetizan las protenas en clulas eucariotas y
procariotas. Una clula de mamfero puede contener aproximadamente 10 millones de
ribosomas. Los ribosomas se pueden ensamblar in vitro.
Los ribosomas, al igual que el ARNt, tienen apareamientos de bases intracatenarios.
Eucariotas (r80S)
Subunidad
Composicin
40S (pequea)
- ARNr 18S
- 30 protenas
60S (grande)
- ARNr 28S, 5,8S y 5S
- 45 protenas

Procariotas (r70s)
Subunidad
Composicin
30S (pequea)
- ARNr 16 S
- 21 protenas
50S (grande)
- ARNr 23S y 5S
- 34 protenas

La subunidad grande de los ribosomas es una ribozima, pues es capaz de catalizar la


formacin de enlaces peptdicos. La falta de protenas ribosmicas provoca un descenso
pero no una prdida completa de la actividad ribosmica, por lo que se deduce que las
protenas ribosomales tienen una funcin estructural.
Seal de inicio de la traduccin
La traduccin no empieza simplemente en el extremo 5 del ARNm ni termina simplemente
en el extremo 3, pues ambos bordes del ARNm son secuencias no codificantes (llamadas
regiones UTR). Las seales que identifican el codn de iniciacin son distintas en clulas
eucariotas y procariotas, debido a las diferencias existentes entre los ARNm
policistrnicos y monocistrnicos.
La traduccin siempre comienza con metionina, codificado generalmente por el codn
AUG. En algunas bacterias existen codones de iniciacin alternativos, como el codn
GUG que cuando se ubica al inicio de una cadena polipeptdica se incorpora metionina en
lugar del aminocido que codifica normalmente (valina)
En la mayora de las bacterias, la sntesis se inicia con un residuo modificado de
metionina (N-formilmetionina), a diferencia de las clulas eucariotas donde la metionina se
encuentra sin modificar a excepcin de en mitocondrias y cloroplastos.

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Los codones de iniciacin en los ARNm bacterianos son precedidos por la secuencia
Shine-Dalgarno, la cual es una secuencia especfica complementaria de una secuencia
del ARNr 16S cerca del extremo 3, que aproxima el ARNm al ribosoma.
En eucariotas, por el contrario, los ribosomas se unen al ARNm reconociendo la 5-cap y
se desplazan por la secuencia del ARNm hasta encontrar un codn de iniciacin AUG.
Las secuencias que flanquean al codn AUG tambin influyen en la iniciacin, pues a
veces el primer AUG en el ARNm no es reconocido y la traduccin comienza en un triplete
ms alejado del extremo 5.
Varios ARNm poseen sitios de entrada internos para ribosomas en los que puede iniciarse
la traduccin mediante la unin de un ribosoma a una posicin interna del ARNm. ste es
un mecanismo de inicio que se activa en condiciones de estrs celular que permiten la
traduccin selectiva cuando se encuentra bloqueado el modo normal de inicio a partir de
la 5-cap.
Mecanismo de traduccin
La traduccin generalmente tiene tres etapas: iniciacin, elongacin y terminacin. En
general, la traduccin comienza con la unin de un metionil ARNt especfico y el ARNm a
la subunidad menor del ribosoma. Luego, la subunidad mayor se une al complejo,
formando un ribosoma funcional sobre el que se elonga la cadena polipeptdica. Tambin
son necesarias protenas no ribosomas especficas.
Los ARNm son traducidos por una serie de ribosomas separados por aproximadamente
100 a 200 nucletidos. Este conjunto de ribosomas se llama polisoma, donde cada
ribosoma funciona de manera independiente.
Inicio
En procariotas
1. La subunidad 30S se une a dos factores de iniciacin, IF1 e IF3
2. El factor de iniciacin IF2-GTP, el ARNm y el N-formilmetionil ARNt se unen a este
complejo. Donde IF2 interacciona con el ARNt iniciador.
3. El ARNt se une al codn de iniciacin del ARNm y se liberan IF1 e IF3.
4. La subunidad 50S se une al complejo, induciendo la hidrlisis del GTP y liberando
el GDP junto a IF2
5. Se forma un complejo 70S-ARNm-ARNt preparado para catalizar la formacin de
un enlace peptdico en la fase de elongacin.
En eucariotas requiere de al menos 11 protenas distintas de mltiples cadenas
polipeptdicas llamadas eIFs, estos factores reconocen tanto al extremo 3 como al
extremo 5.
1. eIF1, eIF1A, eIF3 y eIF5 se unen a la subunidad 40S y el eIF2-GTP se une al
metionil ARNt iniciador.

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2. Se asocia la subunidad 40S y el ARNt iniciador (junto a todos los factores de


iniciacin).
3. La 5-cap del ARNm es reconocido por eIF-4E, que forma un complejo con eIF-4A
y eIF-4G, quien se une a la PABP asociada a la cola poli-A del extremo 3.
4. Los factores de iniciacin eIF-4E y eIF-4G en asociacin con eIF-4A y eIF4B
dirigen al ARNm hacia la unidad ribosmica 40S mediante la interaccin entre los
factores eIF-4G y el eIF-3 (se libera PABP).
5. La subunidad 40S unida al metionil ARNt y a los eIF chequea el ARNm hasta
identificar un codn AUG, este desplazamiento requiere energa.
6. El codn se reconoce y eIF5 provoca la hidrlisis del GTP unido a eIF2, liberando
todos los factores de iniciacin y permitiendo que eIF5B facilite la unin de la
subunidad 60S usando GTP para iniciar el complejo de iniciacin 80S.
Elongacin: El ribosoma tiene tres sitios de unin del ARNt, llamados P (peptidil), A
(aminoacil) y E (liberacin).
1. El metionil ARNt iniciador se une al sitio P.
2. Un factor de elongacin (EF-Tu en procariotas y eEF1 en eucariotas) unido a
GTP gua al aminoacil ARNt hacia el ribosoma, donde se une al sitio A mediante
emparejamiento con el segundo codn del ARNm.
La subunidad pequea tiene un centro descodificador que reconoce los pares de base
codn-anticodn correcto.
3. La insercin del aminoacil ARNt en el dominio A provoca un cambio
conformacional que induce la hidrlisis del GTP y la liberacin de eEF1-GDP.
4. Se forma un enlace peptdico entre el metionil ARNt iniciador del sitio P y el
aminoacil ARNt del sitio A.
5. Se transfiere la metionina al aminoacil ARNt formndose un peptidil ARNt en el
sitio A y dejando un ARNt libre en el sitio P.
6. EF-G en procariotas y eEF-2 en eucariotas unido a GTP se hidroliza e induce la
translocacin, desplazando el ribosoma tres nucletidos sobre el ARNm, moviendo
el peptidil ARNt al sitio P, colocndose un nuevo codn en el sitio A libre y
ubicando el ARNt libre en el sitio E.
7. La unin de un nuevo aminoacil ARNt al sitio A induce la liberacin del ARNt libre.
8. eEF1 en eucariotas y EF-Ts en procariotas sustituye el GDP unido a eEF1 o
EF-Tu por GTP, para que el factor pueda dirigir un nuevo aminoacil ARNt al sitio A.
9. La elongacin contina.
Terminacin
1. Un codn de terminacin (UAA (ocre), UAG (mbar) o UGA (palo)) se coloca en
el sitio A. Los ARNt no contienen anticodones complementarios de los tripletes de
terminacin, pero tienen factores de liberacin (RF1 y RF-2 en procariotas y eRF1
en eucariotas) y RF3 en procariotas y eRF3 en eucariotas, que no reconocen
codones de terminacin pero se asocian a RF1-RF2 o eRF1.
2. El factor de liberacin se une a un codn de terminacin en el sitio A, hidrolizando
el enlace entre el ARNt y la cadena del sitio P, liberndola.
3. El ARNt es liberado, y las subunidades del ribosoma y el ARNm se disocian.

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Regulacin de la traduccin
La traduccin es regulada en respuesta al estrs celular, la disponibilidad de nutrientes y
la estimulacin por protenas represoras de la traduccin y microARN no codificantes.

Unin de protenas represoras, que bloquean a secuencias especficas del ARNm.


Por ejemplo, en ausencia de hierro, protenas reguladoras se unen a una
secuencia de respuesta a hierro en el extremo 5 no codificante, interfiriendo en la
unin del ARNm a la subunidad 40S. En presencia de hierro, la protena
reguladora no se une, de modo que puede comenzar la traduccin.
La traduccin puede ser regulada mediante protenas en secuencias de las regiones 3
no codificantes. En algunos casos, los represores se unen al factor eIF4E e interfieren
en la interaccin de eIF4E y eIF4G. Estas protenas que se unen al extremo 3
tambin son responsables de la localizacin del ARNm en regiones especficas de la
clula.

Largo de la cola poli A: Muchos ARNm son almacenados sin traducir con
pequeas colas de poli A, de aproximadamente 30-50 nucletidos. En un principio,
poseen colas largas de aproximadamente 200 nucletidos, y luego son
reconocidas por una protena represora que se une a secuencias especficas de
sus regiones no codifcantes del extremo 3 y escinden la mayor parte de las colas
poli-A. Si se necesitan, estos ARNm son incorporados a la traduccin mediante el
alargamiento de sus colas poli-A, permitiendo la unin de la PABP.

Interferencia de ARN (iARN): inhibe a travs de la induccin de formacin de


heterocromatina o induciendo la degradacin de molculas diana de ARNm.
ARNsi: se tiene un ARN bicatenario que es escindido por una enzima
llamada Dicer, formando ARNsi.
ARNmi: la polimerasa II transcribe pre-ARNmi de unos 70 nucletidos, que
son sometidos a la escisin secuencial mediante nucleasas Drosha y Dicer
para la formacin de una molcula de unos 22 nucletidos. El genoma
humano codifica para unos 1000 ARNmi y se cree que cada uno puede
reconocer hasta 100 ARNm y que tienen un papel en el desarrollo
embrionario temprano, (sistema nervioso, musculatura, corazn, pulmones
y sistema inmunitario). Estos ARN regulan la proliferancin y supervivencia
de la clula, la expresin anmala de estos ARN se asocia a cardiopatas y
diversos tumores.
El ARN o ADN de cadena nica antisentido son complementarios al ARNm de un gen de
inters, formando hibridos con ARNm diana, bloqueando la traduccin.
1. ARNsi o ARNmi se asocia con un complejo de protenas llamado complejo
silenciador inducido por ARN (RISC)
2. Las dos hebras del ARNsi o ARNmi se separan formando una hebra antisentido, la
cual dirige a RISC a un ARNm diana, inhibiendo la traduccin.
3. El ARNm es escindido por una de las protenas de RISC.
4. El complejo RISC-ARNsi/ARNmi se disocia.

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Modulacin de la actividad de factores de iniciacin:


El eIF-2 y el eIF2B pueden ser fosforilados por protenas quinasas
reguladoras, inhibiendo el intercambio de GDP por GTP.
Factores de crecimiento que estimulan la sntesis activan protenas
quinasas que fosforilan protenas 4E-BPs, quienes se unen a eIF-4E. En
ausencia de dichos factores, las 4E-BPs no fosforiladas se unen a eIF-4E e
inhiben la traduccin.

Plegamiento de protenas
La sntesis del polipptido no significa que la protena sea funcional, pues sta debe
plegarse correctamente en su estructura terciaria para cumplir su funcin.
Chaperonas
Son protenas que actan como catalizadoras que facilitan el ensamblaje sin formar parte
del complejo ensamblado y sin proporcionar ningn tipo de informacin adicional. En
ausencia de las chaperonas las protenas se pliegan incorrectamente o se agregan
formando complejos insolubles relacionados a enfermedades como Alzheimer o
Parkinson.
Las chaperonas se unen a las cadenas polipeptdicas nacientes mientras se sintetizan en
los ribosomas, previniendo el plegamiento incorrecto antes de que la sntesis finalice.
Tambin estabilizan los polipptidos no plegados durante su transporte a orgnulos. El
nmero de chaperonas en clulas eucariotas es considerablemente mayor que en
procariotas.
Hay chaperonas en el citosol y chaperonas en el interior de los orgnulos, por ejemplo, las
chaperonas mitocondriales, quienes facilitan la transferencia del polipptido al atravesar la
membrana y su plegamiento posterior.
Existen dos familias de chaperonas, las Hsp (Heat-shock proteins) y las chaperoninas.
Las Hsp70 estabilizan las protenas durante la traduccin y el transporte, unindose a
siete u ocho residuos de aminocidos, manteniendo el polipptido en una conformacin
extendida. La cadena entonces es transferida de una chaperona Hsp70 a una
chaperonina, en cuyo interior tiene lugar el plegamiento.
Las chaperoninas consisten en multiples subunidades proteicas organizadas en dos
anillas apiladas para formar una estructura con dos cmaras (como un barril). Dentro, las
cadenas no plegadas estn resguardadas del citosol, permitiendo el plegamiento y
evitando que se unan otros polipptidos no plegados.
Enzimas
Catalizan el plegamiento mediante rotura y formacin de nuevos enlaces covalentes.

La protena disulfuro isomerasa (PDI): cataliza la formacin de puentes disulfuro,


los cuales son especialmente abundantes en protenas secretadas y algunas

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protenas de membrana, pues el citosol contiene agentes reductores que impiden


la formacin de puentes disulfuro. En eucariotas, los puentes disulfuro se forman
dentro del retculo endoplasmtico, cuyo lumen es un ambiente oxidante. La PDI
es una de las protenas ms abundantes del RE.
Peptidil prolil isomerasa: cataliza la isomerizacin de los enlaces peptdicos donde
participa la prolina, quien puede adoptar una configuracin cis o trans, formando
curvaturas o codos en la cadena. La isomerasa requiere que la siguiente serina o
treonina estn fosforiladas.

Maduracin de protenas

Escisin de protenas (protelisis): La protelisis es una etapa importante en la


maduracin de muchas protenas.
Eliminacin de la metionina inicial de muchos polipptidos, que ocurre
antes de que la traduccin de la cadena se sintetice completamente.
Escisin de la secuencia seal que marca a las protenas que se dirigen al
retculo endoplasmtico, a los lisosomas o a la membrana y tiene una gran
importancia en la translocacin.
Escisin de precursores inactivos de mayor tamao para formar enzimas u
hormonas funcionalmente activas. Por ejemplo la insulina, que se forma a
partir de dos escisiones de un precursor llamado preproinsulina; la
formacin de las enzimas digestivas, las protenas que participan en la
coagulacin sangunea, y de proteasas que regulan la muerte celular
programada. Tambin es importante en la replicacin del VIH, donde una
proteasa codificada por el virus escinde precursores para formar protenas
vricas estructurales.
Glicosilacin: es la adicin de carbohidratos. Las protenas a las que se aaden
una cadena de glcidos (glicoprotenas) son secretadas o se localizan en la
superficie celular, aunque algunas protenas nucleares o citoslicas tambin estn
glicosiladas. Se inicia en el RE antes de que termine la traduccin. Los
carbohidratos de las glicoprotenas sirven para evitar la agregacin de protenas
en el RE, en la decisin del destino de las protenas y como reconocimiento en
interacciones clula-clula.
N-glicoprotenas: los carbohidratos (N-acetilgluocosamina) se unen al N de
la cadena de asparragina.
1. Un oligosacrido de 14 residuos de monosacridos (dos Nactetilglucosamina, nueve manosas y tres glucosas) que estaba
ubicado en la membrana del RE unido a un lpido transportador, el
dolicol fosfato, se transfiere a un residuo de asparragina de la
secuencia Asn-X-Ser o Asn-X-Thr (X puede ser cualquiera menos
prolina) mediante una enzima llamada oligosacaril transferasa.
2. Tres residuos de glucosa son eliminados en el RE.
3. Se eliminan y se aaden otros azcares en el aparato de Golgi.
O-glicoprotenas: los carbohidratos (N-acetilgalactosamina) se unen al
tomo de O de la serina o treonina.

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1. En el aparato de Golgi se aaden los O-oligosacridos formados


por la adicin de un nico azcar de pocos monosacridos
(pudiendo ser galactosa, cido silico o N-acetilgalactosamina)
Los residuos de manosa pueden unirse a residuos de triptfano a travs de enlaces C-C.

Anclaje de lpidos a cadenas polipeptdicas: estas modificaciones marcan y anclan


las protenas a la membrana plasmtica.
o Cara citoslica:
N-miristoilacin: el cido mirstico (14C) se une al residuo N-terminal de
glicina, el cual es frecuentemente el segundo aminocido incorporado a la
cadena.
Prenilacin: grupos prenilo se anclan a tomos de azufre de cistena del
extremo C-terminal. Muchas protenas que participan en el control de
crecimiento y diferenciacin celular se modifican as, incluyendo protenas
responsables del crecimiento descontrolado de tumores.
1. Un grupo prenilo (farnesilo (15C) o geranilgeranilo (20C)) se aade a
una cistena localizada 3 aminocidos del extremo C-Terminal
(secuencia XAAC)
2. Los aminocidos anteriores a la cistena son eliminados, dejando la
cistena en el extremo C-Terminal.
3. Un grupo metilo se aade al grupo carboxilo de la C-Terminal.
Palmitoilacin: el cido palmtico (16C) se une a los tomos de azufre de
residuos internos de cistena.
o Cara extracelular:
Anclas de glicosilfosfatidilinositol (GPI): este anclaje se ensambla
en la membrana del RE luego de completarse la sntesis.
Glicolpidos que se unen a la secuencia hidrofbica C-terminal
ciertas protenas. Las cadenas de cidos grasos anclan el
glicosilfosfatidilinositol a la membrana.
Regulacin de la funcin proteica

Por pequeas molculas: la mayora de enzimas se regulan por la unin de


molculas que inducen cambios en su conformacin, provocando modificaciones
en su actividad cataltica. Por ejemplo: la retroinhibicin, que regula muchos
factores de transcripcin.
Intercambio GTP-GDP: las protenas alternan entre las conformaciones de unin a
GTP y de unin a GDP, activndose y desactivndose continuamente. Por
ejemplo: la protena Ras si se mantiene en su conformacin activa unida a GTP,
acta como una seal contnua de divisin celular, promoviendo el crecimiento
incontrolado de clulas tumorales.
Fosforilacin de protenas: es un proceso reversible en el que las enzimas protena
quinasas transfieren un grupo fosfato desde el ATP a un grupo hidroxilo de serina,
treonina o tirosina (protena-serina/treonina quinasas o protena-tirosina quinasa).
Dichas enzimas constituyen aproximadamente el 2% de los genes eucariotas. Este
proceso es revertido por las protenas fosfatasas, que catalizan la hidrlisis de un
grupo fosfato del aminocido fosforilado.

~ 23 ~

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Las protenas quinasas pueden participar en vas de transduccin de seales en la que


una quinasa fosforila a una segunda quinasa que puede a su vez actuar sobre una
tercera. sta accin secuencial puede transmitir una seal recibida en la superficie celular
a una protena diana en el interior de la clula, induciendo a cambios en el
comportamiento celular en respuesta a estmulos ambientales. Por ejemplo: la
degradacin de glucgeno a glucosa-1-fosfato por accin de la epinefrina (adrenalina).
1. La epinefrina se une a su receptor en la superficie celular
2. Se convierte el ATP en AMPc, el cual se une a una protena quinasa dependiente
de AMPc.
3. La quinasa dependiente de AMPc fosforila una segunda protena llamada
fosforilasa quinasa, la cual fosforila la enzima glucgeno fosforilasa.
4. La glucgeno fosforilasa conduce a la degradacin de glucgeno a glucosa-1fosfato.

Metilacin y acetilacin de histonas: para activar o reprimir la traduccin.


Nitrosilacin: Adicin de grupos NO a la cadena lateral de cistena en una
modificacin post-traduccional.
Glicosilacin en O de protenas nucleares y citoslicas.

Interacciones protena-protena
Las protenas estn formadas por mltiples subunidades y la unin de una molcula
reguladora altera la conformacin de la protena por cambios en las interacciones entre
sus subunidades.
Por ejemplo, la protena quinasa dependiente de AMPc est constituida por dos
subunidades reguladoras y dos catalticas en su conformacin inactiva. Cuando se une el
AMPc a las subunidades reguladoras se provoca un cambio conformacional que disocia el
complejo, activando la protena.
Degradacin de protenas
La cantidad de protenas no solo est regulada por su tasa de sntesis son tambin por su
tasa de degradacin. La degradacin se produce en respuesta a seales especficas, o
cuando se reconoce una protena daada.

Va de ubiquitina-proteasoma: es la ruta principal de degradacin en eucariotas,


usando la ubiquitina (76A) como un marcador de protenas citoslicas o nucleares
para una rpida protelisis.
Ubiquitinacin:
1. La ubiquitina es activada por una enzima llamada enzima activadora de la
ubiquitina, E1, usando ATP.
2. La ubiquitina se transfiere a una segunda enzima, E2, llamada enzima
conjugante de la ubiquitina.
3. La ubiquitina ligasa, E3, reconoce la protena diana y se une a E2,
transfiriendo la ubiquitina a la protena.

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~ 24 ~

Reconocimiento y degradacin:
4. Se une la ubiquitina al grupo amino lateral de una lisina.
5. Molculas de ubiquitina adicionales se aaden para formar una cadena de
varias ubiquitinas.
6. Las protenas poliubiquitinadas son reconocidas y degradadas (usando
ATP) por un complejo de mltiples subunidades llamado proteasoma.
7. Se libera la ubiquitina para que pueda reutilizarse.
La estabilidad de muchas protenas se determina por su capacidad para ubiquitinarse.
La mayora de las clulas contienen un nico tipo de E1, varios tipos de E2 y varias
familias de E3, pues reconocen a distintos sustratos de protenas. Es la especificidad de
estas enzimas lo que marca selectivamente las protenas para la degradacin.
La ubiquitina no solo interviene en la degradacin de protenas. La unin de molculas
sencillas de ubiquitina a algunas protenas interviene en la regulacin de la reparacin y
la transcripcin del ADN y la endocitosis.
Las protenas pueden modificarse por la unin de protenas similares a la ubiquitina, por
ejemplo SUMO, quienes actan como marcadores de localizacin y regulacin de la
actividad proteica. Muchas protenas modificadas con SUMO intervienen en el
mantenimiento de la estructura de la cromatina.

Protelisis lisosmica: La protena entra en los lisosomas para ser digerida


(autofagia)

Distribucin y transporte de protenas


La va secretora es: RE Golgi
plasmtica/lisosomas/exterior de la clula.

vesculas

de

secrecin/membrana

Algunas protenas pasan por las etapas iniciales de la va secretora pero son retenidas en
el R.E o en el aparato de Golgi.

~ 25 ~

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Las protenas destinadas a la va secretora son transferidas al R.E mientras estn siendo
traducidas por los ribosomas unidos a la membrana (translocacin cotraduccional),
mientras que las protenas destinadas al citosol, al nucleo, a mitocondrias, cloroplastos o
peroxisomas son sintetizadas en ribosomas libres y posteriormente liberadas
(translocacin postraduccional), aunque toda la sntesis proteica se inicia en los
ribosomas presentes en el citosol.

Retculo endoplasmtico
Es una red de tbulos y sacos (cisternas) rodeados de membrana que se extiende desde
la membrana nuclear por todo el citoplasma. Su membrana es aproximadamente la mitad
de todas las membranas de la clula y la luz del retculo puede representar el 10% de
todo el volumen celular.

R.E rugoso: cubierto por ribosomas, procesa protenas.


R.E de transicin: desde donde parten vesculas hacia el aparato de Golgi.
Procesa protenas.
R.E liso: no est asociado a ribosomas y est implicado en el metabolismo de los
lpidos.

RE rugoso
Va cotraduccional:
La marca que determina la unin del ribosoma con el R.E es una secuencia seal de
aproximadamente 20 aminocidos hidrfobos precedidos por un aminocido bsico en el
N-terminal de la cadena polipeptdica creciente, que marca y dirige la cadena a los
microsomas y que posteriormente es escindida por la peptidasa seal.
1. A medida que son sintetizadas, las secuencias seal son reconocidas y unidas a
PRS, la cual est constituida por 6 polipptidos y un ARN citoplsmico pequeo
(ARNsrp). El ARNsrp se une tanto a las protenas como al ARNr de la subunidad
mayor del ribosoma.
2. La PRS inhibe la traduccin y gua al complejo al R.E mediante la unin al receptor
de la PRS en la membrana del RE. ste receptor est formado por una subunidad
de 638 aminocidos y una subunidad de 300 aminocidos, que son los sitios
de unin a GTP.
3. Molculas de GTP se unen tanto a PRS como al receptor, desencadenando la
transferencia de la secuencia seal desde PRS al translocn. Estos translocones
estn constituidos por tres protenas transmembrana llamadas protenas sec61,
que es el ncleo central, receptor de ribosomas; y TRAMP que contacta la regin
N-terminal.
4. La hidrlisis de GTP libera a la PRS para ser reciclada.
5. La transferencia del ribosoma-ARNm desde la PRS al translocn provoca que la
seal interaccione con cadenas laterales hidrofbicas cortas del cuello del canal
del translocn, transfirindose la cadena en crecimiento a travs de l,

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6. La peptidasa seal escinde la secuencia seal y el polipeptido es liberado en la luz


del RER.
La translocacin cotraduccional es dirigida por el procedimiento de la sntesis proteica.
Va postraduccional:
Las protenas sintetizadas en el citoplasma y dirigidas al RER luego de la traduccin no
requieren de una PRS. Sus secuencias seal son reconocidas por el complejo sec62/63
asociadas con el translocn de la membrana del RER.
Sin embargo, s se necesitan de chaperonas citoslicas Hsp70 para mantener las
cadenas en su conformacin primaria para que puedan penetrar en el translocn y luego
otras chaperonas Hsp70 dentro del RER (llamada BiP) necesaria para que atraviese el
canal hasta el interior del RER. BiP dirige la translocacin postraduccional.
Insercin de las protenas en la membrana del RE
Las protenas destinadas a incorporarse en la membrana plasmtica o en la membrana
del RE, Golgi o lisosomas, se insertan inicialmente en la membrana del RE, donde son
transportadas como componentes de la membrana hasta su destino final por la misma va
de secrecin.
Las protenas integrales se incluyen en la membrana mediante regiones hidrofbicas en
hlice alfa de 20 a 25 aminocidos que atraviesan la capa lipdica. La formacin de
hlices alfa maximiza los puentes de hidrgeno entre los enlaces peptdicos y las cadenas
laterales hidrfobas interaccionan con las colas de cidos grasos de los fosfolpidos.
Las protenas pueden tener una o mltiples regiones que la atraviesan la membrana.
Pueden tener el extremo N-terminal o el C-terminal hacia el citosol, y esta orientacin se
establece a medida que las protenas en crecimiento se translocan en el RE. Los
dominios proteicos expuestos a la superficie de la clula estarn en la luz del RE y Golgi.
Si se tienen aminocidos positivos antes de la secuencia de pare la protena tendr el
extremo n-terminal hacia el citosol. Si los aminocidos positivos estn luego de la
secuencia de pare, el extremo N-terminal ir hacia el lumen.
Las protenas que deben incorporarse a la membrana nuclear interna difunden
lateralmente en la membrana del RE en lugar de transportarse en vesculas.

Un solo dominio trans-membrana:


1. La secuencia seal N-terminal es escindida por la peptidasa seal.
2. Una segunda hlice alfa en el centro de la protena que contiene una
secuencia de detencin de la transferencia, provoca el cierre del canal
translocn, bloqueando que la cadena se siga translocando, por lo que el
resto de la protena debe sintetizarse en el citosol.
3. Se separan las subunidades del translocn y el dominio transmembrana
penetra en la bicapa.

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Laura Mendoza

Varios dominios transmembrana: resultado de una serie alternante entre


secuencias seal internas y secuencias transmembrana de detencin de la
transferencia.

Algunas protenas tambin pueden anclarse a la membrana mediante secuencias seales


internas que no son escindidas por la peptidasa seal, sino que son reconocidas por la
PRS y trasladadas a la membrana por el mecanismo anterior.
Plegamiento y procesamiento
En el RE tiene lugar el plegamiento de las protenas, el ensamblaje en varias
subunidades, la formacin de puentes disulfuro, las primeras etapas de la glicosilacin y
la adicin de anclajes de glicolpidos.

Plegamiento: La chaperona BiP se une a la cadena sin plegar cuando cruza la


membrana y despus media el plegamiento y ensamblaje de las subunidades. Las
protenas correctamente ensambladas son liberadas de BiP y otras chaperonas y
estn disponibles para su transporte al aparato de Golgi. Las protenas mal
plegadas son dianas de degradacin.
Formacin de puentes disulfuro: El RE tiene un ambiente oxidante que junto a la
disulfuro isomerasa media la formacin de los puentes disulfuro.
Glicosilacin.
Anclaje de glicolpidos: se aade glicosilfosfatidilinositol a un residuo de
asparragina que ancla la protena a la membrana. El complejo resultante es
transportado a la superficie celular como componentes de la membrana.

Control de calidad:
Las chaperonas y las enzimas del procesamiento proteico en el lumen del RE actan
como sensores de protenas mal plegadas. El proceso del control de calidad implica a BiP,
otras chaperonas, la disulfuro isomerasa y otras protenas accesorias.
1. Dos residuos de glucosa se escinden en la glicosilacin, permitiendo la unin de la
calreticulina, la cual es una protena chaperona que facilita el plegamiento.
2. Se escinde el residuo de glucosa restante, liberando la calreticulina y la
glicoprotena.
3. Un sensor de plegamiento dirige a las protenas plegadas correctamente a hacia el
RE transicional. Sin embargo, si el plegamiento es incorrecto, el sensor aade un
nuevo residuo de glucosa para devolverla a la calreticulina, quien realiza una
nueva tentativa de plegamiento.
4. Si el plegamiento es totalmente incorrecto, se enva a una va de degradacin
mediante la retrotranslocacin. En el citoplasma, la protena se marca con
ubiquitina y se degrada por el proteosoma.
Normalmente hay niveles suficientes de BiP no solo para plegar protenas sino para unirse
a molculas sealizadoras y mantenerlas inactivas. Si hay un exceso de protenas sin
plegar (puede ser debido al estrs celular), estas compiten por el BiP, provocando la

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liberacin de las molculas que sealizan la respuesta a protenas no plegadas,


activndose la respuesta a protenas no plegadas que consiste en:

Un aumento en la expresin de chaperonas


La inhibicin general de la sntesis proteica.
Un aumento en la degradacin de ARNm que codifica protenas de la va
secretora.
Estas respuestas tambin inducen al aumento de la actividad del proteosoma y si
estas medidas son insuficientes, se induce la muerte celular programada.

RE liso
Debido a su naturaleza hidrfoba, los lpidos se sintetizan asociados con membranas
celulares ya existentes. Sin embargo, la mayora se sintetizan en el RE y son
transportados en vesculas o mediantes protenas transportadoras.
El REL crece mientras ms se consuma grasas o alcoholes (cirrosis) hasta que es
demasiado grande.
La mayora de los fosfolpidos derivan del glicerol y son sintetizados en la cara
citoplasmtica de la membrana del REL a partir de precursores hidrosolubles.
1. Dos cidos grasos unidos a los transportadores de CoA se unen al glicerol-3fosfato, liberndose los transportadores.
2. El fosfolpido resultante (cido fosfatidico) se inserta en la membrana.
3. Las enzimas de la cara citoslica del REL convierten el cido fosfatidico en
diacilglicerol y catalizan la adicin de diferentes grupos de cabezas polares,
formando:
a. Fosfatidilcolina
b. Fosfatidiletanolamina
de etanolamina,
la membrana.luego sta se sustituye por
c. Fosfatidilserina: primero30-40%
se aade
serina.
d. Fosfatidilinositol.
Los fosfolpidos nuevos solo se aaden a la mitad citoslica de la membrana del RE. Para
mantener una membrana estable, los fosfolpidos deben transferirse a la mitad de la luz
del RE. Esta transferencia requiere el paso de un grupo polar a travs de la membrana, y
es facilitada por unas flipasas, quienes catalizan la translocacin de fosfolpidos y
garantizan el crecimiento equilibrado de ambas mitades de la bicapa.
El REL es responsable de la sntesis de los productos finales o de los precursores de los
lpidos de membrana principales, por lo tanto se encuentra en grandes cantidades en
clulas activas en el metabolismo lipdico, por ejemplo, en clulas que producen
esteroides, como las de los testculos y del ovario. Tambin es abundante en el hgado,
donde tiene enzimas que metabolizan varios compuestos liposolubles, quienes inactivan
un nmero importante de drogas potencialmente nocivas, como el fenobarbital,
convirtindolas en compuestos hidrosolubles que son eliminados a travs de la orina.

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Laura Mendoza

Exportacin de lpidos y protenas


Las vesculas que median el transporte de lpidos y protenas a travs de la va secretora
se originan por gemacin en la membrana de un orgnulo y se funden con la membrana
de otro.
Las protenas deben estar marcadas por secuencias que sealizan su exporte o su
retencin en el RE. Muchas protenas transmembrana tienen secuencias aminoacdicas
dicidas o di-hidrofbicas en sus dominios citoslicos que sirven como seales de exporte
del RE. Estas protenas transmembrana pueden actuar como receptores de protenas
ancladas por GPI y protenas secretoras de la luz del RE.
Si se permite que las protenas que funcionan en el interior del RE procedan a lo largo de
la va secretora, se perdern para la clula. Por lo tanto, muchas tienen una secuencia
diana Lys-Asp-Glu-Leu (KDEL) en su extremo C-terminal que dirige su recuperacin al
RE. La retencin de algunas protenas transmembrana est dictada por secuencias Cterminales cortas con dos residuos de lisina (KKXX). Estas seales no impiden que las
protenas sean empaquetadas en vesculas y transportadas a Golgi, pero las protenas
con estas seales se unen a receptores especficos para el reciclado. Otras protenas son
recuperadas porque se unen a protenas que tienen la secuencia KDEL, como BiP.

Aparato de Golgi
Est compuesto de cisternas (bolsas aplanadas rodeadas de membranas) y por vesculas
asociadas. Funciona como una fbrica en el que las protenas recibidas desde el RE se
reprocesan y distribuyen para ser transportadas a su destino final. Y, adems, los
glicolpidos y la esfingomielina son sintetizados en el Golgi. En las clulas vegetales, Golgi
es tambin el lugar donde se sintetizan los polisacridos de la pared celular.
El aparato de Golgi es un orgnulo polarizado tanto en su estructura como en su funcin y
contiene numerosos compartimentos, que se dividen en tres secciones: la red cis, el
compartimiento medial y la red trans.
Todas las protenas retenidas en el aparato de Golgi estn asociadas con su membrana
en lugar de ser solubles en su interior. Las seales responsables de esta retencin se han
localizado en sus dominios transmembrana, impidiendo que sean empaquetadas en
vesculas y muchas veces las seales de las colas citoplasmticas de algunas de estas
protenas son responsables de su recuperacin desde compartimientos posteriores.
Las vesculas asociadas a Golgi no participan en el transporte de protenas a travs del
aparato sino que devuelven a las protenas residentes del Golgi a los compartimientos
iniciales para su reutilizacin. Si se inhibe el transporte de vesculas desde el RE
desaparece la estructura organizada del aparato de Golgi, la cual est basada en
interacciones entre protenas de las membranas de las cisternas y el citoesqueleto.
Protenas

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Las protenas procedentes del RE entran por su cara cis, luego son transportadas a travs
del Golgi y salen por su cara trans. Segn atraviesan el Golgi, las protenas se modifican y
distribuyen para el transporte a sus destinos finales. Algunas protenas especficas se
procesan en distintas regiones de cada cisterna.
Las protenas del RE se transportan al compartimento intermedio RE-Golgi (CIREG o
ERGIC) y pasan al aparato de Golgi a travs de la red cis, en la que comienzan las
reacciones de modificacin. Luego atraviesan el compartimiento medial y el principio de la
red trans donde son sometidos a nuevas modificaciones. El final de la red trans acta
como un centro de organizacin y distribucin que dirige las molculas hacia los
endosomas, lisosomas, a la membrana o al exterior de la clula.
Glicosilacin
La segunda parte de la modificacin de N-oligosacridos que se unieron a las protenas
en el RE tiene lugar en el aparato de Golgi:
Protenas destinadas a ser secretadas o a la membrana plasmtica
1. En la cisterna cis se eliminan cuatro residuos de manosa del extremo de la cadena
del oligosacrido.
2. En la cisterna media se aade una N-acetilglucosamina a una de las manosas y se
eliminan dos manosas ms.
3. Se aade una fucosa (6C y un grupo aldehdo) a una N-acetilglucosamina del
extremo unido a la protena y otras dos N-acetilglucosamina a la manosa libre.
4. En la cisterna trans se aaden tres galactosas a las N-acetilglucosamina de los
extremos y tres residuos de cido sialico (NANA) a las galactosas.
Las distintas glicoprotenas se modifican por mecanismos distintos y en grados diferentes
dependiendo de la estructura de la protena como de las enzimas presentes en los
distintos compartimientos de Golgi de cada tipo celular implicadas en el proceso. Las
glicosiltransferasas aaden azcares, y las glicosidasas los eliminan.
Protenas lisosmicas: la fosforilacin ocurre en la red cis.
1. Se aade N-acetilglucosamina fosfato a residuos de manosa
2. Se elimina un grupo N-acetilglucosamina, dejando residuos de manosa-6-fosfato.
Gracias a esto, los residuos de manosa no son eliminados durante el procesamiento
posterior sino que es reconocido por un receptor de manosa-6-fosfato en la red trans que
dirige el transporte a los lisosomas.
La enzima que aade la N-acetilglucosamina fosfato reconoce un determinante estructural
especfico presente en las protenas lisosmicas, el cual no es simplemente una
secuencia de aminocidos sino que son regiones seal que dependen del plegamiento
tridimensional de la protena.

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O-glicosilacin: En el aparato de Golgi ocurre la adicin secuencial de residuos


nicos de azcar. La serina o la treonina se unen directamente a la N-acetilgalactosamina,
a la que se le pueden aadir otros azcares, los cuales a veces sufren modificaciones por
la adicin de grupos sulfato en la red trans.
Distribucin y exportacin de protenas
Las protenas pueden ir desde Golgi hacia:

Un endosoma tardo y posteriormente a un lisosoma.

Las protenas destinadas a la membrana lisosmica estn marcadas por secuencias en


sus colas citoplsmicas en vez de por residuos de manosa-6-fosfato.

Un endosoma de reciclaje.
Vesculas secretoras.
Directamente hacia la membrana plasmtica: esto supone la incorporacin de
nuevas protenas y lpidos en la membrana y la secrecin continua de protenas
celulares.

Las membranas de las clulas epiteliales se encuentran polarizadas, teniendo diferentes


funciones entre sus dos dominios: el dominio apical y el dominio basolateral. Las
protenas que salen de la red trans se deben transportar selectivamente a dominios
diferentes de la membrana polarizada. Esto se hace mediante el embalaje selectivo de
protenas en vesculas de transporte dirigidas a uno u otro dominio.
Sntesis de glicolpidos y esfingomielina

Esfingomielina: es el nico fosfolpido no glicrico presente en las membranas


(15%), sintetizada en la superficie luminal de Golgi por la transferencia de un
grupo fosforilcolina desde la fosfatidil colina a la ceramida.
Glicolpidos: La adicin de carbohidratos a la ceramida da lugar a diferentes
glicolpidos. La glucosa se aade a la ceramida en la cara citoslica de Golgi. Sin
embargo, la glucosilceramida se da la vuelta y los carbohidratos adicionales se
aaden en la cara luminal de la membrana. Los glicolpidos no son capaces de
translocarse a travs de la membrana del Golgi.

Transporte de las vesculas


La selectividad del transporte es vital para mantener la organizacin funcional de la clula.
La especificidad del transporte se basa en el empaquetamiento selectivo de la carga
seleccionada en vesculas que reconozcan y se fusionen solo con la membrana diana
apropiada.
Las vesculas de transporte que llevan protenas secretoras estn recubiertas con
protenas de la cubierta citoslica y por lo tanto se denominan vesculas cubiertas. La

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formacin de estas vesculas est regulada por dos familias de protenas pequeas de
unin a GTP: factores de ADP-ribosilacin (ARFs 1-3 y Sar1) y muchas protenas Rab.
Tres familias de protenas de cubiertas de vesculas:

Clatrina: transporte bidireccional entre la red trans, los endosomas, los lisosomas y
la membrana.
COPI: devuelven a las protenas residentes a los compartimientos anteriores del
RE o de Golgi.
COPII: transportan protenas secretoras desde el RE al aparato de Golgi.

La formacin de vesculas recubiertas con clatrina:


1. En la membrana, ARF/GDP es activada por ARF-GEF.
2. ARF/GTP inicia el proceso reclutando una protena adaptadora (GGA)
3. Las protenas adaptadoras reclutan un receptor transmembrana que tiene unida la
protena a ser transportada
4. GGA recluta otra protena adaptadora, AP1, que sirve como sitio de ensamblaje
de la clatrina.
5. La clatrina se ensambla en una estructura con forma de cesto que distorsiona la
membrana.
Durante el transporte, el GTP unido a ARF1 se hidroliza y el complejo ARF/GDP se
recicla.
Fusin de vesculas:
La vescula de transporte debe
reconocimiento est mediado por
transmembrana, llamadas SNARE
proporciona la energa necesaria
desestabilizarlas y fusionarlas.

reconocer a la membrana diana correcta. Este


la interaccin especfica entre pares de protena
(v-SNARE y t-SNARE). El apareamiento de ambas
para acercar las bicapas lo suficiente como para

La llegada, unin y fusin de vesculas est mediada por complejos proteicos de


ensamblaje secuencial (Rab). Las protenas Rab individuales o combinaciones de ellas
caracterizan distintos orgnulos y vesculas de transporte, otorgando especificidad.
1. Las protenas Rab son transportadas a travs del citosol unidas a GDP por
inhibidores de la disociacin de GDP (GDI).
2. En la membrana, son retirados por factores de desplazamiento de GDI y luego
factores de intercambio de nucletidos convierten Rab-GDP en Rab-GTP. Estos
factores se localizan en membranas especficas y actan sobre miembros
especficos.
3. Rab-GTP recluta protenas efectoras y a v-SNARE para ensamblar un complejo de
pre-fusin. Sucede algo similar con t-SNARE.
4. Las protenas efectoras unen las membranas mediante interacciones protenaprotena.

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5. Se estimula la hidrlisis de Rab-GTP y ambas SNARE se conectan enrollando sus


hlices. Esto crea inestabilidad en las bicapas y se fusionan.
6. NSF/SNAP desensamblan el complejo SNARE hidrolizando ATP.

Lisosomas
Son el sistema digestivo de la clula. Tienen alrededor de 50 enzimas capaces de
degradar todas las biomolculas, bien sea material captado del exterior o componentes
obsoletos de la misma clula.
En las levaduras y clulas vegetales, las vacuolas asumen la funcin de los lisosomas,
adems de almacenar nutrientes y mantener el equilibrio osmtico. Las protenas
destinadas a las vacuolas estn marcadas por secuencias polipeptdicas cortas.
Las enzimas lisosomales son hidrolasas cidas que actan a pH cido de
aproximadamente 5. Esto proporciona una proteccin contra la digestin incontrolada,
incluso si se rompiera la membrana lisosmica.
Para mantener el pH cido los lisosomas deben concentrar activamente H +, mediante una
bomba de protones que transporta protones desde el citosol hacia el lisosoma usando la
energa de la hidrlisis del ATP, pues su concentracin es aproximadamente 100 veces
ms elevada en el interior del lisosoma que en el citoplasma.
Formacin del lisosoma
Se forman mediante la unin de vesculas de transporte de la red trans de Golgi con un
endosoma tardo, que contiene las molculas ingeridas por endocitosis.
Un cambio importante en la maduracin de los endosomas es el descenso del pH interno
que finalmente libera las hidrolasas cidas desde la red trans de Golgi, dirigidas hacia los
lisosomas por residuos de manosa-6-fosfato. Los endosomas tardos se fusionan con
lisosomas o maduran para convertirse en ellos.
Fagocitosis
Clulas especializadas (como los macrfagos) ingieren en fagosomas partculas grandes,
incluyendo bacterias, restos de clulas y clulas envejecidas y se unen con lisosomas
para degradarlas, formando fagolisosomas.

Autofagia
Es el recambio gradual de los componentes de la clula. Esta es una funcin de todas las
clulas, est regulada en respuesta a la disponibilidad de nutrientes y es vital en el
desarrollo embrionario, en la muerte celular programada y en la metamorfosis de insectos.
El primer paso es la formacin de una envoltura de membrana citoslica alrededor de ua
porcin citoplasmtica o un orgnulo. Posteriormente, la vescula formada (un

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autofagosoma) se fusiona con un lisosoma, formando un fagolisosoma y se digiere el


contenido.

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Membrana plasmtica
Todas las clulas estn rodeadas por membrana, que define el lmite de la clula y separa
el contenido interno del medio externo. La membrana plasmtica asla al citoplasma y
media las interacciones entre la clula y su medio, determinando la composicin del
citoplasma.

La estructura de los fosfolpidos es la responsable de la actuacin de las


membranas como barreras entre dos compartimientos acuosos.
La membrana es impermeable a molculas hidrosolubles pues el interior de la
bicapa est formada por cadenas de cidos grasos.
Las bicapas son fluidos viscosos.
Los cidos grasos de la mayor parte de los fosfolpidos tienen enlaces dobles que
introducen codos en las cadenas y dificulta su empaquetamiento.
Es ligera y flexible pues las largas cadenas hidrocarbonadas se mueven
libremente en el interior de la membrana.
Los fosfolpidos y las protenas son capaces de difundir lateralmente dentro de la
membrana.

Constitucin de las membranas


Lpidos de membrana: elementos estructurales fundamentales.
Los fosfolpidos principales la fosfatidilcolina, fosfatidilserina, fosfatidiletanolamina y
esfingomielina. Estos lpidos estn distribuidos de manera asimtrica entre las dos
mitades de la bicapa lipdica.
Fosfatidilcolina, esfingomielina capa externa.
Fosfatidiletanolamina, fosfatidilserina, fosfatidilinositol capa interna. Las cabezas de la
fosfatidilserina y del fosfatidilinositol estn cargadas negativamente, por lo tanto, en la
cara citoslica de la membrana hay una carga neta negativa.
Glicolpidos y colesterol
Los glicolpidos constituyen cerca del 2% de la membrana y estn exclusivamente en la
cara externa, con sus residuos hidrocarbonados expuestos a la superficie celular debido a
su funcin de sealizacin.
El colesterol est distribuido ms o menos igualitariamente en las dos mitades de la
bicapa y ms o menos en las mismas concentraciones molares que los fosfolpidos. Se
inserta dentro de la bicapa con sus grupos polares hidroxilos cercanos a las cabezas de
los fosfolpidos. Tiene la funcin de regular la fluidez de la membrana, a temperaturas muy
altas el colesterol interfiere con el movimiento de las cadenas de cidos grasos de los
fosfolpidos, disminuyendo la fluidez de la parte externa y reduciendo su permeabilidad a
molculas pequeas. A bajas temperaturas el colesterol interfiere entre las cadenas de
cidos, evitando que la membrana se congele. Las clulas bacterianas y vegetales
carecen de colesterol.

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Laura Mendoza

Balsas lipdicas
El colesterol, los glicolpidos y la esfingomielina no difunden libremente sino que forman
pequeas placas semislidas llamadas balsas lipdicas, las cuales se encuentran a un
nivel superior de la mayora de la bicapa pues las temperaturas de fusin de los
esfingolipidos son distintas de las de los fosfolpidos derivados del glicerol. En estas
balsas abundan las protenas ancladas a GPI y otras protenas que participan en la
sealizacin celular y la endocitosis.
Pueden estabilizarse mediante interacciones con el citoesqueleto a travs de protenas
perifricas de membrana, como caveolina. Varios tipos de protenas entran y salen de las
balsas, facilitando la agrucon de estas protenas.
Protenas de membrana: responsables de realizar las funciones especficas de la
membrana.
Debido a que las protenas son ms grandes, hay aproximadamente una protena por
cada 50 o 100 lpidos, aunque las membranas plasmticas estn compuestas por un 5050% de cada grupo.

Protenas perifricas: Se asocian indirectamente a la membrana con interacciones


protena-protena mediante enlaces inicos, y se disocian de la membrana tras el
tratamiento con agentes polares como soluciones de pH extremo o de alta
concentracin salina, que no rompen la bicapa.
Protenas integrales: (transmembrana) Se insertan dentro de la bicapa, y solo
pueden ser liberadas mediante tratamientos que rompan la bicapa alterando las
interacciones hidrofbicas, como los detergentes (molculas anfipticas).

La mayora de las protenas transmembrana son glicoprotenas con sus oligosacridos


expuestos en la superficie y pueden tener uno o varios dominios transmembrana, por
ejemplo la banda 3, que consta de 929 aminocidos y se cree que tiene 14 regiones que
atraviesan la membrana y que forman dmeros que contienen canales internos a travs de
los cuales los iones pueden cruzar la membrana.
Las porinas, protenas que forman canales en las membranas externas de algunas
bacterias, no contienen regiones hlices hidrofbicas sino que atraviesan la membrana
en forma de barriles en los que 8 a 22 lminas se pliegan para formar una estructura
en forma de barril que encierra un poro acuoso donde las cadenas laterales de los
aminocidos polares revisten el poro y las cadenas de los aminocidos hidrofbicos
interaccionan con los cidos grasos.
Otras protenas se unen a la capa interna de la membrana a travs de lpidos asociados
por enlace covalente. Estas protenas son sintetizadas en ribosomas libres y son
modificadas por la adicin de lpidos (N-miristoilacin, palmitoilacin y prenilacin),
adems de estar marcadas con secuencias positivas que interaccionan con los grupos
cargados negativamente de la fosfatidilserina.

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Laura Mendoza

No todas las protenas son capaces de difundir libremente por la membrana, en algunos
casos, la movilidad est restringida por su asociacin con el citoesqueleto, a otras
protenas de membrana, a protenas de la superficie de clulas adyacentes o con la matriz
extracelular. En las clulas polarizadas, la movilidad de las protenas debe estar
restringida a los dominios pertinentes de la superficie celular.
Glicoclix
Es un manto de carbohidratos que cubre a la clula, constituido por los oligosacridos de
los glicolpidos y las glicoprotenas, que sirve para:

Proteger la superficie celular frente al estrs inico y mecnico.


Crear una barrera ante organismos invasores.
Marcadores de interacciones clula-clula.

Transporte de molculas
Las protenas de transporte especficas (carriers y protenas de canal) son las
responsables del trnsito selectivo de molculas pequeas a travs de la membrana.

Simporte; transporte de dos molculas en una misma direccin. Ejemplo:


transporte activo de la glucosa.
Uniporte: transporte de una molcula.
Antiporte: transporte de dos molculas en direcciones opuestas. Ejemplo: antiporte
Na+-Ca+, Na+H+.

Potencial de membrana
La composicin inica del citoplasma es diferente a la del flujo extracelular. El potencial de
membrana viene determinado por el flujo de todos los iones que la atraviesan y la
apertura y el cierre de los canales inicos vienen dados por la dinmica entre el potencial
de reposo y el potencial de equilibrio de todos los iones de la clula.
Impulsos nerviosos
La llegada de un impulso nervioso al terminal de una neurona induce la liberacin de
neurotransmisores como la acetilcolina, estos neurotransmisores se unen a receptores en
la membrana de clulas postsinpticas donde inducen la apertura de los canales inicos
regulados por voltaje.
Difusin pasiva
Es un proceso no selectivo en el que una molcula se disuelve en la bicapa fosfolipdica,
difunde a travs de ella y se disuelve en la solucin acuosa al otro lado de la membrana.
La direccin de este transporte viene determinada por las concentraciones relativas de la
molcula dentro y fuera de la clula, a favor de un gradiente de concentracin. Slo las
molculas pequeas e hidrfobas son capaces de transportarse por este mtodo (O 2,
CO2, etanol, H2O)

~ 38 ~

Laura Mendoza

Difusin facilitada
Viene determinada por sus concentraciones relativas dentro y fuera de la clula (en el
caso de las molculas cargadas, por su potencial elctrico) y no interviene ninguna fuente
de energa, sin embargo, las molculas no se disuelven en la bicapa sino que su trnsito
viene mediado por protenas que permiten a las molculas atravesar la membrana sin
interaccionar con su interior hidrofbico.

Protenas transportadoras: se unen en un lado de la membrana a las molculas


que han de ser transportadas, sufren un cambio conformacional que libera a la
molcula del otro lado (azcares, aminocidos, nuclesidos)

El transportador de glucosa presenta 12 segmentos transmembrana en hlice formada


por aminocidos hidrfobos y ciertos aminocidos polares que forman el sitio de unin de
la glucosa. Este transporte es reversible y ocurre principalmente en las clulas hepticas.

Protenas de canal: forman poros abiertos a travs de la membrana y permiten la


difusin de molculas con el tamao y la carga apropiados. Por ejemplo, las
acuaporinas, que permiten el paso de H2O ms rpidamente que por difusin
pasiva, y que mantienen el equilibrio hdrico en el cerebro y expulsan el sudor de
la piel.
Canales inicos

Su apertura y cierre es extremadamente rpido (un milln de iones por seg).


Altamente selectivos gracias a que tienen un tamao especfico.
No se encuentran permanentemente abiertos, su apertura est regulada por
puertas que se abren en respuesta a estmulos especficos.

La apertura y cierre de estos canales tiene una funcin importante en clulas nerviosas y
musculares pues permiten la transmisin de seales elctricas.

Los canales regulados por ligando se abren en respuesta a neurotransmisores u


otras molculas seal.

En su estado cerrado, el poro de un canal puede estar bloqueado por las cadenas
laterales de los aminocidos hidrofbicos, cuando se une la protena a ser transportada se
induce un cambio conformacional y las cadenas laterales hidrofbicas dejan de estar en el
canal, permitiendo el paso de molculas con carga positiva pero no negativa, pues el
canal est recubierto de aminocidos cargados negativamente.

Los canales regulados por voltaje se abren en respuesta a variaciones del


potencial elctrico.

Los canales regulados por voltaje presentan un mayor grado de selectividad inica.

Canales para Na+ (+H2O): viene dada por la presencia de un poro estrecho que
acta como filtro de tamao.

~ 39 ~

Laura Mendoza

Los canales de Na+ y de Ca+ estn formados por una cadena polipeptdica que
contiene cuatro dominios repetidos que corresponden a la subunidad del canal K +. El
dominio cuatro es el que regula la apertura por voltaje pues contiene mltiples
aminocidos positivos que se desplazan en respuesta a cambios en el potencial.

Canales para K+: est formado por cuatro subunidades idnticas, con varias
hlices transmembrana. Forman canales estrechos, pero para impedir el paso de
molculas ms pequeas usa un mecanismo que consiste en un filtro estrecho
que est delimitado por oxgenos carbonlicos (C=O). Cuando un in K+ entra en el
filtro, interacciona con estos oxgenos carbonlicos y las molculas unidas a K + se
desplazan, dejando al K+ deshidratado pasar a travs del poro. Un Na +
deshidratado es muy pequeo para interaccionar con el filtro selectivo.
Transporte activo

Se usa la energa de la hidrlisis de ATP para dirigir el transporte de las molculas en


direccin energticamente desfavorable.

Bombas inicas: son las responsables de mantener el gradiente inico a travs de


la membrana plasmtica. Estas bombas son saturables.

Bomba de Na+-K+: Est compuesta por 4 polipptidos, 2 (grandes, unin de


Na+) y 2 (pequeas) y usa del 30-50% de ATP. La concentracin de Na+ en la clula es
cerca de diez veces superior fuera que dentro de la clula y la de K+ es mayor dentro que
fuera. Es vital para la propagacin de seales elctricas en el nervio y el msculo, para
mantener el equilibrio osmtico y el volumen celular, pues el citoplasma contiene alta
concentracin de molculas orgnicas que en ausencia de algo que lo compense,
provocara un flujo de agua hacia el interior celular por smosis.
1.
2.
3.
4.
5.
6.

3 Na+ se unen a sitios expuestos dentro de la clula.


La unin estimula la hidrlisis de ATP, fosforilando la bomba.
El Na+ se libera al exterior de la clula.
Al mismo tiempo, dos K+ se unen a sitios expuestos en la superficie celular
Se desfosforila la bomba.
Se libera el K+ al interior de la clula.

El potencial de membrana creado por el flujo de K+ dirige al Cl- fuera de la clula, donde la
concentracin es mayor que en el citoplasma.
Bomba de Ca+: transportan iones de calcio al exterior celular o a la luz del RE por
lo que las concentraciones intracelulares son extremadamente bajas, provocando que la
clula sea sensible a pequeos incrementos del nivel de Ca+, el cual desempea un
papel en la sealizacin celular.

~ 40 ~

Laura Mendoza

Transporte de H+
El H+ es bombeado hacia fuera de las clulas que recubren el estmago, provocando la
acidez del jugo gstrico. El transporte activo de H+ hacia los lisosomas y endosomas son
bombas estructuralmente distintas. Tambin existe una ATP sintetasa en mitocondrias y
cloroplastos, donde la bomba opera en sentido contrario, usando el movimiento de los
iones en contra del gradiente para dirigir la sntesis de ATP.
Transportadores ABC
Son transportadores de membrana caracterizados por dominios de unin a ATP. El ser
humano tiene al menos 48 genes que codifican transportadoras.
En bacterias, introducen una amplia gama de nutrientes y en clulas eucariotas
transportan sustancias txicas al exterior.
Estn relacionados con la resistencia a ciertos frmacos de quimioterapia de clulas
cancerosas y con la fibrosis qustica, en donde el producto del gen responsable de la
enfermedad (CFTR) es un canal de Cl- de transporte defectuoso en clulas epiteliales.
Transporte activo dirigido por gradientes inicos
Es el transporte en contra del gradiente de concentracin empleando la energa derivada
de acoplar el transporte de una segunda molcula en la direccin favorable
energticamente. Por ejemplo, la bomba Na+-K+ proporciona una fuente de energa
empleada para alimentar el transporte activo de azcares, aminocidos e iones.
La toma de glucosa en clulas intestinales se hace mediante un transporte de dos iones
de Na+ y una glucosa hacia el interior celular.
Endocitosis
Es la captacin de macromolculas, donde el material a ser inducido es rodeado por una
porcin de la membrana que luego se invagina para formar una vescula.
La endocitosis mediada por receptor es un mecanismo para la entrada
macromolculas, quienes se unen a receptores de la superficie celular, los
acumulados en regiones especializadas llamadas depresiones revestidas
que tienen una vida media de aproximadamente 2 minutos. La endocitosis
receptor provoca la entrada no selectiva de fluido extracelular.

selectiva de
cuales estn
con clatrina,
mediada por

La dinamina, una protena de unin a GTP, se dispone en anillos alrededor del cuello de
estas depresiones revestidas con clatrina y las invagina para formar vesculas revestidas
con clatrina, quienes se fusionan con endosomas tempranos y su contenido se distribuye.
El colesterol se transporte a travs del torrente sanguneo en forma de partculas
lipoprotenicas como LDL, la cual necesita de receptores especficos para entrar en la
clula. Las personas que padecen de hipercolesterolemia familiar son incapaces de
introducir LDL desde los fluidos extracelulares, bien sea por la ausencia de un receptor,

~ 41 ~

Laura Mendoza

como por el hecho de que no estn acumulados en las depresiones revestidas. Estas
mutaciones pueden ser tan simples como un cambio de aminocidos.
Las seales de internalizacin de muchos receptores estn compuestas por seis
aminocidos en los que la tirosina es esencial. Un receptor de LDL hace un ciclo de ida y
vuelta en aproximadamente 10 minutos, algunos receptores son degradados en los
lisosomas.
Las caveolas son pequeas invaginaciones de la membrana plasmtica organizadas por
la accin de la caveolina. Los lpidos de las caveolas e incluso la caveolina pueden mediar
como receptores para macromolculas como la HDL.
La macropinocitosis es la internalizacin de fluidos mediante vesculas grandes.

~ 42 ~

Laura Mendoza

Mitocondrias
Son los orgnulos responsables de generar la mayora de la energa til derivada de la
degradacin de los lpidos y carbohidratos, que es convertida en ATP mediante la
fosforilacin oxidativa.
La oxidacin del acetil CoA a CO2 est acoplada a la reduccin de NAD+ y FAD a NADH
y FADH2, los cuales se transfieren al O2 a travs de una serie de transportadores de la
membrana. La energa de estas reacciones se convierte en energa potencial acumulada
como un gradiente de protones a travs de la membrana, que se usa para dirigir la
sntesis de ATP.

Contienen varias copias por orgnulo de su propio genoma, distinto al cdigo


universal, formado por molculas circulares de ADN que contiene:
13 secuencias codificadoras de protenas, que son designadas como
componentes de los complejos respiratorios I, III, IV o V.
Intrones.
Genes para los ARNr 12 y 16S (23S, 16S y 5S en bacterias y plantas) y
para 22 ARNt, en los cuales la U en la tercera posicin del anticodn se
puede aparear con cualquiera de las cuatro bases.
Una regin llamada bucle D que contiene un origen de replicacin del ADN
y secuencias promotoras de la transcripcin.
No son orgnulos estticos, sino que se fusionan continuamente entre si y se
dividen en dos, que es posible que permita el intercambio de material gentico.
Casi todas las mitocondrias (incluyendo mutaciones en el orgnulo) son heredadas
de la madre pues se necesita mucha energa para mover los espermatozoides, por
lo que las mitocondrias se ubican en el cuello (flagelo), el cual se desprende al ser
fecundado. Las mutaciones pueden estar relacionadas con el sndrome metablico
(obesidad y diabetes), con neuropatas pticas, etc. La acumulacin progresiva de
mutaciones en el ADN mitocondrial durante la vida de los individuos contribuye al
envejecimiento.
Las mitocondrias de tejidos diferentes contienen protenas distintas.
Su cantidad depende de la funcin de la clula hay 80% en neuronas, 60% en
clulas musculares y 40% en clulas miocrdicas
Estn rodeadas por un sistema de doble membrana, una interna y la otra externa.

La membrana interna forma numerosos pliegues (crestas) que se extienden hacia la


matriz mitocondrial. La membrana interna es el lugar principal de generacin de ATP y eso
se ve reflejado en

El incremento de su superficie mediante el plegamiento en crestas.


Est compuesta en un 70% de protenas, que intervienen en la fosforilacin
oxidativa y en el transporte de metabolitos entre el citosol y la mitocondria.
Es impermeable a la mayora de los iones y las molculas pequeas, lo cual es
vital para mantener el gradiente de protones.

~ 43 ~

Laura Mendoza

La membrana externa es completamente permeable a molculas pequeas, ya que


contiene porinas que forman canales que permiten la difusin libre de molculas menores
de 1000 daltons.
La matriz contiene el sistema gentico mitocondrial y las enzimas responsables de las
reacciones del metabolismo oxidativo. Las etapas iniciales de la gluclisis tienen lugar en
el citoplasma, donde la glucosa es transformada en piruvato. El piruvato es transportado
al interior de la mitocondria, donde se oxida a acetil CoA, la cual es degradada a CO 2
produciendo ATP. Los cidos grasos tambin producen acetil CoA.

Internalizacin de protenas
A pesar de tener su propio genoma, las protenas requeridas para la replicacin,
transcripcin o traduccin del ADN, as como los genes que codifican la mayora de las
protenas mitocondriales requeridas para la fosforilacin oxidativa y las enzimas que
intervienen en el metabolismo mitocondrial, no estn en las mitocondrias sino en el
ncleo.
La mayora de las protenas son marcadas y dirigidas a la mitocondria mediante
secuencias N-terminales de 20 a 25 aminocidos (presecuencias) con mltiples residuos
de aminocidos con carga positiva en forma de hlice que se escinden tras entrar en el
orgnulo.
1. Las presecuencias se unen a receptores en la superficie de las mitocondrias,
Tom22, Tom20 y Tom5
2. La cadena se inserta en un complejo protenico (complejo Tom), que contiene una
Tom40, que dirige la translocacin a travs de la membrana externa.
3. Las protenas son transferidas a un segundo complejo en la membrana interna
(complejo Tim). La mayora de las protenas con presecuencias atraviesan la
membrana interna a travs del complejo Tim23, aunque algunas tienen una
segunda cadena hidrofbica, salen lateralmente de ste complejo para insertarse
en la membrana.
Debido a la transferencia de protones desde la matriz al espacio intermembrana se
establece un potencial elctrico, siendo la matriz negativa. Esto dirige la translocacin de
la presecuencia cargada positivamente.
Las protenas deben estar al menos parcialmente desplegadas, por lo que se requieren
chaperonas Hsp70 en el lado citoplasmtico, otra Hsp70 asociado con el complejo Tim23
que acta como un motor que emplea la hidrolisis del ATP para internalizar las protenas.
4. La presecuencia es entonces escindida por una peptidasa procesadora de la
matriz (MPP) y la protena se une (usando ATP) a otras chaperonas Hsp70 de la
matriz para ser plegadas. Algunas se transfieren a una chaperonina donde se
producen plegamientos adicionales.

~ 44 ~

Laura Mendoza

Distribucin de protenas

Membrana interna: No tienen presecuencias, sino mltiples secuencias de


internalizacin, por lo tanto, no son reconocidas por Tim20. Estas protenas, en
asociacin con una chaperona Hsp90 son reconocidas por un Tom70 y
translocadas mediante Tom40.

Las protenas de la membrana interna son transportadoras de molculas pequeas


(protenas transmembrana multipase) que intercambian nucletidos e iones entre la
mitocondria y el citosol.

Intermembrana: son reconocidas por el complejo Tim22. Protenas Tiny Tims


actan como chaperonas y transportadoras que escoltan protenas hasta Tim22.
Las protenas son parcialmente translocadas hasta que seales internas de
detencin de la transferencia causen su salida lateral del poro.

Protenas destinadas a la membrana externa, interna o al espacio intermembrana tienen


tanto una presecuencia como una secuencia seal interna.

Protenas con dominios transmembrana: salen lateralmente del canal Tom40.


Protenas intermembrana: pasan a travs de la membrana externa pero son
reconocidas por chaperonas especficas para cistena, retenindolas en el
espacio intermembrana.
Otras son transportadas a la matriz a travs del complejo Tim23 y al eliminarse la
presecuencia se deja expuesta una seal que dirige a la protena a travs de un
complejo Oxa1, donde pasan al espacio intermembrana o son insertadas en la
membrana interna.
Protenas de la membrana externa: como Tom40 y porinas (barril ) salen hacia el
espacio intermembrana a travs del complejo Tom, donde son reconocidas por las
tiny tims y transportadas al complejo SAM (maquinaria de distribucin y
ensamblaje) desde donde se insertan en la membrana interna.

Los fosfolpidos tambin son importados desde el citosol. La fosfatidilcolina y la


fosfatidiletanolamina se transportan a las mitocondrias mediante protenas de
transferencia de fosfolpidos, las cuales protegen el sitio de unin hidrofbico de la
protena.
Las mitocondrias sintetizan fosfatidilserina a partir de fosfatidiletaloamina y catalizan la
sntesis de la cardiolipina.
Fosforilacin oxidativa
Produce la mayor parte de la energa utilizable obtenida de la degradacin de los
carbohidratos o los cidos grasos, tiene lugar en el interior de las mitocondrias.

~ 45 ~

Laura Mendoza

La glucolisis y el cido ctrico producen en total cuatro molculas de ATP, diez NADH y
dos FADH2. Los electrones del NADH y el FADH2 son transferidos al O2 mediante la
fosforilacin oxidativa, formando de 32 a 34 molculas de ATP.
Cadena de transporte de electrones
La trasferencia de electrones desde el NADH al O 2 es una reaccin que desprende mucha
energa (-52,5kcal/mol/2e-). Esto debe hacerse paulatinamente a travs de cuatro
complejos transportadores que constituyen la cadena de transporte de electrones o una
gran parte se perdera en calor. Un quinto complejo acopla las reacciones del transporte
de electrones a la sntesis de ATP.
1. Los electrones del NADH entran en la cadena de transporte en el complejo I.
2. Los electrones se transfieren del NADH a un nucletido de flavina y luego, a travs
de un transportador de hierro-azufre, a la coenzima Q, que lleva los electrones
hasta el complejo III. Q es una molcula pequea, liposoluble.
3. Los electrones se transfieren del citocromo b al citocromo c, una protena
perifrica de membrana unida a la cara externa de la membrana interna, que
transporta los electrones al complejo IV.
4. El complejo IV transfiere los electrones al O2
5. El complejo V acopla el transporte de electrones a la sntesis de ATP.
El complejo II recibe los electrones del succinato del ciclo de Krebs y los transfiere a
FADH2
Acoplamiento quimiosmtico
La energa derivada del transporte de electrones est acoplada a la formacin de un
gradiente de protones en la membrana mitocondrial interna pues en cada complejo se
transportan 4 protones por cada par de electrones.
El gradiente de protones a travs de la membrana interna corresponde a una
concentracin de protones diez veces menor en la matriz, que tiene un pH de 8, mientras
que el espacio intermembrana tiene un pH de 7. Este gradiente genera un potencial
elctrico de 0,14V, siendo la matriz negativa.
El complejo V o ATP sintetasa est constituida por F 0 y F1, los cuales estn unidos por un
tallo estrecho. F0 es un motor de energa elctrica que atraviesa la membrana formando
un canal. La subunidad F1 cataliza la sntesis de ATP a partir de ADP e iones fosfato (F i)
mediante el retorno de protones a la matriz.
Se requiere el flujo de 4 protones a travs de F0 para sintetizar una molcula de ATP.
Transporte de metabolitos
Est mediado por protenas transportadoras y dirigido por el gradiente electroqumico.

~ 46 ~

Laura Mendoza

El ATP es exportado mediante un intercambio de ATP por ADP dirigido por el voltaje. El
transporte de Pi y de piruvato se hace intercambiando alguno por OH- y es el pH el que
dirige el intercambio.
Peroxisomas
Contienen al menos 50 enzimas que intervienen en diversas rutas metablicas,
incluyendo la degradacin de cidos grasos (proceso exclusivo de los peroxisomas en
levaduras y plantas mas no en humanos) y el metabolismo de la fotosntesis. La mayora
de las clulas humanas contienen unos 500 peroxisomas, los cuales se multiplican
mediante divisin y pueden ser regenerados.
Sus protenas, (pex1, pex2) se codifica el genoma nuclear y son sintetizadas por
ribosomas libres e importadas al orgnulo. Entre ellas, encontramos a la catalasa, que
descompone el perxido de hidrgeno, el cual es nocivo para la clula, en agua o lo utiliza
para degradar otro compuesto. Por lo tanto, los peroxisomas actan como un
compartimiento para las reacciones de oxidacin.
Los peroxisomas tambin sintetizan dolicol, colesterol y plasmalgenos. En el hgado,
intervienen en la sntesis de cidos biliares. Realizan diferentes reacciones bioqumicas
en distintos tejidos.
Formacin
Pex3, una protena transmembrana ubicada junto a pex9 en el RE, recluta a pex19, una
protena farnesilada del citosol, en el RE, las vesculas que contienen estas protenas se
separan y se fusionan con peroxisomas preexistentes o entre ellas.
Las protenas actan como receptores de importe para otras peroxinas mediante una
secuencia ser-lys-leu en el extremo C-terminal (PTS1) o una secuencia de 9 aminocidos
en el extremo N-terminal (PTS2). Estas secuencias por lo general no se escinden.
Las protenas destinadas a las mitocondrias, cloroplastos y peroxisomas se sintetizan en
los ribosomas libres y son importadas a sus orgnulos de destino como cadenas
polipeptdicas completas.

Laura Mendoza

~ 47 ~

Su proceso de maduracin implica el importe de diferentes clases de protenas desde el


citosol.Diferencias entre la transcripcin en procariotas y eucariotas

Caracterstica

Procariota

Eucariota

Promotor

Cajas y zona operadora

Solo cajas

Cistrn

Policistrones

Monocistrones

ARN polimerasa

Una con 5 subunidades

Tres ARN polimerasas con 13,


12
y
17
subunidades
respectivamente

Estabilizacin

No tiene

Al comienzo de la cadena, 7metil-guanosina (CAP) y al


final, una cola poliA.

Comienzo

La
ARN
pol
se ARN pol necesita la presencia
autoacopla al promotor
de factores de transcripcin

Intrones

No tiene

Tiene y se eliminan mediante


splicing

Lugar de accin

Inmediatamente

En el citoplasma

Conformacin de la PRS
ARNsrp (300 nucletidos)

P9 y P14
P54
P68 y P72
P19

Se une tanto a las protenas como al


ARNr de la subunidad mayor del
ribosoma.
Detiene el alargamiento de la cadena
Se une a la secuencia seal y une al
GTP.
Translocacin a la membrana
Enlaces entre P54 y un extremo de la
cadena de ARNsrp

Laura Mendoza

~ 48 ~
Toms y Tims
Nombre
Tom20
Tom70

Funcin
Reconoce la presecuencia
Reconocer protenas de membrana
interna
Translocar protenas desde el citosol al
espacio intermembrana
Reconocer protenas intermembrana
Dirigir a las protenas hacia Tim22 o a
SAM
Transportar
protenas
desde
la
membrana interna a la matriz
mitocondrial

Tom40
Tim 22
Tiny tims
Tim 23

Complejos de la cadena transportadora de electrones


Nombre

Composicin

Energa liberada

Complejo I

40 polipptidos

-16,6kcal/mol

Complejo II

4 polipptidos

Complejo III

10 polipptidos

Complejo IV
Complejo V

-10,1kcal/mol
-25,8kcal/mol

F0 y F1

Trminos de inters
AMPc: adenosin monofosfato cclico

1ATP/4H

~ 49 ~

Laura Mendoza

ARN:

ARN

Funcin

Mensajero (ARNm)
Transferencia (ARNt)
Ribosmico (ARNr)
ARN no codificante (MicroARN)

Molde para la sntesis de protenas


Traduccin del ARN
Traduccin del ARN
Corte y empalme de ARNm.
Clasificacin de protenas en eucariotas.
Reguladores de la expresin gnica y de la
traduccin.

ARNsi: short interfering ARN.


ARF: ADP-ribosylation factor.
BRE: B recognition element; secuencia reconocida por TFIIB.
Cistrones: Conjunto de varios codones Segmento de ADN compuesto de intrones y
exones.
Monocistrnico: Informacin gentica solo para una cadena polipeptdica
Policistrnico: Informacin gentica para varias cadenas polipeptdicas de
funcin relacionada, propio de procariotas.
Codn: unidad del cdigo gentico compuesta de 3 pares de bases de ADN que codifican
para un aminocido.
Corriente abajo: Va desde el lugar de inicio de la transcripcin (+1) hacia delante.
Corriente arriba: Va desde el lugar de inicio de la transcripcin (+1) hacia atrs.
DPE: Downstream promoter element; secuencia reconocida por TFIID
DCE: Downstream core element; reconocido por TFIID.
DSIF: DRB sensitivity inducing factor.
Fagocitosis: funcin principal de dos glbulos blancos sanguneos: macrfagos y
neutrfilos (fagocitos profesionales), quienes desempean un papel crtico eliminando los
microorganismos de los tejidos infectados.
Gemacin: Reproduccin asexual. Una divisin desigual donde se forman prominencias
sobre el individuo progenitor, y que al crecer y desarrollarse origina nuevos seres que
pueden separarse del organismo parental o quedar unidos a l.
Gen: secuencia de nucletidos en la molcula de ADN equivalente a una unidad de
transcripcin. Contiene la informacin que sintetiza para un polipptido, una enzima o un
cido ribonucleico (ARNm, ARNt, ARNr)
Glicofosfatidilinositol: glicolpido (oligosacrido unido a un lpido) cuyo oligosacrido
constituyente est formado por glucosamina y manosa unidos al residuo inositol del lpido,
con un extremo etanolamina que sirve de puente para el extremo C-Terminal de una
protena.
HDL: high density lipoprotein.
HGM: High movility group.
INR: secuencia iniciadora, se une al factor TFIID y a la polimerasa II.
LDL: low density lipoprotein.
MPP: matrix processing peptidase.

~ 50 ~

Laura Mendoza

MTE: Motif ten element; ubicado de 18-27 nucletidos corriente abajo. La prdida de
actividad de transcripcin de la caja TATA o de DPE por mutaciones puede ser
compensada por la adicin de una secuencia MTE.
NELF: Negative elongation factor.
NTP: ribonuclesidos 5-trifosfato.
PABP: protena de unin a poli-A (poly-A binding protein)
Plasmalgenos: fosfolpidos en los que una de las cadenas carbonadas est unida no
mediante enlace ster sino por un enlace ter. Son componentes importantes de la
membrana de tejidos como el cerebro y el corazn.
Polimerizacin: proceso qumico en el cual se unen varias molculas de un compuesto
para obtener una macromolcula.
PRS: partcula de reconocimiento de la seal
RISC: RNA induced silencing complex
RNPsn: (small nuclear ribonucleoprotein particles) partculas pequeas de
rinonucleoprotenas nucleares
SL1: factor de selectividad 1. Se compone de cuatro subunidades protenicas, una de las
cuales es TBP.
SNARE: Soluble NSF Attachment Protein Receptor.
SUMO: small ubiquitin-related modifier.
Tndem: repeticin de la misma secuencia una y otra vez, todas seguidas.
UBF: (upstream binding factor) factor de unin corriente-arriba.

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