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BCM2503

Mtabolisme molculaire
Introduction
Christian Baron
Nikolaus Heveker

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BCM1502 Fondements du mtabolisme


BCM2503 Mtabolisme molculaire

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Mtabolisme!
Entres (nourriture, respirations, mdicaments)!

anabolisme!
catabolisme!

Sorties (fces, urine, respiration)!

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Le mtabolisme est l'ensemble


des transformations molculaires et
nergtiques qui se droulent de
manire ininterrompue dans la
cellule ou l'organisme vivant. !
!
C'est un processus ordonn, qui
fait intervenir des processus de
dgradation (catabolisme) et de
synthse organique (anabolisme).
Couramment, le mtabolisme est
l'ensemble des dpenses
nergtiques d'une personne. !

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Cela ressemble un peu un circuit lectrique, o les tapes se


succdent, et les ractions sont interdpendantes!
-> Approche ingnierie biologie synthtique !

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On peut regrouper des rgions


fonctionnellement similaires or,
toutes les rgions sont interconnectes.!
!
!
Exemple: acides amins et
neurotransmetteurs!
!
!
Lies multiples liens entre ces
rgions indique que le
mtabolisme est un systme
intgr, consistant en multiples
sous-systmes.!

http://www.genome.jp/kegg/pathway.html#metabolism!

KEGG
Base de donnes
importante

http://earth.google.com/intl/fr/!

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Rgulation du mtabolisme: !
!
Rgulation du dbit des ractions, agissant sur les enzymes!
!
par voie endocrinienne (hormones)!
Transcription (quantit denzyme disponible), !
cofacteurs, !
autres?!
!
!
!
!
Drgulation = variation naturelle, et/ou maladie!
!
!
!
!

But du cours: vous donner des exemples avancs / montrer


des applications des connaissances sur le mtabolisme!

Cours 1: Antibiotiques !
biosynthse et production

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Beaucoup de bactries, champignons et plantes produisent des mtabolites!


hors-norme, des mtabolites secondaires!
!
Beaucoup de mtabolites secondaires sont bioactifs et exploits !
par exemple comme antibiotiques!
-> Concept des mtabolites secondaires!
-> Voies mtaboliques principales de biosynthse!
-> Biosynthse dantibiotiques importants!
Undecylprodigiosin !

actinorhodin!

Cours 2 : Antibiotiques !
mcanismes daction et rsistance !

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Davies & Davies, 2010


Fischbach
De nouvelles superbactries mettent les !
& Walsh, 2009
scientiques en tat d'alerte!
!
De plus en plus de bactries deviennent rsistant contre les antibiotiques!!

-> Comment est-ce que les bactries peuvent rsister aux!

mdicaments trs puissants comme aux antibiotiques!


-> Faut-il sinquiter?

Cours 3: Herbicides mcanisme daction !

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Lusage dherbicides est essentiel pour lagriculture moderne!


!
Le gnie des plantes pour rsistance contre les herbicides est controvers!

-> Cibles pour les herbicides dans le mtabolisme des plantes!


-> Sont-ils toxiques pour les humains?!
-> Gnie des plantes rsistantes contre les herbicides!
!

Cours 4: Mtalloenzymes et !
maladies mitochondriales!

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Les produits de la traduction ne sont pas forcment !


des enzymes actives!
!

Beaucoup denzymes comprennent des mtaux au site actif!

-> Exemples de mtalloenzymes importantes et !


de leur biosynthse et maturation!

Cours 5: Mtabolisme humain !


et mtabolisme du microbiome !

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Il y a 10x plus de cellules de microbes dans et sur le


corps que cellules humaines!
!
Le mtabolisme de ces microbes inuence !
le mtabolisme humain et vice versa!
!
But du human microbiome project !
est de mieux comprendre ces interactions!

-> Quelles maladies et conditions humaines sont!

inuences par les microbes?!


-> Mcanismes de communication !
humain <-> bactrie, bactrie <-> bactrie !
-> Est-ce que ces bactries sont dangereuses ou!
avantageuses?

Cours 6: Gnie mtabolique!


et biologie synthtique!

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Gnie dorganismes synthtiques pour production de produits


commerciaux, mdicaments, biocarburants, bioremdiation, etc.!
!

Procdures de production plus durables et vertes par rapport


aux synthses chimiques!?!

http://ung.igem.org/
-> Valeur ajoute par rapport la biotechnologie!

classique?!
-> Sommes nos connaissances assez avances pour faire !
mieux que lvolution?!
-> Question de risque et de scurit?

Cours 7: Maladies mtaboliques!

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Cours 8: Mtabolisme des mdicaments!

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Cours 9: Lobsit et le syndrome mtabolique !

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Cours 10: Mdicaments ciblant le mtabolisme!


Mtabolisme du cancer!

Cours 11: Mtabolisme et vieillissement !

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Cours 12: Approches de la mtabolomique!


- Mtabolisme des mdicaments !

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Pertinence et principe pdagogique du cours!


Antibiotiques, herbicides, etc.!
comme exemples pour dautres mdicaments!
!
De certains dtails retenir!
!
Cest lapprentissage et la comprhension !
des concepts qui sont importants!
!
Comptences transversales applicables dautres !
domaines de la recherche sur le mdicament et dautres sujets!
!
Il est vraiment important dassister au cours, de poser des!
questions et de discuter!