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Com exceo de um pequeno grupo de molculas de RNA catalticas, todas as enzimas puras
conhecidas so protenas, e a atividade cataltica depende da integridade da estrutura protica.
Por exemplo, se uma enzima fervida com cido forte ou incubada com tripsina, que so
tratamentos que quebram cadeias polipeptdicas, sua atividade cataltica destruda, mostrando
que a estrutura primria da protena enzimtica necessria para a atividade.
Algumas enzimas so formadas apenas por cadeias polipeptdicas e no contm nenhum outro
grupo qumico alm de resduos de aminocidos, como a ribonuclease pancretica.
Outra enzimas necessitam para a sua atividade de um componente qumico adicional chamado
cofator. O cofator pode ser inorgnico como Fe2+, Mn2+ ou Zn2+, ou pode ser uma molcula
orgnica complexa (coenzima).
A cada enzima dado um nmero de classificao com 4 dgitos e um nome sistemtico que
identifica a reao catalisada.
Exemplo:
ATP + D-Glicose ADP + D-Glicose-6-fosfato
O nome sistemtico da enzima que catalisa a reao acima ATP: glicose fosfotransferase, que
indica que ela catalisa a transferncia de um grupo fosfato do ATP para glicose. Seu nmero de
classificao 2.7.1.1, o primeiro dgito (2) indica o nome da classe (transferase), o segundo
(7) indica a subclasse (fosfotransferase), o terceiro dgito (1) indica a sub-subclasse
(fosfotransferase com um grupo hidroxila como aceptor), e o quarto dgito (1) indica a dGlicose como a substncia receptora do grupo fosfato.
O nome trivial dessa enzima hexoquinase.
A enzima combina-se com o seu substrato, formando um complexo, numa reao relativamente
rpida. Numa segunda reao reversvel, menos rpida, o complexo desfeito liberando o
produto da reao e a enzima livre.
Como a segunda etapa o passo limitante da velocidade, a velocidade observvel deve ser
proporcional concentrao do complexo ES.
A Equao de Michaelis-Menten
A deduo comea com as duas reaes bsicas envolvendo a formao e a quebra do
complexo enzima-substrato:
Algumas condies:
Se [Et] representa a concentrao total da enzima (a soma da enzima livre e da combinada),
[ES] a concentrao do complexo enzima-substrato, e [Et] [ES] representa a concentrao
da enzima livre. [S] a concentrao do substrato , ordinariamente, muito maior que [E t] de
forma que a quantidade de S (substrato) ligado pela E (enzima) , a qualquer instante, muito
pequena comparada com a concentrao total de S. A deduo comea considerando as
velocidades de formao e quebra de ES:
3- O equilbrio estacionrio:
velocidade de formao de ES = velocidade de quebra de ES
5- Simplificando a expresso:
E a velocidade inicial, de acordo com Michaelis-Menten, sendo dada pela velocidade de quebra
da segunda reao, cuja constante de velocidade k2:
E ainda, definindo-se Vmx = k2[Et], ou seja, a velocidade da reao quando toda enzima
presente est saturada pelo substrato na forma de ES ([ES] = [Et]), temos a Equao de
Michaelis-Menten:
Certas enzimas, como a anidrase carbnica, requer uma concentrao relativamente alta de
substrato para atingir a metade da velocidade mxima de catlise. Outras enzimas, como a
hexoquinase do crebro que catalisa a transferncia de um grupo fosfato do ATP para glicose,
atingem a metade da velocidade mxima com concentraes de substrato muito baixas.
Enzimas que trabalham com dois ou mais substratos podem ter um km diferente para cada
substrato.
AS ENZIMAS TM UM pH TIMO PARA SUAS REAES
Algumas tm especificidade quase absoluta por um dado substrato e no reagir nem mesmo
molculas muito semelhantes. Outras enzimas, tm especificidade relativamente ampla e agem
em muitos compostos com caractersticas estruturais comuns.
A regio da molcula da enzima onde acontece a interao com o substrato e sua transformao
qumica chamado stio ativo ou stio cataltico.
Apesar das enzimas diferirem muito em estrutura, especificidade e modo de catlise, podem-se
estabelecer algumas generalizaes acerca de seus stios catalticos:
1- O stio ativo ocupa uma parte relativamente pequena do volume total de uma enzima;
2- O stio ativo um entidade tridimensional;
3- Os substratos ligam-se s enzimas por mltiplas atraes fracas;
4- Os stios ativos so depresses ou fendas;
5- A especificidade de ligao depende do arranjo, definido com preciso, dos tomos no stio
ativo.
As formas dos stios ativos das enzimas so modificadas pela ligao com o substrato. Ou seja,
os stios tm formas que so complementares do substrato s depois do substrato estar ligado.
Este processo de reconhecimento dinmico chamado de encaixe induzido.