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Thme 1A2-4 Diversification gntique, diversification des tres vivants et volution

Chapitre 1 : Processus de diversification du vivant


1. Diversification d'origine gntique
1.1. Innovations gntiques
Mutations et duplications de gnes constituent des innovations gntiques expliquant, en partie, la diversification
du vivant : les mutations, en crant de nouveaux allles pour les gnes existants ; les duplications en crant de
nouveaux gnes (familles multigniques).
Les innovations gntiques sont transmissibles (transfert vertical) si elles affectent les cellules germinales
l'origine des gamtes. Elles peuvent alors modifier la population d'origine.
Schma 1.
1.2. Modifications du caryotype
Hybridation et polyplodisation
L'hybridation de deux individus d'espces diffrentes conduit un hybride ayant hrit d'un lot de chromosomes
non homologues de chaque parent.
L'absence d'homologues rendant impossible l'appariement en prophase 1, la miose ne peut aboutir : ces
hybrides sont donc striles.
Dans certains cas, s'effectue le doublement de l'ensemble des chromosomes de l'hybride reformant des paires
d'homologues. La fertilit est rtablie et les descendants sont tous polyplodes.
La polyplodisation est la multiplication naturelle ou artificielle du nombre de chromosomes aboutissant l'tat
polyplode (4n, 6n, etc).
Schma 2.
Remaniements chromosomiques
Les remaniements chromosomiques modifient la structure des chromosomes :
- les chromosomes de 2 paires diffrentes peuvent s'changer un fragment : translocation
- les chromosomes de 2 paires diffrentes peuvent fusionner : fusion
- une portion de chromosome peut s'inverser : inversion
- une partie de chromosome peut tre perdue : dltion
Schma 3.
1.3. Gnes homotiques et dveloppement
Les gnes homotiques dterminent la mise en place des organes le long de l'axe antro-postrieur et
dfinissent ainsi le plan d'organisation.
Ils prsentent une homologie de leurs squences nuclotidiques et constituent donc une famille multignique,
trs conserve au cours de l'volution (gnes ancestraux communs).
L'entre en activit de ces gnes s'effectue dans l'ordre de leur position sur le chromosome qui correspond
l'axe antro-postrieur.
Les gnes du dveloppement codent pour des protines qui sont des facteurs de transcription. Les facteurs de
transcription se fixent sur la squence rgulatrice des gnes-cibles, activant ou inhibant leur transcription et donc
leur expression.
L'expression combine des gnes du dveloppement, en agissant sur des gnes-cibles un instant du
dveloppement, dtermine la mise en place des structures anatomiques.
La modification en intensit et/ou de la dure et/ou de la chronologie de l'expression de ces gnes entrane une
modification dans la mise en place des structures anatomiques.
Schmas 4.
1.4. Transferts horizontaux
Un transfert horizontal correspond la transmission de gnes entre espces diffrentes, d'un virus une plante
ou un animal par exemple.
L'information gntique exogne (d'origine externe) acquise s'intgre au gnome des cellules-htes qui est ainsi
modifi et l'exprime, ce qui modifie son phnotype.
Si le transfert affecte les cellules germinales, le gnome modifi peut tre transmis aux gnrations suivantes.
Schma 5.
2. Diversification d'origine non gntique
2.1. Symbiose
La symbiose est une association durable bnfices rciproques d'tres vivants diffrents (ex. Lichens).
La symbiose existe entre de nombreux tres vivants trs diffrents : animaux, vgtaux, champignons, bactries
(ex. Lichen = algue + champignon).
La diversit des formes symbiotiques est obtenue sans modification gntique des espces associes.
2.2. Apprentissage de nouveaux comportements
Chez les vertbrs principalement, certains comportements sont transmis au sein d'un groupe : il s'agit de
comportements culturels.
Ces comportements sont le rsultat d'un apprentissage, ils ne sont pas dtermins gntiquement.
Ces comportements sont d'autant plus transmis qu'ils prsentent un avantage slectif (reproduction, recherche
de nourriture).
Bilan
La biodiversit est donc la consquence de processus gntiques et non gntiques et de leur volution au cours
du temps.
Schma 6.

Chapitre 2 : De la diversification des etres vivants a l'volution de la biodiversit


1. Variabilit des populations
Une population est un ensemble d'individus se reproduisant entre eux et formant une communaut dont les
limites, dans l'espace et dans le temps, sont fixes en fonction de critres gographiques, historiques, culturels
A lintrieur dune population, on observe une variabilit gntique due, d'une part au polymorphisme gnique
(existence d'allles diffrents) et d'autre part la diversit individuelle rsultant des brassages gntiques.
La rpartition des phnotypes (frquence phnotypique) l'intrieur d'une population dpend de la frquence
gnotypique qui elle-mme dpend de la frquence alllique.
Frquence alllique Frquence gnotypique Frquence phnotypique
2. Evolution gntique des populations
2.1. Slection naturelle
En fonction d'un contexte cologique prcis (pression du milieu, comptition entre tres vivants) certains
phnotypes peuvent prsenter un avantage ou un dsavantage : le milieu exerce une slection des phnotypes.
Dans un contexte donn, les individus possdant un phnotype favorable ont plus de chances de survie et se
reproduisent davantage que ceux prsentant un phnotype dfavorable. Il existe donc, au sein d'une population
htrogne, une survie diffrentielle en fonction du phnotype.
La consquence est la variation des frquences allliques au sein des populations : un phnotype prsentant un
avantage, permet une meilleure reproduction et donc une meilleure transmission des allles favorables qui, en
devenant majoritaires, renforcent le phnotype favorable. Et inversement pour les allles dfavorables qui, moins
transmis, tendent tre limins de la population. La variation de la frquence alllique est donc l'origine de
l'volution gntique des populations.
Tout changement de milieu peut inverser le sens de cette volution.
Schma 7.
2.2. Drive gntique
La drive gntique est l'volution d'une population cause par des phnomnes alatoires et imprvisibles. Elle
concerne surtout les allles neutres cest--dire qui ne confrent ni avantage ni dsavantage slectif.
Les effets de la drive gntique sont d'autant plus importants que la population est petite. En effet, le petit
nombre de gniteurs et/ou de descendants fait que statistiquement, certains allles ne seront pas transmis.
La drive gntique conduit donc, de faon alatoire, l'augmentation ou la diminution de la frquence des
diffrents allles et ainsi une diminution de la diversit gntique d'une population.
Schma 7.
3. Espce et spciation
La spciation est le processus conduisant l'individualisation de nouvelles espces.
L'vnement dterminant dans tout processus de spciation est l'apparition d'un isolement reproducteur entre
deux populations : des individus d'une population initiale ne pouvant plus se reproduire avec l'ensemble de la
population, ne se reproduisent qu'entre-eux. Plusieurs situations peuvent aboutir un tel rsultat :
- une barrire gographique ou cologique (le, changement de climat...),
- une barrire comportementale (prfrence sexuelle, dcalage des priodes de reproduction...),
- la strilit des individus hybrides.
L'isolement reproducteur des sous-populations entrane un isolement gntique : il n'y a plus d'changes
d'allles entre les sous-populations. Les sous-populations vont alors voluer indpendamment sous l'effet du
hasard et de la slection naturelle et formeront deux espces distinctes.
Schma 8.
L'espce n'est donc pas stable et permanente, une espce n'existe que pendant une dure de temps finie.
L'espce disparat si l'ensemble des individus concerns disparat, on parle alors d'extinction, ou si elle cesse d'tre
isole gntiquement (mlange).
Deux critres sont utiliss pour dfinir une espce, bien que de nombreuses exceptions existent :
- le critre de ressemblance : deux individus appartiennent la mme espce s'ils se ressemblent,
- le critre d'interfcondit : deux individus appartiennent la mme espce s'ils peuvent se reproduire
entre eux et avoir une descendance fertile.
4. Parents entre espces
La classification actuelle de la biodiversit repose sur l'tablissement de parents entre espces qui sont les
consquences de l'volution.
Les comparaisons se font sur la base de l'homologie : une homologie dsigne un mme caractre observ chez
deux espces diffrentes, qui a t hrit d'un anctre commun.
4.1. Comparaisons gntiques
La comparaison molculaire de squences nuclotidiques (ADN) ou polypeptidiques (protines) de squences
homologues permet d'valuer le nombre de mutations divergentes entre les gnes de deux espces.
Moins les squences comptent de diffrences, moins il y a eu de mutations divergentes et plus ces squences
sont proches.
Le caryotype peut subir des transformations qui peuvent porter :
- sur le nombre de chromosomes : ajout par hybridation, fusions de chromosomes
- sur la structure des chromosomes : inversions, dltions, translocations (dplacement) de fragments de
chromosomes.

4.2. Comparaisons anatomiques


La comparaison porte sur des organes homologues, c'est--dire ayant la mme origine embryonnaire.
Les parents se dfinissent par rapport des anctres communs hypothtiques et se traduisent par des arbres
phylogntiques.
La position dans le temps dun anctre commun peut tre value par les donnes palontologiques (fossiles).
Lanctre commun prcde la plus ancienne espce fossile prsentant les caractres de lanctre commun.
L'arbre phylogntique est une reprsentation dans le temps de l'volution. Les anctres communs
correspondent aux nuds, les caractres acquis avant un anctre commun sont des caractres primitifs (ou
ancestraux), ceux apparus aprs sont des caractres drivs rsultant d'une volution (= innovations volutives).
Le degr de parent se dfinit uniquement partir des caractres drivs : plus deux espces partagent de
caractres drivs communs, plus elles sont apparentes, plus leur anctre commun est rcent.
Schma 9.
Chapitre 3 : Un regard sur l'volution de l'Homme
1. Parent de l'Homme au sein des Primates
Les comparaisons anatomiques entre l'Homme et les espces actuelles montrent que l'Homme est un Vertbr,
Primate (cortex dvelopp, pouce opposable), Hominode (absence de queue).
Les comparaisons gntiques (molculaires, caryotype) montrent une forte parent avec un trs petit nombre
d'espces regroupes sous le terme d'Hominids : Gorille, Chimpanz-Bonobo.
Le Chimpanz est l'espce actuelle la plus proche de l'Homme :
- au niveau molculaire : ~98,5 % de similitudes des gnomes
- au niveau du caryotype : 16 chromosomes identiques, une fusion (Chimpanz 2n=48, Homme 2n=46),
quelques inversions, 1 dltion.
2. Caractres drivs humains
Le phnotype s'acquiert au cours du dveloppement pr et postnatal et dpend de la dure et de l'intensit dans
la chronologie d'action des gnes homotiques.
Chez l'Homme, l'allongement de la dure des diffrentes phases de dveloppement (htrochronies) est la
consquence de la modification de l'expression des gnes du dveloppement. Ces modifications expliquent
principalement les diffrences anatomiques caractristiques de l'Homme qui constituent les caractres drivs
humains :
- faible dveloppement osseux du crne qui conserve des caractres juvniles : trou occipital centr, face
plate, mchoire rduite, absence de prognathisme, absence de bourrelets, arc dentaire parabolique
- maturation lente du cerveau : augmentation du volume crbral, du nombre de neurones, complexification
du cerveau
- modification du squelette adapt la bipdie permanente : bassin court et large, membres infrieurs trs
dvelopps, fmurs inclins, colonne vertbrale 4 courbures
Les diffrences anatomiques du squelette sont en rapport avec la diffrence du mode de locomotion : l'Homme
est bipde, le Chimpanz est quadrupde et pratique galement la brachiation (dplacement dans les arbres avec
les bras).
Schma 10.
3. L'hominisation
L'hominisation est l'acquisition des caractres drivs humains anatomiques (caractres crniens et caractres
en rapport avec la bipdie) et culturels.
L'anctre commun Homme-Chimpanz a t dat vers environ -6 Ma. A partir de cet anctre commun se sont
individualises la ligne humaine (Hominins) et celle du chimpanz.
Les Hominins apparaissent en Afrique, ils sont tous caractriss par la bipdie. Ces hominins peuvent tre
classs en diffrents genres regroupant plusieurs espces formant des lignes : ligne du genre Australopithque
vers -4Ma, ligne du genre Homo vers -2,5Ma.
Les Australopithques sont bipdes (bassin, fmurs) mais leurs caractres crniens sont dans l'ensemble
primitifs (volume crnien comparable celui des singes). Il existe donc un anctre commun HommeAustralopithque dat vers -4Ma partir duquel se sont spares la branche Australopithque et la branche Homo.
L'volution du genre Homo se caractrise :
- du point de vue anatomique, par l'affirmation de la bipdie permanente (identique l'actuelle avec Homo
erectus vers -1,5 Ma) et le dveloppement progressif des caractres crniens humains
- du point de vue culturel, par la complexification des outils et des pratiques sociales (matrise du feu,
langage, rites funraires, art) en relation avec la complexification et le dveloppement du cerveau
- du point de vue des espces, par une importante diversification
- du point de vue gographique, par des migrations depuis Homo erectus
Schma 11.
L'volution de la ligne humaine montre une grande diversification d'espces plus ou moins apparentes
(volution buissonnante).
Depuis l'extinction vers -30000 ans des Nandertaliens, Homo sapiens est le seul reprsentant actuel du genre
Homo et des Hominins. Toutes les autres espces de la ligne humaine sont des espces d'Hominins fossiles.
Toutes les populations humaines actuelles seraient issues d'un anctre commun Homo sapiens, apparu en
Afrique vers -200000 ans, qui aurait colonis l'ensemble de la plante.
L'existence de l'Homme est donc le rsultat d'une volution, au mme titre que celle de toutes les autres espces
actuelles.

1 : Origine du bl tendre cultiv


Doc.1 : Caryotype du bl cultiv actuel (Triticum
Doc.2 : Etapes ayant conduit au bl actuel
aestivum)

1. Localiser sur le doc. 2 les phases d'hybridation et de


doublement des chromosomes.
2. Donner la formule chromosomique du bl dur et du
bl tendre.
3. Le bl dur et le bl tendre sont-elles des espces
striles ou fertiles ? Justifier.
2 : Caryotype de la mule
La mule et le mulet sont les hybrides obtenus par croisement d'un ne et
d'une jument.
Le bardot est le rsultat de l'hybridation d'un cheval et d'une nesse.
Le cheval (Equus caballus) et l'ne (Equus asinus) sont des espces
diffrentes d'Equids.
Le caryotype du cheval est 2n=64, celui de l'ne 2n=62.
Le caryotype ci-contre correspond celui d'une mule possdant 63
chromosomes.
1. Expliquer l'origine gntique du caryotype prsent.
2. La mule obtenue est-elle fertile ou strile ? Justifier.

3 : Le chant des Pinsons


Le chant d'un oiseau peut tre caractris par son
sonogramme.
Conditions
Diffrentes situations exprimentales ont t tudies de
exprimentales
faon dterminer l'origine du chant.
1. Identifier les modalits d'acquisition du chant chez le
Adulte tmoin
pinson.
2. En rpondant l'exercice 9 p.59, justifier le fait que la
diversit du chant n'est pas d'origine gntique.
Animal lev avec
ses congnres
Chez les pinsons, chaque mle possde un territoire
dont un adulte
(nourriture, reproduction).
Animal lev
Un pinson qui ne possde pas un chant comparable aux
compltement
pinsons de la rgion est chass par les autres pinsons.
Une tude base sur l'enregistrement des chants de pinsons seul
de la mme espce montre qu'il existe une variation
Animal rendu
gographique des chants : tous les pinsons ne chantent pas sourd la
avec le mme accent !
naissance

Chant final du pinson

3. Replacer l'apprentissage prcoce du chant dans la perspective de la slection naturelle.

4 : Contrle de la mise en place de l'axe antro-postrieur chez la drosophile


Le gne bicod est un gne homotique. Il est transcrit et traduit, chez l'embryon, dans ce qui deviendra le ple
antrieur de la drosophile.
Afin de comprendre le rle de cette protine, des expriences de mutation de gne (exprience B) et de transfert
de cytoplasme d'embryon un autre (expriences C et D) ont t ralis afin d'observer la mise en place des
diffrents segments (Te=tte, Th=thorax et Ab=abdomen). Les rsultats de ces expriences sont schmatiss cidessous.
bcd+ : gne actif ;
Paralllement, des dosages de la concentration
bcd- : gne inactif
de la protine bicod ont t raliss dans
diffrentes zones situes le long dun embryon
normal :

Prciser comment le gne bicod intervient dans


la mise en place des diffrents segments de
l'embryon de drosophile.

5 : Globine, slection naturelle et drive gntique


Doc.1 : Structure de la -globine
Doc.2 : -globine de diffrents vertbrs
La -globine est une des chanes protiques qui
Il existe une homologie plus ou moins grande des
constitue l'hmoglobine.
squences des -globines chez les vertbrs.
Sa forme 3D permet la fixation de l'hme qui intervient
Cependant on observe des sites variables et des sites
dans le transport de l'O2.
conservs.
Espce
Thon
Chien
Poule
Souris

Position dans la squence


de 31 42

de 122 126

CLIUVYPWTQRV
L----------F
L----------F
L----------F

TVETQ
-PQV-P-C-AEA-

Les lettres correspondent aux acides amins.


Les numros correspondent ceux des acides amins de
la chane de la -globine.
Proposer une hypothse volutive l'existence des 2 types de sites dans la -globine des vertbrs.
6 : Slection naturelle
Doc.1 : La drpanocytose et le paludisme
La drpanocytose est une maladie gntique
Le paludisme (malaria) est une maladie infectieuse due
autosomique rcessive, en gnral mortelle avant l'ge
la prsence dun parasite transmis par la piqre de
adulte. La mutation de l'allle normal A est l'origine
moustique. Ce parasite envahit les hmaties normales
d'un allle morbide S entranant la synthse d'une dans lesquelles il prolifre et quil dtruit massivement
globine anormale.
et brutalement (crises de paludisme).

Rpartition de l'allle S

Rpartition du paludisme

Doc.2 : Paludisme et viabilit des individus


En 1964, on a dnombr le nombre de morts du
paludisme en fonction du gnotype.

Doc.3 : Frquence des gnotypes AA, AS et SS au sein


de populations soumises des conditions diffrentes

Individus morts du
paludisme

Htrozygotes morts
du paludisme

44
27
13
16

1
0
0
0

Zare
Nigeria
Ghana
Ouganda

Prsence endmique du
paludisme

AA

AS

SS

Population 1

oui

30

50

20

Population 2

non

72,25

25,5

2,5

Formuler une hypothse expliquant la distribution de lallle S au sein des populations humaines.
7 : Spciation
A partir du livre p.70-71 et exercice 10 p.80, prsenter diffrents mcanismes pouvant conduire une spciation,
c'est--dire une individualisation d'espces.
8 : Parent et volution
Grce l'tude des documents et de vos connaissances, justifiez la cration du groupe des Archosauriens.
Le crocodile est-il plus apparent l'autruche ou au lzard ? A l'aigle ou l'autruche ?
Doc. 1 : Deux types de classification de certains
vertbrs

a. Classification traditionnelle

b. Classification phylogntique

Dans les classifications traditionnelles, on a pour


habitude de dfinir les oiseaux comme des
vertbrs ails recouverts de plumes et les
reptiles comme un groupe de vertbrs dont le
corps est recouvert d'cailles pidermiques. Des
scientifiques, dans une approche
phylogntique, ont propos une nouvelle
classification.
Doc. 2 : Comparaison de quelques caractres anatomiques de ces vertbrs
cailles

Membrane
nictitante

Fentre
mandibulaire

Gsier

Plumes

Aigle

sur les pattes

prsente

prsente

prsent

prsentes

Autruche

sur les pattes

prsente

prsente

prsent

prsentes

prsente

prsente

prsent

absentes

absente

absente

absent

absentes

absente

absente

absent

absentes

absente

absente

absent

absentes

Crocodile
Boa
Lzard
Grenouille

sur tout le
corps
sur tout le
corps
sur tout le
corps
absentes

Les tats drivs des caractres tudis sont indiqus en italique.


9 : Comparaison des caryotypes
Livre doc.1 et doc.2 page 84 Lire fusions de
Nombre de diffrences au niveau du caryotype pour les
chromosomes au lieu de fissions de chromosomes . paires II ou IIp et IIq
1. Complter le tableau suivant en indiquant le nombre
Chimpanz
Gorille
Orang-outan
de diffrences entre les caryotypes de l'Homme et celui
des autres espces.
2. Construire un arbre phylogntique simplifi.
Homme

10 : Dveloppement du crne et du cerveau chez l'Homme et le Chimpanz


Doc.1 : Comparaison anatomique des crnes
Ftus

Adulte

Prognathisme
*

Trou
occipital*

Volume
crnien
adulte (cm3)

Ftus
x
Chimpanz
Adulte
350
Ftus
x
Homme
Adulte
1400
* Prognathisme : avance de la face due une mchoire dveloppe
* Trou occipital (TO) : jonction entre le crne et la colonne vertbrale ; vers l'avant ou vers l'arrire
Doc.2 : Comparaison des
cerveaux adultes de
l'Homme (H) et du
Chimpanz (Cz)
H

Cz

Surface du
cortex (dm2)

22

Nombre de
neurones
(millions)

>30

Doc.3 : Phases du dveloppement chez l'Homme et le Chimpanz

Doc.4 : Action du gne ASPM


Le gne ASPM est un gne impliqu dans le
dveloppement du cerveau des animaux.
Chez l'Homme, les personnes dont les deux allles sont
dficients sont atteintes de microcphalie, anomalie de
la croissance et du dveloppement du cerveau.
Nombre de diffrences entre les squences
polypeptidiques (sur 3477 acides amins)

Homme sain

Homme
microcphale

Chimpanz

34

Doc.5 : Action du gne HAR1


HAR1 est un petit gne (118 nuclotides) qui aide
controler la production d'une protine (la reeline)
implique dans l'organisation et le dveloppement des
diffrentes couches de neurones du cortex crbral.
Ce gne, trs conserv chez les vertbrs est trs
diffrent chez l'Homme o HAR1 est trs actif et
acclre le dveloppement du cerveau.

1. Complter le tableau (doc.1).


2. Comparer le dveloppement du crne, du ftus l'adulte, chez l'Homme d'une part ; chez le Chimpanz d'autre
part.
3. Mettre en relation, sous forme d'un schma cause consquence, l'ensemble des documents de faon
expliquer les diffrences du dveloppement du crne et du cerveau chez l'Homme et le Chimpanz.
Livre doc.3 p.87 : acquisition du langage articul.

11 : Parent d'Australopithecus et d'Homo sapiens


Chimpanz

Homo sapiens

Australopithecus

400 cm3

1400 cm3

400 cm3

Chimpanz

Homo sapiens

Australopithecus

Caractres drivs humains : livre p.92-93


en U

Parabolique

1. Dfinir les caractres drivs humains tudis ici.


2. Placer Australopithecus par rapport au Chimpanz et
l'Homme.
3. Justifier le fait que
- Australopithecus n'est ni un singe ni un homme.
- Australopithecus tait bipde + Ex.8 p.105.
12 : Place de Neandertal et Cro-Magnon

Exercice 7 p.105
13 : Ligne humaine et culture
Pascal Picq. L'outil ne fait plus l'Homme. Pour la Science (2007), n57.
L'archologue franais Gabriel de Montillet tablit les grandes squences culturelles du Palolithique (l'ge de
pierre) en introduisant l'ide d'un progrs linaire : les premiers hommes commencrent par utiliser des pierres
casses, puis apprirent tailler eux-mmes la pierre pour obtenir des outils spcialiss. Le concept d'une volution
progressive des grands singes primitifs vers un homme moderne bipde, au cerveau dvelopp et maniant l'outil
avec dextrit s'impose.
On sait aujourd'hui que cette vision linaire des vnements est errone, mais les dogmes qui lui sont associs
n'ont pas t remis en question. L'un d'eux prtend que l'outil est une invention de l'homme et qu'Homo habilis
aurait t le premier en utiliser, voici deux millions d'annes.
Les plus anciens outils en pierre taille ont t dcouverts en Afrique de l'est [dats] entre 2,4 et 1,7 Ma. Mais on
connat au moins cinq Hominids associs ces vestiges archologiques sans qu'il soit possible de savoir qui a
invent l'outil en pierre taille. De surcrot, de plus en plus de paloanthropologues admettent qu'Homo habilis et
Home rudolfensis n'appartiennent pas au genre Homo au sens strict : ils semblent plus proche du genre
Australopithque.
Pratiques culturelles des derniers 800.000 ans