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Eva Palacios Muoz
Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
15.- Aminocidos proteicos: Estructura general. Carcter anftero. Clasificacin segn la cadena lateral: apolar, polar sin carga y polar con carga (cida o bsica). Aminocidos
esenciales (concepto).
2. 3. 1. PROTENAS: Biomolculas (macromolculas) orgnicas ms abundantes de la materia viva, compuestas por C, H, O y N. Son polmeros de ms de 50 aminocidos.
AMINOCIDOS (aa): Son los componentes de las protenas. Son molculas sencillas, no hidrolizables
DEFINICIN
Compuestos orgnicos sencillos de bajo peso molecular. Slidos, cristalinos, de elevado punto de fusin y solubles en agua.
Tienen actividad ptica y son anfteros.
COMPOSICIN Bioelementos
C, H, O y N
QUMICA
Frmula general
H2N-CHR-COOH
ESTRUCTURA
Contienen varios grupos unidos por
1 grupo carboxilo,
1 grupo amino y
enlace covalente a un tomo de C-
una cadena lateral o grupo R
CLASIFICACIN Segn formen parte
Aminocidos
Segn su
Polar
Neutros
Sin ms grupos carboxilos Glicina (Gly)
de las protenas o no proteicos
grupo R
ni amino. Dan enlace de H
(20)
cidos
Con grupos -COOH
Asprtico y glutmico
Bsicos
Con grupos NH2
Lisina, asparagina e histidina
Apolar
Cadena
Alifticos (lineales)
Ala (alanina),Val, Leu, Ile, Met,
(no polares o hidrocarbonada
Trp,
hidrofbicos)
Aromticos (con ciclos
Phe (fenilalanina),
derivados del benceno)
Pro (prolina)
Aminocidos
Algunos son intermediarios en reacciones metablicas
no proteicos (150)
PROPIEDADES
Isomera
Presentan actividad
Dextrgiros (+)
El C- es
ptica
Levgiros (-)
asimtrico
Hay 2 configuraciones D
Pueden ser + o Grupo -NH2 a la derecha
o estereoismeros
L
Pueden ser + o Grupo -NH2 a la izquierda
(la mayora)
Comportamiento
Son anfteros en Pueden ionizarse
En medio cido
Se comporta como base Los grupos amino captan H+,
qumico
disolucin acuosa. como cidos y/o bases
quedando como NH3+
(regulan el pH)
segn sea el pH
En medio bsico
Se comporta como cido Los grupos carboxilo liberan H+,
quedando como COOEn medio neutro
Se comporta como cido Se ionizan doblemente, apareciendo
y base a la vez
un zwitterion o forma dipolar
inica:
+H3N-CHR-COOPunto isoelctrico
Es el valor de pH para el cual un determinado aminocido no
tiene carga elctrica neta
Aminocidos
No pueden ser
Deben ingerirse en la En el hombre son 8 Fenilalanina
Isoleucina
Metionina
esenciales
sintetizados por
dieta
Leucina
Treonina
Valina
los animales
Lisina
Triptfano
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
Apolares
(no polares o
hidrofbicos)
CADENA LATERAL R
Es una cadena con radicales que forman
puente de H con el agua (son ms solubles)
Neutros
CARACTERSTICAS
(CARGA ELCTRICA,)
Sin carga
cidos
Bsicos
Alifticos
Aromtica
ISOMERA
CON O SIN CARBONOS
ASIMTRICOS (C*)
Sin C*
Con un C*- alfa
Gly (glicina)
Casi todos los aminocidos
Con 2 C*
TIPOS
EJEMPLOS
EJEMPLOS
Gly, Ser, Thr, Cys,
Gly (glicina), Cys (cistena), Asn,
Asn, Gln, Tyr
Gln
Con un grupo -OH
Ser, Tyr (tirosina), Thr
Asp (cido asprtico), Glu (cido glutmico)
Lys (lisina), Arg (arginina), His (histidina)
Ala (alanina), Val, Leu, Ile, Met
Phe, Pro, Trp
ESTEREOISMEROS
(configuraciones)
No hay configuraciones
Hay 2 configuraciones (L y D)
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
Dipptidos
Tripptidos
CARACTERES
FUNCIONES
Polipptidos
Contienen ms de 10 residuos
N-terminal
Amino terminal
Carboxilo terminal
Transportadora
C-terminal
Oxitocina
Insulina
Glucagn
Glutatin
Antibiticos
Valinomicina
Presentan 2 extremos
Hormonal
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
17.- Niveles de organizacin de las protenas: estructura primaria (secuencia de aminocidos), secundaria (-hlice y -laminar), terciaria (enlaces que estabilizan la estructura,
protenas globulares y fibrosas) y cuaternaria (hemoglobina).
2. 3. 3. PROTENAS: La forma de las protenas, responsable de su funcin, se debe a su secuencia (orden de aa en la cadena) y organizacin tridimensional o estructura.
ESTRUCTURA DE LAS PROTEINAS: Disposicin en el espacio de las molculas proteicas. La estructura primaria determina la secundaria y la terciaria.
TIPOS DE
PROTENAS QUE LAS
DEFINICIN
TIPOS
CARACTERES
TIPO DE ENLACES QUE
EJEMPLOS
ESTRUCTURAS
PRESENTAN
ESTABILIZAN
PRIMARIA
Todas
Secuencia de aminocidos
La secuencia de una protena
de la protena
se escribe como los pptidos
(desde el extremo N- terminal
al extremo C-terminal)
SECUNDARIA
Protenas filamentosas
Disposicin de la secuencia hlice
Se forma por enrollamiento
Enlaces o
Entre 2 aa: el
(sin estructura terciaria)
de aminocidos o estructura
helicoidal de la estructura
puentes de H
CO de un aa y
y segmentos de muchas
primaria en el espacio
primaria.
intracatenarios
el NH2 del 4
protenas globulares.
(3,6 aa/ vuelta)
aa
Hlice de colgeno
Se forma por enrollamiento
No se pueden formar fcilmente
Colgeno (asociacin de 3
helicoidal de la estructura
los puentes de H intracatenarios,
hlices)
primaria, pero es ms
debido a la abundancia de aa con
alargada
R de gran tamao (Prolina e
(3 aa/ vuelta)
hidroxiprolina)
Conformacin o
lmina plegada
TERCIARIA
CUATERNARIA
Cadena en zig-zag
(conservan su estructura
primaria)
La forma globular permite su
solubilidad en agua y
disoluciones salinas y, por
tanto, sus funciones
biolgicas.
Puentes de H
intercatenarios
Entre cadenas
(No hay
puentes de H
intracatenarios)
Enlaces entre los radicales R de
los aa por:
Covalente
fuerte:
Puente
disulfuro
Dbiles:
Puentes de H
Fuerzas de Van
der Waals.
Interacciones
inicas e
hidrofbicas.
Dmeros
tetrmeros
polmeros
2 protmeros
Hemoglobina,
Cpsida viral
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
TERCIARIA
(Enlaces (covalentes o no
covalentes)
entre los radicales R de los
aa)
CUATERNARIA
(Uniones dbiles,
no covalentes de las
subunidades)
Conformacin
Slo presentan
estructura
terciaria las
protenas
globulares!
Asociacin
Disposicin de la
estructura
secundaria de un
polipptido.
Plegamiento
espacial sobre s
mismo para adoptar
forma globular.
Unin de varias
cadenas
Slo la presentan polipeptdicas
las protenas
(subunidades o
complejas,
monmeros o
(fibrosas o
protmeros) para
globulares)!
formar un complejo
proteico
TIPOS
lice-
(Hlice de colgeno)
Hoja plegada
(Conformacin o
lmina plegada)
Tramos
rectos
Codos
hlice
o hoja
plegada
Sin
estructura
determinada
CARACTRES
La secuencia de una protena se
escribe como los pptidos (desde el
extremo N- terminal al C-terminal)
3,6 aa/ vuelta
Se forman por
enrollamiento
Es ms alargada
helicoidal de la
(3 aa/ vuelta)
estructura
primaria.
Cadena en zig-zag
(conservan su estructura primaria en
zig-zag)
TIPO DE ENLACES
EJEMPLOS
(QUE MANTIENEN ESTA ESTRUCTURA)
Enlaces peptdicos
Los aa que componen la
protena y en el orden:
Ala- Gly- Ile.
Enlaces o puentes
Entre el CO de un aa Ej.- queratina
de H intracatenarios y el NH2 del 4 aa
Los enlaces o
puentes de H no se
pueden formar
fcilmente debido a
Hay puentes de H
intercatenarios
Abundancia de aa con
R de gran tamao
(Prolina e
hidroxiprolina)
No hay enlaces o
puentes de H
intracatenarios!
Puente disulfuro
(covalente)
Puentes de H.
Fuerzas de Van der
Waals
Interacciones inicas e
hidrofbicas (no
covalentes).
Unin dbil de
protmeros por:
Puentes de H.
Fuerzas de Van der
Waals
Ej. globulinas
Dominios estructurales:
Unidades estructurales con
funciones especficas. Son
combinaciones de -hlice o
lmina plegada
estables, globulares, que son
monmeros de varias
protenas globulares. Son
clichs estructurales de
elevada eficacia biolgica.
Dmeros (2 protmeros)
trmeros (colgeno)
tetrmeros (hemoglobina)
polmeros (cpsida viral)
Protenas filamentosas
(sin estructura terciaria)
Ej .- queratina de la seda o
fibrona.
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
PROTENAS FILAMENTOSAS
TIPOS
ALFAQUERATINAS
BETAQUERATINAS
RICAS EN
Cys
22%
10-14%
No contienen Cys
ENLACES
PROPIEDADES
ESTRUCTURA SECUNDARIA
Puentes disulfuro
transversales entre
cadenas polipeptdicas
adyacentes
Se estiran cuando
se calientan
(pelo...).
Forma estirada es
inestable
hlice
Las cadenas peptdicas se
hallan retorcidas o
arrolladas de forma
diferente (al estirar la lana
y el pelo, se parecan a la
queratina)
Lmina plegada
Puentes de H
intracatenarios
No poseen puentes
disulfuro transversales
No se estiran
cuando se calientan
Puentes de H
intercatenarios
COLGENO
Prolina e
Hidroxiprolina
Triple hlice
Las fibrillas de colgeno
se hallan dispuestas de
modo diferente segn sea
la funcin:
EJEMPLOS
Duras y frgiles
Haces de
Blandas y flexibles
macrofibrillasfibrillas ms delgadashaces paralelos de
filamentos proteicos
Cuernos, uas
Piel, pelo y lana
Fibrona de la seda
Hilo de araas
Escamas, garras y picos de reptiles y
aves
Tendones: haces paralelos- estructuras
muy resistentes; pero poca o nula
capacidad de estiramiento.
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
18.- Propiedades de las protenas: solubilidad, des y renaturalizacin. Clasificacin de las protenas (holo y heteroprotenas) y funcin de las mismas
(transportadora, reserva, estructural, enzimtica, hormonal, defensa, contrctil).
2. 3. 4. PROPIEDADES DE LAS PROTEINAS (II): Dependen bsicamente de la naturaleza de los radicales R
SOLUBILIDAD
PROPIEDADES
Depende de la
proporcin de aa
con radicales
polares
DESNATURALIZACIN
Reversible
(prdida de la estructura terciaria y (renaturalizacin)
cuaternaria)
Irreversible
CAUSAS
Los grupos -R polares o hidrfilos se hallan
hacia fuera y
CONSECUENCIAS
EJEMPLOS
Las protenas se rodean de una capa Protenas filamentosas
de agua que impide su precipitacin (estructurales)
Forman puentes de H
Cambios de:
-pH
-Concentracin
- Temperatura
agitacin molecular
Disminuye su solubilidad:
precipitacin
Protenas globulares
(dinmicas)
Protenas globulares
(ovoalbmina, etc)---Protenas filamentosas
Insolubles
Solubles
ESPECIFICIDAD
De funcin
De especie
CAPACIDAD AMORTIGUADORA
(comportamiento anftero)
Prdida de algunos aa
Prdida de la funcin
Por eso puede haber rechazo en
trasplantes de rganos
Son disoluciones tampn o
amortiguadoras, es decir,
amortiguan las variaciones del pH
del medio
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
Desnaturalizacin
Especificidad
Capacidad
amortiguadora
Prdida de su configuracin
Reversible
espacial caracterstica (de su
(renaturalizacin)
forma nativa y adopcin de una
forma al azar) debido a agentes
fsico-qumicos y, prdida de su Irreversible
actividad.
Cambios de:
-pH
-Concentracin
- Temperatura
agitacin
molecular
CONSECUENCIAS
Las protenas se rodean de una capa
de agua que impide su
precipitacin.
Las protenas son macromolculas,
por lo que forman disoluciones
coloidales.
EJEMPLOS
Protenas
Insolubles
filamentosas
(estructurales)
Protenas
Solubles
globulares
(dinmicas)
Disminuye su solubilidad:
precipitan
Protenas globulares
(ovoalbmina, etc)--
Protenas filamentosas
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
Clasificacin de las protenas (holo y heteroprotenas) y funcin de las mismas (transportadora, reserva, estructural, enzimtica, hormonal, defensa,
contrctil).
SUBCLASES
Protenas globulares
Protenas filamentosas
HETEROPROTENAS
(aminocidos y otras
molculas denominadas
grupo prosttico)
Cromoprotenas
( grupo prosttico es un
pigmento)
Glucoprotenas
(glcido)
Lipoprotenas
(cidos grasos)
Nucleoprotenas
(cidos nucleicos)
Fosfoprotenas
(cido ortofosfrico)
EJEMPLOS
Histonas
Albminas
Globulinas
Queratina
Colgeno
Miosina
Elastina
Porfirnicas
Hemoglobina
Mioglobina
No porfirnicas
Hemocianina
Rodopsina
Hormona estimulante del folculo
Hormona luteinizante Glucoprotenas
de membrana
Inmunoglobulinas
Mucus
Lquido sinovial, etc.
Lipoprotenas sanguneas
FUNCIN
Estructural
Transporte y reserva de
aminocidos
Anticuerpos
Estructural
Contraccin muscular
Estructural
Transporte de oxgeno
Visin
Biocatalizadores, etc.
Transporte
Regulacin gentica
Casena, vitelina
Reserva de aminocidos
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COMPOSICIN
H
Slo aminocidos
O
L
O
P
R
O
T
E
N
A
S
(protenas
simples)
TIPOS
Protenas globulares
CARACTERES/
GRUPO PROSTTICO
Solubles en agua y con
funciones dinmicas
EJEMPLOS
Histonas
Bsicas
Albminas
Globulinas
Protenas
filamentosas
CARACTERSTICAS/ TIPOS
LOCALIZACIN
FUNCIN
Estructural
Ovalbmina
Lactalbmina
Seralbmina
Ovoglobulina
Lactoglobulina
Asociadas a los
cidos nucleicos
Clara de hiuevo
Leche
Sangre
Clara de hiuevo
Leche
Seroglobulinas
Sangre
Anticuerpos
Estructural
Epidermis de
vertebrados
Tejidos conectivos
Msculos
Muy elstica
Vasos sanguneos
Transporte y
reserva de
aminocidos
Estructural
Contraccin
muscular
Estructural
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
H
E
T
E
R
O
P
R
O
T
E
N
A
S
COMPOSICIN
Aminocidos y
otras molculas
denominadas
grupo prosttico
(G.P.)
TIPOS
Cromoprotenas
(su grupo
prosttico es un
pigmento o
sustancia
coloreada)
CARACTERES/
G. PROSTTICO
Porfirnicas
(porfirina o anillo
tetrapirrlico +
+ catin metlico)
EJEMPLOS
Hemoglobina
Mioglobina
Citocromos
Las ms
importantes
tienen un catin
metlico
No porfirnicas
Hemocianina
Rodopsina
Glucoprotenas
Glcido
CARACTERSTICAS/
TIPOS
Pigmento respiratorio
formado por: 4 cadenas
polipeptdicas globulares
(globinas) + 4 grupos hemo
Con 1 cadena polipeptdica +
+ grupo prosttico hemo
Interconversin de Fe 2+ a
Fe3+
Pigmento respiratorio de
algunos invertebrados
Sin metal
Pigmento fotosensible
Su G. P. deriva de Vit A
Glucoprotenas de membrana
Mucus
Hormonas
gonadotrficas
LOCALIZA
CIN
Sangre de
vertebrados
Msculos
En sangre de
algunos
invertebrados
Retina
Hormona estimulante
del folculo (FSH)
Hormona luteinizante
(LH)
Inmunoglobulinas o anticuerpos
Lipoprotenas
cidos grasos
Lipoprotenas sanguneas
Nucleoprotenas
cidos nucleicos
Fosfoprotenas
cido ortofosfrico
Casena, vitelina
Transporte de
oxgeno
Transporte de
oxgeno
Transporte de e- en
respiracin celular
Transporte de
oxgeno
Visin
Receptores
Digestivo,
respiratorio
Peptidoglicanos
FUNCIN
Proteccin
Biocatalizadora
Paredes
bacterianas
Proteccin
Defensiva ante
antgenos
Transporte
Regulacin
gentica
Reserva de
aminocidos
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
Protenas
Insolubles en agua y con
Queratina
N
filamentosas
funciones estructurales y de
A
proteccin. Casi slo en
Colgeno
S
animales.
Miosina
(protenas
simples)
Elastina
H
E
T
E
R
O
P
R
O
T
E
N
A
S
Aminocidos y
otras molculas
denominadas
grupo prosttico
Cromoprotenas
(El grupo prosttico
es un pigmento)
Porfirnicas
(porfirina o anillo
tetrapirrlico +
catin metlico)
Hemoglobina
Mioglobina
Con grupo
prosttico
hemo
Citocromos
No porfirnicas
Glucoprotenas
Glcido
Hemocianina
Con metal
(Cu)
Rodopsina
Sin metal
Hormona estimulante del
folculo
Hormona luteinizante
Glucoprotenas de
membrana
Inmunoglobulinas
Mucus
Lquido sinovial, etc.
CARACTERSTICAS/
TIPOS
Bsicas
LOCALIZACIN
FUNCIN
Estructural
Ovalbmina
Lactalbmina
Seralbmina
Ovoglobulina
Lactoglobulina
Asociadas a los
cidos nucleicos
clara de hiuevo
leche
sangre
clara de hiuevo
leche
Seroglobulinas
sangre
Muy resistente
epidermis de
vertebrados
tejidos conectivos
Msculos
Anticuerpos
Estructural
Muy resistente
Contrctil
Muy elstica
Pigmento respiratorio
formado por 4 cadenas
polipeptdicas globulares
(globinas) + 4 grupos hemo
(ferroporfirina)
Con 1 cadena polipeptdica
+ grupo prosttico hemo
Interconversin de Fe 2+ a
Fe3+
Pigmento respiratorio de
algunos invertebrados
Pigmento fotosensible
vasos sanguneos
en sangre de
vertebrados
en msculos
sangre de
algunos
invertebrados
Retina
Transporte y
reserva de
aminocidos
Estructural
Contraccin
muscular
Estructural
Transporte de
oxgeno
Transporte de
oxgeno
Respiracin
celular
Transporte de
oxgeno
Visin
Biocatalizadores,
etc.
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
Lipoprotenas
cidos grasos
Lipoprotenas sanguneas
Transporte
Nucleoprotenas
cidos nucleicos
Fosfoprotenas
cido ortofosfrico
Asociaciones ADNhistonas
Casena, vitelina
Regulacin
gentica
Reserva de
aminocidos
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
ESTRUCTURAL
A nivel celular
A nivel histolgico
ACTIVAS
FISIOLGICA
RESERVA
Ovoalbmina, vitelina
CONTRCTIL
Actina y miosina
Tubulina, dinena, flagelina
Insulina,
Tiroxina,
Hormona de crecimiento.
Protenas reguladoras del pH
HORMONAL
DEFENSA
TRANSPORTE
REGULACIN GENTICA
ENZIMTICA O CATALIZADORA
INMUNITARIA
EJEMPLOS
Glucoprotenas de membrana
Microtbulos del citoesqueleto, cilios y flagelos
Histonas
Queratina, elastina, colgeno.
A nivel celular
A nivel sanguneo
Permeasas
Pigmentos respiratorios
Seroalbmina
Transferrina
Lipoprotenas
Tripsina, ribonucleasa,
Catalasa, peroxidasa, citocromos
Inmunoglobulinas,
Toxinas.
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
19.- Concepto de Biocatalizador. Enzimas: Definicin y caractersticas (actividad y especificidad enzimtica). Factores que regulan la actividad enzimtica
(concentracin de sustrato, T, pH, inhibidores y cofactores). Las vitaminas: Definicin, clasificacin (hidrosolubles y liposolubles) y funcin como
coenzimas.
ENZIMAS:
BIOCATALIZADORES O CATALIZADORES BIOLGICOS:
Sustancias qumicas orgnicas que aumentan la velocidad de reaccin (catalizan) las reacciones biolgicas
CATALIZADORES
ENZIMAS
NO BIOLGICOS
SEMEJANZAS Funcin
Aumentan (aceleran) la velocidad de reaccin.
Energa de activacin Disminuyen la energa de activacin necesaria para llegar al estado de transicin.
Se consumen?
Cantidad necesaria
No se consumen durante la reaccin, sino que se recuperan intactas al final del proceso.
Se requieren cantidades muy pequeas para acelerar la reaccin.
DIFERENCIAS Especificidad
T a la que actan
Actividad
Actan a T ambiente
Son muy activas
Peso molecular
Tienen un peso
molecular muy elevado
TIPOS DE BIOCATALIZADORES
TIPOS
COMPOSICIN QUMICA
ENZIMAS
Protenas globulares
VITAMINAS
ARN (ribozimas)
Glcidos o lpidos sencillos
HORMONAS
Protenas o esteroides,
generalmente.
Derivados de aminocidos o de
cidos grasos
PROPIEDADES
LOS PODEMOS SINTETIZAR
(SOLUBILIDAD)
LOS ANIMALES?
Solubles en agua,
S, son sintetizadas por el
difunden fcilmente en los organismo
lquidos orgnicos.
Hidrosolubles y
liposolubles
CMO ES SU
SNTESIS?
Como cualquier
protena, pues van
codificadas
genticamente
_
ACTUACIN
Catalizan de forma especfica
determinadas reacciones
bioqumicas unindose a la
molcula a transformar (S)
Actan como coenzimas
Son sintetizadas en
glndulas endocrinas y
vertidas al medio
interno (sangre)
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
Enzimas: Definicin y caractersticas (actividad y especificidad enzimtica). Factores que regulan la actividad enzimtica (concentracin de sustrato, T,
pH, inhibidores y cofactores).
3. 1. ENZIMAS: DEFINICIN Y CARACTERSTICAS.
Son catalizadores orgnicos coloidales, de naturaleza proteica, producidos por los seres vivos.
Son protenas globulares (salvo ribozimas), solubles en agua y difunden fcilmente en los lquidos orgnicos.
TIPOS DE ENZIMAS POR SU ESTRUCTURA: COFACTORES ENZIMTICOS
TIPOS DE ENZIMAS
COMPOSICIN
UNIONES DE
TIPOS DE
COFACTORES Y
COFACTOR
ENZIMAS
1.Estrictamente proteicas
2.HOLOENZIMAS =
= Apoenzima +
+ Cofactor
Una o ms cadenas
polipeptdicas
Apoenzima
(parte proteica)
Cofactor
(parte no proteica)
DEFINICIN/
PROPIEDADES
Dbil
1.Activadores
inorgnicos
In metlico u oligoelemento
2.Coenzimas
Molculas orgnicas
complejas.
COENZIMAS
EJEMPLOS DE
HOLOENZ.
TIPOS
CLASES
EJEMPLOS
Mg2+
Nucletidos
Adenosnfosfatos
Nucletidos y PiridnSon inespecficas (un coenzima derivados de nucletidos
puede actuar como cofactor de Vitaminas
Flavnmuchas apoenzimas diferentes.
nucletidos
Ej. ATP).
-
Quinasas
ATP
NAD
NADP
FMN
FAD
Coenzima A
3.Grupos
prostticos
Derivados de
Vitaminas
Derivados de
Vit B12
Grupo hemo
(ferroporfirina
= porfirina +
Fe2+)
Citocromos
(poseen un grupo
prosttico
ferroporfirnico
que acta como
cofactor)
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
FUNCION DE AA
Dan la forma a la enzima, no son dinmicos
Unin del E y el S
Catlisis: rompen algunos de los enlaces del S.
No deben estar necesariamente cerca en la secuencia;
pero s tras el plegamiento de la cadena polipeptdica.
SE UNEN AL
SUSTRATO?
No
S
EXPLICACIN
CUANDO APARECE LA
COMPLEMENTARIEDAD E-S?
La llave es el Sustrato y la
Antes de unirse E y S.
cerradura es la Enzima.
La mano es el Sustrato y el
guante es la Enzima.
Slo despus de haberse unido E y
Hay un cambio de
S.
conformacin de la enzima tras
unirse al sustrato
SUSTRATO?
No
No
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
Enzimas: Definicin y caractersticas (actividad y especificidad enzimtica). Factores que regulan la actividad enzimtica (concentracin de sustrato, T,
pH, inhibidores y cofactores).
ENZIMAS. ACTIVIDAD ENZIMTICA. MECANISMO DE ACCIN: E + S = ES = EP = E + P
N DE
MECANISMO DE ACCIN
SUSTRATOS /
1. INICIACIN
2. TRANSFORMACIN
REACCIN
Un sustrato (S)
1- Fijacin al sustrato en su superficie Se debilitan los enlaces del
3. Formacin del
4. Formacin del
(adsorcin)
sustrato
complejo enzimacomplejo enzima
E + S = ES = E + P
2 - Unin del S al E mediante enlaces
sustrato (ES)
producto (EP)
Se requiere mucha menor
dbiles (S + E)
energa para llegar al complejo
activado
(C. A.)
Dos sustratos (A, B) Mecanismo 1.Fijacin de los dos
Aumenta la probabilidad de
Complejo ABE
Complejo CDE
normal
sustratos en su superficie que se encuentren y reaccionen
E
(adsorcin)
los sustratos
A+B =C+D
Mecanismo 1.Fijacin de un S
_
Complejo AE y
Complejo BE y
E
ping-pong primero y despus, el
liberacin de C y E
liberacin de D y E
otro
3. FINALIZACIN
5. Liberacin de la enzima intacta
(E) y el producto (P)
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
Enzimas: Definicin y caractersticas (actividad y especificidad enzimtica). Factores que regulan la actividad enzimtica (concentracin de sustrato, T,
pH, inhibidores y cofactores).
MECANISMO DE ACCIN DE LAS ENZIMAS. REACCIN ENZIMTICA Y SU CINTICA:
Estudio de la velocidad de las reacciones enzimticas que se define como la cantidad de materia transformada en funcin del tiempo y se mide por la desaparicin de un S o
coenzima o por la aparicin del P, en funcin del tiempo.
La representacin grfica de la cintica enzimtica suele ser una hiprbola: la velocidad de la reaccin aumenta de forma lineal hasta la saturacin de la enzima.
CONSTANTES/ OTROS
Vmx
DEFINICIN
Velocidad mxima que alcanza la reaccin enzimtica
Constante de Michaelis-Menten
(Km)
Ecuacin de Michaelis-Menten
EXPLICACIN
Todas las molculas de la enzima estn
ocupadas por molculas de sustrato
> Afinidad hay entre Son inversamente
el S y la E
proporcionales
> Velocidad
(> Eficacia cataltica)
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Enzimas: Definicin y caractersticas (actividad y especificidad enzimtica). Factores que regulan la actividad enzimtica (concentracin de sustrato, T,
pH, inhibidores y cofactores).
PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS
PROPIEDADES
TIPOS
Especificidad de la
catlisis enzimtica
De accin
De sustrato
Reversibilidad
Eficacia
Gran poder
cataltico
DEFINICIN
GRADOS DE
ESPECIFICIDAD
_
LA ENZIMA RECONOCE
UN TIPO DE
UN TIPO DE
MOLCULAS?
ENLACE?
_
_
EJEMPLO
ENZIMA
SUSTRATO
Oxidacin de un aa,
Especificidad absoluta
(la ms especfica)
S, slo un sustrato
determinado
Ureasa
Urea
Especificidad de grupo
(ms amplia)
S, un tipo de molculas
que tengan una
caracterstica estructural
comn
Protenas con
aa aromticos
Especificidad de clase
(la menos especfica)
S,
independientemente
del tipo de
molcula
Quimiotripsina
(hidroliza
enlaces
peptdicos
diferentes)
Fosfatasas
(separan
fosfatos de
cualquier S)
Grupos fosfato
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
Reversibles
Unin dbil
no covalente
No
CLASES DE INHIBIDORES
(REVERSIBLES)
(segn compitan o no con el S)
-
Competitivos
No competitivos
Compiten con el S
(conformacin espacial
similar al S)
No compiten con el S (se
unen en otra zona del E)
SE UNE EL I AL
CENTRO ACTIVO
DEL E?
INHIBIDORES
Disminuyen o impiden
completamente la
actividad de una E.
Pueden ser perjudiciales.
o beneficiosos.
EFECTOS
Inutiliza a la E
permanentemente
No Complejo E-S
Otra zona del E
Disminuyen la
velocidad de la
reaccin
Impiden la separacin
de E-S y formar el P
Impiden el acceso del
S al centro activo
EJEMPLO
El in cianuro
(inhibe a la
citocromoxidasa
de la respiracin
aerobia)
Sulfamidas
_
_
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3.Modificaciones covalentes
TIPOS
EXPLICACIN
Activadores o efectores
Inhibidores
REVERSIBLES
IRREVERSIBLES
Zimgenos o proenzimas
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
III. Hidrolasas
IV. Liasas
V. Isomerasas
VI. Sintetasas o
ligasas
COENZIMA/TIPO
DE ENLACE
EJEMPLO DE REACCION
(el signo = indica reaccin reversible)
Las de respiracin celular
Glu + O2 = CO2 + H2O + Energa
(se oxida) (se reduce)
Acido asprtico + cido pirvico =
cido oxalactico + alanina
Lipasas
nlace ster
(cido + alcohol)
Carbohidrasas
Glucosdicos
Peptidasas
Descarboxilasas
Peptdicos
Liberacin de CO2 a
partir de un S orgnico
Gliceraldehdo- 3- fosfato =
Dihidroxiacetona 3- fosfato
(Fosfotriosa isomerasa)
A + B + ATP = A-B + ADP + P
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
Hidrlisis
(rotura de sustratos
diversos mediante
el agua)
Introducen grupos
OH y -H
Esterasas
Carbohidrasas
Peptidasas
IV. Liasas
V. Isomerasas
VI. Sintetasas o
ligasas
Soldadura o rotura
de S sin agua.
Adicin de grupos
funcionales (-NH2,
CO2, H2O,) a
molculas que
tienen un doble
enlace.
Isomerizacin o transformacin de
molculas en sus ismeros
Sntesis de molculas con hidrlisis de
ATP
Nucleasas
Aminasas
Carboxilasas
Hidratasas
Lipasas
Fosfatasas
Sacarasa
Amilasa
Tripsina
Pepsina
Adicin de NH2 a un doble
enlace
Adicin de COO a un doble
enlace
Adicin de H2O a un doble
enlace
COENZIMA/TIPO
EJEMPLO DE REACCION
DE ENLACE
(el signo = indica reaccin reversible)
NAD, NADP Y FAD Acido mlico + NAD+ = cido oxalactico
se reducen a NADH2, + NADH + H+
NADPH2 Y FADH2 (Malato- deshidrogenasa)
Glucosdicos
Peptdicos
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
Son las que pueden adoptar dos formas estables diferentes, permitiendo la autorregulacin de la actividad enzimtica (por el S y el P)
FUNCIN
EJEMPLO
1.Centro Activo
2.Centro Regulador
(centro alostrico)
All se une el S
a) Si el centro alostrico est vaco
b) Si el centro alostrico est
ocupado por un ligando o efector
Dos formas
La E cataliza a v normal.
Activadores o efectores
(suelen ser los S)
Inhibidores alostricos
(suelen ser los P)
Regulacin por
retroinhibicin o
inhibicin feed-back
Regulacin por
induccin enzimtica
Permite regulacin
ms rpida y con
menor cantidad de
activadores e inhibidores.
La unin del S al centro activo de una de las subunidades, facilita la unin del S
a los centros activos de otras subunidades.
(El cambio de conformacin de este protmero o transicin alostrica,
se transmite instantneamente a los otros protmeros, activndolos)
Conformacin activa
Conformacin inactiva
Estructura
cuaternaria
(estn formadas
por varias
subunidades)
Cintica
Es diferente a las dems E: es una sigmoide (no hiprbola) -> Cambio muy grande en la velocidad de reaccin (ley del todo o nada).
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
COENZIMA
DERIVADO
-
B1 (Tiamina)
B2 (Riboflavina)
Pirofosfato de tiamina
FAD, FMN
B3 (Niacina)
B5 (cido pantotnico)
B6 (Piridoxina)
NADP+, NAD+
Coenzima A
(imprescindible en el
metabolismo celular)
Fosfato de piridoxal
B8 (Biotina, Vit H)
Biocitina
B9 (Acido flico)
Acido tetrahidroflico
B12 (cobalamina)
Coenzima B12
A (retinol)
11-cis-retinal
D
D2 (Ergocalciferol)
D3 (Colecalciferol)
E (Tocoferol)
K (Filoquinona)
1,2-Dihidroxicolecalciferol
ENFERMEDAD CARENCIAL
Escorbuto, propensin a infecciones
Beri-beri (polineuritis)
Dermatitis, inflamacin y agrietamiento de la
lengua, comisura de boca, etc.
Pelagra (dermatitis, diarrea y demencia)
Palpitacin, dolor y quemaduras en pies,
alteraciones nerviosas y circulatorias
Dermatitis, trastornos del aparato digestivo,
convulsiones
Dermatitis, cada del pelo, anemia
Anemia, insomnio, depresin del sistema
inmunitario
Anemia perniciosa, trastornos nerviosas,
ulceraciones en boca
Ceguera nocturna, xeroftalma, desecacin
epitelial, detencin del crecimiento
Raquitismo en nios, deformaciones seas en
adultos
Envejecimiento celular, impide el crecimiento
Retardo en coagulacin sangunea, hemorragias
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
1.
VITAMINAS LIPOSOLUBLES
NOMBRES
PROVITAMINAS
A (Retinol),
Provitamina A o
(Antixeroftlmica) Betacaroteno
K ( Menadiona)
(Naftoquinona)
(Antihemorrgica)
AVITAMINOSIS
Ciclo visual,
Mantenimiento de epitelios y buen
funcionamiento de todos los tejidos
Antioxidante: ayuda a evitar el cncer.
Desarrollo de huesos.
Metabolismo del calcio, esencial en el
crecimiento y mantenimiento de huesos y
dientes.
Xeroftalmia, ceguera
nocturna, alteraciones
epiteliales, detencin del
crecimiento.
HIPERVITAMINOSIS
Cada del pelo,
descamacin,
Debilidad,
vmitos
Raquitismo en nios,
osteomalacia en adultos,
caries, osteoporosis senil.
Calcificacin
corazn, rin e
hgado
Envejecimiento celular.
Impide el crecimiento.
Trastornos de la
reproduccin.
Retardo en la coagulacin
Hemorragias
FUENTE
Vegetales con carotenos (perejil,
espinacas, zanahorias, orejones
de albaricoque), mantequilla,
hgado, huevos, leche de vaca.
Mantequilla, leche, yema de
huevo, levadura, cereales
germinados y aceites vegetales,
pescados azules, hgado.
Aceites vegetales prensados en
fro (germen de trigo, girasol,
oliva...), semillas, germen de
trigo, vegetales de hojas verdes,
cacahuetes crudos, nueces, yema
huevo.
Vegetales hojas verdes (escarola,
lechuga, espinacas), huevos,
pescados
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Tema 2. Biomolculas compuestas orgnicas: Protenas y biocatalizadores. PAU Biologa. CEA Garca Alix
2. VITAMINAS HIDROSOLUBLES
NOMBRES
COENZIMA
C (Acido ascrbico)
(Antiescorbtica)
AVITAMINOSIS
Escorbuto
Infecciones respiratorias
FUENTE
Kiwi, guayaba, fresa, naranja, pimiento rojo,
brcol, perejil.
Beri-beri,(Polineuritis) y
otros trastornos nerviosos
B1 (Tiamina,)
(Antineurtica)
(Antiberibrica), vit.
del estado de nimo
Pirofosfato de tiamina
(Descarboxilasas : transferencia de
grupos aldehdo en el metabolismo de
glcidos y lpidos)
B2 (Riboflavina)
B3 (Niacina)
(Antipelagrosa)
B8
(Vit H, Biotina)
B9 (Acido flico)
Antianmica.
Formacin de glbulos rojos
Anemia. Insomnio.
Depresin del sistema
inmunitario.
B12 (Cobalamina)
(Antiperniciosa)
Coenzima B12
(metabolismo de cidos nucleicos)
B5
(Acido pantotnico)
B6 (Piridoxina)
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