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INTRODUCCIN AL METABOLISMO
Pautas ms sencillas para desglosar una ruta metablica
Prof. Esther Gimnez
La clase de hoy va a ser una introduccin a la unidad 3, que va a ser acerca de los
procesos degradativos o de oxidacin para la obtencin de elementos que van a generar
energa y como sucede ese transformacin a elementos ricos en energa que van a ser utilizado
por la clula para poder mantener todas sus funciones vitales.
Antes de eso vamos a dar una serie pautas que necesitamos, que nos va a servir de aqu
en adelante hasta la finalizacin del semestre: Cmo estudiar una ruta metbolica? y las pautas
que ustedes deben tener
Esto no est en los libros, y si esta est muy corto, es un compendio de la experiencia de
varios aos que se tiene en relacin a las pautas ms sencillas para desglosar una ruta
metablica.
Muchas veces el susto que les da a los estudiantes de medicina al estudiar bioqumica es
la cantidad de enzimas que se tienen que estudiar y a veces estn perdidos, se aprenden tantas
enzimas que a veces no saben cuales enzimas actan cuales van cuales cuales vienen cual fue
cual no fue.
Hoy es la primera parte, solamente voy a dar las pautas generales, por lo menos los
diferentes mecanismos de

regulacin y como de forma des sincronizada todos estos

mecanismos se concadenan para dar un efecto o una respuesta celular especifica, ese es el
objetivo de la clase de hoy.
Adems vamos a ver una ruta con el metabolismo del Glucgeno, en las clases pasada
vimos cual era el destino de todos esos carbohidratos, de fuente exgena, cuando pasaban a la
sangre circulante, y luego cuando iban a hacer ubicados en todos los tejidos y como iban a ser
almacenados, hablamos de dos tipos de almacenamientos, entonces de Glucgeno Heptico y a
nivel muscular.
Hoy vamos a repasar como se debe ver la sntesis de Glucgeno y como se debe
desglosar la degradacin de Glucgeno y bajo que circunstancia se activan para obtener
Glucosa. Que a partir de la Glucosa se oxida para luego de varias transformaciones vamos a
obtener ATP. El ATP es la moneda universal de energa de los sistemas biolgicos.
1. Metabolismo:
Deriva del griego Antoles que significa cambio o transformacin

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Conjunto de reacciones qumicas que efectan constantemente las clulas de los seres
vivos con el fin de sintetizar sustancias complejas a partir de otras ms simples, o degradar
aquellas para obtener estas.
Objetivos ms importantes:
1) Sustentan las diferentes funciones vitales de las clulas
2) Eliminacin de productos de desechos
3) Sntesis y conversin de metabolitos necesarios para mantener la estructura celular
4) Garantizando as que las clulas tenga todo le necesario para poder trabajar y ejercer
las funciones para las cuales fue diseada
5) Obtencin y utilizacin de la energa
El metabolismo estudia TODAS las reacciones
Sin embargo nosotros todo lo podemos estudiar al mismo tiempo vamos a a estudiar cada
ruta metablica y los fines de cada ruta.
2. Ruta metablica
Secuencia de reacciones qumicas consecutivas catalizadas enzimaticamente
Cuyo objetivo primordial es la TRANSFORMACION QUIMICA ESPECIFICA
El metabolismo es el conjunto completo de todas las reacciones mientras que una ruta
metbolica es el estudio de una transformacin especfica.
Caractersticas:
1) Son una secuencia de reacciones que estn concadenadas una con respecto a la
otra, ya que el producto de una primera reaccin ser el sustrato inmediato de la
siguiente enzima.
2) Siempre vamos a tener un sustrato que va a iniciar esa ruta de transformacin y un
producto final o de inters para la clula que es el producto que vamos a obtener.
3) La obtencin de este producto no es inmediata vamos a tener una serie de
reacciones transcitorias y progresivas. Todos los metabolitos que vamos a obtener
durante esa transformacin progresiva son las que denominamos Metabolitos
intermediarios.
4) Son sistema termodinmicamente abiertos
5) Hay dos tipos de reacciones: Que son las que estn prximas al equilibrio y alejadas
al equilibrio.
6) Las reacciones prximas o cercanas al equilibrio, desde el punto de vista
termodinmico son aquellas cuyo delta G estndar biolgico , o estndar si fue
medido a temperatura ambiente, estn cercanas a 0
7) Las reacciones alejadas al equilibrio, que son las que ustedes generalmente
reconocen, son aquellas que tienen un delta G o muy positivo o muy negativo
8) Nos vamos a concentrar en las que tienen un delta G sumamente negativas, sobre
todo las reacciones correspondiente a la unidad 3, del tipo catablicas.
El metabolismo realmente va a estudiar:
1) Vamos a estudiar todos los intermediarios
2) como suceden esas transformaciones desde el inicio hasta el fin
3) Estudia principalmente el destino de los componentes de la dieta, vamos a estudiar
qu pasa con cada uno de estos para poder ser aprovechados por la clula.
4) La relacin entre las diferentes rutas metablicas

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5) Los mecanismos de regulacin. No todas las rutas metablicas van a estar activas
al mismo tiempo. Sino que de manera concadenada pueda entonces activarse una
ruta en un sentido y la de sentido contrario debe estar inactivada. De lo contrario si
se activan ambas rutas se

generaran ciclos intiles. Y dentro de la clula todo

tiene una razn de ser, y todo tiene que estar en perfecta armona.
3. Las reacciones prxima o cercana al equilibrio:
Donde el estado estacionario es muy cercano a la constante X (constante de equilibrio)
Tienen un delta G estndar biolgico cercano a 0
Estn catalizadas por enzimas
Las reacciones son reversibles (Puede suceder en un sentido y fcilmente revertirse).

Caracterstico de una ruta metablica

La capacidad de revertirse se debe a los pequeos cambios de la concentracin de

sustrato
y los productos modifican el flujo y permiten una fase de fluctuacin de la energa.
Este tipo de reacciones no son sensibles a la regulacin alostericas
No regulan vas metablicas
Sin embargo participan dentro de una via metabolica y son a veces necesarias porque
muchas veces permiten una transformacin que en un momento dado son beneficiosas
4. Las reacciones Alejadas del Equilibrio: SON LA QUE VAMOS A PRESTAR

ATENCIN
Determina la direccionalidad de una va
Son sensibles a la regulacin alosterica (Marcaje metablico para el inicio de la
Transformacin)
Regulan las vas metablica
Hay dos tipos de reacciones:
1) Una generadora del flujo de una va (Que impulsan el flujo de una va)
2) Limitantes del flujo de una va
(Dependiendo de la disponibilidad de ATP o oxigeno, pueden detenerse, llevar un estado
estacionario, manteniendo una relacin de flujo, donde se devuelven las reacciones reversibles y
luego de un momento dado continuar el flujo de transformacin de ese metabolito para llevarlo
a producto. Generalmente antecede el producto)
La concentracin de sustrato se mantiene alta y la del producto se mantiene baja. La
concentracin de sustrato es mayor que el Km de la enzima (Garantizando la
direccionalidad)
Las enzimas son de velocidad baja.
Por ejemplo cuando estamos en el carro en una cola de mucho trfico, notamos que hay
unos carros que van adelantados y otros que van dentro de la fila. Tambin dentro de una
ruta metablica siempre van a haber:
Reacciones que van a ser rpidas, de desvio (van a permitir la fluidez de una ruta en un
momento dado).
Pero en otros puntos, para enlentecer una ruta metablica van a haber puntos limitantes
van a haber enzimas limitantes

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Acumulandose asi un flujo de energa (Ya que hay puntos donde se adelanta y otros se
enlentecen)
Entonces van a aparecer las reacciones prximas al equilibrio que son las que van
mantener este estacionario constante. Mientras se libera ms adelante el flujo que esta
adelante para continuar con la transformacin

La primera (SA) y ltima reaccin (BP) definen el flujo de esa reaccin.

5. Estado estacionario
o Estado energtico adaptado a las condiciones biolgicas de las clulas
o Dentro de las clulas todas las condiciones son constantes pero diferentes al
o
o

equilibrio
Un estado de equilibrio es donde todo lo que entra todo sale (Nada queda)
En la clula la energa que entra parte se libera en forma de calor y parte se
invierte para trabajo

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o

Donde nada es inneceasrio: Nada sobra y nada falta y se mantiene en un

justo equilibrio, denominado estado estacionario que mantiene nuestro
organismo en condiciones sanas

6. TIPOS DE RUTAS METABLICAS

6.1 Segn la estructura de las rutas metablicas, pueden ser:
1) Lineales:
Como el ejemplo anterior
La secuencia va hacia un solo sentido (Directa o indirecta)
Comprenden de un sustrato inicial, un producto final y metabolitos
intermediarios (elementos que a pesar de que han sido catalizado
por enzimas el producto final de inters no se ha logrado en esta
etapa)
2) Ramificadas:
1) Divergentes:
Tiene un sustrato inicial, lleva una serie de transformaciones
Pero llega a un punto de bifurcacin: donde puede seguir una
ruta alternativa A (Que generalmente es la original) o tomar
una ruta alternativa B (Que puede ser ms rpida o una ruta
de desvio) dependiendo de las necesidades de las clulas o
dependiendo de la concentracin de nivel energtico que
pudiramos tener en un momento dado.
2) Convergentes:
Hay 2 rutas paralelas de transformacin que confluyen en una
ruta de transformacin comn (Degradacin o oxidacin)
Caracteristica de vas catablicas.
Comenzamos con varias molculas

iniciales

que

van

degradndose progresivamente para dar a un sustrato comn

que va a ser finalmente transformada en producto
Ejemplo de un sustrato comn o producto intermediario podra
ser Acetil CoA.
3) Cclicas:
Un ejemplo podra ser el Ciclo de Krebs
Comenzamos con un sustrato inicial que se va a sufrir una serie
de transformacin para producir algn elemento.
Al generar el producto de manera simultnea se regenera el
sustrato iniciador para reiniciar el ciclo.
4) Biciclicas:
Ambos ciclos comienzan de forma simultanea

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Al empezar el primer ciclo se genera un intermediario que se
necesita como base par a generar el segundo ciclo de
transformacin
6.2 Segn el Objetivo metablico las rutas se clasifican en: Catablicas, Anablicas y
Anfiblicas.

1)

Catablicas:
Transformacin de molculas complejas a molculas ms simples
Con la consecuente obtencin de energa en forma de ATP o

equivalente reductores
Naturaleza oxidante
Permite la biosntesis de potenciales reductores (NADH Y FADH)
Proceso convergente
Exergnica
Los productos intermediarios sirven de materia prima para el

anabolismo (sntesis)
Produce calor para mantener la temperatura corporal (36,5C es la
temperatura ptima para la cual nuestras enzimas puedan trabajar
adecuadamente, a su mxima capacidad )
Ejemplos de estas son:
o Glicolisis (Degradacin de la Glucosa)
o Licolisis (Degradacin de Acidos grasos TAG)
o Proteolisis
o Beta oxidacin de cidos grasos
2) Anablicas:
Partimos de molculas simples y requerimos de energa para formar

molculas ms complejas
Naturaleza Reductiva
Proceso Divergente
Proceso endergnico (Requiere energa)
Ejemplos:
o Glucogenogenesis (Sintesis de glucgeno)

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o

Gluconeogenesis

(sntesis

de

glucosa

partir

de

elementos no carbohidratos)
Lipogenesis (sntesis de acidos grasos a partir de

unidades monoacetiliadas como acetil CoA)

3) Anfibolicas
Rutas mixtas (Dependiendo de las necesidades de la clula pueden
ser Catablicas Anablicas, al estar activo uno de ellos el otro
est inactivo, nunca estn activos los dos al mismo tiempo)
Ejemplo de estas son el Ciclo de Krebs:
Donde en un momento dado si est del lado catablico va a degradar completamente

las

unidades de AcetilCoA para generar equivalentes reductores que van a ser empaquetados en
forma de FADH NADH y estos van a la cadena respiratoria para sintetizar ATP
El lado anablico consiste en que muchos de los intermediarios del Ciclo de Krebs van a servir
de materia prima para sintetizar otros elementos de inters para la celula. Por ejemplo el
Succinato se utiliza para la sntesis de Morfirinas, para la sntesis del grupo Hem; El Oxalacetato
(Intermediario del Ciclo de Krebs) sirve de materia prima para sintetizar Alanina (aa. Importante
para la sntesis de protenas)
7. Metabolismo Intermediario:
Consta de 3 etapas:
1) Conversin de polmeros a monmeros
2) Incorporacin o transformacin de Monmeros en productos
intermediarios (Sustancias ms simples).
El medio de comunicacin entre las vas anablicas y catablicas son:
o Las coenzimas oxidadas producto del anabolismo
o Las coenzimas reducidas producto del catabolismo
3) Utilizacin adecuada de la energa qumica contenida en ellos para
impulsar otros procesos vitales para la clula
8. Estudio de una ruta metablica:
1) Nombre de la ruta:
1) Nombre de el o los bioqumicos que la descubrieron
2) Nombre del sustrato iniciador o del producto final
Lisis: Ruptura o degradacin
Genesis: Sntesis
2) Objetivo e importancia biolgica:
Utilidad tanto del sustrato iniciador como de los productos que derivan
de l o ellos
Se refiere a que el papel desempea la ruta en el funcionamiento celular
3) Ubicacin de la ruta:
Tisular: Tipo de Tejido donde va a estar ubicado
Por ejemplo la Glucogenognesis puede ocurrir en Hgado o Tejido muscular pero vamos a tener
productos finales diferentes y la utilidad no es la misma.
Compartimiento celular donde se realiza

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Por ejemplo: Activadores a nivel de membrana, Citoplasma, ribosomas o Mitocondria
4) Sustrato:
1. Sustrato iniciador inmediato:
Primera transformacin que sufre el sustrato una vez ingresa a la
clula
Cuando el sustrato es marcado metablicamente o activado para
iniciar una ruta.
2. Sustrato verdadero:
Es aquel que una vez transformado ya no puede ser desviado de
la ruta.
Marcaje metablico: Le estamos aportando la energa para que continue con las reacciones
de transformacion moleculares y Atrapamiento molecular que impida que salga de la clula ya
que no puede atravesar la membrana porque al cambiar la polaridad de la molcula la
membrana ya no la podr reconocer.
Por ejemplo a nivel del Hepatocito ingresa la GLUCOSA libre y activa la Glucoquinasa
fosforilanadola en G-6-P (este seria el sustrato iniciador inmediato) Luego de acuerdo a la
necesidad de la clula puede tomar varias rutas. Esta G-6-P si la cambiamos a G-1-P va a ser
guardada en forma de glucgeno, si la pasamos a F-6-P pasa a la Glucolisis
5) Desarrrollo de la va metablica:
Enzimas claves o limitantes del flujo o de velocidad (Inhibicin y
Activacin)
Reacciones donde se genera o se requiere ATP y equivalentes
reductores (NADH, FADH)
6) Productos generados:
Destino y posible utilizacin de los mismos
7) Balance energtico y/o estequiometria:
Sustrato (n)
Coenzimas (Oxidadas o reducidas)
Intermediarios energticos requeridos
Productos Obtenidos (n)
En un proceso catablico encontramos intermediarios energticos oxidadas porque lo que vamos
a obtener al final es agentes reducidos.
8) Condiciones nutricionales de activacin:
Estado Post-Pandrial (Luego ingesta de comida)
Ayuno (Cuando no hay ingesta de comida suministro de combustible de
forma exgena)
Realimentacin ( Momento en el que llega la primera bocanada de
alimento en el cual se interrumpe el ayuno)
Hormonas (mensajeros qumicos) predominan en estos estados
nutricionales:
Ejemplos de estas son: Insulina (Estado de buena nutricin) y Glucagon
(Ayuno)
9. Las enzimas deben ser reguladas para asegurar

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1) La velocidad de la ruta est adaptado a las necesidad de clula
2) Las vas de sntesis y degradacin no estn activadas al mismo tiempo, ya que ello dara
lugar a un ciclo ftil o intil.
10.
Mecanismos de regulacin metablicos
1) Control Hormonal
Sistema de comunicacin y control remoto del SNC y Sistema Endocrino
con el fin de adaptar la actividad de las clulas a una integracin
funcional
2) Provisin de sustrato y coenzima
Si hay poco sustrato no se puede activar una ruta metablica o se
activara a una velocidad muy lenta.
Si hay mucho producto y poco sustrato la ruta metablica se detiene.
Si tengo sustrato pero no tengo coenzimas no se puede activar la ruta.
3) Control Alosterico
Positivo cuando activamos
Negativo cuando inhibimos
4) Fosfarilacin covalente de una enzima
Que la puede activar (Positiva) o desactivarla (Negativa)
5) Desvio de productos intermediarios o finales
Por ejemplo cuando degradamos la Glucosa obtenemos dos molculas de
Piruvato en el citosol. El piruvato ingresa a la Mitocondria, garantizando el
sentido de la reaccin, se descarboxila para continuar su ruta metablica y
finalmente convertirla en ATP. Si se queda en citoplasma aumenta la
cantidad de producto lleva las reacciones reversibles y se devuelven,
deteniendo toda la ruta metablica
11.
Hormonas
Intermediarios qumicos
Productos de la secrecin de glndulas que constituyen el sistema endocrino y que
se vierten en la circulacin por estmulos especficos vehiculizadas por la sangre
hasta los Tejidos Blancos o Dianas donde va a provocar el efecto determinado
Acciones que ejercen:
o Activan transportadores especficos
o Modifican la actividad enzimtica
o Actuan sobre la sntesis de algunas protenas
o Modifican las vas de algunas rutas
12.

Regulacin a corto plazo:

1) Enzimas Alostricas:
Su actividad puede ser regulada mediante la accin de la molecula
Caractersticas:
o Poseen varias subunidades
o Son oligomericos
o Se ubican al inicio de una ruta metablica o en un punto de
ramificacin
o Presenta cintica Sigmoidea
2) Enzimas isostricas:
No poseen sitios alostricos

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Su actividad es regulada por la concentracin de sustrato o de
producto de la propia reaccin que cataliza
13.

Regulacin a mediano plazo

Modificando covalente de la enzima
Se modifica la estructura de la enzima agregndole o quitndole
grupos fosfatos o nitrilos

14.

Regulacin a largo plazo:

1) Enzimas inducibles:
Enzimas cuya sntesis atiende a las necesidades del organismo
No son sintetizados permanentemente por la clula sino en casos de
seguridad
2) Enzimas constituyentes:
Enzimas que constantemente son sintetizadas en el organismo, es
decir, posee una tasa basal de sntesis de acuerdo a su vida media