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CONSULTA # 4

BIOLOGA MOLECULAR
NOMBRE DE LA ESTUDIANTE: Karla Vasco

FECHA DE ENTREGA: 12 de septiembre de 2013

1. ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS


Para que las protenas cumplan con su funcin biolgica, deben adquirir una estructura tridimensional
energticamente estable 4.
Estructura primaria.- Se la considera como una secuencia lineal de aminocidos unidos mediante enlaces
peptdicos covalentes 5.

Estructura secundaria.- La conformacin de una cadena polipeptidica se


debe a la formacin de puentes de hidrgeno (enlace no covalente) entre
los enlaces peptdidos. Existen ciertas estructuras repetitivas encontradas
en las protenas que permiten clasificarlas en dos tipos: hlice alfa y
lmina beta. La hlice es dextrgira, donde la cadena polipetdica
principal forma la estructura central, y las cadenas laterales se extienden
por fuera de la hlice 9. El grupo carboxlo (CO) de un aminocido n se
une por puente hidrgeno al grupo amino (NH) de otro aminocido que
est tres residuos mas all ( n + 4 ). De esta manera cada grupo CO y NH
de la estructura central se encuentra unido por puente hidrgeno 5.
La lmina est formada por filamentos de protena que se encuentran
una junto a otra, interactuando lateralmente a travs de enlaces de H, entre
la estructura central con el carbonilo de oxgeno y tomos de H de los
aminocidos. Pueden ser paralelas (N-terminales de ambas cadenas en el
mismo extremo) o antiparalelas 10.
Estructura terciaria.- Las protenas tienen una estructura plegada y completa en tres dimensiones de la cadena
polipeptdica. EL plegamiento terciario no es inmediato, primero se agrupan los dominios y lueglo se articulan
definitivamente. Este plegamiento est facilitado por uniones denominadas puentes disulfuro, -S-S- que se
establecen entre los tomos de azufre del aminocido cistena 2.
Existen, sin embargo dos tipos de estructuras terciarias bsicas:protenas fibrosas, insolubles en agua, como la alfa
queratina o el colgeno y protenas globulares, solubles en agua. La estructura terciaria se realiza de manera que
los aminocidos apolares se sitan hacia el interior y los polares hacia el exterior en medios acuosos 10.
Estructura cuaternaria: Deriva de la conjuncin de varias cadenas peptdicas, representa su interconexin y
organizacin. Posee propiedades distintas a la de sus monmeros componentes. Las subunidades se asocian por
interacciones no covalentes, como puentes de hidrgeno, interacciones hidrofbicas o puentes salinos. Para el
caso de una protena constituida por dos monmeros, un dmero, ste puede ser un homodmero, si los

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monmeros constituyentes son iguales, o un heterodmero, si no lo son. Por ejemplo la hemoglobina es una
protena con cuatro polipptidos, dos alfa-globinas y dos beta globinas 5.

Diwan (2003)

2. ESTRUCTURA DE LOS RIBOSOMAS PROCARIOTAS Y EUCARIOTAS


Los ribosomas sintetizan protenas a partir de la informacin gentica del ADN, est constituida por complejos
macromoleculares de protenas y cido ribonucleico (ARN), se encuentran en el citoplasma, en las mitocondrias,
en el retculo endoplasmatico y en los cloroplastos 11.

ESTRUCTURA RIBOSOMAS PROCARIOTAS: El ribosoma procariota tiene un coeficiente de sedimentacin


de 70s, su masa molecular es de 2.500 kilodalton y est formado por dos subunidades de 50s y 30s.

Subunidad mayor (50 S): Tiene 2 molculas de ARN, 1 23S y otra 5S, y 34 protenas bsicas de las cuales
slo una se repite en la subunidad menor 1.
Subunidad menor (30 S): Tiene una molcula de ARNr de 16S y 21 protenas 1.

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Se encuentra en el citoplasma donde recibe el nombre de polisoma o polirribosa. Su ultraestructura del ribosoma
es muy compleja, est formado por ARN ribosmico (65%) y protenas (35%). Es el orgnulo ms abundante,
dando a la clula una apariencia granulosa. Las molculas de ARN ribosmico son ricas en adenina y guanina y
forman una hlice alrededor de las protenas.
ESTRUCTURA RIBOSOMAS EUCARIOTAS: Los ribosomas se originan en el ncleo pero desempean su
funcin de sntesis en el citosol 6. Los ribosomas son 80S, su peso molecular es de 4.200 Kd, tienen ARNr (40%)
y protenas (60%). Tanto el ARNr como las subunidades se suelen nombrar por su coeficiente de sedimentacin
en unidades Svedberg. En las clulas eucariotas, los ribosomas del citoplasma alcanzan un coeficiente de
sedimentacin de 80s, 60s y otro de 40s11. Estructuralmente, tienen dos subunidades: mayor y menor.

Subunidad mayor (60S): 3 tipos de ARNr: 5S, 28S y 5,8S y 49 protenas diferentes a las de la subunidad
menor 1.
Subunidad menor (40S): 1 molcula de ARNr 18S y 33 protenas 1.

Guo, et. al (2011) A schematic presentation of the proposed molecular mode of action of eIF6, RACK1, PKC and CK1 in ribosome assembly and protein translation. Nuclear CK1
phosphorylates eIF6 at Serine 174 and Serine 175. This phosphorylation is required for the shuttling of eIF6 from nucleus into cytosol. eIF6 prevents joining of the cytosolic 60S
ribosome subunit with the 40S subunit from forming a functional 80S ribosome. RACK1, via binding simultaneously to the eIF6 and the activated PKC, can facilitate the
phosphorylation of eIF6 at Serine 235 by PKC. The Serine 235 phosphorylated eIF6 then disassociates from 60S ribosome, thus allowing the assembly of functional 80S ribosome
and initiation of protein translation. CK1, Casein Kinase 1; 60S, 60S ribosome subunit; 40S, 40S ribosome subunit; eIF6, Eukaryotic Initiation Factor 6; RACK1, Receptor for
Activated C Kinase 1; PKC, Protein Kinase C; pi, phosphate.

En plastos de eucariotas, al igual que en procariotas, son 70S pero en la subunidad mayor hay un ARNr 4S
equivalente al 5S procariota. Los ribosomas mitocondriales varan entre 55S y 80S, contienen dos tipos de ARN
ribosmicos, el 12S y 16S, que se transcriben a partir de genes del ADN mitocondrial y son transcritos por una
ARN polimerasa mitocondrial especfica. Todas las protenas que forman parte de los ribosomas mitocondriales
estn codificadas por genes del ncleo celular, que son traducidos en el citosol y transportados hasta las
mitocondrias.
Para que se unas las dos subunidades debe haber una concentracin 0.001M de iones Mg ++, si es menor las
subunidades se separaran, siendo un proceso reversible. Si la concentracin de iones de Mg ++ aumenta hasta 10
veces, se producen dmeros de ribosomas.

Karla Vasco

Ribosoma en 3D
Ramakrishnan (Universidad de Cambridge, Reino Unido), Steitz (Universidad de
Yale, EE.UU., y Yonath (Instituto Weizmann, Israel) ayudaron a construir una
estructura en tres dimensiones del ribosoma, que permiti conocer cmo se
transforma el cdigo gentico en un ser vivo. Este estudio se bas en la cristalografa
de rayos X, que asla las protenas de las clulas y las cristaliza para poder ser
examinadas con rayos X. Adems, estos estudios sobre el ribosoma han sentado las
bases para el desarrollo de nuevos antibiticos 8, 3.
BIBLIOGRAFA
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Belousoff M, Shapir, Bashan, Zimmerman, Rozenberg, Arakawa, Kinashi, Yonath (2011). Crystal structure of the
synergistic antibiotic pair, lankamycin and lankacidin, in complex with the large ribosomal subunit. Proc Natl Acad
Sci U S A. 2011 February 15; 108(7): 27172722. Published online 2011 January 31. doi:
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Karla Vasco

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