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PROTENAS I
- ESTRUCTURA-
Las protenas son tan diversas que realizan casi todas las funciones de la
clula
IDEAS GENERALES
Las protenas constituyen la mayor parte del peso
seco de una clula.
Son elementos estructurales y funcionales de la
clula (realizan prcticamente todas las
funciones: enzimtica, canales, transportadora,
de sealizacin, motora, toxinas).
Son las molculas ms complejas y
funcionalmente ms sofisticadas que se conocen
producto de miles de millones de aos de
evolucin. Son muy verstiles.
A pH fisiolgico sus cadenas laterales hidrfilas tienen carga en parte (+) o (-)
AMINOCIDOS APOLARES
+
Bsicos
cidos
Polares sin
carga
No polares
Superficie de las
Enlaces inicos
protenas solubles o en el
Puentes de Hidrgeno
Interacciones hidrofbicas o
fuerzas de Van Der Waals
interior formando
enlaces con otros
aminocidos similares
Centro de las protenas
solubles.
Regin
transmembrana de
protenas.
ENLACE PEPTIDICO
Reaccin de deshidratacin (condensacin)
Enlace covalente: amida.
El extremo con el grupo amino se denomina N- (o amino)
terminal y el extremo con el grupo carboxilo, C- (o carboxilo)
terminal.
Una protena
est formada
por un
esqueleto
polipeptdico
con cadenas
laterales.
Cada tipo de
protena
difiere de las
dems en su
secuencia y
en su nmero
de
aminocidos.
La secuencia
de
aminocidos
se lee de
izquierda a
derecha
(extremo
amino a
carboxilo).
Pptidos importantes
PEPTIDO
Naa
Funcin
Glutatin
Encefalinas
Vasopresina
Oxitocina
MSH
14
Glucagn
29
Hiperglicemiante en ayuno.
Insulina
51
PPTIDOS
Pptido es un trmino
que designa a una
cadena de aminocidos
de una longitud no
determinada. Sin
embargo, las cadenas de
50 a ms aminocidos
son usualmente
llamadas PROTENAS O
POLIPEPTIDOS.
The Basics of General, Organic, and Biological Chemistry
PROTEINA
Longitud
Ms de 50 aminocidos
Peso
Ms de 10 000 Da (10 KDa)
Funcin
Cadena polipeptdica con existencia
probada en un determinado organismo
ENLACE
Covalente peptdico
CARACTERSTICAS
ENFERMEDADES
Anemia falciforme o
drepanocitica
Fibrosis qustica
Ausencia de fenilalanina
ANEMIA FALCIFORME
Mutaciones variaciones en la secuencia
Los aminocidos invariables son importantes
para la funcin
Las mutaciones conservadoras son cambios
entre aminocidos qumicamente semejantes
Persona normal
Gen normal
Mutacin
DNA
El gen codifica el
polipptido
(b) El polipptido
beta hemoglobina
Hemoglobina normal
6
4
Mutacin cambia
forma de proteina
7
146
Beta
(c) La protena
hemoglobina
(formada por 4
polipptidos
Alfa
6
4
.146
Largas fibras
(d) La clula
Eritrocito
forma de disco
Eritrocito forma
de hoz
ENLACE
ENFERMEDADES
regular repetida.
La cadena polipeptdica puede adoptar distintas disposiciones
espaciales: Hlice , lmina y arrollada al azar.
En una protena promedio el 60% de la cadena polipeptdica se
encuentra en forma de hlices y hoja ; el resto como
plegamientos y giros al azar.
Hlice levgira
Hlice dextrgira
Lmina antiparalela
Lmina paralela
Giros
Bucles
3 4 residuos de aminocidos
Niveles superiores:
A) Superhlice o hlice enrrollada
Dos o tres hlices
tienen la mayor parte de
sus cadenas apolares
hacia un lado de manera
que pueden enrrollarse
una en torno a la otra
colocando estas cadenas
laterales al interior.
Ejm -queratina,
miosina
Niveles superiores:
B) Motivos
Llamadas estructuras
supersecundarias o
plegamientos.
Son combinaciones
regulares de estructuras
secundarias que tienen una
topologa particular.
Motivo giro
Otros motivos
PRIONES
Los priones como agentes patgenos fueron descubiertos en 1982 por
Stanley Prusiner.
Los priones ms
conocidos son los que
afectan al Sistema
Nervioso Central
causando
encefalopatas.
Enfermedades:
Mal de las vacas locas"
o Encefalopata
Espongiforme Bovina.
La enfermedad de
Creutzfeldt-Jakob (en
humanos).
Protena
normal
Protena
prin
ENLACES
ENFERMEDADES
Puentes disulfuro
Grupos sulfhidrilo de dos
residuos de cistena reaccionan
oxidativamente.
Confiere al pptido una
estabilidad considerable dado
su naturaleza covalente.
Intramoleculares o
intermoleculares.
Se interrumpen con agentes
reductores
Puente de HIDRGENO
Se forma entre un tomo
de hidrgeno y un par de
electrones desapareados
de un tomo
electronegativo (O).
Son particularmente
importantes en la
estabilizacin de las
hlices y las estructuras
laminares.
INTERACCIONES HIDROFBICAS
Es la tendencia que
tienen a agruparse
las molculas
hidrfobas, o parte
de ellas, al ser
excluidas de
interacciones con el
agua.
RESUMEN
GLOBULAR
Forma alargada
Mayormente extracelulares
Mayormente intracelulares
Principalmente estructurales
Principalmente funcionales
Insolubles en agua
Con
actividad
enzimtica
DESNATURALIZACIN
RENATURALIZACIN
Sin
actividad
enzimtica
DOMINIO PROTEICO
Territorio discreto de una estructura terciaria que puede plegarse
independientemente del resto, dando lugar a una estructura compacta y
estable.
Contiene entre: 50 350 aminocidos y tiene una caracterstica o funcin
especfica.
Es la unidad modular a partir de la cual de construyen muchas protenas
mayores.
Existen protenas con un dominio comn (como unir un in metlico o
reconocer a una molcula especfica) que suelen tener similar funcin.
Existen protenas multifuncionales que suelen tener dominios separados
para cada funcin.
Protena
Src con 3
dominios
Enzima lactato
deshidrogrenasa con
dominio de unin al NAD+
Dominio variable de la
cadena ligera de
inmunoglobulina
Dominios proteicos
ESTRUCTURAL
FUNCIONAL
Principales dominios
Dominio
Caracterstica
Quinasa
SH2
Dominio de unin a
fosfotirosina
SH3
SH4
Homeodominio
Bromodominio
Cromodominio
Familias de protenas
Las protenas actuales se pueden agrupar en familias proteicas:
secuencia de aminocidos y conformacin tridimensional semejante.
Surgieron en la evolucin por duplicacin de genes y posterior
modificacin.
Dos protenas que tengan ms del 25% de similitud en sus secuencias de
aminocidos, generalmente comparten la misma estructura global.
Familia de serin
proteasas. Cada
una rompe
diferentes
protenas o
diferentes enlaces
peptdicos
ORTLOGAS: Se
encuentran en
diferentes organismos
pero tienen la misma
funcin. Ejm: Elastasa
humana y elastasa del
ratn.
MODULO PROTEICO
Son dominios mviles en el tiempo que comparten diversas
protenas
Dos dominios
serin proteasas
moviles
MDULOS PROTEICOS
Los dominios:
Pueden ser integrados fcilmente a otras protenas
Se ha estimado que el Genoma Humano tiene:
1000 dominios de inmunoglobulinas
500 dominios de proten quinasa
250 homeodominios
300 dominios SH3
120 dominios SH2
Cremallera de
Leucina
Es un motivo que
crea fuerzas de
adhesin a travs de
hlices alfa en
paralelo. Es un
dominio de
dimerizacin comn
en protenas
involucradas en la
expresin gnica.
Dedos de Zinc
Son pequeos motivos estructurales de protenas que pueden coordinar uno o ms iones de zinc
para ayudar a estabilizar sus pliegues. Funcionan como mdulos de interaccin que unen el ADN,
ARN, protenas y molculas pequeas. Posee una hlice alfa y una lmina beta antiparalela.
ENLACE
CARACTERSTICAS
ENFERMEDADES
COLGENO: TRMERICA
NEURAMINIDASA: TETRAMRICA
TAMAOS Y FORMAS
PROTEICAS
ENSAMBLAJES PROTEICOS.
Con un solo lugar de unin:
dmeros
ESTRUCTURA SUPRAMOLECULAR
Estructuras:
Complejos enzimticos
Filamentos proteicos
Virus
Membranas
Ventajas
Reducen la informacin gentica
Enlaces de energa relativamente baja
Minimizan los errores en la sntesis
Lminas planas, tubos, anillos, esferas
Ensamblaje Cilndrico
Ejm. Virus del mosaico del tabaco
Mecanismo de autoensamblaje
Rotura proteoltica de
algunas protenas
P
R
O
T
E
I
N
A
S
S
I
M
P
L
E
S
ALBUMINAS
GLOBULINAS
HISTONAS
ESCLEROPROTEINAS
C
O
N
J
U
G
A
D
A
S
Caractersticas
Ejemplos
Ovoalbmina
Lactoalbmina
Ovoglobulina
Lactoglobulina
Colgeno
Elastina
PROTEINA
GRUPO PROSTETICO
EJEMPLOS
NUCLEOPROTEINAS
RNA
Ribosomas
LIPOPROTEINAS
- Lipoproteinas
GLUCOPROTEINAS
-Globulinas
FOSFOPROTEINAS
Casena, Vitelina
FLAVOPROTEINAS
Flavn nuceltido
Succinato Dhasa
METALOPROTEINAS
Fe (OH)3
Fe y Cu
Zn
D-aminocido oxidasa
Citocromo oxidasa
Alcohol deshidrogenasa
Localizacin y funcin
Enzimas
Hexocinasa
Fosforila a la glucosa
Lactato Deshidrogenasa
Deshidrogena al lactato
Ribonucleasa
Tripsina
Hormonas
Horm. adrenocorticotropa
Insulina
Protenas reguladoras
Calmodulina
Troponina C
Protenas de reserva
Casena
Protena de la leche
Ferritina
Ovoalbmina
Tipos y ejemplos
Localizacin y funcin
Protenas transportadoras
Albmina srica
Beta-lipoprotena
Hemoglobina
Transporte de O2 en la sangre.
Mioglobina
Transporte de O2 en msculo
Protenas contrctiles
Actina
Dinena
Cilios y flagelos
Miosina
Fibringeno
Trombina
Protenas estructurales
Colgeno
Elastina
- Queratina
Tipos y ejemplos
Localizacin y funcin
Protenas Cromosmicas
Histonas
No histonas
Protenas Receptores
Receptor a FGE y otros
Receptor de insulina, etc